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使用autodock4在linux下进行批量对接(命令行)

使用autodock4在linux下进行批量对接(命令行)
使用autodock4在linux下进行批量对接(命令行)

使用Autodock4在Linux下进行批量对接(命令行)

1.安装

1.从官方网站下载MGLTools 和Autodock4压缩包,按说明解压安装。

2.准备MGLTools应用程序:安装完成后,将./mgltools_i86Linux**/MGLToolsPckgs/AutoDockTools/Utilities24目录下的所有应用程序拷贝到个人工作目录。再将./mgltools_i86Linux**/bin目录下的pythonsh应用程序拷贝到工作目录。

3.将autodock4压缩包中的Autogrid4和Autodock4也放到工作目录。

2.使用

1.下载对接的配体和受体文件(*.pdb格式)。进入工作目录。

2.将PDB格式文件转换成Autodock识别的PDBQT文件:

./pythonsh prepare_ligand4.py –l ligand.pdb

./pythonsh prepare_receptor4.py –r receptor.pdb –A hydrogens –U waters

3.准备autogrid4参数文件:

./pythonsh prepare_gpf4.py –l ligand.pdbqt –r receptor.pdbqt

4.准备autodock4参数文件:

./pythonsh prepare_dpf4.py –l ligand.pdbqt –r receptor.pdbqt

5.运行Autogrid4:

./autogrid4 –p receptor.gpf

6.运行Autodock4:

./autodock4 –p ligand_receptor.dpf

3.结果分析

Autodock 对接结果记录在*.dlg文件中,用Estimated free energy of binding值评价对接结果,值越低表示越容易结合。

从*.dlg文件中提取Estimated free energy of binding值:

egrep ‘DOCKD:USER Run|Cluster|Rank|RMSD from reference structure|USER Estimated’ *.dlg

后记:

本人在使用以上方法进行批量对接过程中,偶尔有报错情况,但大部分对接能跑出结果。祝君好运!O(∩_∩)O哈哈~

linux常用命令

新手刚刚接触Linux的时候可能处处感到不便,不过没有关系,接触新的事物都有这样的一个过程,在你用过Linux一段时间后,你就会逐渐了解Linux其实和Windows一样容易掌握。 由于操作和使用环境的陌生,如果要完全熟悉Linux的应用我们首先要解决的问题就是对Linux常用命令的熟练掌握。本章我们就来介绍Linux的常用基本命令。 Linux常用命令 1.Linux命令基础 Linux区分大小写。在命令行(shell)中,可以使用TAB键来自动补全命令。即可以输入命令的前几个字母,然后按TAB键,系统自动补全命令,若不止一个,则显示出所有和输入字母相匹配的命令。 按TAB键时,如果系统只找到一个和输入相匹配的目录或文件,则自动补全;若没有匹配的内容或有多个相匹配的名字,系统将发出警鸣声,再按一下TAB键将列出所有相匹配的内容(如果有的话)以供用户选择。 首先启动Linux。启动完毕后需要进行用户的登录,选择登陆的用户不同自然权限也不一样,其中―系统管理员‖拥有最高权限。 在启动Linux后屏幕出现如下界面显示:Red Hat Linux release 9 (Shrike) Kernel 2.4.20.8 on an i686

login: 输入:root(管理员名)后,计算机显示输口令(password:),输入你的口令即可。当计算机出现一个―#‖提示符时,表明你登录成功! 屏幕显示Linux提示符:[root@localhost root]#_ 这里需要说明的是―Red Hat Linux release 9 (Shrike)‖表示当前使用的操作系统的名称及版本。―2.4.20.8‖表示Linux操作系统的核心版本编号。―i686‖表示该台电脑使用的CPU的等级。 下面我们来介绍常用基本命令 一,注销,关机,重启 注销系统的logout命令 1,Logout 注销是登陆的相对操作,登陆系统后,若要离开系统,用户只要直接下达logout命令即可: [root@localhost root]#logout

linux申请端口

linux申请端口 LINUX开启允许对外访问的网络端口 LINUX通过下面的命令可以开启允许对外访问的网络端口: /sbin/iptables -I INPUT -p tcp --dport 8000 -j ACCEPT #开启8000端口 /etc/rc.d/init.d/iptables save #保存配置 /etc/rc.d/init.d/iptables restart #重启服务查看端口是否已经开放 /etc/init.d/iptables status 想查看TCP或者UDP端口使用情况,使用 stat -anp 如果有些进程看不见,如只显示”-”,可以尝试 sudo stat -anp 如果想看某个端口的信息,使用lsof命令,如: sudo lsof -i :631 -bash-3.00# stat -tln

