DNA提取实验报告
大肠杆菌和植物基因组DNA提取
生科基彭健鹏2012141242048
1.大肠杆菌DNA提取方案设计
实验目的
学习并掌握细菌基因组的提取方法
提取大肠杆菌DH5α中的DNA并进行质量检测
实验概述
提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含十二烷基硫酸钠（SDS）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。
试验准备
实验材料：大肠杆菌DH5α菌液
实验试剂：LB液体培养基，TE溶液，10%SDS，蛋白酶K，5mol/L NaCl，CTAB/NaCl溶液，酚/氯仿/异戊醇，异丙醇，70%乙醇
实验仪器与用具：微量移液器，低温离心机，水浴锅，eppendorf管，恒温摇床
实验步骤
（1）将2mL培养至对数期的大肠杆菌DH5α菌液5000rpm冷冻离心10分钟弃上清；
目的：分离大肠杆菌与其培养液。
（2）加190μL TE悬浮沉淀，并加10μL 10%SDS，1μL 20mg/mL蛋白酶K，混匀，37℃保温1h；
目的：裂解大肠杆菌。
（3）加30μL 5mol/L NaCl，混匀；
目的：盐析。NaCl降低DNA在水中的溶解度且不破坏其结构,从而提取粗的DNA。在浓氯化钠（1-2M）溶液中， DNP 的溶解度很大， RNP 的溶解度很小；在稀氯化钠（0.14M）溶液中， DNP 的溶解度很小， RNP 的溶解度很大；
0.14MNaCl-0.01MEDTA溶解RNP，而使DNP沉淀。
（4）加30μL CTAB/NaCl溶液，混匀，65℃保温20min；
目的：CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂，可溶解细胞膜，它能与核酸形成复合物，在高盐溶液中（0.7 mol/L NaCl）是可溶的，当降低溶液盐浓度到一定程度（0.3 mol/L NaCl）时，从溶液中沉淀。通过离心就可将CTAB-核酸的复合物与蛋白，多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA，而CTAB 溶于乙醇或异丙醇而除去。
（5）加入300μL酚/氯仿/异戊醇（25：24：1）抽提，5000rpm离心10min，将上清液移至干净离心管；
目的：分离蛋白多糖和DNA，得到较纯的DNA，若此步得到DNA不纯，可重复此步骤进行多次纯化。
（6）加300μL异丙醇，颠倒混合，室温下静止10min，沉淀DNA；5000rpm 离心10min，沉淀DNA，加入500μL70%乙醇，5000rpm离心10min，弃乙醇，吸干；
目的：将DNA沉淀出，进一步用乙醇促进DNA析出水。
（7）取少量用光谱仪测DNA质量，并取少量跑电泳。
目的：对DNA纯度的检测。
注意事项
DNA浓度和纯度的测定方法
从提取的DNA样品中取出1μL，用TE稀释到100μL，用紫外/可见分光光度计，分别测定260 nm和280 nm的吸光值OD260和OD280，计算检测DNA的纯度、浓度和产率。
(1)DNA纯度＝OD260/OD280
DNA的纯制品的OD260/OD280值为1.8，而RNA的纯制品的OD260/OD280值为2.0。若OD260/OD280值高于1.8，那么说样品中可能有RNA的污染；若样品中蛋白或酚的污染较严重则OD260/OD280值低于1.8。
(2)DNA浓度（ng/μL）＝OD260×50μg/mL×100倍（1 OD260=50ng/μl）
(3)DNA产率（ng/g·FW）＝OD260×50μg/mL×100倍×50μL/0.5 g （体积/取材量）
2. 植物基因组DNA提取
实验目的：
a)了解真核生物基因组DNA提取的一般原理；
b)掌握植物基因组DNA提取的方法和步骤。
实验原理：
c)使用液氮对植物叶片进行研磨，在保证破碎细胞的同时，会大大降低酶
活，减少DNase对植物基因组DNA的降解作用。
d)植物提取液中含有SDS可溶解蛋白，使之变性从而脱离基因组DNA。
e)提取液中EDTA同样可通过螯合金属离子从而使DNase丧失活性，保护植
物基因组DNA不被降解。
实验材料：
