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无创产前基因检测胎儿染色体非整倍体的临床应用研究_温海琦

无创产前基因检测胎儿染色体非整倍体的临床应用研究_温海琦
无创产前基因检测胎儿染色体非整倍体的临床应用研究_温海琦

胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(高通量测序法)注册技术审查指导原则(2017年第52号)

附件 胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13) 检测试剂盒(高通量测序法)注册技术 审查指导原则 本指导原则旨在指导注册申请人对胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(高通量测序法)注册申报资料的准备及撰写,同时也为技术审评部门对注册申报资料的技术审评提供参考。 本指导原则是针对该类试剂的一般要求,申请人应依据产品的具体特性确定其中内容是否适用,若不适用,需具体阐述理由及相应的科学依据,并依据产品的具体特性对注册申报资料的内容进行充实和细化。 本指导原则是对申请人和审查人员的指导性文件,但不包括注册审批所涉及的行政事项,亦不作为法规强制执行,如果有能够满足相关法规要求的其他方法,也可以采用,但需要详细阐明理由,并对其科学合理性进行验证,提供详细的研究资料和验证资料,相关人员应在遵循相关法规的前提下使用本指导原则。 本指导原则是在现行法规和标准体系以及当前认知水平下

制定的,随着法规和标准的不断完善,以及科学技术的不断发展,本指导原则相关内容也将适时进行调整。 一、范围 胎儿染色体非整倍体(Fetal Chromosome Aneuploidies)中的21三体、18三体、13三体(Trisomies 21、Trisomies 18、Trisomies13,即T21、T18、T13)是临床上最常见的染色体非整倍体疾病。其对应的分别为21-三体综合征(又称唐氏综合征,先天愚型或Down综合征)、18-三体综合征(又称Edwards综合征)和13-三体综合征(又称Patau综合征),发病率分别约为1/700、1/6000、1/10000,患儿绝大多数存在严重智力障碍及器官畸形。 产前筛查和产前诊断是为避免产生遗传缺陷患儿提供的手段。常规的产前筛查方法包括:早孕期的超声与血清学联合筛查和中孕期母体血清学筛查。筛查结果为高风险的孕妇经建议经产前诊断进行最终确认,由孕妇知情选择。胎儿染色体异常的产前诊断金标准为介入前产前诊断手术,是指通过绒毛取材术/羊膜腔穿刺术/经皮脐血管穿刺术,取相应细胞采用细胞生物学方法对胎儿染色体进行核型分析。 高通量测序方法检测胎儿染色体非整倍体的原理是:孕妇母体血浆中存在胎儿游离DNA(cell-free DNA,cfDNA),长度约为75bp—250bp,几乎全部来源于胎盘的滋养层细胞,其浓度和

胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(高通量测序法)注册技术审查指导原则(2017年第52号)

附件 胎儿染色体非整倍体( T21、 T18、 T13) 检测试剂盒(高通量测序法)注册技术审查指 导原则 本指导原则旨在指导注册申请人对胎儿染色体非整倍体 (T21、T18 、T13)检测试剂盒(高通量测序法)注册申报资料 的准备及撰写,同时也为技术审评部门对注册申报资料的技术审 评提供参考。 本指导原则是针对该类试剂的一般要求,申请人应依据产品的 具体特性确定其中内容是否适用,若不适用,需具体阐述理由及相 应的科学依据,并依据产品的具体特性对注册申报资料的内容进行 充实和细化。 本指导原则是对申请人和审查人员的指导性文件,但不包括注 册审批所涉及的行政事项,亦不作为法规强制执行,如果有能够满 足相关法规要求的其他方法,也可以采用,但需要详细阐明理由, 并对其科学合理性进行验证,提供详细的研究资料和验证资料,相 关人员应在遵循相关法规的前提下使用本指导原则。 本指导原则是在现行法规和标准体系以及当前认知水平下 制定的,随着法规和标准的不断完善,以及科学技术的不断发展, —1——

本指导原则相关内容也将适时进行调整。 一、范围 胎儿染色体非整倍体(Fetal Chromosome Aneuploidies )中 的21 三体、 18 三体、 13 三体( Trisomies 21、 Trisomies 18、Trisomies13 ,即 T21 、T18、T13)是临床上最常见的染色体非整 倍体疾病。其对应的分别为 21-三体综合征(又称唐氏综合征,先天愚型 或 Down 综合征)、18-三体综合征(又称 Edwards 综合征)和 13-三体 综合征(又称 Patau 综合征),发病率分别约为 1/700、1/6000、1/10000,患儿绝大多数存在严重智力障碍及器官畸形。 产前筛查和产前诊断是为避免产生遗传缺陷患儿提供的手 段。常规的产前筛查方法包括:早孕期的超声与血清学联合筛查和中 孕期母体血清学筛查。筛查结果为高风险的孕妇经建议经产前诊断进 行最终确认,由孕妇知情选择。胎儿染色体异常的产前诊断金标准 为介入前产前诊断手术 ,是指通过绒毛取材术 /羊膜腔穿刺术 /经皮脐 血管穿刺术,取相应细胞采用细胞生物学方法对 胎儿染色体进行核型分析。 高通量测序方法检测胎儿染色体非整倍体的原理是:孕妇母体 血浆中存在胎儿游离DNA (cell-free DNA ,cfDNA ),长度约为 75bp— 250bp,几乎全部来源于胎盘的滋养层细胞,其浓度和 孕周密切相关并以一定比例( 5%— 30%)稳定存在于母体外周血 浆中。高通量测序方法通过取母体血浆提取包含正常母体和胎 —2——

