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GATK使用说明及流程

GATK使用说明及流程
GATK使用说明及流程

GATK使用说明及流程

1.要分析的序列名称中,一般不要有空格

2.准备Reference文件(需为fasta格式)及比对

1)Index处理:生成一个ref.fasta.fai的文件

2)生成.dict文件:

samtools faidx reference.fasta

java-jar picard-tools/CreateSequenceDictionary.jar R=reference.fasta O=reference.dict

bwa index-a bwtsw ref.fasta

bwa mem-t16-M ref.fasta read.fq mates.fq>sample.sam

转换结果文件到bam格式

java-jar picardtools/SamFormatConvert I=xx.sam o=xx.bam

or

samtools view-bS xx.sam-o xx.bam

3.准备样本的BAM文件

1)Sort the aligned reads by coordinate order

2)Mark duplicates

3)Add read group information(同时具有,sam2bam转换、sort功能,可合并setp1) 4)Index the BAM file

java-jar picardtools/SortSam.jar INPUT=unsorted_reads.bam OUTPUT=sorted_reads.bam SORT_ORDE R=coordinate

(input可以输入sam文件,output输出bam,省去上述的格式转换)

java

-jar picardtools/MarkDuplicates.jar INPUT=sorted_reads.bam OUTPUT=dedup_reads.bam MET RICS_FILE=sample01.dedup.metrics MAX_FILE_HANDLES=1000

注意:MAX_FILE_HANDLES=Integer,参数由“ulimit-n”获得极限值。

During the sequencing process,the same DNA molecules can be sequenced several times.The resulting duplicate reads are not informative and should not be counted as additional evidence for

or against a putative variant.The duplicate marking process(sometimes called dedupping in bioinformatics slang)identifies these reads as such so that the GATK tools know to ignore them.

java

-jar picardtools/AddOrReplaceReadGroups.jar I=dedup_reads.bam O=addrg_reads.bam ID=grou p1LB=lib1PL=illumina PU=unit1SM=sample1

ID=String Read Group ID Default value:1.This option can be set to'null'to clear the default value.

LB=String Read Group Library Required.

PL=String Read Group platform(e.g.illumina,solid)Required.

PU=String Read Group platform unit(eg.run barcode)Required.

SM=String Read Group sample name Required.

java-jar picardtools/BuildBamIndex I=addrg_reads.bam

or

samtools index addrg_reads.bam

例如

1)bwa比对

bwa index-a bwtsw ref.fasta

bwa mem-t16-M ref.fasta read.fq mates.fq>sample.sam

2)转换sam到bam

samtools view-bS sample01.sam-o sample01.bam

java-jar picardtools/SamFormatConvert I=xx.sam o=xx.bam

3)排序

java-jar picardtools/SortSam.jar I=sample.bam

O=sample.sorted.bam sort_order=coordinate

4)去重复

java-jar picardtools/MarkDuplicates.jar INPUT=sorted_reads.bam

OUTPUT=dedup_reads.bam METRICS_FILE=sample01.dedup.metrics

MAX_FILE_HANDLES=1000

5)分组

java-jar picardtools/AddOrReplaceReadGroups.jar

I=sample.sorted.bam O=group.bam ID=group1LB=lib1PL=illumina

PU=unit1SM=sample1

6)index样品

java-jar~/my_bin/picardtools1.94/BuildBamIndex.jar I=group.bam

4.使用参数

--------------------------------------------------------------------------------

The Genome Analysis Toolkit(GATK)v2.6-4-g3e5ff60,Compiled2013/06/2414:48:56 Copyright(c)2010The Broad Institute

For support and documentation go to https://www.wendangku.net/doc/338154925.html,/gatk

--------------------------------------------------------------------------------

--------------------------------------------------------------------------------

All command line parameters accepted by all tools in the GATK

--analysis_type/-T(required String)

Type of analysis to run.

-I,--input_file

input file(s),SAM or BAM

-rbs,--read_buffer_size

Number of reads per SAM file to buffer in memory

--BQSR/-BQSR(File)

The input covariates table file which enables on-the-fly base quality score recalibration(intended for use with BaseRecalibrator and PrintReads).Enables on-the-fly recalibrate of base qualities. The covariates tables are produced by the BaseQualityScoreRecalibrator tool.Please be aware that one should only run recalibration with the covariates file created on the same input bam(s).

-K,--gatk_key

GATK Key file.Required if running with-et NO_ET.Please see -home-and-how-does-it-affect-me#latest for details.

--intervals/-L(List[IntervalBinding[Feature]])

One or more genomic intervals over which to operate.Can be explicitly specified on the command line or in a file(including a rod file).Using this option one can instruct the GATK engine to traverse over only part of the genome.This argument can be specified multiple times.One may use samtools-style intervals either explicitly(e.g.-L chr1or-L chr1:100-200)or listed in a file (e.g.-L myFile.intervals).Additionally,one may specify a rod file to traverse over the positions for which there is a record in the file(e.g.-L file.vcf).To specify the completely unmapped reads in the BAM file(i.e.those without a reference contig)use-L unmapped.

-XL,--excludeIntervals

One or more genomic intervals to exclude from processing.Can be explicitly specified on the command line or in a file(including a rod file)

--reference_sequence/-R(File)

Reference sequence file.

--num_threads/-nt(Integer with default value1)

How many data threads should be allocated to running this analysis..How many data threads should be allocated to this analysis?Data threads contains N cpu threads per data thread,and act as completely data parallel processing,increasing the memory usage of GATK by M data threads. Data threads generally scale extremely effectively,up to24cores

......

