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蛋白质组学课程论文

蛋白质组学课程论文
蛋白质组学课程论文

利用蛋白质组学分析技术研究 p53 蛋白的技术路线

姓名:高小琪

学号:82101082436

指导老师:邱德文

年级: 08 级

班级:硕士13班

利用蛋白质组学分析技术研究p53蛋白的技术路线指导老师:邱德文学生:高小琪学号:82101082436

p53 基因是一种具有阻滞细胞周期、启动细胞凋亡、维持基因组稳定性作用的、重要的抑瘤基因。p53 基因突变与大多数人类肿瘤发生、发展有关, 至少50 %以上的人类肿瘤存在p53 基因高频率突变失活。p53 蛋白功能失活的主要原因有 4 个, 最常见的原因是p53 基因点突变或缺失。其他3 个p53蛋白功能失活的原因不涉及p53 基因突变, 属于非遗传原因(extragenic)。其一是细胞蛋白与野生型p53蛋白结合, 如MDM2 瘤蛋白与p53 结合后、加速p53 蛋白泛素化和降解; 其二是野生型p53蛋白核外排(nuclear exclusion) , 即p53 蛋白被分隔(sequestration) 于细胞浆, 不能进入细胞核而发挥作用, 如热休克蛋白70 (HSP270) 和HSP290 家族成员可通过此种方式使p53 蛋白功能失活; 其三是病毒蛋白与野生型p53 蛋白结合, 如SV40 大T抗原、HPV E6蛋白、腺病毒E1B 和E4/ F4 蛋白,以及乙肝病毒x 抗原(HBx) 等与p53 蛋白结合使之失活。本路线以p53 蛋白为诱饵,先采用抗p53 抗体免疫共沉淀, 从鼻咽癌细胞中的p53 结合蛋白, 再采用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对含p53 结合蛋白的复合物进行分离, 然后采用液相色谱-电喷雾串联质谱结合数据库搜索鉴定p53 结合蛋白, 试图阐明鼻咽癌中p53 蛋白聚集及功能异常的分子机制。

路线

1、细胞蛋白抽提:

分别收集对数生长期的鼻咽癌细胞系HNE1和HNE2 细胞, 加入抽提缓冲液(20 mmol/Ltris-HCl、pH 7.5 , 150 mmol/L NaCl , 1 mmol/LEDTA , 5 mmol/L DTT, 1 % Triton X2100 , 10 %蛋白酶抑制剂混合物, 1 %磷酸化酶抑制剂Ⅰ, 1 %磷酸化酶抑制剂) , 冰上裂解30 min , 12 000 r/min、4 ℃离心15 min去除细胞碎片, 吸取上清液, 即为细胞总蛋白, 用BCA试剂盒测定蛋白质浓度, 立即用于免疫共沉淀。

2、免疫共沉淀p53 相关蛋白:

在含2 mg 细胞总蛋白的1 mL抽提缓冲液中, 加入1μL 正常兔血清和30μL protein G-Sepherose 4B 珠子, 4 ℃、振荡2h , 9 000 r/min离心5 min去除珠子以消除非特异结合蛋白, 保留上清。在上清液中加入5μL 兔抗人p53抗体和30μL protein G-Sepherose 4B 珠子, 4 ℃,振荡过夜, 9 000 r/min 离心 5 min 去上清, 保留珠TBST缓冲液洗涤含免疫复合物的珠子4 次,每次5 min , 离心收集珠子。以BSA 取代p53 抗体作为对照。

3、SDS-PAGE 电泳与凝胶染色:

加30μL 2 ×SDS-PAGE上样缓冲液(4 % SDS, 125 mmol/L Tris-HCl pH 6.8 , 4 %β-巯基乙醇和10 %甘油) 于含protein G-Sepherose 4B 珠子的试管中, 煮沸3 min.短暂离心后取上清进行12.5 % SDS2-AGE. 电泳结束后, 考马斯亮蓝R 250 和硝酸银试剂

盒进行凝胶染色. 实验重复5 次。

4、质谱分析样品的制备:

从胶中切取分辨较好的5 条蛋白质带, 置于1.5 m L Eppendorf 管中,对经两种染色的蛋白质带分别进行脱色、还原、烷基化、酶解、萃取和脱盐等处理, 将制备好的样品用于质谱分析。

5、质谱分析和数据库查询:

制备好的样品在电喷雾串联质谱(LC-ESI-MS/MS) 仪上进行分析。所有测定均在正离子方式下进行. 质谱仪的校正是用PPG2000串联质谱碎片校正的, 质量准确度小于0.1 u. 雾化气体为氮气, 碰撞气体为氩气。源温80 ℃, 锥孔电压50 V 左右。TOF 加速电压为0.2 kV。MCP检测器电压为2.7 kV。当进行LC-ESI-MS/MS全自动分析时, 毛细管电压为3 000 V。自动进样系统装备一个C18 脱盐预柱(长5 mm, 内径180μm). 在进样后的前3 min 通过预柱脱盐,以后的时间通过梯度洗脱经C18 毛细管柱(75μm×15 cm) 进行肽段分离, 分离后直接进入质谱仪,仪器一级扫描范围为400~1 600 u。一级和二级之间通过母离子强度和母离子电荷自动转换. 进行CID 的母离子单扫描强度域值设为5 counts,电荷条件设定为: 2、3、4 , 同时满足以上两个条件的一级离子自动进行二级分析。一次分析离子的最大个数设定为4 , 间隔时间0.1 s。二级分析7.7 s 后转换为一级继续扫描。碰撞能量根据肽段电荷和质量范围的不同而异。测定结果仪器自动以peaklist 文件形式给出, 通过Mascot 查询SWISSPROT, OWL或NCBI 即可对蛋白质进行鉴定. 也可借助

Micromass公司配备的专用软件MASseq 直接推导出肽段序列, 再用推断的序列与肽段质量相结合, 查询数据库对蛋白质进行鉴定。

6、免疫共沉淀和蛋白质印迹分析验证p53 结合蛋白:

p53 抗体分别与2 mg HNE1、HNE2 细胞总蛋白进行免疫共沉淀, 收集的蛋白质复合物进行12.5 % SDS-PAGE分离, 胶中蛋白质电转移至硝酸纤维膜上。印迹膜在5 %脱脂牛奶中4 ℃封闭过夜;在11∶000 稀释的羊抗人HSP78 一抗中室温温育2 hPBS洗涤3 次, 每次10 min; 在1∶1 500 稀释的兔抗羊二抗中室温温育2 h , PBS洗涤3 次, ECL 试剂发光、显影和定影。未进行免疫共沉淀的100μHNE1总蛋白凝胶同时电泳、转膜后进行蛋白质印迹分析作为对照。

