SCI收录生物安全相关论文的文献计量学分析

文献计量

SCI 收录生物安全相关论文的文献计量学分析

田德桥,郑　涛

(军事医学科学院生物工程研究所,北京　100071)

摘要:利用《科学引文索引(扩展版)》

(SCI Expanded )数据库检索并统计了2003-2008年生物安全相关的论文,对其年度论文数量的变化、国家或地区分布、主要研究机构、主要期刊等进行了分析研究,以期为我国生物安全相关研究工作提供参考。

关键词:生物安全;文献计量学;科学引文索引

中图分类号:G350 文献标志码:A 文章编号:1671-3982(2009)05-0069-03

Bibliometric analysis of biosecurity -related papers covered in SCI

TIAN De -qiao ,ZHENG T ao (Beijing Biotechnology Institute ,Beijing 100071,China )

Abstract :The bio security -related papers in 2003-2008were ret rieved f rom SCI Expanded data 2base.The annual number of papers covered in SCI Expanded ,t he dist ribution of papers in coun 2t ries and regio ns ,t he main research instit utions t hat cont ributed t he papers ,and t he main jour 2nals t hat p ublished t he papers were analyzed in an attempt to p rovide t he reference for t ho se who are engaged in research of bio security or biosafety.

K ey Words :biosecurity ;biblio metry ;Science Citation Index

收稿日期:2009-01-13

基金项目:国家自然科学基金资助项目(70573120,70773118)作者简介:田德桥(1975-),男,河北安新人,硕士,助理研究员,发

表论文10篇。

在20世纪,5亿多人死于感染性疾病,其中有

数万人死于病原体或毒素的蓄意释放[1]。2001年,美国纽约、新泽西和华盛顿等地发生了“炭疽邮件”事件,22人发病,5人死亡,并造成了严重的社会动荡和巨大的经济损失。此后,国际社会普遍加强了生物安全相关领域的研究[2]。生物恐怖防御、实验室生物安全、转基因食品安全、全面禁止生物武器等问题越来越受到各国的广泛关注。这一系列与生物安全相关的问题是当今科研人员及政策制定者面临的重要挑战。笔者通过美国《科学引文索引(扩展

版)》(SCI Expanded )检索、统计、分析了各国(地区)发表生物安全相关论文的情况,旨在了解各国或地区对生物安全相关领域的关注与研究动态,为加强我国生物安全相关研究提供线索。1　方法

用关键词“biosecurity ”,“bio safety ”,“bioter 2rorism ”,“biodefense ”or “biodefence ”,“biological

weapons ”or “biological weapon ”or “biological war 2fare ”检索SCI Expanded [3],检索时间为2008年12

月2日,检索范围为“Title ”。从检索结果中选择文

献类型为“article ”的检索结果,从文献数量的年度变化、主要国家或地区、主要研究机构、主要期刊等方面进行分析。2　结果2.1　生物安全相关论文数量的年度变化　SCI Ex 2panded 收录生物安全相关论文数量的年度变化见表1。从表1可以看出,在2002年除了关于“bio 2safety ”的论文以外,用其他关键词检索到的论文数量均较多,有关“bioterrorism ”的论文多达74篇,但此后呈递减趋势。2.2　生物安全相关论文的地区分布　SCI Expand 2ed 收录生物安全相关论文的地区分布见表2。从表2可以看出,美国学者发表的论文最多,达401篇,其余依次为法国、英国、澳大利亚、德国、加拿大、日本、以色列、荷兰等。在这些国家中,美国、法国、加拿大、以色列发表的有关“bioterrorism ”的文献较多,英国发表有关“biological warfare ”的论文较多,澳大利亚发表有关"bio security"的论文较多,德国、日本、荷兰发表有关“biosafety ”的论文较多,我国仅

在“bio safety”方面发表5篇论文,未见发表其他几个关键词的论文。

表1　SCI Expanded收录生物安全相关论文数量的年度变化(单位:篇)关键词199419951996199719981999200020012002200320042005200620072008 Biological warfare43691210112313571052 Biodefense104910465 Biosafety126751095546107813 Biosecurity12233512748668 Bioterrorism11165277463412926157合计16111517412748124916564534035

表2　SCI Expanded收录生物安全相关论文的地区分布(单位:篇)

国家或地区Biological warfare Biodefense Biosafety Biosecurity Bioterrorism总计

美国75303937220401

法国61721228

英国8167527

澳大利亚4227419

德国4172418

加拿大143513

日本324211

以色列3710

荷兰162110

印度1528

新西兰1157

意大利1315

中国55

俄罗斯11215

瑞典1225

瑞士235

比利时2114

巴西1214

西班牙11114

其他901491437

合计1233811578281635

2.3　生物安全相关SCI文献主要科研机构分析　SCI Expanded收录生物安全相关论文较多的机构见表3。从表3可以看出,发表与生物安全相关论文较多的机构均在美国,其中美国疾病预防控制中心(CDC),发表相关论文最多,达51篇。2.4　SCI Expanded收录生物安全相关文献数量较多的期刊　SCI Expanded收录生物安全相关论文较多的期刊见表4。其中Emerging Infectious Dis2 eases发表的论文最多,达39篇,其次为ASM News,Clinical Infectious Diseases等。

表3　SCI Expanded收录生物安全相关论文的主要科研机构

科研机构Biological warfare Biodefense Biosafety BiosecurityBioterrorism合计美国疾病预防控制中心(CDC)411013551美国陆军(U S-ARM Y)723719约翰霍普金斯大学(Johns Hopkins Univ)51915 Uniformed Serv Univ Hlt h Sci6410加州大学洛山矶分校(Univ Calif Los Angeles)4610美国过敏与感染性疾病研究所(NIAID)13329明尼苏达大学(Univ Minnesota)1438科罗拉多大学(Colorado State Univ)55

表4　SCI Expanded收录生物安全相关论文较多的期刊及其发文情况期刊名称Biological warfare Biodefense Biosafety Biosecurity Bioterrorism Emerging Infect Dis523239 ASM News231217 Clin Infect Dis3111015 Chem Eng News134412 J AMA7411 Mil Med71210 Public Healt h Rep1910 Vet Clin Nort h Am Food

Anim Pract

1010

3　讨论

生物安全相关论文数量变化在一定程度上反映了各国或地区对于生物安全的关注程度与科研水平。笔者利用SCI Expanded统计分析了与生物安全相关的论文数量,由于是题名检索,可能会漏掉一些论文,但基本能够反映全球生物安全研究发展状况。

从论文数量上可以看出,2002年除了“bio safe2 ty”之外,用其余所有关键词检出的论文数量均较多,说明在2001年“炭疽邮件”事件后,对其关注程度的增加。其中美国发表的有关生物安全的论文较多,表明美国具有较高的科研实力和对生物安全研究的重视[4]。发表与生物安全相关的论文数量较多的其他国家有法国、英国、澳大利亚、德国、加拿大、日本、以色列、荷兰等。这些国家均为较发达的国家,在一定程度上说明发达国家对生物安全的关注程度较高,且科研实力较强。

我国在SCI Expanded收录的期刊上发表有关生物安全的论文数量较少,与发达国家存在差距,说明我国在生物安全相关领域的研究任重而道远。相关研究人员与政策制定者要肩负起历史的责任,不要“亡羊补牢”,而是要“未雨绸缪”“防患于未然”。

参考文献:

[1]　Frischknecht F.The History of Biological Warfare.Human Ex2

perimentation,Modern Night mares and Lone Madmen in t he Twentiet h Century[R].EMBO Rep(S1469-221X),2003,4 (Sepcial Issues):S47-S52.

