takara 双酶切表

Note:

1) It is confirmed that 10 units of each enzyme completely digest 1 μg of DNA at 37°C in one hour in 50 μl reaction mixture.

2) The concentration of Glycerol should be less than 10% to minimize star activity.

3) DNA may not be digested completely, when recognition sequences of two enzymes are close each other, or when DNA takes high-structure conformation.

反应体系（20ul）：

10* M Buffer 2ul

质粒T-5.3kb Gt13ul XbaⅠ、HindⅢ各0.5ul（7.5U）无菌水14ul 37℃水浴保温2h

生物安全柜使用操作步骤

生物安全柜的使用制度 1、在做保养前，应先切断电源。 2、由于对操作时间的统计直接影响对维护需要的判断，因此在使用此柜时应备有 操作时间的详细记录以备参考和查询。 3、表面的清洁： 非工作区的不锈钢：用浸泡在浓缩肥皂液中的柔软毛巾清洁表面，然后用浸泡在干净的热水或温水中的另一块棉布或毛巾擦净工作区的不锈钢：使用医用 酒精擦净。禁止使用强氧化性的试剂或溶液。 外部涂层：任一种非研磨的家庭用清洁剂，使用柔软的棉布或毛巾擦净。 4、在使用过程中每日清洁： 1）消毒和清洗操作区 2）对控制面板进行消毒 3）用柔软的清洁剂或玻璃专用清洁剂清洗箱体外表面和玻璃 4）对设备的各种功能进行检查 5) 将本次工作记录在案 5、每月清洗： 1）用清洗剂将所有外表面的尘埃消除， 2)对设备的工作台面 内壁表面、观察窗内面应以75﹪酒精擦拭。 3）将本次清洗记录在案 6 每年维护： 1）检查前玻璃门驱动装置的松紧度 2）检查紫外线灯管和荧光灯管 3）每年申请厂家对安全柜的整体性能检测 4）将本次维护记录在案。

生物安全柜使用操作步骤 准备工作： 1、物品准备： ⑴操作人员防护用品：无粉乳胶手套及聚氯乙烯手套各1副，一次性防渗透防护衣1件，一次性口罩、帽子（有条件者备N95口罩）、防护镜等； ⑵治疗盘：常规消毒用物1套，无菌纱布、棉球； ⑶一次性注射器、一次性防渗透防护垫、防渗透专用污物袋； ⑷根据医嘱备化疗药物、输液袋等。 2、人员准备：洗手，佩戴一次性口罩、帽子、更鞋，换工作服，外套一次性防渗透防护衣；配药时带双层手套，即：聚氯乙烯手套外戴1副无粉乳胶手套。 操作流程： 1、配药前洗手，穿防渗透护服，佩戴口罩，帽子，带聚氯乙烯手套，其外套一副乳胶手套。 2、配药前启动紫外线灯进行生物安全柜内操作空气消毒30分钟，并在操作前用75%究竟擦拭柜内面及台面，保持洁净的备药环境，柜内操作台面铺一次性防渗防护垫，减少药液污染。 3、取合适的注射器及注射针并检查 4、再次查对医嘱及治疗卡 5、割据安剖前应轻弹其颈部，使附着的药粉降至瓶底，打开安剖时应垫一纱布，以防划破手套。瓶装药物稀释及抽取药液时，应插入双针头以排除瓶内压力,防止针栓脱出造成污染。并且要求在抽取药液后, 瓶内进行排气和排液后再拔针, 不可使药液排于空气中。加药时将化疗药加入瓶装液体后应抽尽瓶内空气, 避免瓶内压力过大导致更换液体时药液外溢。 6、抽取药液时可选用一次性注射器，并注意抽取药液以不超过注射器容量的3 /4为宜。抽取药液后放以垫有聚乙烯薄膜的无菌盘内备用，每次用后按污物处理。 7、再次查对 8、完成配置后，保持安全柜运行5--10分钟，使飞散的气溶胶完全附着到过滤器上，关闭。再用75%酒精擦拭操作台面。 9、整理用物，操作中使用的注射器、输液器、输液袋、敷料及放置化疗药物的安瓿等物品应放在专用的塑料袋内集中封闭处理, 以免药液蒸发污