f)液氮。
g)细胞提取液：100mmol/L Tris-HCl pH8.0，5mmol/L EDTA，500mmol/L NaCl，
1.25% SDS，1%β-巯基乙醇。
h)5mol/L KAC
i)饱和酚
j)氯仿/异戊醇（24：1）
k)异丙醇
l)70%乙醇
m)ddH
O
2
实验步骤：
n)取500μL细胞提取液于65℃水浴中加热。
o)研钵用液氮预冷，新鲜植物叶片（自来水清洗，蒸馏水冲洗干净），去除主体叶脉，剪成细条状，置于研钵中混合液氮进行研磨，将其研磨成粉末状。
注：保证在研磨过程中DNase不会对植物基因组DNA进行降解，同时由于液氮的存在，植物叶片变得松脆，极易研磨至粉末状。
p)取0.1g粉末（约1药匙）转移至500μL预热的细胞提取液中，轻柔摇匀，65℃水浴中保温20min，5min左右温和颠倒混匀一次。
注：自研磨结束起，植物基因组DNA变暴露在体系中，应动作尽量轻柔，防止机械剪切力对植物基因组DNA造成破坏，影响植物基因组DNA完整性。
q)从水浴中取出Ep管，加入150μLKAC溶液，颠倒混匀，冰上放置20min 后离心(10000rpm×10min)。
注：KAC可使SDS变成水不溶性PDS，从而通过沉淀PDS进一步沉淀蛋白质。
r)将上清液转移到另一干净Ep管中，加等体积酚（约250μL）、氯仿/异戊醇（约250μL），温和颠倒混匀，离心12000rpm×5min，取上清液于另一干净Ep管中。
s)加等体积氯仿/异戊醇（约470μL），温和颠倒混匀，12000r/min×5min，取上清液到另一干净Ep管中。
t)加入等体积的异丙醇（沉淀DNA），温和颠倒混匀，-20℃沉淀1h。
u)离心12000rpm×3min后，去上清，获得沉淀，加入1000μL70%乙醇离心12000r/min×2min。
O，溶解DNA。
v)自然干燥至无乙醇气味后，加入20μLddH
2
w)取5μL溶液，0.7%琼脂糖凝胶电泳检测DNA完整性。
实验结果与讨论
细菌的分光光度计的峰值及DNA含量的测量结果
从分光光度计的结果来看大肠杆菌组实验中DNA 提取是较为成功的，因为其A260/A280的数值是基本符合预期结果的，基本在1.8到2.0之间而且A260/A230的值也说明DNA 提取中基本除掉了糖和盐的干扰。
从电泳结果上来看，大肠杆菌组实验可以观察非常明显的一个超出了marker 范围的条带，而这个条带就是我们通常认为的组DNA 。植物组实验虽然也可以看到一条较为明显的超过marker 的条带，但是在电泳结果中出现大片模糊的情况，这就说明在提取植物DNA 的过程中存在问题只是DNA 的提取出现了污染。
感想与心得
本次试验中最大的感想来自于实验结果的记录。就此以上的结果记录来说，这些实验结果的图片均来自于本组的第二次试验，因为在第一次的结果出来自后没有负责照胶的同学没有记录第一次实验的实验结果所以在本次的实验报告中没有出现第一次的实验记录，而第二次结果中大肠杆菌组的实验结果虽然有所记录但仅仅使用手机拍摄的图片效果并是很好，相对而言，植物组实验的实验记录就显得完整了许多。
最左边为15K 的Marker 的条带，
B1和B2明显都有一个条带超过
了Marker 的测量范围。
植物OD 值及含量测定结果 植物的电泳结果，1为15k 的Marker ，2为5k 的Marker
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水利工程施工实验报告
目录 一、 二、 一、 二、
《水利工程施工》地下洞室支护系统 锚杆拱效应实验报告 一、实验目的 （1）通过地下洞室支护系统锚杆拱效应实验进一步深入与拓展对地下洞室喷锚支 护知识的了解； （2）直观展示地下洞室的系统锚杆支护原理，改善地下工程施工部分内容的实验 教学环节的不足； （3）提高学生的动手能力，培养学生开展工程实验的能力。 二、实验原理 当在地下洞室进行喷锚支护后，洞室顶端山体形成以系统锚杆头和紧固端为顶点 的锥形体压缩区，如果将锚杆沿洞室顶拱按一定间距径向排列，在锚杆沿洞室顶拱按 一定间距径向排列，在锚固力作用下，每根锚杆周围形成的锥形体压缩区彼此重叠联 结，在围岩中形成一连续压缩带，该区域不仅能保持自身的稳定，而且承受上部围岩 压力，阻止上部围岩的松动和变形发展。