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board?Science(S0193-4511).2005,307(5714):1396-1398.

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https://www.wendangku.net/doc/0a12530671.html,/UA_GeneralSearch_input.do?

product=UA&search_mode=GeneralSearch&SID =4Aji47aiJ PNf kaMmPFN&preferencesSaved.

[4]　Franco C.Billions for Biodefense:Federal Agency Biodefense

Funding,fy2008-fy2009[J].Biosecur Bioterror(1538-

7135),2008,6(2):131-146.

[本文编辑:杜海洲]

生命科学概论论文

生命科学概论论文题目：“草草”引发的思考 学院：土木工程学院 专业：给排水科学与工程 姓名：余小航 学号：201609834 班级：给排水（本）201603 指导老师：邹立扣

【摘要】大自然中，奔腾于草原上的骏马，穿梭于林间的飞禽走兽，翱翔于长空的展翅雄鹰，以及深藏于海底的奇珍异宝……生命的形式如此丰富，她们中的任何一个都值得我们去探索与发现。 这些生物具有多样性，然而它所提供的价值在其有效实现之前会有一个在空间上的一个积累过程，也就是说她提供的可利用价值是间接的，需要一个转化过程。正如森林，她提供的果实这一部分的使用价值人们可以马上享受到，然而她提供的另一部分价值，例如森林系统所涵养的水流就需要在空间上的一个流动积累，才能汇集成河流为我们所用。之前上课时，邹老师放了一个关于大熊猫“草草”的视频，给了我不少关于生物多样性思考，同时也让我联想到了另外一种动物就是华南虎 关键词：华南虎生态系统人类活动生物多样性 华南虎是中国特有的虎亚种，生活在中国中南部，也叫做中国虎，是中国十大濒危野生动物之一。野生华南虎主要生活在山地，多单独生活，不成群，喜食新鲜肉，捕食对象包括业主、野牛和鹿类。由于人类活动范围的扩大和人类文明对华南虎生存环境的破坏，华南虎的数量剧减，目前在野外几乎灭绝，仅在各地动物园繁殖基地人工饲养着100多只华南虎不发挥着极其重要的作用，且其起源以及分布区的变迁过程在研究虎的 起源和演化等方面具有不可替代的科学价值。华南虎是中国独有的虎亚种，因此也叫做中国虎。但是作为中华民族的图腾之一，华南虎的命运却着实让人担心。从新中国建立到现在，华南虎种群的数量锐减，到现在已经基本确定境内华南虎灭绝。保护华南虎，保护濒临灭绝的野生动植物，是人类义不容辞的责任和义务。野生华南虎惨淡的生存现状要从建国开始研究。 建国初期，野生华南虎的数量还有4000多头。经过20世纪50年代和60年代华南虎标本持续进行的大规模捕杀，华南虎种群遭受重创，一蹶不振。当时，政府宣布华南虎为“四害” 之一，除虎如同剿匪，大打人民战争，还组织专门的打虎队，由解放军和民兵协同作战，赶尽杀绝。而在1962年9月国务院颁布指示保护和合理利用野生动植物资源，列出19种动物为严禁捕猎动物，并在一些地区受到保护，华南虎再度被排斥在外，这对华南虎的种群数量又是一次打击。之后国务院颁布一些条例规定，将华南虎的保护级别逐步提升。到1979年，农业部才把华南虎列为一级保护动物。不过这个措施为时已晚，因为据估计，1981年，的种群数量已经只有150-200了。1996年，联合国国际自然与自然资源保护联盟发布的《植物国际公约》将华南虎列为第一号濒危物种，列为世界十大濒危物种之首。据传人类最后一次在野外看见华南虎，也是2007年10月13日在重庆和陕西交界的大巴山原始森林。后经专家组研究认定这种说法可信度很低，并断定华南虎已经灭绝。由此可见，华南虎的受威胁程度是非常严重的，早年受政府下令捕杀，等到种群数量很低政府出台条例保护华南虎时， 华南虎面临的捕杀危机虽然减弱，但是生存环境由于人类的活动而急剧减少，一只成年公存所需的100公顷的森林在华南虎种群分布范围内已经很少见。重重困难和危机下，华南虎群遭到灭顶之灾。而维持华南虎个体数量的圈养华南虎种群形势也不容乐观。由于数量极其有限，动物园和繁殖基地的华南虎的近亲繁殖系数极高，生下的幼崽常有多病痴呆等症状，种群面临严重衰退。生活在这种环境的华南虎体质和免疫力低下，正常的繁殖都需要人类助，很难承担维持种群数

保护生物学论文

保 护 生 物 学 论 文 姓名：林姿余 学院：园林学院 班级：13级环境设计二班 学号：20133895

摘要针对我国目前保护生物以及生物发展状况，论述了现代生物的发展状况以及采取的措施，保护生物的关键所在对人类的影响。 关键词保护生物生态环境使用价值保护措施 新兴学科在发展过程中会经历很多变化，初期建立起来的秩序都可能被未来新的发现所推翻，学科体系在时间的推移和事实的验证中不断逐渐完善。当今全球环境问题、生态问题恶化趋势尚未扭转IUCN近期的分析报告和国内外的众多保护生物学研究所都在不断警告人类迅速行动，遏制生物多样性的高速、毁灭性消失的灾难，研究的紧迫性和时效性更为突出。 认识生物的多样性是为了更好地保护和合理利用生物的多样性。保护生物的多样性是一项艰巨的任务，涉及到方方面面的问题。保护生物的多样性是可持续发展的重要内容 保护生物多样性就是在生态系统、物种和基因三个水平上采取保护战略和保护措施.主要有： 1.就地保护，即建立自然保护区。 2 .迁地保护，如建立遗传资源种质库、植物基因库，以及野生动物园和植物园及水族馆等。 3. 制定必要的法规，对生物多样性造成重大损失的活动进行打击和控制。 保护生物多样性，是全球共同的大事，最主要的是要行动，这必须所有缔约国广泛合作，积极行动，制定必要的法规，对生物多样性造成重大损失的活动进行打击和控制，对濒临灭绝的物种、破坏严重的生态系统和遗传资源实行有效的保护和抢救。 生物多样性包括生物种类的多样性、基因的多样性和生态系统的多样性。生物多样性的意义主要体现在生物多样性的价值，对于人类来说，生物多样性具有直接使用价值、间接使用价值和潜在使用价值。 直接使用价值：生物为人类提供食物、纤维、建筑和家具材料、药物及其他工业原料。 生物多样性还具有美学价值。如大千世界色彩纷呈的植物和神态各异的动物

