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质粒pCAMBIA 1303

质粒pCAMBIA 1303
质粒pCAMBIA 1303

20: AF234299 Binary vector pCAMBIA-1303, complete sequence PubMed, Protein, Related Sequences, Taxonomy

LOCUS AF234299 12361 bp DNA circular SYN 24-APR-2000

DEFINITION Binary vector pCAMBIA-1303, complete sequence.

ACCESSION AF234299

VERSION AF234299.1 GI:7638078

KEYWORDS .

SOURCE Binary vector pCAMBIA-1303.

12361

ecor1= 11548

nhe1 2540 5981

ORGANISM Binary vector pCAMBIA-1303

artificial sequence; vectors.

REFERENCE 1 (sites)

AUTHORS Hajdukiewicz,P., Svab,Z. and Maliga,P.

TITLE The small, versatile pPZP family of Agrobacterium binary vectors

for plant transformation

JOURNAL Plant Mol. Biol. 25 (6), 989-994 (1994)

MEDLINE 95002787

PUBMED 7919218

REFERENCE 2 (bases 1 to 12361)

AUTHORS Roberts,C., Rajagopal,S., Smith,L.M., Nguyen,T.A., Yang,W.,

Nugrohu,S., Ravi,K.S., Vijayachandra,K., Harcourt,R.L.,

Dransfield,L., Desamero,N., Slamet,I., Hadjukiewicz,P., Svab,Z.,

Maliga,P., Mayer,J.E., Keese,P.K., Kilian,A. and Jefferson,R.A.

TITLE A comprehensive set of modular vectors for advanced manipulations

and efficient transformation of plants

JOURNAL Unpublished

REMARK Full description of constructs

REFERENCE 3 (bases 1 to 12361)

AUTHORS Roberts,C., Rajagopal,S., Smith,L.M., Nguyen,T.A., Yang,W.,

Nugrohu,S., Ravi,K.S., Vijayachandra,K., Harcourt,R.L.,

Dransfield,L., Desamero,N., Slamet,I., Hadjukiewicz,P., Svab,Z.,

Maliga,P., Mayer,J.E., Keese,P.K., Kilian,A. and Jefferson,R.A.

TITLE Direct Submission

JOURNAL Submitted (15-FEB-2000) CAMBIA, Clunies Ross St, Black Mountain /

GPO Box 3200, Canberra, ACT 2601, Australia

FEATURES Location/Qualifiers

source 1..12361

/organism="Binary vector pCAMBIA-1303"

/db_xref="taxon:118391"

GUS GFP 2.(1807).2569

/note="gusA (N358Q) - mgfp5* gene fusion; His6"

/codon_start=1

/produ11ct="GUSA (N358Q)/MGFP5 fusion, hexaHis tagged"

/protein_id="AAF65347.1"

/db_xref="GI:7638079"

/translation="MVDLTSLRPVETPTREIKKLDGLWAFSLDRENCGIDQRWWESAL

QESRAIAVPGSFNDQFADADIRNYAGNVWYQREVFIPKGWAGQRIVLRFDAVTHYGKV

WVNNQEVMEHQGGYTPFEADVTPYVIAGKSVRITVCVNNELNWQTIPPGMVITDENGK

KKQSYFHDFFNYAGIHRSVMLYTTPNTWVDDITVVTHVAQDCNHASVDWQVVANGDVS

VELRDADQQVVATGQGTSGTLQVVNPHLWQPGEGYLYELCVTAKSQTECDIYPLRVGI

RSVAVKGQQFLINHKPFYFTGFGRHEDADLRGKGFDNVLMVHDHALMDWIGANSYRTS

HYPYAEEMLDWADEHGIVVIDETAAVGFQLSLGIGFEAGNKPKELYSEEAVNGETQQA

HLQAIKELIARDKNHPSVVMWSIANEPDTRPQGAREYFAPLAEATRKLDPTRPITCVN

VMFCDAHTDTISDLFDVLCLNRYYGWYVQSGDLETAEKVLEKELLAWQEKLHQPIIIT

EYGVDTLAGLHSMYTDMWSEEYQCAWLDMYHRVFDRVSAVVGEQVWNFADFATSQGIL

RVGGNKKGIFTRDRKPKSAAFLLQKRWTGMNFGEKPQQGGKQASKGEELFTGVVPILV

ELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTFSYGVQCFSRY

PDHMKRHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKE

DGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKANFKTRHNIEDGGVQLADHYQQNTPIGD

GPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITHGMDELYKASHHHHHHV"

misc_feature 1088..1090

/note="N358Q glycosylation mutation"

misc_feature 2598..2850

/note="nos (nopaline synthase) 3'UTR (polyA signal)"

misc_feature 2888..2913

/note="right border T-DNA repeat"

misc_feature complement(3954..4954)

/note="STA region from pVS1 plasmid"

rep_origin complement(5547..6547)

/note="pVS1-REP; replication origin from pVS1"

misc_feature complement(6957..7217)

/note="bom site from pBR322"

rep_origin complement(7357..7637)

/note="pBR322 origin of replication"

CDS complement(7928..8722)

/note="aadA (kanamycin resistance) gene amplified from

pIG121Hm"

/codon_start=1

/product="aminoglycoside phosphotransferase"

/protein_id="AAF65349.1"

/db_xref="GI:7638081"

/translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLK MTDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEY EDEQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWE EDTPFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKW YDIAFCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"

misc_feature 9147..9172

/note="left border repeat from C58 T-DNA"

misc_feature 9239..9447

/note="CaMV 3'UTR (polyA signal)"

CDS complement(9463..10488)

/note="hptII (hygromycin resistance) gene"

/codon_start=1

/product="hygromycin phosphotransferase"

/protein_id="AAF65350.1"

/db_xref="GI:7638082"

/translation="MKKPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGR GYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQD LPETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVY HWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWS EAMFGDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQ SLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPS TRPRAKK"

promoter complement(10524..11331)

/note="CaMV35S2; CaMV 35S promoter, duplicated"

promoter 11452..11506

/note="PlacZ; lacZ promoter"

CDS 11534..11767

/codon_start=1

/product="LacZ alpha fragment"

/protein_id="AAF65348.1"

/db_xref="GI:7638080"

/translation="MTMITNSSSVPGDPLESTCRHASLALAVVLQRRDWENPGVTQLN RLAAHPPFASWRNSEEARTDRPSQQLRSLNGEC"

misc_feature 11576..11626

/note="pUC18 MCS; polylinker"

promoter 11818..12355

/note="CaMV35S; 35S promoter from CaMV"