生物安全柜标准操作规程

1. 目的: 规范生物安全柜的操作与维护保养工作，确保设备的正常运作，以保障操作人员的安全。 2. 范围: 无菌实验室阳性间菌检员使用的BHC-1300A2生物安全柜。 3．职责：菌检员负责设备的正常操作与维护保养，由质量部经理复核相关文件记录。 4. 内容 4.1 安全柜应放置于十万级以下的初级净化间。操作前应打开紫外灯，照射30min，后将本次操作所需的全部物品移入安全柜，避免双臂频繁穿过气幕破坏气流；并且在移入前用75%酒精擦拭物品表面消毒，以去除污染。 4.2 打开风机10min，待柜内空气净化并气流稳定后再进行实验操作。将双臂缓缓伸入安全柜内，至少静止2min，使柜内气流稳定后再进行操作。 4.3 生物安全柜内不放与本次实验无关的物品。物品应尽量靠后放置，不得挡住气道口，以免干扰气流正常流动。 4.4 操作时应避免交叉污染。为防止可能溅出的液滴，应准备好75%的酒精棉球或用消毒剂浸泡的小块纱布，避免用物品覆盖住安全柜的格栅。 4.5 在实验操作时，不可完全打开玻璃视窗，应保证操作人员的脸部在工作窗口之上。在柜内操作时动作应轻柔、舒缓，防止影响柜内气流。 4.6 安全柜应定期进行检测与保养，以保证其正常工作。工作中一旦发现安全柜工作异常，应立即停止工作，采取相应处理措施，并通知质量部经理。 4.7 检验完成后，关闭玻璃视窗，保持风机继续运转10min，同时打开紫外灯，照射30min。 4.8 安全柜应定期进行清洁消毒，可用75%酒精或0.2%新洁尔灭溶液擦拭工作台面及柜体外表面；每次检验工作完成后应全面消毒。 4.9 柜内使用的物品应在消毒缸消毒后再取出，以防止将标准菌株残留带出而污染环境，造成生物危害。 4.10 使用方法： 4.10.1 安全柜采用LED液晶面板控制，控制面板包括的功能键有：电源开关键、杀菌灯键、风挡键（快速、慢速、无风）、照明键。 4.10.2 插上220V交流电源后，按下控制面板上的所示电源开关开启即可使用；需要灭菌时，按灭菌灯键；风挡键有三级（快速、慢速、无风）循环，默认为无风，按一次为慢速，再按为快速，第三次则回到无风，如此循环；平时操作照明，只需按照明键即可。 5.设备的维护保养 5.1 每次检验操作后用75%的酒精（其他杀菌剂视用户使用的材料而定）彻底对安全柜内部工作区域表面、侧壁、后壁、窗户进行表面净化。切勿使用含有氯的杀菌剂，因为它可能对安全柜的不锈钢结构造成损坏。同时对紫外灯和电源输出口表面进行清洁。当清洁安全柜内部区域时，操作人员除了手放以外，身体的其他任何部位不能进入安全柜。 5.2 长时间未实验时也得每两周进行清洁维护，按5.1进行，定期清洁不锈钢表面会使之保持表面的光滑美观。 5.3 每月用湿布对安全柜外部表面进行擦拭，尤其是安全柜的前面和上部，把堆积的灰尘打扫干净。并检查所有的维护配件的合理使用情况。 5.4 根据实际情况，每个季度或者半年检查安全柜的任何物理异常或故障，如有异常及时报修；将初效过滤器拆下清洗，防止积尘将导致进风量不足，而降低洁净效果。 5.5 每年请具备资格的认证技术人员对安全柜进行性能认证，依据紫外灯使用寿命效果，进行紫外灯的更换；当正常调节或清洗初效空气过滤器后，仍达不到理想的截面风速时，则应调节风机的工作电压（旋动旋钮），从而达到理想的均匀风速（将调节风速旋钮从左向右，从低速向高速缓慢调节，新工作台不应调至最高风速）。 5.6 在使用十八个月后当风机工作电压调整至最高点时，仍不能达到理想风速时，则说明高效空气过滤器积尘过多（滤料上滤孔已基本被堵，要及时更新），一般高效空气过滤器的使用期限为十八个月；更换高效空气过滤器时，应注意型号规格尺寸（原生产厂家配置），按箭头风向装置，并注意过滤器的周边密封，绝对无渗漏现象发生。

如何添加酶切位点

当在引物5’端添加酶切位点时要考虑： a)该目的序列内部不得含有相同的酶切位点，在引物发出后才发现错误的事情本人就干过，在论坛上也能看到这样的粗心人。这样的错误会给将来的克隆造成麻烦。 b)如果打算PCR 后直接酶切，不要忘了在酶切位点的外侧再加上保护碱基，不同的酶对于保护碱基的要求是不同的。 如果不设计保护碱基，则多半要用TA 克隆的方式连接到质粒上，这时要注意Taq 酶的选择，若想在目的序列上附加上并不存在的序列，如限制位点和启动子序列，可以加入到引物5'端而不影响特异性。 当计算引物Tm 值时并不包括这些序列，但是应该对其进行互补性和内部二级结构的检测。PCR设计引物时酶切位点的保护? ?酶寡核苷酸序列切割率%?2 hr20 hr?Acc IGGTCGACC CGGTCGACCG CCGGTCGACCGG 0 00 0?Afl IIICACATGTG CCACATGTGG CCCACATGTGGG0 >90 >900 >90 >90?Asc IGGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA>90 >90 >90>90 >90 >90?Ava ICCCCGGGG CCCCCGGGGG TCCCCCGGGGGA50 >90 >90>90 >90 >90?BamH ICGGATCCG CGGGATCCCG CGCGGATCCGCG10 >90 >9025 >90 >90?Bgl IICAGATCTG GAAGATCTTC GGAAGATCTTCC0 75

>90 >90?BssH IIGGCGCGCC AGGCGCGCCT TTGGCGCGCCAA0 500 >90?BstE IIGGGT(A/T)ACCC010?BstX IAACTGCAGAACCAATGCATTGG AAAACTGCAGCCAATGCATTGGAA CTGCAGAACCAATGCATTGGATGCAT0 25 250 50 >90?Cla ICATCGATG GATCGATC CCATCGATGG CCCATCGATGGG0 >90 500 >90 50?EcoR IGGAATTCC CGGAATTCCG CCGGAATTCCGG>90 >90 >90>90 >90 >90?Hae IIIGGGGCCCC AGCGGCCGCT TTGCGGCCGCAA>90 >90 >90>90 >90 >90?Hind IIICAAGCTTG CCAAGCTTGG CCCAAGCTTGGG0 100 75?Kpn IGGGTACCC GGGGTACCCC CGGGGTACCCCG0

