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PCR步骤

PCR步骤
PCR步骤

PCR实验步骤

一、总RNA提取(此处以提取悬浮细胞RNA为例)

准备:提前预冷低温离心机

1.取出细胞,把细胞转移到离心管中,1000r,离心5min。

2.小心倒掉上清,加入1ml trizol,吹打均匀至液体澄清且无细胞团块后,室温静止5min,然后把所有液体转移到1.5mlEP管中。

3.每1ml trizol加入0.2ml氯仿,向EP管加入氯仿,盖紧盖子,剧烈上下摇晃10s后,室温静止2min。

4.放入已预冷的离心机,4℃,12000rmp,离心10min。

5.离心后液体会分成三层,将上层水层转移到另一个1.5mlEP管中(约450ul),加入0.5ml异丙醇,混匀,静止10min。然后4℃,12000rmp,离心10min。

水层(含RNA)

蛋白质

有机层

6.小心倒掉液体,加入1ml预冷的75%乙醇,轻轻摇晃。然后4℃,12000rmp,离心10min。

7.用枪头尽可能除去液体,超净台内静在置干燥,待白色沉淀变为半透明状,立即加入RNA free水。

8.放入-80℃冰箱保存。、

二、反转录

准备:预热水浴箱(37℃及85℃)、枪头、EP管必须是PCR专用的

1、桌面喷洒酒精,取出一个200ul PCR管,按以下比例配制反转录体系(冰上操作):

H2O:2ul

RNA:6ul

Premix:2ul

总:10ul

2、将mix混匀,短暂离心,然后37℃水浴15min,85℃水浴10s。完毕后放到冰上待用。

三、PCR步骤

1、取出500ulEP管,分别依次加入:

H2O:7.7ul 23.1 ul

Primer F 0.4ul 1.2 ul

Primer R 0.4ul ×3 1.2 ul 混匀后,短暂离心。

EX Taq:10ul 30 ul

模板cDNA 1.5ul 4.5ul

总:20ul 60ul

2、将上述配得的两管mix分别分装到3个200ul PCR管中,19ul/管。

3、放入PCR机中进行扩增,

条件:

8、扩增,将上诉的PCR管放入PCR机中进行扩增,扩增程序为:94℃,2min→98→72℃,10min→4℃

重复N次

完毕后4℃保存或者取出放到冰上。

四、电泳

1、PCR扩增期间,可先行配胶(2%的胶),配制比例为:

小胶(11孔):0.6g琼脂糖+ 30ml 1×TEA +1ul EB替代染料

大胶(25 孔):1.2g琼脂糖+ 60ml 1×TEA + 2ul EB替代染料把琼脂糖溶液放入微波炉加热至完全透明,待琼脂糖溶液冷却至温热时再加入EB替代染料,摇匀并倒入带有梳子的电泳板中冷却凝固。

2、凝固后的琼脂糖块放入电泳槽中,并倒入适量1×TEA溶液。

3、加样。

4、接上电源,电压150V,电流100I进行电泳。

5、紫外灯检测。

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