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EM算法matlab程序

EM算法matlab程序
EM算法matlab程序

X=zeros(600,2);

X(1:200,:) = normrnd(0,1,200,2);

X(201:400,:) = normrnd(0,2,200,2);

X(401:600,:) = normrnd(0,3,200,2);

[W,M,V,L] = EM_GM(X,3,[],[],1,[])

下面是程序源码:

打印帮助

function[W,M,V,L] = EM_GM(X,k,ltol,maxiter,pflag,Init)

% [W,M,V,L] = EM_GM(X,k,ltol,maxiter,pflag,Init)

%

% EM algorithm for k multidimensional Gaussian mixture esti mation

%

% Inputs:

% X(n,d) - input data, n=number of observations, d=dimension of variable

% k - maximum number of Gaussian components allowed

% ltol - percentage of the log likelihood difference between 2 iterations ([] for none) % maxiter - maximum number of iteration allowed ([] for none)

% pflag - 1 for plotting GM for 1D or 2D cases only, 0 otherwise ([] for none)

% Init - structure of initial W, M, V: Init.W, Init.M, Init.V ([] for none)

%

% Ouputs:

% W(1,k) - estimated weights of GM

% M(d,k) - estimated mean vectors of GM

% V(d,d,k) - estimated covariance matrices of GM

% L - log likelihood of estimates

%

% Written by

% Patrick P. C. Tsui,

% PAMI research group

% Department of Electrical and Computer Engineering

% University of Waterloo,

% March, 2006

%

%%%% Validate inputs %%%%

ifnargin <= 1,

disp('EM_GM must have at least 2 inputs: X,k!/n')

return

elseifnargin == 2,

ltol = 0.1; maxiter = 1000; pflag = 0; Init = [];

err_X = Verify_X(X);

err_k = Verify_k(k);

iferr_X | err_k,return;end

elseifnargin == 3,

maxiter = 1000; pflag = 0; Init = [];

err_X = Verify_X(X);

err_k = Verify_k(k);

[ltol,err_ltol] = Verify_ltol(ltol);

iferr_X | err_k | err_ltol,return;end

elseifnargin == 4,

pflag = 0; Init = [];

err_X = Verify_X(X);

err_k = Verify_k(k);

[ltol,err_ltol] = Verify_ltol(ltol);

[maxiter,err_maxiter] = Verify_maxiter(maxiter);

iferr_X | err_k | err_ltol | err_maxiter,return;end

elseifnargin == 5,

Init = [];

err_X = Verify_X(X);

err_k = Verify_k(k);

[ltol,err_ltol] = Verify_ltol(ltol);

[maxiter,err_maxiter] = Verify_maxiter(maxiter);

[pflag,err_pflag] = Verify_pflag(pflag);

iferr_X | err_k | err_ltol | err_maxiter | err_pflag,return;end elseifnargin == 6,

err_X = Verify_X(X);

err_k = Verify_k(k);

[ltol,err_ltol] = Verify_ltol(ltol);

[maxiter,err_maxiter] = Verify_maxiter(maxiter);

[pflag,err_pflag] = Verify_pflag(pflag);

[Init,err_Init]=Verify_Init(Init);

iferr_X | err_k | err_ltol | err_maxiter | err_pflag | err_Init,return;end else

disp('EM_GM must have 2 to 6 inputs!');

return

end

%%%% Initialize W, M, V,L %%%%

t = cputime;

ifisempty(Init),

[W,M,V] = Init_EM(X,k); L = 0;

else

W = Init.W;

M = Init.M;

V = Init.V;

end

Ln = Likelihood(X,k,W,M,V);% Initialize log likelihood

Lo = 2*Ln;

%%%% EM algorithm %%%%

niter = 0;

while(abs(100*(Ln-Lo)/Lo)>ltol) & (niter<=maxiter),

E = Expectation(X,k,W,M,V);% E-step

[W,M,V] = Maximization(X,k,E); % M-step

Lo = Ln;

Ln = Likelihood(X,k,W,M,V);

niter = niter + 1;

end

L = Ln;

%%%% Plot 1D or 2D %%%%

ifpflag==1,

[n,d] = size(X);

ifd>2,

disp('Can only plot 1 or 2 dimensional applications!/n');

else

Plot_GM(X,k,W,M,V);

end

elapsed_time = sprintf('CPU time used for EM_GM: %5.2fs',cputime-t); disp(elapsed_time);

disp(sprintf('Number of iterations: %d',niter-1));

end

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of EM_GM %%%%

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

functionE = Expectation(X,k,W,M,V)

[n,d] = size(X);

a = (2*pi)^(0.5*d);

S = zeros(1,k);

iV = zeros(d,d,k);

forj=1:k,

ifV(:,:,j)==zeros(d,d), V(:,:,j)=ones(d,d)*eps;end

S(j) = sqrt(det(V(:,:,j)));

iV(:,:,j) = inv(V(:,:,j));

end

E = zeros(n,k);

fori=1:n,

forj=1:k,

dXM = X(i,:)'-M(:,j);

pl = exp(-0.5*dXM'*iV(:,:,j)*dXM)/(a*S(j));

E(i,j) = W(j)*pl;

end

E(i,:) = E(i,:)/sum(E(i,:));

end

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Expectation %%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

function[W,M,V] = Maximization(X,k,E)

[n,d] = size(X);

W = zeros(1,k); M = zeros(d,k);

V = zeros(d,d,k);

fori=1:k, % Compute weights

forj=1:n,

W(i) = W(i) + E(j,i);

M(:,i) = M(:,i) + E(j,i)*X(j,:)';

end

M(:,i) = M(:,i)/W(i);

end

fori=1:k,

forj=1:n,

dXM = X(j,:)'-M(:,i);

V(:,:,i) = V(:,:,i) + E(j,i)*dXM*dXM';

end

V(:,:,i) = V(:,:,i)/W(i);

end

W = W/n;

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Maximization %%%%

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

functionL = Likelihood(X,k,W,M,V)

% Compute L based on K. V. Mardia, "Multivariate Analysis", Academic Press, 1979, PP. 96-97 % to enchance computational speed

[n,d] = size(X);

U = mean(X)';

S = cov(X);

L = 0;

fori=1:k,

iV = inv(V(:,:,i));

L = L + W(i)*(-0.5*n*log(det(2*pi*V(:,:,i))) ...