信息计量学

1.文献计量学：是采用数学统计方法，对各类文献的诸计量特征进行统计分析，进而揭示、研究文献情报规律，文献情报科学管理以及科学发展趋势的一门学科。 2.质量牵制原则：出版物的增长数量与其质量有关，不同质量的出版物有不同的出版速度；质量高的文献增长速度慢。 3.文献老化：科学文献随着其年龄的增长，逐渐失去了作为科学情报源的价值，越来越少的被用户利用的过程。 4.半衰期：某学科现在尚在被使用的全部文献中，较新的一半是在多长时间内发表的。 5.普赖斯指数：指在某一领域内，出版年龄不超过5年的被引证文献与被引证文献总数之比。 6.文献耦合：是指引用文献通过参考文献建立起来的耦合，如果A、B两篇文献共同引用了一篇或多篇相同的论文，则A、B两篇论文的关系即为耦合关系，也叫文献合配。 7文献信息流：文献所含情报的汇流称文献信息流。 8文献老化：科技文献随着其"年龄"的增长，其内容日益变得陈旧过时，失去了作为科学情报源的价值，以及因此越来越少被科学工作者和专家们利用的过程。 9科学生产率：个体科研人员在一定时期内所撰写的论文数量。 10引文分析：利用各种方法对科学期刊、论文、著者等分析对象的引证和被引证现象进行分析，以揭示其特征和内在规律。 11影响因子:即某期刊前两年发表的论文在统计当年的被引用总次数除以该期刊在前两年内发表的论文总数。 12信息计量学：是以信息作为对象进行计量研究的学问，采用数学、统计学等定量方法，对信息基本循环图式所描述的社会化的信息交流过程中的信息组织，存储，分布，传递，相互引用和开发利用等进行定量描述和统计分析，以便揭示社会信息交流过程的数量特征和内在规律。 13网络信息计量学是采用数学、统计学等定量分析方法，对网上信息的组织、存储、分布、传递、相互引证和开发利用等进行定量描述和统计分析，以揭示七数量特征和内资规律的一门新兴学科。 文献信息老化的主要度量指标有哪两个？两者有何异同？ 文献信息老化的主要度量指标是半衰期和普赖斯指数。两者既有联系又有区别。它们都是从文献被利用的角度出发，但以不同的方式来反映文献老化的情况。普赖斯认为，“有现时作用”的引文数量与“档案性”引文数量的比例，是比引文的“一半寿命”更为重要的特征。文献的“半衰期”只能笼统地衡量某一学科领域全部文献的老化情况，而“普赖斯指数”既可用于某一领域的全部文献，也可用于评价某种期刊、某一机构，甚至某一作者或某篇文章的老化特点。半衰期概念可以适用于一般情报老化，而普赖斯指数只适用于文献情报。 简述布拉德福定律的基本内容。 布拉德福定律的文字表述为：如果将科学期刊按照其登载某个学科论文载文率的大小，按渐减顺序排列，那么可以把期刊分为专门面向这个学科的核心区和包含着与核心区同等数量论文的几个区。这时，核心区期刊的数量与相继各区期刊数量的关系将是1：a：a 2 ……。 a 为布拉德福常数，或称比例系数。图象描述：如果取上述登记排列的期刊序号（级数）的对数1gn为横坐标，以相应的论文累积数R(n)为纵坐标进行图象描述，可得到一条曲线。

生物信息学论文

生物信息学的进展综述 韩雪晴 （生物工程1201班，学号：201224340124） 摘要：生物信息学是一门研究生物和生物相关系统中信息内容和信息流向的综合性系统科学。80年代以来新兴的一门边缘学科，信息在其中具有广阔的前景。伴随着人类基因组计划的胜利完成与生物信息学的发展有着密不可分的联系，生物信息学的发展为生命科学的发展为生命科学的研究带来了诸多的便利，对此作了简单的分析。 关键词：生物信息学；进展；序列比对；生物芯片 A review of the advances in Bioinformatics Han Xueqing （Bioengineering, Class1201，Student ID：201224340124） Abstract: Bioinformatics is the science of comprehensive system of information content and information flows to a study on the biological and bio related in the system. The edge of an emerging discipline since 80, has broad prospects in which information. With the human genome project was completed and the development of bioinformatics are inextricably linked, for the life science research development of bioinformatics for the development of life science has also brought a lot of convenience, has made the simple analysis. Keywords: bioinformatics；progress；Sequence alignment；biochip 1、生物信息学的产生背景 生物信息学是20世纪80年代末开始，随着基因组测序数据迅猛增加而逐渐兴起的一门学科[1]。应用系统生物学的方法认识生物体代谢、发育、分化、进化以及疾患发生规律的不可或缺的工具[2]。及时、充分、有效地利用网络上不断增长的生物信息数据库资源，已经成为生命科学和生物技术研究开发的必要手段，从而诞生了生物信息学。 2、生物信息学研究内容 主要是利用计算机存储核酸和蛋白质序列，通过研究科学的算法，编制相应的软件对序列进行分析、比较与预测，从中发现规律。白细胞介素-6(IL-6)是机体重要的免疫因子,但在两栖类中未见报道。采用生物信息学方法对两栖类模式动物非洲爪蟾IL-6进行分析[3]。以人IL-6基因对非洲爪蟾数据库进行搜索、分析,并采用RT-PCR方法对所得序列进行验证。结果表明,非洲爪蟾IL-6基因位于scaffold_52基因架上,具有保守的IL-6家族基序[4]。采用生物信息新方法进行不同物种的免疫基因挖掘、克隆,是一种有效的方法[5]。 2.1序列比对 比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性。序列比对是生物信息学的基础。两个序列的比对现在已有较成熟的动态规划算法，以及在此基础上编写的比对软件包BLAST和FASTA[6]。序列数据库搜索最著名且最常用的工具之一便是BLAST算法。FASTA算法是另一族常用的序列比对及搜索工具[7]。 2.2结构比对 比较两个或两个以上蛋白质分子空间结构的相似性或不相似性。 2.3蛋白质结构预测 从方法上来看有演绎法和归纳法两种途径。前者主要是从一些基本原理或假设出发来预测和研究蛋白质的结构和折叠过程。分子力学和分子动力学属这一范畴。后者主要是从观察和总结已知结构的蛋白质结构规律出发来预测未知蛋白质的结构[8]。 3、生物信息学的新技术