5.分析流程

1)Mapping and Duplicate Marking

2)Local Realignment

3)Base Quality

Recalibration

该步骤的运行,需要使用已知的snp/indel信息做参考。若没有已知信息,可以先用GATK 和samtools初步获得,取其一致snp/indel信息,作为参考。具体可参考他人博客:https://www.wendangku.net/doc/338154925.html,/s/blog_6721167201018jik.html

##step1:variants calling by GATK

java-jar GenomeAnalysisTK.jar\

-R ref.fasta\

-T UnifiedGenotyper\

-I sample01.realn.bam\

-o sample01.gatk.raw.vcf\

-stand_call_conf30.0\

-stand_emit_conf0\

-glm BOTH\

-rf BadCigar

这边有一个-rf参数,是用来过滤掉不符合要求的reads,这边是把包含错误的Cigar字符串的reads给排除掉,关于Cigar字符串可以参考关于sam文件的说明(The SAM Format Speci?cation),sam文件的第六行就是这边的Cigar字符串,-rf的其他参数可以参考GATK 网站Read filters下面的条目https://www.wendangku.net/doc/338154925.html,/gatk/gatkdocs/

##step2:variants calling by samtools

samtools mpileup-DSugf ref.fasta sample01.realn.bam|\

bcftools view-Ncvg-\

>sample01.samtools.raw.vcf

##step3:选取GATK和samtools一致的结果

java-Xmx4g-jar GenomeAnalysisTK.jar\

-R ref.fasta\

-T SelectVariants\

--variant sample01.gatk.raw.vcf\

--concordance sample01.samtools.raw.vcf\

-o sample01.concordance.raw.vcf

##step4:筛选上面得到的结果,这边filter用到的几个标准可以根据实际情况

##灵活更改,对QUAL值的筛选用的是$MEANQUAL,表示所有QUAL值的平均

##值,linux底下这个值可以通过第一条命令行得到

##计算平均值

MEANQUAL=`awk'{if($1!=/#/){total+=$6;count++}}

END{print total/count}'sample01.concordance.raw.vcf`

##筛选

java-Xmx4g-jar GenomeAnalysisTK.jar\

-R ref.fasta\

-T VariantFiltration\

--filterExpression"QD<20.0||ReadPosRankSum<-8.0||FS>10.0||QUAL< $MEANQUAL"\

--filterName LowQualFilter\

--missingValuesInExpressionsShouldEvaluateAsFailing\

--variant sample01.concordance.raw.vcf\

--logging_level ERROR\

-o sample01.concordance.flt.vcf

##step5:提取通过筛选标准的位点到结果文件中

grep-v"Filter"sample01.concordance.flt.vcf>sample01.confidence.raw.vcf

4)Data Compression with Reduce Reads

5)Calling Variants

=============================以下步骤需要其他外部资源=================================

6)Variant Quality Score Recalibration

7)Genotype_refinement

3P流程与工作说明

3P流程与工作说明-标准化文件发布号:(9556-EUATWK-MWUB-WUNN-INNUL-DDQTY-KII

PPP流程与工作说明 财政部规定的5阶段 19步骤 PPP五阶段——项目识别 1. 项目发起 政府发起(主):财政部门向各行业主管部门征集潜在的政府和社会资本合作的项目。 社会资本发起(辅):社会资本以项目建议书的方式向财政部门推荐潜在政府和社会资本合作的项目。 2. 项目筛选 (1) 财政部门会同行业主管部门对潜在项目进行筛选,确定备选项目。 (2) 财政部门制定项目年度和中期开发计划。 (3) 项目发起人提交相关资料: ①新建改建项目提交可行性研究报告、项目产出说明和初步实施方案; ②存量项目提交资产历史资料、项目产出说明和初步方案。 3.物有所值评价 定性评价:PPP模式与传统采购模式相比能否增加供给、优化风险分配、提高运营效率、促进创新和公平竞争等,并根据指标进行专家打分。

定量评价:①通过对PPP项目全生命周期内政府支出成本现值与公共部门比较值进行比较,计算项目的物有所值量值与物有所值指数,判断PPP模式是否降低项目全生命周期成本; ②现阶段以定性评价为主,定量评价工作由各地根据实际情况开展。 4.财政承受能力论证 每一年度全部PPP项目需要从预算中安排的支出责任,占一般公共预算支出比例应当不超过10%。有例外。 PPP五阶段——项目准备 1. 管理架构组建 ①县级(含)以上地方政府可建立专门协调机制,负责项目评审、组织协调和检查督导等工作; ②政府或其指定的有关职能部门或事业单位可作为项目实施机构,负责项目准备、采购、监管和移交等工作 2.实施方案编制 ①项目概况:基础情况,经济技术指标,项目公司股权情况; ②风险分配基本框架:政府承担法律政策和最低需求等风险,社会资本承担商业风险;具体风险分配需列表协商; ③项目运作方式:1. 委托运营,2.管理合同,3.建设-运营-移交(BOT), 4.建设-拥有-运营(BOO), 5.转让-运营-移交(TOT), 6.改建-运营-移交(ROT)等; ④交易结构:项目投融资结构,回报机制,相关配套安排; ⑤合同体系:项目合同,股东合同,融资合同,工程承包合同,运营服务合同,原材料供应合同,产品采购合同和保险合同等; ⑥监管架构:授权关系(政府授权项目实施机构),监管方式(履约管理行政管理、公众监督); ⑦采购方式选择:公开招标、竞争性谈判,邀请招标,竞争性磋商,单一来源采购。 3.实施方案审核 ①财政部门对项目实施方案进行物有所值和财政承受能力验证,通过验证的,由项目实施机构报政府审核;