BASE COUNT 3041 a 3276 c 3276 g 2768 t

ORIGIN Bgl II Spe I

1 catggtagat ctgactagtt tacgtcctgt agaaacccca acccgtgaaa tcaaaaaact

61 cgacggcctg tgggcat i tca gtctggatcg cgaaaactgt ggaattgatc agcgttggtg

121 ggaaagcgcg ttacaagaaa gccgggcaat tgctgtgcca ggcagtttta acgatcagtt

181 cgccgatgca gatattcgta attatgcggg caacgtctgg tatcagcgcg aagtctttat

241 accgaaaggt tgggcaggcc agcgtatcgt gctgcgtttc gatgcggtca ctcattacgg

301 caaagtgtgg gtcaataatc aggaagtgat ggagcatcag ggcggctata cgccatttga

361 agccgatgtc acgccgtatg ttattgccgg gaaaagtgta cgtatcaccg tttgtgtgaa

421 caacgaactg aactggcaga ctatcccgcc gggaatggtg attaccgacg aaaacggcaa

481 gaaaaagcag tcttacttcc atgatttctt taactatgcc ggaatccatc gcagcgtaat

541 gctctacacc acgccgaaca cctgggtgga cgatatcacc gtggtgacgc atgtcgcgca

601 agactgtaac cacgcgtctg ttgactggca ggtggtggcc aatggtgatg tcagcgttga

661 actgcgtgat gcggatcaac aggtggttgc aactggacaa ggcactagcg ggactttgca

721 agtggtgaat ccgcacctct ggcaaccggg tgaaggttat ctctatgaac tgtgcgtcac

781 agccaaaagc cagacagagt gtgatatcta cccgcttcgc gtcggcatcc ggtcagtggc

841 agtgaagggc caacagttcc tgattaacca caaaccgttc tactttactg gctttggtcg

901 tcatgaagat gcggacttac gtggcaaagg attcgataac gtgctgatgg tgcacgacca

961 cgcattaatg gactggattg gggccaactc ctaccgtacc tcgcattacc cttacgctga

1021 agagatgctc gactgggcag atgaacatgg catcgtggtg attgatgaaa ctgctgctgt

1081 cggctttcag ctgtctttag gcattggttt cgaagcgggc aacaagccga aagaactgta

1141 cagcgaagag gcagtcaacg gggaaactca gcaagcgcac ttacaggcga ttaaagagct

1201 gatagcgcgt gacaaaaacc acccaagcgt ggtgatgtgg agtattgcca acgaaccgga 1261 tacccgtccg caaggtgcac gggaatattt cgcgccactg gcggaagcaa cgcgtaaact 1321 cgacccgacg cgtccgatca cctgcgtcaa tgtaatgttc tgcgacgctc acaccgatac 1381 catcagcgat ctctttgatg tgctgtgcct gaaccgttat tacggatggt atgtccaaag 1441 cggcgatttg gaaacggcag agaaggtact ggaaaaagaa cttctggcct ggcaggagaa 1501 actgcatcag ccgattatca tcaccgaata cggcgtggat acgttagccg ggctgcactc 1561 aatgtacacc gacatgtgga gtgaagagta tcagtgtgca tggctggata tgtatcaccg 1621 cgtctttgat cgcgtcagcg ccgtcgtcgg tgaacaggta tggaatttcg ccgattttgc 1681 gacctcgcaa ggcatattgc gcgttggcgg taacaagaaa gggatcttca ctcgcgaccg 1741 caaaccgaag tcggcggctt ttctgctgca aaaacgctgg actggcatga acttcggtga 1801 aaaaccgcag cagggaggca aacaagctag taaaggagaa gaacttttca ctggagttgt 1861 cccaattctt gttgaattag atggtgatgt taatgggcac aaattttctg tcagtggaga 1921 gggtgaaggt gatgcaacat acggaaaact tacccttaaa tttatttgca ctactggaaa 1981 actacctgtt ccgtggccaa cacttgtcac tactttctct tatggtgttc aatgcttttc 2041 aagataccca gatcatatga agcggcacga cttcttcaag agcgccatgc ctgagggata 2101 cgtgcaggag aggaccatct tcttcaagga cgacgggaac tacaagacac gtgctgaagt 2161 caagtttgag ggagacaccc tcgtcaacag gatcgagctt aagggaatcg atttcaagga 2221 ggacggaaac atcctcggcc acaagttgga atacaactac aactcccaca acgtatacat 2281 catggccgac aagcaaaaga acggcatcaa agccaacttc aagacccgcc acaacatcga 2341 agacggcggc gtgcaactcg ctgatcatta tcaacaaaat actccaattg gcgatggccc 2401 tgtcctttta ccagacaacc attacctgtc cacacaatct gccctttcga aagatcccaa 2461 cgaaaagaga gaccacatgg tccttcttga gtttgtaaca gctgctggga ttacacatgg 2521 catggatgaa ctatacaaag ctagccacca ccaccaccac cacgtgtgaa ttggtgacca 2581 gctcgaattt ccccgatcgt tcaaacattt ggcaataaag tttcttaaga ttgaatcctg 2641 ttgccggtct tgcgatgatt atcatataat ttctgttgaa ttacgttaag catgtaataa 2701 ttaacatgta atgcatgacg ttatttatga gatgggtttt tatgattaga gtc1ccgcaat 2761 tatacattta atacgcgata gaaaacaaaa tatagcgcgc aaactaggat aaattatcgc 2821 gcgcggtgtc atctatgtta ctagatcggg aattaaacta tcagtgtttg acaggatata 2881 ttggcgggta aacctaagag aaaagagcgt ttattagaat aacggatatt taaaagggcg 2941 tgaaaaggtt tatccgttcg tccatttgta tgtgcatgcc aaccacaggg ttcccctcgg 3001 gatcaaagta ctttgatcca acccctccgc tgctatagtg cagtcggctt ctgacgttca 3061 gtgcagccgt cttctgaaaa cgacatgtcg cacaagtcct aagttacgcg acaggctgcc 3121 gccctgccct tttcctggcg ttttcttgtc gcgtgtttta gtcgcataaa gtagaatact 3181 tgcgactaga accggagaca ttacgccatg aacaagagcg ccgccgctgg cctgctgggc 3241 tatgcccgcg tcagcaccga cgaccaggac ttgaccaacc aacgggccga actgcacgcg 3301 gccggctgca ccaagctgtt ttccgagaag atcaccggca ccaggcgcga ccgcccggag 3361 ctggccagga tgcttgacca cctacgccct ggcgacgttg tgacagtgac caggctagac 3421 cgcctggccc gcagcacccg cgacctactg gacattgccg agcgcatcca ggaggccggc 3481 gcgggcctgc gtagcctggc agagccgtgg gccgacacca ccacgccggc cggccgcatg 3541 gtgttgaccg tgttcgccgg cattgccgag ttcgagcgtt ccctaatcat cgaccgcacc 3601 cggagcgggc gcgaggccgc caaggcccga ggcgtgaagt ttggcccccg ccctaccctc 3661 accccggcac agatcgcgca cgcccgcgag ctgatcgacc aggaaggccg caccgtgaaa 3721 gaggcggctg cactgcttgg cgtgcatcgc tcgaccctgt accgcgcact tgagcgcagc 3781 gaggaagtga cgcccaccga ggccaggcgg cgcggtgcct tccgtgagga cgcattgacc 3841 gaggccgacg ccctggcggc cgccgagaat gaacgccaag aggaacaagc atgaaaccgc 3901 accaggacgg ccaggacgaa ccgtttttca ttaccgaaga gatcgaggcg gagatgatcg 3961 cggccgggta cgtgttcgag ccgcccgcgc acgtctcaac cgtgcggctg catgaaatcc 4021 tggccggttt gtctgatgcc aagctggcgg cctggccggc cagcttggcc gctgaagaaa 4081 ccgagcgccg ccgtctaaaa aggtgatgtg tatttgagta aaacagcttg cgtcatgcgg 4141 tcgctgcgta tatgatgcga tgagtaaata aacaaatacg caaggggaac gcatgaaggt 4201 tatcgctgta cttaaccaga aaggcgggtc aggcaagacg accatcgcaa cccatctagc 4261 ccgcgccctg caactcgccg gggccgatgt tctgttagtc gattccgatc cccagggcag 4321 tgcccgcgat tgggcggccg tgcgggaaga tcaaccgcta accgttgtcg gcatcgaccg 4381 cccgacgatt gaccgcgacg tgaaggccat cggccggcgc gacttcgtag tgatcgacgg 4441 agcgccccag gcggcggact tggctgtgtc cgcgatcaag gcagccgact tcgtgctgat 4501 tccggtgcag ccaagccctt acgacatatg ggccaccgcc gacctggtgg agctggttaa 4561 gcagcgcatt gaggtcacgg atggaaggct acaagcggcc tttgtcgtgt cgcgggcgat 4621 caaaggcacg cgcatcggcg gtgaggttgc cgaggcgctg gccgggtacg agctgcccat 4681 tcttgagtcc cgtatcacgc agcgcgtgag ctacccaggc actgccgccg ccggcacaac 4741 cgttcttgaa tcagaacccg agggcgacgc tgcccgcgag gtccaggcgc tggccgctga 4801 aattaaatca aaactcattt gagttaatga ggtaaagaga aaatgagcaa aagcacaaac 4861 acgctaagtg ccggccgtcc gagcgcacgc agcagcaagg ctgcaacgtt ggccagcctg 4921 gcagacacgc cagccatgaa gcgggtcaac tttcagttgc cggcggagga tcacaccaag 4981 ctgaagatgt acgcggtacg ccaaggcaag accattaccg agctgctatc tgaatacatc 5041 gcgcagctac cagagtaaat gagcaaatga ataaatgagt agatgaattt tagcggctaa 5101 aggaggcggc atggaaaatc aagaacaacc aggcaccgac gccgtggaat gccccatgtg 5161 tggaggaacg ggcggttggc caggcgtaag cggctgggtt gtctgccggc cctgcaatgg 5221 cactggaacc cccaagcccg aggaatcggc gtgacggtcg caaaccatcc ggcccggtac 5281 aaatcggcgc ggcgctgggt gatgacctgg tggagaagtt gaaggccgcg caggccgccc 5341 agcggcaacg catcgaggca gaagcacgcc ccggtgaatc gtggcaagcg gccgctgatc 5401 gaatccgcaa agaatcccgg caaccgccgg cagccggtgc gccgtcgatt aggaagccgc 5461 ccaagggcga cgagcaacca gattttttcg ttccgatgct ctatgacgtg ggcacccgcg 5521 atagtcgcag catcatggac gtggccgttt tccgtctgtc gaagcgtgac cgacgagctg 5581 gcgaggtgat ccgctacgag cttccagacg ggcacgtaga ggtttccgca gggccggccg 1 SEQ1303_R