保护生物学课程复习

保护生物学课程复 习 ●保护生物学：保护生物学是 解决生物多样化危机的科学， 其原则是：进化的眼光，动 态和综合的观点，必须考虑 人的观点，分析、解决（缓 解）矛盾。 ●生物多样性：生态系统的多 样性，物种的多昂性，基因 的多样性。【是指一个地区的 生物、他们遗传多样性、他 们所属生态系统的类型。】 ●种群：一个地区内相同个体 的集合。 ●生态系统：一个空间内所有 生物及其无机环境的统一整 体。 ●景观：不同生态系统组成的 异质性区域。 ●物种:可以交配并繁衍后代 的个体的集合。 ●生态系统服务功能：生态系 统在能流、物流的生态过程 中，对外部显示的重要作用， 如改善环境，提供产品等。 ●林奈的分类系统：界（动物 界）、门（脊索动物门）、纲 （哺乳纲）、目（灵长目）、 科（人科）、属（人属）、种 （智人）->人 ●物种形式存在的意义：1.物 种的分异是生物对环境异质 性的应答；2.物种间的不连 续抵消了有性生殖带来的遗 传的不稳定性；3.物种是大 进化的基本单位；4.物种是 生态系统中的功能单位-食 物链 ●小进化：种内的个体和种群 层次上的进化改变。基本单 位：无性繁殖系或种群遗传 组成的变化。

●大进化：种和种以上分类群 的进化。基本单位：物种。 ●生态系统各成员间通过营养 关系【食物链】、【食物网】 彼此连成一个整体。 ●物种丰度：一个地区物种的 数量。 ●物种多度：即单一物种的度， 有相对多度和绝对多度。多 度可用数量或生物量来测量。 ●物种多样性：如果根据丰度、 生产力或数量等某种重要性 来衡量物种，就是在谈论物 种的多样性。 ●

●关键种：是指它们的消失或 削弱引起整个群落和生态系 统发生根本性变化的物种。 ●旗舰物种：代表某个物种对 一般大众具有特别号召力和 吸引力，可促进大众对动物 保护的关注。 ●伞护种：是指那些生存环境 需求能够涵盖许多其他物种 生存环境需求的物种。 ●指示种：是指其生物学或生 态学特性可表征其他物种生 长环境或环境状况的生物种。 ●生物多样性指数： Shannon-Wiener index（H’） 和Simpson index(D)。 ●种群数量：一个地区某一特 定时间种群的数量。 ●种群动态：种群数量在时间 和空间上的变动规律。 ●热点地区：具有丰富的地方 特有种的地区。 ●生物多样性遭受的威胁：1. 栖息地破坏、破碎化和改变； 2.物种入侵（入侵种：某物 种通过自然或人为的手段， 被引入一个原来没有该物种 的生态系统中，逐渐发展繁 殖，并对当地自然或人为生 态系统产生毁灭性影响的物 种）；3.过度开发和过度开采； 4.污染和有毒物质的产生。 5.连锁效应和协同效应。 ●连锁效应：一个物种的绝灭 导致另一物种的绝灭。 ●协同效应：单独因素无作用， 但因素协同后影响巨大。 ●生物多样性公约：是一项保 护地球生物资源的国际性公 约，签署于1992年6月1日。 ●UNEP：联合国环境规划署（united nations environment programme ） ●IUCN：世界自然保护联盟

生物信息学课程论文 作业题目 分配表

生物技术12-1 生物技术12-1 学号姓名性 别 签名学号姓名性别签名学号姓名性 别 签名 12114350101陈丽娜女大肠杆菌连接 酶 12114350104黄少敏女人的胰蛋白 酶 12114350105黄晓静女T4噬菌体 DNA聚合酶12114350106纪秀玲女人的肌红蛋白12114350107列泳婵女蛋白酶K序 列 12114350108石彩虹女小鼠P53基 因12114350110周海琪女拟南芥端粒酶 序列 12114350111曹杰濠男淀粉酶12114350113陈永成男G-谷氨酰转 肽酶12114350115方壮杰男乳酸脱氢酶12114350116冯健锋男肝癌铁蛋白12114350118黄静云男牛血清白蛋 白12114350119李树森男18S rDNA 12114350120李涛男ATP合成酶12114350121林秀尧男谷氨酸脱羧 酶12114350123刘国标男CDK4 12114350124罗皓炽男胃蛋白酶12114350125阮永刚男鲨烯合酶基 因12114350126石晓洲男肌动蛋白12114350129王佐正男肥胖基因相 关蛋白 12114350130吴文祯男柑橘果胶酯 酶12114350131吴永鹏男凝血酶原12114350132徐国相男维生素C合 成基因 12114350133叶业林男葡萄糖脱氢 酶

12114350134张维彬男大肠杆菌Β-半 乳糖苷酶 12114350135张伟龙男抗干旱基因12114350136郑晓坤男人血红蛋白 12114350142郑桂捷男磷酸酶的蛋白 质12114350138黄忠海男牛凝乳酶原 基因 12114350139徐少东男岩藻糖苷酶 12114350141王晓敏女木瓜蛋白酶 本班总人数：31 生物技术12-2 生物技术12-2 学号姓名性别签名学号姓名性别签名学号姓名性别签名12114350201黄雪梅女人的胰岛素12114350202李晨晨女热震惊蛋白/ 热击蛋白 1211435020 3 廖垭娣女乙肝病毒 CABYR- binding prot ein 12114350204冉梦梦女腺苷酸环化酶12114350205魏丹璇女DNA ase I 1211435020 6 吴彩凤女纤维素酶 12114350207武亦婷女18 rDNA 12114350208叶国玲女谷胱甘肽1211435020 9 叶锦玉女线粒体基因

保护生物学论文

海南师范大学生命科学学院 保护生物学 论文题目：丹顶鹤的保护现状及保护对策 学院：生命科学学院 系别：生物科学系 专业：生物科学 学生姓名：符淑乾 学号： 201208010209 填表时间：年月日