常用限制性内切酶酶切位点保护残基

酶切位点保护碱基-PCR引物设计用于限制性内切酶 发布: 2010-05-24 20:19| 来源:生物吧| 编辑:刘浩| 查看: 161 次 本文给出了分子克隆中常用限制性内切酶的保护碱基序列，如AccI，AflIII，AscI，AvaI，BamHI，BglII，BssHII，BstEII，BstXI，ClaI，EcoRI，HaeIII，HindIII，KpnI，MluI，NcoI，NdeI，NheI，NotI，NsiI，PacI，PmeI，PstI，PvuI，SacI，SacII，SalI，ScaI，SmaI，SpeI，SphI，StuI，XbaI，XhoI，XmaI， 为什么要添加保护碱基？ 在分子克隆实验中，有时我们会在待扩增的目的基因片段两端加上特定的酶切位点，用于后续的酶切和连接反应。由于直接暴露在末端的酶切位点不容易直接被限制性核酸内切酶切开，因此在设计PCR引物时，人为的在酶切位点序列的5‘端外侧添加额外的碱基序列，即保护碱基，用来提高将来酶切时的活性。 其次，在分子克隆实验中选择载体的酶切位点时，相临的两个酶切位点往往不能同时使用，因为一个位点切割后留下的碱基过少以至于影响旁边的酶切位点切割。 该如何添加保护碱基？ 添加保护碱基时，最关心的应该是保护碱基的数目，而不是种类。什么样的酶切位点，添加几个保护碱基，是有数据可以参考的。 添加什么保护碱基，如果严格点，是根据两条引物的Tm值和各引物的碱基分布及GC含量。如果某条引物Tm值偏小，GC%较低，添加时多加G或C，反之亦反。 为了解不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求，NEB采用了一系列含识别序列的短双链寡核苷酸作为酶切底物进行实验。实验结果对于确定双酶切顺序将会有帮助（比如在多接头上切割位点很接近时），或者当切割位点靠近DNA末端时也很有用。在本表中没有列出的酶，则通常需在识别位点两端至少加上6个保护碱基，以确保酶切反应的进行。 实验方法：用γ-[32P]ATP在T4多聚核苷酸激酶的作用下标记0.1A260单位的寡核苷酸。取1μg已标记了的寡核苷酸与20单位的内切酶，在20°C条件下分别反应2小时和20小时。反应缓冲液含70mM Tris-HCl (pH 7.6), 10 mM MgCl2, 5 mMDTT及适量的NaCl或KCl（视酶的具体要求而定）。20%的PAGE（7M尿素）凝胶电泳分析，经放射自显影确定酶切百分率。 本实验采用自连接的寡核苷酸作为对照。若底物有较长的回文结构，切割效率则可能因为出现发夹结构而降低。

常用限制性内切酶酶切位点

AatII 识别位点 Acc65I 识别位点 AccI 识别位点 AciI 识别位点 AclI 识别位点 AcuI 识别位点 AfeI 识别位点 AflII 识别位点 AflIII 识别位点 AgeI 识别位点 AhdI 识别位点 AleI 识别位点 AluI 识别位点 AlwI 识别位点 AlwNI 识别位点 ApaI 识别位点 ApaLI 识别位点 ApeKI 识别位点 ApoI 识别位点 AscI 识别位点 AseI 识别位点 AsiSI 识别位点

AvaI识别位点 AvaII识别位点 AvrII识别位点 BaeI识别位点 BamHI 识别位点 BanI识别位点 BanII识别位点 BbsI识别位点 BbvCI识别位点 BbvI识别位点 BccI识别位点 BceAI识别位点BcgI识别位点BciVI识别位点BclI识别位点 BfaI识别位点BfuAI识别位点BglI识别位点BglII识别位点BlpI识别位点Bme1580I识别位点BmgBI识别位点BmrI识别位点

BmtI 识别位点 BpmI 识别位点 Bpu10I 识别位点 BpuEI 识别位点 BsaAI 识别位点 BsaBI 识别位点 BsaHI 识别位点 BsaI 识别位点 BsaJI 识别位点 BsaWI 识别位点 BsaXI 识别位点 BseRI 识别位点 BseYI 识别位点 BsgI 识别位点 BsiEI 识别位点 BsiHKAI 识别位点 BsiWI 识别位点 BslI 识别位点 BsmAI 识别位点 BsmBI 识别位点 BsmFI 识别位点 BsmI 识别位点

各种酶切位点的保护碱基(引物设计必看)

各种酶切位点的保护碱基 酶不同，所需要的酶切位点的保护碱基的数量也不同。一般情况下，在酶切位点以外多出3个碱基即可满足几乎所有限制酶的酶切要求。在资料上查不到的，我们一般都随便加3个碱基做保护。 寡核苷酸近末端位点的酶切 (Cleavage Close to the End of DNA Fragments (oligonucleotides) 为了解不同内切酶对识别位点以外最少保护碱基数目的要求，NEB采用了一系列含识别序列的短双链寡核苷酸作为酶切底物进行实验。实验结果对于确定双酶切顺序将会有帮助（比如在多接头上切割位点很接近时），或者当切割位点靠近DNA末端时也很有用。在本表中没有列出的酶，则通常需在识别位点两端至少加上6个保护碱基，以确保酶切反应的进行。 实验方法：用γ-[32P]ATP在T4多聚核苷酸激酶的作用下标记0.1A260单位的寡核苷酸。取1 μg 已标记了的寡核苷酸与20单位的内切酶，在20°C条件下分别反应2小时和20小时。反应缓冲液含70 mM Tris-HCl (pH 7.6), 10 mM MgCl2 , 5 mM DTT及适量的NaCl或KCl（视酶的具体要求而定）。20%的PAGE（7 M尿素）凝胶电泳分析，经放射自显影确定酶切百分率。 本实验采用自连接的寡核苷酸作为对照。若底物有较长的回文结构，切割效率则可能因为出现发夹结构而降低。

