使用DnaSP计算核苷酸多样性和单倍型多样性

使用DnaSP计算核苷酸多样性和单倍型多样性

2012年09月26日? Evolution ?字号小中大?评论2 条?阅读2,547 次[点击加入在线收藏夹]

熊荣川，中国科学院成都生物研究所

在进行种群遗传学研究时，都会用到核苷酸多样性（π）和单倍型多样性（Hd）。

下面简单介绍怎样用软件DnaSP v5（Librado et al.，2009）得到相关的信息首先我们需要一个比对好的fasta 文件，例如taiwan30aln.fas

打开DnaSP v5

打开文件“taiwan30aln.fas”出现一个数据信息框，或者说软件赋予你的数据的一些默认信息

比如它会默认你的数据是来自常染色体的核基因、是二倍体型，因此我们常常需要对之进行修改以符合我们数据的实际情况，关掉这个信息框之后使用“data”-> “format”选项卡进行修改。

修改好之后，进行DNA 多态性分析“Analysis”-> “DNA Polymorphism”

结果中包含了我们需要的核苷酸多样性（Pi）和单倍型多样性（Hd），当然了还有很多其他相关的信息。

不同物种Agouti基因编码区生物信息学分析

不同物种Agouti基因编码区生物信息学分析 摘要：为了研究不同物种Agouti基因的遗传多样性，该实验采用生物信息学方法比较分析了山羊、绵羊、牛、髯羊、野猪、马、犬、狒狒、黑猩猩、人、兔、家猫、鼠和猕猴Agouti基因编码区(CDS)的遗传多样性。结果表明，来自14个物种的77条基因序列中检测到93个多态位点，共生成30 种单倍型，物种间及物种内Agouti基因序列编码区存在较丰富的遗传多样性。 关键词：物种；Agouti基因；遗传多样性 Bioinformatics Analysis of Coding Regions of Agouti Gene among Species Tian Teng-fei Li Xiang-long Zhou Rong-yan Li Lan-hui (College of Animal science and Technology, Agricultural University of Hebei, Baoding, 071001, China ) Abstract: In this study, the CDS of the Agouti gene sequences of Capra hircus, Ovis aries, Bos taurus, Ammotragus lervia,Sus scrofa, Equus caballus, Canis lupu s, Papio anubis, Pan troglodytes, Homo sapiens, Oryctolagus cuniculus, Felis catus, Peromyscus and Macaca radiata were analyzed using the method of bioinformatics. And the genetic diversity was analyzed. The results showed that a total of 93 polymorphic sites were detected from 77 sequencesof 14 species, from which 30 hapolotypes were sorted, and there was rich genetic diversity of the CDS of the Agouti gene within and among species. Key words: species; Agouti gene; genetic diversity 现代分子遗传学研究表明，Agouti基因通常编码对抗黑素细胞刺激素受体(melanoeyte stimulating hormone receptor，MSHR)的信号蛋白(agouti signaling protein，ASP)。Agouti信号蛋白由Agouti基因编码，人、鼠、狐狸、猪、绵羊等的Agouti基因相继被发现[1,2]，当Agouti基因表达时会引起棕黑素的产生，而Agouti不表达时则会引起真黑素的产生，从而调节真黑素和棕黑素之间的转换[3]，不同物种的Agouti基因及其信号蛋白有较高的同源性。随着对Agouti位点进一步研究，表明Agouti基因位点控制着毛囊内真黑素和棕黑素的相对数量，结构复杂，是一个含多等位基因的位点。林大光(1984)所述家兔的Agouti 位点主要有2个等位基因A和a， A为刺鼠毛基因，其作用是使毛纤维上出现分段着色，整根毛纤维呈深色—浅色—深色的状态，a为非刺鼠毛基因，其作用是使毛纤维颜色一致，A对a完全显性[4]。近年来人们对Agouti基因位点的研究主要集中于鼠和人，Kwon（1994）等[1]发现人的Agouti基因位于染色体20q11·2区，编码的ASP由132个氨基酸构成，人与鼠的Agouti基因同源性高达85%，Agouti信号蛋白同源性高达89% (即89%的氨基酸序列完全一致)。目前已证实Agouti位点不是一个单一基因，具有许多等位基因[5]，其中两个等位基因对某一颜色起着重要的作用，因此研究Agouti基因的编码区对研究动物的毛色变异具有重要作用。 本研究选用GenBank中已提交物种的Agouti基因的编码区序列，利用比较基因组学和生物信息学方法研究了该基因编码区的变异，以期探明该基因在不同种间及种内遗传分化，进而为动物毛色变异研究以及动物育种工作提供基础资料。 1.材料和方法 1.1 序列来源从NCBI网站https://www.wendangku.net/doc/6a11183907.html,/的GenBank中下载山羊、绵羊、牛、髯羊、野猪、马、犬、狒狒、黑猩猩、人、兔、家猫、鼠和猕猴等14个物种的77条Agouti基因序列（表1）。 表1 不同物种的Agouti基因序列来源 Table 1 The source of sequences for Agouti gene in different species 物种(Species) 序列数(Sample size) 序列号(Access number) 髯羊(Ammotragus lervia) 1 EU420031 山羊（Capra hircus） 3 EF587236, EU037983, GU076166 绵羊（Ovis aries）9 EU057181, EU420022, EU420024, EU420025, EU420026, EU420027, EU420029, EU420030, NM_001134303 牛（Bos taurus） 5 AH013175, NM_206843, X99691, X99692, XM_001790188 野猪（Sus scrofa）11 AJ427478, AJ634673, AY308996, AY308997, AY308998, AY916525, GQ373180, NM_001001648, NM_001011646, NM_001011647,