-0.5*(n-1)*(trace(iV*S)+(U-M(:,i))'*iV*(U-M(:,i))));

end

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Likelihood %%%%

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

functionerr_X = Verify_X(X)

err_X = 1;

[n,d] = size(X);

ifn

disp('Input data must be n x d!/n');

return

end

err_X = 0;

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Verify_X %%%%

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

functionerr_k = Verify_k(k)

err_k = 1;

if~isnumeric(k) | ~isreal(k) | k<1,

disp('k must be a real integer >= 1!/n');

return

end

err_k = 0; %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Verify_k %%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

function[ltol,err_ltol] = Verify_ltol(ltol)

err_ltol = 1;

ifisempty(ltol),

ltol = 0.1;

elseif~isreal(ltol) | ltol<=0,

disp('ltol must be a positive real number!');

return

end

err_ltol = 0; %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Verify_ltol %%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

function[maxiter,err_maxiter] = Verify_maxiter(maxiter) err_maxiter = 1;

ifisempty(maxiter),

maxiter = 1000;

elseif~isreal(maxiter) | maxiter<=0,

disp('ltol must be a positive real number!');

return

end

err_maxiter = 0; %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Verify_maxiter %%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

function[pflag,err_pflag] = Verify_pflag(pflag)

err_pflag = 1;

ifisempty(pflag),

pflag = 0;

elseifpflag~=0 & pflag~=1,

disp('Plot flag must be either 0 or 1!/n');

return

end

err_pflag = 0; %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Verify_pflag %%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

function[Init,err_Init] = Verify_Init(Init)

err_Init = 1;

ifisempty(Init),

% Do nothing;

elseifisstruct(Init),

[Wd,Wk] = size(Init.W);

[Md,Mk] = size(Init.M);

[Vd1,Vd2,Vk] = size(Init.V);

ifWk~=Mk | Wk~=Vk | Mk~=Vk,

disp('k in Init.W(1,k), Init.M(d,k) and Init.V(d,d,k) must equal!/n')

return

end

ifMd~=Vd1 | Md~=Vd2 | Vd1~=Vd2,

disp('d in Init.W(1,k), Init.M(d,k) and Init.V(d,d,k) must equal!/n')

return

end

else

disp('Init must be a structure: W(1,k), M(d,k), V(d,d,k) or []!');

return

end

err_Init = 0;

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Verify_Init %%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

function[W,M,V] = Init_EM(X,k)

[n,d] = size(X);

[Ci,C] = kmeans(X,k,'Start','cluster', ...

'Maxiter',100, ...

'EmptyAction','drop', ...

'Display','off');% Ci(nx1) - cluster indeices; C(k,d) - cluster centroid (i.e. mean) whilesum(isnan(C))>0,

[Ci,C] = kmeans(X,k,'Start','cluster', ...

'Maxiter',100, ...

'EmptyAction','drop', ...

'Display','off');

end

M = C';

Vp = repmat(struct('count',0,'X',zeros(n,d)),1,k);

fori=1:n,% Separate cluster points

Vp(Ci(i)).count = Vp(Ci(i)).count + 1;

Vp(Ci(i)).X(Vp(Ci(i)).count,:) = X(i,:);

end

V = zeros(d,d,k);

fori=1:k,

W(i) = Vp(i).count/n;

V(:,:,i) = cov(Vp(i).X(1:Vp(i).count,:));

end

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Init_EM %%%%

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

functionPlot_GM(X,k,W,M,V)

[n,d] = size(X);

ifd>2,

disp('Can only plot 1 or 2 dimensional applications!/n'); return

end

S = zeros(d,k);

R1 = zeros(d,k);

R2 = zeros(d,k);

fori=1:k, % Determine plot range as 4 x standard deviations S(:,i) = sqrt(diag(V(:,:,i)));

R1(:,i) = M(:,i)-4*S(:,i);

R2(:,i) = M(:,i)+4*S(:,i);

end

Rmin = min(min(R1));

Rmax = max(max(R2));

R = [Rmin:0.001*(Rmax-Rmin):Rmax];

clf, hold on

ifd==1,

Q = zeros(size(R));

fori=1:k,

P = W(i)*normpdf(R,M(:,i),sqrt(V(:,:,i)));

Q = Q + P;

plot(R,P,'r-'); grid on,

end

plot(R,Q,'k-');

xlabel('X');

ylabel('Probability density');

else% d==2

plot(X(:,1),X(:,2),'r.');

fori=1:k,

Plot_Std_Ellipse(M(:,i),V(:,:,i));

end

xlabel('1^{st} dimension');

ylabel('2^{nd} dimension');

axis([Rmin Rmax Rmin Rmax])

end

title('Gaussian Mixture estimated by EM'); %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Plot_GM %%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

functionPlot_Std_Ellipse(M,V)

[Ev,D] = eig(V);

d = length(M);

ifV(:,:)==zeros(d,d),

V(:,:) = ones(d,d)*eps;

end

iV = inv(V);

% Find the larger projection

P = [1,0;0,0]; % X-axis projection operator

P1 = P * 2*sqrt(D(1,1)) * Ev(:,1);

P2 = P * 2*sqrt(D(2,2)) * Ev(:,2);

ifabs(P1(1)) >= abs(P2(1)),

Plen = P1(1);

else

Plen = P2(1);

end

count = 1;

step = 0.001*Plen;