生命科学概论论文

生命科学概论论文题目:“草草”引发的思考 学院:土木工程学院 专业:给排水科学与工程 姓名:余小航 学号:201609834 班级:给排水(本)201603 指导老师:邹立扣

【摘要】大自然中,奔腾于草原上的骏马,穿梭于林间的飞禽走兽,翱翔于长空的展翅雄鹰,以及深藏于海底的奇珍异宝……生命的形式如此丰富,她们中的任何一个都值得我们去探索与发现。 这些生物具有多样性,然而它所提供的价值在其有效实现之前会有一个在空间上的一个积累过程,也就是说她提供的可利用价值是间接的,需要一个转化过程。正如森林,她提供的果实这一部分的使用价值人们可以马上享受到,然而她提供的另一部分价值,例如森林系统所涵养的水流就需要在空间上的一个流动积累,才能汇集成河流为我们所用。之前上课时,邹老师放了一个关于大熊猫“草草”的视频,给了我不少关于生物多样性思考,同时也让我联想到了另外一种动物就是华南虎 关键词:华南虎生态系统人类活动生物多样性 华南虎是中国特有的虎亚种,生活在中国中南部,也叫做中国虎,是中国十大濒危野生动物之一。野生华南虎主要生活在山地,多单独生活,不成群,喜食新鲜肉,捕食对象包括业主、野牛和鹿类。由于人类活动范围的扩大和人类文明对华南虎生存环境的破坏,华南虎的数量剧减,目前在野外几乎灭绝,仅在各地动物园繁殖基地人工饲养着100多只华南虎不发挥着极其重要的作用,且其起源以及分布区的变迁过程在研究虎的 起源和演化等方面具有不可替代的科学价值。华南虎是中国独有的虎亚种,因此也叫做中国虎。但是作为中华民族的图腾之一,华南虎的命运却着实让人担心。从新中国建立到现在,华南虎种群的数量锐减,到现在已经基本确定境内华南虎灭绝。保护华南虎,保护濒临灭绝的野生动植物,是人类义不容辞的责任和义务。野生华南虎惨淡的生存现状要从建国开始研究。 建国初期,野生华南虎的数量还有4000多头。经过20世纪50年代和60年代华南虎标本持续进行的大规模捕杀,华南虎种群遭受重创,一蹶不振。当时,政府宣布华南虎为“四害” 之一,除虎如同剿匪,大打人民战争,还组织专门的打虎队,由解放军和民兵协同作战,赶尽杀绝。而在1962年9月国务院颁布指示保护和合理利用野生动植物资源,列出19种动物为严禁捕猎动物,并在一些地区受到保护,华南虎再度被排斥在外,这对华南虎的种群数量又是一次打击。之后国务院颁布一些条例规定,将华南虎的保护级别逐步提升。到1979年,农业部才把华南虎列为一级保护动物。不过这个措施为时已晚,因为据估计,1981年,的种群数量已经只有150-200了。1996年,联合国国际自然与自然资源保护联盟发布的《植物国际公约》将华南虎列为第一号濒危物种,列为世界十大濒危物种之首。据传人类最后一次在野外看见华南虎,也是2007年10月13日在重庆和陕西交界的大巴山原始森林。后经专家组研究认定这种说法可信度很低,并断定华南虎已经灭绝。由此可见,华南虎的受威胁程度是非常严重的,早年受政府下令捕杀,等到种群数量很低政府出台条例保护华南虎时, 华南虎面临的捕杀危机虽然减弱,但是生存环境由于人类的活动而急剧减少,一只成年公存所需的100公顷的森林在华南虎种群分布范围内已经很少见。重重困难和危机下,华南虎群遭到灭顶之灾。而维持华南虎个体数量的圈养华南虎种群形势也不容乐观。由于数量极其有限,动物园和繁殖基地的华南虎的近亲繁殖系数极高,生下的幼崽常有多病痴呆等症状,种群面临严重衰退。生活在这种环境的华南虎体质和免疫力低下,正常的繁殖都需要人类助,很难承担维持种群数

奥妙植物学论文

考号: 姓名:学号: 学院:xxxx学院专业:班级: 植物在我们身边的作用 奥妙植物学对于我们虽然是一门选修课课,但是它加深了我们对植物界额了解。我们收获不仅是知识,而且还有乐趣。生活在我们的共同的环境中,对身边的种种植物,在人类社会的发展过程中,人类的探索逐步发现了神奇的植物世界,至今,植物世界中的种种现象仍然有待科学去发现和探索。通过一个学期的《奥妙植物学》的学习了解了众多的植物世界中的神奇,有着较动物世界完全不同的方式;植物寿命的奥秘, 植物的繁殖奥秘, 植物探矿奥秘,各种环境下的不同习性的植物的生长特性。 植物与我们息息相关,我们与植物共同生存在地球上,植物是我们生存不可缺少的一部分,植物为我们提供氧气,这是它的最重要的作用,因此我们离不开植物,可以说没有植物就不会有人类生活。植物的发展先后已经历30多亿年在我们生活的地球上拥有大约50万种植物,其中包括了藻类,菌类,地衣,苔藓,蕨类和种子植物。世界是物质性的,丰富的植物资源为人类提供了赖以生存的物质基础。人类的生活中的衣、食、住、行等各个方面都必须直接或间接地来自植物。自然界的中其他一切的动物的生存所需更离不开植物。随着科技的迅猛发展,社会经济水平不断提高,人类的文明程度也越来越进步。经济的发展,与人类对自然资源,包括丰富的植物资源的全面利用紧密相联系。经济发展的,科技与教育越来越占据社会发展的主导地位,生态环境破坏污染日益严峻,在新的形势下,人类必须不断深刻认识到丰富的植物资源对社会经济的重要性,要合理与全面的利用植物资源,并且,我们要不断学习有关植物学理论,全面掌握植物学的基本理论,包括一些奇妙的植物生物学现象,具备创新思维和敏锐的眼光,探索利用植物资源不断谋求其中巨大经济经济效益。我们可以从环境、衣食住行、工业、药业、美化环境、陶冶情操、文化等几个大方面阐述植物在人类日常生产和生活中的作用,它的作用可以说不止这些方面。植物界中的原始生命逐渐进化,使自身具有叶绿素,能够进行光合作用,提供氧气和营养物质,地球上所有生物都是直接或间接依靠植物来获得生存和发展的。 一、植物对环境起保护和稳定作用植物对人类赖以生存和发展的环境有着保护和稳定的作用,以保障人类正常的生产和生活。比如:1、植物能净化空气。植物能通过叶片吸收大气中的毒物,减少大气中的毒物含量,能降低和吸收粉尘,净化空气。特别是某些植物表面具有皮毛、粘液、油脂,因此可以吸附灰尘,转化有毒物质,减少大气中的毒物含量,同时叶片经雨水冲刷后又可恢复吸附能力,如桑树、垂柳具有较高吸附氟的作用。再如,