无创dna产前筛查都检测哪些项目

无创dna产前检测都有哪些项目?95项全 什么是无创dna产前检测? 无创DNA产前检测,是一种非侵入性的胎儿染色体异常检测技术,采用第二代高通量DNA测序技术和结合生物信息学分析,只需抽取孕妇的静脉血,便可以预先知道胎儿患有21三体综合症(唐氏综合症)、18三体综合症(爱德华氏综合症)、13三体综合症(巴陶氏综合症)的风险率。 检测准确率高达99.9%,假阳率更低于0.1%。同时也可检测性染色体非整倍体综合症以及染色体缺失症等。是检查胎儿是否为唐氏儿的一种产前筛查手段。无创dna产前检测都有哪些项目? 香港卓信/医/疗(v亻言fchkdna)无创dna产前检测最早怀孕10周就可检测,在技术上也是非常的成熟,也是很多孕妈妈最信赖的一种检测方式,它可以检测23对染色体,检测95项内容,其中有6项三倍体综合症、4项性染色体异常综合症、84项微缺失及微重复综合症以及XY染色体检测(男女检测)。

香港无创dna产前检测项目(95项全):6种三倍体综合症: Trisomy21(Down Syndrome唐氏综合症)* Trisomy18(Edwards Syndrome爱德华氏综合症)* Trisomy13(Patau Syndrome巴陶氏综合症)* Trisomy9(9号染色体三倍体) Trisomy16(16号染色体三倍体) Trisomy22(22号染色体三倍体) 4种性染色体异常综合症+XY染色体: 45,X(XO)(Turner Syndrome透纳氏综合症) XXY(Klinefelter Syndrome柯林菲特氏综合症) XXX(Triple Syndrome三X综合症) XYY(XYY Syndrome XYY三体综合症) 84种缺失和重复综合症 1.染色体1p31重复综合症 2.染色体1p32-p31缺失综合症 3.染色体1p36缺失综合症 4.染色体1q41-q42缺失综合症 5.染色体2p12-p11.2缺失综合症 6.染色体2p16.1-p15缺失综合症 7.裂手裂足症5型

华大基因、达安基因、贝瑞和康三大无创DNA检测技术平台比较

华大基因、达安基因、贝瑞和康三大无创DNA检测技术平台比较点击数:7561录入时间:2014-6-6[打印此页][返回] 2014年2月,国家食药监总局和卫计委联合发布通知,暂停基因测序临床应用。而在临床医学上,基因测序应用最广泛、最成熟的是无创产前基因检测,尤其 是产前唐氏综合征筛查。 相比于传统技术,无创产前基因检测仅需抽取少量孕妇外周血,用高通量测序 技术即可准确分析胎儿是否患有染色体疾病,具有安全、快速、检测周期短等 优势,已逐渐被中国大众所接受。据统计,无创产前基因检测目前在中国已经 积累了超过40万例临床应用。 “叫停令”直接影响了国内多家实施基因检测的公司,但所幸的是,“叫停” 并不是完全停止,通知第二条规定:“基因测序诊断产品应按规定经食品药品 监管部门审批注册,并经卫生计生行政部门批准技术准入方可应用。” 中国当前市场使用的测序仪均不符合这一条件。为促进无创产前基因检测在中 国市场尽快获批,各大测序服务提供商开始通过高通量基因测序仪的“国产化”,来满足现有的监管法规要求。 贝瑞和康此次联合Illumina共同生产新型测序仪,并向食药总局申请注册,使得Illumina公司的测序平台进入了中国的注册审批程序。 据财新网消息,除贝瑞和康外,当前正在向食药总局申请注册的“国产”测序 仪包括:华大基因的BGISEQ1000(基于CG的测序平台)、中山大学达安基因 股份有限公司的DA8600(基于Life Technologies公司的Ion Proton测序 平台)。 这些公司都是国内无创产前检测的领头公司。现在,他们站在差不多同一条起 跑线上,将在中国市场上进行搏杀。他们之间的竞争,将会走向何方?我们可 以从各自使用的技术平台和申报国家医疗器械注册证情况探知一二。 竞争激烈“国产化”将走向何方? 当前,全球市场上测序仪最主要的提供商是美国的Illumina公司和 Life Technologies公司,我国市场上的基因测序仪也几乎被这两家公司垄断。达安基因、华大基因、贝瑞和康等国内公司在无创产前检测领域竞争的背后, 实际上是Life Tech与Illumina两大技术平台的PK。 一、Life Tech/Illumina两大技术平台PK

开展无创产前基因检测项目工作实施方案

开展无创产前基因检测项目工作实施方案 为保障母婴健康,降低出生缺陷风险,提高我市出生人口素质,根据《中华人民共和国母婴保健法》和《X省产前诊断技术管理实施细则》有关规定,按照《中共X市委办公室X市人民政府办公室关于明确市委市政府X年十项重点民生工程及责任单位的通知》(X办〔X〕12号)要求,今年开始在全市育龄妇女中开展无创产前基因检测工作。 开展无创产前基因检测项目,能够尽早发现唐氏综合征、爱德华氏综合征、帕陶氏综合征等三种胎儿染色体非整倍体异常,避免先天性智力低下、生长发育迟缓、五官四肢内脏畸形、多流产或出生后不久死亡等。此项工作将本着“政府引导,知情自愿,科学规范”的原则,将出生缺陷干预关口前移至筛查环节,与国家免费孕前优生健康检查项目对接,解决生育政策调整后群众“生得好”的问题,从而有效降低出生缺陷发生率,提高出生人口素质。 一、服务对象、机构、内容 (一)服务对象及检测时间 1.夫妇一方具备X市本地户籍且符合计划生育政策,并按规范接受孕产妇健康管理服务(国家基本公共卫生服务项目)的孕妇。 2.妊娠时间为1+02-2+66周,月经不规律者以B超确定孕周的孕妇。 3.符合条件的妇女,按照市委、市政府制定的惠民政策,每孩次享受一次优惠的无创产前基因检测服务。