5641 gcatggccag tgtgtgggat tacgacctgg tactgatggc ggtttcccat ctaaccgaat 5701 ccatgaaccg ataccgggaa gggaagggag acaagcccgg ccgcgtgttc cgtccacacg 5761 ttgcggacgt actcaagttc tgccggcgag ccgatggcgg aaagcagaaa gacgacctgg 5821 tagaaacctg cattcggtta aacaccacgc acgttgccat gcagcgtacg aagaaggcca 5881 agaacggccg cctggtgacg gtatccgagg gtgaagcctt gattagccgc tacaagatcg 5941 taaagagcga aaccgggcgg ccggagtaca tcgagatcga gctagctgat tggatgtacc 6001 gcgagatcac agaaggcaag aacccggacg tgctgacggt tcaccccgat tactttttga 6061 tcgatcccgg catcggccgt tttctctacc gcctggcacg ccgcgccgca ggcaaggcag 6121 aagccagatg gttgttcaag acgatctacg aacgcagtgg cagcgccgga gagttcaaga 6181 agttctgttt caccgtgcgc aagctgatcg ggtcaaatga cctgccggag tacgatttga 6241 aggaggaggc ggggcaggct ggcccgatcc tagtcatgcg ctaccgcaac ctgatcgagg 6301 gcgaagcatc cgccggttcc taatgtacgg agcagatgct agggcaaatt gccctagcag 6361 gggaaaaagg tcgaaaaggt ctctttcctg tggatagcac gtacattggg aacccaaagc 6421 cgtacattgg gaaccggaac ccgtacattg ggaacccaaa gccgtacatt gggaaccggt 6481 cacacatgta agtgactgat ataaaagaga aaaaaggcga tttttccgcc taaaactctt 6541 taaaacttat taaaactctt aaaacccgcc tggcctgtgc ataactgtct ggccagcgca 6601 cagccgaaga gctgcaaaaa gcgcctaccc ttcggtcgct gcgctcccta cgccccgccg 6661 cttcgcgtcg gcctatcgcg gccgctggcc gctcaaaaat ggctggccta cggccaggca 6721 atctaccagg gcgcggacaa gccgcgccgt cgccactcga ccgccggcgc ccacatcaag 6781 gcaccctgcc tcgcgcgttt cggtgatgac ggtgaaaacc tctgacacat gcagctcccg 6841 gagacggtca cagcttgtct gtaagcggat gccgggagca gacaagcccg tcagggcgcg 6901 tcagcgggtg ttggcgggtg tcggggcgca gccatgaccc agtcacgtag cgatagcgga 6961 gtgtatactg gcttaactat gcggcatcag agcagattgt actgagagtg caccatatgc 7021 ggtgtgaaat accgcacaga tgcgtaagga gaaaataccg catcaggcgc tcttccgctt 7081 cctcgctcac tgactcgctg cgctcggtcg ttcggctgcg gcgagcggta tcagctcact 7141 caaaggcggt aatacggtta tccacagaat caggggataa cgcaggaaag aacatgtgag 7201 caaaaggcca gcaaaaggcc aggaaccgta aaaaggccgc gttgctggcg tttttccata 7261 ggctccgccc ccctgacgag catcacaaaa atcgacgctc aagtcagagg tggcgaaacc 7321 cgacaggact ataaagatac caggcgtttc cccctggaag ctccctcgtg cgctctcctg 7381 ttccgaccct gccgcttacc ggatacctgt ccgcctttct cccttcggga agcgtggcgc 7441 tttctcatag ctcacgctgt aggtatctca gttcggtgta ggtcgttcgc tccaagctgg 7501 gctgtgtgca cgaacccccc gttcagcccg accgctgcgc cttatccggt aactatcgtc 7561 ttgagtccaa cccggtaaga cacgacttat cgccactggc agcagccact ggtaacagga 7621 ttagcagagc gaggtatgta ggcggtgcta cagagttctt gaagtggtgg cctaactacg 7681 gctacactag aaggacagta tttggtatct gcgctctgct gaagccagtt accttcggaa 7741 aaagagttgg tagctcttga tccggcaaac aaaccaccgc tggtagcggt ggtttttttg 7801 tttgcaagca gcagattacg cgcagaaaaa aaggatctca agaagatcct ttgatctttt 7861 ctacggggtc tgacgctcag tggaacgaaa actcacgtta agggattttg gtcatgcatt 7921 ctaggtacta aaacaattca tccagtaaaa tataatattt tattttctcc caatcaggct 7981 tgatccccag taagtcaaaa aatagctcga catactgttc ttccccgata tcctccctga 8041 tcgaccggac gcagaaggca atgtcatacc acttgtccgc cctgccgctt ctcccaagat 8101 caataaagcc acttactttg ccatctttca caaagatgtt gctgtctccc aggtcgccgt 8161 gggaaaagac aagttcctct tcgggctttt ccgtctttaa aaaatcatac agctcgcgcg 8221 gatctttaaa tggagtgtct tcttcccagt tttcgcaatc cacatcggcc agatcgttat 8281 tcagtaagta atccaattcg gctaagcggc tgtctaagct attcgtatag ggacaatccg 8341 atatgtcgat ggagtgaaag agcctgatgc actccgcata cagctcgata atcttttcag 8401 ggctttgttc atcttcatac tcttccgagc aaaggacgcc atcggcctca ctcatgagca 8461 gattgctcca gccatcatgc cgttcaaagt gcaggacctt tggaacaggc agctttcctt 8521 ccagccatag catcatgtcc ttttcccgtt ccacatcata ggtggtccct ttataccggc 8581 tgtccgtcat ttttaaatat aggttttcat tttctcccac cagcttatat accttagcag 8641 gagacattcc ttccgtatct tttacgcagc ggtatttttc gatcagtttt ttcaattccg 8701 gtgatattct cattttagcc atttattatt tccttcctct tttctacagt atttaaagat 8761 accccaagaa gctaattata acaagacgaa ctccaattca ctgttccttg cattctaaaa 8821 ccttaaatac cagaaaacag ctttttcaaa gttgttttca aagttggcgt ataacatagt 8881 atcgacggag ccgattttga aaccgcggtg atcacaggca gcaacgctct gtcatcgtta 8941 caatcaacat gctaccctcc gcgagatcat ccgtgtttca aacccggcag cttagttgcc 9001 gttcttccga atagcatcgg taacatgagc aaagtctgcc gccttacaac ggctctcccg 9061 ctgacgccgt cccggactga tgggctgcct gtatcgagtg gtgattttgt gccgagctgc 9121 cggtcgggga gctgttggct ggctgg tggc aggatatatt gtggtgtaaa caaattgacg 9181 cttagacaac ttaataacac attgcggacg tttttaatgt actgaattaa cgccgaatta 9241 attcggggga tctggatttt agtactggat tttggtttta ggaattagaa attttattga 9301 tagaagtatt ttacaaatac aaatacatac taagggtttc ttatatgctc aacacatgag 9361 cgaaacccta taggaaccct aattccctta tctgggaact actcacacat tattatggag 9421 aaactcgagc ttgtcgatcg acagatccgg tcggcatcta ctctatttct ttgccctcgg 9481 acgagtgctg gggcgtcggt ttccactatc ggcgagtact tctacacagc catcggtcca 9541 gacggccgcg cttctgcggg cgatttgtgt acgcccgaca gtcccggctc cggatcggac 9601 gattgcgtcg catcgaccct gcgcccaagc tgcatcatcg aaattgccgt caaccaagct 9661 ctgatagagt tggtcaagac caatgcggag catatacgcc cggagtcgtg gcgatcctgc 9721 aagctccgga tgcctccgct cgaagtagcg cgtctgctgc tccatacaag ccaaccacgg 9781 cctccagaag aagatgttgg cgacctcgta ttgggaatcc ccgaacatcg cctcgctcca 9841 gtcaatgacc gctgttatgc ggccattgtc cgtcaggaca ttgttggagc cgaaatccgc 9901 gtgcacgagg tgccggactt cggggcagtc ctcggcccaa agcatcagct catcgagagc 9961 ctgcgcgacg gacgcactga cggtgtcgtc catcacagtt tgccagtgat acacatgggg 10021 atcagcaatc gcgcatatga aatcacgcca tgtagtgtat tgaccgattc cttgcggtcc 10081 gaatgggccg aacccgctcg tctggctaag atcggccgca gcgatcgcat ccatagcctc 10141 cgcgaccggt tgtagaacag cgggcagttc ggtttcaggc aggtcttgca acgtgacacc 10201 ctgtgcacgg cgggagatgc aataggtcag gctctcgcta aactccccaa tgtcaagcac

