多特征融合的蛋白质相互作用位点预测

多特征融合的蛋白质相互作用位点预测

程家兴;杜秀全;王池社

【摘要】蛋白质相互作用位点预测为蛋白质功能和药物设计的理解提供重要线索.而蛋白质的各种特征为蛋白质相互作用位点预测提供了大量有用信息,特别是进化信息、残基序列邻近和空间邻近性.不同的蛋白质特征对蛋白质间的相互作用的贡献也不一样.通过提取蛋白质序列谱、保守性和残基熵,提出了特征融合技术对蛋白质相互作用位点进行研究,采用SVM构建三种预测器,分别对各种不同的特征加以验证,实验结果表明了基于特征融合方法的有效性和正确性.

【期刊名称】《计算机工程与应用》

【年(卷),期】2009(045)016

【总页数】4页(P50-52,59)

【关键词】蛋白质相互作用位点;蛋白质特征;序列谱;残基保守性;残基熵;支持向量机

【作者】程家兴;杜秀全;王池社

【作者单位】安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,合肥,230039;安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,合肥,230039;安徽大学,计算智能与信号处理教育部重点实验室,合肥,230039

【正文语种】中文

【中图分类】工业技术