Contour1 = zeros(2001,2);

Contour2 = zeros(2001,2);

forx = -Plen:step:Plen,

a = iV(2,2);

b = x * (iV(1,2)+iV(2,1));

c = (x^2) * iV(1,1) - 1;

Root1 = (-b + sqrt(b^2 - 4*a*c))/(2*a);

Root2 = (-b - sqrt(b^2 - 4*a*c))/(2*a);

ifisreal(Root1),

Contour1(count,:) = [x,Root1] + M';

Contour2(count,:) = [x,Root2] + M';

count = count + 1;

end

end

Contour1 = Contour1(1:count-1,:);

Contour2 = [Contour1(1,:);Contour2(1:count-1,:);Contour1(count-1,:)]; plot(M(1),M(2),'k+');

plot(Contour1(:,1),Contour1(:,2),'k-');

plot(Contour2(:,1),Contour2(:,2),'k-'); %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

%%%% End of Plot_Std_Ellipse %%%% %%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

遗传算法MATLAB完整代码(不用工具箱)

遗传算法解决简单问题 %主程序:用遗传算法求解y=200*exp(-0.05*x).*sin(x)在区间[-2,2]上的最大值clc; clear all; close all; global BitLength global boundsbegin global boundsend bounds=[-2,2]; precision=0.0001; boundsbegin=bounds(:,1); boundsend=bounds(:,2); %计算如果满足求解精度至少需要多长的染色体 BitLength=ceil(log2((boundsend-boundsbegin)'./precision)); popsize=50; %初始种群大小 Generationmax=12; %最大代数 pcrossover=0.90; %交配概率 pmutation=0.09; %变异概率 %产生初始种群 population=round(rand(popsize,BitLength)); %计算适应度,返回适应度Fitvalue和累计概率cumsump [Fitvalue,cumsump]=fitnessfun(population); Generation=1; while Generation

聚类分析Matlab程序实现

2. Matlab程序 2.1 一次聚类法 X=[11978 12.5 93.5 31908;…;57500 67.6 238.0 15900]; T=clusterdata(X,0.9) 2.2 分步聚类 Step1 寻找变量之间的相似性 用pdist函数计算相似矩阵,有多种方法可以计算距离,进行计算之前最好先将数据用zscore 函数进行标准化。 X2=zscore(X); %标准化数据 Y2=pdist(X2); %计算距离 Step2 定义变量之间的连接 Z2=linkage(Y2); Step3 评价聚类信息 C2=cophenet(Z2,Y2); //0.94698 Step4 创建聚类,并作出谱系图 T=cluster(Z2,6); H=dendrogram(Z2); Matlab提供了两种方法进行聚类分析。 一种是利用 clusterdata函数对样本数据进行一次聚类,其缺点为可供用户选择的面较窄,不能更改距离的计算方法; 另一种是分步聚类:(1)找到数据集合中变量两两之间的相似性和非相似性,用pdist函数计算变量之间的距离;(2)用 linkage函数定义变量之间的连接;(3)用 cophenetic函数评价聚类信息;(4)用cluster函数创建聚类。 1.Matlab中相关函数介绍 1.1 pdist函数 调用格式:Y=pdist(X,’metric’) 说明:用‘metric’指定的方法计算 X 数据矩阵中对象之间的距离。’ X:一个m×n的矩阵,它是由m个对象组成的数据集,每个对象的大小为n。 metric’取值如下: ‘euclidean’:欧氏距离(默认);‘seuclidean’:标准化欧氏距离; ‘mahalanobis’:马氏距离;‘cityblock’:布洛克距离; ‘minkowski’:明可夫斯基距离;‘cosine’: ‘correlation’:‘hamming’: ‘jaccard’:‘chebychev’:Chebychev距离。 1.2 squareform函数 调用格式:Z=squareform(Y,..) 说明:强制将距离矩阵从上三角形式转化为方阵形式,或从方阵形式转化为上三角形式。 1.3 linkage函数 调用格式:Z=linkage(Y,’method’) 说明:用‘method’参数指定的算法计算系统聚类树。 Y:pdist函数返回的距离向量;

PID算法Matlab仿真程序和C程序

增量式PID控制算法Matlab仿真程序设一被控对象G(s)=50/(0.125s^2+7s),用增量式PID控制算法编写仿真程序(输入分别为单位阶跃、正弦信号,采样时间为1ms,控制器输出限幅:[-5,5],仿真曲线包括系统输出及误差曲线,并加上注释、图例)。程序如下clear all; close all; ts=0.001; sys=tf(50,[0.125,7, 0]); dsys=c2d(sys,ts,'z'); [num,den]=tfdata(dsys,'v'); u_1=0.0;u_2=0.0; y_1=0.0;y_2=0.0; x=[0,0,0]'; error_1=0; error_2=0; for k=1:1:1000 time(k)=k*ts; S=2; if S==1 kp=10;ki=0.1;kd=15; rin(k)=1; % Step Signal elseif S==2 kp=10;ki=0.1;kd=15; %Sin e Signal rin(k)=0.5*sin(2*pi*k*ts); end du(k)=kp*x(1)+kd*x(2)+ki*x(3); % PID Controller u(k)=u_1+du(k); %Restricting the output of controller if u(k)>=5 u(k)=5; end if u(k)<=-5 u(k)=-5; end %Linear model yout(k)=-den(2)*y_1-den(3)*y_2+nu m(2)*u_1+num(3)*u_2; error(k)=rin(k)-yout(k); %Return of parameters u_2=u_1;u_1=u(k); y_2=y_1;y_1=yout(k); x(1)=error(k)-error_1; %C alculating P x(2)=error(k)-2*error_1+error_2; %Calculating D x(3)=error(k); %Calculating I error_2=error_1; error_1=error(k); end figure(1); plot(time,rin,'b',time,yout,'r'); xlabel('time(s)'),ylabel('rin,yout'); figure(2); plot(time,error,'r') xlabel('time(s)');ylabel('error'); 微分先行PID算法Matlab仿真程序%PID Controler with differential in advance clear all; close all; ts=20; sys=tf([1],[60,1],'inputdelay',80); dsys=c2d(sys,ts,'zoh'); [num,den]=tfdata(dsys,'v'); u_1=0;u_2=0;u_3=0;u_4=0;u_5=0;

