LncRNA研究思路

LncRNA研究思路

lncRNA参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，很多人看到lncRNA的热点还没有过去，经常会问老谈如果没有相关的工作基础，如何开始lncRNA的研究?今天我们就褪去虚伪假衣，研究的大方向是这样子的：

1. 寻找到lncRNA分子

2. lncRNA分子表型研究

3. lncRNA通过何种机制调节表型？

老谈将这些研究方向及实验手段按层次的方式绘成流程图，如下所示：

首先，是样本的准备与收集，高质量的样本是实验结果具有可靠性的前提。

其次，是lncRNA检测，可以先通过芯片的方式高通量筛选到目的基因，然后通过q-PCR或Northernblot的方法验证所得到的芯片结果。

再次，其研究方向根据研究目的而定。如果是研究生物标志物，那么可以通过收集更多的临床样本，研究lncRNA对疾病的指示作用。如果是研究其功能，则是研究其细胞表型，分子表型及机制。

小伙伴们是不是觉得这和miRNA的总体研究思路相似呢？这时可以根据各自的实验平台条件选择相应的研究。值得注意的是，lncRNA的功能研究并不像miRNA一样通过3’UTR影响翻译套路，总的来说lncRNA机制研究套路还不成熟。对于很多科研工作者，lncRNA分子的获得及其细胞表型的获得并非难事，关键在于如何进一步进行研究，这时候就要涉及到对功能研究的定位。归纳如下：

lncRNA的功能分为3方面:

1. 是通过修饰染色体参与表观调节；

2. 通过与转录因子的相互作用参与转录调节；

3. 通过影响mRNA处理过程参与转录后调节。

在以上3个方向的研究中，其中转录后调节相对简单，大家在选择lncRNA的时候，可以对其序列做一下分析，看看自己研究的lncRNA是作为miRNA的sources还是sinks？

另外两方面的调节机制均涉及RNA-蛋白质的相互作用。在没有目的蛋白的时候，此时不得不使用先进技术，用于检测RNA-蛋白质相互作用的实验手段如下：

RNA-蛋白质相互作用的检测手段有nRIP，CLIP；lncRNA由于其长片段核苷酸序列，碱基之间相互作用，通常二级结构，可通过RNase足迹等实验手段进行探讨；在染色体结构修饰作用中，还会涉及RNA-RNA的相互作用，可通过CHIRP等实验手段来研究。

由于上述实验手段比较难得，lncRNA的机制研究相对还是比较困难。那我们该怎样进行lncRNA研究呢？咱换个思路，不要将lncRNA作为一个调节分子，而是把lncRNA当做和mRNA 一样的分子来研究，尽管很少表达蛋白。在体外，可以通过分子干扰手段，进行分子及表型研究；在体内，也是如此。两者通过各种组合，那就等着发5分的文章吧。

一文参透：lncrna研究思路、模式和数据库应用知识讲解

一文参透：l n c r n a研究思路、模式和数据 库应用

一文参透：lncRNA研究思路、模式和数据库应用... 作者：解螺旋.老谈 导语当很多小伙伴还徘徊在miRNA时，lncRNA已经横空出世，还没得来得及反应过来lncRNA到底是怎么回事时，circRNA又开始崭露头角了。科研就是这样，你落后一步，便步步落后，跟娶媳妇生孩子是一样一样的。说回正题，应部分解螺旋粉丝的要求，今天老谈帮大家整体梳理了曾经红极一时、目前热度不减的IncRNA的研究思路和模式以及相关工具，希望能对那些想在IncRNA研究上有所作为的小伙伴能助上一臂之力。lncRNA研究思路IncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程。很多人看到lncRNA的热度还没有过去，经常会问老谈如果没有相关的工作基础，如何开始lncRNA的研究?今天我们就褪去虚伪外衣，研究的大方向是这样子的： 1. 寻找到lncRNA分子 2. lncRNA分子表型研究 3. lncRNA 通过何种机制调节表型？ 老谈将这些研究方向及实验手段按层次的方式绘成流程图，如下所示：首先，是样本的准备与收集。高质量的样本是实验结果具有可靠性的前提。

其次，是lncRNA检测。可以先通过芯片的方式高通量筛选到目的基因，然后通过q-PCR或Northern blot的方法验证所得到的芯片结果。 再次，其研究方向根据研究目的而定。如果是研究生物标志物，那么可以通过收集更多的临床样本，研究lncRNA对疾病的指示作用。如果是研究其功能，则是研究其细胞表型、分子表型及机制。 小伙伴们是不是觉得这和miRNA的总体研究思路相似呢？这时可以根据各自的实验平台条件选择相应的研究。值得注意的是，lncRNA的功能研究并不像miRNA一样通过3’UTR影响翻译套路，总的来说lncRNA机制研究套路还不成熟。对于很多科研工作者而言，lncRNA分子的获得及其细胞表型的获得并非难事，关键在于如何进行下一步研究，这时候就要涉及到对功能研究的定位。归纳如下：lncRNA的功能分为3方面: 1. 通过修饰染色体参与表观调节； 2. 通过与转录因子的相互作用参与转录调节； 3. 通过影响mRNA处理过程参与转录后调节。在以上3个方向的研究中，其中转录后调节相对简单，大家在选择lncRNA的时候，可以对其序列做一下分析，看看自己研究的lncRNA是作为miRNA的sources还是sinks？

