组胚图谱

第一章上皮组织

图1-1单层扁平上皮-间皮的表面观（肠系膜铺片镀银染色10×10）细胞为不规则的多边形，边缘呈锯齿状，核为浅色的圆形或椭圆形位于中央。

图1-2单层扁平上皮-间皮的表面观（肠系膜铺片镀银染色10×20）

图1-3单层扁平上皮（结缔组织中毛细血管的切面HE染色10×20）血管内表面内呈一条红色细线，内皮细胞界限不清，核为扁椭圆形突向管腔。

皮，细胞核为圆形，大小比较一致，排列整齐。

细胞核为椭圆形，靠近细胞的基底部，上皮的基底部可见染成红色细线状的基膜。

图1-6单层柱状上皮（小肠HE染色10×40）上皮内的柱状细胞界限清楚，形态为高柱状，游离面可见纹状缘，上皮内可见轮廓清楚的呈高脚酒杯状的杯状细胞，顶端胞质染色浅为空泡状，基底部较细，可见

较小的扁椭圆形细胞核。

图1-7假复层纤毛柱状上皮（气管HE染色10×20）假复层纤毛柱状上皮由高矮不等的纤毛柱状细胞、杯状细胞、梭形细胞和锥形细胞组成，从切面上看细胞核排列为3~4层，好似复层上皮，实际上每细胞的基底部都长在基膜（↑）上，上皮的游离面可见明显的纤毛（↓）和空泡状的杯状细胞（←）。

图1-8复层扁平上皮（食管HE染色10×10）图示未角化的复层扁平上皮由多层细胞组成，基底层细胞为小的立方或矮柱状细胞，具有增生分裂能力，细胞核为圆形、排列密集、染色深、体积小，中间部分的细胞为较大的多边形，细胞轮廓较清楚，细胞核为较大的圆形，胞质染色较浅，表面的数层细胞为扁平形，细胞核为梭形，体积最小。上皮的基底部与深部的结缔组织的连接处呈凹凸不平状。

图1-9变移上皮（膀胱HE染色10×40）又称移行上皮，上皮的细胞形态和排列层数随器官的功能状态而发生变化。从切面上看，细胞排列为多层，细胞核形态呈圆形或椭圆形，最表层的细胞形态为大立方形，胞质染色深，可见双核，可覆盖下面2~3细胞，称为盖细胞，中间层细胞为多边形或梨形，基底层为矮柱状或立方形。

第二章结缔组织

图2-1 疏松结缔组织铺片（兔肠系膜铺片台盼蓝活体注射+醛复红+偶氮洋红染色10×10）图中染成粉红色较粗的索条状结构为胶原纤维（↑），染成紫蓝色较细的似头发丝状的叫弹性纤维（←），单个或成群分布，细胞核为红色呈圆形或椭圆形，周围有大量蓝色颗粒分布的是巨噬细胞（→），只见红色圆形或椭圆形核，胞质染色浅，细胞轮廓不清的是成纤维细胞（↓）。

图2-2 疏松结缔组织铺片（兔肠系膜铺片台盼蓝活体注射+醛复红+偶氮洋红染色10×40）图示染成粉红色较粗的是胶原纤维、染成紫蓝色较细的是弹性纤维，细胞核为红色呈圆形或椭圆形，周围有大量蓝色颗粒分布的是巨噬细胞。

图2-3 疏松结缔组织铺片（兔肠系膜铺片台盼蓝活体注射+醛复红+偶氮洋红+甲笨胺蓝染色10×40）图示肥大细胞（→）。

图2-4疏松结缔组织切片（食道HE染色10×40）图示染红色索状的胶原纤维，排列疏，纤维之间可见蓝色梭形的纤维细胞核，基质染色浅。

图2-5规则的致密结缔组织切片（肌腱HE染色10×10）图示胶原纤维索染成红色，纤维索之间可见蓝色梭形的腱细胞排列成行。

图2-6脂肪组织切片（皮下组织HE染色10×20）脂肪组织由大量脂肪细胞组成，脂肪细胞为圆形或多边形，细胞内有一大的脂肪滴，在制片过程中溶解故呈空泡状，细胞核为扁椭圆形或梭形被脂滴挤到边缘，一般不易切到故不易见到。

图2-7网状纤维（淋巴结镀银染色10×10）图示网状纤维被染成黑色细丝状，相互连接为网状，纤维之间的大量黑色小点为淋巴细胞。

第三章软骨与骨

图3-1透明软骨（气管HE染色10×10）透明软骨的周围是软骨膜（※），为致密结缔组织；软骨组织由大量软骨细胞和软骨基质组成，近软骨膜的软骨细胞较小而幼稚，近中间部的软骨细胞渐趋成熟而体积增大，并以同源细胞群的形式存在为主，软骨基质嗜碱性，染成紫蓝色，颜色由周边向中间逐渐加深。