通过锚杆对破碎岩体施加锚固力是形成加固 拱地前提。 本次实验在一个拱形石料槽中安 设锚杆并填充碎石料来模拟地下洞室 支护的系统锚杆加固拱的作用，锚杆 的上下两端都采用垫片加螺母来对石 料施加锚固力，实验原理如下图1： （1）先安装石料槽底板，在石料 图1槽内不设置锚杆的情况，将粒径 40-60mm的石料装进拱槽内，拆卸装置 石料槽底板，观察石料完全塌落情况； （2）再次安装石料槽底板，再将下端固定好垫片的锚杆安放在底板上； （3）将粒径40-60mm的石料重新装入拱形石料槽，保证锚杆位置无过大变动；（4） 石料装满石料槽后，旋钮锚杆顶部的碟形螺母，在垫片的作用下对石料施加足够的锚
固力； （5）拆卸装置的石料槽底板，观察石料的锚固情况，若石料不完全掉落，呈连续拱形，则实验成功，系统锚杆的拱效应得到验证。 三、实验用品 拱形石料槽、集中锚固锚杆40支、工具箱（手套、老虎钳、锤子）、铁锹、斗车、 石料（粒径40-60mm ）。 四、实验步骤 （1）将锚杆锚固端的垫片和螺栓拆开放好； （2）分区域将拆好的锚杆插入石料槽的底板的孔洞中，并 倒入第一层石料； （3）直至所有锚杆都立在石料槽对应的孔洞中，并倒入第 一层石料将锚杆固定，图2； （4）用锤子轻轻锤石料，压实第一层石料； （5）待第一层石料压实之后，再进行第二层石料下料； （6）分层下料，分层压实，直至下料高度距离锚杆端部10cm 左右； （7）压实结束后，装上垫片并调整至水平，旋钮 锚杆顶部的蝶形螺母，在垫片的作用下对石料施 加足够的锚固力； （8）待螺栓全部拧紧之后，拆卸装置的石料槽底 板，观察石料的锚固情况，石料不完全掉落，且 呈连续拱形。如图3； 五、实验结果 石料不完全掉落，呈连续拱形，实验成功，系统 锚杆的拱效应的到验证。 六、分析与讨论 （1）锚杆的悬吊作用 悬吊作用是指用锚杆将软弱的直接顶板吊挂在其上的坚固老顶之上。 如图1所示，或者是用锚杆将因巷道开挖而引起松动的岩块连接在松动区外的完图2 图3
DEMArcGIS水文分析—河网和流域提取
基于DEM的ArcGIS水文分析 —河网和流域的提取 一、实验背景 水文分析是DEM 数据应用的一个重要方面。而利用DEM生成的集水流域和水流网络，成为大多数地表水文分析模型的主要输入数据。表面水文分析模型研究与地表水流有关的各种自然现象例如洪水水位及泛滥情况，划定受污染源影响的地区，预测当某一地区的地貌改变时对整个地区将造成的影响等。 二、实验目的 通过本实验，使读者理解基于DEM数据进行水文分析的基本原理，掌握利用ArcGIS提供的水文分析工具进行水文分析的基本方法和步骤，并利用DEM数据提取出河网及流域。 三、实验数据 某地区栅格数据DEM，数据来源于随书光盘（…\Chp9\Ex2）。 四、实验要求 根据DEM利用水文分析工具提取地表水流径流模型的水流方向、汇流累积量、水流长度、河流网络（包括河流网络的分级等）以及对研究区的流域进行分割等。
五、实验流程图 六、实验内容及步骤 1．无洼地DEM生成 DEM 是比较光滑的地形表面模型，但由于DEM 误差以及一些真实地形或特殊地形的影响，使得DEM 表面存在一些凹陷的区域。 在进行水流方向计算时，由于这些区域的存在，往往得到不合理的甚至错误的水流方向。因此，在进行水流方向的计算之前，应该首先对原始DEM 数据进行洼地填充，得到无洼地的DEM。 洼地填充的基本过程是先利用水流方向数据计算出DEM 数据中的洼地区域，并计算洼地深度，然后，依据这些洼地深度设定填充阈值进行洼地填充。 1．1 水流方向的提取 水流的流向是通过计算中心格网与邻域格网的最大距离权落差来确定。对于每一格网的水流方向指水流离开此网格的指向。在ARCGIS 中，通过对中心栅格的1、2、4、8、16、32、64、128 等8个邻域栅格编码，中心栅格的水流方向便可有其中的某一值来确定。例如，若中心栅格的水流流向左边，则水流方向赋值16。 流向的生成是个自动的过程，可能要等一段自时间，运算的时间跟电脑性能和DEM图
碘水中碘的萃取实验报告
碘水中碘的萃取实验报告 Prepared on 22 November 2020