lncRNA作用机制

lncRNA 在肿瘤中的研究现状 长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是一类转录本长度超过200nt、不编码蛋白的RNA，这类RNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，随着2007年Hotair功能的被发掘，lncRNA的功能渐渐明晰。据计算，约有93%的转录本为lncRNA1，lncRNA通常位于细胞核和细胞质。但是lncRNA的基因转录水平一般低于蛋白质编码基因，序列保守性差，承受的进化压力小，但promoter序列通常比较保守。lncRNA与小分子RNA相比，序列更长、空间结构也较为复杂，参与表达调控的机制也更具有多样性和复杂性。尽管目前只有一小部分lncRNA的功能有相关报道，但可以明确的是lncRNA参与发育、分化、代谢等多方面的调控。lncRNA能在表观遗传2、转录3及转录后4水平调控基因表达，参与X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活与抑制、核内运输等多种重要的调控过程，与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切联系。 研究表明，lncRNA的异常表达与肿瘤的诊断、复发及转移相关5。lncRNA 以外泌体的形式分泌到细胞外，体液中的lncRNA具有作为生物标志物的潜能，指示肿瘤的进展与恶性程度，指导个性化治疗。PCA3是一个前列腺癌特异表达lncRNA，在前列腺癌患者尿液中异常升高，已经用于临床前列腺癌诊断6。血浆中稳定存在的lncRNA也有作为生物标志物的潜能，比如胃癌患者血浆中lncRNA H19显著升高7。在临床，相同癌症患者接受相同的治疗方式，但往往会表现出不同的临床后果，lncRNA的差异表达是造成这一现象的原因之一8。癌组织中lncRNA的异常表达通常与转移及预后较差相关。在胰腺癌中lncRNA HULC表达异常升高，其异常高表达与肿瘤体积、高级别的淋巴结转移与血管浸

论文研究思路和研究方法

论文研究思路和研究方法 许多学子为撰写毕业论文而绞尽脑汁发愁，论文东拼西凑应付差事，实在不行，在网上另请高手代写论文通关，其实掌握了撰写毕业论文的研究方法和技巧，揭开毕业论文的神秘面纱，一切会变得简单而明了。下面分享常用的撰写毕业论文的研究方法，希望对大家有所帮助。 一、调查法 调查法是科学研究中最常用的方法之一。它是有目的、有计划、有系统地搜集有关研究对象现实状况或历史状况的材料的方法。调查方法是科学研究中常用的基本研究方法，它综合运用历史法、观察法等方法以及谈话、问卷、个案研究、测验等科学方式，对教育现象进行有计划的、周密的和系统的了解，并对调查搜集到的大量资料进行分析、综合、比较、归纳，从而为人们提供规律性的知识。调查法中最常用的是问卷调查法，它是以书面提出问题的方式搜集资料的一种研究方法，即调查者就调查项目编制成表式，分发或邮寄给有关人员，请示填写答案，然后回收整理、统计和研究。 二、观察法 观察法是指研究者根据一定的研究目的、研究提纲或观察表，用自己的感官和辅助工具去直接观察被研究对象，从而获得资料的一种方法。科学的观察具有目的性和计划性、系统性和可重复性。 在科学实验和调查研究中，观察法具有如下几个方面的作用： ①扩大人们的感性认识。 ②启发人们的思维。 ③导致新的发现。 三、实验法 实验法是通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果联系的一种科研方法。 其主要特点是： 第一、主动变革性。观察与调查都是在不干预研究对象的前提下去认识研究对象，发现其中的问题。而实验却要求主动操纵实验条件，人为地改变对象的存在方式、变化过程，使它服从于科学认识的需要。 第二、控制性。 科学实验要求根据研究的需要，借助各种方法技术，减少或消除各种可能影响科学的无关因素的干扰，在简化、纯化的状态下认识研究对象。 第三，因果性。实验以发现、确认事物之间的因果联系的有效工具和必要途径。 四、文献研究法 文献研究法是根据一定的研究目的或课题，通过调查文献来获得资料，从而全面地、正确地了解掌握所要研究问题的一种方法。文献研究法被子广泛用于各种学科研究中。 其作用有： ①能了解有关问题的历史和现状，帮助确定研究课题。 ②能形成关于研究对象的一般印象，有助于观察和访问。 ③能得到现实资料的比较资料。

lncRNA研究方案

1 lncRNA 研究技术手册 一、lncRNA 概述 lncRNA (Long noncoding RNAs,lncRNAs)长链非编码RNA ，起初被认为是基因组转录的不具有生物学功能的“噪音”，是RNA 聚合酶II 转录的副产物。然而，近年来的研究表明，lncRNA 参与了X 染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，lncRNA 的这些调控作用也开始引起人们广泛的关注。随着研究的推进，各类lncRNA 的大量发现，lncRNA 的研究将是RNA 基因组研究非常吸引人的一个方向，使人们逐渐认识到基因组存在人类知之甚少的“暗物质”。 lncRNA 的功能分为3方面： 1）通过修饰染色体参与表观调节-与mRNA 相互作用； 2）通过与转录因子的相互作用参与转录调节-与蛋白（转录因子）相互作用； 3）通过影响mRNA 处理过程参与转录后调节-ceRNA 作用模式。 三种lncRNA 机制作用方式，1和2主要发生于细胞核，3则发生在胞质。从研究难度来说，1>2>3：1）的RNA interaction 与array 并无成熟的研究模式；2）需要RIP 和RNA pull-down ，实验执行难度大风险高；3）转录后调节的研究方法-ceRNA 作用模式可行性及阳性率较高，是目前研究最热门的lncRNA 作用方式。 lncRNA 的ceRNA 作用模式：lncRNA 作为竞争性内源RNA(competing endogenousRNA ，ceRNA)，与microRNA 结合，在细胞中起到microRNA 海绵的作用。从而降低microRNA 的活性，间接上调microRNA 相关靶基因的表达。 图：lncRNA 的ceRNA 作用模式

课题研究思路过程与方法

研究思路 （1）探究信息技术环境下有益的教学模式和适合的教学方法——牙克石市综合高中“四环”教学模式，结构为：自学、合作、展示、检测。 （2）应用信息技术，通过数字化校园网络，为学生营造愉快的活动氛围，开阔学生的知识视野，激发学生的学习兴趣，提高学生的创新能力。 （3）优化活动质量，关注学生的个性发展，为学生创造质疑问题、探索创新的活动氛围。 （4）在丰富的现代信息技术教育中促进师生间积极的情感交流，实现师生共同成长。 研究过程 （1）酝酿准备阶段（2016年9月—2017年1月） 构思、规划、制订出本课题研究的总体方案及各阶段的实施要点，组建实施组织机构，建立课题管理制度，组织参与本课题研究的教师加强相关理论的学习，学习课题研究方案，明确课题研究的意义及做法。 2016年9月，成立课题研究小组，确定成员及分工，坚持理论先行的原则，组织课题组成员进行理论学习，对参与研究的教师进行培训，使课题组成员进一步明确课题研究的意义、目标和任务。 2016年10月—11月，课题组集中讨论开题研究的情