图3-2透明软骨（气管HE染色10×20）图示软骨陷窝（★）、软骨囊（←）和皱缩的软骨细胞（→）。

图3-3弹性软骨（耳廓弹性纤维染色10×10）图示弹性软骨的软骨膜、软骨细胞及弹性纤维，可见软骨陷窝周围的许多弹性纤维分布。

间骨板（D）及中央管（C）等结构。

骨陷窝（↓）及大量细丝状的骨小管，骨单位最外周的还可见粘合线（→）。

图3-6软骨内骨发生（婴儿指骨的纵切HE染色10×4）图示从左向右的四个箭头所指区域为婴儿指骨的

软骨内骨发生的四个成骨活动区域，依次为软骨细胞静止区、软骨细胞增生区、软骨基质钙化区及成骨区。

图3-7软骨内骨发生（婴儿指骨的纵切HE染色10×10）图示软骨细胞静止区（1）内的软骨细胞体积小、散在分布，软骨细胞增生区（2）内的细胞体积增大，通过分裂形成的同源细胞群纵向排列形成许多软骨细

胞柱。

泡状（☆），核固缩及退化死亡的软骨细胞留下的大陷窝，成骨区（※）内为初级骨髓腔，内有血细胞。

图3-9软骨内骨发生（婴儿指骨的纵切HE染色10×20）图示的成骨区内可见原始骨小梁（※），其表面可见梭形的成骨细胞（↓）附着，此种细胞能分泌形成类骨质，并使钙盐沉积在其周围而形成骨质，自身被包埋成为骨细胞；小梁之间为大小不等的骨髓腔（☆），内有血细胞，小梁表面有时可见破骨细胞（→），

该细胞胞质嗜酸性，有多个细胞核，具有分泌酶来破坏和溶解骨质，从而进行骨的改建的功能。

第四章血液

图4-1血细胞（人血涂片瑞氏染色10×40）图示大量红细胞（↑），无细胞核且中央染色浅；中性粒细胞（→）体积比红细胞大，细胞核嗜碱性呈分叶状。

图4-2血细胞（人血涂片瑞氏染色10×40）图示蓝色圆形细胞为小淋巴细胞（→），体积比中性粒细胞（←）小而与红细胞相当，细胞质很少，细胞核呈圆形；还可见体积非常小的血小板（↓）。

图4-3血细胞（人血涂片瑞氏染色10×40）图示大淋巴细胞（↑），大小与中性粒细胞相当，可见明显的细胞质，细胞核为圆形；还可见散在分布的血小板（→）。

图4-4血细胞（人血涂片瑞氏染色10×40）图示嗜碱性粒细胞（↑），细胞内可见大小不等的嗜碱性颗粒，大小与中性粒细胞（↓）相当，该细胞一般不易见到。

图4-5血细胞（人血涂片瑞氏染色10×100）图示为血细胞中体积最大的细胞（→），细胞核为马蹄形，也可为粗大的“S”形、肾形或不规则形；中性粒细胞（←）核较小，分叶。

图4-6血细胞（人血涂片瑞氏染色10×100）图示嗜酸性粒细胞（），细胞内含有大量嗜酸颗粒且分布均匀，故细胞呈鲜红色。

第五章肌肉组织

图5-1骨骼肌纵切（HE染色10×10）骨骼肌细胞为长圆柱状，一个细胞上可见多个小的蓝色梭形细胞核，位于细胞的肌膜内侧，细胞呈现明显的横纹结构。

图5-2骨骼肌横切（HE染色10×10）图示几个肌束的横断面，肌束之间有明显的间隔且有少量结缔组织，每一个肌束内有多个骨骼肌细胞，形态为圆形或多边形，每个肌细胞周边可见数个蓝色细胞核。

图5-3骨骼肌纵切（HE染色10×40）一个骨骼肌细胞上可见多个小的蓝色梭形细胞核（↓），细胞呈现明显的横纹结构。

胞周边可见2~5个蓝色细胞核（→）。

图5-5骨骼肌纵切（苏木素染色10×40）图示非常清晰地显示横纹结构，有明显的明带与暗带。

图5-6心肌纵切（HE染色10×40）心肌细胞呈短柱状，可有分支，相互连接成网状，连接处的结构叫闰盘（←），为染色较深的横行粗线，一个细胞一般有一圆形或椭圆形核（↓），但横纹结构不如骨骼肌明

显。

核，形态为圆形位于细胞的中央。

或长杆状，位于细胞的中央。

状细胞核。

图5-10平滑肌横切（十二指肠HE染色10×40）图示平滑肌细胞的横切面形态为圆形或椭圆形、大小不等、排列紧密，大部分没有切到细胞核，少数可切到，细胞中央可见一个圆形的细胞核。

第六章神经组织

中间的白色小孔是中央管，周围部分是白质，染成较浅的蓝色。

深、形态各异。

图6-3脊髓灰质内的神经细胞（脊髓横切HE染色10×40）图示三个形态不同的神经元，胞体中间有一染色较浅的圆形细胞核，核仁（←）色深、清晰；也可见一个神经细胞的两个较明显的树突（※）。