丹顶鹤的保护现状及保护对策 摘要：丹顶鹤是我国著名的文化鸟类，在我国文化历史上具有极高的地位，历来受到全国人民的喜爱。近年来，由于环境的迁和人为的干扰，野生丹顶鹤数量逐年下降，全球现存数量仅为2600只左右，而东亚的大陆总数量约1500只左右。国内外就丹顶鹤的保护现状及保护对策进行了大量的研究工作，并取得了明显的成果，丹顶鹤是在我国研究最广泛、最深入的鸟类，从宏观到微观，从个体到群落，从野生到饲养等各个领域；到目前为止，我国发表的涉及丹顶鹤的文献共1162篇，并对论文发表年代，研究内容、涉及领域进行了统计和分析，并提出了我国丹顶鹤的保护现状及保护对策。 关键词：丹顶鹤；现状；保护；对策 丹顶鹤属鹤行目，鹤科，为大型涉禽，是国家一级重点保护动物，世界涉危鸟类，被列入CTTES附录中。自古以来丹顶鹤深受人们的喜爱，文人墨客常把它同松树会写在一起制作（松鹤图）作为长寿的象征加以赞美和歌颂。丹顶鹤栖息繁殖于湿地中，被人们冠以“湿地之神”之美称。由于它对湿地的文化十分敏感，又被称为“环境变化指示剂”。丹顶鹤也是世界上著名的文化鸟类，在诗歌、绘画、雕刻、文学、音乐及舞蹈中均有种种表现。 一、生存现状及保护现状 在中国东北和远东地区人类活动对湿地的破坏在1960年代以后急剧加重，对湿地的围垦不仅侵占了原有的栖息地还是原本流通的水系阻断，再加上近年远东地区气候干燥化趋势明显，水域面积缩小严

生物信息学的论文

生物信息学 一、我对生物信息学的认识 1、什么是生物信息学 生物信息学从事对基因组研究相关生物信息的获取、加工、储存、分配、分析和解释。包括了两层含义，一是对海量数据的收集、整理与服务，也就是管好这些数据；另一个是从中发现新的规律，也就是用好这些数据。具体地说，生物信息学是把基因组DNA序列信息分析作为源头，找到基因组序列中代表蛋白质和RNA基因的编码区；同时，阐明基因组中大量存在的非编码区的信息实质，破译隐藏在DNA序列中的遗传语文规律；在此基础上，归纳、整理与基因组遗传语文信息释放及其调控相关的转录谱和蛋白质谱的数据，从而认识代谢、发育、分化、进化的规律。 2、、生物信息学的重要性 生物信息学不仅仅是一门科学学科，它更是一种重要的研究开发工具。 从科学的角度来讲，它是一门研究生物和生物相关系统中信息内容物和信息流向的综合系统科学，只有通过生物信息学的计算处理，我们才能从众多分散的生物学观测数据中获得对生命运行机制的详细和系统的理解。 从工具的角度来讲，它是今后几乎进行所有生物（医药）研究开发所必需的舵手和动力机，只有基于生物信息学通过对大量已有数据资料的分析处理所提供的理论指导和分析，我们才能选择正确的研发方向，同样，只有选择正确的生物信息学分析方法和手段，我们才能正确处理和评价新的观测数据并得到准确的结论。 可见生物信息学在今后的无论是生物（医药）科研还是开发中都具有广泛而关键的应用价值；而且，由于生物信息学是生物科学与计算科学、物理学、化学和计算机网络技术等密切结合的交叉性学科，使其具有非常强的专业性，这就使得专业的生物（医药）科研或开发机构自身难以胜任它们所必需的生物信息学业务，残酷的市场竞争及其所带来的市场高度专业化分工的趋势，使得专业的生物（医药）开发机构不可能在自身内部解决对生物信息学服务的迫切需求，学术界内的生物（医药）科研机构也是如此，而这种需求，仅靠那些高度分支化和学术化的分散的生物信息学科研机构是远远不能满足的。可见，在生命科学的新世纪，生物信息学综合服务将是一个非常重要的也是一个极具挑战性的领域。 3、生物信息学的最终目的

文献计量学综述

文献计量学综述 一、起源及发展 早在20世纪初，人们已经开始对文献进行定量化研究，但是当时文献计量学并没有作为一门独立的学科而存在。直到1969年，英国著名情报学家阿伦.普理查德首次提出术语“Bibliometrics”，这一术语的出现标志着文献计量学的正式诞生。 三阶段：萌芽、发展和分化 萌芽（1917-1933）这一时期文献研究人员首创文献统计方法,并在一些学科领域解剖学和化学专业进行了文献计量分析的大胆尝试,取得了一定的成果。这些研究都为文献计量学的诞生与后期的发展奠定了基础 发展（1934- 1960）年注重理论研究与规律发现，著名的文献计量学的三大基本定律中的布拉德福定律以及齐普夫定律就是在这一时期发现的到 成熟与分化阶段全面发展与分化时期(1960年至今) 这一时期文献计量学已由狭隘的理论研究发展到了广阔的应用研究和指标的研究,同时涉及的领域和主题也越来越多。 迁移衍生： 专利计量学 文献计量学网络计量学 政策计量学 二、概念界定 文献计量学是以文献体系和文献计量特征为研究对象,采用数学、统计学等计量研究方法, 研究文献信息的分布结构、数量关系、变化规律和定量管理,并进而探讨科学技术的某些结构、特征和规律的一门学科。可以定量地揭示某一学术领域的发展历程、研究重点以及未来的研究方向。目前，文献计量分析已被看作总结历史研究成果、揭示未来研究趋势的一种重要工具。学科交叉使得文献计量研究内容体系日益丰富。数学中的图论、社会学中的社会网络分析、物理学中的复杂网络等理论与方法均被移植到文献计量学的研究体系中。 三、三大定律 布拉德福定律该定律描述文献分布规律，利用刊载某专业论文的数量来确定该专业的核心期刊，应用于指导文献情报工作和科学评价。 齐普夫定律该定律用以统计文献中的词频，通过文献的词频分析可确定学科或行业的研究热点和研究趋势。 洛特卡定律该定律描述著者人数与所著论文之间的关系。探讨了科学论文著者分布平衡的规律，在宏观的科学著作活动中，少数作者写出了大量文章，大多数人的著作还是很少的。依此定律推论出“杰出科学家数目仅是科学家数目的平方根”。 从表面上三大定律的统计对象各异，其结论也不尽相同，但是它们的研究方法存在着某些相似之处，事实上它们属于同一个分布体系。该体系被称为布－齐－洛体系。如果把期刊、字词、书籍、文章等称为信息发生源，将作品、论文、字词的出现、书籍的使用、文章的被引等称为产物，那么文献计量学的规律可认为是发生源数量与产物数量之间存在的函数关系。