10261 ttccggaatc gggagcgcgg ccgatgcaaa gtgccgataa acataacgat ctttgtagaa

10321 accatcggcg cagctattta cccgcaggac atatccacgc cctcctacat cgaagctgaa

10381 agcacgagat tcttcgccct ccgagagctg catcaggtcg gagacgctgt cgaacttttc

10441 gatcagaaac ttctcgacag acgtcgcggt gagttcaggc tttttcatat ctcattgccc

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维真生物-如何阅读基因载体图谱

如何阅读基因载体图谱 基因载体是基因工程的核心,也是基因治疗中强有力的生物工具,我们先来认识和阅读载体图谱吧。 一、载体分类及载体组成元件 载体分类 1、按属性分类:病毒载体和非病毒载体 病毒载体是一种常见的分子生物学工具,可将遗传物质带入细胞,原理是利用病毒具有传送其基因组进入目的细胞,进行感染的分子机制。可发生于完整活体或是细胞培养中。可应用于基础研究、基因疗法或疫苗。用于基因治疗和疫苗的病毒载体应具备以下基本条件: (1)携带外源基因并能包装成病毒颗粒; (2)介导外源基因的转移和表达; (3)对人体不致病; (4)在环境中不会引起增殖和传播。 非病毒载体一般是指质粒DNA。 2、按进入受体细胞的类型分类:原核载体、真核载体、穿梭载体(含原核和真核2个复制子,能在原核和真核细胞中复制,并可以在真核细胞中有效表达)。 3、按功能分类:克隆载体、表达载体 克隆载体:具有克隆载体的基本元件(Ori,Ampr,MCS等),可以携带DNA片段或外源基因进入受体细胞并克隆和大量扩增DNA片段(外源基因)的载体。 表达载体:克隆载体中加入一些与表达调控(具有转录/翻译所必需的DNA顺序)有关的元件即成为表达载体。 载体组成元件 1、复制起始位点Ori:即控制复制起始的位点。Ori的箭头指复制方向,其他元件标注的箭头多指转录方向(正向)。 2、抗生素抗性基因:可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+ (1)Ampr:水解β-内酰胺环,解除氨苄的毒性。

(2)tetr :可以阻止四环素进入细胞。 (3)camr:生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。 (4)neor(kanr):氨基糖苷磷酸转移酶,使G418(卡那霉素衍生物)失活。 (5)hygr:使潮霉素β失活。 3、多克隆位点:MCS克隆携带外源基因片段,它具有多个限制酶的单一切点,便于外源基因的插入。如果在这些位点外有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活,便于筛选。决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。还要再看外源DNA插入片段大小。质粒一般只能容纳小于10kb的外源DNA片段。一般来说,外源DNA片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。 4、P/E:启动子/增强子 5、Terms:终止信号 6、加poly(A)信号:可以起到稳定mRNA作用 示例阅读载体: pENTER载体 1)human ORF + pENTER载体 2) CMV启动子,T7启动子 3) ORF的C端融合了Flag和His tag 4) 多克隆位点,常用AsisI 和 MluI(人源基因上不常见的)

《时间序列分析》案例

《时间序列分析》案例案例名 称:时间序列分析在经济预测中的应用内容要 求:确定性与随机性时间序列之比较设计作 者:许启发,王艳明 设计时 间:2003年8月

案例四:时间序列分析在经济预测中的应用 一、案例简介 为了配合《统计学》课程时间序列分析部分的课堂教学,提高学生运用统计分析方法解决实际问题的能力,我们组织了一次案例教学,其内容是:对烟台市的未来经济发展状况作一预测分析,数据取烟台市1949—1998年国内生产总值(GDP)的年度数据,并以此为依据建立预测模型,对1999年和2000年的国内生产总值作出预测并检验其预测效果。国内生产总值是指一个国家或地区所有常住单位在一定时期内生产活动的最终成果,是反映国民经济活动最重要的经济指标之一,科学地预测该指标,对制定经济发展目标以及与之相配套的方针政策具有重要的理论与实际意义。在组织实施时,我们首先将数据资料印发给学生,并讲清本案例的教学目的与要求,明确案例所涉及的教学内容;然后给学生一段时间,由学生根据资料,运用不同的方法进行预测分析,并确定具体的讨论日期;在课堂讨论时让学生自由发言,阐述自己的观点;最后,由主持教师作点评发言,取得了良好的教学效果。 经济预测是研究客观经济过程未来一定时期的发展变化趋势,其目的在于通过对客观经济现象历史规律的探讨和现状的研究,求得对未来经济活动的了解,以确定社会经济活动的发展水平,为决策提供依据。 时间序列分析预测法,首先将预测目标的历史数据按照时间的先后顺序排列,然后分析它随时间的变化趋势及自身的统计规律,外推得到预测目标的未来取值。它与回归分析预测法的最大区别在于:该方法可以根据单个变量的取值对其自身的变动进行预测,无须添加任何的辅助信息。 本案例的最大特色在于:它汇集了统计学原理中的时间序列分析这一章节的所有知识点,通过本案例的教学,可以把不同的时间序列分析方法进行综合的比较,便于学生更好地掌握本章的内容。 二、案例的目的与要求 (一)教学目的 1.通过本案例的教学,使学生认识到时间序列分析方法在实际工作中应用的必要性和可能性; 2.本案例将时间序列分析中的水平指标、速度指标、长期趋势的测定等内容有机的结合在一起,以巩固学生所学的课本知识,深化学生对课本知识的理解; 3.本案例是对烟台市的国内生产总值数据进行预测,通过对实证结果的比较和分析,使学生认识到对同一问题的解决,可以采取不同的方法,根据约束条件,从中选择一种合适的预测方法; 4.通过本案例的教学,让学生掌握EXCEL软件在时间序列分析中的应用,对统计、计量分析软件SPSS或Eviews等有一个初步的了解; 5.通过本案例的教学,有助于提高学生运用所学知识和方法分析解决问题的能力、合作共事的能力和沟通交流的能力。 (二)教学要求 1.学生必须具备相应的时间序列分析的基本理论知识; 2.学生必须熟悉相应的预测方法和具备一定的数据处理能力; 3.学生以主角身份积极地参与到案例分析中来,主动地分析和解决案例中的问题; 4.在提出解决问题的方案之前,学生可以根据提供的样本数据,自己选择不同的统计分析方法,对这一案例进行预测,比较不同预测方法的异同,提出若干可供选择的方案; 5.学生必须提交完整的分析报告。分析报告的内容应包括:选题的目的及意义、使用数据的特征及其说明、采用的预测方法及其优劣、预测结果及其评价、有待于进一步改进的思路或需要进一步研究的问题。 三、数据搜集与处理 时间序列数据按照不同的分类标准可以划分为不同的类型,最常见的有:年度数据、季度数据、月度数据。本案例主要讨论对年度数据如何进行预测分析。考虑到案例设计时的侧重点,本案例只是对烟