(二)服务机构 市妇幼保健院、县级妇幼保健计划生育技术服务机构(县妇幼保健院)、华大基因X医学检验所、省卫计委审批的产前诊断中心。 (三)服务内容 优生健康教育、产前咨询、无创产前基因检测等服务。 1.优生健康教育 向婚前和早孕夫妇传播优生科学知识,增强出生缺陷预防意识。由承担基本公共卫生服务的婚前、孕产期保健技术服务机构负责通过优生指导、优生咨询、优生宣传等多种方式,积极做好婚前和孕期预防先天性缺陷、遗传性疾病的健康教育,并发放《无创产前基因检测服务卡》(以下简称《服务卡》)。在《孕产期保健登记本》上做好相关登记。告知到市妇幼保健院或县级妇幼保健计划生育技术服务机构(县妇幼保健院)接受相关检测服务。2.无创产前基因检测标本采集对符合条件的孕妇进行采血,并按检测要求做好标本的储藏及运输。由市妇幼保健院和县级妇幼保健计划生育技术服务机构(县妇幼保健院)负责对符合享受此项目条件的孕产妇进行血样标本采集,并做好宣传咨询、登记,与孕妇签订《胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测临床申请单》、《检测知情同意书》、《检测医疗保险知情同意书》(以下简称保险书),检测结果发放、解读、异常病例的转诊和检测档案的管理。 二、服务流程

2016年无创产前筛查和诊断(NIPT)分析报告

2016年11月出版

正文目录 1、无创产前筛查和诊断(NIPT):精度高、风险低、无流产风险 (3) 2、NIPT 全球发展状况分析 (4) 2.1、主要地区发展 (4) 2.1.1、美国 (4) 2.1.2、欧洲 (6) 2.2、发展状况 (7) 2.3、市场规模及格局 (8) 3、NIPT 我国市场分析 (11) 3.1、发展历程 (11) 3.2、市场格局 (12) 3.3、规模展望 (13) 3.4、我国NIPT企业与国外企业的差异 (14) 3.5、我国各地无创产前基因检测(NIPT)相应政策 (15) 3.5.1、福建卫计委无创产前定价1400元,目前最低 (15) 3.5.2、深圳市NIPT纳入医保 (15) 3.5.3、湖北省NIPT定价1460元/次 (15) 3.5.4、江苏物价局NIPT定价价2210元/次 (15) 3.5.5、重庆市NIPT纳入医保 (16) 3.5.6、四川发改委定价NIPT定价2400元/次 (16) 3.5.7、贵州省高龄单独两孩孕产妇出生缺陷基因筛查享受全免费政策 (16) 3.5.8、湖南省:计划生育特殊家庭可享免费产前诊断,但未对孕妇无创产前基因检 测纳入医保进行规定 (17) 3.6、最新规范通知出台,NIPT发展驶入新蓝海 (17) 3.7、国内NIPT市场商业模式分析 (19) 4、未来基因测序发展趋势:拓展辅助生殖和癌症等领域 (20) 5、投资策略与建议 (20) 6、风险提示 (20) 图表目录 图表 1:NIPT 的原理介绍 (3) 图表 2:NIPT替代传统三体筛查技术指日可待 (7) 图表 3:美国主要 NIPT 公司介绍 (9) 图表 4:国外NIPT公司概况 (10) 图表 5:我国NIPT市场情况概述 (13) 图表 6:我国关于 NIPT 的政策变化 (13) 无创产前筛查和诊断(NIPT):精度高、风险低、无流产风险 无创产前筛查和诊断(NIPT, Non-Invasive Prenatal Testing)是一种非侵入性产前检测,即通过采集孕妇外周血提取胎儿游离DNA 的方式,精准检测胎

无创产前基因检测知情同意书 (1)