Python py2exe使用方法

一、简介 py2exe是一个将python脚本转换成windows上的可独立执行的可执行程序(*.exe)的工具,这样,你就可以不用装python而在windows系统上运行这个可执行程序。 py2exe已经被用于创建wxPython,Tkinter,Pmw,PyGTK,pygame,win32com client和server,和其它的独立程序。py2exe是发布在开源许可证下的。 二、安装py2exe 从https://www.wendangku.net/doc/338154925.html,/py2exe下载并运行与你所安装的Python对应的py2exe 版本的installer,这将安装py2exe和相应的例子;这些例子被安装在lib\site-packages\py2exe\samples目录下。 三、py2exe的用法 如果你有一个名为helloworld.py的python脚本,你想把它转换为运行在windows上的可执行程序,并运行在没有安装python的windows系统上,那么首先你应写一个用于发布程序的设置脚本例如mysetup.py,在其中的setup函数前插入语句import py2exe 。 mysetup.py示例如下: # mysetup.py from distutils.core import setup import py2exe setup(console=["helloworld.py"]) 然后按下面的方法运行mysetup.py: python mysetup.py py2exe 上面的命令执行后将产生一个名为dist的子目录,其中包含了helloworld.exe,python24.dll,library.zip这些文件。 如果你的helloworld.py脚本中用了已编译的C扩展模块,那么这些模块也会被拷贝在个子目录中,同样,所有的dll文件在运行时都是需要的,除了系统的dll文件。 dist子目录中的文件包含了你的程序所必须的东西,你应将这个子目录中的所有内容一起发布。 默认情况下,py2exe在目录dist下创建以下这些必须的文件: 1、一个或多个exe文件。 2、python##.dll。 3、几个.pyd文件,它们是已编译的扩展名,它们是exe文件所需要的;加上其它的.dll文件,这些.dll是.pyd所需要的。 4、一个library.zip文件,它包含了已编译的纯的python模块如.pyc或.pyo 上面的mysetup.py创建了一个控制台的helloword.exe程序,如果你要创建一个图形用户界的程序,那么你只需要将mysetup.py中的console=["helloworld.py"]替换为windows=["myscript.py"]既可。

正确使用手机的方法

正确使用手机的方法 手机的广泛使用,使我们被罩在“电子雾”中,无处躲避。很多人都会有这种体会,打手机超过几分钟后,耳朵和脸部都会有发热的感觉。长时间使用手机会影响大脑的功能,造成记忆力减退、失眠,甚至会发生情绪的改变。个别人也可能因为神经细胞和神经胶质细胞的畸变形成恶性脑肿瘤。 这样用手机危害大: 年轻人爱煲电话粥 许多年轻人有意无意的成为煲电话粥的一员,从大学生到社会上的白领阶层,煲电话粥可以说成为一种非常常见的事情。然而长时间的手机辐射会对大脑造成伤害。 热心肠电话变细菌中转站 有些人非常的热心肠,手机常常给别人使用,这样造成的后果就是手机变成细菌的中转站,成为各种病菌的乐园。 大忙人接电话 有些个大忙人,分秒中几百万,所以为了省事就侧着头接电话,长此以往必将危害脊椎,危害大脑,形成健康隐患。 躲起来说悄悄话 有些人打电话害羞,就爱躲到楼梯里避开大家打,可这样的往往让手机的辐射翻倍的增长,对自己的辐射更加厉害。 聊到尽兴充电打 有时候聊的尽兴了,会边充电边打,这样固然能很好的保持气氛,但对健康很不利 打电话性急 有些性急的人拨完号就开始把手机放在耳朵上,其实所有电话在接通状态时辐射都是非常厉害的,所以接电话不用性急。

用质量不好的手机 有些人贪图小便宜用一些非常廉价的手机,这样的手机质量不好,接听电话时往往造成很大的辐射。 正确使用手机的方法 1、在手机呼出时最好先将手机远离头部,以避免手机较大功率发射时对头部的辐射。 2、尽量减少每次使用手机的时间,以及每天使用手机的次数。在必须要较长时间通话时,应左右耳交替或者使用耳机更为科学。 3、当手机信号变弱时,手机会自动提高电磁波的发射功率,此时不要把耳朵紧贴手机。 4、不要在墙角处接打手机,建筑物角落的信号覆盖比较差,因此会在一定程度上使手机的辐射功率增大。基于同样道理,身处电梯等小而封闭的环境时,应慎打手机。 5、接打手机时不要随意走动,频繁移动位置会造成接收信号的强弱起伏,从而引发不必要的短时间高功率发射。