图6-4脊髓灰质内的神经细胞（脊髓横切HE染色10×40）图示两个神经元，一个神经细胞（↑）胞质内可见染色较深的嗜碱性颗粒即为尼氏体（※），另一个神经元（→）的尼氏体较少，胞体染色较浅。

图6-5神经细胞（脊髓横切浸银法10×40）图示多极神经元的突起，神经元胞体及突起内的神经原纤维。

图6-6有髓神经纤维纵切（坐骨神经纵切HE染色10×40）图示有髓神经纤维的神经纤维节或叫郎飞氏节（↓），是两个节间体的交界处，呈小写的“x”形，神经纤维的中间有一条染色较深的轴索（↑），其两侧为染色浅呈空泡状的髓鞘（△）。

图6-7有髓神经纤维横切（坐骨神经横切HE染色10×20）图示有髓神经纤维横切面的形态为圆形，中央染色深呈点状的为轴索，周围染色浅的为髓鞘，其外侧染色较深的是神经膜。

图6-8脊神经节内的神经细胞（脊神经节HE染色10×40）脊神经节内主要由假单极的感觉神经元构成，大小不等，细胞核特征明显（↑），可分为亮神经元（☆）和暗神经元（→），胞体周围有一层卫星细胞（↓）包裹，是一种周围神经系统的神经胶质。

图6-9交感神经节内的神经细胞（交感神经节HE染色10×40）神经节内主要由多极运动神经元（※）构成，大小不等，散在分布，胞体周围有一层卫星细胞（→）包裹。

图6-10小脑皮质（小脑皮质切片HE染色10×40）图示小脑皮质的分子层（☆）、蒲肯野细胞层（◇）和颗粒层（△），三层分界清楚，蒲肯野细胞是小脑皮质的唯一传出神经元，另两层细胞是中间神经元。

图6-11触觉小体（手掌皮HE染色10×40）图示手掌皮的表皮（A）、真皮乳头（B）及其内的毛细血管（◇），乳头内有触觉小体（※），呈卵圆形，外包结缔组织囊，内有多层横列的扁平细胞。

图6-12环层小体（手掌皮HE染色10×40）手掌皮的皮下组织内可见环层小体，体积较大，卵圆形或圆形，周围有多层呈同心圆排列的扁平细胞构成，中央有一均质状的圆柱体，内有裸露的轴索。

图6-13运动终板（骨骼肌整装片氯化金染色10×20）图示有髓神经纤维（※）反复分支，其终末部分膨大呈爪状（←）附着于骨骼肌纤维（☆）上。

图6-14中枢神经系统的神经胶质细胞（大脑皮质HE染色10×20）图示神经胶质细胞的形态不同、大小不等，有许多细长突起。

图6-15室管膜细胞（脊髓横切HE染色10×40）图示为脊髓的中央管（☆），其内表面为单层立方或矮柱状的室管膜细胞（→），也是一种中枢神经系统的神经胶质。

插入图片：神经细胞的胞体与突起

第七章眼和耳

图7-1角膜（人角膜HE染色10×4）图示角膜的五层结构依次为角膜上皮（1）、前界层（2）、角膜基质（3）、后界层（→）和角膜内皮（4）。

图7-2角膜（人角膜HE染色10×20）角膜上皮（1）为未角化的复层扁平上皮，前界层（2）为无细胞的均质层，由胶原原纤维和基质组成。

图7-3眼球壁（眼球后壁HE染色10×4）眼球壁由内向外分为视网膜（1）、血管膜或脉络膜（2）及纤维膜或巩膜（3），其中视网膜与虹膜有分离。

图7-4视网膜（眼球后壁HE染色10×10）低倍镜下的视网膜全层结构。

组胚考试范围及详解

一．组胚实验 考20道共20分 考试范围四次实验课要求看的切片 二．选择题包括单项选择题和多项选择题 共50分 考试范围上课内容（考题全部来源于组胚小书） 三．名词解释 考5个共10分 考试范围： 1.肌节：为肌原纤维上相邻两条Z线之间的一段结构，一个肌节由1/2明带+暗带+1/2明带组成。肌节是肌原纤维结构和功能的基本单位。 2.动脉周围淋巴鞘：呈鞘状包绕脾中央动脉的弥散淋巴组织，由大量T细胞和少量巨噬细胞与交错突细胞等构成，相当于淋巴结的副皮质区。 3. 淋巴小结：是淋巴组织存在一种形式，主要由B细胞聚集而成的椭圆形结构。再受抗原刺激后，小结增大，中央出现浅染色的生发中心，内有许多呈分裂相的B细胞，还有巨噬细胞、滤泡树突状细胞和Th细胞等。有生发中心的称为次级淋巴小结，没有生发中心的称为初级淋巴小结。从次级淋巴小结中产生出针对抗原的幼浆细胞和记忆性B细胞。 4.滤过屏障：是位于肾血球毛细血管腔与肾小囊之间的结构，又称滤过膜，由有孔内皮、基膜和足细胞裂孔膜组成。当血液流经血管球时，大量的水和小分子物质在较高的毛细血管压作用下，通过滤过膜进入肾小囊腔，形成原尿。正常时，血细胞和血浆中的大分子物质不能通过。 5.黄体：排卵后，残留在卵巢内的卵泡颗粒和卵细胞膜喜爱那个腔内塌陷，卵泡膜的结缔组