如何阅读分析质粒图谱

如何阅读分析质粒图谱 日期:2012-04-18来源:未知作者:xilu点击:次 如何阅读分析质粒图谱 载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。 一个合格质粒的组成要素 1. 复制起始位点Ori即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。 2. 抗生素抗性基因可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+ 3. 多克隆位点MCS 克隆携带外源基因片段 4. P/E 启动子/增强子 5. Terms 终止信号 6. 加poly(A)信号可以起到稳定mRNA作用 如何阅读质粒图谱 第一步:首先看Ori的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒) 所谓穿梭质粒是指一类人工构建的具有两种不同复制起点和选择标记,因而可以在两种不同类群宿主中存活和复制的质粒载体。此概念不仅用于不同的微生物菌群之间,也可以推广到真核生物表达载体的构建,如用于枯草的pBE2、酵母的pPIC9K、哺乳动物表达载体pMT2 和用于植物细胞的Ti 质粒。这些穿梭质粒不仅可以在大肠杆菌中复制扩增,也可以在相应的枯草、酵母、动物或植物细胞中扩增和表达。这样利于对质粒的分子生物学操作和大量制备。 第二步:再看筛选标记,如抗性,决定使用什么筛选标记。 1. Ampr水解β-内酰胺环,解除氨苄的毒性。 2. tetr可以阻止四环素进入细胞。 3. camr生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。

4. neor(kanr) 氨基糖苷磷酸转移酶使G418(长那霉素衍生物)失活 5. hygr使潮霉素β失活。 第三步:看多克隆位点(MCS)。它具有多个限制酶的单一切点。便于外源基因的插入。如果在这些位点外有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活,而便于筛选。决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。 第四步:再看外源DNA插入片段大小。质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。一般来说,外源DNA片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。 第五步:是否含有表达系统元件,即启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号。这是用来区别克隆载体与表达载体。克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。 启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号

致1303家长的一封信

致1303班家长们的一封信 亲爱的家长们,我是我们班的英语老师Miss Huang。平时跟大家在群里交流也比较多,但由于大家时间上的不一致并不是每位家长都能交流上。总想着要给大家写一封信解答下大家在群里反映过的一些忧虑,但一直由于负责四个班英语教学和一个班副班主任的工作教学任务比较重加上学校活动比较多而迟迟耽搁未能下笔。本想借着家长会跟大家交流的,而四个班的几分钟交流实在难以解决实际问题,我现在就家长会没能进入各个班跟大家反映孩子们的学习情况向各位家长表达歉意,今天我就想就作业、课堂表现、和考试三个方面反映下孩子们的英语学习情况。 一.作业方面 绝大部分孩子能够按时按量的完成每次作业。其中作业态度尤其认真和作业质量尤其过硬的有向熙敬、王博艺、孟想、龚蓝溪、张涵雅、邓慧绘、邓思泽、曹梓瑶、罗唯、胡诗颖、彭轩凡、王思敏、黄小宸、黄可颐、谭皓峰、程翰哲。这些优秀作业有一些共同的特征,一孩子学习习惯好,自己的事自己做,二自己热爱英语,三家长严格要求、认真督促。其实只要具备其中一个特点,孩子们自己的作业足以保证优质优量。其他孩子作业也基本达标,缺量或者有小错误的也都会做好补充和更改,但也有一些孩子似乎把作业当做老师的任务,一次一次缺做,老师提醒也不能及时补充及时交给老师批阅,而需要老师守候在他身边,享受被监督的感觉。其实后面的这种情况很多家长似乎也不得而知,因为我常常第二次批改作业时,发现孩子前面的作业没有更正,我的评语或者反馈依然孤孤单单的缩在孩子本子的一角,所以,当您的孩子同时缺少以上三个特点时,亲爱的家长,我们是否也能想想我们能帮助孩子做点什么? 一.课堂表现 我们班的孩子较平行班的孩子来说比较活跃。有些孩子在课堂上持续表现非常优秀如彭煜航、向熙敬、王思敏、曹梓瑶、胡宇轩、黄可颐、黄小宸、张涵雅、邓慧绘,也会有相当一部分孩子中间突然变得积极爱思考爱答疑如廖子琦、孟想、王博艺、龚蓝溪、彭茉涵、汪洋、羊顺滋、李睿、杨家望、匡曙、方振远、龙哲轩、左想、蔡梓琦,但他们好似六月的娃娃天,阴晴不定。同时有一些孩子开学时特别突出的随着新秀的涌现他们逐渐淡出江湖,如罗唯、卿雅琴、邓思泽、曹泽雅、刘宸汐、黄若榛、李佳霖。还有一些孩子不错但比较害羞需要锻炼胆量如王博艺、胡诗颖、罗唯、邓思泽、周佳霖,总的来说我们的孩子刚从幼儿园进入一年级,还没完全从轻轻松松的玩耍中进入认认真真的学习状态,也很难感受到自己的责任和义务,学习目的不明确课堂表现周期性变化也很正常,关键是老师和家长们正确的引导,协助孩子养成良好的学习习惯。当您的孩子快要出现松懈的苗头要赶快打一剂强心针,您可以引入竞争机制,同龄孩子榜样示范,和自己赛跑,当然最好有一定的记录和参照,我们班级上有评分板,您也可以给自己的孩子建立评分板,每天放学让孩子自己总结一天各类课堂表现、作业完成、同学关系、吃饭情况、路队情况、做操情况、午休情况,鼓励孩子自己给自己打分或者贴笑脸和哭脸,这有利于培养孩子的客观性公正性,培养孩子的自我检查和判断力,关键是二字——坚持,孩子需要坚持,更需要我们坚持做出的表率。 二.考试 这次期中考试主要是以考查的形式进行的,全方位的考查孩子们在口语方面、听力方面和笔试方面的英语综合运用能力。其实这不仅仅是英语考试,它也考查培养孩子的语言表达能力,因为孩子们要说;锻炼孩子们的胆量,因为孩子们要上讲台一个人面对老师进行三道口语测试,他必须克服恐惧心理;锻炼孩子独立分析理解和审查的能力,因为孩子需要根据题目独自进行解题判断,写完后还要自主检查发现并补充遗漏更正错误。所以我们亲爱的家长您以后是否还只是紧紧盯住孩子的分数不放,还是能够看到试卷里面隐藏的小玄机呢?这

Eviews时间序列分析实例

Eviews 时间序列分析实例 时间序列是市场预测中经常涉及的一类数据形式, 绍。通过第七章的学习,读者了解了什么是时间序列, 、指数平滑法实例 所谓指数平滑实际就是对历史数据的加权平均。它可以用于任何一种没有明显函数规 律,但确实存在某种前后关联的时间序列的短期预测。 由于其他很多分析方法都不具有这种 特点,指数平滑法在时间序列预测中仍然占据着相当重要的位置。 (―)一次指数平滑 一次指数平滑又称单指数平滑。它最突出的优点是方法非常简单, 甚至只要样本末期的 平滑值,就可以得到预测结果。 一次指数平滑的特点是: 能够跟踪数据变化。 这一特点所有指数都具有。 预测过程中添 加最新的样本数据后, 新数据应取代老数据的地位, 老数据会逐渐居于次要的地位, 直至被 淘汰。这样,预测值总是反映最新的数据结构。 一次指数平滑有局限性。第一,预测值不能反映趋势变动、季节波动等有规律的变动; 第二,这种方法多适用于短期预测, 而不适合作中长期的预测;第三, 由于预测值是历史数 据的均值,因此与实际序列的变化相比有滞后现象。 指数平滑预测是否理想,很大程度上取决于平滑系数。 Eviews 提供两种确定指数平滑 系数的方法:自动给定和人工确定。 选择自动给定,系统将按照预测误差平方和最小原则自 动确定系数。如果系数接近 1,说明该序列近似纯随机序列,这时最新的观测值就是最理想 的预测值。 出于预测的考虑,有时系统给定的系数不是很理想, 用户需要自己指定平滑系数值。平 滑系数取什么值比较合适呢? 一般来说,如果序列变化比较平缓,平滑系数值应该比较小, 比如小于0.1; 如果序列变化比较剧烈, 平滑系数值可以取得大一些, 如0.3?0.5。若平滑系 数值大于0.5才能跟上序列的变化,表明序列有很强的趋势,不能采用一次指数平滑进行预 测。 [例1]某企业食盐销售量预测。现在拥有最近连续 30个月份的历史资料(见表 I ), 试预测下一月份销售量。 表 某企业食盐销售量 单位:吨 解:使用对数据进行分析,第一步是建立工作文件和录入数据。有关操作在本 理和一些分析实例。本节的主要内容是说明如何使用 Eviews 软件进行分析。 本书第七章对它进行了比较详细的介 并接触到有关时间序列分析方法的原