况，撰写《开题报告》，对初步形成的《开题报告》进行审订和修改补充，对研究的内容和课题进行初步的探讨，结合教师教学的实际，在总结的基础上达成课题研究的共识。 2016年12月，为确保课题研究工作的顺利进行，扎扎实实做好各项研究工作，课题组制定课题研究方案，课题组结合我校教学工作安排，对课题的实施方案进行了多次修改，进一步明确课题研究目的、研究对象、研究步骤、研究成效等。 （2）课题实施阶段（2017年2月—2018年2月） 在课题实施过程中，建立子课题组，使教师能根据自己的优势和特长进行有侧重点的研究，在此基础上通过各级研讨活动（公开课、评课、论文交流、专题研讨、讲座等多种形式），加强教师的总结和交流，为进一步研讨提供有效的经验，并在此基础上不断修改、完善研究方案。 2017年2月—2017年7月，课题组运用调查法了解和掌握高中生对学习情况的调查，收集材料，以问题为中心，讲述教师在开展有效教学过程中有价值的案例。课题组根据调查反馈，调整有效教学设计方案。 2017年7月—2017年10月，根据既定计划进行实践研究，积累分析活动案例，定期开展活动，记录并分析活动过程。 2017年10月—2017年12月，课题组集中讨论研究进

课题研究的思路与步骤

课题研究的思路与步骤 一、课题研究的背景与意义 我校学生主要来源于县城学校及其周边农村的学校，城区学生与乡下学生的知识基础、学习兴趣、学习环境多方面都有明显区别。如何在课堂教学中正视学生的个体差异，使学生的个性得到充分发展，使每一位学生乐学、善学、会学，让不同类型的学生都能得到不同程度的发展，体验学习的成功与欢乐。防止出现优生“吃不饱”，学困生“难消化”，厌学甚至辍学的现象。我们想通过本课题的研究，在课堂教学中，兼顾学生个体差异，让不同层面的学生分别到达其思维最近发展区，从而使每一位学生得到充分的发展。探索提升教师教学技能的途径和方法，帮助教师掌握专业发展策略。 二、课题研究的内容与目标 1、本课题研究的主要内容：（1）对初中住校生和走读生基础知识、学习兴趣、学习环境差异，对数学学习能力影响进行现状调查、成因分析和优化分层教学策略研究。（2）探求初中学生小组合作学习数学与个体差异的有效结合形式，最大限度地利用他们之间的差异互补来促进合作学习数学的有效开展。 2、本课题研究的主要目标：研究本课题旨在引导教师注重学生差异、合理利用差异，探寻教得轻松、学生学得愉快的教学方法和途径，创造出更为有效的教育教学方法和数学课堂分

层教学模式，全面提高学生的数学素养。将此实践经验推广到学校其它学科的教学活动中和学校的管理工作中。 三、课题研究的思路与步骤 本课题的研究分为三个阶段。 1、研究的准备阶段。 时间安排：2010.4—2010.8 (1)设计课题方案、制定了切实可行的研究计划。查阅大量文献，掌握国内外关于学生个体差异对学习数学影响的研究概况，确定研究课题，在科学理论的指导下，设计了课题研究方案，修订、论证研究方案，集中讨论并制定切实可行的研究计划，使课题研究具有明确的目标。(2)进行课题组建设，使课题研究处于科学、规范的组织管理之中。把课题组成员分为三个小组。明确课题组成员的职责和分工。制定课题组阶段性计划。完善课题研究制度和组织纪律，包括理论学习制度、培训制度、研究制度和档案资料管理制度。(3)进行预备调查，根据调查结果修改、完善调查问卷，进一步明确研究的思路和目标。 2、研究的实施阶段。 时间安排：2010.9—2011.6 (1)设计学生数学学习兴趣与能力的调查问卷。三个小组分头在实验班学生中进行问卷调查，掌握大量真实的第一手资料。(2)组织课题组成员对问卷调查资料进行认真统计，着眼差异，进行现状分析和成因研究，形成全面而详细的分析报告。依

LncRNA研究思路

LncRNA研究思路 lncRNA参与了X染色体沉默，基因组印记以及染色质修饰，转录激活，转录干扰，核内运输等多种重要的调控过程，很多人看到lncRNA的热点还没有过去，经常会问老谈如果没有相关的工作基础，如何开始lncRNA的研究?今天我们就褪去虚伪假衣，研究的大方向是这样子的： 1. 寻找到lncRNA分子 2. lncRNA分子表型研究 3. lncRNA通过何种机制调节表型？ 老谈将这些研究方向及实验手段按层次的方式绘成流程图，如下所示： 首先，是样本的准备与收集，高质量的样本是实验结果具有可靠性的前提。 其次，是lncRNA检测，可以先通过芯片的方式高通量筛选到目的基因，然后通过q-PCR或Northernblot的方法验证所得到的芯片结果。 再次，其研究方向根据研究目的而定。如果是研究生物标志物，那么可以通过收集更多的临床样本，研究lncRNA对疾病的指示作用。如果是研究其功能，则是研究其细胞表型，分子表型及机制。 小伙伴们是不是觉得这和miRNA的总体研究思路相似呢？这时可以根据各自的实验平台条件选择相应的研究。值得注意的是，lncRNA的功能研究并不像miRNA一样通过3’UTR影响翻译套路，总的来说lncRNA机制研究套路还不成熟。对于很多科研工作者，lncRNA分子的获得及其细胞表型的获得并非难事，关键在于如何进一步进行研究，这时候就要涉及到对功能研究的定位。归纳如下：