织和毛细血管也伸入颗粒层，这些成分逐渐演化成具有内分泌功能的细胞团，新鲜时显黄色，故称黄体。黄体含颗粒黄体细胞和膜黄体细胞，前者分泌孕激素，两者协同分泌雌激素。 6.粘液-碳酸氢盐屏障：由胃上皮表面粘液细胞分泌的含高浓度碳酸氢根的不可溶性粘液，覆盖于上皮表面形成。粘液层将上皮与胃液中的胃蛋白酶隔离，而高浓度碳酸氢根使局部pH为 7.既抑制了酶的活性，又可中和深入的盐酸，从而使胃黏膜免受损伤。粘液产生减少或分泌过多盐酸，屏障受到破坏，都会导致胃组织的自我消化，形成胃溃疡。 7.趋化性：体内某些细胞（如巨噬细胞）有沿着某些化学物质浓度梯度进行定向移动，聚集到产生和释放这些化学物质的病变部位的特性。这些化学物质，称为趋化因子。这种趋化性也可见于结缔组织和血液的其他细胞，如肥大细胞、中性粒细胞等。 8.郎飞结：有髓神经纤维的髓鞘呈节段状，相邻两个节段之间无髓鞘的缩窄部称郎飞结。郎飞结处的轴突部分裸露于外。 9.尼氏体：是神经元胞质内的强嗜碱性小斑块或颗粒。电镜下由许多平行排列的粗面内质网和游离核糖体组成。尼氏体是神经元合成蛋白质的场所，主要合成结构蛋白，合成神经递质所需的酶类和肽类的神经调质。 四．论述题 考四个共20分 考试范围 1.试述浆细胞的光镜结构、超微结构和功能 浆细胞是疏松结缔组织中的一种重要的细胞，其光镜特点是细胞为圆形或椭圆形，胞核为圆形，常偏居细胞一侧，异染色质常呈粗块状，呈辐射状排列。胞质丰富，嗜碱性，核旁有一浅染色区。电镜显示，其胞质内有丰富的粗面内质网，而浅染色区内则有高尔基复合体和中心体。浆细胞能合成和分泌免疫球蛋白，即抗体，抗体能与特异性的抗原结合，抑制或杀灭

基因组学的研究内容

基因组学的研究内容 结构基因组学： 基因定位；基因组作图；测定核苷酸序列 功能基因组学：又称后基因组学（postgenomics基因的识别、鉴定、克隆；基因结构、功能及其相互关系；基因表达调控的研究 蛋白质组学： 鉴定蛋白质的产生过程、结构、功能和相互作用方式 遗传图谱 （genetic map）采用遗传分析的方法将基因或其它dNA序列标定在染色体上构建连锁图。 遗传标记： 有可以识别的标记，才能确定目标的方位及彼此之间的相对位置。 构建遗传图谱 就是寻找基因组不同位置上的特征标记。包括： 形态标记； 细胞学标记； 生化标记；DNA 分子标记 所有的标记都必须具有多态性！所有多态性都是基因突变的结果！ 形态标记： 形态性状：株高、颜色、白化症等，又称表型标记。 数量少，很多突变是致死的，受环境、生育期等因素的影响 控制性状的其实是基因，所以形态标记实质上就是基因标记。

细胞学标记 明确显示遗传多态性的染色体结构特征和数量特征 ：染色体的核型、染色体的带型、染色 体的结构变异、染色体的数目变异。优点：不受环境影响。缺点：数量少、费力、费时、对生物体的生长发育不利 生化标记 又称蛋白质标记 就是利用蛋白质的多态性作为遗传标记。 如：同工酶、贮藏蛋白 优点： 数量较多，受环境影响小 ?

缺点： 受发育时间的影响、有组织特异性、只反映基因编码区的信息 DNA 分子标记： 简称分子标记以 DNA 序列的多态性作为遗传标记 优点： ? 不受时间和环境的限制 ? 遍布整个基因组，数量无限 ?