无创产前基因检测知情同意书 无创产前基因检测是通过采集孕妇外周血(5ml),提取游离DNA,采用新一代高通量测序技术,结合生物信息分析,得出胎儿患染色体非整倍性疾病(21-三体又称唐氏综合征,18-三体,13-三体)的风险率,准确率为99%以上;具有无创取样、无流产风险、高灵敏度,准确性高的特点。该方法最佳检测时间为孕早、中期,且不需要实施穿刺手术,避免了孕妇疼痛、出血及胎儿流产、感染等风险,是非常安全的检测方法。 无创产前基因检测是一项安全性高的早中孕期无创性非介入性的产前筛查技术,进行该检测你需要知情以下内容: 1、无创产前检测抽血与常规静脉采血方法相同,采集5mL静脉血用于检测;采血不需要空腹,只要正常饮食、作息即可。 2、该方法检测时间为孕12周(超声推算或确认)之后,最佳检测孕周为12~24周。 3、无创产前检测可在孕12周开始进行,但鉴于当前医学检测技术水平的限制和孕妇个体差异等原因,即使在检测人员已经履行了工作职责和操作规程的前提下,仍有可能会出现假阳性或假阴性;如果孕妇孕周推测不准,或孕周过小(实际孕周<12周),可能影响检测结果的准确性。 4、无创产前检测仅针对21三体综合征(唐氏综合征)、18三体综合征(爱德华氏综合征)、13三体综合征(帕陶氏综合征)三大染色体疾病。 5、无创产前检测不适于检测:胎儿染色体中的嵌合体型、易位型、微缺失、微重复等结构性异常;怀有多胞胎的孕妇;孕妇本人为染色体非整倍体疾病患者;孕妇接受过移植手术、干细胞治疗;孕妇在4周之内接受过免疫治疗;孕妇在一年之内输注过异体血制品等。 6、由于孕妇个体化差异导致的血浆中胎儿DNA浓度过低,可能需要重新抽血取样;若不重新抽血取样则不能获得退费。 7、本检测结果仅供参考,不作为最终确诊结果。如检测结果为高风险,需进行产前诊断及遗传咨询;如胎儿患疾病的风险为低风险,建议继续进行常规产检;相关解释需咨询临床医生。 孕妇方已知晓上述所有内容,已充分了解该检查的准确性和局限性,对其中的疑问已得到医生的解答,经本人慎重考虑愿意进行该项检测,并承担因检测带来的相关风险。孕妇方承诺提供的个人资料真实可靠;同意在去掉所有个人信息后,检测数据可供研究参考并同意将该检测样本用于非赢利性的科学研究。为确认上述内容为双方意思的真实表达,医方已履行了告知义务,孕妇方已享有充分知情和选择的权利,签字生效。 孕妇同意(签字)医生(签字) 身份证号日期年月日日期年月日

无创胎儿染色体非整倍体产前检测技术的应用

无创胎儿染色体非整倍体产前检测技术的应用 无创胎儿染色体非整倍体产前检测技术是20多年来基因组学首个真正意义上能够进入临床应用领域的创新性突破,以下是搜集的一篇探究无创胎儿染色体非整倍体产前检测技术的,供大家阅读查看。 研究发现,孕妇外周血浆中存在胎儿游离DNA(cffD-NA),长度在75bp和250bp之间,平均为166bp。怀孕4周可检出,8周后含量上升并稳定存在(7周建立胎儿胎盘循环),其含量在5%~30%之间,能够通过高通量方法稳定检测出来。cffDNA以核小体形式稳定存在,在分娩后2h内快速消失从而不会影响下一胎的检测。因此,可以作为非创伤性产前检测的理想材料。 xx年8月,我院与中国医学遗传中心,湖南家辉遗传专科医院,北京贝瑞和康生物技术有限公司合作开展了“无创胎儿染色体非整倍体产前检测”,xx年8月-xx年8月,对257例孕13周~26周孕妇外周血进行了胎儿游离DNA检测。 检测的257例孕妇外周血中,253例正常,4例异常。其中:1例提示21-三体阳性,羊水结果证实(无假阳性,无假阴性)。1例提示18-三体阳性,羊水结果证实(无假阳性,无假阴性)。1例提示13-三体阳性,羊水结果正常(有假阳性,无假阴性)。1例提示母体性

染色体异常,对孕妇外周血进行染色体检查,结果为46,XXX/46,XX(60%∶40%)(无假阳性,无假阴性)羊水结果提示胎儿正常。阳性率为1.56%,灵敏度99%以上。 3.1国外临床试验结果:自1997年发现母体血液中存在胎儿游离DNA之后,无创伤的直接检测胚胎染色体异常成了一个重大的研究课题。xx年 ___中文大学和美国斯坦福大学的研究人员相继发表了应用高通量测序技术从母体血浆DNA中检测胎儿21三体的论文。xx 年 ___中文大学、美国Sequenom公司和VerinataHealth公司先后开展了应用高通量测序方法检测胎儿21、18、13号染色体的临床试验。 3.1.1 ___中文大学于xx年1月发表于英国医学 ___(BritishMedicalJournal)的文章表明,通过对753例高危孕妇的血浆DNA进行检测,准确检出86例唐氏综合征胎儿,灵敏度大100%,3例假阳性,无假阴性。 3.1.2Sequenom公司的临床结果于xx年3月发表于AJOG,该机构对449例高危孕妇的血浆DNA进行了检测,准确诊断出39例T21样本,1例假阳性,无假阴性,与 ___中文大学的结果非常相似。

内容胎儿染色体异常无创产前基因检测试剂技术参数

胎儿染色体异常无创产前基因检测试剂技术参数 特别提醒: 1.加注“*”号的为核心指标,如投标设备/产品未达到招标文件上“*”号指标要求,即做废标处理。 技术参数参考文献:

[1] Benn P, Cuckle H, Pergament E. Non-invasive prenatal testing for aneuploidy: current status and future prospects. Ultrasound Obstet Gynecol. 2013;42(1):15-33. PMID: [2].Gil MM, Quezada MS, Revello R, Akolekar R, Nicolaides KH. Analysis of cell-free DNA in maternal blood in screening forfetal aneuploidies: updated meta-analysis. Ultrasound Obstet Gynecol .2015;45(3):249–266. PMID: . [3] Zhang H, Gao Y, Jiang F, Fu M, Yuan Y, Guo Y, Zhu Z, Lin M, Liu Q, Tian Z, Zhang H, Chen F, Lau TK, Zhao L, Yi X, Yin Y, Wang W.Non-invasive prenatal testing for trisomies 21, 18 and 13: clinical experience from 146,958 pregnancies. Ultrasound Obstet Gynecol. 2015; 45(5):: .

