新版Pubmed检索攻略

新版Pubmed检索攻略

——日读一帖，解螺旋大V团队伴你科研路

【科研热点】让你时间比别人花的少、知道的比他早！【基金专栏】国自然等各项基金独到经验见解【SCI 专栏】从开始到接收全程tips【实验技能】这么棒快告诉你老板！关注我们，为您的科研路提速

第一章PubMed概述

笔者最近接到很多同学的微信，说希望看到pubmed的搜索教程，然后就在网上进行了检索，发现网上的教程都是老版的pubmed，比如还有limit按钮等等，其实pubmed改版之后已经变得更加简洁，就行百度搜索框一样，只有一个框和go。而以前的5个功能按钮早早已经删除，在你搜索结果中才可以显示，在我们搜索的左侧。那么下面我们就开始学习学习pubmed的搜索技巧吧！

我看到很多人用了几年的PubMed，还是只知道在检索框里输入一个关键字，然后按一下'Go'按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况，这样的操作就足以得到令人满意的信息，但对于另一半情况，就没有那么幸运了，要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的'无用'信息中，要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。

令人费解的是，很多医务工作者宁可在每次检索时都花

上成倍的时间，却不愿花上几个小时的时间去认真研究PubMed。'君欲善其事，必先利其器'，PubMed就好像一

把功能强大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹，更重要的是，你要知道如何利用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。

在以后的章节中，我们将逐步深入地了解PubMed，相信通过这些章节的学习，我们可以真正熟练掌握PubMed，从而使自己的工作事半功倍。

第二章PUBMED简单检索技巧

一．在这一章里，我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献，作以简单介绍。

1．直接检索。当你打开浏览器，在地址栏内键入

https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/PubMed/ 或是百度pubmed，就进入了PUBMED检索系统主页。在靠近页面上部的地方，首先映入我们眼帘的，即是供我们输入所需查询内容的检索框。这就是改版之后的pubmed，是不是非常简洁？在检索框中输入查询词，然后单击'go'按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面，你还可以选定所要检索内容的数据库范围，除NCBI的数据库以外，可供选择的还有：PROTEIN、STRUCTURE、POPSET等等。

说到这里，很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符

然后回车一敲便可万事大吉，其实不然。每个人搜索效率的高低往往存在很大差别。在这里提供以下建议仅供读者参考：明确你索要检索的关键概念及词语，即关键字；考虑到关键字的类似说法，即有可能出现的同义词；通过限定DATES,STUDY GROUP等，精炼你的检索范围；多向有经验的人求教，因为不同的专业背景以及个人的差异，都有可能形成不同的方法和技巧。

2．通过布尔（BOOLEAN）运算来提高你的效率

最常用的三种布尔运算即是AND,OR,和NOT。

AND提供的运算方式即不管所输入的两个关键词语所

出现的位置在哪，只要他们都出现在索引文章的某一处，就将其列出。

而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出，这种运算在想将相似主题的文章罗列在一起时，十分有效。

NOT运算可以在你的检索范围内将某些不需要的部分

除去。但是在使用的时候要特别注意，会有可能将一些你所需要的文章漏掉。比如当你的检索词为LEAD POISONING NOT CHILDREN时，除了会删除掉那些仅讨论儿童的文章，同时也会删去那些同时讨论儿童及其他年龄组的文章。3．PUBMED检索类型

通常我们所要查询的单词类型大致可以分为：

词语（主题）检索这时我们在PubMed主页的检索框

中键入的是英文单词或短语（大写或小写均可）。然后回车

或点击'Go'，PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。例如：键入'vitamin c common cold'后回车或点击'Go'，PubMed开始检索并将检索结果显示出来。

著者检索当我们所要查询的是著作者时，在检索框中键入著者姓氏全称和名字的首字母缩写，格式为：'著者姓空格名字首字母缩写'，例如smith ja，然后回车或点击Go，系统会自动到著者字段去检索，并显示检索结果。

刊名检索在检索框中键入刊名全称或MEDLINE形式的简称、ISSN号，例如：molecularbiology of the cell, 或mol biol cell, 或1059-1524，然后回车或点击Go,系统将在刊名字段检索，并显示检索结果。