浅析农业信息化的作用

声明 本人郑重声明:所呈交的论文《浅析农业信息化的作用》,是本人在指导教师的指导下,进行深入写作所取得的成果。除文中已经注明参考文献的内容外,本人论文的研究成果不包含任何他人创作的、已公开发表或没有公开发表的作品内容。对本论文所涉及的研究工作做出贡献的其他个人和集体,均已在文中以明确方式标明。本人论文原创性声明的法律责任由本人承担。 声明人(签字): 2012年7月15日

浅析农业信息化的作用 学号:115311298435 姓名:兰静 摘要:当今社会经济正由工业化时期进入信息化时代,以计算机多媒体技术、光纤和卫星通信技术为特征的信息化浪潮正在席卷全球。农业信息化是国民经济信息化的重要基础,也是国民经济信息化的重要组成部分;推进农业信息化有助于发挥经济的“后发”效应;实现国民经济信息化,必须首先实现农业信息化;农业信息化必须与国民经济信息化同步。提高农业信息化水平,开发和利用农业信息资源,对于实现农产品供求平衡,加强和改善农业科研和农业技术推广体系,促进农业科技成果转化为生产力,促进农业结构调整,促进农业增效、农民增收,加速我国国民经济持续、健康、快速发展具有十分重要的战略意义。与此同时,现代信息技术正在加快向农业领域渗透,在未来新的农业技术革命中,信息技术将上升到更重要的地位。我们必须抓住机遇,迎接挑战,深入研究农业信息化的发展规律,掌握农业信息化建设的主动权。 关键词: 农业信息经济市场 全国人民对农业信息化有着不同的定义,例如:张燕认为农业信息化是利用现代信息技术和信息系统为农业供销及相关的管理和服务提供有效的信息支持,并提高农业的综合生产力和经营管理效率,形成集采集、加工、发布、服务于一体的农村市场信息服务体系。李道南认为农村信息化简单为四个字:程度,就是普及的程度。过程,农村信息化不是一天两天能够完成的,它是若干年的发展过程,所以说它是一个信息技术在农业,农村,农民生活中普遍应用的程度和过程。 一、农业信息化有利于社会主义新农村建设 实现全面建设小康社会的重点和难点都在农村,统筹城乡社会发展的关键点也在农村。农业信息化是统筹城乡经济发展的重要结合点,是建设生活富裕、乡风文明、村容整洁、民理民主的社会主义新农村的目标和要求。推进农业信息化有利于实现生产发展;有利于消除城乡之间信息占有和利用的差别;有利于促进农村市场的开拓和城乡协调发展。通过网络技术可以建立城乡间信息传递、互动、交换的平等关系,提升农村发展速度,有利于缩短城乡之间发展的距离,引导农民改变传统的生产生活方式,促进农民享受现代社会的文明成果,推进农村科技、文化、社会各项事业的发展,促进农村小康社会建设。 二、农业信息化有利于改变农民的消费观念 农业信息化可以改善农民的生活环境,促使农民的消费观念和方式的改变。通过农业信息化的建设,可以实现电视网、电话网和电脑网的“三电合一”,农民可以利用这些网络,了解国内外农业、农民和农村生活的发展动态。农业信息化扩大了农民的视野,丰富了农民的文化娱乐生活,还将促使农村居民的思想价值观念、生活方式、消费观念的变革,促使农民由注重物质文化生活的消费,向注重精神文化生活消费的转移。 三、农业信息化有利于提高农民的整体素质 培养有文化、懂技术、会经营的新型农民,是建设社会主义新农村的一个目标。在现代信息社会,农民素质主要体现在接受、分析、处理信息的能力上,谁能最先捕捉到有价值的信息,谁就能走在市场的前列,就能掌握生产经营主动权。如果信息不灵,反应不快,就会丧失机遇,陷于被动,遭受损失。高素质经营型农民正是以自身很强的信息意识,不断地搜集、筛选、利用信息,使有价值的信息成为生产经营决策的依据,不断地为自身创造发展机会。农业信息化要求劳动者具有更高的知识和技术水平,互联网上丰富的教育资源,为农民学习生活提供了广阔的新天地,有助于农民整体素质的提高。 四、农业信息化有利于促进农民与市场的有机连接 落后的生产管理水平和小农意识经营管理水平,是农民增收的重要障碍。农业生产管理包括农田基本建设、农作物栽培管理、农作物病虫害防治、畜禽饲养管理、养殖管理等方面。

蛋白质组学研究方法选择及比较

蛋白质组学研究方法选择及比较 目前研究蛋白组学的主要方法有蛋白质芯片及质谱法,本文将从多方面对两种研究方法进行了解与比较; 蛋白质芯片(Protein Array) 将大量不同的蛋白质有序地排列、固定于固相载体表面,形成微阵列。利用蛋白质分子间特异性结合的原理,实现对生物蛋白质分子精准、快速、高通量的检测。 主要类型: ●夹心法芯片(Sandwich-based Array) ●标记法芯片(Label-based Array) ●定量芯片(Quantitative Array) ●半定量芯片(Semi-Quantitative Array) 质谱(Mass Spectrometry) 用电场和磁场将运动的离子按它们的质荷比分离后进行检测,测出离子准确质量并确定离子的化合物组成,即通过对样品离子质荷比的分析而实现对样品进行定性和定量的一种方法。 主要类型:

●二维电泳+质谱(2D/Mass Spectrometry, MS) ●表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(Surface-enhanced laser desorption/ionization- time of flight, SELDI) ●同位素标记相对和绝对定量(Isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ) Protein Array or Mass Spectrometry? 如何选择合适的研究方法?以下将从六个方面进行比较与推荐: 1.筛查蛋白组学表达差异 建议选择:RayBiotech(1000个因子的芯片)+质谱 a)不同的方法学有不同的特点:对于质谱,可以筛查到未知的蛋白,但是对于分子量大、 低丰度的蛋白质,质谱的灵敏度和准确性有一定的限制。 b)不同的方法能筛查到的目标不同:根据Proteome Analysis of Human Aqueous Humor 一文中报道,质谱筛查到的差异蛋白集中在小分子与代谢物。而用RayBiotech芯片筛查到的结果,多是集中在细胞因子、趋化、血管、生长等等。 c)质谱筛查到355个蛋白,而RayBiotech抗体芯片也筛查到328个蛋白,且用定量芯片 验证25个蛋白有差异,这些蛋白是质谱找不到的。目前RayBiotech夹心法抗体芯片已经可以检测到1000个蛋白,采用双抗夹心法,尤其是对于低丰度蛋白,有很好的灵敏度和特异性,很多的低丰度蛋白是抗体芯片可以检测出来,而质谱检测不到的,且样品不经过变性和前处理,保持天然状态的样品直接检测,对于蛋白的检测准确度高。 d)质谱的重复性一直是质谱工作者纠结的问题,不同操作者的结果,不同样品处理条件, 峰值的偏移等影响因素都会产生大的影响;RayBiotech的夹心法芯片重复性高。

保护生物学论文

保 护 生 物 学 论 文 姓名:林姿余 学院:园林学院 班级:13级环境设计二班 学号:20133895

摘要针对我国目前保护生物以及生物发展状况,论述了现代生物的发展状况以及采取的措施,保护生物的关键所在对人类的影响。 关键词保护生物生态环境使用价值保护措施 新兴学科在发展过程中会经历很多变化,初期建立起来的秩序都可能被未来新的发现所推翻,学科体系在时间的推移和事实的验证中不断逐渐完善。当今全球环境问题、生态问题恶化趋势尚未扭转IUCN近期的分析报告和国内外的众多保护生物学研究所都在不断警告人类迅速行动,遏制生物多样性的高速、毁灭性消失的灾难,研究的紧迫性和时效性更为突出。 认识生物的多样性是为了更好地保护和合理利用生物的多样性。保护生物的多样性是一项艰巨的任务,涉及到方方面面的问题。保护生物的多样性是可持续发展的重要内容 保护生物多样性就是在生态系统、物种和基因三个水平上采取保护战略和保护措施.主要有: 1.就地保护,即建立自然保护区。 2 .迁地保护,如建立遗传资源种质库、植物基因库,以及野生动物园和植物园及水族馆等。 3. 制定必要的法规,对生物多样性造成重大损失的活动进行打击和控制。 保护生物多样性,是全球共同的大事,最主要的是要行动,这必须所有缔约国广泛合作,积极行动,制定必要的法规,对生物多样性造成重大损失的活动进行打击和控制,对濒临灭绝的物种、破坏严重的生态系统和遗传资源实行有效的保护和抢救。 生物多样性包括生物种类的多样性、基因的多样性和生态系统的多样性。生物多样性的意义主要体现在生物多样性的价值,对于人类来说,生物多样性具有直接使用价值、间接使用价值和潜在使用价值。 直接使用价值:生物为人类提供食物、纤维、建筑和家具材料、药物及其他工业原料。 生物多样性还具有美学价值。如大千世界色彩纷呈的植物和神态各异的动物

植物论文

植物造景研究进展 ——由上海世博会法国馆的垂直花园引发的思考 随着物质环境的日益发达,人们生活水平得到很大的提高,城市范围内的贫苦大面积消失,人们对于环境的要求也日益提高,俗话说“饱暖思淫欲”,高楼林立曾经是城市的骄傲,而如今却冠以“水泥森林”来表示不满。不满足于“经济、实用”而越来越强调“美观”,并且愈发重视低碳、生态、环保等,人们迫切需要绿色来点亮这个城市,以使之更环境友好。这些都催发着园林植物学的发展。 21世纪开端的今天,信息时代悄然而至,后知后觉发现生活的一切都发生了巨大的改变,整个世界被拉平了,差异化越来越小,人的思维、审美、观念等都在大范围的相互影响下剧变(提高),自我需要更充分的表达,个性也空前突出。在这样一个如此“嘈杂”时代,植物造景如何去满足人们的需求并且表达这个时代的特征呢?我国园林工程建设是在近几十年才开始快速的发展,并且逐渐成为城市和乡镇整体规划建设方案中的重点内容和建设项目之一。在现代园林工程建设中,对植物造景的技术性与艺术性的要求都有了明显的提高,传统的植物造景方式已经不能满足于现代园林建设的要求。代表着国际各领域发展前沿的世博会在“城市让生活更美好”的口号下来到上海,而其中法国馆的垂直花园无疑代表着植物造景发展的一种先进理念。本文也将就此展开思考。 一、植物造景的现状以及其局限性 植物造景:以自然乔、灌、藤、草本植物群落的种类、结构,层次和外貌为基础,通过艺术手法,充分发挥其形体、线条、色彩等自然美进行创作,形成山水—植物、建筑—植物、街道—植物等综合景观,让人产生一种实在的美的感受和联想。(摘自百度百科) 植物造景伴随着人类的发展而发展,具有久远的历史,各个国家、各个文明都发展处拥有自己各自特点的园林。如今全球化的趋势下,各区域的植物造景方面也不断交流发展,在我国的很多小区、公园,你可以看到不同风格的园林景观,而植栽技术的发展带动下,气候、环境的差异也愈发减小,热带的植物也可以种在北方,这也大大丰富了植物造景的题材。大大小小的植物景观深入都市空间,点缀其间,同时在视觉与生态上改善着城市,城市的主人——人们也在日常的活动感受着它们的同时也享受着它们的好处。 植物造景在当下更多是体现在城市公共空间的营造上,虽然也渐渐开始尝试走进建筑内部,例如屋顶花园,但还不够。而公共空间的植物造景也更多停留在平面上或者半立体上,我称之为2D或者2.5D。而这样一种现状则有个重大的局限就是花了大代价却不一定使人的感受得到等价。比如,我曾经看到一幅图片,是荷兰的郁金香种植园的航拍图,不同品种的郁金香在人为种植下呈现彩条状,像一张自然的地毯一样,非常美丽。而当以人在地面的视觉,是否还能看到这些“彩条”?就像平时做设计时一味强调平面的构图并不很有意义一样,而现实的城市空间中更加难有如此大的面积给予呈现,则更难把其铺向城市空间。当然,这是2D造景比较极端的一种体现。而鉴于面积的限制,城市空间的植