公司业务流程说明书

[选取日期] HISU工作流程说明书 [键入文档副标题] | User

目录 一、目的 ................................................................................................................................... 错误!未定义书签。 二、适用范围 ........................................................................................................................... 错误!未定义书签。 三、职责 ................................................................................................................................... 错误!未定义书签。 1、项目经理 ..................................................................................................................... 错误!未定义书签。 2、制造工程部 ................................................................................................................. 错误!未定义书签。 3、质量部 ......................................................................................................................... 错误!未定义书签。 4、采购部 ......................................................................................................................... 错误!未定义书签。 5、生产部(或外协厂) ................................................................................................. 错误!未定义书签。 四、工作流程 ........................................................................................................................... 错误!未定义书签。 (一)、新产品需求、研发阶段 ................................................................................... 错误!未定义书签。 1、启动阶段 ................................................................................................... 错误!未定义书签。 1.1启动阶段任务 ............................................................................................ 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 1.2启动阶段输出 ............................................................................................ 错误!未定义书签。 1.3启动阶段流程图 ........................................................................................ 错误!未定义书签。 2、计划阶段 ................................................................................................... 错误!未定义书签。 2.1计划阶段任务 ............................................................................................ 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 2.2计划阶段输出 ............................................................................................ 错误!未定义书签。 2.3计划阶段流程图 ........................................................................................ 错误!未定义书签。 3、实施、监控阶段 ................................................................................................. 错误!未定义书签。 3.1实施、监控阶段任务 ................................................................................ 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 3.2实施、监控阶段主要输出 ........................................................................ 错误!未定义书签。 3.3实施、监控阶段流程图 ............................................................................ 错误!未定义书签。 4、收尾阶段 ............................................................................................................. 错误!未定义书签。 4.1收尾阶段任务 ............................................................................................ 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 ................................................................................................................... 错误!未定义书签。 4.2收尾阶段主要输出 .................................................................................... 错误!未定义书签。 4.3收尾阶段流程图 ........................................................................................ 错误!未定义书签。 (二)新产品试产、量产阶段 ....................................................................................... 错误!未定义书签。 1、启动阶段 ................................................................................................... 错误!未定义书签。 1.1启动阶段任务 ............................................................................................ 错误!未定义书签。

正确使用说明的方法

恰当使用说明的方法 一、教学目标 1.掌握几种最常见的说明方法。 2.学会运用恰当的说明方法写说明文。 二、教学重点 教师讲解和学生讨论、训练相结合。 三、教学过程 (一)导入新课 师:同学们,现在假设你们面前有一条河,大家到河对岸去,应该怎么去? 生:从桥上走过去。 趟过去。 乘船…… 师:对,大家的方法都很好!但究竟是趟河、是过桥还是乘船呢?这就要根据情况来选择。比如现在是夏天,河水也很浅,你就可以趟过去。但如果河水很深,而河上又没有桥,那你就只有乘船了。总之,到河的对岸,这是我们的目的。现在,如果我把“过河”比作说明的目的,那么我们过河的各种方法就是说明方法。大家想—想:我们写说明文的目的是什么? 生:是为了把事物特征说清楚,或者把事理阐述明白。 师:对!为了达到这个目的,我们在写说明文时就必须运用恰当的说明方法。(板书) (二)讲授新课 师:现在大家回忆一下,我们学过的说明方法有那些? 生:举例子、打比方、列数据、下定义、作比较、作诠释、分类别、摹状貌、画图表。(教师板书) 师:对!那么我们经常用到的说明方法有那些呢? 生:举例子、打比方、列数据。 师:那么,谁能告诉我,“恰当”是什么意思?(指导学生查字典,回答) 生:恰当,是能够恰如其分的说明事物或事理。 师:对!我们写说明文,就是要根据说明对象和写作目的,选用最佳的方法。比如刚上课时为了让大家明白说明方法的重要,我就采用了打比方的说明方法。好,现在大家打开书,回忆一下我们学过的《中国石拱桥》、《万紫千红的花》这两课,看作者都运用丁那些恰当的说明方法。 (学生分组讨论) 生:《中国石拱桥)说“石拱桥的桥洞成弧形,就像虹”,是打比方;说卢沟桥“桥长265米,由11个半圆形的石拱组成,每个石拱长度不一。自16米到21.6米”,是列数据:说桥上的石狮子“有的母子相抱,有的交头接耳,有的像倾听水声,千态万状,惟妙惟肖”,是摹状貌。 师:《万紫千红的花》举了很多大家熟悉的例子,用图表来说明。如果不用这些说明方法行不行?

公司各部门架构、岗位职责和工作流程

公司各部門架構、崗位職責和工作流程 一、目の 為進一步規範管理,明確各部門架構、各崗位職責、工作流程; 以指導各部門、各崗位運作;優化工作流程の同時提高工作效率及 團隊協作,適應公司可持續發展需要。 二、概述和適用範圍 本程序適用於章華漢草商超事業部運作 三、組織架構

四、部門職責及工作標准 (一)銷售部職責 1、部門職責: ◆根據公司發展戰略,組織制定銷售戰略規劃,完成回款指標。 ◆掌握市場動態,負責收集行業政策、競爭對手信息、客戶信息等,分析市場發展趨勢並有獨特見解。 ◆定期、准確の向營銷總監和相關部門提供有關銷售、回款、費用等反映公司銷售工作現狀の信息,為公司決策提供信息支持2、大區經理崗位職責及工作標准: 報告上級:營銷總監/總監助理 關聯崗位:市場經理、推廣經理、督導

(二)推廣部職責 1、部門職責: ◆負責品牌在終端の推廣及銷售工作 ◆掌握市場動態,收集行業政策、競爭對手等信息,定期、准確の向公司反饋,為公司決策提供信息支持 ◆與部門相關の其他職責 2、推廣經理崗位職責及工作標准: 報告上級:營銷總監/總監助理 關聯崗位:大區經理、市場經理、督導、客服、導購

備注;以上工作標准流程請參考“月度計劃模板”及“推廣經理日常工作指引” 3、督導崗位職責及工作標准: 報告上級:推廣經理 關聯崗位:大區經理、市場經理、導購

(三)市場部職責 1、部門職責: ◆提升品牌知名度及銷售,協助完成回款指標 ◆渠道專業化與規範化提升の標准文件及執行監督 ◆協助重點市場、重點系統打造工作及其他與崗位相關の工作 2、市場部經理崗位職責及工作標准: 報告上級:營銷總監/總監助理 關聯崗位:大區經理、推廣市場經理、企劃、督導、客服