日期或日期范围检索可以在检索框中键入日期或日

期范围，然后回车或点击Go，系统会按日期段检索，并将

符合条件的记录予以显示。日期的录入格式为

YYYY/MM/DD；如：1999/09/08

也可以不录月份和日子，如：2000或1999/12。检索期刊子集（辑）检索的格式为检索词ANDjsubseta,如：neoplasm AND jsubseta。可供检索的期刊子库有3种：Abridged Index Medicus（有120种重要核心期刊）、Dental 和Nursing。分别使用jsubseta,jsubsetd, jsubsetn进行限定。

这个功能非常实用，如果想入组比较高质量额文献，比如核心期刊，这个时候实用期刊检索方式将会给你剩下很多时间，比如，我们搜索neoplasm，直接搜索，一共出来了2692727篇文献。如果我们限定核心期刊，那么结果只有40238篇文献，这个工作量的差异对我们来说无疑是巨大的！大家一定要掌握。检索带文摘的记录检索的格式为：检索词AND has abstract, 如：liver cancer ANDhas abstract。要注意的是在1975年前出版的文章，其MEDLINE 记录中没有文摘。

布尔逻辑检索PubMed系统允许使用布尔逻辑检索，只要在检索框中键入布尔逻辑运算符（AND，OR或NOT）。具体使用时要注意的问题，详见上第2点所述。

4．如何处理检索结果

当你点击GO或回车后，PubMed将会自动运行检索命令，在屏幕的下方显示出符合检索要求的项目，并且在查询框内保留原检索词。此时要注意的是符合检索要求的项目是以SUMMARY（简要格式）显示出来的，就是列出作者，文章题目，以及文章来源的一些信息。

在DISPLAY键后还可以选择别的显示格式，点击DISPLAY键后，系统按所选格式全部检索结果。

那么如何批量保存文献呢？打开Summary下拉菜单选择其中一种格式，然后点击Save键；要保存特定记录时，

点击记录左边的选择框予以标记后，再点击Save键。

使用浏览器的打印功能，即可把感兴趣的内容打印出来。系统允许每页最多显示500条记录。如果想打印成文本格式，请先点击Text键，然后再打印。第三章PUBMED简单检

索实例

在上一章里，我们已经对如何用PUBMED来查询我们感兴趣问题的文献。在这一章，我们可以通过几个简单的实例来具体熟悉PUBMED的用法。

1．明确所要检索的内容。如果我们要查询的问题是'维生素C对于普通感冒的防治作用'。首先我们应分析这一问题中的关键词语，主要由'维生素C'，和'普通感冒'构成。即

'VITAMIN C'和'COMMON COLD'。

2．分析所要检索的两个相关词语的关系。根据我们的

日常生活经验，可以将两个关键词之间的关系定义为'AND',于是我们可以在检索框内键入'VITAMINC AND COMMON COLD'.，然后点击'GO'，进行检索。下面的画面即为经过上面检索过程后所得到的相关文章。3．以上初步检索后

所显示的结果都以默认的SUMMER格式显示出来，在经过对SUMMER的阅读后，我们可以进一步筛选文献的内容。如我们感兴趣的是第二、三、五篇的话，选中这几篇文献左侧的方框。如果我们想要同时看到这几篇的ABSTRACT，

在Display Settings键后的下拉菜单选择ABSTRACT，然后

点击DISPLAY。即可看到所要结果。查看结果：第四章PUBMED高级检索技巧

高级检索技巧有两个入口：一是通过搜索前的advanced进入，就在pubmed首页搜索框的下面。这里三个高级搜索选型：1、是左侧的and or not选项，很简单，具体见简单搜索步骤2. 2、是搜索框选型，fieids，选择你需要选择的搜索范围。3、是index索引，以cancer 为例，点击list，出现下图内容，可以很方便的选择子方向，这个选项可以大大的提高我们的检索效率，缩小工作范围。第二个功能入口就是我们搜索之后的界面，在左侧的选项。还是以cancer为例，左侧出现了additional filter，这里我们可以把我们需要的内容进行筛选，比如我需要找到临床试验类型的文章，就在article types 中点击clinical trial，需要查看最近5年的文章，就选择publication data 5 years，等等。这个功能可以帮助我们快速的筛选出我们需要的文章类型，实在是好用的没话说啊！