农业信息技术论文

“数据库技术”在我国农业信息化建设中的作用一、数据库技术概述(一)、数据库基本概念数据库系统是基于数据库的计算机应用系统。它包括了以数据为主体的数据库和管理数据库系统的系统软件DBMS,还包括了支持数据库系统的计算机硬件环境和操作系统环境、管理和使用数据库系统的人。数据库技术是信息系统的一个核心技术。是一种计算机辅助管理数据的方法,它研究如何组织和存储数据,如何高效地获取和处理数据。是通过研究数据库的结构、存储、设计、管理以及应用的基本理论和实现方法,并利用这些理论来实现对数据库中的数据进行处理、分析和理解的技术。即:数据库技术是研究、管理和应用数据库的一门软件科学。数据库技术是现代信息科学与技术的重要组成部分,是计算机数据处理与信息管理系统的核心。数据库技术研究和解决了计算机信息处理过程中大量数据有效地组织和存储的问题,在数据库系统中减少数据存储冗余、实现数据共享、保障数据安全以及高效地检索数据和处理数据。数据库技术研究和管理的对象是数据,所以数据库技术所涉及的具体内容主要包括:通过对数据的统一组织和管理,按照指定的结构建立

相应的数据库和数据仓库;利用数据库管理系统和数据挖掘系统设计出能够实现对数据库中的数据进行添加、修改、删除、处理、分析、理解、报表和打印等多种功能的数据管理和数据挖掘应用系统;并利用应用管理系统最终实现对数据的处理、分析和理解。(二)、数据库技术发展数据管理技术是对数据进行分类,组织,编码,输入,存储,检索,维护和输出的技术.数据管理技术的发展大致经过了以下三个阶段:人工管理阶段;文件系统阶段;数据库系统阶段。1、人工管理阶段20世纪50年代以前,计算机主要用于数值计算。从当时的硬件看,外存只有纸带,卡片,磁带,没有直接存取设备;从软件看(实际上,当时还未形成软件的整体概念),没有操作系统以及管理数据的软件;从数据看,数据量小,数据无结构,由用户直接管理,且数据间缺乏逻辑组织,数据依赖于特定的应用程序,缺乏独立性。 2、文件系统阶段 50年代后期到60年代中期,出现了磁鼓,磁盘等数据存储设备。新的数据处理系统迅速发展起来。这种数据处理系统是把计算机中的数据组织成相互独立的数据文件,系统可以按照文件的名称对其进行访问,对文件中的记录进行存取,并可以实现对文件的修改,插入和删除,这就是文件系统。文件系统实现了记录内的结构化,即给出了记录内各

保护生物学课程复习

保护生物学课程复 习 ●保护生物学:保护生物学是 解决生物多样化危机的科学, 其原则是:进化的眼光,动 态和综合的观点,必须考虑 人的观点,分析、解决(缓 解)矛盾。 ●生物多样性:生态系统的多 样性,物种的多昂性,基因 的多样性。【是指一个地区的 生物、他们遗传多样性、他 们所属生态系统的类型。】 ●种群:一个地区内相同个体 的集合。 ●生态系统:一个空间内所有 生物及其无机环境的统一整 体。 ●景观:不同生态系统组成的 异质性区域。 ●物种:可以交配并繁衍后代 的个体的集合。 ●生态系统服务功能:生态系 统在能流、物流的生态过程 中,对外部显示的重要作用, 如改善环境,提供产品等。 ●林奈的分类系统:界(动物 界)、门(脊索动物门)、纲 (哺乳纲)、目(灵长目)、 科(人科)、属(人属)、种 (智人)->人 ●物种形式存在的意义:1.物 种的分异是生物对环境异质 性的应答;2.物种间的不连 续抵消了有性生殖带来的遗 传的不稳定性;3.物种是大 进化的基本单位;4.物种是 生态系统中的功能单位-食 物链 ●小进化:种内的个体和种群 层次上的进化改变。基本单 位:无性繁殖系或种群遗传 组成的变化。

●大进化:种和种以上分类群 的进化。基本单位:物种。 ●生态系统各成员间通过营养 关系【食物链】、【食物网】 彼此连成一个整体。 ●物种丰度:一个地区物种的 数量。 ●物种多度:即单一物种的度, 有相对多度和绝对多度。多 度可用数量或生物量来测量。 ●物种多样性:如果根据丰度、 生产力或数量等某种重要性 来衡量物种,就是在谈论物 种的多样性。 ●

●关键种:是指它们的消失或 削弱引起整个群落和生态系 统发生根本性变化的物种。 ●旗舰物种:代表某个物种对 一般大众具有特别号召力和 吸引力,可促进大众对动物 保护的关注。 ●伞护种:是指那些生存环境 需求能够涵盖许多其他物种 生存环境需求的物种。 ●指示种:是指其生物学或生 态学特性可表征其他物种生 长环境或环境状况的生物种。 ●生物多样性指数: Shannon-Wiener index(H’) 和Simpson index(D)。 ●种群数量:一个地区某一特 定时间种群的数量。 ●种群动态:种群数量在时间 和空间上的变动规律。 ●热点地区:具有丰富的地方 特有种的地区。 ●生物多样性遭受的威胁:1. 栖息地破坏、破碎化和改变; 2.物种入侵(入侵种:某物 种通过自然或人为的手段, 被引入一个原来没有该物种 的生态系统中,逐渐发展繁 殖,并对当地自然或人为生 态系统产生毁灭性影响的物 种);3.过度开发和过度开采; 4.污染和有毒物质的产生。 5.连锁效应和协同效应。 ●连锁效应:一个物种的绝灭 导致另一物种的绝灭。 ●协同效应:单独因素无作用, 但因素协同后影响巨大。 ●生物多样性公约:是一项保 护地球生物资源的国际性公 约,签署于1992年6月1日。 ●UNEP:联合国环境规划署(united nations environment programme ) ●IUCN:世界自然保护联盟