2.双酶切的问题 参看目录，选择共同的buffer。其实，双酶切选哪种buffer是实验的结果，takara公司从1979年开始生产限制酶以来，做了大量的基础实验，也积累了很多经验，目录中所推荐的双酶切buffer 完全是依据具体实验结果得到的。 有共同buffer的，通常按照常规的酶切体系，在37℃进行同步酶切。但BamH I在37℃下有时表现出star活性，常用30℃单切。 两个酶切位点相邻或没有共同buffer的，通常单切，即先做一种酶切，乙醇沉淀，再做另一种酶

酶切位点设计和选择

引物设计原则及酶切位点选择和设计 [整理]：最初的时候，由于害怕设计酶切位点最后且不开，所以经常采用最通用的方法，用T载体克隆解决问题，但后来发现她也有问题，就是浓度提不上去，你需要体大量的载体来酶切，所以感到还是直接扩增好一点。但这就需要你仔细设计引物。连入质粒中的重要目的就是进行酶切和连接，当然首先就是在想要合成或者是进行PCR扩增出靶基因的时候在核酸的两端接入酶切位点，酶切位点是与你的质粒的特点相关的，可以在质粒的图谱说明书上找取相应的位点，进行设计。 （一）设计引物前应做的准备工作： 准备载体图谱，大致准备把片断插在那个部分 对片断进行酶切分析，确定一下那些酶切位点不能用 准备一本所买公司的酶的商品目录，便于查酶的各种数据及两种酶是否可以配用 （二）设计引物所要考虑的问题 两个位点应是载体上的，，所连接片断上没有这两个位点，且距离不能太近，往往导致两个酶都切不好。因此，紧挨在一起，只能切一个，除非恰好是与上面两个酶在一起的酶切位点。我看promega的说明书上说，最好隔四个。还有一种情况是：不能有碱基的交叉，比如AGATCTTAAG，这样的位点比较难切。 两个酶切点最好不要是同尾酶（切下来的残基不要互补），否则效果相当于单酶切。 最好使用酶切效率高的。 最好使用双酶切有共同buffer的酶。 最好使用较常用的酶（如hind3，bamh1，ecor1等），最好使用自己实验室有的酶，这样可以省钱。 Tm的计算，关于Tm的问题，很多的战友都有疑惑。其实园子里有很多的解释了。 Tm叫溶解温度（melting temperature, Tm），即是DNA双链溶解所需的温度。大家可以理解，这个温度是由互补的DNA区域决定的，而不互补的区域对DNA的溶解是没有作用的。因此，对于引物的Tm，只有和模板互补的区域对Tm才有贡献。计算Tm时，只计算互补的区域（除非你的酶切位点也与模板互补）。不少战友设计的引物都Tm过低，是因为他们误把保护碱基和酶切位点都计算到Tm里了，最后的结果是导致了PCR反应的诸多困难。所以，设计引物的时候，先不管5'端的修饰序列，把互补区的Tm控制在55度以上（我喜欢控制在58以上，具体根据PCR的具体情况，对于困难的PCR，需要适当提高Tm），再加上酶切位点和保护碱基，这样的引物通常都是可用的，即使有小的问题，也可以挽回。Tm温度高的引物就比较容易克服3‘发卡、二聚体及3'非特异结合等问题。简单的计算公式可以用2+4的公式。若你计算的Tm值达到了快90 ，不包括酶切位点。引物公司给你发的单子是包括酶切位点的。自己可以再估计一下。如你设计了带酶切位点的引物，总长分别为29、33个碱基，去掉酶切位点和保护碱基，分别为17、21个碱基。引物公司给的单子是70多度，实际用的只有50度，用55度扩的结果也差不多。 其它关于Tm值的计算，有用PP5.0进行评价的，需要考虑的参数包括：base number、GC%、Tm、hairpin、dimer、false priming、cross dimer。退一般退火温度为Tm-5度，退火温度的计算可以不把加入的酶切位点及保护碱基考虑进去，如上所言，PCR几个循环后，引物外侧的序列已经参入了扩增片断中，所以你可以在预变性后多加几步，温度比你Tm值低些（这样可能会增加非特异性），Tm值是你包括酶切位点及保护碱基的Primer计算出来的。1.一般在5'端加保护碱基,如果你扩增后把目的条带做胶回收转入T-VECTOR或者其它的载体的话,酶切时可以不需加保护碱基2.有人的经验加入酶切位点的引物可以和未加入时使用相同的退火温度,结果也还是令人满意。

生物安全柜使用与维护作业指导书

1 目的 建立确保正确使用生物安全柜，特规范生物安全柜的使用方法。 2 范围 适用于生物安全柜的操作。 3 责任人 生物安全柜操作人员。 4 内容 4.1工作原理 安全柜在运行中，通过一台外置外排风机所排出的空气所形成箱内负压，从室内吸入部分空气进入操作区前格栅，从而在安全柜操作口形成一个流速大于0.5m/s的气幕（理论或实测值），同时在安全柜内置送风风机的驱动下，从安全柜顶部进风口吸进的实验室内（或室外）的空气，通过送风过滤器过滤后形成垂直下降的洁净气流。从上向下的垂直气流在接近工作台面时，在外排风机的作用下分成前后二路进入底部负压风道，与从工作台开口面进入的气流混合后，经排风过滤器过滤后，通过管道排到室外。这样就形成了B2型安全柜运行时的完整气流模式，保证了安全柜的运行。 4.2操作步骤 4.2.1准备 4.2.1.1按实验室等级要求穿戴好防护服、头盔、口罩、眼罩、手套等个人防护品； 4.2.1.2工作之前，生物安全柜的工作台面、内壁表面、观察窗内面应以70%浓度的乙醇擦拭，再用无菌水再擦拭一遍清除残余的氯，减小实验时的交叉感染； 4.2.1.3将电源插头插入固定插座后，将前窗操作口开启到200mm高度，首先应启动外排风机，在风机运转稳定后再启动安全柜风机，应使安全柜的风机至少运行3～5min以净化安全柜内空气，工作之前，应按实验所需物品清单先将实验材料置于安全柜内，并将工作椅高度调整到确保自己的脸部在工作窗开口之上，并使自己的手