工作审批流程说明

工作审批流程说明Newly compiled on November 23, 2020

一、业务流程定义: 该流程描述了招商引资(买进卖出股权、盘活固定资产、新设公司)的项目拟订、谈判、签约、执行的整体流程。 二、业务流程图(见附图) 三、业务流程描述: 根据集团中长期发展规划、短期目标以及集团领导的指示,拟订招商引资项目的计划。该计划包括项目的名称、规模、人员、设备、招商要求、联系方式及联系人等。 责任人:投资部业务主管。 经理对该计划初步审核,作出计划的修改稿。 责任人:投资部经理。 集团主管领导对该计划进行审核 责任人:集团总经理。 根据领导批准的最终审批计划,利用多种途径,如集团网站、产权交易所挂牌、中介机构等,向社会公布项目信息。 责任人:投资部业务主管。 对反馈回来的信息进行筛选,确定可供进一步谈判的对象。 责任人:投资部业务主管。 经理对谈判对象初步审核。 责任人:投资部经理。 集团主管领导确定谈判对象,并对谈判的框架、权力范围作出指示。 责任人:集团总经理。

在投资部经理的领导牵头下,组成谈判小组进行谈判,谈判的过程中随时将有关情况向领导汇报,并草拟合同,在交集团法律顾问审问后,向集团领导汇报。 责任人:投资部经理。 集团领导掌握谈判的原则及整体进程。 责任人:集团总经理。 投资部负责审定合同、制作合同签约文本。 责任人:投资部经理。 集团领导签约。 责任人:集团总经理 签约后,由投资部牵头执行合同,按合同中规定的各项义务分解到各个部门及子公司,由它们具体执行。 责任人:投资部经理。 投资部负责款项的收取,财务部负责款项的入帐。 责任人:投资部、财务部

py2exe使用方法

py2exe使用方法 一、简介 py2exe是一个将python脚本转换成windows上的可独立执行的可执行程序(*.exe)的工具,这样,你就可以不用装python而在windows系统上运行这个可执行程序。 py2exe已经被用于创建wxPython,Tkinter,Pmw,PyGTK,pygame,win32com client和server,和其它的独立程序。py2exe是发布在开源许可证下的。 二、安装py2exe 从https://www.wendangku.net/doc/338154925.html,/py2exe下载并运行与你所安装的Python对应的py2exe 版本的installer,这将安装py2exe和相应的例子;这些例子被安装在lib\site-packages\py2exe\samples目录下。 三、py2exe的用法 如果你有一个名为helloworld.py的python脚本,你想把它转换为运行在windows上的可执行程序,并运行在没有安装python的windows系统上,那么首先你应写一个用于发布程序的设置脚本例如mysetup.py,在其中的setup函数前插入语句import py2exe 。 mysetup.py示例如下: # mysetup.py from distutils.core import setup import py2exe setup(console=["helloworld.py"]) 然后按下面的方法运行mysetup.py: python mysetup.py py2exe 上面的命令执行后将产生一个名为dist的子目录,其中包含了helloworld.exe,python24.dll,library.zip这些文件。 如果你的helloworld.py脚本中用了已编译的C扩展模块,那么这些模块也会被拷贝在个子目录中,同样,所有的dll文件在运行时都是需要的,除了系统的dll文件。 dist子目录中的文件包含了你的程序所必须的东西,你应将这个子目录中的所有内容一起发布。 默认情况下,py2exe在目录dist下创建以下这些必须的文件: 1、一个或多个exe文件。 2、python##.dll。 3、几个.pyd文件,它们是已编译的扩展名,它们是exe文件所需要的;加上其它的.dll文件,这些.dll是.pyd所需要的。 4、一个library.zip文件,它包含了已编译的纯的python模块如.pyc或.pyo 上面的mysetup.py创建了一个控制台的helloword.exe程序,如果你要创建一个图形用户界的程序,那么你只需要将mysetup.py中的console=["helloworld.py"]替换为windows=["myscript.py"]既可。 py2exe一次能够创建多个exe文件,你需要将这些脚本文件的列表传递给console或windows 的关键字参数。如果你有几个相关联的脚本,那么这是很有用的。 运行下面个命令,将显示py2exe命令的所有命令行标记。 python mysetup.py py2exe --help

Python对Excel操作详解

Python对Excel操作 详解 文档摘要: 本文档主要介绍如何通过python对office excel进行读写操作,使用了xlrd、xlwt 和xlutils模块。另外还演示了如何通过Tcl tcom包对excel操作。 关键字: Python、Excel、xlrd、xlwt、xlutils、TCl、tcom

1Python简介 Python是一种面向对象、直译式电脑编程语言,具有近二十年的发展历史,成熟且稳定。它包含了一组完善而且容易理解的标准库,能够轻松完成很多常见的任务。它的语法简捷和清晰,尽量使用无异义的英语单词,与其它大多数程序设计语言使用大括号不一样,它使用縮进来定义语句块。 与Scheme、Ruby、Perl、Tcl等动态语言一样,Python具备垃圾回收功能,能够自动管理存储器使用。它经常被当作脚本语言用于处理系统管理任务和网络程序编写,然而它也非常适合完成各种高级任务。Python虚拟机本身几乎可以在所有的作业系统中运行。使用一些诸如py2exe、PyPy、PyInstaller之类的工具可以将Python源代码转换成可以脱离Python解释器运行的程序。 2Python安装 Python目前的版本已经更新到3.4.0,本文使用的版本为2.7.5,所有的版本都可以在python官网https://www.wendangku.net/doc/338154925.html,/下载,至于2.x和3.x版本的具体区别也可以在官网查看。 从官网下载了python 2.7.5安装文件python-2.7.5.msi后,直接双击就可以安装python了,可以选择安装路径,我改为C:\Python2.7.5\了,然后一路next就完成安装了,安装完成后在C盘下就多了一个文件夹Python2.7.5。 Python也是一种实时交互语言,可以通过自带的IDLE编写python语句并反馈回显信息,可以通过图1方式调出python IDLE。 图1