植物学论文

植物与人类关系 自远古以来,人类就与植物建立了密切的关系,人对植物的依赖是人人皆知的,植物作为第一生产者,吸收大地的养份、太阳的光辉、环境中的二氧化碳,经雨露滋润,进行光合作用,生产氧气,制造出碳水化合物,生产出各种食物、营养物质、药品和木材。植物是人类呼吸中的需要的氧气来源。植物在光合作用中放出氧气,净化环境,为人类的生存提供了必备条件。 一.食品作物 有人把水稻、小麦、大麦、玉米、高粱、大豆、豆类、甜菜、甘蔗、花生、马铃薯、薯芋、木薯、椰子、香蕉列为世界15种重要食用植物,也有人把水稻、小麦、大麦、高粱、玉米作为谷类粮食作物的5大台柱。 (一)禾谷类粮食作物 禾谷类粮食作物出自禾本科植物,这个科包括约660多个属,近10000种,我国有225个属,约1200个种 1.稻:在禾谷类和所有粮食作物中,稻谷的栽培面积和消耗量首屈一指。全世界人口的60%用水稻当粮食,摄取的能源中有30%直接来自水稻。由于长期栽培和选育的结果,稻的品种已发展到7000多个。稻分为陆稻、水稻两大类。普通的稻米含有水分12%,纤维素0.2%,蛋白质7.5%,脂肪0.5%,无机盐0.4%,主要是碳水化合物,含79%,其他的还含有微量的硫胺素、核黄素和尼克酸。2.麦类:特别是小麦是水稻以外被人来食用最多的禾谷类植物。麦类植物包括小麦、大麦、燕麦等三个不同属的植物。小麦属植物约有15个种,最主要的是普通小麦;大麦属植物约有16-20种,最主要的是普通大麦;燕麦属植物约有50种,最常见的是普通燕麦。 (二)非禾本科植物 属于非禾本科植物的粮食作物,可以列出一张长的名单,其中主要有豆科植物中的大豆、蚕豆、豌豆、扁豆、豇豆、菜豆、花生,茄科中的马铃薯,大戟科中的木薯,旋花科中的甘薯,薯芋科中的山药,芭蕉科中的香蕉等等,也已成为世界人民不可少的粮食作物。 浓缩油植物 在整个植物界中,从菌藻植物、苔藓植物一直到种子植物,都含有植物油。从现在世界上的产量来看,占重要地位的食用油植物为大豆、花生、棉、椰子、向日葵、油棕、油菜、芝麻、玉米、油橄榄。根据植物学形态特征和农艺性状,可将油菜分为白菜型油菜、甘蓝型油菜、芥菜型油菜及埃塞俄比亚芥菜四大类,后者种植面积少,世界上大多数国家只种植前三种类型的油菜。 2.蔬菜植物 研究发现,蔬菜中有许多维生素、矿物质微量元素以及相关的植物化学物质、酶等都是有效抗氧化剂,所以蔬菜不仅是低糖、低盐、低脂的健康食物,同时还能有效的减轻环境污染对人体的损害,同时蔬菜还对各种疾病起预防作用。十字花科甘蓝类蔬菜:如青花菜、花菜、甘蓝、叶甘蓝、芥兰等含有吲哚类萝卜硫素、异硫氰酸盐、类胡萝卜素、维生素C等,对防治肿瘤、心血管病有较好的作用,特别是青花菜。豆类中,如大豆、毛豆、黑豆等所含的类黄酮、异黄酮、蛋白酶抑制剂、肌醇、大豆皂苷、维生素B,对降低血胆固醇调节血糖,减低癌症发病及防治心血管、糖尿病有良好作用。芦笋含有丰富的谷胱甘肽、叶酸,对防止新生儿脑神经管缺损,防肿瘤有良好作用。

蛋白质组学生物信息学分析介绍

生物信息学分析FAQ CHAPTER ONE ABOUT GENE ONTOLOGY ANNOTATION (3) 什么是GO? (3) GO和KEGG注释之前,为什么要先进行序列比对(BLAST)? (3) GO注释的意义? (3) GO和GOslim的区别 (4) 为什么有些蛋白没有GO注释信息? (4) 为什么GO Level 2的统计饼图里蛋白数目和差异蛋白总数不一致? (4) 什么是差异蛋白的功能富集分析&WHY? (4) GO注释结果文件解析 (5) Sheet TopBlastHits (5) Sheet protein2GO/protein2GOslim (5) Sheet BP/MF/CC (6) Sheet Level2_BP/Level2_MF/Level2_CC (6) CHAPTER TWO ABOUT KEGG PATHWAY ANNOTATION (7) WHY KEGG pathway annotation? (7) KEGG通路注释的方法&流程? (7) KEGG通路注释的意义? (7) 为什么有些蛋白没有KEGG通路注释信息? (8) 什么是差异蛋白的通路富集分析&WHY? (8) KEGG注释结果文件解析 (8) Sheet query2map (8) Sheet map2query (9) Sheet TopMapStat (9) CHAPTER THREE ABOUT FEATURE SELECTION & CLUSTERING (10) WHY Feature Selection? (10)

聚类分析(Clustering) (10) 聚类结果文件解析 (10) CHAPTER FOUR ABOUT PROTEIN-PROTEIN INTERACTION NETWORK (12) 蛋白质相互作用网络分析的意义 (12) 蛋白质相互作用 VS生物学通路? (12) 蛋白质相互作用网络分析结果文件解析 (12)