MATLAB课程遗传算法实验报告及源代码

硕士生考查课程考试试卷 考试科目: 考生姓名:考生学号: 学院:专业: 考生成绩: 任课老师(签名) 考试日期:年月日午时至时

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选择题目: B 、设计遗传算法求解f (x)极小值,具体表达式如下: 321231(,,)5.12 5.12,1,2,3i i i f x x x x x i =?=???-≤≤=? ∑ 要求必须使用m 函数方式设计程序。 一、问题分析(10分) 这是一个简单的三元函数求最小值的函数优化问题,可以利用遗传算法来指导性搜索最小值。实验要求必须以matlab 为工具,利用遗传算法对问题进行求解。 在本实验中,要求我们用M 函数自行设计遗传算法,通过遗传算法基本原理,选择、交叉、变异等操作进行指导性邻域搜索,得到最优解。 二、实验原理与数学模型(20分) (1)试验原理: 用遗传算法求解函数优化问题,遗传算法是模拟生物在自然环境下的遗传和进化过程而形成的一种自适应全局优化概率搜索方法。其采纳了自然进化模型,从代表问题可能潜在解集的一个种群开始,种群由经过基因编码的一定数目的个体组成。每个个体实际上是染色体带有特征的实体;初始种群产生后,按照适者生存和优胜劣汰的原理,逐代演化产生出越来越好的解:在每一代,概据问题域中个体的适应度大小挑选个体;并借助遗传算子进行组合交叉和主客观变异,产生出代表新的解集的种群。这一过程循环执行,直到满足优化准则为止。最后,末代个体经解码,生成近似最优解。基于种群进化机制的遗传算法如同自然界进化一样,后生代种群比前生代更加适应于环境,通过逐代进化,逼近最优解。 遗传算法是一种现代智能算法,实际上它的功能十分强大,能够用于求解一些难以用常规数学手段进行求解的问题,尤其适用于求解多目标、多约束,且目标函数形式非常复杂的优化问题。但是遗传算法也有一些缺点,最为关键的一点,即没有任何理论能够证明遗传算法一定能够找到最优解,算法主要是根据概率论的思想来寻找最优解。因此,遗传算法所得到的解只是一个近似解,而不一定是最优解。 (2)数学模型 对于求解该问题遗传算法的构造过程: (1)确定决策变量和约束条件;

0.618法的matlab实现

实验报告 实验题目: 0.618法的MATLAB实现学生姓名: 学号: 实验时间: 2013-5-13

一.实验名称: 0.618法求解单峰函数极小点 二.实验目的及要求: 1. 了解并熟悉0.618法的方法原理, 以及它的MATLAB 实现. 2. 运用0.618法解单峰函数的极小点. 三.实验内容: 1. 0.618法方法原理: 定理: 设f 是区间],[b a 上的单峰函数, ] ,[ ,)2()1(b a x x ∈, 且)2()1(x x <. 如果)()()2()1(x f x f >, 则对每一个],[)1(x a x ∈, 有)()()2(x f x f >; 如果)()()2()1(x f x f ≤, 则对每一个] ,[) 2(b x x ∈, 有)()()1(x f x f ≥. 根据上述定理, 只需选择两个试探点, 就可将包含极小点的区间缩短. 事实上, 必有 如果)()()2()1(x f x f >, 则],[)1(b x x ∈; 如果)()() 2()1(x f x f ≤, 则][)2(x a x ,∈. 0.618 法的基本思想是, 根据上述定理, 通过取试探点使包含极小点的区间(不确定区间)不断缩短, 当区间长度小到一定程度时, 区间上各点的函数值均接近极小值, 因此任意一点都可作为极小点的近似. 0.618 法计算试探点的公式: ). (618.0),(382.0k k k k k k k k a b a a b a -+=-+=μλ 2. 0.618法的算法步骤: ①置初始区间],[11b a 及精度要求0>L , 计算试探点1λ和1μ, 计算函数值)(1λf 和)(1μf . 计算公式是 ).(618.0 ),(382.011111111a b a a b a -+=-+=μλ 令1=k . ②若L a b k k <-, 则停止计算. 否则, 当)()(k k f f μλ>时, 转步骤③; 当)()(k k f f μλ≤时, 转步骤④. ③置k k a λ=+1, k k b b =+1, k k μλ=+1,)(618.01111++++-+=k k k k a b a μ, 计算函数值)(1+k f μ, 转步骤⑤.