引导孩子合理使用电子产品的正确方法

引导孩子合理使用电子产品的正确方法 家长朋友们: 大家好,今天和大家交流的话题是:如何引导孩子合理使用电子产品。这是家长很头痛的问题,也是教育部门高度关注的问题。随着信息时代的发展,电子产品已经走进了千家万户。高科技的生活方式,为我们带来便利的同时,也出现了一些难以应对的问题,尤其是电子产品对青少年学生的冲击较大。今天我主要围绕孩子在使用网络及电子产品时产生的问题与大家做个交流。 一、学生使用手机、电脑等电子产品的现状及危害 (一)学生使用电子产品的现状 生活中常见的电子产品,主要包括:电脑、平板电脑、智能手机、智能手表、电视机、摄像机等等。今后随着数字产业的发展和人们生活需求的提高,还会有更多的电子产品融入我们的生活。电子产品的普及,给我们的生活带来便利的同时,也带来了一些不利的影响。虽然说,很多电子产品的利大于弊,但从不利影响来看,主要是网络、手机等电子产品对自制力差的人群,尤其是青少年学生,产生了较大的危害。 目前中小学生使用频率最高的电子产品就是手机了,其次是电脑。作为家长,我们对这些现象并不陌生:孩子放学一回到家就千方百计的想玩手机,好多孩子周末、假期不喜欢到户外活动,宅在家里玩手机、电脑;一群孩子即使聚集在一起,多数也是在组团打网络游戏;亲子相处,即使同处

一室,多数是拿着手机在各自的虚幻世界里遨游。手机更成为我们教育孩子的重要难题:孩子小的时候,为了哄孩子开心,手机无形中成为电子保姆;稍大一点的孩子,可以把玩电脑、玩手机作为和父母谈判的交换条件,甚至会用生闷气、哭闹、威胁的方式对抗父母。父母明知长时间玩电子产品对孩子的健康和心理发展有害,却束手无策。我就亲眼见到一个孩子因为家住深沟无信号,他周末每天起床很早,坐在沟口桥上玩一天手机,不吃不喝,十分投入。 学校对手机也是屡禁不止。学生偷偷把手机带到学校,上课下课钻空子玩,晚上在宿舍偷着玩;甚至有学生半夜从窗户翻进教师办公室玩通宵;有的三五成群蹲坐在教师办公室窗下蹭wifi;有的在课间打开教室里的多媒体设备玩游戏;有的甚至因为老师的批评而顶撞老师,厌学,逃学……这些现象严重影响了学生的成长和师生关系,成为学校教育的难题之一。 在玩电子产品的时间上,专家则建议:4-6 岁,每天大约20-30分钟,7-10 岁每天大约30-45分钟,11-13 岁每天大约60分钟。而据统计,中小学生手机持有率逐年攀升,目前已达到71.1%,用手机上网比较普遍,且年级越高上网的人数越多。有41.07%学生放学回家后,不是先写作业,而是去用电子产品娱乐放松,有46.43%的学生偶尔会这么做;课堂上使用电子产品的占8.93%,在家庭中使用的占83.93%; 16.07%的玩游戏,25%的是聊天,50%看视频听音乐,学习的只有8.93%,使用时间在一小时内占28.57%,1—2小时的占

公司各部门工作流程.

作业流程 一、整个作业流程: ① 提单 ②签字 ④ ⑤⑧ 签字 ③下工作单 ⑥工作单 ⑦图纸/材料清单 (一式三份) ⑨工作单/图纸/材料清单 ? 领用材料 ⑩清点库存,核对需购买材 ?购买完成 ?制作完成 ?安排车辆出货 ?安装调试完成 ? ? 二、工程部工作流程: 厂长助理 厂长 仓库 生产部 采购 业务助理 业务总经理 工程部 人事部 安装与售后部 客户验收 业务部 财务对账收款

报价方案 材料清单 技指导 技术资料 生产实践 技术指导 安装实践 2.1 工程部出图流程: ⑥审批 ② ③⑦ 签字 ①下工作单 ④下单 ⑤图纸/材料清单,一式三份 ⑤提供材料资料 ⑥ 技术指导和支持 厂长助理 生产部 厂长 工程 部 判定 业务助理 采购部 安装售后部 工程部 采购部 生产部 安装售后部 业务部

三、生产部与各部门联系 出货通知 人力支援 技术支持 领料/成品半成品入库 生产实践反馈 发料/工具 人员配合/成品半成品交期 细分流程: 3.1、车间接单: 签字 工作单/图纸/材料单 NO 询问 YES YES 工程部 安排车间人员 仓库领料 厂长助理 生产部 审核图纸 厂长 工程部 生产部 仓库 人事部 安装售后部

3.2.车间领料 指定领料人按材料清单上的品名、规格、数量去仓库领料,并按仓库规定填写领料单 拿工程材料清单 YSE NO 按单发料 反馈 要求补材料单 补材料单 签字 发材料单 按单发料 指定领料人 仓库 在仓库的工程材料单上 标注领用数量、领用人 拒绝发料 发料 领料人 生产负责人核实 工程出图人员 厂长 厂长助理 仓库 发料 领料 下料、焊接、组装 下料、焊接、组 领料