臂操作时保持适宜位置； 4.2.1.4开始工作前应关闭工作台下方的排水阀，这样，当有溢溅发生时，污染物就不会逸出安全柜外。 4.2.2操作 4.2.2.1操作开始时，应使手缓慢进入工作室，同时要注意手臂进入操作口后，应让流入气流流过手臂约一分钟后开始操作，这样能保持气流的稳定； 4.2.2.1操作应在操作台面上距进风格栅100mm距离内进行； 4.2.2.1为减少操作中的溢洒和气溶胶的产生，应严格执行生物安全操作规程 4.2.2.2操作中应避免使用明火，保持操作室正常气流流态； 4.2.2.3操作结束后，所有物品从安全柜内取出前，必须进行表面除污消毒，取出工作室内物品后，应对工作室内壁四周用消毒剂进行消毒灭菌。 4.2.3结束 4.2.3.1在确认所有内壁已消毒完毕且已干燥后，建议让安全柜继续运行3～5min，以便净化柜内气体； 4.2.3.2关闭灯、风机，关闭前窗； 4.2.3.3按规定处理污染物品和搬移实验材料 4.3日常维护保养 4.3.1实验室应编制日常使用保养计划，每次的操作后保养，均应有记录； 4.3.2每次操作前和操作后，都应对操作区作清洁消毒，以确保安全柜的正常使用； 4.3.3操作中若发生喷溅，应及时用吸水纸巾清除，放入生物危险灭菌袋内，大量的喷溅可按实验室已编制的危害处理程序处理(如用消毒液浸泡、冲洗等)。清理应在安全柜运行状态中进行； 4.3.4紫外线灯应每周进行表面清洁，以保证紫外线幅照的强度； 4.3.5安全柜在安装和使用一定周期后，应按法定程序对安全柜的整体运行性能进行确认，这种工作应有资质的专业机构或专业人员进行。 4.4故障处理 4.4.1故障判断与处理

常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)

The Type II restriction systems typically contain individual restriction enzymes and modification enzymes encoded by separate genes. The Type II restriction enzymes typically recognize specific DNA sequences and cleave at constant positions at or close to that sequence to produce 5-phosphates and 3-hydroxyls. Usually they require Mg 2+ ions as a cofactor, although some have more exotic requirements. The methyltransferases usually recognize the same sequence although some are more promiscuous. Three types of DNA methyltransferases have been found as part of Type II R-M systems forming either C5-methylcytosine, N4-methylcytosine or N6-methyladenine. ApaI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5'GGGCC^C 3' BamHI（类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' G^GATCC 3' BglII （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' A^GATCT 3' EcoRI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' G^AATTC 3' HindIII （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' A^AGCTT 3' KpnI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' GGTAC^C 3' NcoI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' C^CATGG 3' NdeI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' CA^TATG 3' NheI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' G^CTAGC 3' NotI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' GC^GGCCGC 3' SacI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' GAGCT^C 3' SalI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' G^TCGAC 3' SphI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' GCATG^C 3' XbaI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' T^CTAGA 3' XhoI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' C^TCGAG 3' 当然，上面总结的这些肯定不全，要查找更多内切酶的识别序列，你还可以选择下面几种方法： 1. 查你所使用的内切酶的公司的目录或者网站；NEB网站上提供的识别序列图表下载 2. 用软件如：Primer Premier5.0或Bioedit等，这些软件均提供了内切酶识别序列的信息；

海尔生物安全柜操作规程

海尔生物安全柜操作规程 1. 目的 为了规范海尔生物安全柜使用与维护，保证仪器正常运行，确保设备、环境、人员和血液的安全，建立本操作规程。 2. 范围 2.1适用于海尔生物安全柜使用及维护。 3. 职责 3.1检验科工作人员严格遵守本操作规程对核酸标本试管开盖、平衡温度以及对仪器进行使用维护，并填写《重点设备运行、保养记录》。 3.2 实验室负责人负责仪器的综合管理。 4. 环境要求 温度：18℃-25℃，湿度：30%-80% 5. 操作方法 5.1接通电源。 5.2抬高前窗玻璃，使玻璃门体下沿对正门高标志线（红点处）。 5.3安全柜自洁净运转，直至“please wait”消失。 5.4清洁安全柜工作台和内壁。 5.5实验操作。 5.6取出全部实验物品。 5.7安全柜自运行3分钟。 5.8清洁安全柜工作台和内壁。 5.9关闭前窗玻璃，将门体拉至最底部。 5.10切断电源。 6紫外灯设定步骤 6.1连续按“↑”或“↓”键，直至出现紫外灯设置页面。 6.2按动“设置”键，指示灯亮。 6.3在“U.V AUTO MODE:NO”中”NO“闪动时按动“↑”或“↓”键，进行转换，