stat -tln 命令是用来查看linux的端口使用情况 /etc/init.d/vsftp start 是用来启动ftp端口~! 看文件/etc/services stat 查看已经连接的服务端口(ESTABLISHED) stat -a 查看所有的服务端口(LISTEN,ESTABLISHED) sudo stat -ap 查看所有的服务端口并显示对应的服务程序名 nmap <扫描类型><扫描参数> 例如:

nmap localhost nmap -p 1024-65535 localhost nmap -PT 192.168.1.127-245 当我们使用 stat -apn 查看网络连接的时候,linux会发现很多类似下面的内容: Proto Recv-Q Send-Q Local Address Foreign Address State PID/Program name tcp 0 52 218.104.81.152:7710 211.100.39.250:29488 ESTABLISHED 6111/1 显示这台服务器开放了7710端口,那么这个端口属于哪个程序呢?我们可以使用 lsof -i :7710 命令来查询: MAND PID USER FD TYPE DEVICE SIZE NODE NAME sshd 1990 root 3u IPv4 4836 TCP *:7710 (LISTEN) 这样,我们就知道了7710端口是属于sshd程序的。

Linux常用命令大全.pdf

Linux常用命令学习 1、ls命令 就是list的缩写,通过ls 命令不仅可以查看linux文件夹包含的文件,而且可以查看文件权限(包括目录、文件夹、文件权限)查看目录信息等等 常用参数搭配: ls -a 列出目录所有文件,包含以.开始的隐藏文件 ls -A 列出除.及..的其它文件 ls -r 反序排列 ls -t 以文件修改时间排序 ls -S 以文件大小排序 ls -h 以易读大小显示 ls -l 除了文件名之外,还将文件的权限、所有者、文件大小等信息详细列出来 实例: (1) 按易读方式按时间反序排序,并显示文件详细信息 ls -lhrt (2) 按大小反序显示文件详细信息 ls -lrS (3)列出当前目录中所有以“t”开头的目录的详细内容 ls -l t* (4) 列出文件绝对路径(不包含隐藏文件) ls | sed "s:^:`pwd`/:" (5) 列出文件绝对路径(包含隐藏文件) find $pwd -maxdepth 1 | xargs ls -ld 2、cd命令 (changeDirectory),命令语法:cd [目录名]。说明:切换当前目录至dirName 实例: (1)进入要目录 cd /

(2)进入"家"目录 cd ~ (3)进入上一次工作路径 cd - (4)把上个命令的参数作为cd参数使用。 cd !$ 3、pwd命令 查看当前工作目录路径 实例: (1)查看当前路径 pwd (2)查看软链接的实际路径 pwd -P 4、mkdir命令 创建文件夹 可用选项: -m: 对新建目录设置存取权限,也可以用chmod命令设置; -p: 可以是一个路径名称。此时若路径中的某些目录尚不存在,加上此选项后,系统将自动建立好那些尚不在的目录,即一次可以建立多个目录; 实例: (1)当前工作目录下创建名为t的文件夹 mkdir t (2)在tmp目录下创建路径为test/t1/t的目录,若不存在,则创建 mkdir -p /tmp/test/t1/t 5、rm命令 删除一个目录中的一个或多个文件或目录,如果没有使用- r选项,则rm不会删除目录。如果使用rm 来删除文件,通常仍可以将该文件恢复原状 rm [选项] 文件… 实例:

Linux常用命令详解(配合示例说明,清晰易懂)

Linux常用命令详解 (常用、详细) BISTU 自动化学院 刷碗小工(frisen.imtm) 2010年11月 开源社区,造福大家,版权所有,翻录不究(初次接触Linux命令可能对以下说明有不少疑问,可待看完一遍后再回头细看) (配合Ctrl + F可快速查找你想了解的命令)