如何利用dnasp软件计算单倍型多样性,核苷酸多样性,单倍型数量PAUP软件构建MP树

如何利用dnasp软件计算单倍型多样性，PAUP软件构建MP树 1、利用BioEdit和Clustalx对所有需要构建系统进化树的个体进行序列比对 2、将Clustalx比对结果中的*.aln文件利用BioEdit打开，在其中删除clustal cons文件，这 时候有一行“*******”消失，将该文件转存为*.fst格式文件。 3、用dnasp软件打开该文件，弹出对话框选择关闭，然后选择analysi s→DNA polymorphism， 弹出对话框看一下序列长度对不对，然后点击OK，在弹出的对话框中的Number of Haplotypes,后面对应的数值即为单倍型多样性，Standard Deviation of Haplotype diversity后面对应为SD（标准差）值。在该对话框中Nucleotidy diversity即为核苷酸多样性。 注：单倍型多样性即指在某一个种群或几个种群中存在差异序列的数量。 4、用dnasp软件打开该文件，弹出对话框选择关闭，然后选择Genetate→Haplotype Date file，弹出对话框看一下序列长度对不对，然后点击OK，在弹出的对话框中输入保存的路径和文件名（注意不要修改扩展名），点击确定，在弹出的对话框中给出了单倍型数量和每个单倍型中包含的样本信息，在后续处理中每个单倍型只需选择一个样本。 5、用dnasp软件打开该文件，弹出对话框选择关闭，然后选择Overview→polymorphism date，弹出对话框看一下序列长度对不对，然后点击OK，里面有单倍型多样性和核苷酸多样性信息。 6、由于PAUP并不识别该格式软件，因此需要利用dnasp软件将其转存为*.nex格式，方法 如下，用dnasp软件打比对后的*.fat格式文件，在菜单中选择fil e→save/export date as →NEXUS file format，命名，选择路径。 7、打开PAUP软件，打开刚才利用dnasp转存的文件。这时会在对话框下方出现如图1所 示文字。 图1 8、在下面的框中依次输入下面命令即可。命令如下： 注：其中第三和第四步需要运行一段时间后再输入下一命令。第七步需要输入要保存的文件名。将红色的*换成文件名。这样就构建完MP树了。 1）set criterion = parsimony maxtrees = 1000 increase = auto autoclose = yes 2）pset gapmode = newstate 3）hsearch addseq = random nreps = 100 swap = TBR 4）bootstrap nrep = 1000 keepall = yes cutoffpct = 0 search = heuristic / addseq = random nreps = 20 swap = TBR 5）showtree all / root = outgroup 6）describetree 1 / plot = phylogram brlens = yes root = outgroup 7）savetrees file = *.tre root = yes brlens = yes savebootp = both from = 1 to = 1 8）log stop 9）factory 10)quit

浅谈生物多样性的重要性

浅谈生物多样性的重要性 现代科学技术发展极大的促进了社会的进步与发展，而生命科学技术的飞速发展尤其使人们的生活发生了翻天覆地的变化。随着研究的不断深入，技术水平的不断提高，生命科学与我们的生活的联系越来越紧密，悄悄地改变着我们生活的方方面面。生命科学是研究生命现象、生命活动的本质、特征和发生、发展规律，以及各种生物之间和生命与环境之间相互关系的科学。用于有效地控制生命活动，能动地改造生物界，造福人类生命科学与人类生存、人民健康、经济建设和社会发展有着密切关系，是当今在全球范围内最受关注的基础自然科学。 世界上这各种各样些生物物种的存在，使得我们的自然界变得丰富多彩，但是由于人类的快速发展，许多物种面临着灭绝和已灭绝的危机，所以从此刻开始，我们必须重视对物种多样性的保护，因为生物多样性是人类可持续发展的重要指标！ 生物多样性可以帮助清洁我们呼吸的空气以及喝的水，提供我们食物，为建造我们的屋子提供原材料，还带给我们自然世界的无尽美丽。正是生物多样性使这个星球上的生命得以持续。通过森林吸收二氧化碳这种温室气体，我们才得以呼吸空气。通过土壤、微生物和气象变化移除了水中的污物我们才得以喝到水。全部的物种--植物、动物、微生物，组成了生命。然而，我们却威胁到了许多物种，而正是它们构成地球这个宏伟的不能代替的支持生命的系统。 但是，为什么？我们对此怀着深深的疑问。一些无名的物种真的有这么重要？假如这个世界上的物种减少到牛、羊、鸡、猪和足够的放在动物园的动物，难道我们就不能舒服的过日子了吗？为什么我们必须关注一些特种的鸽子或者是一种火蜥蜴或者是一种生活在遥远沼泽里的小小植物？它们灭绝了关我们什么事？毕竟，我们还有许多种别的鸽子和许多种别的蜥蜴，还有许多种植物留下来。几千年前，人类以及他们所驯养的生物——狗、猫、猪等就开始与自然有了矛盾冲突。随着人口数量的增加和农业技术的提高，我们需要清除更多的森林并且保护自己的庄园以防各种人们虚构的或是真实存在的危险的发生。在这过程中我们已经开始令一些物种灭绝了，一些是因为被用来做衣服、做食物；另外一些是因为我们害怕，从而杀戮。专家估计，我们现在令物种灭绝的速度是动物自然灭绝速度的50-100倍。有一些物种灭绝得更快，大约是自然灭绝速度的1000-10000倍。