MATLAB实现FCM 聚类算法

本文在阐述聚类分析方法的基础上重点研究FCM 聚类算法。FCM 算法是一种基于划分的聚类算法,它的思想是使得被划分到同一簇的对象之间相似度最大,而不同簇之间的相似度最小。最后基于MATLAB实现了对图像信息的聚类。 第 1 章概述 聚类分析是数据挖掘的一项重要功能,而聚类算法是目前研究的核心,聚类分析就是使用聚类算法来发现有意义的聚类,即“物以类聚” 。虽然聚类也可起到分类的作用,但和大多数分类或预测不同。大多数分类方法都是演绎的,即人们事先确定某种事物分类的准则或各类别的标准,分类的过程就是比较分类的要素与各类别标准,然后将各要素划归于各类别中。确定事物的分类准则或各类别的标准或多或少带有主观色彩。 为获得基于划分聚类分析的全局最优结果,则需要穷举所有可能的对象划分,为此大多数应用采用的常用启发方法包括:k-均值算法,算法中的每一个聚类均用相应聚类中对象的均值来表示;k-medoid 算法,算法中的每一个聚类均用相应聚类中离聚类中心最近的对象来表示。这些启发聚类方法在分析中小规模数据集以发现圆形或球状聚类时工作得很好,但当分析处理大规模数据集或复杂数据类型时效果较差,需要对其进行扩展。 而模糊C均值(Fuzzy C-means, FCM)聚类方法,属于基于目标函数的模糊聚类算法的范畴。模糊C均值聚类方法是基于目标函数的模糊聚类算法理论中最为完善、应用最为广泛的一种算法。模糊c均值算法最早从硬聚类目标函数的优化中导出的。为了借助目标函数法求解聚类问题,人们利用均方逼近理论构造了带约束的非线性规划函数,以此来求解聚类问题,从此类内平方误差和WGSS(Within-Groups Sum of Squared Error)成为聚类目标函数的普遍形式。随着模糊划分概念的提出,Dunn [10] 首先将其推广到加权WGSS 函数,后来由Bezdek 扩展到加权WGSS 的无限族,形成了FCM 聚类算法的通用聚类准则。从此这类模糊聚类蓬勃发展起来,目前已经形成庞大的体系。 第 2 章聚类分析方法 2-1 聚类分析 聚类分析就是根据对象的相似性将其分群,聚类是一种无监督学习方法,它不需要先验的分类知识就能发现数据下的隐藏结构。它的目标是要对一个给定的数据集进行划分,这种划分应满足以下两个特性:①类内相似性:属于同一类的数据应尽可能相似。②类间相异性:属于不同类的数据应尽可能相异。图2.1是一个简单聚类分析的例子。

最短路径算法_matlab程序[1]

算法描述: 输入图G,源点v0,输出源点到各点的最短距离D 中间变量v0保存当前已经处理到的顶点集合,v1保存剩余的集合 1.初始化v1,D 2.计算v0到v1各点的最短距离,保存到D for each i in v0;D(j)=min[D(j),G(v0(1),i)+G(i,j)] ,where j in v1 3.将D中最小的那一项加入到v0,并且从v1删除这一项。 4.转到2,直到v0包含所有顶点。 %dijsk最短路径算法 clear,clc G=[ inf inf 10 inf 30 100; inf inf 5 inf inf inf; inf 5 inf 50 inf inf; inf inf inf inf inf 10; inf inf inf 20 inf 60; inf inf inf inf inf inf; ]; %邻接矩阵 N=size(G,1); %顶点数 v0=1; %源点 v1=ones(1,N); %除去原点后的集合 v1(v0)=0; %计算和源点最近的点 D=G(v0,:); while 1 D2=D; for i=1:N if v1(i)==0 D2(i)=inf; end end D2 [Dmin id]=min(D2); if isinf(Dmin),error,end v0=[v0 id] %将最近的点加入v0集合,并从v1集合中删除 v1(id)=0; if size(v0,2)==N,break;end %计算v0(1)到v1各点的最近距离 fprintf('计算v0(1)到v1各点的最近距离\n');v0,v1 id=0; for j=1:N %计算到j的最近距离 if v1(j)

遗传算法Matlab程序

% f(x)=11*sin(6x)+7*cos(5x),0<=x<=2*pi; %%初始化参数 L=16;%编码为16位二进制数 N=32;%初始种群规模 M=48;%M个中间体,运用算子选择出M/2对母体,进行交叉;对M个中间体进行变异 T=100;%进化代数 Pc=0.8;%交叉概率 Pm=0.03;%%变异概率 %%将十进制编码成16位的二进制,再将16位的二进制转成格雷码 for i=1:1:N x1(1,i)= rand()*2*pi; x2(1,i)= uint16(x1(1,i)/(2*pi)*65535); grayCode(i,:)=num2gray(x2(1,i),L); end %% 开始遗传算子操作 for t=1:1:T y1=11*sin(6*x1)+7*cos(5*x1); for i=1:1:M/2 [a,b]=min(y1);%找到y1中的最小值a,及其对应的编号b grayCodeNew(i,:)=grayCode(b,:);%将找到的最小数放到grayCodeNew中grayCodeNew(i+M/2,:)=grayCode(b,:);%与上面相同就可以有M/2对格雷码可以作为母体y1(1,b)=inf;%用来排除已找到的最小值 end for i=1:1:M/2 p=unidrnd(L);%生成一个大于零小于L的数,用于下面进行交叉的位置if rand()

matlab实现Kmeans聚类算法

题目:matlab实现Kmeans聚类算法 姓名吴隆煌 学号41158007

背景知识 1.简介: Kmeans算法是一种经典的聚类算法,在模式识别中得到了广泛的应用,基于Kmeans的变种算法也有很多,模糊Kmeans、分层Kmeans 等。 Kmeans和应用于混合高斯模型的受限EM算法是一致的。高斯混合模型广泛用于数据挖掘、模式识别、机器学习、统计分析。Kmeans 的迭代步骤可以看成E步和M步,E:固定参数类别中心向量重新标记样本,M:固定标记样本调整类别中心向量。K均值只考虑(估计)了均值,而没有估计类别的方差,所以聚类的结构比较适合于特征协方差相等的类别。 Kmeans在某种程度也可以看成Meanshitf的特殊版本,Meanshift 是一种概率密度梯度估计方法(优点:无需求解出具体的概率密度,直接求解概率密度梯度。),所以Meanshift可以用于寻找数据的多个模态(类别),利用的是梯度上升法。在06年的一篇CVPR文章上,证明了Meanshift方法是牛顿拉夫逊算法的变种。Kmeans 和EM算法相似是指混合密度的形式已知(参数形式已知)情况下,利用迭代方法,在参数空间中搜索解。而Kmeans和Meanshift相似是指都是一种概率密度梯度估计的方法,不过是Kmean选用的是特殊的核函数(uniform kernel),而与混合概率密度形式是否已知无关,是一种梯度求解方式。 k-means是一种聚类算法,这种算法是依赖于点的邻域来决定哪些