索引:(待完善) 文件说明:Linux命令很多,但最常用的80个左右 文档内容充实,用示例说明命令如何使用笔者力求语言简洁,清晰易懂 由于忙于其他事情,改进排版的工作只能搁置了 最后,望此文档能为大家Linux学习之路献微薄之力 一、路径: 执行命令前必须要考虑的一步是命令的路径,若是路径错误或是没有正确的指定,可能导致错误的执行或是找不到该命令。要知道设置的路径,可执行以下命令: 一般而言,本书的命令位于/bin、usr/bin、/sbin、/usr/sbin之中。若读者执行了命令却出现“command not find”或是“命令不存在”的字样,就必须要确定该命令的位置是否在命令的路径中,或是系统上根本没有安装该套件。 二、命令顺序: 若在shell内置的命令/bin以及/usr/bin之下都出现了命令pwd,那当我们执行该命令时,会执行哪一个?答案是第一优先执行shell内置的命令,再执行路径中的设置;因此若有相同名称的命令时,必须要注意顺序设置,或是直接输入完整路径。 三、参数(或称选项)顺序: 一般除了特殊情况,参数是没有顺序的。举例而言,输入“–a –v”与输入“–v –a”以及“–av”的执行效果是相同的。但若该参数后指定了要接的文件或特殊对象,如“–a cmd1 –v cmd2”,则不能任意改变选项顺序。 四、常用参数: 下面所列的是常见的参数(选项)意义: --help,-h 显示帮助信息 --version,-V 显示版本信息 -v 繁琐模式(显示命令完整的执行过程) -i 交谈模式(指定界面) -l 长列表输出格式 -q,-s 安静模式(不显示任何输出或错误信息) -R 递归模式(连同目录下所有文件和子目录一起处理) -z 压缩 五、命令的结合与定向: 命令中除了一般命令外,还有管道(或称途径)(|)与定向(>或>>)。 管道(途径)的用法: “命令一[选项]”| “命令二[选项]”,也就是将“命令一[选项]”的输出结果传到“命令二[选项]”,通过命令二的处理之后才输出到标准输出(屏幕)上。比如“ls /etc”会列出etc下的所有文件,若加上“| less”,也就是“ls /etc | less”,则会将“ls /etc”的结果通过less分页输出。 定向的用法: 将结果定向到命令的输出设备,一般不加文件名意为将结果输出到屏幕,若是在定向后加上文件名,则会将命令的执行结果输出到定向的文件,例如“ls > temp.txt”,就会将ls 的结果输出到文件temp.txt中。“>”与“>>”的差异在于前者是覆盖,而后者是附加。 六、命令中的命令: 许多命令在执行后,会进入该命令的操作模式,如fdisk、pine、top等,进入后我们必须要使用该命令中的命令,才能正确执行;而一般要退出该命令,可以输入exit、q、quit或是按【Ctrl+C】组合

Linux命令以及客户端工具的使用

一.终端工具:SecureCRT-v6.58H SecureCRT是一款支持SSH(SSH1和SSH2)的终端仿真程序,同时支持Telnet和rlogin 协议。SecureCRT是一款用于连接运行包括Windows、UNIX和VMS的远程系统的理想工具。通过使用内含的VCP命令行程序可以进行加密文件的传输。有流行CRTTelnet客户机的所有特点,包括:自动注册、对不同主机保持不同的特性、打印功能、颜色设置、可变屏幕尺寸、用户定义的键位图和优良的VT100,VT102,VT220和ANSI竞争.能从命令行中运行或从浏览器中运行.其它特点包括文本手稿、易于使用的工具条、用户的键位图编辑器、可定制的ANSI颜色等.SecureCRT的SSH协议支持DES,3DES和RC4密码和密码与RSA鉴别. 1)运行SecureCRT.exe,点击【文件】菜单-【连接】-设置如上图 2)此工具有Ftp上传功能,只能当个文件上传,【文件】-连接SFTP 标签页 二.基本命令 1.vim,vi打开,nano等也可以(*.sh,*.txt,*.xml等文本类型的) 1)编辑文件 -vim filename 打开文件 -i 进行编辑 -d 删除信息 -q! 退出不保存 -wq 保存并退出 ctrl+c 可以返回命令行 2. dir 单列显示文件列表ls 一列可以显示多个文件 3. netstat - anp | grep 端口号(8080)看此端口是否被占用 kill -9 端口号进程编号(杀掉进程) 4. cp -rf sourcefile newfile 复制文件 5. mv -if 原文件名新文件名 6. tomcat tail -f logs/catalina.out(查看tomcat的控制台动态输出) cat ../logs/catalina.out(查看tomcat的输出静态日志) 7.rpm是包文件,使用rpm -ivh +文件名进行安装,rpm -e +包名进行卸载。 zip,是压缩包,使用unzip +包名进行解压。 rar的话可以下载一个unrar,编译安装后就可以时用unrar e +文件名进行解压了。 由于linux下后缀名有可能是错误的,所以请使用file +文件名,判断文件的类型。 对于常见的*.tar.gz或者*.tgz,使用tar -xzvf进行解压 *.tar.bz2则使用tar -xjvf进行解压。