基于孕妇游离DNA的胎儿染色体非整倍体检测试剂质量控制技术评价指南(高通量测序法)征求意见稿

基于孕妇游离DNA的胎儿染色体非整倍体检测试剂质量控制技术评价指南(高通量测序法) (征求意见稿)

1.前言 对孕妇外周血中游离DNA进行高通量测序(Next Generation Sequencing, NGS),并分析孕妇外周血中携带的胎儿的染色体突变异常风险,特别是染色体非整倍体变异的检测,是近几年出现的无创产前筛查新技术。 本指南主要是对企业研发、质检和产品应用关于质量控制和分析的指导性文件,应在遵循相关法规的前提下使用本指南。 本指南旨在规范申请人在胎儿染色体非整倍体检测试剂盒(高通量测序法)的产品设计开发、性能评价的诊断试剂技术指标和要求,并为技术审评部门对注册申报资料的技术审评提供参考,不代替注册申报资料的准备及撰写的指南和规范。 本指南仅作为技术指导性文件使用,需根据技术的发展和实际需要进行适当的更新,本指南不具有法律强制性。 2.适用范围 本指南所述的胎儿染色体非整倍体检测试剂(Noninvasive Prenatal Test, NIPT)是 采用低深度全基因组的高通量测序法,指的是直接通过对孕妇外周血中游离DNA进行文库构建、上机测序的第二代高通量测序方法,并不完全适用于高深度的目标片段测序法,SNP突变测序法和表观遗传学甲基化的测序法等其他高通量测序法。和本指南不相适应的其他高通量测序法,可以参照本指南的性能评价、质量控制的要求,并通过企业参考品,证明和本指南的要求具有实质性的等效性。 对于第三代单分子测序或其他测序方法,在文中并未涉及,但高通量测序技术发展迅速,第三代单分子测序方法在企业内部参考品设置、性能评估等,如有适用的方面,可以参照执行并证实实质性的等效性。

刘兴会教授:胎儿染色体非整倍体无创产前筛查(2016年ACMG声明更新)

刘兴会教授:胎儿染色体非整倍体无创产前筛查(2016年 ACMG声明更新) 翻译:苏明连刘兴会陈锰单位:四川大学华西第二医院产科参考文献:Gregg et al. Noninvasive prenatal screening for fetal aneuploidy, 2016 update: a position statement of the American College of Medical Genetics and Genomics. Genet Med. 2016 Oct;18(10):1056-65. 自2013年美国遗传学和基因组学学会(ACMG)首次发表声明以来,应用细胞游离DNA的无创产前筛查(NIPS)已经被快速整合进入产前检查体系。新的证据强烈推荐在不同年龄段的非肥胖妇女中,妊娠9-10周以后,NIPS可以取代针对Patau综合征,Edwards综合征,和Down综合征的传统筛查。进行NIPS前的咨询至关重要,但咨询需要超出Patau 综合征,Edwards综合征,和Down综合征这三个综合征的范围。鉴于目前没有其他的筛查方法,应用NIPS筛查性染色体非整倍体及有临床意义的拷贝数变异(CNVs)越来越常见。 本声明强调所有的遗传学筛查都存在残余风险。需要重点强调的是NIPS不是针对患者的筛查;在临床上不用于单基因病的筛查;不用于预测晚期妊娠并发症;也不能筛查开放性神经管缺陷,故仍然应在妊娠15-20周时检测母亲血清甲胎

蛋白以筛查开放性神经管缺陷。NIPS无法取代常规得胎儿解剖学超声筛查。 NIPS临床实践:基因检测是一个多方面的临床过程 在妊娠期进行基因检测或者筛查,是出于向患者提供信息便于他们优化妊娠结局的目的。遗传学咨询贯穿了基因检测或筛查的整个主题,咨询的核心是建立患者的偏好和期望。患者的信息偏好对在产检中使用NIPS起重要作用。ACMG推荐:检测前的咨询,应当充分告知患者能够(例如非整倍体,易位,微缺失和微重复)和不能够被识别(例如单基因疾病)的异常类型,以及检测的缺点,以便优化患者不依赖筛查方法的决策。检测实验室应当与公共健康组织,政策制定者和私人支付方合作,使得NIPS,包括检测前、检测后教育和咨询,对所有妊娠妇女可及。允许患者根据个人目的和偏好选择胎儿染色体非整倍体和/或基因变异的诊断和筛查方法。告知所有妊娠期妇女诊断性检查(CVS或者羊膜穿刺术)是检测染色体异常和有临床意义的CNVs的选择之一。 NIPS的应用 1.告知所有妊娠期妇女,筛查传统的染色体非整倍体(包括Patau综合征,Edwards综合征,和Down综合征),NIPS是最敏感的方法。不推荐NIPS用于除Patau综合征,Edwards 综合征和Down综合征之外的其他常染色体非整倍体筛查。 2.应告知患者NIPS可扩展用于筛查性染色体非整倍体的可

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无创产前染色体非整倍体项目书

无创产前染色体非整倍体检测项目书 1

目录 华大基因简介 (3) 华大基因染色体相关项目(部分) (4) 基于孕妇外周血的胎儿染色体非整倍体无创基因检测 (4) (一)项目简介 (4) (二)现有技术比较 (6) (三)可行性分析及项目数据 (7) (四)样本要求 (9) (五)适用范围 (9) (六)技术路线 (10) (七)相关文章 (10) 2