保护生物学复习提纲2017

保护生物学课程复习提纲（2017） 重要名词： （1）保护生物学 Conservation Biology: Definitions 什么是保护生物学？ “The applied science of maintaining the earth’s biologicaldiversity” M. Hunter, 1996维护地球生物多样性的应用科学 “The new, multidisciplinary science that has developed todeal with the crisis confronting biologicaldiversity….Conservation biology should be considered acrisis discipline." R. Primack 1993 新的、多学科、应对生物多样性的危机 （2）生物多样性 Biodiversity, orbiological diversity= the sum of anarea’s organisms 物种多样性 遗传多样性 生态系统多样性 （3）物种 自由交配，后代可育（生物学） 一组生物的个体，其形态、生理和生化特征与其他个体显著不同，能够相互区分（形态学） （4）种群 “A population may be defined organisms of the same species aoscacugpryoiunpg oaf particular space at a particular time.”(Charles J. Krebs, Ecology, 4th edition) “种群可以定义为占有特定的空间和时间的同一物种的一组有机体。” 种群是遗传多样性的容器 （5）生态系统 （6）生态系统服务功能 直接产品提供：淡水资源、食品、药物、纤维、木材、燃料、遗传基因、生化产

生物信息学课程论文

生物信息学的发展和前景 摘要：生物信息学已成为整个生命科学发展的重要组成部分，成为生命科学研究的前沿。本文对生物信息学的产生背景及其研究现状等方面进行了综述，并展望生物信息学的发展前景。生物信息学的发展在国内、外基本上都处在起步阶段。因此，这是我国生物学赶超世界先进水平的一个百年一遇的极好机会。 关键字：生物信息学、产生、发展、前景

生物信息学的发展和前景 随着生物科学技术的迅猛发展，生物信息数据资源的增长呈现爆炸之势，同时计算机运算能力的提高和国际互联网络的发展使得对大规模数据的贮存、处理和传输成为可能，为了快捷方便地对已知生物学信息进行科学的组织、有效的管理和进一步分析利用，一门由生命科学和信息科学等多学科相结合特别是由分子生物学与计算机信息处理技术紧密结合而形成的交叉学科——生物信息学(Bioinformatics))应运而生,并大大推动了相关研究的开展,被誉为“解读生命天书的慧眼”。 生物信息学的产生 生物信息学是80年代未随着人类基因组计划（Human genome project)的启动而兴起的一门新的交叉学科。它通过对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析，进而达到揭示数据所蕴含的生物学意义的目的。由于当前生物信息学发展的主要推动力来自分子生物学，生物信息学的研究主要集中于核苷酸和氨基酸序列的存储、分类、检索和分析等方面，所以目前生物信息学可以狭义地定义为：将计算机科学和数学应用于生物大分子信息的获取、加工、存储、分类、检索与分析，以达到理解这些生物大分子信息的生物学意义的交叉学科。事实上，它是一门理论概念与实践应用并重的学科。 生物信息学的产生发展仅有10年左右的时间---bioinformatics这一名词在1991年左右才在文献中出现，还只是出现在电子出版物的文本中。事实上，生物信息学的存在已有30多年，只不过最初常被称为基因组信息学。美国人类基因组计划中给基因组信息学的定义：它是一个学科领域，包含着基因组信息的获取、处理、存储、分配、分析和解释的所有方面。 自1990年美国启动人类基因组计划以来，人与模式生物基因组的测序工作进展极为迅速。迄今已完成了约40多种生物的全基因组测序工作，人基因组约

生物学基础论文

关于物种形成的理解 摘要： 本文就物种的概念、形成方式、形成原因进行了一定的研究与思考，重点考虑了地理成种和非地理成种两种成种方式。物种形成是指由物种通过各种机制进化出新物种的过程，是进化生物学领域最基本也是最重要的问题之一。从根本上来说，物种形成是生物学多样性产生的基本机制。尽管达尔文在《物种起源》中就已经提出，自然选择是物种形成的主导因素（Darwin,1859）,但一直以来，物种形成过程一般被认为是由随机过程导致的。直到生殖隔离的概念被提出，自然选择在物种形成中的作用才重新受到重视，并认为物种形成是与地理因素存在着重要的关系。本文对物种形成进行了较为详细的介绍，并就在生殖隔离与物种形成方式上进行较为详细的论述。 关键词:物种形成；生殖隔离；地理成种；非地理成种；。Abstract： In this paper, the species of the concept, form and forming reason was research and thinking, mainly considering the geography into species and geographical into two ways. Speciation refers to the process of new species evolve by species through various mechanisms, evolutionary biology is one of the most basic and most important problems. Fundamentally, speciation is a basic mechanism of biological diversity. Although Darwin has been put forward in the origin of species, natural selection is a dominant factor of speciation (Darwin, 1859), but for a long

生物信息学认识

浅谈生物信息学 一、生物信息学产生的背景 有人说，基于序列的生物学时代已经到来，尽管对“序列生物学”这一提法可能有所争议，但是今日像潮水般涌现的序列信息却是无可争辩的事实。自从1990年美国启动人类基因组计划以来，人与模式生物基因组的测序工作进展极为迅速。迄今已完成了约40多种生物的全基因组测序工作，人基因组约3x109碱基对的测序工作也接近完成。至2000年6月26日，被誉为生命“阿波罗计划”的人类基因组计划，经过美、英、日、法、德和中国科学家的艰苦努力，终于完成了工作草图，这是人类科学世上又一个里程碑式的事件。它预示着完成人类基因组计划已经指日可待。截止目前为止，仅登录在美国GenBank数据库中的DNA序列总量已超过70亿碱基对。在人类基因组计划进行过程中所积累起来的技术和经验，使得其它生物基因组的测序工作可以完成得更快捷。可以预计，今后DNA序列数据的增长将更为惊人。生物学数据的积累并不仅仅表现在DNA序列方面，与其同步的还有蛋白质的一级结构，即氨基酸序列的增长。此外，迄今为止，已有一万多种蛋白质的空间结构以不同的分辨率被测定。基于cDNA 序列测序所建立起来的EST数据库其纪录已达数百万条。在这些数据基础上派生、整理出来的数据库已达500余个。这一切构成了一个生物学数据的海洋。可以打一个比方来说明这些数据的规模。有人估计，人类（包括已经去世的和仍然在世的）所说过的话的信息总量约为5唉字节（1唉字节等于1018字节）。而如今生物学数据信息总量已接近甚至超过此数量级。这种科学数据的急速和海量积累，在人类的科学研究历史中是空前的。 数据并不等于信息和知识，但却是信息和知识的源泉，关键在于如何从中挖掘它们。与正在以指数方式增长的生物学数据相比，人类相关知识的增长（粗略地用每年发表的生物、医学论文数来代表）却十分缓慢。一方面是巨量的数据；另一方面是我们在医学、药物、农业和环保等方面对新知识的渴求，这些新知识将帮助人们改善其生存