不影响性状表达 ? 自然存在的变异丰富，多态性好 ? 共显性，能鉴别纯合体和杂合体 限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism ， RFLP ） DNA 序列能或不能被某一酶酶切，

组织学与胚胎学实验考试图及答案

组织学与胚胎学实验考试图及答案照片名称：14平滑肌 照片名称：15尼氏体 照片名称：16轴丘 照片名称：17郎飞结 照片名称：21淋巴小结 照片名称：19小静脉小动脉 照片名称：18毛细血管 照片名称：1单层柱状上皮 照片名称：22皮质 照片名称：23淋巴小结生发中心 照片名称：24脾白髓 照片名称：28皮肤 照片名称：27腺垂体 照片名称：26肾上腺皮质

照片名称：25甲状腺滤泡照片名称：29胃(四层) 照片名称：31主细胞 照片名称：30胃 照片名称：32壁细胞 照片名称：36粘液性腺泡照片名称：35潘氏细胞照片名称：34小肠绒毛照片名称：33小肠 照片名称：37浆液性腺泡照片名称：39胰岛 照片名称：40肝 照片名称：38胰腺 照片名称：44肺泡 照片名称：43肝门管区

照片名称：42肝血窦 照片名称：41中央静脉 照片名称：45肾小体 照片名称：46近曲小管（近端小管曲部）照片名称：48致密斑 照片名称：52生精小管 照片名称：51滤过屏障 照片名称：49足细胞 照片名称：56初级卵泡 照片名称：55精子 照片名称：54支持细胞 照片名称：53精原细胞 照片名称：60胚泡 照片名称：59卵丘

照片名称：58次级卵泡 照片名称：57原始卵泡初级卵泡照片名称：61胚泡 照片名称：62二胚层胚盘 照片名称：63二胚层胚盘 照片名称：64脐带 照片名称：3杯状细胞 照片名称：红细胞白细胞 照片名称：65胎盘 照片名称：5浆细胞 照片名称：7嗜酸性粒细胞 照片名称：6中性粒细胞 照片名称：4肥大细胞 照片名称：12骨骼肌 照片名称：10单核细胞

基因组序列的差异分析

基因组序列的差异分析 ----mVISTA的在线使用说明 当然，除了在线版的，我们还可以在网站上填写信息申请离线的软件。但我试用了一下，需要先自己比对，然后要按照一定的格式来制作文件，当然你还必须得安装java才能运行软件；总之，我感觉没有在线版的方便。 1 将数据放入服务器中 在首页，你将被要求确定你想要分析的基因组序列的数量。输入这个数字之后，点击“提交”，将带你到主提交页面。 mVISTA服务器最多可以同时处理100条序列。 1.1主提交页面必填的内容 E-mail 地址 通过E-mail，我们可以提示你的在线处理已经得到结果。

序列 你可以用2种方式来上传你的序列： 1.使用“Browse”按钮从你的电脑上，上传纯文本的Fasta格式文件。如果是一个作为参 考的生物体的DNA序列必须作为一个contig提交(可以进行一定的定向排列将多个片段合并为一个contig)，而其他非参考序列可以在一个或多个contig中提交(draft)。 Fasta格式的示例序列(您可以在NCBI站点上找到关于该格式的更多细节)： >mouse ATCACGCTCTTTGTACACTCCGCCATCTCTCTCT … ！！！注意:序列里面我们只接受字母CAGTN和X。请确保提交序列是作为一种纯文本格式，而不是Word或HTML文件格式。 如果您以FASTA格式提交序列，我们建议您为它取一个有意义的名称（比如直接是你的物种名之类的），因为这些名称将出现在我们生成的图形中。如果您使用的是一个draft草图序列，那么结果中每个contigs的命名都将按照您在“>”符号后指示的命名进行。 2.您可以给出它的GenBank登录号，系统将自动从GenBank数据库里进行检索序列。 在这两种情况下，序列的总大小都不应超过10M，而且任何一条序列都不应超过2M。 1.2主提交页面选填的内容 这些选项允许您自定义您的VISTA分析。您可以使用独立获得的基因注释，选择合适的Repeat Masker选项，给分析的序列指定名称，并改变序列保存分析的参数。如果您没有填写这些选填选项，我们将使用它们的默认值。 比对程序 根据您分析的具体内容(参见“about”-链接中的详细信息)，您可以选择以下比对程序之一：1、AVID----全局两两比对。如果您选择使用这个程序，其中一个序列应该被完成比对，其他 所有序列可以完成或以草图draft格式完成。对于集合中所有已完成的序列，AVID生成所有相对所有成对的比对结果，可以使用任何序列作为基础(参考)来显示。如果某些序列是草图格式，AVID将生成它们与最终序列的比对，这将被用作基础(参考)。这是该服务器上唯一可以处理草图序列的比对程序。 （小知识：草图序列与完整序列DNA sequence, draft: Sequence of a DNA with less accuracy than a finished sequence. In a draft sequence, some segments are missing or are in the wrong order or are oriented incorrectly. A draft sequence is as opposed to a finished DNA sequence.）2、LAGAN----完成完整序列的全局两两比对和多重比对。如果某些序列是草图格式，您的查 询将被重定向到AVID以获得两两比对。多重比对将由VISTA可视化，它将计算并显示序列的保守区，以您指示的任何序列作为参考。这是该服务器上唯一能够产生真正的多重

人类基因组图谱定义(精)

