文档库 最新最全的文档下载
当前位置:文档库 › 磁珠法石蜡包埋组织基因组DNA 提取详细步骤

磁珠法石蜡包埋组织基因组DNA 提取详细步骤

磁珠法石蜡包埋组织基因组DNA 提取详细步骤
磁珠法石蜡包埋组织基因组DNA 提取详细步骤

磁珠法石蜡包埋组织基因组DNA 提取详细步骤

注意事项

需要自备材料:二甲苯、无水乙醇、异丙醇、磁铁或磁架、1.5mL离心管(最好低吸附的离心管);需要去除RNA自备RNase A(100mg/ml),在蛋白酶K消化这一步加入4 μl RNase A;◆整个过程请勿离心,以免磁珠不可逆聚集而影响提取效果。

实验准备

磁珠用前一定要充分混匀;◆56℃和80℃加热源;◆使用前需在Buffer FTGWI中加入相应体积的无水乙醇,使乙醇比例占80%。

操作步骤

1.脱蜡:①切下5 片厚度约为10μM(重约10mg)的组织块,尽量切去石蜡部分,置于1.5ml的离心管中。加入1ml二甲苯,并振荡30s,然后室温放置5分钟。20℃,14000 x g 离心3 min,用移液器移尽上清。②加入1ml 100%乙醇振荡离心管20s,然后20℃,14000 x g 离心3 min,用移液器移去上清,室温干燥组织沉淀15min。注意:任何残留的乙醇可能会影响蛋白酶K的消化以及减少核酸的得率

2. 消化:加300 μL Buffer FTGL,振荡至彻底悬浮,用匀浆机进行匀浆破碎(使其彻底无大块组织残留),再加入20 μL蛋白酶K(PK),于56℃温浴15min (期间不时混匀),然后置于80℃ 15min;注意:①组织大于50mg时需要增加蛋白酶K (PK)的用量。

3. 裂解结合:将离心管从80℃加热器上离开,冷却至室温,在上清液中加入600 μl Buffer FTGB和600uL 异丙醇,最后加入磁珠悬浮液(MB) 30 μL(使用

前充分重悬),颠倒混匀5分钟;将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体。

4. 漂洗:

(1) 将离心管从磁力架上取下,向离心管中加入500 μl Buffer FTGW0,轻微涡旋振荡5S,使磁珠重悬,将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体,重复该步骤一次。

(2) 将离心管从磁力架上取下,向离心管中加入500 μl Buffer FTGW I,轻微涡旋振荡5S,使磁珠重悬,将离心管放置于磁力架上,待磁珠完全吸附后吸弃液体。重复该步骤一次,待磁珠完全吸附后吸弃液体(液体一定要弃尽,不然残留会影响下游实验),晾干2min。

5. 洗脱:将离心管从磁力架上取下加入50-200 μl Buffer EB ,剧烈涡旋振荡,重悬磁珠(一定要完全重悬磁珠,若未充分重悬会影响DNA得率),56℃ 放置5min(每隔2min振荡混匀重悬磁珠),置于磁力架上,将上清DNA转移至一新的离心管中,放入-20 ℃ 保存备用,保质期为2 年。

相关文档