农业信息化课程论文

农业信息化课程论文-计科1201班-刘怡然-10 遥感技术在农作物估产中的应用摘要:遥感估产是基于作物特有的波谱反射特征,利用遥感手段对作物产量进行监测预报的一种技术,在农业发展中具有传统的统计方法不可比拟的优势,能客观、动态、快速、精准地获得农作物长势、产量等信息。遥感技术必须与其它工具相结合,才能更好地估产。本文主要研究了遥感技术在农作物估产中的应用,先介绍了遥感估产的基本原理和方法,分析了几种与遥感技术结合的估产模型的优劣;然后以冬小麦和玉米为例,介绍了两种遥感估产模型;最后,分析了现有遥感估产存在的问题和遥感估产的发展方向,为遥感估产的进一步研究提供了方向和思路。关键字:遥感技术,农业,估产 The Application of Remote Sensing Technology in Estimating Crop Yield Abstract Estimating crop yield by remote sensing is a technology monitoring and forecasting crop yield by remote sensing based on specific spectrum characteristics of crop. It

has incomparable advantages compared with traditional statistical methods in the development of agriculture and it can acquire growing and yield information of crops in a object,dynamic,fast and accurate way. To estimating crop yield better, remote sensing technology must be combined with other technologies. In this paper, the application of remote sensing technology in estimating crop yield is introduced. To begin with, the basic theory and method of estimating crop yield by remote sensing are mentioned, then the merits and demerits of the estimating models integrated into remote sensing are analyzed. Finally, the existing problems and prospect are statemented, which proposed direction and thoughts for next researches. Key words Remote Sensing Technology,Agriculture,Yield Estimation 1 农业信息化课程论文-计科1201班-刘怡然-10 目录 1引言--------------------------------------------------------------3 2遥感估产的原理和方法----------------------------------------------3 2.1基

保护生物学论文

海南师范大学生命科学学院 保护生物学 论文题目:丹顶鹤的保护现状及保护对策 学院:生命科学学院 系别:生物科学系 专业:生物科学 学生姓名:符淑乾 学号: 201208010209 填表时间:年月日

丹顶鹤的保护现状及保护对策 摘要:丹顶鹤是我国著名的文化鸟类,在我国文化历史上具有极高的地位,历来受到全国人民的喜爱。近年来,由于环境的迁和人为的干扰,野生丹顶鹤数量逐年下降,全球现存数量仅为2600只左右,而东亚的大陆总数量约1500只左右。国内外就丹顶鹤的保护现状及保护对策进行了大量的研究工作,并取得了明显的成果,丹顶鹤是在我国研究最广泛、最深入的鸟类,从宏观到微观,从个体到群落,从野生到饲养等各个领域;到目前为止,我国发表的涉及丹顶鹤的文献共1162篇,并对论文发表年代,研究内容、涉及领域进行了统计和分析,并提出了我国丹顶鹤的保护现状及保护对策。 关键词:丹顶鹤;现状;保护;对策 丹顶鹤属鹤行目,鹤科,为大型涉禽,是国家一级重点保护动物,世界涉危鸟类,被列入CTTES附录中。自古以来丹顶鹤深受人们的喜爱,文人墨客常把它同松树会写在一起制作(松鹤图)作为长寿的象征加以赞美和歌颂。丹顶鹤栖息繁殖于湿地中,被人们冠以“湿地之神”之美称。由于它对湿地的文化十分敏感,又被称为“环境变化指示剂”。丹顶鹤也是世界上著名的文化鸟类,在诗歌、绘画、雕刻、文学、音乐及舞蹈中均有种种表现。 一、生存现状及保护现状 在中国东北和远东地区人类活动对湿地的破坏在1960年代以后急剧加重,对湿地的围垦不仅侵占了原有的栖息地还是原本流通的水系阻断,再加上近年远东地区气候干燥化趋势明显,水域面积缩小严

~~西南大学的童鞋们都来看看吧~关于我们的通识选修课~~ 有...

PS:以下全部内容来自樟树林论坛,非本人观点,如有雷同,不胜荣幸! 注:我们的选课是在2011年3月1日早上8点,童鞋们下手要早啊! 2011年3月1日早上9点全国大学英语四级成绩公布,以下省略748字!!! 开始进入正题:换字体了 中国现当代文学名篇导读:老师说偶尔会点名,不过貌似没点过,考试是一篇关于中国现当代的论文,3000字,手写 老师讲课挺好的,主要是挑一些文学名篇来讲,像“再别康桥”这些的 健康教育:每节课豆要签到,不过那个可以代签的,考试时开卷考试,考前一节课一定要到教室听老师讲重点 讲的内容就是“健康教育”这方面的,想了解的同学可以去上,我们宿舍的貌似都不喜欢呢 动物行为学:点名方式是偶尔抽查几个人,像我就是被抽查过的,考试方式是开卷,考前一节课会画重点,不过考试时间不一定是最后一堂课,提前了也不一定的 喜欢动物的童鞋可以选修,挺好玩的,就讲一些小动物之类的,有一回放的一个视频我们拷回来看得还挺入迷的 中国民俗:第一节课教务处的来点了下名,后来没点吧,去的人也多,考试内容是交一篇关于自己家乡民俗的论文 老师讲课还好吧,但是他普通户平翘舌部分,听得我有点纠结的说 食用菌学:点名的话是挨个位子登记过去了,我们上课点过两次名。考试方式是开卷 喜欢蘑菇的童鞋可以选修这门课,就是讲蘑菇。我们现在就在研究吃啥蘑菇好,上课上得觉得蘑菇最好了

世界名花鉴赏第一次点名。一次小作业,开卷考试,有重点、有范围。 基础教育课程改革随机点三次名。中期作业一篇论文,开卷考试,不划重点。 班主任工作随机点名,次数不定。中期作业一次,开卷考试。 论语课一般都点名,最后交论文。交论文时是一个一个过的。 二胡课不点名,最后交一篇心得体会即可。 市场营销名单在教室里传着签字的点名方式,最后开卷考试。 计算机信息基础第一次上课点名,划重点,闭卷考试。不过不难。 逻辑学不点名。但是课间做至少三次作业,而且当场交,属变个方式点名。开卷。 太极养生每次都点。每天上完课后写一篇心得体会,最后交。当场检查考试。 健身气功同上。 人生美学点名三次,中期作业一次。最后一篇小论文,2000以上都行。 生命科学导论点名三次,最后一篇相关论文,3000字左右。 整形美容,建议大家都可以选选。老师实在是太好:第一节课就说明:我知道大家都很忙,都没时间来。于是第一节课就把论文题目给说了,然后说不会点名啊什么的,哪周的那节课你来把论文交了就行了。事实的确如此,虽然猫猫经常还是回去,但是老师的确没说谎,很多人基本就没去过,就交了一个论文,轻松上80 街舞,每节课必须去,当然有街舞基础的可以翘几节课......老师街舞实在是跳得好.........最后基本人人轻松过,除非(实在是 哦,这次选的论语要点,但是有时点只是个过场,不会记下来的~考试是论文~老师是个可爱的老爷爷,不过是重庆话授课哦,外省同学慎选~ 中国古代小说鉴赏,老师第一节课就会说不点名,也允许我们吃东西睡觉或者散步,囧,考试是交三千字论文,我还没有写。。。T T 大学音乐,很少点吧,但是上课不太好玩,不喜欢老师教的歌,考试很简单,上去唱首歌。。。不过很好过~ 日本通俗文化,上课的时候老师放视频,自己消失不见。。。点名应该点得不多,但是从成绩来看我估计被点到过,哈哈~考试是交论文~