lncRNA的功能分为3方面: 1. 是通过修饰染色体参与表观调节； 2. 通过与转录因子的相互作用参与转录调节； 3. 通过影响mRNA处理过程参与转录后调节。 在以上3个方向的研究中，其中转录后调节相对简单，大家在选择lncRNA的时候，可以对其序列做一下分析，看看自己研究的lncRNA是作为miRNA的sources还是sinks？ 另外两方面的调节机制均涉及RNA-蛋白质的相互作用。在没有目的蛋白的时候，此时不得不使用先进技术，用于检测RNA-蛋白质相互作用的实验手段如下： RNA-蛋白质相互作用的检测手段有nRIP，CLIP；lncRNA由于其长片段核苷酸序列，碱基之间相互作用，通常二级结构，可通过RNase足迹等实验手段进行探讨；在染色体结构修饰作用中，还会涉及RNA-RNA的相互作用，可通过CHIRP等实验手段来研究。 由于上述实验手段比较难得，lncRNA的机制研究相对还是比较困难。那我们该怎样进行lncRNA研究呢？咱换个思路，不要将lncRNA作为一个调节分子，而是把lncRNA当做和mRNA 一样的分子来研究，尽管很少表达蛋白。在体外，可以通过分子干扰手段，进行分子及表型研究；在体内，也是如此。两者通过各种组合，那就等着发5分的文章吧。

lncRNA芯片结果分析思路与方法

博医工具|史上最全lncRNA芯片结果分析方法 面对lncRNA芯片检测结果报告中的复杂数据，我们该如何从中获取自己想要的信息？今天，百替生物将我们自己的工作经验分享给大家。 芯片分析的大体思路，从以下几个方面考虑： 1.我们最常看到的是聚类分析结果，通常是以热图的形式展现：

实验数据质量评估，预处理及均一化处理等等。提供我们一份包含检测结果的表格， 从这份表格中我们可以看出，芯片分析的结果包括lncRNA和mRNA，分别做差异表达lncRNA和mRNA基因的筛选。芯片公司再根据这份初步的数据，对差异表达lncRNA及mRNA 的筛选：根据客户提供样本量的大小与分布或实验目的，应用倍数法、多重假设检验等手段，对两条件或多条件下的表达差异的lncRNA和mRNA分别进行计算和筛选。实现以下三种分析结果： （1）表达模式聚类分析：针对芯片结果进行样本及差异表达lncRNA和mRNA的聚类，寻找属于同

一表达趋势的基因或样本。 （2）GO和pathway显著性富集分析：差异基因，应用数据库进行功能富集分析，挖掘具有统计学意义的差异表达基因的功能类别。显著性P值越小，则它随机聚集差异表达基因的概率越小，其功能相关性的非随机性就越小，该功能模块有较大的可能与疾病（或药物作用）相关。 （3）蛋白互作网络分析：研究与指定蛋白质相互作用的其他蛋白质的信息，以使研究人员能够更加深入地认清相关蛋白质的功能，更清楚地理解其调控机制。 呈现给我们的数据将会有以下几种类型： 2.差异lncRNA的重注释 lncRNA芯片注释不完善，需要将筛选出来的lncRNA进行重注释。同时会对芯片所检测的mRNA信息进行注释。 3.lncRNA作用机制的分析 （1）lncRNA cis作用机制研究：对于感兴趣的差异表达lncRNAs，搜索其上下游100K范围内的所有编码基因，这些在基因组上临近、且表达模式上共表达的基因很可能被该lncRNAs 所调控。 （2）lncRNA trans作用机制研究：计算LncRNAs 共表达的编码基因，集合与转录因子/染色质调控复合物的靶基因集合的交集，利用超几何分布计算该交集的富集程度，得到与lncRNAs 显著相关的转录因子，从而识别可能与lncRNAs 联合发挥调控作用的转录因子/染色质调控因子。

研究思路和方法

课题研究的基本方法主要有: ⑴观察法.⑵调查法.⑶测验法.⑷行动研究法.⑸文献法⑹经验总结法.⑺个案研究法.⑻案例研究法. ⑼实验法(在一个课题研究过程中，根据不同的研究目的和要求，往往会用到两种以上方法) 教育课题研究的基本方法主要有以下几种： 一、观察法 1．观察法：为了了解事实真相，从而发现某种现象的本质和规律。 2．观察法的步骤：观察法的实施分为以下三个步骤，步骤之一就是进行观察研究的设计，此步骤可分为如下几个方面： （1）作大略调查和试探性观察。 这一步工作的目的不在于搜集材料，而在于掌握基本情况，以便能正确地计划整个观察过程。例如：要观察某一教师的教学工作，便应当预先到学校大致了解这位教师的工作情况，学生的情况，有关的环境和条件等等。这可以通过跟教师和学校领导人谈话，查阅一些有关的材料，如教案、教学日记、学生作业等，以及听课等方式进行。 （2）确定观察的目的和中心。 根据研究任务和研究对象的特点，考虑弄清楚什么问题，需要什么材料和条件，然后作明确的规定。如果这规定不明确，观察便不能集中，结果就不能深入。观察不能有几个中心，范围不能太广，全部观察要围绕一个中心进行。如果必须要观察几个中心，那就采取小组观察，分工合作。 （3）确定观察对象 一是确定拟观察的的总体范围； 二是确定拟观察的个案对象； 三是确定拟观察的具体项目。比如，要研究新分配到小学任教的中师或大专毕业生在课余时间进行业务、文化进修的情况，那么，拟观察总体就是教师工作年限达一年或两年的新教师。在这一总体范围内，再定下具体观察哪几所小学，哪几个教研组中的哪些教师。具体观察名单确定以后，再把拟观察的时间、场合、具体观察项目确定下来。 （4）制定观察计划 观察计划除了明确规定观察的目的、中心、范围，以及要了解什么问题、搜集什么材料之外，还应当安排观察过程：观察次数、密度、每次观察持续的时间，如何保证观察现象的常态等。 （5）策划和准备观察手段观察手段一般包括两种：