同时对于高级玩家来说，如果想要查看pubmed的检索的详细内容，可以点击右下侧的search details，点击see more，你将会看到pubmed的全部搜索信息，同时提供修改。

以上就是pubmed常用的高级搜索技巧了，同时一些基本的内容比如如何把文献导出txt，如何只查看title就比较简单了，不再赘述。第五章谈MeSH Browser（医学主题词浏

览器）

【何为MeSH】

MeSH其实是Medical Subject Headings的缩略词，即医学主题词，是用规范化的医学术语来描述生物医学概念。NIH的工作人员按MeSH词表规定，浏览生物医学期刊全文后标引出每篇文献中的MeSH主题词，其中论述文献中心的主题词称主要主题词（major topic headings），论述主题某

一方面的内容的词称为副主题词。

【那么为什么要使用医学主题词呢？】

我们先来看个比喻，如果有人问你感冒了吗？你会不会回答'没有啦，我只是有点着凉发烧而已'呢？当然不会，因为你知道感冒就是着凉发烧。但一个检索系统，如果你不告诉它的话，它就有可能不知道这一点。在期刊中，对于同一个概念往往可能有不同的描述形式，如Tumor和Neoplasm都是指肿瘤。当一个查询者希望查阅肿瘤和

diet(饮食)相关的文献时，他可能会输入Tumor，也可能输入Neoplasm作为关键字，但其实这两者之间是没有区别的。

一个愚蠢的检索系统可能就认识不到这点，而像PubMed这样的'智能化'检索系统就能够准确的意识到这点，从而不会造成检索结果的遗漏。如何使用

如果你希望使用医学主题词进行检索，同样有两个入口。

1、可以从PubMed首页上点击PubMed Services下方

的MeSH Browser即可进入以下界面。 2.直接从搜索框内进入。把pubmed的下拉框打开，在里面直接找到mesh 的选项。

举例说明，如果你想要检索Neoplasms和bone的相关文献，首先在MeSHBrowser的检索框内输入检索词Neoplasms，然后点击Browse按钮。

然后，我们再在MeSH浏览器内输入bone，按检索按钮，系统会告诉你bone不是一个主题词，但它会自动将其转换成主题词Bone and Bones，同样，其下方也会显示出其定义及在树状等级结构中的位置。你一样可以选择Detailed display以便进行更为精细的选择，选择完成后，点击'Add'按钮，则进入下面的界面。这时，你只需点击PubMed Search按钮即开始检索，查询出用这两个主题词为关键字以及所选择的相应逻辑关系的文献检索结果。

总而言之，主题词检索法虽然稍嫌繁琐，但其检索结果的准确性高，遗漏率低，是最佳的检索方法，一旦熟练掌握，将使得我们的检索工作事半功倍。

以上就是pubmed检索的技巧，希望可以帮助到您们，如果感觉有用请分享给更多的人，谢谢。

新版Pubmed检索攻略

新版Pubmed检索攻略 ——日读一帖，解螺旋大V团队伴你科研路 【科研热点】让你时间比别人花的少、知道的比他早！【基金专栏】国自然等各项基金独到经验见解【SCI 专栏】从开始到接收全程tips【实验技能】这么棒快告诉你老板！关注我们，为您的科研路提速 第一章PubMed概述 笔者最近接到很多同学的微信，说希望看到pubmed的搜索教程，然后就在网上进行了检索，发现网上的教程都是老版的pubmed，比如还有limit按钮等等，其实pubmed改版之后已经变得更加简洁，就行百度搜索框一样，只有一个框和go。而以前的5个功能按钮早早已经删除，在你搜索结果中才可以显示，在我们搜索的左侧。那么下面我们就开始学习学习pubmed的搜索技巧吧！ 我看到很多人用了几年的PubMed，还是只知道在检索框里输入一个关键字，然后按一下'Go'按钮这样一种单一原始的检索方式。虽然有一半左右的情况，这样的操作就足以得到令人满意的信息，但对于另一半情况，就没有那么幸运了，要么你真正所需的信息湮没在大量纷繁芜杂的'无用'信息中，要么你只得到了大量有用信息的冰山一角。 令人费解的是，很多医务工作者宁可在每次检索时都花