如何阅读质粒图谱(更新版本)

如何阅读质粒图谱 最近由于实验需要,需要查阅载体图谱,到园子里搜罗一番,发现虽然有人问载体图谱阅读的问题,也有前辈回答,但都不详细,借自己也在琢磨这个问题的机会,将我学到的东西整理一下,于 大家分享。 载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA是一种新的非病毒转基因载体。 一个合格质粒的组成要素 #复制起始位点Oril 即控制复制起始的位点。原核生物DNA分子中只有一个复制起始点。而真核生物DNA分子有多个复制起始位点。 #抗生素抗性基因可以便于加以检测,如Amp+l ,Kan+ #多克隆位点MCS 克隆携带外源基因片段l #P/E 启动子/增强子l #Termsl 终止信号 #加poly(A)信号l 可以起到稳定mRNA作用 二、如何阅读质粒图谱 第一步:首先看Ori的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒) 第二步:再看筛选标记,如抗性,决定使用什么筛选标记。 (1)Ampr 水解β-内酰胺环,解除氨苄的毒性。 (2)tetr 可以阻止四环素进入细胞。 (3)camr 生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。 (4)neor(kanr)氨基糖苷磷酸转移酶使G418(卡那霉素衍生物)失活 (5)hygr 使潮霉素β失活。 第三步:看多克隆位点(MCS)。它具有多个限制酶的单一切点。便于外源基因的插入。如果在这些位点外有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活,而便于筛选。决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。 第四步:再看外源DNA插入片段大小。质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。一般来说,外源DNA片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。 第五步:是否含有表达系统元件,即启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号。这是用来区别克隆载体与表达载体。克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。 启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号 #启动子-促进DNA转录的DNA顺序,这个DNA区域常在基因或操纵子编码顺序的上游,是DNA分子上可以与RNApol特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。 #增强子/沉默子-为真核基因组(包括真核病毒基因组)中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。其作用与增强子所在的位置或方向无关。即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。/沉默子-负增强子,负调控序列。 #核糖体结合位点/起始密码/SD序列(Rbs/AGU/SDs):mRNA有核糖体的两个结合位点,对于原核而言是AUG(起始密码)和SD序列。l #转录终止顺序(终止子)/翻译终止密码子:结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA的保守序列,此位点down-stream有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。

Eviews时间序列分析实例.

Eviews时间序列分析实例 时间序列是市场预测中经常涉及的一类数据形式,本书第七章对它进行了比较详细的介绍。通过第七章的学习,读者了解了什么是时间序列,并接触到有关时间序列分析方法的原理和一些分析实例。本节的主要内容是说明如何使用Eviews软件进行分析。 一、指数平滑法实例 所谓指数平滑实际就是对历史数据的加权平均。它可以用于任何一种没有明显函数规律,但确实存在某种前后关联的时间序列的短期预测。由于其他很多分析方法都不具有这种特点,指数平滑法在时间序列预测中仍然占据着相当重要的位置。 (-)一次指数平滑 一次指数平滑又称单指数平滑。它最突出的优点是方法非常简单,甚至只要样本末期的平滑值,就可以得到预测结果。 一次指数平滑的特点是:能够跟踪数据变化。这一特点所有指数都具有。预测过程中添加最新的样本数据后,新数据应取代老数据的地位,老数据会逐渐居于次要的地位,直至被淘汰。这样,预测值总是反映最新的数据结构。 一次指数平滑有局限性。第一,预测值不能反映趋势变动、季节波动等有规律的变动;第二,这种方法多适用于短期预测,而不适合作中长期的预测;第三,由于预测值是历史数据的均值,因此与实际序列的变化相比有滞后现象。 指数平滑预测是否理想,很大程度上取决于平滑系数。Eviews提供两种确定指数平滑系数的方法:自动给定和人工确定。选择自动给定,系统将按照预测误差平方和最小原则自动确定系数。如果系数接近1,说明该序列近似纯随机序列,这时最新的观测值就是最理想的预测值。 出于预测的考虑,有时系统给定的系数不是很理想,用户需要自己指定平滑系数值。平滑系数取什么值比较合适呢?一般来说,如果序列变化比较平缓,平滑系数值应该比较小,比如小于0.l;如果序列变化比较剧烈,平滑系数值可以取得大一些,如0.3~0.5。若平滑系数值大于0.5才能跟上序列的变化,表明序列有很强的趋势,不能采用一次指数平滑进行预测。 [例1]某企业食盐销售量预测。现在拥有最近连续30个月份的历史资料(见表l),试预测下一月份销售量。 表1 某企业食盐销售量单位:吨 解:使用Eviews对数据进行分析,第一步是建立工作文件和录入数据。有关操作在本

质粒pCAMBIA 1303

20: AF234299 Binary vector pCAMBIA-1303, complete sequence PubMed, Protein, Related Sequences, Taxonomy LOCUS AF234299 12361 bp DNA circular SYN 24-APR-2000 DEFINITION Binary vector pCAMBIA-1303, complete sequence. ACCESSION AF234299 VERSION AF234299.1 GI:7638078 KEYWORDS . SOURCE Binary vector pCAMBIA-1303. 12361 ecor1= 11548 nhe1 2540 5981 ORGANISM Binary vector pCAMBIA-1303 artificial sequence; vectors. REFERENCE 1 (sites) AUTHORS Hajdukiewicz,P., Svab,Z. and Maliga,P. TITLE The small, versatile pPZP family of Agrobacterium binary vectors for plant transformation JOURNAL Plant Mol. Biol. 25 (6), 989-994 (1994) MEDLINE 95002787 PUBMED 7919218 REFERENCE 2 (bases 1 to 12361) AUTHORS Roberts,C., Rajagopal,S., Smith,L.M., Nguyen,T.A., Yang,W., Nugrohu,S., Ravi,K.S., Vijayachandra,K., Harcourt,R.L., Dransfield,L., Desamero,N., Slamet,I., Hadjukiewicz,P., Svab,Z., Maliga,P., Mayer,J.E., Keese,P.K., Kilian,A. and Jefferson,R.A. TITLE A comprehensive set of modular vectors for advanced manipulations and efficient transformation of plants JOURNAL Unpublished REMARK Full description of constructs REFERENCE 3 (bases 1 to 12361) AUTHORS Roberts,C., Rajagopal,S., Smith,L.M., Nguyen,T.A., Yang,W., Nugrohu,S., Ravi,K.S., Vijayachandra,K., Harcourt,R.L., Dransfield,L., Desamero,N., Slamet,I., Hadjukiewicz,P., Svab,Z., Maliga,P., Mayer,J.E., Keese,P.K., Kilian,A. and Jefferson,R.A. TITLE Direct Submission JOURNAL Submitted (15-FEB-2000) CAMBIA, Clunies Ross St, Black Mountain / GPO Box 3200, Canberra, ACT 2601, Australia FEATURES Location/Qualifiers source 1..12361 /organism="Binary vector pCAMBIA-1303" /db_xref="taxon:118391" GUS GFP 2.(1807).2569 /note="gusA (N358Q) - mgfp5* gene fusion; His6" /codon_start=1 /produ11ct="GUSA (N358Q)/MGFP5 fusion, hexaHis tagged" /protein_id="AAF65347.1" /db_xref="GI:7638079" /translation="MVDLTSLRPVETPTREIKKLDGLWAFSLDRENCGIDQRWWESAL QESRAIAVPGSFNDQFADADIRNYAGNVWYQREVFIPKGWAGQRIVLRFDAVTHYGKV WVNNQEVMEHQGGYTPFEADVTPYVIAGKSVRITVCVNNELNWQTIPPGMVITDENGK KKQSYFHDFFNYAGIHRSVMLYTTPNTWVDDITVVTHVAQDCNHASVDWQVVANGDVS VELRDADQQVVATGQGTSGTLQVVNPHLWQPGEGYLYELCVTAKSQTECDIYPLRVGI RSVAVKGQQFLINHKPFYFTGFGRHEDADLRGKGFDNVLMVHDHALMDWIGANSYRTS HYPYAEEMLDWADEHGIVVIDETAAVGFQLSLGIGFEAGNKPKELYSEEAVNGETQQA HLQAIKELIARDKNHPSVVMWSIANEPDTRPQGAREYFAPLAEATRKLDPTRPITCVN VMFCDAHTDTISDLFDVLCLNRYYGWYVQSGDLETAEKVLEKELLAWQEKLHQPIIIT EYGVDTLAGLHSMYTDMWSEEYQCAWLDMYHRVFDRVSAVVGEQVWNFADFATSQGIL RVGGNKKGIFTRDRKPKSAAFLLQKRWTGMNFGEKPQQGGKQASKGEELFTGVVPILV ELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTFSYGVQCFSRY PDHMKRHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKE DGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKANFKTRHNIEDGGVQLADHYQQNTPIGD GPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITHGMDELYKASHHHHHHV" misc_feature 1088..1090 /note="N358Q glycosylation mutation" misc_feature 2598..2850 /note="nos (nopaline synthase) 3'UTR (polyA signal)" misc_feature 2888..2913 /note="right border T-DNA repeat"