显示“YES“表示启动紫外灯自动运行模式。 6.4“TIME1“闪动可按动“↑”或“↓”键为紫外灯自动运行设定时间，最多可设置3个时间。 6.5按动“设置“键，指示灯灭，设置完成。 7维护和保养 7.1生物安全柜的维护和保养 7.1.1全面保养的周期 每年或每1000个工作时，以及每次重新启动都应当进行维护。 7.1.2清洁 在通常情况下，清洁只需用少量中性清洁剂，将它溶于水后直接擦拭，就可将设备表面的污物擦掉。 7.1.3在使用过程中每次清洁 （1）使用结束后，自运行5-10分钟。 （2）使用医用酒精消毒和清洗工作室。 （3）使用医用酒精对操作面板进行消毒和清洗。 （4）清洁剂清洁外表面及玻璃门。 7.1.4每周75%酒精擦拭紫外线灯管。 7.1.5每月清洗 （1）用清洁剂将所有外表面的尘埃清除。 （2）对设备内部进行消毒处理。 （3）对设备进行风速等功能检验，并在通常使用时检查设备安全。 7.1.6每年维护 （1）检查前玻璃门驱动装置的松紧度。 （2）检查紫外灯管。 8 支持性文件 8.1 《设备管理程序》 9 质量记录 9.1 《重点设备运行、保养记录》

生物安全柜使用与维护作业指导书

建立确保正确使用生物安全柜，特规范生物安全柜的使用方法。 2 范围 适用于生物安全柜的操作。 3 责任人 生物安全柜操作人员。 4 内容 4.1工作原理 安全柜在运行中，通过一台外置外排风机所排出的空气所形成箱内负压，从室内吸入部分空气进入操作区前格栅，从而在安全柜操作口形成一个流速大于0.5m/s的气幕（理论或实测值），同时在安全柜内置送风风机的驱动下，从安全柜顶部进风口吸进的实验室内（或室外）的空气，通过送风过滤器过滤后形成垂直下降的洁净气流。从上向下的垂直气流在接近工作台面时，在外排风机的作用下分成前后二路进入底部负压风道，与从工作台开口面进入的气流混合后，经排风过滤器过滤后，通过管道排到室外。这样就形成了B2型安全柜运行时的完整气流模式，保证了安全柜的运行。 4.2操作步骤 4.2.1准备 4.2.1.1按实验室等级要求穿戴好防护服、头盔、口罩、眼罩、手套等个人防护品； 4.2.1.2工作之前，生物安全柜的工作台面、内壁表面、观察窗内面应以70%浓度的乙醇擦拭，再用无菌水再擦拭一遍清除残余的氯，减小实验时的交叉感染； 4.2.1.3将电源插头插入固定插座后，将前窗操作口开启到200mm高度，首先应启动外排风机，在风机运转稳定后再启动安全柜风机，应使安全柜的风机至少运行3～5min 以净化安全柜内空气，工作之前，应按实验所需物品清单先将实验材料置于安全柜 臂操作时保持适宜位置； 4.2.1.4开始工作前应关闭工作台下方的排水阀，这样，当有溢溅发生时，污染物就不会逸出安全柜外。 4.2.2操作 4.2.2.1操作开始时，应使手缓慢进入工作室，同时要注意手臂进入操作口后，应让流入气流流过手臂约一分钟后开始操作，这样能保持气流的稳定； 4.2.2.1操作应在操作台面上距进风格栅100mm距离内进行； 4.2.2.1为减少操作中的溢洒和气溶胶的产生，应严格执行生物安全操作规程 4.2.2.2操作中应避免使用明火，保持操作室正常气流流态； 4.2.2.3操作结束后，所有物品从安全柜内取出前，必须进行表面除污消毒，取出

常见限制性酶切位点

常见限制性内切酶识别序列(酶切位点)（BamHI、EcoRI、HindIII、NdeI、XhoI等）分子生物学实验室技术2009-11-17 17:46:32 阅读2235 评论2 字号：大中小订阅. 在分子克隆实验中，限制性内切酶是必不可少的工具酶。 无论是构建克隆载体还是表达载体，要根据载体选择合适的内切酶（当然，使用T载就不必考虑了）。先将引物设计好，然后添加酶切识别序列到引物5’端（英语怎么说？）。常用的内切酶比如BamHI、EcoRI、HindIII、NdeI、XhoI等可能你都已经记住了它们的识别序列，不过为了保险起见，还是得查证一下。 下面，我就总结了一些常用的内切酶的识别序列，仅供各位参考。下面这些内切酶都属于II型内切酶。 先介绍一下什么是II型内切酶吧。 The Type II restriction systems typically contain individual restriction enzymes and modification enzymes encoded by separate genes. The Type II restriction enzymes typically recognize specific DNA sequences and cleave at constant positions at or close to that sequence to produce 5-phosphates and 3-hydroxyls. Usually they require Mg 2+ ions as a cofactor, although some have more exotic requirements. The methyltransferases usually recognize the same sequence although some are more promiscuous. Three types of DNA methyltransferases have been found as part of Type II R-M systems forming either C5-methylcytosine, N4-methylcytosine or N6-methyladenine. ApaI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5'GGGCC^C 3' BamHI（类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' G^GATCC 3' BglII （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' A^GATCT 3' EcoRI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' G^AA TTC 3' HindIII （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' A^AGCTT 3' KpnI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' GGTAC^C 3' NcoI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' C^CA TGG 3' NdeI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' CA^TATG 3' NheI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' G^CTAGC 3' NotI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' GC^GGCCGC 3' SacI （类型：Type II restriction enzyme ）识别序列：5' GAGCT^C 3'