各种职位说明书招聘工作流程

各种职位说明书招聘工 作流程 Document number【980KGB-6898YT-769T8CB-246UT-18GG08】

招聘工作流程 总体原则: 招聘员工本着以用人所长、容人所短、追求业绩、鼓励进步为宗旨;以面向社会,公开招聘、全面考核、择优录用为原则,从学识、品德、能力、经验、体格、符合岗位要求等方面进行全面审核。 招聘流程: 1.提交需求 各部门根据用人需求情况,由部门经理填写《招聘申请表》,报主管经理、总经理批准后,交人力资源部。由人力资源部统一组织招聘。 2.材料准备 人力资源部根据招聘需求,准备以下材料: (1)招聘广告。招聘广告包括本企业的基本情况、招聘岗位、应聘人员的基本条件、报名方式、报名时间、地点、报名需带的证件、材料以及其他注意事项。 (2)公司宣传资料。发给通过初试的人员。 3.选择招聘渠道 渠道主要有三种:参加人才交流会、人才交流中心介绍、刊登报纸广告。 4.填写登记表 应聘人员带本人简历及各种证件复印件来公司填写《应聘人员登记表》。《应聘人员登记表》和应聘人员资料由人力资源部保管。 5.初步筛选 人力资源部对应聘人员资料进行整理、分类,定期交给各主管经理。主管经理根据资料对应聘人员进行初步筛选,确定面试人选,填写《面试通知》。主管经理将应聘人员资料及《面试通知》送交人力资源部,人力资源部通知面试人员。 6.初试 初试一般由主管经理主持,主管经理也可委托他人主持。人力资源部负责面试场所的布置,在面试前将面试人员资料送交主持人;面试时,人力资源部负责应聘人员的引导工作。主持人在面试前要填写《面

试人员测评表》,特别注意填写"测评内容"的具体项目。主持人应将通过面试人员介绍至人力资源部,由人力资源部人员讲解待遇问题、赠送公司宣传资料。面试结束后,主持人将《面试人员测评表》及应聘人员资料交至人力资源部。通过初试并不代表一定被公司录用。 7.复试 通过初试的人员是否需要参加复试,由主管经理决定。一般情况下,非主管经理主持的初试,通过初试的面试者都应参加复试。复试原则上由主管经理主持,一般不得委托他人。复试的程序与初试的程序相同。

使用 PYTHON 开发 WINDOWS 桌面程序

使用python 开发windows 应用程序 本人以前一直用的是C++,MFC,毕业到了公司以后,公司用python做流程,我 顺便最近研究了一下用python开发windows 应用程序的整个流程,大体如下: 一、开发前期准备 1.boa-constructor-0.6.1.bin.setup.exe #一个wxWidges 的集成开发环境,简单如Delphi,可以直接拖拽控件,并且和其他集成环境不一样, #它不与集成开发环境的MainLoop冲突,用pythonwin,pyScripter都会冲突,典型 报错就是运行第二次 #程序的时候,直接导致 集成开发环境的强制退出,因为MainLoop冲突了 2.wxPython2.8-win32-unicode-2.8.10.1-py26.exe #wxPython库,提供了用C++写的 windows 组件库wx 3.py2exe-0.6.9.win32-py2.6.exe #打包发布工具,将python写的windows 程序或控 制台程序直接打包成exe 可执行文件,供用户使用 上述三个软件都是基于python2.6的,软件版本一定要配套,因为他们默认的安装路径和python版本有关系,否则会找不到相关库的存在。 二、开发 软件安装完以后,打开BOA,哇塞,拖控件真简单,而且属性啥的和Dephi差 不多,你只要改改属性,代码会自动生成,它生成的控件很漂亮,记得以前用C++6.0开发软件的时候,那个控件真丑,都需要我重新用控件库去绑定优化, 现在不用了~BOA生成的控件,视觉效果相当好~开发软件速度相当快,再也 不用为了软件界面而写太多代码,也不用为了生成一个小程序而生成了很多的 文件,python开发的程序,没有多余的文件,而且文件很小。 三、发布 很多人都想在自己的软件程序写好以后,发布给其他人使用,一方面不希望自 己的代码泄露,一方面以此显出一点成就感,呵呵,可以使用py2exe将你的windows 程序打包发布了!当然,首先你得写个如下的setup.py文件: 代码 1 from distutils.core import setup 2 import py2exe 3 includes = ["encodings", "encodings.*"] 4 options = {"py2exe": 5 { "compressed": 1, 6 "optimize": 2, 7 "includes": includes, 8 "bundle_files": 1 9 } 10 } 11 setup( 12 version = "0.1.0",