华大基因简介 华大基因是国际领先的基因组学研究中心,拥有一批标志性的科研成果,致力于以先进的科学技术为民生造福,聚焦?基因与健康?领域。通过与国内外医疗机构广泛合作,积极地推动基因组领域所取得的科研成果与技术突破应用于医学健康实践;为?预防为主、服务民生?的新医疗健康体系提供强有力的技术和平台支撑。自2007以来,华大基因共在国际高水平杂志《自然》、《新英格兰医学》、《柳叶刀》、《细胞》、《科学》等期刊上发表论文200余篇。现有研发人员4000多人,拥有中国科学院院士、德国科学院院士及发展中国家科学院院士1人,深圳市高层次人才29人,其中国家级领军人才19人,地方级领军人才4人,后备级人才6人。广东省首批引进的重点科研团队国际肿瘤基因组创新研究团队成员10人。持专家证的外国专家2人。 2007年10月,依托华大基因全球领先的基因组技术力量,成立了深圳华大基因临床检验中心,先后通过了卫生部临床基因扩增检验实验室技术验收、ISO 9001:2008及ISO17025等资质认证。本中心以?基因引领未来?为理念,旨在建立标准化、规范化的独立医学检测服务平台,成为基因检测前沿技术的引领者,着重为生育健康、出生缺陷、单基因病、血液病、遗传代谢性疾病、病原微生物、肿瘤、药物基因组等相关方向提供研发及临床检测服务;致力于将拥有自主知识产权、技术领先的基因检验回馈社会,为人民的健康保驾护航。 妇幼健康状况直观地反映了国民的健康水平、生活质量和社会文明程度。出生缺陷是对妇幼生存健康最严重的威胁,是我国卫生体系的重点防控方向。基于 3

胎儿染色体非整倍体基因检测软件产品技术要求华大基因

2. 性能指标 2.1 通用要求 2.1.1 处理对象 本软件针对基因测序仪上获得的基因组DNA序列数据进行计算,获得分别与之对应的参考序列比对结果,并根据阈值进行统计和筛选达到对T13、T18、T21的检出目的,确定样本检测结果为阳性(确诊或高危)或阴性,可用于13、18、21常染色体的非整倍体基因检测数据分析。 2.1.2 最大并发数 本软件属于单机版软件,在服务器端标准配置要求下可行的最大并发用户数为1个。 2.1.3 数据接口 用户接口:软件采取功能键作为用户接口。模块之间采用函数调用、参数传递、返回值方式进行信息传递。各接口传递的信息是以数据结构封装了的数据,以参数传递或返回值的形式在各模块间传输。 产品接口:基因测序仪产生的测序下机数据。 2.1.4 特定软硬件 a)特定软件: 1)操作系统x64 Windows 7或以上; 2)R(版本号3.0.0或以上)。 b)特定硬件:基因测序仪 2.1.5 临床功能 1)数据筛选模块:可以实现按是否分析和测序日期对测序数据进行筛选;

2)测序批次选择模块:对输入路径下所有测序批次进行列表,并显示测序 批次ID; 3)样本选择模块:选择特定测序批次后,用户界面会列出该批次中所包含 的所有样本列表,用户可以选择一个或多个样本进行分析; 4)比对分析模块:对所选择的样本中的测序数据与参考序列进行比对,并 输出比对结果; 5)报告生成模块:测序数据分析完成后,会输出质控指标和分析结果;2.1.6 使用限制 本软件仅适用于与基因测序仪配套使用,仅供经专业培训的操作人员使用。 2.1.7 用户访问控制 本软件的调用和访问,受基因测序仪用户控制界面的限制,用户可根据界面上的图标进行操作,实现相应功能。 2.1.8 版权保护 使用了基于软件加壳的版权保护技术。 2.1.9 用户界面 用户通过视窗调用运行本软件。 2.1.10 消息 出自软件的消息应设计成使最终用户易于理解的形式。 2.1.11 可靠性 软件进行数据分析完成后会在本地固定路径自动对分析结果进行备份。 2.1.12 维护性 包括用户所需的维护信息: 1)软件可以自动监控数据产出情况,并自动运行主程序; 2)软件可以自动生成监控日志记录程序的运行情况; 2.1.13 效率 在满足软硬件标准配置条件要求下,处理一个标准数据量(5M reads)数据时间约为800秒左右,多核处理器可同时处理核数个样本,一个文库(16个样本)大约需要3200M的存储空间。 2.1.14 运行环境

无创基因检测常见问题-2011.12.28

胎儿染色体非整倍体无创基因检测常见问题 1.无创基因检测有哪些优点? 无创,安全,早期,准确,快速。 孕早期,只需抽取5ml孕妇外周血就可以进行。结果准确率高达99%以上,能够极大的减轻孕妇的心理负担,不用担心穿刺等刺激带来的流产等伤害,2-3周即可拿到检测结果。 2.无创基因检测与唐氏筛查有区别吗? 无创基因检测在孕早期(12周)即可进行,通过对母体外周血中胎儿的遗传物质DNA进行直接测序分析,具有很高的准确性;唐氏筛查检测的最佳时间为孕15-20周,是根据孕妇的激素水平结合年龄、孕周、体重等参数进行计算的,因影响因素较多,这些参数经常不是很准确,所以计算出的风险值也是有误差的。虽然检测的都是21,18,13号染色体是否异常,但无创基因检测的准确率较高,可以达到99%。 3.无创基因检测可以代替羊水穿刺吗? 不能互相代替,是两种检测方法。无创产前检测只需要抽取孕妇的静脉血,对孕妇及胎儿均无伤害,孕12周即可进行检测,三周左右出检测结果,对于21,18,13号染色体的检测准确率和羊水穿刺是一样的,99%以上;羊水穿刺需要抽取羊水,最佳检测时间为孕20-24周,对孕妇有一定的创伤,存在流产风险,也存在细胞培养失败的可能,大概要1个月出结果,目前是检测染色体异常的金标准,是诊断方法。 4.哪些人比较适合做无创基因检测?