人类Y染色体DNA单倍型类群介绍2018

Y染色体DNA单倍群介绍 1、Y-DNA单倍群 人类Y染色体DNA单倍群由非重组DNA的Y染色体突变进行定义。这种由许多人共享的突变称为单核苷酸多态性（SNP）。人类Y染色体每一代大约积累两次突变。Y-DNA单倍群的分支结构组成一个Y染色体进化树，有数百甚至数千的突变由这些不同的单倍群共享。 Y染色体的最近的共同祖先（most recent common ancestor MRCA），也被称为Y染色体亚当，是目前活着的男性的最近的男性共同祖先。 Y染色体亚当估计生活在大约236000年前的非洲。通过研究其他瓶颈，所有欧亚大陆的人都是69000年前的一个男人的后裔。之后一个主要的遗传瓶颈期发生在大约5000年前，今天大多数欧亚大陆的人可以追溯到5000年前的十二个祖先。

Y-DNA单倍群进化树 单倍群 A & B 单倍群 A(M91)

单倍群A是所有单倍群起源点。现代所有单倍群都是单倍群A的后代，稀疏分布在非洲，主要集中在西南部的科伊桑人和尼罗河谷东北部人群。 单倍群 BT (M42,M94,M139,M299) 约55000年前分，BT是单倍群A的分支 单倍群B(M60) 单倍群B主要分布于非洲，主要集中于俾格米人群。 详细树形图：见B单倍群文件夹 单倍群 CT (P143) 标识单倍群 CT的突变标记是M168和M294.包含单倍群D、E、C、F,可能88000年前在亚洲或非洲出现。 单倍群 C (M130) 历史起源：C单倍群携带M130突变，来源于CF单倍群。中国境内的C单倍群主要是C2（携带M217突变），占中国总人口比例大约为5%—10%。其下游又可分为南北两大支，北支C2b（携带F1396突变），主要分布于蒙古族和满族等民族；南支C2c（携带F1067突变），几乎遍及全中国。 详细树形图：见C单倍群文件夹 Haplogroup C (M130, M216) 分布在亚洲、大洋洲和北美等 o Haplogroup C1 (F3393/Z1426) ?Haplogroup C1a (CTS11043) ?Haplogroup C1a1 (M8, M105, M131) 日本低频分布 ?Haplogroup C1a2 (V20) 欧洲和尼泊尔低频分布 ?Haplogroup C1b (F1370, Z16480) ?Haplogroup C1b1 (AM00694/K281) ?Haplogroup C1b1a (B66/Z16458)

生物多样性保护的意义及价值

生物多样性保护的意义及价值 论文摘要: 生物多样性的价值是巨大的，是人类赖以生存的基础。它提供着人类基本所需的全部食品、许多药物和工业原料。生物多样性对于人类社会的重要作用是难以估计的，估计全球经济有40%是基于生物的产品和工艺方面的。人类生存与发展，归根结底依赖于自然界各种各样的生物。生物多样性是人类赖以生存的各种有生命资源的总汇和未来工农业、医药业发展的基础，为人类提供了食物、能源、材料等基本需求。同时，生物多样性对于维持生态平衡、稳定环境具有关键性作用，为全人类带来了难以估价的利益。生物多样性的存在使人类有可能多方面多层次地持续利用甚至改造这个生机勃勃的生命世界。生物多样性是地球生命的基础。它的重要的社会经济伦理和文化价值无时不在宗教、艺术、文学、兴趣爱好以及社会各界对生物多样性保护的理解与支持等方面反映出来。它们在维持气候、保护水源、土壤和维护正常的生态学过程对整个人类做出的贡献更加巨大。生物多样性的意义主要体现在它的价值。对于人类来说，生物多样性具有直接使用价值、间接使用价值和潜在使用价值。 关键词：生物多样性人类发展地球价值 引言： 生物多样性是指在一定时间和一定地区所有生物（动物、植物、微生物）物种及其遗传变异和生态系统的复杂性总称。它包括遗传多样性、物种多样性和生态系统多样性三个层次。20世纪后叶生命科学各领域取得了巨大的进展，特别是分子生物学的突破性成就，使生命科学在自然科学中的位子起了革命性的变化，很多科学家认为在未来的自然科学中生物科学将成为带头学科，甚至预言本世纪是生物学的世纪。从事生命科学研究的专业人员也越来越多，例如，在美国近年统计48万博士学位获得者中从事生命科学的占51%。在生物科学诸多的分支中，保护生物多样性是当前生物科学最紧迫的任务之一，也是全球生物学界共同关心的焦点问题之一。据可靠的数据说明，每天约有100多种生物在地球上灭绝，很多生物在没有被人类认识以前就消亡了，这对人类无疑是一种悲哀和灾难。保护生物多样性的行动势在必行、迫在眉睫。 正文： 一、生物多样性的概念 20世纪80年代以后，人们在开展自然保护的实践中逐渐认识到，自然界中各个物种之间、生物与周围环境之间都存在着十分密切的联系，因此自然保护仅仅着眼于对物种本身进行保护是远远不够的，往往也是难于取得理想的效果的。还需要对物种所在的整个生态系统进行有效的保护。在这样的背景下，生物多样