点应该分在一个组中。当一堆点都靠的比较近,那这堆点应该是分到同一组。使用k-means,可以找到每一组的中心点。 当然,聚类算法并不局限于2维的点,也可以对高维的空间(3维,4维,等等)的点进行聚类,任意高维的空间都可以。 上图中的彩色部分是一些二维空间点。上图中已经把这些点分组了,并使用了不同的颜色对各组进行了标记。这就是聚类算法要做的事情。 这个算法的输入是: 1:点的数据(这里并不一定指的是坐标,其实可以说是向量) 2:K,聚类中心的个数(即要把这一堆数据分成几组) 所以,在处理之前,你先要决定将要把这一堆数据分成几组,即聚成几类。但并不是在所有情况下,你都事先就能知道需要把数据聚成几类的。但这也并不意味着使用k-means就不能处理这种情况,下文中会有讲解。 把相应的输入数据,传入k-means算法后,当k-means算法运行完后,该算法的输出是: 1:标签(每一个点都有一个标签,因为最终任何一个点,总会被分到某个类,类的id号就是标签) 2:每个类的中心点。 标签,是表示某个点是被分到哪个类了。例如,在上图中,实际上

遗传算法经典MATLAB代码资料讲解

遗传算法经典学习Matlab代码 遗传算法实例: 也是自己找来的,原代码有少许错误,本人都已更正了,调试运行都通过了的。 对于初学者,尤其是还没有编程经验的非常有用的一个文件 遗传算法实例 % 下面举例说明遗传算法% % 求下列函数的最大值% % f(x)=10*sin(5x)+7*cos(4x) x∈[0,10]% % 将x 的值用一个10位的二值形式表示为二值问题,一个10位的二值数提供的分辨率是每为(10-0)/(2^10-1)≈0.01。% % 将变量域[0,10] 离散化为二值域[0,1023], x=0+10*b/1023, 其 中 b 是[0,1023] 中的一个二值数。% % % %--------------------------------------------------------------------------------------------------------------% %--------------------------------------------------------------------------------------------------------------% % 编程 %----------------------------------------------- % 2.1初始化(编码) % initpop.m函数的功能是实现群体的初始化,popsize表示群体的大小,chromlength表示染色体的长度(二值数的长度),

% 长度大小取决于变量的二进制编码的长度(在本例中取10位)。 %遗传算法子程序 %Name: initpop.m %初始化 function pop=initpop(popsize,chromlength) pop=round(rand(popsize,chromlength)); % rand随机产生每个单元 为{0,1} 行数为popsize,列数为chromlength的矩阵, % roud对矩阵的每个单元进行圆整。这样产生的初始种群。 % 2.2 计算目标函数值 % 2.2.1 将二进制数转化为十进制数(1) %遗传算法子程序 %Name: decodebinary.m %产生[2^n 2^(n-1) ... 1] 的行向量,然后求和,将二进制转化为十进制 function pop2=decodebinary(pop) [px,py]=size(pop); %求pop行和列数 for i=1:py pop1(:,i)=2.^(py-i).*pop(:,i); end pop2=sum(pop1,2); %求pop1的每行之和 % 2.2.2 将二进制编码转化为十进制数(2) % decodechrom.m函数的功能是将染色体(或二进制编码)转换为十进制,参数spoint表示待解码的二进制串的起始位置

最优化方法的Matlab实现(公式(完整版))

第九章最优化方法的MatIab实现 在生活和工作中,人们对于同一个问题往往会提出多个解决方案,并通过各方面的论证从中提取最佳方案。最优化方法就是专门研究如何从多个方案中科学合理地提取出最佳方案的科学。由于优化问题无所不在,目前最优化方法的应用和研究已经深入到了生产和科研的各个领域,如土木工程、机械工程、化学工程、运输调度、生产控制、经济规划、经济管理等,并取得了显著的经济效益和社会效益。 用最优化方法解决最优化问题的技术称为最优化技术,它包含两个方面的内容: 1)建立数学模型即用数学语言来描述最优化问题。模型中的数学关系式反映了最优化问题所要达到的目标和各种约束条件。 2)数学求解数学模型建好以后,选择合理的最优化方法进行求解。 最优化方法的发展很快,现在已经包含有多个分支,如线性规划、整数规划、非线性规划、动态规划、多目标规划等。 9.1 概述 利用Matlab的优化工具箱,可以求解线性规划、非线性规划和多目标规划问题。 具体而言,包括线性、非线性最小化,最大最小化,二次规划,半无限问题,线性、非线性方程(组)的求解,线性、非线性的最小二乘问题。另外,该工具箱还提供了线性、非线性最小化,方程求解,曲线拟合,二次规划等问题中大型课题的求解方法,为优化方法在工程中的实际应用提供了更方便快捷的途径。 9.1.1优化工具箱中的函数 优化工具箱中的函数包括下面几类: 1 ?最小化函数

2.方程求解函数 3.最小—乘(曲线拟合)函数

4?实用函数 5 ?大型方法的演示函数 6.中型方法的演示函数 9.1.3参数设置 利用OPtimSet函数,可以创建和编辑参数结构;利用OPtimget函数,可以获得o PtiOns优化参数。 ? OPtimget 函数 功能:获得OPtiOns优化参数。 语法:

最短距离聚类的matlab实现-1(含聚类图-含距离计算)