Linux基本命令大全

下面我们来介绍常用基本命令 一、注销,关机,重启 注销系统的logout命令 1,Logout 注销是登陆的相对操作,登陆系统后,若要离开系统,用户只要直接下达logout命令即可: [root@localhost root]#logout Red Hat Linuxrelease 9(Shike) Kernel 2.4.20.8 on an i686 Login: ←回到登陆的画面 2,关机或重新启动的shutdown命令 Shutdown命令可以关闭所有程序,依照用户的需要,重新启动或关机。 参数说明如下: λ立即关机:-h 参数让系统立即关机。范例如下: [root@localhost root]#shutdown –h now ←要求系统立即关机 λ指定关机时间:time参数可指定关机的时间;或设置多久时间后运行shutdown命令,范例如下: [root@localhost root]#shutdown now ←立刻关机 [root@localhost root]#shutdown +5 ←5分钟后关机 [root@localhost root]#shutdown 10:30 ←在10:30时关机 关机后自动重启:-rλ参数设置关机后重新启动。范例如下: [root@localhost root]#shutdown -r now ←立刻关闭系统并重启 [root@localhost root]#shutdown -r 23:59 ←指定在23:59时重启动 3,重新启动计算机的reboot命令 顾名思义,reboot命令是用来重新启动系统的。常用的参数如下: λ-f 参数:不依正常的程序运行关机,直接关闭系统并重新启动计算机。 -Iλ参数:在在重新启动之前关闭所有网络接口。 虽然reboot命令有个参数可以使用,但是一般只需要单独运行reboot命令就可以了 二、文件与目录的操作 列出文件列表的ls命令 1,ls(list)命令是非常有用的命令,用来显示当前目录中的文件和子目录列表。配合参数的使用,能以不同的方式显示目录内容。范例如下: ? 显示当前目录的内容: [tony@free tony]$ ls Desktop mail myinstall.log test.txt ←有两个目录及两个文件夹 ? 当运行ls命令时,并不会显示名称以―.‖开头的文件。因此可加上―-a‖参数指定要列出这些文件。范例如下: [tony@free tony]$ ls –a ? 以―-s‖参数显示每个文件所有的空间,并以―-S‖参数指定按所有占用空间的大小排序。范例如下: [tony@free tony]$ ls –s –S 总计36 4 Desktop 4 mail 24 myinstall.log 4 test.txt ? 在ls命令后直接加上欲显示的目录路径,就会列出该目录的内容。范例如下: [tony@free tony]$ ls –l/usr/games 2,切换目录的cd命令

Linux中如何查看服务及监听端口

linux教程:实例:Linux中如何查看服务及监听端口 问:我该如何发现哪种服务正在某个特定端口上监听呢?我如何发现哪一个程序正在一个特定端口上监听呢? 答:在*NIX系统中,你可以使用下面的任何一个命令来得到在一个特定TCP端口上监听的列表。 Ls of:其功能是列示打开的文件,包括监听端口。 nets tat :此命令象征性地展示各种与网络有关的数据和信息的内容。 Ls of命令示例 你可以输入下面的命令来查看IPv4端口: # ls of -Pnl +M -i4 你可以输入下面的命令来查看IPv6协议下的端口列示: # ls of -Pnl +M -i6 此例输出: 这里我们不妨解释一下。第一栏是command,它给出了程序名称的有关信息。请注意标题的细节。例如,第二行的gweather* 命令从美国NW S服务器(140.90.128.70)获取天气的报告信息,包括交互天气信息网络和其它的天气服务。在这里,我们解释一下命令各个参数。

1. -P :这个选项约束着网络文件的端口号到端口名称的转换。约束转换可以使ls of运行得更快一些。在端口名称的查找不能奏效时,这是很有用的。 2. -n : 这个选项约束着网络文件的端口号到主机名称的转换。约束转换可以使ls of的运行更快一些。在主机名称的查找不能奏效时,它非常有用。 3. -l :这个选项约束着用户ID号到登录名的转换。在登录名的查找不正确或很慢时,这个选项就很有用。 4. +M :此选项支持本地TCP和UDP端口映射程序的注册报告。 5. -i4 :仅列示IPv4协议下的端口。 6. -i6 : 仅列示IPv6协议下的端口。 Nets taty命令举例 请输入下面的命令: # nets tat -tulpn 或者是 # nets tat -npl 请看输出结果::

Red_Hat_Linux常用命令汇总

[资料] Red Hat Linux常用命令汇总 Linux 常用命令汇总 ls命令: 1. ls //列出当前目录的文件和文件夹 2. ls –a //列出当前目录的文件和文件夹,包含隐藏文件 3. ls –l //列出详细信息 4. ls 目录 //列出某目录下的文件 pwd命令 //查看当前所在位置 du 命令 1. du 目录 //查看目录的总容量以及子目录的容量 2. du –s 目录 //查看目录总容量 cd 命令 1.cd .. //回上一级目录 2.cd / //回根目录 3. cd //回用户主目录 4.cd 目录路径 //去某目录 mkdir 目录名 //创建目录 rmdir 空目录名 //删除空目录 rm 文件名 //删除文件 rm –rf 目录名 //删除目录以及目录下所有文件 mount 命令 1.mount /dev/cdrom /mnt/cdrom //挂载光驱到 /mnt/cdrom目录下2.mount -t vfat /dev/sda1 /mnt/u //挂载U盘到 /mnt/u目录下