生物多样性对人类生活的影响.pdf

题目: 保护物种多样性的重要性 摘要：我们人类是地球母亲的子女之一，千千万万的兄弟姐妹们本应与我们同样的享受地母 的爱抚于恩赐，然而随着人类的发展壮大，对地母的掠夺对其他生命的迫害日益加剧。人类的生产活动将其他生命的生活范围与生存资源一次又一次的压榨，尤其是十九世纪以来随着 工业革命的发展，动植物的生存面临更加巨大的危机。物种多样性的保护对于维持生态的平衡、促进人类生活的和谐健康发展有重要的意义。多姿的生物环境，多彩的生存空间对于人 类的经济和身心文化的发展都有极其重要的意义。为了我们自己和子孙后代的长远我们必须 认识到目前物种所面临的问题及其保护物种多样性的重要意义，并且在我们的社会发展过程 中做出自己的一点努力。 关键词：生物多样性可持续发展中国特色资源短缺 正文：在西方的神话传说中上帝是在第七日创造的人类，在我们人类被创造之前已经造出了 鸟兽虫鱼。虽然说是非科学的神话传说，没有科学的依据基础但是从另一种角度去分析却也 不难反映出物种是多样性的，我们人类并不是唯一的一种生物，还有许多各种各样的生物。 1、生物环境现状 1．1生物分类 在生物学的界绸中，依其科学的标准，将除了包括人类在内的世界上这许多各种各样的 生物，按照生物学的分类系统，将其划分为七个主要的级别：种、属、科、目、纲、门、界。 而这界、门、纲、目、科、属、种的划分单元中，种既物种是其基本单元，而属是近缘的种 的总合的归合。而近缘的属又被其归合为科，科隶于目，目隶于纲，纲隶于门，门隶于界。 1.2物种多样性所面临的严峻挑战 我们的世界上正因为有了这些许许多多的生物物种的存在，我们的自然界才会变得丰富 多彩。但是由于人类的快速发展，许多物种面临着灭绝和已灭绝的危机。下面就让我通过收集到的一些数据来向大家说明这一点。就离我们最近的20世纪来说，仅这短短的一点时间就 有大约20多万种的物种从此消失在了地球上。 1.2.1仅二十世纪消失于地球上的动物 昆士兰毛鼻袋熊于1900年灭绝；圣诞岛虎头鼠于1900年灭绝；澳米氏弹鼠于1901年灭绝；南加利福尼亚猫狐于1903年灭绝；纹兔袋鼠（澳洲大陆）于1906年灭绝；亚洲狮于1908年灭