碘水中碘的萃取 一、实验目的： ①体验从碘水中提取碘单质，树立实验环保意识。 ②认识各种仪器，熟悉和掌握分液漏斗的操作。 ③验证萃取的原理。 二、实验原理： 利用溶解度的不同，用一种溶剂把溶质从它与另一种溶剂组成的溶液中提取出来。 三、仪器及用品： 量筒、烧杯、分液漏斗、铁架台（带铁圈）。 试剂：碘的饱和溶液，四氯化碳（或煤油） 四、操作步骤： 1、检漏 关闭分液漏斗的活塞，打开上口的玻璃塞，往分液漏斗中注入适量水，盖紧上口玻璃塞。把分液漏斗垂直放置，观察活塞周围是否漏水。再用右手压住分液漏斗上口玻璃塞部分，左手握住活塞部分，把分液漏斗倒转，观察上口玻璃塞是否漏水，用左手转动活塞，看是否灵活。 2、装液 用量筒量取5 mL碘的饱和水溶液，倒入分液漏斗，然后再注入 2 mL四氯化碳（CCl4），盖好玻璃塞。 3、振荡
用右手压住分液漏斗口部，左手握住活塞部分，把分液漏斗倒转过来振荡，使两种液体充分接触；振荡后打开活塞，使漏斗内气体放出。 4、静置分层 将分液漏斗放在铁架台上，静置待液体分层。 5、分液（取下层溶液） 将分液漏斗颈上的玻璃塞打开（或使塞上的凹槽对准漏斗上的小孔），再将分液漏斗下面的活塞拧开，使下层液体慢慢延烧杯壁流下。 6、分液（取上层溶液） 待下层液体全部流尽时，迅速关闭活塞。烧杯中的碘的四氯化碳溶液回收到指定容器中，分液漏斗内上层液体由分液漏斗上口倒出。 7、回收 将碘的四氯化碳溶液倒入2到指定的容器中。 8、清洗仪器，整理实验桌。 五、现象和结论： 现象： 1、碘的饱和水溶液倒入分液漏斗中再注入四氯化碳可以观察到：溶液分层，上层黄色，下层无色透明、油状。 2、振荡时有少量气泡。 静置分层溶液分层，上层无色（或黄色变浅），下层紫红色。
利用ArcGIS水文分析工具提取河网水系的方法
利用ArcGIS水文分析工具提取河网水系的方法 DEM 包含有多种信息，ArcToolBox 提供了利用DEM 提取河网的方法，但是操作比较烦琐（帮助可参看Hydrologic analysis sample applications ），今 天结合我自己的使用将心得写出来与大家分享。提取河网首先要有栅格 DEM,可以利用等高线数据转换获得。在此基础上，要经过洼地填平、水流方向计算、水流积聚计算和河网矢量转化这几个大步骤。 1．洼地填平 DEM 洼地（水流积聚地）有真是洼地和数据精度不够高所造成的洼地。洼地填平的主要作用是避免DEM 的精度不够高所产生的（假的）水流积聚地。洼地填平使用ArctoolBox->Spatial Analysis Tools->Hydrology - > Fill 工具。 2．水流方向计算水流方向计算就可以使用上一步所生成的DEM 为源数据了（如果使用未经洼地填平处理的数据，可能会造成精度下降 )。这里主要使用
ArctoolBox->Spatial Analysis Tools->Flow Direction 工具。输入的DEM 采用第一步的Fill1_exam1 3．水流积聚计算 这里主要使用ArctoolBox->Spatial Analysis Tools->Flow Accumulation 工具流向。栅格数据就是第二步所获得的数据 ( FlowDir_fill1 )。可以看到， 生成的水流积聚栅格已经可以看到所产生的河网了。现在所需要做的就 是把这些河网栅格提取出来。可以把产生的河网的支流的象素值作为阀值来提取河网栅格。 4．提取河网栅格 使用spatial analyst 中的栅格计算器，将所有大于河网栅格阀值的象素全部提取出来。至于这个阀值是多少因具体情况而定。通常是要大于积聚 计算后得到栅格的最低河流象素值。这里采用的是500 这个值。最后生 成只有0、1 值的栅格数据。其中1 表示是河网，0 是非河网。 5．生成河网矢量这里主要使用ArctoolBox->Spatial Analysis Tools->Stream to Feature 工具.Input Stream raster为第四步只有0、1值的河
DNA提取实验报告