上成倍的时间，却不愿花上几个小时的时间去认真研究PubMed。'君欲善其事，必先利其器'，PubMed就好像一 把功能强大的枪，你决不能仅仅满足于知道扣动扳机就可以发射子弹，更重要的是，你要知道如何利用准星瞄准，如何把这把枪的功能发挥到及至。 在以后的章节中，我们将逐步深入地了解PubMed，相信通过这些章节的学习，我们可以真正熟练掌握PubMed，从而使自己的工作事半功倍。 第二章PUBMED简单检索技巧 一．在这一章里，我们将对如何应用PUBMED这一得力助手检索文献，作以简单介绍。 1．直接检索。当你打开浏览器，在地址栏内键入 https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/PubMed/ 或是百度pubmed，就进入了PUBMED检索系统主页。在靠近页面上部的地方，首先映入我们眼帘的，即是供我们输入所需查询内容的检索框。这就是改版之后的pubmed，是不是非常简洁？在检索框中输入查询词，然后单击'go'按钮或按回车键，PubMed将会自动开始检索，并将检索到的相关条目显示在屏幕上。在检索框前面，你还可以选定所要检索内容的数据库范围，除NCBI的数据库以外，可供选择的还有：PROTEIN、STRUCTURE、POPSET等等。 说到这里，很多人可能以为只需傻瓜式的输入几个字符

NCBI之PubMed完全攻略

PubMed完全攻略 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed 的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed的主界面后，首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。

PubMed检索原理及途径

PubMed检索原理及途径 1. 检索原理 PubMed具有自动转换匹配功能（Automatic Term Mapping）。对于输入检索框中的检索词，将按照一定的顺序进行对照、匹配和转换，然后再进行检索。其顺序是：MESH转换表、期刊刊名转换表、短语表、著者索引。此外，还可进行短语检索，即将短语作为一个词组进行检索，可用双引号将其引起，此时系统不进行自动转换匹配，也不进行MeSH词的扩检。 2. 检索途径 ⑴基本检索 PubMed的主界面有一个简单的提问词输入框及辅助工具栏，此外，其左侧栏还提供了几种检索功能：Journals Database , MeSH Database , Single Citation Matcher, Batch Citation Matcher, Clinical Queries, Special Queries, LinkOut, My NCBI (Cubby)。在提问框输入自由词或检索表达式（可直接进行字段限定），点击go 即可进行自由词检索。同样可结合辅助工具栏按钮，进一步检索。 Limits：限定检索。PubMed限制内容较多，可对字段、出版类型、年龄、性别、语言、出版年限、收录进Entrez年限、是否具备摘要、检索范围等进行限制。 History：检索历史。可自动将检索式及结果数量记录到History屏，结合#号进一步检索。#号间可以用布尔逻辑符组佩检索，如#1 AND #2。 例:查找2004年以来的有关胎盘生长(placenta growth)和氧气(oxygen)的英文文献 步骤：PubMed主页→点击limits，限定时间2004；语种为English→页面最下端点击go，在检索词输入框中,输入placenta gr owth AND oxygen→点击go→得到检索结果。 ⑵主题词检索 点击主页左侧栏MeSH Database，或从上面数据库PubMed下拉菜单中选中MeSH, 即可进入MESH检索界面。 输入提问词，点击go。如不是MeSH词，系统则提供相关概念供选择。 选择出现的MeSH词，可察看下面对该MeSH词的注释。 点击该主题词进入副主题词选择，选中需要的副主题词，也可点击进行加权、不扩展检索。 然后从屏幕上方或下方的display行Send to框的下拉菜单中选择发送地方及组配方式，如要检索，发送到Search Box中，在Search Box中将显示检索表达式，可进行修改和继续添加。 最后点击Search PubMed进行检索。

PubMed检索完全攻略----好东西_吐血狂顶!