保护生物多样性的重要意义

生物多样性的重要性及其保护 摘要：物种与物种、物种与环境之间总是相互作用，密切联系的。作为地球上最大的生态系统—生物圈中的一员，生物多样性亦是人类社会赖以生存和发展的基础。我们的衣、食、住、行及物质文化生活的许多方面都与生物多样性的维持密切相关。然而，随着人类的频繁活动以及工业发展，生物多样性逐渐丧失，一系列问题也接踵而至，保护生物多样性成为人们日渐关注的重要课题。 关键词：生物多样性生态系统直接价值间接价值就地保护迁地保护基因库生物多样性公约 1.背景 1936年最后一只袋狼死于塔斯马尼亚岛上的霍巴特动物园，1980年渡渡鸟灭绝，1987年黑海雀在南美洲销声匿迹，还有北美旅鸽、比利牛斯北山羊、爪哇虎……据世界《红皮书》统计，仅20世纪，就有110个种和亚种的哺乳动物以及139个种和亚种的鸟类在地球上永远消失。是什么原因导致了它们的灭绝呢？18世纪工业革命在极大程度上推进了人类社会的历史进程，然而这一切带来的却是生物资源过度的开采利用，环境污染以及其他生物栖息地的丧失。与此同时，随着人们能够更方便地往来各地，造成了生物栖息地的片段化以及外来物种入侵等状况。人类社会的不断发展使得越来越多的生物失去了生存的空间，最终导致了生物多样性的丧失。而这种在人类干预下物种灭绝的速度是自然速度的104-105倍！直到20世纪，面临着人口、资源、环境、粮食和能源等5大危机，人类才意识到了保护生物多样性的重要性，自此开展了一系列拯救珍稀濒危物种、防止自然资源的过度利用等方面的工作，并在1992年6月5日联合国所召开的里约热内卢世界环境与发展大会上正式通过了生物多样性公约。 2.生物多样性的价值 生物多样性是大自然的宝贵财富，与人类的生存和发展息息相关。同时，作为自然资源的重要组成部分，生物多样性具有难以估量的价值。一般将其分为以下三类： 2.1直接价值 生物为人类提供了食物、纤维、建筑和家具材料及其他生活、生产原料。 2.1.1生物多样性与食物 以食物而论，餐桌上我们之所以能吃到色、香、味各式不同的佳肴，正因为有各种各样不同生物的存在。仅仅是人类已经知道的约270,000种高等植物，能够被食用的就有10,000-15,000种，其中，又有大约7,000种被用于实际的农业生产。虽然真正被人类视为重要农作物的只是曾用于农业生产中的几百种植物，然而这些看似不多的种群类别中却又有着极高的基因多样性。而这些正为生产出产量更高，性能更优的农作物提供了可能，同时为人类提供了不同的风味需求。倘若地球上只有很少的几类生物，真的很难想象人类该如何满足口腹之欲。

保护生物多样性的意义及措施

保护生物多样性的意义及措施 西北农林科技大学水建学院土木104班 姓名：李明华学号：11 [摘要]生物多样性是人类社会赖以生存和发展的基础。我们的衣、食、住、行及物质文化生活的许多 方面都与生物多样性的维持密切相关。所以，人类为了保护自己的生存和发展，应采取必要的措施保护物种，保持生物多样性，使整个人类社会可持续发展。 [关键词]生物多样性; 就地保护; 迁地保护。 生物多样性是指地球上的生物( 动物、植物和微生物)在所有形式、层次和联合体中生命的多样化，包 括生态系统多样性、物种多样性和基因多样性。保护生物多样性是环境地理学的重要分支学科环境保护地 理学的重要内容之一。生物多样性是人类社会赖以生存和发展的基础。我们的衣、食、住、行及物质文化 生活的许多方面都与生物多样性的维持密切相关。随着生产的发展和人口增加、技术进步，不少物种正在 遭到过度开发和利用，许多地方不但生物资源已陷入枯竭境地，而且它们所栖息的生境也不断恶化。生物 多样性是全人类的共同财富。保护生物多样性即是保护物种，也是保护人类本身的生存。 1.保护生物多样性的重要意义 生物多样性直接作用 生物多样性为我们提供了食物、纤维、木材、药材和多种工业原料。我们的食物全部来源于自然界, 维持生物多样性, 食物品种会不断丰富。人民的生活质量会不断提高。在偏僻地区生活的居民的蛋白质主要来源于狩猎野生动物。在非洲野生动物的肉制品在人们食物中占据了所需蛋白质的很高比例。生物多样性对人类健康的贡献更是不可估量.。在科学技术发达的今天, 人们的医疗保健在很大程度上仍依赖于生物。大约80%的世界人口仍主要依赖从植物中获得的各种药材。中国有记载的药用植物就有5000 多种, 其中1700种为常用药物，相当多的陆生动物也是医药来源，如蜂毒可以治疗关节炎, 某些蛇毒能控制高血压, 斑 癌症。目前, 已知的具有抗癌潜力的海洋生物就有500余种, 蝥素可以治疗某些[]1 但被人们研究应用的仅是其中极少一部分。生物多样性还为人类提供多种多样的工业原料, 如木材、纤维、橡胶等。甚至能源———石油、煤、天然气等也是由古代森林所储藏的几百万年前的日光能所提供。木材是一些发展中国家的重要出口产品, 全世界每年的木材产值在750 亿美元以上。现代工业生产还需要开发 能源。 更多新的生物资源, 以提供原料和新型[]2 另外，生物遗传多样性为人类提供了大量的基因资源。每一个物种或品种在遗传组织上都可能是唯一的, 即使是一草一木也应该珍惜。谁能在若干年前就想到中药天花粉的蛋白质不仅能治愈绒毛膜皮癌, 而且还是治疗艾滋病的良药人类未来还会面临各种各样意想不到的挑战, 那些现在看来毫无用处, 微不足道的生物, 也许将来某一天却能帮助人类免于饥荒, 祛除疾病而继续生存下去。 生物多样性的间接作用 生物多样性在大气层成分、地球表面温度、地表沉积层氧化还原电位以及PH 值等方面的调控发挥着重要作用。例如, 现在地球大气层中的氧气含量为21%, 供给我们自由呼吸, 这主要应归功于植物的光合作用。在地球早期, 大气中氧气的含量要低很多。据科学家估计, 假如断绝了植物的光合作用, 那么大气层中