人类基因组图谱定义 1543年，比利时解剖学家A·维萨里（1514－1564）发表了划时代的著作《人体的构造》，开创了人体解剖学，使人们从宏观上了解了自己。“人类基因组计划”建立的人类基因组图，被誉为“人体的第二张解剖图”，它将从微观上或者说从根本上使人类了解自己。 人类第一个基因组草图 2000年6月26日，美国总统克林顿和英国首相布莱尔联合宣布：人类有史以来的第一个基因组草图已经完成。2001年2月12日中、美、日、德、法、英等6国科学家和美国塞莱拉公司联合公布人类基因组图谱及初步分析结果。 人类基因组计划中最实质的内容，就是人类基因组的DNA序列图，人类基因组计划起始、争论焦点、主要分歧、竞争主战场等都是围绕序列图展开的。在序列图完成之前，其他各图都是序列图的铺垫。也就是说，只有序列图的诞生才标志着整个人类基因组计划工作的完成。 2003年4月15日，在DNA双螺旋结构模型发表50周年前夕，中、美、日、英、法、德六国元首或政府首脑签署文件，六国科学家联合宣布：人类基因组序列图完成。 人类基因组图谱的绘就，是人类探索自身奥秘史上的一个重要里程碑。它被很多分析家认为是生物技术世纪诞生的标志，也就是说，21世纪是生物技术主宰世界的世纪。正如一个世纪前量子论的诞生被认为揭开了物理学主宰的20世纪一样。 全球专家拟绘癌症基因图谱 国际癌症基因组协会4月29日在英国伦敦成立。这一组织计划通过统筹各国和地区专家的合作，耗资10亿美元，历时10年，绘制较为完整的致癌基因突变图谱。目前已有英国、中国和美国等9国加入这一计划。 专家认为，图谱将为癌症预防、诊断和治疗带来一场革命，开辟癌症个案化治疗的新时代。 方法 国际癌症基因组协会计划利用更加先进、快速的基因组测序新技术，详细研究50种不同类别的癌症，希望找到所有与癌症相关的基因突变现象。 英国剑桥韦尔科姆基金会桑格研究所是这一计划的主要参与者之一。 英国《泰晤士报》援引桑格研究所专家迈克·斯特拉顿的话说：“借助更快速的脱氧核糖核酸（ＤＮＡ）测序新技术，国际癌症基因组协会雄心勃勃，志在为数以千计癌症基因组测序，制作一个涵盖所有ＤＮＡ变异的目录，绘制完整的癌变图谱。” 越来越多科研成果表明，癌症并非单一类型。而每种癌症都包括大量由不同类型基因突变导致的不同亚种类别，需要分别对症治疗。 国际癌症基因组协会计划在每种癌症的研究中，提取500名病人的细胞并测序基因组，与健康细胞作比对，以期找出导致癌细胞形成和扩散的基因突变。 意义 专家认为，图谱绘制对于癌症治疗具有革命性意义。 如果图谱绘制成功，医生就可准确掌握单个患癌病人的致癌基因突变因素，进而更为轻松地对症下药，寻找对特定病人或特定癌症种类具有针对性的治疗药物。 比如，医学界目前普遍认为，赫赛汀（Herceptin）是特定种类乳癌的治疗药物。 图谱还有助于发明新的癌症治疗药物。 韦尔科姆基金会负责人马克·沃尔波特说，识别致癌基因突变是癌症治疗领域内的一次“大跨步”进展，目的在于实现“对症治疗”。 沃尔波特披露，桑格研究所的斯特拉顿等专家已启动一项致力于研发癌症治疗新药的计划。 合作 国际癌症基因组协会成立的作用还在于促进各国专家合作。 目前已确定加入这一计划的国家为英国、中国、美国、澳大利亚、加拿大、法国、印度、日本和新加坡。 协会计划对每一种类癌症的研究资助2000万美元，因而整个研究项目将耗资约10亿美元。

组胚期末试卷参考答案

（ --- 学年第学期） 班级：姓名：学号： 课程名称组织学与胚胎学专业班级 考核日期考核方式闭卷考试备注 题号一二三四五六七八九十总分阅卷人满分60 5 10 15 10 100 得分 一．A1型题（单句型最佳选择题） 1 在PAS反应中多糖被过碘酸氧化形成：D A. 羧基 B. 羟基 C. 巯基 D. 醛基 2 HE染色中, 嗜酸性结构被染成：C A. 紫蓝色 B. 天蓝色 C. 红色 D. 黑色 3 显示脂类常用:B A. 甲苯胺蓝 B. 苏丹染色 C. PAS反应 D. HE染色 4 HE染色中所说的嗜酸性是指：A A. 对伊红亲和力强 B. 对苏木精亲和力强 C. 对过碘酸亲和力强 D. 对甲苯胺蓝亲和力强 5 普通光镜观察的组织切片一般厚度为： B A. 5-10mm B. 5-10μm C. 5-10nm D. 0.5-0.7mm 6 免疫组织化学指:B A.免疫组织中的化学组成 B. 用已知抗体去检测组织、细胞中的抗 原 C.用组织化学技术观察免疫器官 D.体液免疫和细胞免疫 7 电镜技术中，电子密度高是指：A A.吸附重金属多，照片上呈黑或深灰色 B.吸附重金属少，照片上呈黑或深灰色 C.吸附重金属多，照片上呈浅灰色