酶切位点的设计

酶切位点的设计 44 推荐 经常有战友对一些常见问题在丁香园反复问答了很多遍，所以希望园子中一些战友，特别是低分与0分战友，能将好的帖子归纳总结了一下，并结合自己的经验整理，一方面这是个学习提高的过程，另一方面也能帮助大家解决这方面的问题。同时如有不当或不完善的地方，希望各位战友不断补充，争取有朝一日我们能把园子里战友的经验系统整理，给大家以帮助。我先把设计引物如何设计酶切位点这方面的帖子整理一下，因为昨天一下子看到三个相似问题。原帖如下：我想向你求教一个问题,假如说我想把胰岛素基因和腺病毒载体连接起来,如何确定设计目的基因PCR时的引物呢?和相应的限制性核酸内切酶呢?谢谢老师能给予讲解,谢谢 [整理]：最初的时候，由于害怕设计酶切位点最后且不开，所以经常采用最通用的方法，用T载体克隆解决问题，但后来发现她也有问题，就是浓度提不上去，你需要体大量的载体来酶切，所以感到还是直接扩增好一点。但这就需要你仔细设计引物。连入质粒中的重要目的就是进行酶切和连接，当然首先就是在想要合成或者是进行PCR扩增出靶基因的时候在核酸的两端接入酶切位点，酶切位点是与你的质粒的特点相关的，可以在质粒的图谱说明书上找取相应的位点，进行设计。 （一）设计引物前应做的准备工作： 准备载体图谱，大致准备把片断插在那个部分 对片断进行酶切分析，确定一下那些酶切位点不能用 准备一本所买公司的酶的商品目录，便于查酶的各种数据及两种酶是否可以配用 （二）设计引物所要考虑的问题 两个位点应是载体上的，，所连接片断上没有这两个位点，且距离不能太近，往往导致两个酶都切不好。因此，紧挨在一起，只能切一个，除非恰好是与上面两个酶在一起的酶切位点。我看promega的说明书上说，最好隔四个。还有一种情况是：不能有碱基的交叉，比如AGATCTTAAG，这样的位点比较难切。 两个酶切点最好不要是同尾酶（切下来的残基不要互补），否则效果相当于单酶切。 最好使用酶切效率高的。 最好使用双酶切有共同buffer的酶。 最好使用较常用的酶（如hind3，bamh1，ecor1等），最好使用自己实验室有的酶，这样可以省钱。 Tm的计算，关于Tm的问题，很多的战友都有疑惑。其实园子里有很多的解释了。 Tm叫溶解温度（melting temperature, Tm），即是DNA双链溶解所需的温度。大家可以理解，这个温度是由互补的DNA区域决定的，而不互补的区域对DNA的溶解是没有作用的。因此，对于引物的Tm，只有和模板互补的区域对Tm才有贡献。计算Tm时，只计算互补的区域（除非你的酶切位点也与模板互补）。不少战友设计的引物都Tm过低，是因为他们误把保护碱基和酶切位点都计算到Tm里了，最后的结果是导致了PCR反应的诸多困难。所以，设计引物的时候，先不管5'端的修饰序列，把互补区的Tm控制在55度以上（我喜欢控制在58以上，具体根据PCR的具体情况，对于困难的PCR，需要适当提高Tm），再加上酶切位点和保护碱基，这样的引物通常都是可用的，即使有小的问题，也可以挽回。Tm温度高的引物就比较容易克服3‘发卡、二聚体及3'非特异结合等问题。简单的计算公式可以用2+4的公式。若你计算的Tm值达到了快90 ，不包括酶切位点。引物公司给你发的单子是包括酶切位点

生物安全柜的使用说明(详细)

生物安全柜介绍 1. 概述 生物安全柜是生物实验室的一级隔离屏障设备。所谓生物安全柜，实质就是一种负压过滤排风柜（见有关标准：YY0569、JG170、ANSI/NSF49、EN12469对生物安全柜作出的定义），其本身可分为部分隔离和完全隔离。 生物危害的隔离措施通常由一次隔离和二次隔离措施实现。采用生物安全柜的目的是为了把生物实验室污染区域及污染风险降到最低，以实现一次隔离目的。为防止生物危害从实验室漏到外部环境，把实验室和外界隔断，即为二次隔离，二次隔离的目的是防止实验室外的人被生物感染。 由于生物危险的事例几乎都发生在实验室内，一次隔离措施越严格、充分，则可降低实验室污染的风险，从源头上抑制生物危害的发生。 由于目前生物实验室以及医院临床医学检验和研究应用最广的是Ⅱ级生物安全柜，本文将着重对Ⅱ级生物安全柜进行阐述。 2. 依据 GB 19489—2007《实验室生物安全通用要求》； 《实验室生物安全手册》（WHO）； ISO 15190—2003《医学实验室—安全要求》； YY0569-2005 生物安全柜； JG170-2005 生物安全柜； JGxxx-xxxx 洁净工作台（报批稿）。 3. 生物安全柜的特殊防护设计 3.1 生物安全柜的级别类型和适用范围 生物安全柜分成Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ共三个等级，其中：Ⅱ级生物安全柜又细分为A1、A2、B1、B2四个类型，A1、A2、B1分别为循环气流结构，B2为气流100%直接排放结构。实验领域对于A1类生物安全柜应用极少，其流入气流流速相对较低，对人员防护隔离能力相对较低，不能满足生物危害的高风险场合应用。通常， A1类生物安全柜仅用于医学教学或对已知的低风险病原体操作。B1类生物安全柜的排风气流流量是系统总风量的70%，尚有30%循环气流，这样的特性决定了它仍然不能用于化学毒性场合。常用的是Ⅱ级生物安全柜中的A2、B2类生物安全柜。 生物安全柜应用气流围场、空气负压、物理过滤、风险预警及联锁控制等综合隔离技术，实现生物危害防护，实现保护人员或保护人员、保护实验对象、保护环境目的。 ●Ⅰ级生物安全柜 Ⅰ级生物安全柜从前部操作口吸入空气，经排风口高效空气过滤器滤除病原体颗粒后排出空气。它依赖吸入空气实现生物隔离，其应用目的是保护人员免遭病原体感染。 注：Ⅰ级生物安全柜不对样本保护。 适用范围：仅适用于对第1、2、3、4类病原体的操作时的人员保护场合。 ●Ⅱ级生物安全柜