质粒图谱的阅读方法

---------------------------------------------------------------最新资料推荐------------------------------------------------------ 质粒图谱的阅读方法 质粒图谱的阅读方法载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒 DNA 是一种新的非病毒转基因载体。 一、一个合格质粒的组成要素 a. 复制起始位点 Ori 即控制复制起始的位点。 原核生物 DNA分子中只有一个复制起始点。 而真核生物 DNA分子有多个复制起始位点。 b. 抗生素抗性基因可以便于加以检测,如 Amp+ ,Kan+ c. 多克隆位点 MCS 克隆携带外源基因片段 d. P/E 启动子/增强子 e. Terms 终止信号 f. 加 poly(A)信号可以起到稳定 mRNA 作用二、如何阅读质粒图谱第一步: 首先看 Ori 的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒)。 第二步: 再看筛选标记,如抗性,决定使用什么筛选标记。 (1) Ampr 水解-内酰胺环,解除氨苄的毒性。 (2) tetr 可以阻止四环素进入细胞。 (3) camr 生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。 (4) neor(kanr)氨基糖苷磷酸转移酶使 G418(长那霉素衍生物)失活(5) hygr 使潮霉素失活。 第三步: 1 / 6

看多克隆位点(MCS)。 它具有多个限制酶的单一切点。 便于外源基因的插入。 如果在这些位点外有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活,而便于筛选。 决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。 第四步: 再看外源 DNA 插入片段大小。 质粒一般只能容纳小于 10Kb 的外源 DNA 片段。 一般来说,外源DNA 片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。 第五步: 是否含有表达系统元件,即启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号。 这是用来区别克隆载体与表达载体。 克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。 选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。 启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号 a. 启动子-促进 DNA 转录的 DNA 顺序,这个 DNA 区域常在基因或操纵子编码顺序的上游,是 DNA 分子上可以与 RNApol 特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。 b. 增强子/沉默子-为真核基因组(包括真核病毒基因组)

[课程]Eviews时间序列分析实例

[课程]Eviews时间序列分析实例 Eviews时间序列分析实例 时间序列是市场预测中经常涉及的一类数据形式,本书第七章对它进行了比较详细的介绍。通过第七章的学习,读者了解了什么是时间序列,并接触到有关时间序列分析方法的原理和一些分析实例。本节的主要内容是说明如何使用Eviews软件进行分析。 一、指数平滑法实例 所谓指数平滑实际就是对历史数据的加权平均。它可以用于任何一种没有明显函数规律,但确实存在某种前后关联的时间序列的短期预测。由于其他很多分析方法都不具有这种特点,指数平滑法在时间序列预测中仍然占据着相当重要的位置。 (,)一次指数平滑 一次指数平滑又称单指数平滑。它最突出的优点是方法非常简单,甚至只要样本末期的平滑值,就可以得到预测结果。 一次指数平滑的特点是:能够跟踪数据变化。这一特点所有指数都具有。预测过程中添加最新的样本数据后,新数据应取代老数据的地位,老数据会逐渐居于次要的地位,直至被淘汰。这样,预测值总是反映最新的数据结构。 一次指数平滑有局限性。第一,预测值不能反映趋势变动、季节波动等有规律的变动;第二,这种方法多适用于短期预测,而不适合作中长期的预测;第三,由于预测值是历史数据的均值,因此与实际序列的变化相比有滞后现象。 指数平滑预测是否理想,很大程度上取决于平滑系数。Eviews提供两种确定指数平滑系数的方法:自动给定和人工确定。选择自动给定,系统将按照预测误差平方和最小原则自动确定系数。如果系数接近1,说明该序列近似纯随机序列,这时最新的观测值就是最理想的预测

值。 出于预测的考虑,有时系统给定的系数不是很理想,用户需要自己指定平滑系数值。平滑系数取什么值比较合适呢,一般来说,如果序列变化比较平缓,平滑系数值应该比较小,比如小于0.l;如果序列变化比较剧烈,平滑系数值可以取得大一些,如0.3,0.5。若平滑系数值大于0.5才能跟上序列的变化,表明序列有很强的趋势,不能采用一次指数平滑进行预测。 〔例1〕某企业食盐销售量预测。现在拥有最近连续30个月份的历史资料(见表l),试预测下一月份销售量。 表1 某企业食盐销售量单位:吨 解:使用Eviews对数据进行分析,第一步是建立工作文件和录入数据。有关操作在本章第一节中已经阐明,这里不再赘述。假设已经建立工作文件,并生成了一个样本期为l,30的序列,命名为SALES。序列SALES中包含例1中需要分析的数据。 第二步,绘制序列图形。在序列对象窗口中,点击View?Line Graph。 屏幕显示图1所示图形。 图1 某企业近30个月的销售量动态图 从图1中可以看出,这个企业近30个月的销售量并不存在明显的趋势,并且没有明显的季节趋势。因此,从直观上判断可以采用一次指数平滑法对企业下个月的销售量进行预测。 第三步,扩大样本期。本例要求对下一个月的销售量进行预测,而工作文件的样本期是1,30,在Eviews中要求先更改样本期。更改样本期的操作在本章第一节已经讲过,这里将样本期改为l,31。

16_CFR_1303法规 - 中文

PART 1303—BAN OF LEAD-CONTAINING PAINT AND CERTAIN CONSUMER PRODUCTS BEARING LEAD-CONTAINING PAINT 1303部分--禁用含铅油漆以及某些使用含铅油漆的消费品 1303.1 Scope and application. 适用范围 1303.2 Definitions. 定义 1303.3 Exemptions. 豁免 1303.4 Banned hazardous products. 禁止使用的有害产品 1303.5 Findings. 依据 § 1303.1 Scope and application. 1303.1 适用范围 (a) In this part 1303, the Consumer Product Safety Commission declares that paint and similar surface-coating materials for consumer use that contain lead or lead compounds and in which the lead content (calculated as lead metal) is in excess of 0.06 percent of the weight of the total nonvolatile content of the paint or the weight of the dried paint film (which paint and similar surface-coating materials are referred to hereafter as ‘‘lead-containing paint’’) are banned hazardous products under sections 8 and 9 of the Consumer Product Safety Act (CPSA), 15 U.S.C. 2057, 2058. (See parts 1145.1 and 1145.2 for the Commission’s finding under section 30(d) of the Consumer Product Safety Act (CPSA) that it is in the public interest to regulate lead-containing paint and certain consumer products bearing such paint under the CPSA.) The following consumer products are also declared to be banned hazardous products: A.在该1303部分,消费品安全委员会声明:依照《消费品安全法案》(CPSA)的第八 部分和第九部分, 15 U.S.C. 2057, 2058.(参考1145.1和1145.2 委员会在《消费品安全法案》(CPSA)30(d)中的依据,根据公众利益,所规范的CPSA下的含铅