PubMed检索完全攻略----好东西，吐血狂顶！ 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与

PubMed 文献检索完全攻略

PubMed检索完全攻略 第一章 进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/pubmed/ 就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这

PubMed检索

第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed 是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入： https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和

部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed的主界面后，首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。 这是PubMed的核心部分。大部分工作，我们只要利用这"一框五键"（检索框，Limit键, Preview/Index键, History键，Clipboard键和Details键）即可完成。 在主界面的左侧框（如左图），有： · Journal Browser 期刊浏览 · MeS h Browser可以用它来分层流览MeSH表 · Single Citation Matcher输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式) 3) Related Resources · Order Docume nts可以使用户在当地得到文献的全文，但这是要收费的，至于如何免费获得文献全文，我将在后面的有关章节中详述。 · Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系

PubMed检索完全攻略----好东西,值得分享!

PubMed检索完全攻略----好东西，值得分享！ 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家

生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH ）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed 前都感谢NCBI 呢？ PubMed 覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed 挂钩的出版商会自动向PubMed 提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed ，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed 提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed 上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed 的主界面后， 首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。 这是PubMed 的核心部分。大部分工作，我们只要利用这"一框五键"（检索框，Limit 键, Preview/Index 键, History 键，Clipboard 键和Details 键）即可完成。 在主界面的左侧框（如左图），有： · Journal Browser 期刊浏览 · MeSh Browser 可以用它来分层流览MeSH 表 · Single Citation Matcher 输入期刊的信息可以找到某 单篇的文献或整个期刊的内容。 · Batch Citution Matcher 用一种特定的形式输入期刊 的信息一次搜索多篇文献。 · Clinical Queries 这一部分为临床医生设置，通过过 滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、 病原学与预后。 · Old PubMed (使用旧式的PubMed 查询方式) 3) Related Resources · Order Documents 可以使用户在当地得到文献的全 文， 但这是要收费的，至于如何免费获得文献全文，我 将在后面的有关章节中详述。

PubMed完全攻略

文献首页生物动态实验方法软件应用生物信息产业信息其他文档七嘴八舌软件下载 PubMed完全攻略(一) 作者:佚名整理时间:2005-08-19 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed 所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间，但借助于PubMed，我们仍旧可以随时掌握最新的动向，从而大大有利于自己的临床和研究工作。还有些出版商通过PubMed提供文献的全文，有时甚至是免费的，这样，我们就可以在PubMed上真正享受"坐拥书城"的感觉了（关于如何获取全文将在以后的章节中详述）。 进入PubMed的主界面后，首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键（如下图）。

PUBMED检索

?主题词(Mesh Heading)，又称叙词Descriptor,从信息内容中抽取出来的、能表达信息实质内容的规范化专业名词或术语?款目词，又称入口词，entry word,主题词的同义词或近义词?副主题词（Subheading）, 又称为限定词（Qualifiers）, 对主题词进一步限定的规范化用词 ?缩小检索范围，获取最专指的文献 ?举例：茶碱治疗哮喘 ?哮喘 asthma（指"asthma"[MeSH Terms] OR asthma[Text Word]）99696 asthma[mesh]（指"asthma"[MeSH Terms] ）81824 ?哮喘的药物治疗 asthma/drug therapy19695 ?茶碱（theophylline)治疗哮喘(2352) theophylline/TU7366 Medline：是PubMed的主体部分。[PubMed--Indexed for MEDLINE]。 OldMedline：含1950-1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录中没有MeSH字段和摘要字段，记录的标记是[PubMed - OLDMEDLINE for Pre1966]。 PreMedline：是Medline的前期数据库，收录的是那些正在等待标引的文献，其作用在于缩短文献报道时差。[PubMed--in Process] Publisher-Supplied Citations：出版商提供的电子期刊中有一些属于