研究思路及框架--开题报告

三、研究的思路、论文框架 本文采取文献研究、定性研究、定量研究、计量研究等研究方法，紧紧围绕“宁波对外贸易对产业结构升级的影响”这一主题展开，在研究国内外关于这方面的文献的基础上，深入分析在一个开放经济中宁波对外贸易可以通过哪些途径影响产业结构升级，并结合近几年的统计数据，对宁波对外贸易与产业结构之间的关系进行实证分析，最后指出在对外贸易促进宁波产业结构升级的过程中还存在哪些问题并提出解决措施。本文的初步研究框架拟定如下： 1 导论 1.1 选题背景和意义 1.2 相关文献回顾 1.3 研究思路、研究方法及创新点 1.4 论文结构和篇章安排 2 对外贸易对产业结构升级影响的理论分析 2.1 基本概念 2.2 对外贸易对产业结构升级影响的理论依据 2.2.1比较优势理论 2.2.2生命周期理论 2.2.3雁形理论 2.2.4战略性贸易政策理论 2.3 对外贸易对产业结构升级影响的作用机理 2.3.1通过进口促进产业结构升级 2.3.2通过出口促进产业结构升级 2.3.3对外贸易与产业结构升级的相互作用 3 宁波产业结构现状 3.1 宁波产业结构的演变 3.2 宁波产业结构的特点 3.3 宁波各个产业内部结构分析 4 宁波对外贸易现状 4.1 对外贸易规模分析 4.2 对外贸易商品结构分析 4.3 对外贸易方式分析 4.4 对外贸易主体分析 4.5 对外贸易地理方向分析 5 宁波对外贸易对产业结构升级影响的实证分析 5.1 宁波对外贸易对产业结构影响的实证模型 5.2 实证结果分析 5.3 宁波对外贸易对产业结构升级作用中存在的问题 6 结论及对策建议 6.1 结论 6.2 对策建议

本课题的研究思路、研究方法、技术思路和实施步骤

本课题的研究思路、研究方法、技术思路和实施步骤 思想政治理论课的学科特点适合实施研究性教学。高职院校思想政治理论课的主要任务是对大学生进行系统的马克思理论教育，最终使大学生成为品学兼优适合社会需求的技术人才。思想政治教育课最终目的是要求学生知行统一，知识的识记只是其手段。而研究型教学主张教学以学生为主体，重实践、探究、强调学生在做中学，使学生在研究过程中体验并把所学知识内化。这与思想政治教育课的目的是一致的。 研究方法采用定量研究与定性研究相结合的方法。定量研究主要用观察、实验、调查、统计等方法研究教育现象,注重研究的严密性、客观性, 以求得到客观事实。定性研究采用参与观察和深度访谈而获得第一手资料,具体的方法主要有参与观察、行动研究、历史研究法等。两种研究方法各有所长。本课题采用多种科学研究方法，多角度、全方位地进行研究，以期取得理想的研究成果。项目预期的成果形式为调查报告、论文。 拟用三年时间实施本课题的研究，实施范围为北海职业学院的在校生，收益学生估计为三千到四千人。 第一阶段为动员和调查阶段（2006年9月至2007年8） 推动研究性教学，必须以转变教育观念为先导，以具有针对性的现代教育理论为指导思想，组织思想政治理论课教师和相关管理人员深入开展研究性教学教育思想的学习与讨论。 课题组成员采用集中、分散、问卷、开座谈会等方式调查本院学生。调查内容为学生对思想政治理论课教学方法、课程讲授、课堂讨论、作业训练、实践训练、考核方式等六方面的意见和看法；学生人生观、价值观、法律意识等基本情况。收集第一手材料为研究作准备，此阶段拟用九个月时间。 第二阶段为教学环境现代化建设阶段、理论研究阶段（2007年9月至2008年8） 推动研究性教学，必须积极营造教学资源丰富的环境，特别是有信息技术和先进仪器、设备支持下的教学环境，具体包括立体化精品教材、多媒体教室、电子图书馆、全球知识共享的校园网络以及有利于推动研究性教学的组织、管理制度与运行机制等，为推动研究性教学提供充分的物质保障和制度保障。 课题组成员根据第一手资料的原始数据进行相关领域的理论研究，提出改革策略。此阶段拟用九个月时间。

二、-研究思路和创新

开题报告 一、选题目的与意义 20世纪80年代以来，科学技术的发展促进了经济的迅猛发展，也使得全球经济更加复杂化，再加上不断发生的公司舞弊案等一系列因素，促使人们对内部控制有效性进行了思考。研究发现，传统的查错纠弊式的内部控制已不能满足现代企业纷繁多变的管理环境，企业如何将控制点前移，建立以风险为导向的内部控制体系日益成为世界范围内内部控制研究和实践的关注焦点，而财务环节作为内部控制的关键控制点，更成为重中之重。风险导向财务内部控制的本质特征是以风险要素管理为基础，企业构建风险导向内部控制可以兼顾内部控制与全面风险管理两个方面的工作，是内部控制理论和实践发展的大势所趋。 从我国来看，随着经济体制改革的逐步深入，企业竞争不断加剧，尤其是发生中航油、中储棉等大型企业财务管理失控事件后，暴露出我国企业在财务内部控制方面存在如风险意识淡薄、缺乏有效防范及控制措施等诸多问题，引起了政府监管部门的高度重视。2006年6月，国资委颁布了《中央企业全面风险管理指引》，要求中央企业把风险管理工作摆在内部控制的重要位置；五部委接连于2008年6月和2010年4月发布《企业内部控制基本规范》和《企业内部控制配套指引》，指出企业内部控制要与风险防范相结合，建立了企业内部控制思路转变的新起点，也为企业财务内部控制指明了新的方向。 国家电网公司作为特大型中央企业，承担着为经济社会发展提供坚强电力保障的基本使命，一旦出现财务危机，将给整个经济体系带来灾难，破坏经济的运行，影响人们的正常生活，故其经营业绩倍受关注、而其内部控制就显得更为重要。2010年，公司为贯彻落实中央对加强企业全面风险管理和内部控制工作的要求，也为加强自身建设、完善内部管理，保证战略目标的实现，要求在集团内各单位按照“前期试点、全面实施、整体提升”三个阶段开展全面风险管理和内部控制。其中的财务内部控制，因为较能体现公司管理成果，故在“前期试点”过程中常被作为试点中的试点。目前，“前期试点”工作已基本结束，进入了“全面实施”阶段，网省公司层面的风险管理和内部控制体系已基本建立，下阶段将逐步推广到地市级及以下的基层企业。 基层电力企业作为集团管理的终端，其企业性质、业务定位和管理职能等具有其特殊性，相应的，其财务管理的目标、定位、现状等也具有其独特性，故在基层公司实施财务内部控制时，应秉承“一脉相承”与“自我特色”相结合的原