3. umount /mnt/cdrom //卸载光驱 fdisk –l //查看本机存储设备 file 文件名 //查看文件类型 find 目录名–name “*.c” //在某目录下查找文件为*.c的文件 whereis 文件名 //查找文件在哪些目录下 cat 文件名 //显示文件内容 cat 文件名 | grep 文字 //只显示包含文字相关的内容 cat 文件名 | more //分页显示文件内容 tail 文件名 //查看文件末尾 head 文件名 //从头查看文件 cp 命令: cp 文件1 文件2 //复制文件1 到文件2 cp 文件1 目录1 //复制文件1到目录1下 cp 目录1/文件1 目录2 //复制目录1下的文件1到目录2下 cp –r 目录1 目录2 //复制目录1下所有内容到目录2 mv 命令: mv 文件1 文件2 //重命名文件1为文件2 mv 文件1 目录1 //移动文件1到目录1下 mv 目录1/文件1 目录2 //移动目录1下的文件1到目录2下 mv –r 目录1 目录2 //移动目录1下所有内容到目录2 chmod 命令: chmod u+x g+r o-w 文件名 //为文件设置权限(用户,组,其他人)chmod 744 文件名 //为文件设置权限(1-执行,2-写,4-读) chown 命令: chown 用户文件名 //把文件改为用户所有

红帽linux常用操作命令

红帽linux常用操作命令 1.查看硬件信息 # uname -a # 查看内核/操作系统/CPU信息 # head -n 1 /etc/issue # 查看操作系统版本 # cat /proc/cpuinfo # 查看CPU信息 # hostname # 查看计算机名 # lspci -tv # 列出所有PCI设备 # lsusb -tv # 列出所有USB设备 # lsmod # 列出加载的内核模块 # env # 查看环境变量资源 # free -m # 查看内存使用量和交换区使用量# df -h # 查看各分区使用情况 # du -sh # 查看指定目录的大小 # grep MemTotal /proc/meminfo # 查看内存总量 # grep MemFree /proc/meminfo # 查看空闲内存量 # uptime # 查看系统运行时间、用户数、负载# cat /proc/loadavg # 查看系统负载磁盘和分区 # mount | column -t # 查看挂接的分区状态 # fdisk -l # 查看所有分区 # swapon -s # 查看所有交换分区 # hdparm -i /dev/hda # 查看磁盘参数(仅适用于IDE设备) # dmesg | grep IDE # 查看启动时IDE设备检测状况网络# ifconfig # 查看所有网络接口的属性 # iptables -L # 查看防火墙设置 # route -n # 查看路由表 # netstat -lntp # 查看所有监听端口 # netstat -antp # 查看所有已经建立的连接 # netstat -s # 查看网络统计信息进程

linux查看tomcat端口命令行_linux查看tomcat端口命令(Word可编辑版)

linux查看tomcat端口命令行_linux查看 tomcat端口命令 (最新版) -Word文档,下载后可任意编辑和处理- linux下tomcat服务是经常进行操作的一个服务,那我们要怎么查看tomcat端口信息呢?下面由烟花美文网小编为大家整理了linux查看tomcat端口命令的相关知识,希望对大家有帮助! linux查看tomcat端口命令详解 1.linux查看Tomcat端口命令 执行命令$netstat -nat能列出tomcat占据的端口,8080及其它类似的端口是需要注意的。这命令也需要Tomcat启动了。 netstat -nat Active Internet connections Proto Recv-Q Send-Q Local Address Foreign Address State tcp 0 0 0.0.0.0:60000 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 127.0.0.1:2208 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:2049 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:5801 0.0.0.0:* LISTEN

tcp 0 0 0.0.0.0:523 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:5901 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:877 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:51343 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:111 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:6001 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:785 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:946 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:5811 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:5911 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 127.0.0.1:631 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 127.0.0.1:25 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 9.47.228.61:443 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 0.0.0.0:6011 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 127.0.0.1:2207 0.0.0.0:* LISTEN tcp 0 0 9.47.228.61:60000 9.47.228.61:33664 ESTABLISHED tcp 0 0 9.47.228.61:60000 9.47.228.61:53605 ESTABLISHED tcp 0 0 9.47.228.61:60000 9.47.228.61:51221 ESTABLISHED 补充:linux查看tomcat进程命令 2.查看Tomcat进程 执行命令$ps -ef|grep tomcat 你就能找出tomcat占据的进程号,当然这要求tomcat启动了。