农业信息化课程论文

遥感技术在农作物估产中的应用 摘要:遥感估产是基于作物特有的波谱反射特征,利用遥感手段对作物产量进行监测预报的一种技术,在农业发展中具有传统的统计方法不可比拟的优势,能客观、动态、快速、精准地获得农作物长势、产量等信息。遥感技术必须与其它工具相结合,才能更好地估产。本文主要研究了遥感技术在农作物估产中的应用,先介绍了遥感估产的基本原理和方法,分析了几种与遥感技术结合的估产模型的优劣;然后以冬小麦和玉米为例,介绍了两种遥感估产模型;最后,分析了现有遥感估产存在的问题和遥感估产的发展方向,为遥感估产的进一步研究提供了方向和思路。 关键字:遥感技术,农业,估产 The Application of Remote Sensing Technology in Estimating Crop Yield Abstract Estimating crop yield by remote sensing is a technology monitoring and forecasting crop yield by remote sensing based on specific spectrum characteristics of crop. It has incomparable advantages compared with traditional statistical methods in the development of agriculture and it can acquire growing and yield information of crops in a object,dynamic,fast and accurate way. To estimating crop yield better, remote sensing technology must be combined with other technologies. In this paper, the application of remote sensing technology in estimating crop yield is introduced. To begin with, the basic theory and method of estimating crop yield by remote sensing are mentioned, then the merits and demerits of the estimating models integrated into remote sensing are analyzed. Finally, the existing problems and prospect are statemented, which proposed direction and thoughts for next researches. Key words Remote Sensing Technology,Agriculture,Yield Estimation

保护生物学复习提纲2017

保护生物学课程复习提纲(2017) 重要名词: (1)保护生物学 Conservation Biology: Definitions 什么是保护生物学? “The applied science of maintaining the earth’s biologicaldiversity” M. Hunter, 1996维护地球生物多样性的应用科学 “The new, multidisciplinary science that has developed todeal with the crisis confronting biologicaldiversity….Conservation biology should be considered acrisis discipline." R. Primack 1993 新的、多学科、应对生物多样性的危机 (2)生物多样性 Biodiversity, orbiological diversity= the sum of anarea’s organisms 物种多样性 遗传多样性 生态系统多样性 (3)物种 自由交配,后代可育(生物学) 一组生物的个体,其形态、生理和生化特征与其他个体显著不同,能够相互区分(形态学) (4)种群 “A population may be defined organisms of the same species aoscacugpryoiunpg oaf particular space at a particular time.”(Charles J. Krebs, Ecology, 4th edition) “种群可以定义为占有特定的空间和时间的同一物种的一组有机体。” 种群是遗传多样性的容器 (5)生态系统 (6)生态系统服务功能 直接产品提供:淡水资源、食品、药物、纤维、木材、燃料、遗传基因、生化产

蛋白质组学与分析技术课复习思1考

蛋白质组学与分析技术课复习思考 一、名词解释 1、蛋白质组学: 蛋白质组学是研究与基因对应的蛋白质组的学科,蛋白质组(proteome)一词,源于蛋白质(protein)与基因组(genome)两个词的杂合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。 2、二维(双向)电泳原理: 根据蛋白质的等电点和相对分子质量的特异性将蛋白质混合物在第一个方向上按照等电点高低进行分离,在第二个方向上按照相对分子质量大小进行分离。二维电泳分离后的蛋白质点经显色,通过图象扫描存档,最后是呈现出来的是二维方向排列的,呈漫天星状的小原点,每个点代表一个蛋白质。 3、三步纯化策略: 第一步:粗提。纯化粗样快速浓缩(减少体积) 和稳定样品(去除蛋白酶) 最适用层析技术: 离子交换/疏水层析 第二步:中度纯化。去除大部分杂质 最适用层析技术: 离子交换/疏水层析 第三步:精细纯化。达到最终纯度(去除聚合物,结构变异物) 最适用层析技术:凝焦过滤/离子交换/疏水层析/反相层析 4、高效纯化策略 在三步纯化蛋白质过程中,同时考虑到纯化的速度、载量、回收率及分辨率的纯化策略。5、离子交换色谱: 离子交换色谱中的固定相是一些带电荷的基团,这些带电基团通过静电相互作用与带相反电荷的离子结合。如果流动相中存在其他带相反电荷的离子,按照质量作用定律,这些离子将与结合在固定相上的反离子进行交换。固定相基团带正电荷的时候,其可交换离子为阴离子,这种离子交换剂为阴离子交换剂;固定相的带电基团带负电荷,可用来与流动相交换的离子就是阳离子,这种离子交换剂叫做阳离子交换剂。阴离子交换柱的功能团主要是-NH2,及-NH3 :阳离子交换剂的功能团主要是-SO3H及-COOH。其中-NH3 离子交换柱及-SO3H离子交换剂属于强离子交换剂,它们在很广泛的pH范围内都有离子交换能力;-NH2及-COOH 离子交换柱属于弱离子交换剂,只有在一定的pH值范围内,才能有离子交换能力。离子交换色谱主要用于可电离化合物的分离,例如,氨基酸自动分析仪中的色谱柱,多肽的分离、蛋白质的分离,核苷酸、核苷和各种碱基的分离等。 6、吸附色谱 吸附色谱系色谱法之一种,利用固定相吸附中对物质分子吸附能力的差异实现对混合物的分离,吸附色谱的色谱过程是流动相分子与物质分子竞争固定相吸附中心的过程。洗脱次序∶一般为正相,即:极性低的先被洗脱。 7、PCR扩增 PCR技术(polymerase chain reaction)技术能把单个目的基因大量扩增,这个方法必须在已知基因序列或已知该基因所翻译的氨基酸序列。进而推断出因序列的情况下使用。PCR 的每次扩增循环包括三步:1)变性,在高温下把双链靶DNA拆开;2)在较低的温度下使

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