学会正确使用语言的方法

学会正确使用语言的方法 根据"通顺"和"文采"的要求,我们在选择和使用语言时,要注意以下一些问题: ⒈要学会锤炼语言 经过锤炼的语言是被认真筛选并确定的语言,只有这样的语言才能达到“准”、“美”、“生动”的标准。 锤炼语言范围要广,涉及到词语、句子和句群。 在词语的锤炼上要注意同义词词义的细微差别、感情色彩以及语境的要求。写文章首先要选用最能反映事物本质特征的那一个词语,使用词恰当,鲜明生动,富于变化,增添文章的文采。如大家熟悉的鲁迅小说《孔乙己》中的“窃书不算偷”,不用“偷书”而用“窃书”,正是孔乙巳身份和性格的体现,深刻揭示了人物形象。 选用恰当而富有表现力的动词、形容词,力求准确传神。如果平淡无味,只是枯燥地叙述一件事或几件事,就不能给人以艺术美的享受。下面的几个例子就非常传神。 “不必说碧绿的菜畦,光滑的石井栏,高大的皂荚树,紫红的桑枯;也不必说鸣蝉在树叶里长吟,肥胖的黄蜂伏在菜花上,轻捷的叫天子忽然从草间直窜上云霄里去了。” “爷爷站成一轮弯弯的月亮,目送着孙子远去” 在句子的锤炼上,要达到结构完整。一个完整的句子不仅要能够回答“谁,干什么”或“什么,怎么样”,还要能够回答“什么时候,谁,在什么地方,干什么,怎样干”或“什么时候,什么,在什么地方,干什么,怎样干”。 内容要具体生动。例如,同样用到“抚摸”,下面的句子一句比一句生动: ①朝阳抚摸着土地。 ②朝阳柔和地抚摸着土地。 ③深秋的早晨,朝阳柔和地抚摸着一望无际的土地。 ④深秋的早晨;在辽阔的北方平原上,薄薄的雾气正馒馒散去,朝阴柔和地抚摸着一望无际的土地。 角色也要富于变换。同一个词语,可以从不同的角度,按不同的语序来造句,产生不同的意义: ①隋朝大运河依旧拍打着干年的堤岸。 ②隋朝的大运河拍打着堤岸,干年依旧。 ③干年的堤岸,隋朝大运河依旧拍打着。 ④干年依陌,隋朝的大运河拍打着堤岸。。 2.选择生动的词语 语言的生动性,往往是与形象性紧密相连、不可分割的,就如同形与影一样。形象化的语言,它能调动读者的形象思维,引起读者丰富的想像与联想,能给人一种如临其境、如见其物、如闻其声的感觉。苏联作家阿?托尔斯泰曾经指出:语言艺术中最重要的是动词。因为全部生活都是运动的,大凡运动的东西,往往最富有感人的魅力。古人讲究炼字,在许多情况下,是讲究动词的锤炼。例如,“僧敲月下门”中的“敲”、“春风又绿江南岸”中的“绿”、“红杏枝头春意闹”中的“闹”,都是几经斟酌、反复修改才定下来的。由于这几个词用得生动恰当、具有立体感,才使得作品成为千古流传的佳篇。 动词的锤炼一般有下面三个要求: 第一,所使用的动词,必须是唯一准确的动词。 在世界的语言宝库中,无论哪一种语言,描写某一动作的动词,最准确的往往只有一个。在写作时,找到了这个唯一准确的动词,对人物动作的描写,才具有独特性,才最富于表现力和感染力。 ①夏季的豆荚长满门的四周。

UVB使用方法与详解

UVB使用方法与详解 1.使用剂量 具体操作步骤:先用几天每天一次照射来找到每个人的亚红斑量剂量,方 法是第一次每个部位都先照射60秒左右,脸可以40开始,照射后并等第2天是皮肤反应的时候,如果皮肤不红就递增10到20秒,第二天再看皮肤反应直到能出现红润色皮肤症状就是你需要的治疗时间,基本上以后就是红——几天后红消退后照射——第2天红——几天后红消退后循环照射的治疗过程了,具体治疗中还需要注意细节,请自己看以下说明。 当找到能红的时间就进入治疗期,第一次使用的时候,必须从最小的能红 的量使用,然后逐渐增大;一周三次就足够了。但是,这里有一个重要的细节要指出:绝对不是每次都一定要比上次增加一个单位量(10秒左右)。是否增加,完全取决于你的皮肤的承受力。那么如何判断皮肤是否需要加量了呢。 一般来说,正常的、有效的照射后,皮肤的感受是“在照射后8个小时到 一天开始微微发痒,皮肤有点微红”(注意,都是“微”,而不是很痒,很红)。当你是这种感觉的时候,表明你的皮肤对于当前量是能够承受的,并且是有反 应的。因此,当你等2到3天后红消退第二次使用的时候,仍然保持这个量,而不要加量。如果你下次皮肤在照射以后,仍然微微发痒,有点微红,那么说 明依然有效,你第三次还应该坚持这个量。如果这次皮肤没有反应了,即不痒 不红,那么就说明量不够了;那么第三次就应该增加一个单位的使用量。用量

逐渐增加,假如长期好几个月治疗甚至半年后可能增加到好几分钟甚至15-20 分钟的时候,就不要再增加了,因为按照临床大夫来说,这是上限了。当然这 个15到20分钟是说的极限,是最大量,假如长期能在几十秒、几分钟内能每次正常反应是不会使用到最大量的。注意牛皮癣每次用时间比白癜风要多的多,可以80起步,每次加30秒,以皮肤红,有点疼为准。 假如不小心没有把握好照多了时间起泡也不要紧,很快会恢复,这就是有 些病人理解的光疗不好控制,容易起泡的说法,其实仅仅是医院里按死板的方 法加上去不考虑皮肤的耐力。从红到起泡还有一个时间跨度缓冲时间段,所以 按标准来治疗不会产生照射过量的问题,万一自己照多了可以摸点红霉素软膏,照多了起泡也不是大问题,有些机构还故意让起泡,来加快色素的生成,只是 绝大部分人不能忍受这个过程。照射的每次稍微红和很红到起泡都有效果,起 泡后生成色素快点,但是不让皮肤起泡总效果是一样的。 连续照射多次后会产生掉皮现象是正常的,掉皮后可能需要减一个数量级,牛皮癣可以不减少量。当你感觉一个阶段内每次照射后皮肤反应比较足就可以 适当在随后的几次照射减少治疗频率让两次照射间隔时间长点,目的给皮肤一 个恢复的过程,然后再治疗频率再密集点,然后再减少,让皮肤在中间产生一 个恢复的机会。使用过程中出现了治疗中断。比如出差,中断了2个星期。此时,当你继续治疗的时候,必须适度减量。因为停止使用一段时间会导致皮肤 的耐受能力下降,如果还保持中断前的量,可能会导致皮肤无法承受而受到损

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