大肠杆菌和植物基因组DNA提取 生科基彭健鹏2012141242048 1.大肠杆菌DNA提取方案设计 实验目的 学习并掌握细菌基因组的提取方法 提取大肠杆菌DH5α中的DNA并进行质量检测 实验概述 提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含十二烷基硫酸钠（SDS）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质，再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质，得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。 试验准备 实验材料：大肠杆菌DH5α菌液 实验试剂：LB液体培养基，TE溶液，10%SDS，蛋白酶K，5mol/L NaCl，CTAB/NaCl溶液，酚/氯仿/异戊醇，异丙醇，70%乙醇 实验仪器与用具：微量移液器，低温离心机，水浴锅，eppendorf管，恒温摇床 实验步骤 （1）将2mL培养至对数期的大肠杆菌DH5α菌液5000rpm冷冻离心10分钟弃上清； 目的：分离大肠杆菌与其培养液。 （2）加190μL TE悬浮沉淀，并加10μL 10%SDS，1μL 20mg/mL蛋白酶K，混匀，37℃保温1h； 目的：裂解大肠杆菌。 （3）加30μL 5mol/L NaCl，混匀； 目的：盐析。NaCl降低DNA在水中的溶解度且不破坏其结构,从而提取粗的DNA。在浓氯化钠（1-2M）溶液中， DNP 的溶解度很大， RNP 的溶解度很小；在稀氯化钠（0.14M）溶液中， DNP 的溶解度很小， RNP 的溶解度很大； 0.14MNaCl-0.01MEDTA溶解RNP，而使DNP沉淀。 （4）加30μL CTAB/NaCl溶液，混匀，65℃保温20min； 目的：CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂，可溶解细胞膜，它能与核酸形成复合物，在高盐溶液中（0.7 mol/L NaCl）是可溶的，当降低溶液盐浓度到一定程度（0.3 mol/L NaCl）时，从溶液中沉淀。通过离心就可将CTAB-核酸的复合物与蛋白，多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA，而CTAB 溶于乙醇或异丙醇而除去。 （5）加入300μL酚/氯仿/异戊醇（25：24：1）抽提，5000rpm离心10min，将上清液移至干净离心管； 目的：分离蛋白多糖和DNA，得到较纯的DNA，若此步得到DNA不纯，可重复此步骤进行多次纯化。
指纹提取实验报告doc
指纹提取实验报告 篇一：指纹实验报告 中央民族大学生命与环境科学学院遗传学实验报告人类指纹的采集识别与分析 XX年11月9日人类指纹的采集识别与分析前言 遗传学研究中根据遗传性状的表现特征将其分为两类，即数量性状（quantitative character）和质量性状（qualitative character）。质量性状通常差异显著，呈不连续变异， 由主基因决定，杂交子代的表型呈现出一定的比例，可直接采用孟德尔遗传原理进行分析。 数量性状不同于质量性状，数量性状是可以度量的性状，呈连续变异，由多基因决定，各基 因作用微小并且是累加的，呈剂量效应，因此通常要采用统计学方法分析。指纹性状就是属 于数量形状。 1880年hey fauld及william herschel 相继提出利用指纹鉴定个人身份的 设想。 galton研究了有血缘关系的人群的指纹证明了指纹花样对人来说是一个稳定的性状。 1924 年挪威女科学家bonnevie提出指嵴数计数法。指纹在胚胎发育第13周开始形成，第 19周完成。因此如有某种遗传或生理因素造成嵴纹发
育不良既能在指纹上反映出来。本实 验中，同学采用石墨粉填充沟纹再用透明胶粘手指的方法取自己的指纹，并利用这些指纹进 行指嵴数计数、分析，从而对多基因遗传的特点有了更深刻地认识。 1. 材料和方法&设备和方法2b铅笔一只；约20cm×10cm 的复印纸一张；透明胶带；直尺一把个人电脑及adobe photoshop软件；拍照设备一台。 2. 实验原理 1.人类指纹的形成：指纹是指人手上的条状纹路，它们的形成依赖于胚胎发育时的环境 和遗传因素。指纹属于多基因遗传，在胚胎第12~13周（也有人提出15～16周）即已形成并 保持终生不变。每个人的指纹都是独一无二的，两人之间甚至双胞胎之间，不存在相同的手 指指纹。拥有相同指纹的可能性在10亿分之一以下。因此指纹被称做是无法伪造的身份证。 对一个个体而言，指纹具有唯一性和稳定性。 2.肤(皮纹)与指纹皮纹包括指纹、掌纹和褶纹。指纹为最常用的皮纹。大量研究表明， 某些遗传病，特别是一些染色体病和先天畸形常伴有特殊的皮纹异常。所以皮纹检查可以