长链非编码RNA整体实验

长链非编码RNA整体实验 1、提供长链非编码RNA（LncRNA）整体实验方案：客户根据课题标书及 需做实验的主体内容，拟定并提供初步的项目方案，含课题申请书，实验 方案，实验设计，实验思路，实验文献等与实验相关等内容和资料。或者 由嘉美实验协助实验委托者完成长链非编码RNA（LncRNA）整体实验方 案的设计。 2、项目评估报价：公司技术团队根据客户提供的相关资料，综合评估项目 可行性，与客户共同确定准确的实验项目执行方案，给出准确的实验价格。嘉美实验协助设计的课题直接给出准确的报价。 3、签订服务协议：签署服务协议并预付部分费用，做好实验初步准备及项 目预安排。 4、执行服务项目：正式启动实验进程，全面展开实验，确保项目有效执行。 5、沟通项目进展：及时沟通反馈实验的最新进展，随时了解掌控实验的最 新动态。 6、完成项目交付：支付剩余尾款，交付实验结果，正确应用实验结果，提 供售后服务。 一、非编码RNA（Non-coding RNA）介绍 1、非编码RNA（Non-coding RNA）是指不编码蛋白质的RNA。其中包括rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA 、microRNA 和lncRNA等多种已知功能

的 RNA，还包括未知功能的RNA。目前主要研究方向集中在非编码RNA 及其相互结合的DNA、RNA、蛋白质等科学问题，而科学问题的解答依赖 于实验技术的创新使用和革命。 2、长链非编码RNA（long noncoding RNA，lncRNA）是一类长度＞200bp 的RNA，由RNA聚合酶Ⅱ转录，lncRNA具有保守的二级结构,大部分不编 码蛋白质。LncRNA发挥功能的方式很广，可以与蛋白、DNA和RNA相互 作用，参与多种生物学过程的调控。主要包括基因组表观遗传修饰、调控 转录后翻译、发挥ceRNA、增强子RNA作用等，从而对细胞的增殖、分化、迁移、凋亡、免疫等发挥调控作用。 3、LncRNA火热的十年。近年来，LncRNA相关研究在国内外的热度居高 不下，早在1991年，Xist 调控X染色体的失活就登上Nature，但当时认为 这只是一种特殊情况。2007年Howard Chang在Cell上发表题为“Functional demarcation of active and silent chromatin domains in human HOX loci by noncoding RNAs”的论文，正式开启了LncRNA火热的十年。

毕业论文开题报告思路

毕业论文开题报告思路 毕业论文开题报告思路 1．选题方向与题目 论文选题要充分考虑自己的研究基础、研究能力和研究 兴趣。所选的研究课题一般应具有如下特点： 一是具有重要性。学位论文选题要有理论意义和现实意义，一定要是尚未解决或尚未完全解决而又要必须解决的问 题，即能解决理论问题以推动学科发展，能解决实际问题产 生多种效益，这样的问题当然就有理论意义和现实意义。 二是具有创新性。学位论文课题应是社会经济发展和环 境变化产生的新问题，以及前人没有解决的疑难问题，可以 推动理论创新、方法创新和应用创新，因此，论文选题可以 是完善或创新理论与方法，也可以是拓展现有理论的应用研 究领域。 三是具有学术性。论文讨论的问题一定要是一个学术问题，才有学术意义和学术价值。四是具有可行性。论文选题 要求在科学上成立并可以探究，符合发展趋势，并有一定宽 度，可分解，能循序渐进，可以深入研究。 在选题方向确定后，拟定具体的题目就非常重要了。论 文题目是文章的题眼，可谓“干言万语第一句话”。拟定题目时要尽可能做到以下几点：

一是要体现专业性，符合本学科专业的学术要求和规范。 二是要有问题意识，有针对性，从题目表述就可以看出 论文研究的核心问题。 三是题目大小要适度，表述简洁、无歧义。一般采取中 生表达，文题相对。字数一般在25个字左右，最好不要超过3O个字。 2．文献选择与阅读 围绕研究方向领域或关键词选择文献，所选文献要尽量 基金项目：湖北省高校教学研究项目“基于新制度经济学视 角的大学内部治理研究”(XX0324)和湖北民族学院教学研究项目“大学内部治理结构优化与人才培养模式创新研究” 权威和前沿，特别是近五年的同类研究文献，要尽量“一网 打尽”。与此同时，耍对文献进行编排处理，并严格按文献 著录格式标明文献出处。文献选定后就要认真阅读，通过阅 读文献，熟悉了解本研究领域国内外主流期刊最新的研究成 果。在阅读文献的过程中，要特别注意四个问题。一是论文 所研究的科学问题是什么?是否重要?为什么重要?二是论文中用到哪些研究手段?这些研究手段足以解决所提出的科学 问题吗?三是论文中是否有创新的思想?是否使用了新的研究手段?四是论文产生了新的结论或概念吗?论文的数据是否能够支持这些结论或概念?在此基础上，尽量整理出系统的文献综述，并在国内外专业期刊上发表，以实现“更加熟

lncRNA研究策略与技术

lncRNA研究策略与技术

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lncRNA研究策略与技术 研究背景： 长链非编码RNA(long noncoding RNA，lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子，长度在200 bp 以上，起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能；近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构，可以与蛋白、DNA和RNA相互作用，参与多种生物学过程的调控，尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色，如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA的诱导分子干扰基因的表达等，图1所示。随着高通量测序技术的发展，越来越多的lncRNA被注释，但是绝大多数的lncRNA的功能仍然不清楚，因此lncRNA的研究是一片非常广阔的未知领域，具有极大的研究价值和意义。 图1. lncRNA参与肿瘤生物学调控，红色线状图表示lncRNA。 A.染色质重组 B.转录激活和抑制 C.蛋白抑制 D.转录后修饰 E.诱导分子 锐博生物提供研究思路： 差异lncRNA筛选的研究方法：