入门学习Linux常用必会60个命令实例详解

入门学习Linux常用必会60个命令实例详解 Linux必学的60个命令 Linux提供了大量的命令,利用它可以有效地完成大量的工作,如磁盘操作、文件存取、目录操作、进程管理、文件权限设定等。所以,在Linux系统上工作离不开使用系统提供的命令。要想真正理解Linux系统,就必须从Linux命令学起,通过基础的命令学习可以进一步理解Linux系统。 不同Linux发行版的命令数量不一样,但Linux发行版本最少的命令也有200多个。这里笔者把比较重要和使用频率最多的命令,按照它们在系统中的作用分成下面六个部分一一介绍。 ◆安装和登录命令:login、shutdown、halt、reboot、install、mount、umount、chsh、exit、last; ◆文件处理命令:file、mkdir、grep、dd、find、mv、ls、diff、cat、ln; ◆系统管理相关命令:df、top、free、quota、at、lp、adduser、groupadd、kill、crontab; ◆网络操作命令:ifconfig、ip、ping、netstat、telnet、ftp、route、rlogin、rcp、finger、mail、nslookup; ◆系统安全相关命令:passwd、su、umask、chgrp、chmod、chown、chattr、sudo ps、who; ◆其它命令:tar、unzip、gunzip、unarj、mtools、man、unendcode、uudecode。本文以Mandrake Linux 9.1(Kenrel 2.4.21)为例,介绍Linux下的安装和登录命令。immortality按:请用ctrl+f在本页中查找某一部分的内容或某一命令的用法。 -------------------------------------------------------------------------------- Linux必学的60个命令(1)-安装与登陆命令 login 1.作用 login的作用是登录系统,它的使用权限是所有用户。 2.格式 login [name][-p ][-h 主机名称] 3.主要参数

Linux系统信息查看命令大全

# uname -a # 查看内核/操作系统/CPU信息 # head -n 1 /etc/issue # 查看操作系统版本 # cat /proc/cpuinfo # 查看CPU信息 # hostname # 查看计算机名 # lspci -tv # 列出所有PCI设备 # lsusb -tv # 列出所有USB设备 # lsmod # 列出加载的内核模块 # env # 查看环境变量 资源 # free -m # 查看内存使用量和交换区使用量 # df -h # 查看各分区使用情况 # du -sh <目录名> # 查看指定目录的大小 # grep MemTotal /proc/meminfo # 查看内存总量 # grep MemFree /proc/meminfo # 查看空闲内存量 # uptime # 查看系统运行时间、用户数、负载 # cat /proc/loadavg # 查看系统负载 磁盘和分区 # mount | column -t # 查看挂接的分区状态 # fdisk -l # 查看所有分区 # swapon -s # 查看所有交换分区 # hdparm -i /dev/hda # 查看磁盘参数(仅适用于IDE设备) # dmesg | grep IDE # 查看启动时IDE设备检测状况 网络 # ifconfig # 查看所有网络接口的属性 # iptables -L # 查看防火墙设置 # route -n # 查看路由表 # netstat -lntp # 查看所有监听端口 # netstat -antp # 查看所有已经建立的连接 # netstat -s # 查看网络统计信息

Linux基本命令(带参考答案)

实训项目2 Linux基本命令 一、实训目的 ●掌握Linux各类命令的使用方法; ●熟悉Linux操作环境。 二、实训内容 练习使用Linux常用命令,达到熟练应用的目的。 三、实训步骤 子项目1.文件和目录类命令的使用 (1)启动计算机,利用root用户登录到系统,进入字符提示界面。练习使用cd命令 (2)用pwd命令查看当前所在的目录。 pwd命令用于显示用户当前所在的目录。如果用户不知道自己当前所处的目录,就可以使用这个命令获得当前所在目录 (3)用ls命令列出此目录下的文件和目录。 然后,使用ls命令,并用-a选项列出此目录下包括隐藏文件在内的所有文件和目录。 最后,用man命令查看ls命令的使用手册。 补充说明浏览信息内容:(以下面图片为例) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1属性:- 代表文件,l代表链接文件,d代表目录 2 所有者权限(文件权限):具有r 读w 写没有x 执行

3 同组用户权限(文件权限):只读r 4 其他人权限(文件权限):只读r 5 链接数:1 6 文件拥有者:root 7 文件所属组:root 8 文件大小:8字节 9 创建或修改日期:2月21日 10 创建或修改时间:18:42 11 文件或目录名称 (4)在当前目录下,创建测试目录test。利用ls或ll命令列出文件和目录,确认test 目录创建成功。然后进入test目录,利用pwd查看当前工作目录。 mkdir命令用于创建一个目录。 该命令的语法为:mkdir [参数] 目录名 常用参数–p:如果父目录不存在,则同时创建该目录及该目录的父目录。 (5)利用cp命令复制系统文件/etc/profile到当前目录下。 # cp /etc/profile . (6)复制文件profile到一个新文件profile.bak,作为备份。 # cp profile profile.bak (7)用ll命令以长格形式列出当前目录下的所有文件,注意比较每个文件的长度和创建时间的不同。 (8)用less命令分屏查看文件profile的内容,注意练习less命令的各个子命令,如b、p、q等,并对then关键字查找。 注意:可以通过less - -help 命令查看帮助 less命令是more命令的改进版,比more命令的功能强大。more命令只能向下翻页,而less命令可以向下、向上翻页,甚至可以前后左右的移动。 执行less命令后,进入了less状态,按【Enter】键可以向下移动一行,按【space】键可以向下移动一页;按【b】键可以向上移动一页;也可以用光标键向前、后、左、右移动;按【q】键可以退出less命令。