指纹提取实验报告
竭诚为您提供优质文档/双击可除 指纹提取实验报告 篇一：指纹实验报告 中央民族大学生命与环境科学学院遗传学实验报告人 类指纹的采集识别与分析20XX年11月9日人类指纹的采集识别与分析前言 遗传学研究中根据遗传性状的表现特征将其分为两类，即数量性状（quantitative character）和质量性状（qualitativecharacter）。质量性状通常差异显著，呈不连续变异， 由主基因决定，杂交子代的表型呈现出一定的比例，可直接采用孟德尔遗传原理进行分析。 数量性状不同于质量性状，数量性状是可以度量的性状，呈连续变异，由多基因决定，各基 因作用微小并且是累加的，呈剂量效应，因此通常要采用统计学方法分析。指纹性状就是属 于数量形状。1880年heyfauld及williamherschel相 继提出利用指纹鉴定个人身份的
设想。galton研究了有血缘关系的人群的指纹证明了指纹花样对人来说是一个稳定的性状。 1924年挪威女科学家bonnevie提出指嵴数计数法。指纹在胚胎发育第13周开始形成，第 19周完成。因此如有某种遗传或生理因素造成嵴纹发育不良既能在指纹上反映出来。本实 验中，同学采用石墨粉填充沟纹再用透明胶粘手指的方法取自己的指纹，并利用这些指纹进 行指嵴数计数、分析，从而对多基因遗传的特点有了更深刻地认识。 1.材料和方法&设备和方法2b铅笔一只；约20cm×10cm 的复印纸一张；透明胶带；直尺一把个人电脑及adobe photoshop软件；拍照设备一台。 2.实验原理 1.人类指纹的形成：指纹是指人手上的条状纹路，它们的形成依赖 于胚胎发育时的环境 和遗传因素。指纹属于多基因遗传，在胚胎第12~13周（也有人提出15～16周）即已形成并 保持终生不变。每个人的指纹都是独一无二的，两人之间甚至双胞胎之间，不存在相同的手 指指纹。拥有相同指纹的可能性在10亿分之一以下。
浙大生化实验报告DNA的提取
实验报告 课程名称： 生化实验甲 指导老师： 成绩：__________________ 实验名称：植物基因组DNA 的提取 实验类型： 生化定性实验 同组学生姓名： 及纯度与含量的测定 一、实验目的和要求（必填） 二、实验内容和原理（必填） 三、实验材料与试剂（必填） 四、实验器材与仪器（必填） 五、操作方法和实验步骤（必填） 六、实验数据记录和处理 七、实验结果与分析（必填） 八、讨论、心得 一、实验目的和要求 1、学习并掌握植物基因组DNA 的提取原理和方法； 2、了解琼脂糖凝胶电泳检测核酸的原理和操作； 3、学习并掌握对电泳检测基因组DNA 结果的初步分析； 4、学习紫外吸收法测定核酸基本原理和方法； 5、学习并掌握紫外吸收法测定基因组DNA 纯度与含量的方法。 二、实验基本原理 植物基因组DNA 的提取方法就其提取原理主要有二种：十六烷基三乙基溴化铵（CTAB)法、十二烷基硫酸钠 (SDS)法。十六烷基三甲基溴化铵和十二烷基硫酸钠等离子型表面活性剂，能溶解细胞膜和 核膜蛋白，使核蛋白解聚，从而使DNA 得以游离出来。再加入苯酚和氯仿等有机溶剂，能使蛋白质变性，并使抽提液分相，因核酸(DNA 、RNA)水溶性很强，经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。上清液中加入无水乙醇使DNA 沉淀，沉淀DNA 溶于TE 溶液中，即得植物基因组 DNA 溶液。 由于植物中的次生代谢产物——多酚类化合物可介导DNA 降解，而多糖的污染也是影响植物核酸纯度最常见的问题，这些多糖能抑制限制酶、连接酶及DNA 聚合酶等分子生物学酶类的生物活性。传统的CTAB-DNA 提取法步骤多，较烦琐，DNA 产率低，而且由于酚很难完全去除，容易影响以后的酶切等工作的效率。