保护生物学大纲-公选课.doc

《生物多样性》 一、课程基本信息 课程编号： 课程中文名称：生物多样性 课程英文名称：Biological Conservation 课程类型：公共选修课 总学时：36 理论学时：36 学分：2 适用专业：全校各专业 开课院系：生命科学学院 二、课程性质和任务 本课程是面向全校各专业学生的一门公共选修课程。本课程的任务是使学生明确生物多样性的内容和价值，生物多样性丧失的主要原因、人类的活动对生物多样性的影响；掌握保护生物学的基本原理、方法和实施措施；了解生物多样性保护法规和各种保护机构。使学生具备生物多样性保护的基本知识，在今后工作和生活中自觉树立的环境保护和可持续发展意识。 三、课程教学目标 在学完本课程之后，学生能够： 1．理解生物多样性及其保护的定义、范畴、基本原理；了解生物多样性保 护的现状和发展趋势及各种生物多样性保护措施； 2．了解造成生物多样性危机的主要原因及物种濒危的程度； 3．树立科学发展观，自觉保护环境、参与生物多样性保护行动。 四、理论教学环节和基本要求 第一章生物多样性概念、价值及中国生物多样性特征 1．掌握生物多样性的概念和层次； 2．了解生物多样性的价值，理解生物多样性的重要性； 3．了解中国生物多样性的特征。 本章重点：生物多样性的概念、层次；生物多样性的价值。 本章难点：生物多样性的伦理价值。 第二章遗传的多样性 1．掌握遗传多样性的概念、产生基础，了解遗传多样性的意义； 2．了解遗传多样性的研究方法和测度方法； 3．理解遗传多样性研究的意义。 本章重点：遗传多样性的产生基础。

本章难点：遗传多样性的检测方法及测度。 第三章物种的多样性 1．理解物种概念，掌握物种多样性的概念； 2．理解物种多样性的分布格局； 3．了解全球的物种多样性概况及中国物种多样性特点及分布核心。 本章重点：物种多样性的概念，全球物种多样性概况及分布格局。 本章难点：物种概念及物种多样性分布格局。 第四章生态系统的多样性 1．掌握生态系统多样性概念； 2．了解全球生态系统的类型及其划分依据； 3．了解全球主要生态系统类型及中国生态系统的特点； 4. 了解生态系统多样性的测度方法（α多样性和β多样性测度方法），理解生态系统的多样性的动态变化和监测手段，明确物种多样性与生态系统功能的关系。 本章重点：掌握生态系统多样性的测度方法，生态系统变化的几方面以及生态系统多样性监测的重要意义和监测内容。 本章难点：生态系统多样性的测度方法，并理解各种指数的含义及应用。 第五章生物多样性演化的宏观因素 1．理解在地质史上生物多样性一直在发生变化； 2．了解地质年代、大陆形成及漂移、第四纪冰川及青藏高原隆起对生物多 样性演化的重大影响； 3．理解物种大灭绝的概念及灭绝的周期性。 本章重点：各种地质事件对全球生物多样性演化的影响。 本章难点：物种灭绝的周期性。 第六章人类冲击对生物多样性影响 1. 了解人类与自然环境关系的演化过程及其原因； 2. 理解现代人类活动对自然环境造成的各种不良影响。 本章重点：人类活动对自然环境及生物多样性造成的不良影响。 本章难点：人类活动对自然环境及生物多样性造成的不良影响。 第七章生物多样性丧失 1．理解并掌握生物多样性丧失的表现层次； 2．理解遗传多样性丧失、物种灭绝及生态系统丧失的原因； 3．明确人类活动是造成当今生物多样性的主要原因；

文献计量学六大规律

文献计量学：文献分布定律，布拉德福定律，词频分布定律，齐普夫定律，科学论文作者分布定律，洛特卡定律，文献增长，科学文献老化，引文分析，情报冗余等。 文献信息源的定量研究开始于20世纪初。在20世纪70年代末，就形成了布拉德福定律、齐普夫定律、洛特卡定律、文献增长规律、文献老化规律、文献引用规律等六大规律，并在后来的研究中得到不断的完善与发展。 布拉德福定律：也称文献分散定律。是由英国文献学家布拉德福（S.C.Bradford）1934 年首先提出。它是定量描述科学论文在相关期刊中集中——分散状况的一个规律。经过后来的许多研究者的修正和研究，发展成为著名的文献分布理论。布氏定律的文字描述为“如果将科学期刊按其刊载某个学科领域的论文数量以递减顺序排列起来，就可以在所有这些期刊中区分出载文量最多的…核心?区和包含着与核心区同等数量论文的随后几个区，这时核心区和后继各区中所含的期刊数成1:a:a 2 …… 的关系（a>1）。”布氏定律主要反映的是同一学科专业的期刊论文在相关的期刊信息源中的不平衡分布规律。布氏定律的应用研究也获得了许多切实有效的成果，应用于指导文献情报工作和科学评价，选择和评价核心期刊，改善文献资源建设的策略，确立入藏重点，了解读者阅读倾向，评价论文的学术价值以节约经费、节约时间，切实提高文献信息服务和信息利用的效率和科学评价的科学性。 洛特卡定律：是由美国的统计学家、情报学家洛特卡（A.J.lotka）研究出来的描述科学论文作者动态的最早的量化规律。在科研活动中，不同人的科研能力及其成果著述数量肯定是不同的。那么，在同样的一段抽样时间内，不同的科技工作者的论著数量分布有没有什么规律呢？1926 年，洛特卡发表了论文“科学生产率的频率分布”。他在文中统计分析了化学和物理学两大学科中一段时间内科学家们的著述情况，提出了定量描述科学生产率的平方反比分布规律，又被称为“倒平方定律”。其经典公式为：f(x) =（C为常数）上式的意义为：设撰写X 篇论文的作者出现频率为f(X) ，则撰写X篇论文的作者数量与他们所写的论文数量呈平方反比关系。如撰写了2篇论文的作者数量大约是撰写了一篇论文的作者数量的1/4 （即1/2 2 ），写3篇论文的作者数量大约是一篇论文作者数量的1/9（即1/32），写n篇论文的作者数量大约是写一篇论文作者数量的1/n 2。洛特卡定律，探讨了科学论文著者的不平衡分布规律。通过他的研究成果，我们可以明确：在宏观的科学著述活动中，少数作者写出了大量的文章；反之，而大多数人的著述则是不多的。研究科技工作者及其论著间的数量关系有很重要的现实意义。在信息资源管理和信息利用过程中，可以用它来预测著者数量和文献数量，掌握作者的研究动态，提示不同领域中文献现状和趋势，便于对文献信息源进行有效的选择，搜集和科学管理。在科学学中，还可用它来研究科研工作者的创造活动规律，研究人才及其成果分布规律。如普赖斯就从洛特卡定律推论出“杰出科学家数量仅仅是科学家数量的平方根”。 齐普夫定律：是由美国语言学家齐普夫（G.K.Zipf）于1935年研究发现的关于文献中的词频分布规律。其具体表述如下：如果将一篇达到一定长度的文章中的词按其出现频率递减排序，根据频率高低编上相应的等顺序号，次最高的为 1 级，其次为2 级…… ，这样一直到若干级，如果用 f 表示词在文章中出现的频率，用r 表示词的等级序号，则有： fr = c (c 为常数) 应用词频分布规律及其参数，可以预测关键词的数量，计算各词汇的重要程度，对于文献标引与词汇控制、词表的编制、文献信息检索等方面都具有重要的应用价值。文献增长规律：随着科学的不断发展，科学文献的增长也成为一种客观的社会现象。对于这一现象人们在20 世纪初就已注意到。但一直到20 世纪40 年代后，由于当时图书馆管理的需要，特别是科学史研究以及科技情报工作发展的需要，文献增长规律才被研究者重视，取得了一系列研究成果。其中最具代表性的是普赖斯（D.Price ）提出的科学文献的指数增长规律。普赖斯在其著作《巴比伦以来的科学》中考察统计了科学期刊的增长情况，发现科学期刊的数量大约每50 年增长10 倍。他以科技文献量为纵轴，以历史年代为横轴，不同