最短距离聚类的matlab实现-1 【2013-5-21更新】 说明:正文中命令部分可以直接在Matlab中运行, 作者(Yangfd09)于2013-5-21 19:15:50在MATLAB R2009a(7.8.0.347)中运行通过 %最短距离聚类(含距离计算,含聚类图) %说明:此程序的优点在于每一步都是自己编写的,很少用matlab现成的指令, %所以更适合于初学者,有助于理解各种标准化方法和距离计算方法。 %程序包含了极差标准化(两种方法)、中心化、标准差标准化、总和标准化和极大值标准化等标准化方法, %以及绝对值距离、欧氏距离、明科夫斯基距离和切比雪夫距离等距离计算方法。 %==========================>>导入数据<<============================== %变量名为test(新建一个以test变量,双击进入Variable Editor界面,将数据复制进去即可)%数据要求:m行n列,m为要素个数,n为区域个数(待聚类变量)。 % 具体参见末页测试数据。 testdata=test; %============================>>标准化<<=============================== %变量初始化,m用来寻找每行的最大值,n找最小值,s记录每行数据的和 [M,N]=size(testdata);m=zeros(1,M);n=9999*ones(1,M);s=zeros(1,M);eq=zeros(1,M); %为m、n和s赋值 for i=1:M for j=1:N if testdata(i,j)>=m(i) m(i)=testdata(i,j); end if testdata(i,j)<=n(i) n(i)=testdata(i,j); end s(i)=s(i)+testdata(i,j); end eq(i)=s(i)/N; end %sigma0是离差平方和,sigma是标准差 sigma0=zeros(M); for i=1:M for j=1:N sigma0(i)=sigma0(i)+(testdata(i,j)-eq(i))^2; end end sigma=sqrt(sigma0/N);

数学实验05聚类分析---用matlab做聚类分析

用matlab做聚类分析 Matlab提供了两种方法进行聚类分析。 一种是利用clusterdata函数对样本数据进行一次聚类,其缺点为可供用户选择的面较窄,不能更改距离的计算方法; 另一种是分步聚类:(1)找到数据集合中变量两两之间的相似性和非相似性,用pdist函数计算变量之间的距离;(2)用linkage函数定义变量之间的连接;(3)用cophenetic函数评价聚类信息;(4)用cluster函数创建聚类。1.Matlab中相关函数介绍 1.1pdist函数 调用格式:Y=pdist(X,’metric’) 说明:用‘metric’指定的方法计算X数据矩阵中对象之间的距离。’X:一个m×n的矩阵,它是由m个对象组成的数据集,每个对象的大小为n。 metric’取值如下: ‘euclidean’:欧氏距离(默认);‘seuclidean’:标准化欧氏距离; ‘mahalanobis’:马氏距离;‘cityblock’:布洛克距离; ‘minkowski’:明可夫斯基距离;‘cosine’: ‘correlation’:‘hamming’: ‘jaccard’:‘chebychev’:Chebychev距离。 1.2squareform函数 调用格式:Z=squareform(Y,..)

说明:强制将距离矩阵从上三角形式转化为方阵形式,或从方阵形式转化为上三角形式。 1.3linkage函数 调用格式:Z=linkage(Y,’method’) 说明:用‘method’参数指定的算法计算系统聚类树。 Y:pdist函数返回的距离向量; method:可取值如下: ‘single’:最短距离法(默认);‘complete’:最长距离法; ‘average’:未加权平均距离法;‘weighted’:加权平均法; ‘centroid’:质心距离法;‘median’:加权质心距离法; ‘ward’:内平方距离法(最小方差算法) 返回:Z为一个包含聚类树信息的(m-1)×3的矩阵。 1.4dendrogram函数 调用格式:[H,T,…]=dendrogram(Z,p,…) 说明:生成只有顶部p个节点的冰柱图(谱系图)。 1.5cophenet函数 调用格式:c=cophenetic(Z,Y) 说明:利用pdist函数生成的Y和linkage函数生成的Z计算cophenet相关系数。 1.6cluster函数 调用格式:T=cluster(Z,…) 说明:根据linkage函数的输出Z创建分类。

最优化算法-Matlab程序

CG程序代码 function [x,y] = cg(A,b,x0) %%%%%%%%%%%%%%%%%CG算法%%%%%%%%%%%% r0 = A*x0-b; p0 = -r0; k = 0; r = r0; p = p0; x = x0; while r~=0 alpha = -r'*p/(p'*A*p); x = x+alpha*p; rold = r; r = rold+alpha*A*p; beta = r'*r/(rold'*rold); p = -r+beta*p; plot(k,norm(p),'.--'); hold on k = k+1; end y.funcount = k; y.fval = x'*A*x/2-b'*x;

function [x,y] = cg_FR(fun,dfun,x0) %%%%%%%%%%%%%%%CG_FR算法%%%%%%%%%%%%%%% error = 10^-5; f0 = feval(fun,x0); df0 = feval(dfun,x0); p0 = -df0; f = f0; df = df0; p = p0; x = x0; k = 0; while ((norm(df)>error)&&(k<1000)) f = feval(fun,x); [alpha,funcNk,exitflag] = lines(fun,0.01,0.15,0.85,6,f,df'*p,x,p);%%用线搜索找下降距离%% if exitflag == -1 disp('Break!!!'); break; end x = x+alpha*p; dfold = df; df = feval(dfun,x); beta = df'*df/(dfold'*dfold); p = -df+beta*p; plot(k,norm(df),'.--'); hold on k = k+1; end y.funcount = k; y.fval = feval(fun,x); y.error = norm(df);