SDS 法操作简单，温和,也可提取到较高分子量DNA ，但所得产物含糖类杂质较多,这将直接影响DNA 的限制性核酸内切酶酶切效果。由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA 的抽提产生不利的影响，在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。 本实验采用十二烷基硫酸钠 (SDS)法提取植物基因组DNA ，基因组DNA 提取后， ①通过琼脂糖凝胶电泳鉴定基因组DNA 分子量大小、纯度；②用紫外吸收法测定基因组DNA 纯度与含量。 DNA 的琼脂糖凝胶电泳鉴定: DNA 分子在琼脂糖凝胶中有电荷效应和分子筛效应。DNA 分子在高于等电点的溶液中带负电荷，它在电场中向正极移动。在一定的电场强度下，DNA 分子的迁移速度取决于分子筛效应，即具有不同的相对分子量的DNA 片段泳动速度不同。DNA 片断在凝胶中当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙锭（EB ）染色后，在紫外光下可见橙红色带，并可确定DNA 片断在凝胶中的位置。 紫外吸收法测定基因组DNA 纯度与含量 核酸——DNA 和RNA 所含碱基的苯环结构（嘌呤环和嘧啶环）的共轭双键具有紫外吸收的性质，它们在260nm 处有最大的吸收峰。因此，可以用260nm 波长进行核酸含量的测定。 波长为260nm 时，DNA 或RNA 的光密度的大小不仅与总含量有关，也与它们的不同构型而有差异。 对标准样品来说，浓度为1μg / ml 时，DNA 钠盐的OD260＝0.02。
水文分析实验报告
实验项目（四）：水文分析 一. 实验目的： 利用水文分析工具提取地表水流径流模型的水流方向、汇流累积量、水流长度、河流网络（包括河流网络的分级等）以及对研究区的流域进行分割等。通过对这些基本水文因子的提取和基本水文分析，可以在DEM表面之上再现水流的流动过程，最终完成水文分析过程。 二.实验器材： arcmap 三..实验数据： DEM数据 四、实验步骤: 1、无洼地DEM生成 水流方向提取: 1) 在ArcMap中用左键单击ArcToolbox图标，启动ArcToolbox。 2) 打开水文分析模块。启动ArcToolbox，展开Analysis Tools工具箱， 打开hydrology工具集。 3) 双击Flow Direction工具，打开水流方向（Flow Direction）计算对 话框。设置对话框，计算出水流方向数据。 洼地计算 1) 双击hydrology工具集中的Sink工具，弹出洼地计算对话框。 2) 设置对话框，完成。 洼地深度计算 1) 双击hydrology工具集中的watershed工具，弹出流域计算对话框； 2) 设置对话框，进行洼地贡献区域的计算； 3) 计算每个洼地所形成的贡献区域的最低高程。双击spatial analysis tools工具箱中zonal工具集下的zonal statistic工具，弹 出分区统计对话框； 4) 设置对话框； 5) 统计类型选择；这里选择最小值作为统计类型。 6) 计算每个洼地贡献区域出口的最低高程即洼地出水口高程。双击 spatial analysis tools工具箱中zonal工具集下的zonal fill工 具，在Input zone raster文本框中选择watershsink，在Input weight raster文本框中选择dem，在Output raster文本框中将输出数据文 件名改为zonalmax，然后单击OK，进行运算。 7) 计算洼地深度。加载Spatial Analyst模块，点击Spatial Analyst 模块的下拉箭头，点击raster calculator菜单工具，在文本框里面 输入sinkdep = ( [zonalmax] - [zonalmin])，然后点击evaluate 进行计算。 洼地填充
基于DEM数据的河网河床提取分析方法的研究
新疆农业大学专业文献综述 题目: 基于DEM数据的河网河床提取分析方法的研究 姓名: 白文新 学院: 草业与环境科学学院 专业: 地理信息系统 班级: 072 学号: 074234213 指导教师: 朱磊职称: 20010 年12 月25 日 新疆农业大学教务处制