Linux操作系统常用的网络状态查询命令

Linux操作系统常用的网络状态查询命令 对于做系统运维的工程师来说,经常会在客户那面临这些问题:怎么网关不通?怎么端口被占用了?怎么IP配置不生效?所以掌握如何通过命令行设置IP、路由、排查网络故障的技巧就显得非常重要了,这篇文章给大家介绍下Linux系统中常用的网络状态查询命令:ifconfig | ping | netstat | route | traceroute | nslook | lsof 1. ifconfig 该命令用来显示所有网络接口的详细情况的,例如:IP地址、网关、子网掩码、网口别名、MAC地址等。 ethx是以太网网卡的名称,其实只是系统为其分配的一个别名而已,是可以修改的。 配置文件在/etc/sysconfig/network/ifcfg-ethX中(这是SUSE Linux的路径,不同的操作系统会有些区别,不过大体都差不多的) DEVICE=”eth0″ HWADDR=”00:0C:29:68:C0:8C” NM_CONTROLLED=”yes” ONBOOT=”yes” #设置为yes则开机的时候启动网卡,no为开机时不启动网卡BOOTPROTO=dhcp #dhcp设置为动态获取IP,static则设置为静态获取Ip #IPADDR=192.168.1.5 #设置ip地址 #GATEWAY=192.168.1.1 #设置网关 #NETMASK=255.255.255.0 #设置子网掩码 在配置固定IP时,IPADDR和NETMASK这两个参数是一定要写上的。 2. ping 该命令用于检查网络上某台主机是否为活动状态或是否发生故障。其原理是利用了TCP/IP协议中的IP层中的ICMP协议从特定的主机上返回响应。 如果想禁ping的话,则echo 1 > /proc/sys/net/ipv4/icmp_echo_ignore_all 3. netstat –an 该命令用于显示网络连接、路由表和网络接口信息的。 netstat的参数选项有: a:显示所有套接子的状态。 n:打印实际的地址,加了这个参数速度比较好,消耗内存小。 r:打印路由表。 netstat -an的回显信息说明:LISTEN代表侦听来自远方的TCP端口的连接请求。在本图中,接收来自任何IP的任何端口去连本机的22端口。 ESTABLISHED代表打开的连接情况。 在Linux中,端口机制是如果一个端口被外部的一起请求占用了,系统会自动复制出来一个和原来的端口一模一样的端口进行侦听下一个外部请求。 4. route: 该命令用于查看那系统的路由表信息。 5. traceroute 该命令用于追踪网络数据包的路径,数据包的大小默认为40字节。可以知道数据包到达目的地需要经过几个路由。

linux netstat 统计连接数查看外部 如何查80端口tcp链接数

linux netstat 统计连接数查看外部如何查80端口tcp链接数 时间:2013-03-26 19:14来源:未知作者:admin 点击:2530次 服务器上的一些统计数据: 1)统计80端口连接数 netstat -nat|grep -i "80"|wc -l 2)统计httpd协议连接数 ps -ef|grep httpd|wc -l 3)、统计已连接上的,状态为“established netstat -na|grep ESTABLISHED|wc -l 4)、查出哪个IP地址连接最多,将其封了. netstat -na|grep ESTABLISHED|awk {print $5}|awk -F: {print $1}|sort|uniq -c|sort -r +0n netstat -na|grep SYN|awk {print $5}|awk -F: {print $1}|sort|uniq -c|sort -r +0n --------------------------------------------------------------------------------------------- 1、查看apache当前并发访问数: netstat -an | grep ESTABLISHED | wc -l 对比httpd.conf中MaxClients的数字差距多少。 2、查看有多少个进程数: ps aux|grep httpd|wc -l 3、可以使用如下参数查看数据 server-status?auto #ps -ef|grep httpd|wc -l 1388 统计httpd进程数,连个请求会启动一个进程,使用于Apache服务器。 表示Apache能够处理1388个并发请求,这个值Apache可根据负载情况自动调整。 #netstat -nat|grep -i "80"|wc -l 4341