生物多样性对人类的意义

保护生物多样性对人类的重要意义摘要：生物多样性是维持生态平衡、促进人与自然和谐发展的重要成分，保护生物多样性，对于人类经济和未来的发展都是极其有利的。本文通过自身对保护生物多样性对人类的重要意义的理解，结合社会发展过程中存在的一些问题，对保护生物多样性提出自己的见解和呼吁。 关键词：生物多样性；人类发展；重要意义 1992年在巴西里约热内卢世界环境与发展大会上签署的《生物多样性保护公约》把生物多样性提到了与世界和平与发展同等重要的地位，已成为国际社会共同关注的热点问题。生物多样性是人类赖以生存和发展的物质源泉，目前生物多样性的丧失已严重威胁到人类的生存和发展，专家估计:地球上已知的生物种的25%已消失，并有20%一30%还有消失的危险。而任何多样性的丧失是不可逆的、不可再生的，对人类的损失是不可估量的。因此保护生物多样性已成为全球共同的呼声，将有利于环境保护和生物资源的持续利用，对人类具有极为重要的意义，需要全人类共同采取迫切行为。 1.生物多样性的概念 生物多样性是生物及其环境形成的生态复合体以及与此相关的各种生态的总和。生物多样性一词80年代初出现在自然保护刊物上，是指生物的变异性。它包括数以万计的动物、植物、微生物和它们所拥有的基因以及它们与生存环境形成的复杂的生态系统。是一个描述自然界多样性程度内容的广泛概念，其中研究较多、意义重大的主要包括遗传多样性、物种多样性、生态系统多样性和景观多样性四个层次。 不同水平的生物多样性是紧密联系、不可分割的。生态系统的功能是由物种表现的，物种具有不同的特征是因为其具有不同的基因型。换言之，某一水平的多样性是由其下一级生命实体的不同组合方式形成的，尽管不同水平的多样性都很重要，但从目前生物多样性的现状、研究方法或手段的成熟与难易程度，人力及财力资源的承受能力等方面考虑，都有其各自的研究重点。可以认为，物种多样性是生物多样性研究的基础，生态系统多样性是生物多样性的研究重点。 2．生物多样性的表现 科学家们曾在一棵树上发现多达650种的昆虫，它们是如何结成一个生态系统的？ 即使是一只昆虫本身也能自成一大千世界。将一只蜣螂置于显微镜下，可以惊讶地发现蜣螂的背上和翅膀上各住着两种不同的虫子，两种虫子因种类不同，栖息地也不一样，它们之间是如何达成协议的？

分子生物学复习重点

第六章基因表达调控 1. 顺式作用元件：指调控真核生物结构基因转录的DNA序列，包括启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和反应元件等。它们通过与反式作用因子相互作用来发挥转录调控作用。 2.反式作用因子：指真核基因的转录调节蛋白，包含DNA结合结构域和转录激活结构域。它们与顺式作用元件、RNA聚合酶相互作用，以及转录因子之间相互协同或者拮抗，反式调控另一基因的转录。 3. 操纵子：原核生物绝大多数基因按照功能相关性成簇串联排列，与启动子、操纵基因等调控元件共同组成一个转录单位，实现协调表达。 4.增强子是一种能够提高转录效率的顺式作用元件。 5.真核生物的调控元件：顺式作用元件和反式作用因子 6. 顺式作用元件是指起转录调控作用的DNA序列，包括启动子、增强子、沉默子等。 7.转录水平的调控是原核生物基因表达的关键环节。 8.大肠杆菌的RNA聚合酶是σ亚基和核心酶构成。 9.转录起始是真核生物基因表达调控的关键。 10.真核生物表达可以在DNA水平、转录水平、转录后水平、翻译水平、翻译后水平上进行调控。 11..基因表达调控的基本规律是？ A、基因表达具有时空特异性。 B、诱导表达和阻遏表达是基因表达调控的普遍方式。 C、基因表达受顺式作用元件和反式作用因子共同调节。 D、蛋白质-DNA以及蛋白质-蛋白质的相互作用是基因表达调控的分子基础。 E、基因表达调控是多层次的复杂调节。 12.真核基因组的特点有？ A．真核基因组比原核基因组大得多。B.真核基因组中只有10%的序列编码蛋白质、rRNA、tRNA。C.真核生物编码蛋白质的基因是不连续的，转录后需要剪接去除内含子，这就增加了基因表达调控的层次。D.真核生物是一个结构基因转录生成一条mRNA，即mRNA是单顺反因子，许多功能相关的蛋白将涉及多个基因的协调表达。E.真核生物DNA在细胞核内与多种蛋白质结合构成染色质，这种复杂的结构直接影响着基因表达。F.真核生物的遗传信息不仅存在于核DNA上，还存在于线粒体DNA上，调控既相互独立而又需要协调。第八章细胞信号转导 1、受体:位于细胞膜上或细胞内能特异识别配体并与之结合，进而引起生物学效应的特殊蛋白质，个别是糖脂。 2、信号转导：是通过多种分子相互作用的一系列有序反应，将来自细胞外的信息传递到细胞各种效应分子的过程。 3、第二信使物质：cAMP、cGMP、DAG、Ca2+、IP3等。 4.受体分膜表面受体和细胞内受体。膜受体分为离子通道型受体、G蛋白偶联受体、蛋白激酶偶联受体。 5.调节信号转导分子主要包括G蛋白和接头蛋白。 6.各种信号转导机制具有的共同基本规律有？ A、信号的传递和终止涉及许多双向反应。 B、细胞信号在转导过程中被逐级放大。 C、细胞信号转导途径既有通用性又有特异性。 7.G蛋白偶联受体介导的细胞信号转导途径有？ .1)cAMP-PKA途径。 2)IP3/DAG-PKC途径。 3)Ca2+/钙调蛋白依赖性蛋白激酶途径。 第十一章 1.抑癌基因：一类编码产物起抑制细胞增殖信号转导、负性调节细胞周期的作用，从而抑制细胞增殖和抑制肿瘤生成的基因。 2.癌基因：是指细胞内或病毒内存在的、编码产物能促使正常细胞恶性转化，即发生恶性变的基因。 3.癌基因包括细胞癌基因和病毒癌基因。