D.吸附重金属少，照片上呈浅灰色 8 一般情况下，对苏木精染料亲和性强的结构是：B A. 细胞质 B. 细胞核 C. 细胞膜 D. 线粒体 9 苏木精作为一种染料具有：D A. 嗜酸性 B. 嗜碱性 C. 酸性 D. 碱性 10 PAS反应能显示组织细胞内的：C A. DNA B. RNA C. 多糖 D. 蛋白质 11 免疫组织化学技术可以用来检测细胞或组织中的：C A. 多糖 B. 脂肪 C. 蛋白质和多肽 D. 磷脂 12 具分支导管和管状腺泡的腺体称为：D A.单腺 B.管泡状腺 C.复腺 D.复管状腺 13 胃粘膜上皮中有：D A.杯状细胞 B.纤毛 C.两者均有 D.两者均无 14 下列哪个器官分布有角化的复层扁平上皮：D A.口腔 B.食管 C.阴道 D.皮肤 15 以下关于间皮的描述哪项错误：A A.从上皮表面观察，细胞扁平 B.能减少器官间的磨擦 C.分布于胸膜、腹膜和心包膜 D.细胞只有含核的部分略厚 16 胎儿出生后肝的静脉导管将成为：B A．动脉韧带Ｂ．静脉韧带Ｃ．肝圆韧带Ｄ．脐外侧韧带17 心管与动脉相连的是：A A．头端Ｂ．尾端Ｃ．中间Ｄ．侧面 18 在心血管的畸形中，主肺动脉错位是由于：B A．主肺动脉隔呈螺旋生长Ｂ．主肺动脉隔呈直板生长 Ｃ．主肺动脉隔分隔不均Ｄ．右心室肥大 19 胚体内的内皮管网来源于：D A．血岛周边的细胞B．体蒂中胚层 C．体节中胚层D．各处的间充质 20 位于原始消化管背系膜与中肾嵴之间的纵行隆起是B A．尿生殖嵴B．生殖腺嵴C．脊索D．生肾索 21 原始生殖细胞的迁入发生于：B

组胚切片考试器官特点

食管:复层扁平上皮；固有层突入基底部形成乳头；分为粘膜，粘膜下层，肌层，外膜；粘膜下层有粘液性的食管腺。 气管：假复层纤毛柱状上皮；粘膜下层有混合性腺体构成的气管腺；外膜由透明软骨和疏松结缔组织构成；基膜很明显。 膀胱：变移上皮（较薄较平）；肌层为平滑肌，分为内纵，中环，外纵；表层细胞较大，为盖细胞。 中等动静脉： ①中A：壁厚，腔圆，规则，小，内弹性膜呈波浪状，可见外弹性膜； ②中V：壁薄，腔大，不规则，内弹性膜不明显，无外弹性膜 ③标本中有两个较大的血管断面，腔面只见一层内皮细胞核 大动脉：①内膜最薄，中膜最厚，外膜较薄；②中膜数十层，呈波浪状，同心圆排列；③分内，中，外膜；④中膜由平滑肌纤维和胶原纤维组成 淋巴结：①浅层皮质有许多淋巴小结，中心浅染为生发中心；②副皮质区中可见毛细血管后微静脉；③髓质中有浅色的髓窦和深蓝色的淋巴索；④被膜伸到实质内形成小梁，可见小梁周窦和被膜淋巴窦 脾脏：①可见动脉周围淋巴鞘，中央有中央动脉；②在淋巴鞘一侧有脾小结；③可见红紫色的红髓和深蓝紫色的球团成条索状的白髓；④红髓中可见含血红细胞的脾窦 胸腺：①被膜深入到实质内形成小叶间隔，将胸腺分隔成不完全分离的胸腺小叶；②髓质中有胸腺小体；③相邻小叶髓质相连；④胸腺小叶：周边深蓝色皮质，中央浅色的髓质；⑤无淋巴小结 指皮：①表皮为角化的复层扁平上皮，角质层很厚，红色；②有波浪状起伏的指纹；③真皮中，乳头层有触觉小体；④皮下组织有环层小体 头皮：①表皮为角化的复层扁平上皮，较薄；②真皮较薄，有许多毛囊，汗腺，皮脂腺，立毛肌；③皮下组织有环层小体 胃：①单层柱状上皮，上皮凹陷形成胃小凹；②固有层有许多胃底腺，开口于胃小凹；③可在胃底腺中看到紫蓝色的主细胞和红色壁细胞 十二指肠:①绒毛呈叶状，凸向管腔，有杯状细胞；②固有层可见肠腺；③黏膜下层有粘液性十二指肠腺 空肠：①大的突起为小肠皱襞②黏膜表面有指状突起——小肠绒毛；③绒毛表面覆盖有单层柱状上皮，有杯状细胞，可见纹状缘；④固有层可见肠腺 结肠：①无绒毛；②固有层有大量肠腺；③单层柱状上皮，有大量的杯状细胞，纹状缘不明显；④固有层结缔组织中可见孤立淋巴小结弥散淋巴细胞 阑尾：①管腔细小不规则；②肠腺短小；③固有层内含有丰富的淋巴组织形成许多淋巴小结； ④粘膜肌层不完整 颌下腺：①以深染的浆液性腺泡为主，色浅的粘液性腺泡和混合腺泡少；②在混合性腺中可见半月；③小叶内闰管断面少，可见许多红染的分泌管 舌下腺：①以浅染的粘液性腺泡为主，浆液性腺泡少，有混合性腺泡；②无闰管，纹状管不多；③各种腺泡细胞与基膜之间有肌上皮细胞；④可见较多的浆半月 腮腺：①纯浆液性腺泡，深染；②可见较多的闰管和纹状管（分泌管）断面；③在小叶间隔内有大的导管，即小叶间导管；④在腺泡上皮与基膜之间有肌上皮细胞 肝脏（猪）：①可见许多多边形不规则的肝小叶；②肝小叶内有一中央静脉，其上有血窦的开口；③可见肝板，肝血窦；④门管区内有小叶间动脉，小叶间静脉和小叶间胆管 胰脏：①胰泡为纯浆液性腺泡；②在腺泡中央可见泡心细胞；③可见大小不等，染色较浅的细胞团，分散于腺泡间为胰岛，有结缔组织被覆；④闰管的纵，横断面较多；⑤有结缔组织