基于DEM和ArcGIS关于的河网河床提取分析的研究 摘要：目前，利用DEM 进行流域分析的工具很多，通过DEM 可以提取大量的地 表形态信息，如流域网格单元的坡向、坡度以及单元格之间的关系等，随着GIS 技术的发展这方面的应用也越来越广泛，需求量也越来越大。现以新疆玛纳斯县河流河床河网的提取为例，进行DEM数据的分析研究。本文将主要介绍基于DEM 数据如何进行关于河网河床的提取，包括从原始DEM 数据提取河网的步骤、应注意的问题，DEM数据的快速裁剪，不同精度DEM数据拼接的方法和技巧。 关键词：GIS; ArcGIS; DEM; 栅格数据；流域特征； Based on the discrete element method (DEM) and ArcGIS about DWM riverbed extraction analysis research Abstract : at present, using DEM on river basin analysis tools, through many DEM can extract large topographies information, such as river basin of slopes grid unit cell, slope and the relationship between the development of GIS technology, with this aspect of the application and more extensive, demand too more and more big. Now in xinjiang manas county-region river river as an example, the extraction of river on DEM data analysis. This article mainly introduced based on DEM about how to carry on the river, including the extraction of riverbed from primitive DEM data extraction river-net steps and problems that should be paid attention to, DEM data quickly cut, different precision DEM data Mosaic methods and techniques. Key words:GIS; ArcGIS; DEM；Raster data；Watershed characteristics； DEM(Digital Elevation Mode1)是表示区域地形上的三维向量的有限序列，其函数的形式描述为：Z =(置， ) i：1，2，3，?，n式中：、是平面坐标，是(置， )对应的高程。DEM的主要的模型有：规则格网模型，等高线模型和不规则三角网模型。由于其中的规则格网高程矩阵可以方便地被栅格数据结构的地理信息系统用来计算等高线、坡度、坡向、山坡阴影、自动提取流域地形等，故规则格网模型成为DEM 最广泛使用的格式。 DEM作为地形表面的一种数字表达形式，具有多种优点：容易以多种形式显示地形信息，精度不会损失，容易实现自动化、实时化等。总的来说，数字高程模型具有便于储存、更新、传播和处理的特点。更重要的是应用DEM可以方便的进行坡度、坡向、坡长等地形因子的提取。20世纪50年代后期以来，DEM在测绘、土木工程、地质、矿山工程、景观建筑、道路设计、防洪、农业、规划、军事工程、飞行器与战场仿真等领域取得了广泛应用。同样在流域信息提取中，DEM也受到人们的青睐。 DEM(Digital Elevation Model，数字高程模型)数据中包含了丰富的水文信息，通过它可以提取大量的水文信息，如水流流向、汇流累积量等。现在市场上已经有较多的成熟软件来完成流向、汇流等水文信息的提取lT作，如AreGIS —Rivertools等。当前，通过DEM 来进行地形、地貌分析已经发展成熟，而流域特