案例解读： 案例(一)RNA seq发现lincRNA 1. 2011年，Rinn研究小组对24种组织样本进行RNA测序发现了8000多个人的lincRNA 图2. A.利用RNA-seq预测lincRNA的流程图 B.多个参考数据库找到的lincRNA的数量及 交集及用软件组装的结果 2. lincRNA的表达具有组织特异性 图3. lincRNA和mRNA在不同组织当中的表达情况

lncRNA研究策略之：RNA Pull Down实验技术

【实验技巧】lncRNA研究策略之：RNA Pull Down实验技术 lncRNA研究策略之：RNA Pull Down实验技术 RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。RNA pull-down使用体外转录法标记生物素RNA探针，然后与胞浆蛋白提取液孵育，形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链亲和素标记的磁珠结合，从而与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后，通过Western Blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与RNA相互作用。 1) lncRNA筛选： 通过lncRNA芯片或RNA测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行lncRNA表达谱分析；通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异的lncRNA，构建共表达网络，预测lncRNA的靶基因； 通过PCR或Northern Blot技术对候选lncRNA验证，确定其表达差异。 2) lncRNA确定： 通过5' RACE获取lncRNA 5'全长，3' RACE获取lncRNA3'全长，最终拿到完整的lncRNA序列。 3) 表达分析： 细胞水平表达：在细胞水平进行检测表达差异。 组织分布：检测不同组织、不同阶段表达特性。 表达水平动力学变化：比较不同处理条件下，如药物处理、诱导处理下，表达水平差异。 4) 功能研究： 功能获得性研究：构建lncRNA过表达载体:原则上是将全长lncRNA定向克隆到表达载体上实现lncRNA的过表达。然而有些lncRNA很大或全长尚未分离，这时将视lncRNA在基因组上的定位采取不同的研究策略。 功能缺失性研究：可通过siRNA、shRNA、反义核酸等方法沉默lncRNA，干预lncRNA后检测其对疾病相关基因表达的影响和对细胞表型如增值、凋亡、侵袭、转移等的影响； 采用RNA pull down、RNA-RIP(RNA Binding Protein Immunoprecipitation)、 ChIRP-seq(Chromatin Isolation by RNA Purification)等方法检测与lncRNA结合的DNA、RNA、蛋白质。 采用lncRNA芯片分析技术结合mRNA对lncRNA功能进行预测，研究lncRNA trans和cis作用机制。 采用配体指数级富集系统进化技术(systematic evolution of ligands by exponential enrichment，SELEX)，设计一种RNA配体，与癌症相关的lincRNA结合达到抑制肿瘤细胞的生长和转移。

开题报告中研究思路与研究方法

开题报告中研究思路与研究方法的写法 研究方法 （1）模糊层次分析法 本论文考虑到绿色造船评价指标既有定量指标又有定性指标，可以借助模糊评价方法的处理方式，将一些模糊的概念转化成定量的数据。此外，为了表达综合评价目标的层次性，考虑采用层次分析方法，建立评价对象和评价指标体系。因此，本文结合了层次分析法和模糊评价法的优点，采用模糊层次分析方法对船舶建造的绿色度进行综合评价。 （2）理论研究与实证研究相结合的方法 绿色造船评价指标体系的研究注重理论与实证两种研究方法的结合，对现实中改善船舶建造活动与环境的关系，具有一定的评价和指导意义。本文采用该方法，界定了绿色造船的定义以及综合评价目标等相关概念（第2、3章）；构建了绿色造船评价指标体系；结合模糊层次分析法，构建了数学评价模型（第4章）。最后，结合实例进行验证研究（第5章）。 （3）定性与定量分析相结合的方法

本文在研究过程中，重视并力求结合定性分析与定量分析进行研究。本文根据绿色造船的三大特征，构建了绿色造船评价指标体系（第3章）。采用模糊层次分析法确定了各个评价指标的权重，并结合专家打分法和中国节水技术政策大纲、《工业企业厂界噪声标准》、《大气污染物综合排放标准》等权威统计数据给予评价指标以定量的数值，最终得出定量的综合评价结果（第4章）。 （4）比较研究的方法 比较研究方法[32]是确定事物之间共同点和差异点的一种逻辑方法。在现实中，比较研究法几乎成为认识事物最常用的一种方法。本文在总结绿色造船定义中大量采用比较研究法，通过横向比较找出绿色造船和一般造船的共同点与不同点以及中、日、韩三国造船现状的比较（第2章）；然后，将众多绿色度评价方法进行比较，比较各个评价方法的优点和缺点，为绿色造船评价指标体系选择适当的评价方法，从而使综合评价结果更具科学性与合理性（第4章）。 （5）归纳与演绎相结合的方法 归纳与演绎相结合的方法是一种辩证逻辑的方法。本文归纳分析了绿色造船的四个流程（第2章）；在此基础之上，归纳了绿色造船的三个特征的研究并构建了绿色造船评价指标体系（第3章）。

环状RNA(circRNA)研究技术手册.doc

环状 RNA(CircRNA)研究技术手册
Circular RNA 研究技术手册
一、环状 RNA 概述
何谓环状 RNA（circRNAs）？ circRNAs （Circular RNAs， 环形 RNA 分子） 是一类不具有 5' 末端帽子和 3' 末 端 poly(A)尾巴、并以共价键形成环形结构的非编码 RNA 分子。circRNA 是区 别于传统线性 RNA 的一类新型 RNA， 具有闭合环状结构， 大量存在于真核转录 组中。大部分的环状 RNA 是由外显子序列构成，在不同的物种中具有保守性， 同时存在组织及不同发育阶段的表达特异性。由于环状 RNA 对核酸酶不敏感， 所以比线性 RNA 更为稳定，这使得环状 RNA 在作为新型临床诊断标记物的开 发应用上具有明显优势。
环状 RNA 研究的历史？ 1971 年。研究者在马铃薯纺锤块茎病的研究中，发现类病毒（Viroids）能侵染 植株并导致死亡。 与病毒不同的是， 类病毒没有蛋白质外壳包被， 基因组是单链、 闭合、RNA 分子。 1979 年洛克菲勒大学的 Hsu 和 Coca-Prados 在电子显微镜下观察到的真核细 胞细胞质中观测到环状 RNA 的存在。
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环状 RNA(CircRNA)研究技术手册
1993 年在小鼠精子决定基因 Sry 中发现环状转录。 2006 年在果蝇中发现来自于 Muscleblind 的未知环状转录本。 2012 年，Salzman 通过 RNA-Seq 方法首次报道了~80 个环状 RNA。至此借 助于高通量测序技术，环状 RNA(circular RNA)验明正身进入科研视界。大量的 circRNA 分子被相继发现，Jeck 等在人类成纤维细胞中检测出了高达 25000 多种的 circRNA；而 Memczak 等通过 RNA-seq 数据结合人白细胞数据库鉴 定出 1950 种人类 circRNA、 1903 种小鼠 circRNA (其中 81 种与人类 circRNA 相同) 和 724 种线虫 circRNA。虽然 circRNA 大规模研究时间不长，但重量级 文章陆续在 NSC 等期刊上发表，研究热潮已然升起。
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LncRNA的研究策略