基因组序列拼接

硕士学位论文 基于reads引导的基因组序列拼接GENOME ASSEMBLY GUIDED BY READS 曾培龙 哈尔滨工业大学 2012年6月

国内图书分类号：TP391 学校代码：10213 国际图书分类号：621.3 密级：公开 工学硕士学位论文 基于reads引导的基因组序列拼接 硕士研究生：曾培龙 导师：王亚东教授 申请学位：工学硕士 学科：计算机科学与技术 所在单位：计算机科学与技术学院 答辩日期：2012年6月 授予学位单位：哈尔滨工业大学

Classified Index: TP391 U.D.C: 621.3 Dissertation for the Master Degree GENOME ASSEMBLY GUIDED BY READS Candidate：Zeng Peilong Supervisor：Prof. Wang Yadong Academic Degree Applied for：Master of Engineering Speciality：Computer Science and Technology Affiliation：School of Computer Science and Technology Date of Defence：June, 2012 Degree-Conferring-Institution：Harbin Institute of Technology

哈尔滨工业大学硕士学位论文 摘要 基因组序列拼接是生物信息学领域的核心问题，测序产生的读取片段reads经过序列拼接组装，生成基因组的碱基序列。新一代测序技术的快速发展，为生命科学重大问题的研究提供巨大帮助的同时，其数据海量、读取片段reads长度短、精确度低等特点也为全基因组序列拼接提出了相当严峻的挑战，而传统的序列拼接算法已不再适用。针对新一代测序的数据特点，研发能满足实际应用需要的基因组序列拼接软件，已显得极为迫切。 本文首先简要介绍了新一代测序技术的产生背景、测序策略及技术特点等，认真分析了基因组序列拼接所面临的主要挑战，比如大量重复片段的存在，reads数据海量、长度短及含有测序错误等，深入探讨了当前基因组序列拼接所采用的主要策略，即贪心策略，交叠-排序-生成共有序列（OLC）策略和De Bruijn图策略等，总结了不同算法的优势及不足，并提出了序列拼接算法的改进方向。 接着，本文提出了基于reads引导的基因组序列拼接算法，以整条reads为拼接的基本单位，并率先在拼接算法中提出了基于信息累计和数据特征相结合的评分方法。该算法分为reads拼接和contigs组装两个阶段，contigs是由reads拼接生成的长序列片段。reads拼接阶段主要包括数据预处理、De Bruijn图的建立、contigs构建等，而contigs组装阶段则主要有contigs相对位置的确定、交叠overlap检测、contigs连接及空隙gaps填充等过程，其中在确定contigs的相对位置时首次提出了配对数目数组PEN的概念，并用序列比对的方法消除或纠正contigs末端的碱基错误，提高了拼接精度。 最后，进行了算法验证和性能评价。选取若干组数据对该算法软件进行测试，并用评测软件Mauve Assembly Metrics将拼接结果与主流的拼接软件进行比较，分析评测结果，得出了该算法在序列拼接时无论是拼接的长度还是拼接的准确度都表现不错的结论。 关键词: 生物信息学；新一代测序技术；基因组序列拼接；reads；De Bruijn图