选择性收录期刊。[PubMed - as supplied by publisher] PubMed主页上提供与NCBI的7个数据库建立了超链接Nucleotide：DNA序列数据库 Protein：氨基酸（蛋白质）序列数据库 Genome：基因组序列数据库 Structure：分子结构模型数据库 Popset：种群、种系发生或突变序列数据库 Taxonomy：生物分类数据库 OMIM：人类孟德尔遗传学在线数据库 Books：相关图书 注：在检索提问框内输入的检索词若不用字段限定，系统依次到下列3个表中进行词语的核对、转换和检索：①MeSH转换表(MeSH Translation Table)、②刊名转换表(Journals Translation Table)、③著者索引(Author Index)。如果在MeSH转换表中找到了相匹配的检索词，系统用MeSH词和Text Word词(TI、AB、MH、NM、PS、OT等字段中的词)一起进行检索。如果在MeSH转换表中未找到匹配的检索词，系统接着到刊名转换表和著者索引中搜词检索。如果在上述3个表中都找不到匹配的短语，系统将短语拆小，继续到这3个表中搜索，短语断开部分的逻辑关系是AND。如果拆到单词在以上3个表中还是找不到匹配词，将到所有字段中去搜索这些单词，单词之间的逻辑关系也是AND。 作者检索Smith j模糊（Smith JD/JR/J等）

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PubMed 检索系统 PubMed 检索系统 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆 （U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明，并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science或Nature）上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 PubMed 检索 Details 键的用法 存储检索策略--URL 键的用法 特征栏（Feature Bar）介绍 检索结果的显示、存盘、打印 PubMed 详解 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping）在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 （2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦

NCBI PubMed 检索简介与检索技巧集锦 注：在本文中的叙述中，所有输入PubMED检索框中的内容均用<>符号括起来，如以基因治疗为主题词检索，在检索框中的输入内容表示为<"Gene Therapy"[MESH]>。 PubMed简介 PubMed是由隶属于美国国家卫生部（NIH, National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM, Nationa Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, National Center for Biotechnology Information）提供，可通过NCBI网站的Entrez检索系统（Entrez retrieval system）进行MEDLINE和PreMEDLINE引文数据库的在线免费检索。此外，PubMed还提供引文与其它数据库的接入服务，与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据，提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内容包括：DNA 与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。Entrez检索系统是NCBI在线提供的一类基于文字进行搜索与索取的检索系统，可检索NCBI网站的主要数据库，如PubMed，核酸与蛋白序列，基因组序列，蛋白结构，OMIM等等。PubMed是一类提供生物医学文献资料检索的数据库，此外，它还针对网上资源，提供全文地址及其它相关的NCBI提供的网上资源，如核酸蛋白序列、OMIM入口等，以及其它生命科学数据库。其文献内容的提供方式，由各期刊出版商在期刊发表前可发表时提供给NCBI。如果该出版商有网站，则NCBI会提供相应的网络出口。MEDLINE 及PubMed引文数据库中的新条目在每周周二至周六每日更新。 PubMed服务内容概括 基于互联网WWW的MEDLINE及PreMEDLINE引文数据库免费检索系统。 提供MEDLINE、PreMEDLINE与其他相关数据库接入服务，如NCBI的其它数据库DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线，及NCBI外的其它数据库。 提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物学数据，序列中心的数据等等。 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及临床医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。 随着国内互联网的普及，网络已逐步地成为一名医务工作者获取多种信息的有效渠道。网络已成为医学研究者追踪国际研究进展，了解世界先进水平的一个重要手段。 传统的医学文献检索（MEDLINE）尽管在本地局域网提供的情况下，具有高速的特点。但与互联网