lncRNA研究策略 转载请注明来自丁香园 发布日期：2012-09-21 14:47 文章来源：丁香园 分享到：收藏夹新浪微博腾讯微博开心网豆瓣社区人人网 关键词：RNA miRNA 技术专题锐博生物丁香通丁香园点击次数：3447 1、差异表达筛选 通过lncRNA芯片或RNA-seq测序等方法对多对疾病模型和对照样本组织进行lncRNA 表达谱分析。 2、生物信息分析 通过生物信息学的方法筛选出具有表达差异的lncRNA，构建共表达网络，预测lncRNA 的靶基因。 3、细胞分子水平研究 （1）功能获得性研究：构建lncRNA过表达载体 （2）功能缺失性研究：可通过siRNA、shRNA、反义核酸等方法沉默lncRNA，干预lncRNA后检测其对疾病相关基因表达的影响和对细胞表型如增值、凋亡、侵袭、转移等的影响 （3）可通过RNA pull down、RNA-RIP、ChIRP-seq等方法检测与lncRNA结合的DNA、RNA、蛋白质。 4、动物实验 （1）构建移植瘤或原位瘤模型，转移模型 （2）导入siRNA或者lncRNA表达质粒 （3）检测肿瘤生长曲线 （4）通过免疫组化、RT-PCR、Western Blot等方法检测相关指标变化。 小知识 RNA-RIP技术（RNA Binding Protein Immunoprecipitation)是一种高通量检测细

胞内RNA与蛋白结合情况的技术，运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来，然后经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行分析。RIP技术下游结合microarray技术被称为RIP-Chip，帮助我们更高通量地了解癌症以及其它疾病整体水平的RNA变化。 CHIRP-Seq( Chromatin Isolation by RNA Purification )是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白的高通量测序方法。方法是通过设计生物素或链霉亲和素探针，把目标RNA拉下来以后，与其共同作用的DNA染色体片段就会附在到磁珠上，最后把染色体片段做高通量测序，这样会得到该RNA能够结合到在基因组的哪些区域；如果结合物是蛋白质，可以通过将蛋白质打断成短肽再通过质谱进行鉴定，从而或者与RNA结合的蛋白质。RNA Pull down技术与此类似。

LncRNA研究背景

长链非编码ＲＮＡ（long noncoding RNAs，LncRNAs）是一类长度超过200nt 的非编码RNA分子，其表达水平相对于蛋白编码基因较低，但它们在Ｘ染色体沉默、基因组印迹、染色体修饰、转录激活、转录干扰以及核内运输等方面具有重要的功能，广泛参与细胞周期调控、生长发育、胚胎干细胞分化等多种生物学过程。lncRNA 一般可分为五类，分别为：同义lncRNA、反义lncRNA3、双向lncRNA、内含子lncRNA和基因间lncRNA。 lncRNA转录可以干扰沉默基因，它的转录同样可以对邻近基因的表达能力产生深远的影响，还可以穿过下游蛋白质编码基因启动子区域的lncRNA直接干扰转录因子与启动子的结合，并因此阻止蛋白质编码基因的表达，同样LncRNA 转录的进行引起组蛋白修饰，从而阻止在转录体内部位点起始虚假基因转录[1]。LncRNA由于序列保守性较低，其发挥作用可能并不是依赖于严格的序列保守性，而是依靠二级空间结构来发挥作用。 一些LncRNA通过与染色质相互作用和招募染色质修饰结构来调节多种基因的转录沉默，通过招募多梳复合物在顺式位置形成其转录位点的抑制结构域、可与抑制性复合物CoR结合作用于甲基化酶对多梳蛋白Pc2进行甲基化修饰，进而结合E2F1因子形成抑制性复合、结合转录因子，直接顺式调节基因的转录、与不同不同功能的几类效应分子构成大分子复合体，然后与靶基因结合，形成蛋白质－ＲＮＡ－ＤＮＡ异源多聚体调节基因的转、在转录后水平可通过和互补的ｍＲＮＡ形成双链ＲＮＡ，影响ｍＲＮＡ加工、剪接、转运、翻译和降解等过程，从而调节基因的表达[2]。据有关报道，功能相同或相近的蛋白具有相似的表达倾向。共表达网络，即表达趋势一致的基因网络，已经被证实是一个对未知蛋白编码基因进行功能注释的有效方法之一[3]。 同样，LncRNA 与蛋白编码基因的双色共表达网络也是对LncRNA 进行功能注释的有效可行的方法。已有研究报道，一部分LncRNA 倾向调节基因组上临近的蛋白编码基因。因此，基于基因组共定位的方法，即挖掘既共表达又在基因组上临近( 比如，距离不超过100kb) 的LncRNA蛋白编码基因关系,将蛋白编码基因的功能赋予该 LncRNA基于网络 Hub的方法，则以 LncRNA 作为中心节点，寻找与该LncRNA 直接相连( 共表达) 的蛋白编码基因，计算这些蛋白编码基因富集的功能，并赋予该中心节点LncRNA[3]。LncRNA在表观遗传、转录调控和转录