1303第三节船舶索具及保养

第三节船舶索具及保养 0311. A fiber towing hawser is readied for service by ___C___.[89] 把纤维缆准备好进行拖带是指() A.Spooling it on a winch cathead 把它卷在绞车的滚筒上B.Coiling it in a counterclockwise direction on the fantail在扇形尾甲板上把它按逆时针方向盘起来 C.Faking it on deck in a fore and aft direction 把它在甲板上纵向排好 D.Spooling it on a reel lying on its side to prevent rolling 把它卷在边上的滚轴上以防滑出去 0313. A long splice in a line ___A___. 结绳索上的长插接() A.is used in running rigging 用于连接吊货索B.doubles the size of the line 直径比原来增大一倍 C.is only used on fiber rope 仅用于纤维绳D.is very weak 很弱0314. A mooring line leading at nearly right angles to the keel is a __D____. 系船缆中,出缆方向几乎与龙骨成直角的的缆绳是() A.Spring line 倒缆B.Bow line 头缆C.Stern line 尾缆D.Breast line 横缆 0321. A wire rope that has been overstrained will show ___B___.[279] 过分受的钢丝会显现出() A.A bulge in the wire where the strain occurred 受力点会突起B.A decrease in diameter where the strain occurred 当受力时直径变细 C.A kink in the wire where the strain occurred 受力时会打结D.No visible effects of an overstrain 过分受力外观无明显变化0322. All wire rope used in shipboard cargo gear must be identified and described in a certificate.The certificate shall certify all of the following EXCEPT the ___C___.[333] 船上用做吊货索的所有钢丝绳都应签发一本证书加以识别,并在证书中对钢丝绳加以说明。下列各项中,哪一项不是该证书的认证项目()A.Date of the test 测试日期 B.Load at which a test sample broke 样品试验的破断强度C.Name of the vessel 船名 D.Number of strands and of wires in each strand 股数及每股丝数

《时间序列分析》案例04

《时间序列分析》案例 案例名称:时间序列分析在经济预测中应用内容要求:确定性与随机性时间序列之比较设计作者:许启发,王艳明 设计时间:2003年8月

案例四:时间序列分析在经济预测中应用 一、案例简介 为了配合《统计学》课程时间序列分析部分课堂教学,提高学生运用统计分析方法解决实际问题能力,我们组织了一次案例教学,其内容是:对烟台市未来经济发展状况作一预测分析,数据取烟台市1949—1998年国内生产总值(GDP)年度数据,并以此为依据建立预测模型,对1999年和2000年国内生产总值作出预测并检验其预测效果。国内生产总值是指一个国家或地区所有常住单位在一定时期内生产活动最终成果,是反映国民经济活动最重要经济指标之一,科学地预测该指标,对制定经济发展目标以及与之相配套方针政策具有重要理论与实际意义。在组织实施时,我们首先将数据资料印发给学生,并讲清本案例教学目与要求,明确案例所涉及教学内容;然后给学生一段时间,由学生根据资料,运用不同方法进行预测分析,并确定具体讨论日期;在课堂讨论时让学生自由发言,阐述自己观点;最后,由主持教师作点评发言,取得了良好教学效果。 经济预测是研究客观经济过程未来一定时期发展变化趋势,其目在于通过对客观经济现象历史规律探讨和现状研究,求得对未来经济活动了解,以确定社会经济活动发展水平,为决策提供依据。 时间序列分析预测法,首先将预测目标历史数据按照时间先后顺序排列,然后分析它随时间变化趋势及自身统计规律,外推得到预测目标未来取值。它与回归分析预测法最大区别在于:该方法可以根据单个变量取值对其自身变动进行预测,无须添加任何辅助信息。 本案例最大特色在于:它汇集了统计学原理中时间序列分析这一章节所有知识点,通过本案例教学,可以把不同时间序列分析方法进行综合比较,便于学生更好地掌握本章内容。 二、案例目与要求 (一)教学目 1.通过本案例教学,使学生认识到时间序列分析方法在实际工作中应用必要性和可能性; 2.本案例将时间序列分析中水平指标、速度指标、长期趋势测定等内容有机结合在一起,以巩固学生所学课本知识,深化学生对课本知识理解; 3.本案例是对烟台市国内生产总值数据进行预测,通过对实证结果比较和分析,使学生认识到对同一问题解决,可以采取不同方法,根据约束条件,从中选择一种合适预测方法; 4.通过本案例教学,让学生掌握EXCEL软件在时间序列分析中应用,对统计、计量分析软件SPSS或Eviews等有一个初步了解; 5.通过本案例教学,有助于提高学生运用所学知识和方法分析解决问题能力、合作共事能力和沟通交流能力。 (二)教学要求 1.学生必须具备相应时间序列分析基本理论知识; 2.学生必须熟悉相应预测方法和具备一定数据处理能力; 3.学生以主角身份积极地参与到案例分析中来,主动地分析和解决案例中问题; 4.在提出解决问题方案之前,学生可以根据提供样本数据,自己选择不同统计分析方法,对这一案例进行预测,比较不同预测方法异同,提出若干可供选择方案; 5.学生必须提交完整分析报告。分析报告内容应包括:选题目及意义、使用数据特征及其说明、采用预测方法及其优劣、预测结果及其评价、有待于进一步改进思路或需要进一步研究问题。 三、数据搜集与处理 时间序列数据按照不同分类标准可以划分为不同类型,最常见有:年度数据、季度数据、月度

表达载体的构建方法及步骤

表达载体的构建方法及步骤 一、载体的选择及如何阅读质粒图谱 目前,载体主要有病毒和非病毒两大类,其中质粒DNA 是一种新的非病毒转基因载体。 一个合格质粒的组成要素: (1)复制起始位点Ori 即控制复制起始的位点。原核生物DNA 分子中只有一个复制起始点。而 真核生物DNA 分子有多个复制起始位点。 (2)抗生素抗性基因可以便于加以检测,如Amp+ ,Kan+ (3)多克隆位点MCS 克隆携带外源基因片段 (4)P/E 启动子/增强子 (5)Terms 终止信号 (6)加poly(A)信号可以起到稳定mRNA 作用 选择载体主要依据构建的目的,同时要考虑载体中应有合适的限制酶切位点。如果构建的目 的是要表达一个特定的基因,则要选择合适的表达载体。 载体选择主要考虑下述3点: 【1】构建DNA 重组体的目的,克隆扩增/基因表达,选择合适的克隆载体/表达载体。 【2】.载体的类型: (1)克隆载体的克隆能力-据克隆片段大小(大选大,小选小)。如<10kb 选

质粒。 (2)表达载体据受体细胞类型-原核/真核/穿梭,E.coli/哺乳类细胞表达载体。(3)对原核表达载体应该注意:选择合适的启动子及相应的受体菌,用于表达真核蛋白质时注意克服4个困难和阅读框错位;表达天然蛋白质或融合蛋白作为相应载体的参考。 【3】载体MCS 中的酶切位点数与组成方向因载体不同而异,适应目的基因与载体易于链接,不能产生阅读框架错位。 综上所述,选用质粒(最常用)做载体的5点要求: (1)选分子量小的质粒,即小载体(1-1.5kb)→不易损坏,在细菌里面拷贝数也多(也有大载 体); (2)一般使用松弛型质粒在细菌里扩增不受约束,一般10个以上的拷贝,而严谨型质粒<10个。 (3)必需具备一个以上的酶切位点,有选择的余地; (4)必需有易检测的标记,多是抗生素的抗性基因,不特指多位Ampr(试一试)。 (5)满足自己的实验需求,是否需要包装病毒,是否需要加入荧光标记,是否需要加入标签蛋白,是否需要真核抗性(如Puro、G418)等等。 无论选用哪种载体,首先都要获得载体分子,然后采用适当的限制酶将载体DNA 进行切割,获得线性载体分子,以便于与目的基因片段进行连接。 如何阅读质粒图谱 第一步:首先看Ori 的位置,了解质粒的类型(原核/真核/穿梭质粒)

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