PubMed检索步骤

PubMed检索步骤 1、PUBMED 词汇自动转换功能：例如：在键入“Vitamin c",点击"Go",再点击"Details"显示("ascorbic acid"[MeSH Terms] OR vitamin c[Text Word])，看一下主题词是什么？所用词汇是否合适？然后点击“Preview/Index”显示你所用的检索词、检中的篇数、所用时间。也可点击“limit"进行检索。检索时可以使用通配符"*"进行截词检索或用双引号进行强制检索词检索。 2、著者强制检索：作者用双引号括起来"zhang y" [au]；比较一下分别输入zhang yun ;yun zhang,zhang y; zhang y [au]；"zhang y" [au] 检索结果的区别。 3、刊名检索：可用刊名全称或缩写、ISSN号，再加上刊名子段限定符，如：输入J Tradit Chin Med [ta] ，然后敲回车或点击Go，系统将在刊名子段中检索，并显示检索结果。点击“History”可以查看检索历史。 4、布尔逻辑检索：系统允许使用布尔逻辑检索，布尔逻辑运算符要大写（AND、OR或NOT）。 5、剪贴板：使用"send to Clipboard",可把检索结果存入剪贴板，剪贴板最多可存放500条记录。只要剪贴板中有记录，就可点击Clipboard查看其中的记录（记录为summary格式），粘贴板按记录存放的先后顺序显示记录题录。 6、当前页显示篇数默认为20篇，如果需要可调整当前页的篇数“5、10、20、50、100、200、500”篇。检索结果默认summary格式（题录格式），可以选择display下拉菜单中的Abstract（文摘），以文摘格式显示。 （一）基本检索 1. 检索2000年以来收录我院孙保亮老师作为第一作者的论文数量 2.检索PubMed收录山东大学姓王的作者所有的文献 3. 字段限制检索：检索作者Jone W Smith发表的论文标题中含癌症治疗方面的文献。 提示：smith jw[AU] AND (cancer[TI] OR tumor[TI] OR neoplasms[TI] ) AND (treatment[TI] OR therapy[TI]) 4. 利用PubMed检索检索作者 Bishop B近5年来发表在J Biol Chem 期刊上的文献。请写出检索步骤。 5. 检索期刊N Engl J Med的全称，并通过济南泉方网站或Medsci网站查到2012年SCI的影响因子。 6.自己的名字在英文杂志上的书写格式？ 7. 利用PubMed检索J Allergy Clin Immunol期刊近五年来非综述性文献。 8. 检索PubMed收录《中华内科杂志》(zhonghua nei ke za zhi)的论文有多少篇？ 9.请利用PubMed检索2008年11月以来发表在BMC Public Health上的文献中，由Free full article免费全文文献有几条？请写出以Ahonkhai VI为最后一名作者的文献篇名。 10. 德国科学家哈拉尔德?楚尔?豪森（Harald zur Hausen）因发现导致宫颈癌的HPV（人乳头状瘤病毒）而获得2008年诺贝尔生理学或医学奖。请利用PubMed 回答该作者2008年是否发表了有关HPV的文章？如有，请写出该文的出处。

Pubmed全攻略使用教程

PubMed检索系统简介 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。 PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。 PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明，并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science 或Nature）上发表的地理学文章等。 PubMed 系统的主要特点 1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping） 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。 （1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。 （2）刊名转换表（Journal Tanslation Table），包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN 号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。如：在检索提问框中键入：“new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。 （3）短语表（Phrase list）。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统（UMLS: Unified Medical Language System）和补充概念（物质）名称表[Supplementary Concept (Substance) Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词，就会查找短词表。 （4）著者索引（Author Index）。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词，或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语，PubMed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词，PubMed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程，直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词，单个词会被联一起（用AND）在全部字段中检索。 如："single cell"，系统就会自动将其分成两个词：“single“和“cell”检索，其检索表达式为：“single AND cell”。要查验检索词的转换情况，可点击“Details”键。

PubMed使用方法

PubMed检索完全攻略(1) 第一章进入PubMed魔法学校--PubMed概述 有位退休的老教授不止一次的向我感叹："你们现在真是幸福，我们那时候要查一篇相关的文献，要到图书馆一本一本目录去检索。尤其是做一些别人不太做的课题时，要搜集几篇有用的文献，竟要花上3，4个月时间，而你们现在……。"趁他打顿的时候，我告诉他，"快的话，可能只要3秒钟"。从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。 我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形，但对于现在的医学工作者来说，我已经无法想像，如果我们失去PubMed，世界将会怎样。 尽管在因特网上，类似于PubMed的医学文献检索系统并不少，但就其信息量，使用的方便程度，更新速度等多方面因素而言，PubMed都首屈一指。还有非常重要的一点，正如它的名字（PubMed＝ Public+Medicine）所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。无论何时何地，你只要在浏览器地址栏中输入：https://www.wendangku.net/doc/0117856985.html,/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。 俗话说，喝水不忘掘井人。PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯，不知道我们是否也有必要每次使用PubMed前都感谢NCBI呢？ PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长，早的可以追溯到20世纪60年代，通常而言，这已经足够早了，很少有人会需要查阅在此之前的文献。当然，研究生物医学史的工作者可能是个例外。而最新的文献几乎就在此时此刻。与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要，而往往在这个时候文献还没有正式出版。所以尽管生物