Linux查看端口使用状态及启动

LINUX网络性能之管理工具三剑客本文是介绍管理Linux查看端口这些输出信息,该命令将显示从每个数据包传出的头和来自主机hostname对端口80的编址。 Netstat -tln 命令是Linux查看端口使用情况 /etc/init.d/vsftp start 是用来启动ftp端口~! 看文件/etc/services netstat Linux查看端口查看已经连接的服务端口(ESTABLISHED) netstat -a Linux查看端口查看所有的服务端口(LISTEN,ESTABLISHED) sudo netstat -ap Linux查看端口查看所有的服务端口并显示对应的服务程序名 nmap <扫描类型><扫描参数> 例如: nmap localhost nmap -p 1024-65535 localhost nmap -PT 192.168.1.127-245 当我们使用netstat -apn查看网络连接的时候,会发现很多类似下面的内容: Proto Recv-Q Send-Q Local Address Foreign Address State PID/Program name tcp 0 52 218.104.81.152:7710 211.100.39.250:29488 ESTABLISHED 6111/1 显示这台开放了7710端口,那么这个端口属于哪个程序呢?我们可以使用lsof -i :7710命令来查询:

COMMAND PID USER FD TYPE DEVICE SIZE NODE NAME sshd 1990 root 3u IPv4 4836 TCP *:7710 (LISTEN)网管联盟这样,我们就知道了7710端口是属于sshd程序的。

linux常用命令集(PDF版)

常用命令集 LINUX常用命令集

cal (10) 使用权限 (10) 使用方式 (10) 说明 (10) 参数 (10) 范例 (10) crontab (11) 使用权限 (11) 使用方式 (11) 说明 (11) 参数 (11) 例子 (11) 注意 (12) date (12) 使用权限 (12) 使用方式 (12) 说明 (12) 参数 (13) 例子 (13) 注意 (14) sleep (14) 使用权限 (14) 使用方式 (14) 说明 (14) 参数 (14) 例子 (14) time (15) 使用权限 (15) 使用方式 (15) 说明 (15) 使用方式 (15) 范例 (17) uptime (17) 使用权限 (17) 使用方式 (18) 说明 (18) 参数 (18) 范例 (18) chfn (18) 使用权限 (18) 用法 (18) 说明 (18) LINUX常用命令集

chsh (19) 使用权限 (19) 用法 (19) 说明 (19) 范例 (19) finger (20) 使用权限 (20) 使用方式 (20) 说明 (20) 范例 (20) last (21) 使用权限 (21) 使用方式 (21) 说明 (21) 参数 (21) login (21) passwd (22) 使用权限 (22) 使用方式 (22) 说明 (22) 参数 (22) who (22) 使用权线 (22) 使用方式 (22) 说明 (23) 参数 (23) cat (23) 使用权限 (23) 使用方式 (23) 说明 (23) 参数 (23) 范例 (23) cd (24) 使用权限 (24) 使用方式 (24) 说明 (24) 范例 (24) chmod (24) 使用权限 (24) 使用方式 (24) 说明 (25) 参数 (25) LINUX常用命令集

linuxnetstat命令查看端口是不是占用

linux 与windows netstat命令查看端口是否占用 netstat命令是一个监控TCP/IP网络的非常有用的工具,它可以显示路由表、实际的网络连接以及每一个网络接口设备的状态信息,这里我只用到其中的部分功能. netstat 的常用参数: - t、- u、- w和- x分别表示TCP、UDP、RAW和UNIX套接字连接。-a标记,还会显示出等待连接(也就是说处于监听模式)的套接字。-l 显示正在被监听(list en)的端口, -n表示直接显示端口数字而不是通过察看/etc/service来转换为端口名,-p选项表示列出监听的程序 1) netstat -tl 查看当前tcp监听端口 Active Internet connections (only servers) Proto Recv-Q Send-Q Local Address Foreign Address State tcp 0 0 *:rrac *:* LISTEN tcp 0 0 *:34006 *:* LISTEN ...... 2) netstat -tlp 查看当前tcp监听端口, 需要显示监听的程序名,当不清楚mysql的监听端口时比较好用Active Internet connections (only servers) Proto Recv-Q Send-Q Local Address Foreign Address State PID/Prog ram name tcp 0 0 *:rrac *:* LISTEN - tcp 0 0 *:34006 *:* LISTEN 23425/mysqld ...... 3) netstat -tl | grep 34006 只查看mysql的监听端口,当前启动的mysql端口为34006,明确知道mysql监听端口时使用 4) netstat -ta | grep 34006 tcp 0 0 *:34006 *:* LISTEN tcp 0 0 linux.local:34006 linux.local:41485 ESTABLISHED tcp 0 0 linux.local:34006 linux.local:41486 ESTABLISHED ... tcp 0 0 10.3.2.35:41488 10.3.2.35:34006 ESTABLISHED tcp 0 0 10.3.2.35:41489 10.3.2.35:34006 ESTABLISHED

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