设计引物如何设计酶切位点

经常有战友对一些常见问题在丁香园反复问答了很多遍，所以希望园子中一些战友，特别是低分与0分战友，能将好的帖子归纳总结了一下，并结合自己的经验整理，一方面这是个学习提高的过程，另一方面也能帮助大家解决这方面的问题。同时如有不当或不完善的地方，希望各位战友不断补充，争取有朝一日我们能把园子里战友的经验系统整理，给大家以帮助。 我先把设计引物如何设计酶切位点这方面的帖子整理一下，因为昨天一下子看到三个相似问题。原帖如下：我想向你求教一个问题,假如说我想把胰岛素基因和腺病毒载体连接起来,如何确定设计目的基因PCR时的引物呢?和相应的限制性核酸内切酶呢?谢谢老师能给予讲解,谢谢 [整理]：最初的时候，由于害怕设计酶切位点最后切不开，所以经常采用最通用的方法，用T载体克隆解决问题，但后来发现她也有问题，就是浓度提不上去，你需要体大量的载体来酶切，所以感到还是直接扩增好一点。但这就需要你仔细设计引物。连入质粒中的重要目的就是进行酶切和连接，当然首先就是在想要合成或者是进行PCR扩增出靶基因的时候在核酸的两端接入酶切位点，酶切位点是与你的质粒的特点相关的，可以在质粒的图谱说明书上找取相应的位点，进行设计。 （一）设计引物前应做的准备工作： 准备载体图谱，大致准备把片断插在那个部分 对片断进行酶切分析，确定一下那些酶切位点不能用 准备一本所买公司的酶的商品目录，便于查酶的各种数据及两种酶是否可以配用（二）设计引物所要考虑的问题 两个位点应是载体上的，，所连接片断上没有这两个位点，且距离不能太近，往往导致两个酶都切不好。因此，紧挨在一起，只能切一个，除非恰好是与上面两个酶在一起的酶切位点。我看promega的说明书上说，最好隔四个。还有一种情况是：不能有碱基的交叉，比如AGATCTTAAG，这样的位点比较难切。 两个酶切点最好不要是同尾酶（切下来的残基不要互补），否则效果相当于单酶切。 最好使用酶切效率高的。 最好使用双酶切有共同buffer的酶。

生物安全柜操作维护规程-检验科PCR室作业书

生物安全柜操作维护规程 1．目的：正确使用生物安全柜。 2．适用范围：本SOP适用于本实验室使用的生物安全柜。 3．负责人：操作人： 4.性能参数:见说明书。 5．程序： 5．1新安装或长期未使用的生物安全柜，使用前必须用超净真空吸尘器或不产生纤维的物品认真进行清洁工作。5．2接通电源，使用前应提前15～30分钟同时开启紫外灯和风机组工作。 5．3当需要调节风机风速时，用生物安全柜操作面板上的风速调节钮进行调节。风机、照明均由指示灯指示其工作状态。 5．4工作台面上禁止存放不必要的物品，以保持工作区的洁净气流不受干扰。 5．5禁止在工作台面上记录书写，工作时应尽量避免作明显扰动气流的动作；禁止在预过滤进风口部位放置物品，以免挡住进风口造成进风量减少，降低净化能力。 5．6使用结束后，用消毒液清理工作台面后打开紫外灯，15～30分钟后关闭紫外灯，关闭生物安全柜电源。每次使用生物安全柜后，均需对其进行清洁。 5．7根据环境洁净程度，定期将预过滤器中的滤料拆下清洗，一般间隔时间为3～6个月。 5．8定期（一般每半年1次）计测工作区风速，如发现不符合技术

参数要求，则可调大风机供电电压。当风机组电压调到最大时，工作区风速仍达不到0.3m/s，则必须更换高效空气过滤器（由厂家或院仪器维修人员进行）。4．9有相应的维护记录，长期不使用的生物安全柜拨下电源插头。 6.仪器维护 (1)使用注意。该仪器在日常使用中请注意符合“4.注意事项”要求 (2)废液瓶满要及时倒掉废液，切勿强行扯动红黄两根管来打开瓶盖，检查废液瓶是否漏气，防止低真空出现。 (3)当出现堵孔时，按自动冲洗键冲洗管道。 (4)严格按照仪器的关机程序关机。 7.期间核查 (1)PE-5700基因扩增仪的定标不需要特别的周期间隔，本实验室PE-5700基因扩增仪执行卫生部临床检验中心的指定校准。 (2)校准物均为与ICSH之标准相符合的校准物，测定值偏差均不超过其规定值。 8.相关记录 仪器使用登记表 仪器设备维护和校准记录表 仪器设备检定周期表 仪器设备维修申请表 仪器报废（停用）单 仪器设备使用授权表 仪器设备档案卡