保护生物多样性及其潜在价值

保护生物多样性及其潜在价值 摘要：当今世界，地球破坏造成了人类生存环境的极度恶劣，已形成人类生存的困境，令人类无可奈何的活着。人类虽然似乎享受着现代工业文明的幸福，其实尚不如人类的祖先。人类正在面临着生物多样性的危机，面临着地球毁灭的危机。我针对我国目前保护生物以及生物发展状况，论述一下在我眼里的现代生物的发展状况以及采取的措施，在我看来保护生物的关键所在对人类的影响。 关键词:保护生物生态环境使用价值保护措施 1：引言 “生物多样性”是生物（动物、植物、微生物）与环境形成的生态复合体以及与此相关的各种生态过程的总和，包括生态系统、物种和基因三个层次。生物多样性是人类赖以生存的条件，是经济社会可持续发展的基础，是生态安全和粮食安全的保障。 认识生物的多样性是为了更好地保护和合理利用生物的多样性。保护生物的多样性是一项艰巨的任务，涉及到方方面面的问题。保护生物的多样性是可持续发展的重要内容 2：正文 近年来，物种灭绝的加剧，遗传多样性的减少，以及生态系统特别是热带森林的大规模破坏，引起了国际社会对生物多样性问题的极大关注。生物多样性丧失的直接原因主要有生境丧失和片段化、外来种的侵入、生物资源的过度开发、环境污染、全球气候变化和工业化的农业及林业等。但这些还不是问题的根本所在，根源在于人口的剧增和自然资源消耗的高速度、不断狭窄的农业、林业和渔业的贸易谱、经济系统和政策未能评估环境及其资源的价值、生物资源利用和保护产生的惠益分配的不均衡、知识及其应用的不充分以及法律和制度的不合理。总而言之，人类活动是造成生物多样性以空前速度丧失的根本原因。 中国是生物多样性特别丰富的国家之一。据统计，中国的生物多样性居世界第八位，北半球第一位。同时，中国又是生物多样性受到最严重威胁的国家之一。中国的原始森林长期受到乱砍滥伐、毁林开荒等人为活动的影响，其面积以每年0．5×104km2的速度减少；草原由于超载过牧、毁草开荒的影响，退化面积达87×104km2。生态系统的大面积破坏和退化，不仅表现在总面积的减少，更为严重的是其结构和功能的降低或丧失使生存其中的许多物种已变成濒危种或受威胁种。高等植物中有4000—5000种受到威胁，占总种数的15％—20％。在“濒危野生动植物种国际贸易公约”列出的640个世界性濒危物种中，中国就占156种，约为其总数的1／4，形势是十分严峻的。 生存环境的改变和破坏，这是我国生物多样性面临威胁的主要原因。我国人口的增长和经济的发展，对自然资源的需求越来越多。森林的超量砍伐、草原的过度开垦、过度放牧，以及围湖造田、沼泽开垦、过度利用土地和水资源等，都导致野生生物生存环境遭到破坏，甚至消失，影响到物种的正常生存。例如，过去北大荒(东北的沼泽湿地)曾出现的“棒打狍