MVDR算法matlab程序

clc clear all close all %% 常量定义 Freqs=1.6e9; %工作频率 c=3e8; %光速 lamda=c/Freqs; %波长 d=0.5*lamda; %单元间距 M=16; %天线阵元数 fs=2e6; %采样频率 pd=10; %快拍数 %% 模型建立 %--------------第一个干扰模型-------------------- thetaJ1=20*pi/180; %干扰方向 FreqJ1=5e5; %第一个干扰的频率 J1NR=sqrt(10^(60/10)); J1one=J1NR*exp(j*(2*pi*FreqJ1*(1:1:pd)/fs)); %1*pd %--------------第二个干扰模型-------------------- ThetaJ2=60*pi/180; %干扰方向 FreqJ2=6e5; %第二个干扰的频率 J2NR=sqrt(10^(60/10)); J2one=J2NR*exp(j*(2*pi*FreqJ2*(1:1:pd)/fs)); %1*pd %--------------信号模型-------------------- ThetaS=30*pi/180; FreqS=7e5; SNR=sqrt(10^(40/10)); Sone=SNR*exp(j*(2*pi*FreqS*(1:1:pd)/fs)); %1*pd %--------------空域处理------------------------- I1=zeros(M,1); I2=zeros(M,1); IS=zeros(M,1); for n=1:M I1(n)=exp(j*2*pi*(n-1)*d*sin(thetaJ1)/lamda); I2(n)=exp(j*2*pi*(n-1)*d*sin(ThetaJ2)/lamda); IS(n)=exp(j*2*pi*(n-1)*d*sin(ThetaS)/lamda); end J1=I1*J1one; J1=J1.'; J2=I2*J2one; J2=J2.'; %------------产生噪声------------------------- noise=sqrt(1/2)*randn(pd,M)+j*sqrt(1/2)*randn(pd,M);

基于遗传算法的matlab源代码

function youhuafun D=code; N=50;%Tunable maxgen=50;%Tunable crossrate=0.5;%Tunable muterate=0.08;%Tunable generation=1; num=length(D); fatherrand=randint(num,N,3); score=zeros(maxgen,N); while generation<=maxgen ind=randperm(N-2)+2;%随机配对交叉 A=fatherrand(:,ind(1:(N-2)/2)); B=fatherrand(:,ind((N-2)/2+1:end)); %多点交叉 rnd=rand(num,(N-2)/2); ind=rnd tmp=A(ind); A(ind)=B(ind); B(ind)=tmp; %%两点交叉 %for kk=1:(N-2)/2 %rndtmp=randint(1,1,num)+1; %tmp=A(1:rndtmp,kk); %A(1:rndtmp,kk)=B(1:rndtmp,kk); %B(1:rndtmp,kk)=tmp; %end fatherrand=[fatherrand(:,1:2),A,B]; %变异 rnd=rand(num,N); ind=rnd[m,n]=size(ind); tmp=randint(m,n,2)+1; tmp(:,1:2)=0; fatherrand=tmp+fatherrand; fatherrand=mod(fatherrand,3); %fatherrand(ind)=tmp; %评价、选择 scoreN=scorefun(fatherrand,D);%求得N个个体的评价函数 score(generation,:)=scoreN; [scoreSort,scoreind]=sort(scoreN); sumscore=cumsum(scoreSort); sumscore=sumscore./sumscore(end); childind(1:2)=scoreind(end-1:end); for k=3:N tmprnd=rand; tmpind=tmprnd difind=[0,diff(t mpind)]; if~any(difind) difind(1)=1; end childind(k)=scoreind(logical(difind)); end fatherrand=fatherrand(:,childind); generation=generation+1; end %score maxV=max(score,[],2); minV=11*300-maxV; plot(minV,'*');title('各代的目标函数值'); F4=D(:,4); FF4=F4-fatherrand(:,1); FF4=max(FF4,1); D(:,5)=FF4; save DData D function D=code load youhua.mat %properties F2and F3 F1=A(:,1); F2=A(:,2); F3=A(:,3); if(max(F2)>1450)||(min(F2)<=900) error('DATA property F2exceed it''s range (900,1450]') end %get group property F1of data,according to F2value F4=zeros(size(F1)); for ite=11:-1:1 index=find(F2<=900+ite*50); F4(index)=ite; end D=[F1,F2,F3,F4]; function ScoreN=scorefun(fatherrand,D) F3=D(:,3); F4=D(:,4); N=size(fatherrand,2); FF4=F4*ones(1,N); FF4rnd=FF4-fatherrand; FF4rnd=max(FF4rnd,1); ScoreN=ones(1,N)*300*11; %这里有待优化

[设计]罚函数法MATLAB程序

[设计]罚函数法MATLAB程序 一、进退法、0.618法、Powell法、罚函数法的Matlab程序设计罚函数法(通用) function y=ff(x,k) y=-17.86*0.42*x(1)/(0.8+0.42*x(1))*(1-exp(- 2*(0.8+0.42*x(1))/3))*exp(-1.6)*x(2)-22. 99*x(1)/(0.8+x(1))*(1-exp(-2*(0.8+x(1))/3))*x(3)+k*(x(2)- (1.22*10^2*(9517.8*exp(-1 .6-2*0.42*x(1)/3)*x(2)+19035.6*exp(- 2*x(1)/3)*x(3)))/(1.22*10^2+9517.8*exp(-1.6-2 *0.42*x(1)/3)*x(2)+19035.6*exp(-2*x(1)/3)*x(3)))^2+k*(x(3)-exp(-0.8-2*x(1)/3)*x(3) -exp(-2.4-2*0.42*x(1)/3)*x(2))^2; % 主函数,参数包括未知数的个数n,惩罚因子q,惩罚因子增长系数k,初值x0,以及允许的误差r function G=FHS(x0,q,k,n,r,h,a) l=1; while (l) x=powell(x0,n,q,r(1),h,a); %调用powell函数 g(1)=ff1(x),g(2)=ff2(x) . . . g(p)=ffp(x); %调用不等式约束函数,将其值 %存入数组g h(1)=hh1(x),h(2)=hh2(x) . . . h(t)=hht(x); %调用等式约束函数,将其值%存入数组h for i=1:p

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