为什么保护野生动物选修课论文.

奇妙的动物世界论文 为什么要保护野生动物 学院：化学与环境工程学院 姓名：王鹏 专业班级：化学工程与工艺10-1 指导老师：王双山 时间：2012.12.22

为什么要保护野生动物 无论人类怎么保护，每一只朱鹮、华南虎、大熊猫都会死掉，那为什么要挽救它们呢？而作为一个物种，任它们灭绝又如何？花那么多钱保护大熊猫值得吗？这些野生动物保护领域的基本问题，屡受争议。野生动物保护，并不只是保护一个会卖萌的物种那么简单。 个体的意义 在野生动物保护工作的各个领域里，最直观、最感人，也最容易引发共鸣的，无疑是“救助个体”。看到一只伤愈的红隼重返蓝天，足以让每一个在场者热泪盈眶。 但是，很容易被志愿者忽略的一点是，救助野生动物个体的价值往往并不在个体本身，而更多地在个体背后的整个种群。这和救助人类社会中的弱势群体。动物和人的差异很多，按照演化生物学家道金斯等人的观点，最大的差异可能在于动物缺乏文化。在这里，文化的定义是“与遗传无关、但可以模仿和传承的行为模式”。 人类社会中，文化因素正在逐渐压倒遗传生理的因素。我们对自我的改造能力越来越强，先天遗传素质的重要性也越来越小。当我们说“每个人都独一无二” 的时候，这种独特性大部分来源于后天。而一个人对社会的贡献更是几乎全部来自文化领域：他的一生中会创造出无数的新思想和新事物，影响身边的每一个人；而当他死去时，哪怕他的血脉有后代来传承，那些未曾表达出来的无数思想也会永远消失。相比之下，他对人类的遗传贡献显得微不足道。 然而，野生动物个体在环境中的绝大部分行为，都可以回溯到它的基因；个体间的文化传承即便存在，影响也通常微乎其微。如果两群狼面对同一场景做出了不同的反应，那是因为它们的遗传特征不同，而不是因为它们各自经历了不同的狼群历史、有不同的狼群文化。就算有动物因为和人相处而从人类这里习得了复杂的行为，当它回归野外时也几乎不可能把自己学会的“人类技巧” 教给其它动物、改变原有的文化。一种不适应其所在环境的人类文化可以导致一个文明的毁灭，但动物界中的文化似乎从来没有这样巨大的效果。 因此，野生动物的价值更多地承载于它的基因之中，种群本身的延续更为关键。个体的死亡是必然的，但基因通过种群基因库可以长存下去，维持物种的存

生物信息学小论文

生物信息学的过去现在和将来 摘要：生物信息学是生物技术的核心,是一门由生物、数学、物理、化学、计算机科学、信息科学等多学科交叉产生的新兴学科。本文介绍了生物信息学的概念,分析了发展生物信息学对现今科学发展的重大意义。根据生物信息学的发展特点,具体分析了生物信息学研究的内容:基因组序列的分析; 基因进化;药物设计; 基因区域预测; 基因功能预测;蛋白质结构预测。评述了生物信息学发展的现状,指出我国生物信息学发展中存在的问题, 并对我国发展生物信息学提出了一些建议。最后分析了生物信息学发展的方向, 展望了生物信息学的发展前景。 关键词：生物信息发展实际应用生产 正文： 生物信息学是生命科学、信息科学、数理科学等众多行馆学科相互交融所形成的一门新兴边缘学科，它随人类基因组计划（HGP）的实施而诞生，已旭旭发展成为当今生命科学的重大前沿领域之一。 一、生物信息学产生的背景 有人说, 基于序列的生物学时代已经到来,尽管对/ 序列生物学0这一提法可能有所争议,但是今日像潮水般涌现的序列信息却是无可争辩的事实。自从1990年美国启动人类基因组计划以来,人与模式生物基因组的测序工作进展极为迅速。迄今已完成了约40多种生物的全基因组测序工作,人基因组约3@109碱基对的测序工作也接近完成。至2000年6月26日,被誉为生命/ 阿波罗计划0的人类基因组计划,经过美、英、日、法、德和中国科学家的艰苦努力, 终于完成了工作草图, 这是人类科学史上又一个里程碑式的事件。它预示着完成人类基因组计划已经指日可待。截止日前为止,仅登录在美国GenBank数据库中的DNA序列总量已超过70亿碱基对。在人类基因组计划进行过程中所积累起来的技术和经验,使得其它生物基因组的测序工作可以完成得更为快捷。可以预计, 今后DNA序列数据的增长将更为惊人。生物学数据的积累并不仅仅表现在DNA 序列方面,与其同步的还有蛋白质的一级结构, 即氨基酸序列的增长。此外,迄今为止, 已有一万多种蛋白质的空间结构以不同的分辨率被测定。基于cDNA序列测序所建立起来的EST数据库其记录已达数百万条。在这些数据的基础上派生、整理出来的数据库已达500余个。这一切构成了一个生物学数据的海洋。可以打一个比方来说明这些数据的规模。有人估计,人类( 包括已经去世的和仍然在世的) 所说过的话的信息总量约为5唉字节( 1唉字节等于10@18字节) 。而如今生物学数据信息总量已经接近甚至超过此数量级。这种科学数据的急速和海量积累,在人类的科学研究历史中是空前的。数据并不等于信息和知识, 但却是信息和知识的源泉,关键在于如何从中挖掘它们。与正在以指数方式增长的生物学数据相比, 人类相关知识的增长(粗略地用每年所发表的生物、医学论文数来代表) 却十分缓慢。一方面是巨量的数据;另一方面是我们在医学、药物、农业和环保等方面对新知识的渴求,这些新知识将帮助人们改善其生存环境和提高其生活质