所有希望排除胎儿染色体非整倍体,特别是21、18、13号染色体非整倍体的孕妇;唐氏筛查高危、临近高危但不愿首选创伤性检查的孕妇;年龄大于35岁,不能做唐氏筛查,又不愿首选创伤性检查的孕妇;因惧怕流产等风险拒绝创伤性检查的孕妇。 5.怀孕多少周可以进行无创基因检测? 最佳检测孕周为12-21周,部分大于21孕周的孕妇如有特殊需求并有较强意愿的,也可参加无创产前基因检测。 6.如果无创基因检测是低风险,还用做羊水穿刺吗? 无创产前基因检测项目目前承诺检测21,18,13号染色体的准确率是99%以上,如果希望了解其他染色体,可以依据自己的情况选择是否羊穿或者遵医嘱。 7.无创基因检测高风险怎么办? 医生会第一时间通知孕妇,及早到医院进行羊水穿刺核型分析等产前诊断;接受产前诊断产生的费用,对国家统筹支付之外的和个人支付部分,由中国人保报销支付,最高限额2500元。投保费用属无偿赠送,不需另行支付。 8.无创基因检测低风险,是不是孩子就没任何问题了? 无创检测,羊水穿刺检测都是针对染色体异常的检测,如果是发育异常引起的畸形等问题需要靠孕期B超监测,孕期的各项检测都很重要,一项检测不能解决所有的问题。 9.无创基因检测低风险,还是生出有问题的孩子怎么办? 如果无创检测为低风险,婴儿出生1年内经县级以上医院专科医生明确诊断为21-三体、18-三体、13-三体综合征的孕妇,由中国人

2017年基因检测公司大全

基因检测业务包括无创产前基因检测、液体活检(ctDNA技术)、肿瘤个性化用药、肠道微生物菌群、消费级基因检测、儿童天赋基因检测等等。 2017年基因检测公司大全 深圳 华大基因、华因康、康昕瑞、碳云智能、核子基因、康昕瑞、海普洛斯、微基因 Wegene、弘睿康hcode、裕策生物、承启医学、联合医学、美因生物、基因启示录、恒创基因、基因家、基因慧、瀚海基因、千年基因、谱元科技、斯坦福医学、因合生物、云蜂基因、乐土基因、蓝图基因、卓然基因、爱米基因、微健康基因、一道生物https://www.wendangku.net/doc/139459237.html,/ 北京 贝瑞和康、一脉基因、基云惠康、安诺优达、奥维森、诺禾致源、迈基诺、鑫诺美迪、普利莱基因、美佳基因、吉因加、博奥、齐康泰、中源协和、水母基因 广州 达安基因、金域检验、达瑞生物、锐博生物、安必平医药、基迪奥、永诺生物、益善生物、赛哲生物、赛哲生物、燃石生物、美格生物、艾基生物、库基生物、腾飞生物、拓普基因、博奥木花、嘉检医学、奇辉生物、基准生物、精科生物、贯善生物、迈景基因 上海 南方基因、解码基因、邃志生物、易瑞基因、天使生物等等 武汉 言行生物、康圣环球、武汉华大基因、生命之美、未来组生物、锦奥生物、博洪生物、树桥科技、贝纳基因、莎菲生物、大众源生、良培基因、爱基百客、冰港生物、点墨生物、拜科基因、康测科技、基诺赛克 成渝 中科院成都生物所、迈克生物、新基因格、博奥晶芯、先导药物、昂迈思、赛荣生物、云合基因、23魔方、云蓉科技、基因帮(生命基线)、奇恩生物、威斯腾生物、佰诺吉生物、浦洛通生物、倍斯瑞生物 江苏 南京迪康金诺、苏州首度基因、苏州智核生物、苏州贝康医疗、苏州金唯智生物、苏州泓迅科技、南京诺维赞生物、苏州吉玛基因、苏州贝斯派生物、苏州阅微基因、苏州健路生物、南京金斯瑞生物、南京世和基因、江苏亿康基因、苏州为真生物、苏州天昊基因、苏州天衍药业、苏州协云基因、苏州科贝生物 杭州 博圣生物、迪安诊断、浙江天科、联川生物、沃森生物、健洲生物、祥音生物、杭州贝瑞和康、中瀚金诺、谷禾信息、百迈生物、燃纳生物、米天基因、艾迪康医学、壹基因、名川生物、晶佰生物、科宁生物、基智基因、北角生物、本因生物、瑞普基因、圣庭生物、奥明基因

胎儿染色体非整倍体21三体18三体和13三体检测试剂盒高通量

《胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测试剂盒(高通量测序 法)》行业标准编制说明 一、工作简况 1、任务来源 高通量测序技术已经广泛的应用于胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测中,不同公司在不同的测序技术平台上开发了胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测试剂盒(高通量测序法)。目前尚无相关的标准对试剂盒的性能及使用进行规范。项目名称定为:“胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测试剂盒(高通量测序法)”。标准起草由中国食品药品检定研究院发起,中国食品药品检定研究院、深圳华大生命科学研究院、广州市达瑞生物技术股份有限公司、北京市医疗器械检验所、博奥生物集团有限公司等单位共同参与撰写。主要起草人:曲守方等。 2、工作过程 本标准于2018年3月形成工作组草案,2018年4月11日在北京召开了工作组草案讨论会,5月30日召开标准研讨会,针对工作组草案和验证方案进行了讨论。会后在2018年月至月组织企业对标准进行了验证,并形成征求意见稿。 二、标准编制原则和确定标准主要内容 1、标准制定的意义、原则 染色体非整倍体是指相对于人的正常的46条染色体而言,细胞中的某一条或几条染色体数目增加或减少,与婴幼儿期显著的发病率和死亡率有着密切的关系。我国新生儿中染色体异常的发病率为1/60,其中21三体(唐氏综合征)、18三体(爱德华氏综合征)和13三体(帕陶氏综合征)是三种最主要常染色体非整倍体疾病,在新生儿中发病率分别为1/(600-800)、1/(3500-8000)和1/(7000-20000) 。临床上对胎儿这几种病变产前诊断方法主要是通过B超引导下的羊水穿刺,再将羊水细胞培养后进行染色体核型分析。该技术检测结果准确,但所需时间长,检测过程中还可能导致羊水量骤减而造成胎儿宫内窘迫;另外羊水细胞不易培养,不便于大规模的产前普查。高通量测序的方法是通过检测孕妇外周静脉全血样本中的胎儿游离DNA,然后对测序信号的生物信息学分析,对21、18和13号染色体所属的DNA 片段数量进行统计,将统计的结果与大量正常样本构成的参考集合相比较,从而获得样品中所含的DNA 片段数量是否存在异常,从而实现对21、18和13三体综合征快速的产前辅助诊断。高通量测序技术在胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测中具有显著优势,不同公司进行了胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测试剂盒(高通量测序法)开发,但是不同的技术平台及评价指标不统一。目前尚无相关的标准对试剂盒的性能及使用进行规范,对临床使用上的风险不易把控。

43 胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(高通量测序法)指导原则(征求意见稿)+

附件1 胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(高通量测序法)技术审查 指导原则(征求意见稿) 一、前言 本指导原则旨在指导注册申请人对胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒(高通量测序法)注册申报资料的准备及撰写,同时也为技术审评部门对注册申报资料的技术审评提供参考。 本指导原则是对该类试剂的一般要求,申请人应依据产品的具体特性确定其中内容是否适用,若不适用,需具体阐述理由及相应的科学依据,并依据产品的具体特性对注册申报资料的内容进行充实和细化。如申请人认为有必要增加本指导原则未包含的研究内容,可自行补充。 本指导原则是对申请人和审查人员的指导性文件,但不包括注册审批所涉及的行政事项,亦不作为法规强制执行,如果有能够满足相关法规要求的其他方法,也可以采用,但需要提供详细的研究资料和验证资料,相关人员应在遵循相关法规的前提下使用本指导原则。 本指导原则是在现行法规和标准体系以及当前认知水平下制定的,随着法规和标准的不断完善,以及科学技术的不断发展,本指导原则相关内容也将适时进行调整。 二、适用范围

(一)临床背景 胎儿染色体非整倍体(fetal chromosome aneuploidies)中的21三体、18三体、13三体(trisomies 21、18、13,即T21、T18、T13)是临床上最常见的染色体非整倍体疾病。其对应的分别21-三体综合征(又称唐氏综合征,先天愚型或Down综合征)、18-三体综合征(又称Edwards综合征)和13-三体综合征(又称Patau综合征),发病率分别约为1/700、1/6000、1/10000,患儿绝大多数存在严重智力障碍及器官畸形,生活无法自理,不仅影响儿童的生命健康和生活质量,同时影响经济社会的健康可持续发展。 依据《中华人民共和国母婴保健法》,为了保障母亲和婴儿健康,提高出我国出生人口素质,医疗保健机构应当为育龄妇女和孕产妇提供孕产期保健服务。产前筛查和产前诊断即是为避免产生遗传缺陷患儿提供的有效手段。常规的产前筛查方法包括:早孕期的超声与血清学联合筛查和中孕期母体血清学筛查。中孕期母体血清学筛查是指通过中孕期母体血清甲胎蛋白、血清人绒毛膜促性腺激素、血清人绒毛膜促性腺激素游离?亚基、抑制素A和非结合雌三醇指标结合孕妇的年龄、体重、孕周、病史等进行综合风险评估,得出胎儿是否罹患相关三体综合征或神经管缺陷的风险度。筛查结果为高风险的孕妇经建议经产前诊断进行最终确认,由孕妇知情选择。胎儿染色体异常的产前诊断金标准为介入前产前诊断手术,是指通过绒毛取材术/羊膜腔穿刺术/经皮脐血管穿刺术,取相应细胞采用细胞生物学方法对胎儿染色体进行核型分析。 我国对以下孕妇均实行产前诊断:35岁以上的高龄孕妇;产前筛查出来的胎儿染色体异常高风险的孕妇;曾生育过染色体病患儿的孕妇;产前B超检查怀疑胎儿可能有染色体 异常的孕妇;夫妇一方为染色体异常携带者;医师认为有必要进行产前诊断的其他情形。 (二)高通量测序法进行产前筛查 高通量测序(High-Throughput Sequencing)是近年来迅

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