论述生物多样性的意义

论述生物多样性的意义 进八工业化社会以来，随着人口的增加，生产技术的进步和消费水平的提高，人类正以前所未有的规模和唱度影响环境，改变环境，使全球生命支持系统臼。持续性受到严重威胁，现了诸如资源短缺、物种锐减、环境胁迫、气候异常、灾害频繁、生态危机等一系 列世界性问题。这些问题已经对全球经济的持续发展和地球的长期可居住条件造成了相 当大的影响，甚至成为国际和平与安全谈半lJ中必须关注的大事。鉴于这种背景，1992年6月在巴西里约热内卢召开了“联合国环境与发展大会”.其中，“生物多样性(biodlversi- ty)”被作为大会讨论的中心议题之一，并成为《21世纪议程》的重要组成部份。100多个国家和地区的首脑还第一次签署了(联合国生物多样性公约》。同时，生物多样性问题已 被联合国环境规划署确认为与全球气候变暖、臭氧层破坏和有害废物转移相并列的四大全球环境问题之一。可见，作为环境与资源保护的重要组成部份—生物多样性保护已被提到了国际议事日程，成为当今世界普遍关注的问题。生物多样性是现代生态学、资源科学和 环境科学研究的热点之一。其含义是指生物之间的多样性和变异性，以及物种与生存环 境之间的生态复杂性，是地球上所有生命形式的总称，它包括植物、动物和微生物在内的所有物种，以及它们所拥有的遗传基因和它们构成的生态系统。通常分为三个层次:遗 传多样性、物种多样性和生态系统多样性。但从内涵、外延及分化的基础上来看，还应增加生物地理景观多样性和生物圈多样性两上层次。生物多样性这一概念把遗传基因、物种、生态系统和生态环境等有机地联系起来了，不但包括丰富的生物资源，而且还包括生物赖以生存的无机环境，这说明人类对生物圈有了从质方面更深入的认识。在地球历史发展时期，由于地质和气候的变过，生物多样性在三个层次上均有一些‘作者:冯维波，中国科学院兰州文献情报中心，(资源生态环境网络研究动态》编辑部四川环境1995年第14卷第4期类型不断产生，一些类型不断消失，但总的来 讲，还是处于相对的平衡状态。然而，作为重要生物类群的人类，当其从“自然人”进化为“智能人了演化阶段，即从自然生态系统的一个普通成员进化为单优势种群后，就对地球上的生物多样性产生了愈来愈大的影响，打破了生物多样性相对平衡的洛局。特别是进 入工业化社会以来的生育过渡和粗放外延式的经济发展模式，使得许多物种、遗传基因，以及生态系统类型还未被人类所开发利用就丧失掉了。目前，对全球生物的估计大约在200万一1亿种之间，最好的估计是1000万种，而其中只有140万种被鉴定注册，说明人类对整个生物圈还知之甚少。据联合国环境规划署在(1991年世界环境报告)中的预测，1990 一2000年间，由于生态环境的被破坏，将使5一15%的物种消失。另据报道，每年大约有15一5万个物种从地球上消失掉(这比地球历史上任何时期的灭绝速率都高，在过去的2亿年中，脊椎动物的灭绝速度大约为每个世纪90种;在过去的4亿年中，植物的灭绝速度大约为每27年1种)，可能在未来20一 30年中，将有25%的物种处于来绝的危险。鸟类和哺乳类动物的灭绝速度几乎要比过去 」决100一1000倍。全球热带森林的面积大约有8一12亿ha，生长了50%以上的物种。据联合国粮农组织和联合国环境规划署估计，每年至少有1100万ha的热带森林被彻底消失，另有1000万ha遭到严重破坏，致使每年有0.5一 10%生长在其中的物种被又绝。就热带封育林而言，年砍伐率高达0.6%，即使扣除新 植林和自然增长，也将在177年内全部消失。由于人类活动的影响，在非洲南撒哈拉地区，野生生物栖息地的丧失率高达65%;在亚洲热带地区达67%，其中，孟加拉国和香港高 达90%以上;而我国虽野生生物栖息地占国土面积的比例不大，但丧失率也高达61啊，。 由于栖息地面积逐渐缩小和片断化，导致了野生生物种内遗传多样性的严重丧失， 出现近亲交配，种群萎缩，致使野生生物种对疾病、气候变化和栖息地变迁的抵抗力降低，从而使驯化物种的品种迅速减少，抗病虫害的能力大为降低，如世界每年因作物单一型

生物多样性的重要意义以及现今生物多样性的现状

生物多样性的重要意义以及现今生物多样性的现状 一、生物多样性的重要意义 生物多样性是人类社会赖以生存和发展的基础。我们的衣、食、住、行及物质文化生活的许多方面都与生物多样性的维持密切相关。 1 、生物多样性为我们提供了食物、纤维、木材、药材和多种工业原料。我们的食物全部来源于自然界，维持生物多样性，我们的食物品种会不断丰富。人民的生活质量会不断提高，从温饱型向小康型转变。 2、生物多样性还在保持土壤肥力、保证水质以及调节气候等方面发挥了重要作用。黄河流域曾是我们中华民族的摇篮，在几千年以前，那里还是一片十分富饶的土地。树木林立，百花芬芳，各种野生动物四处出没。但由于长期的战争及人类过度地开发利用，这里已变成生物多样性十分贫乏的地区，到处是黄土荒坡，遇到刮风的天气便是飞沙走石，沙漠化现象十分严重。近年来由于人工植树，大搞"三北防护林"工程，生物多样性得到了一定程度的恢复，沙漠化进程得到了抑制，森林覆盖率逐年上升，环境不断得到改善。 3、生物多样性在大气层成分、地球表面温度、地表沉积层氧化还原电位以及PH 值等方面的调控方面发挥着重要作用。例如，现在地球大气层中的氧气含量为21%，供给我们自由呼吸，这主要应归功于植物的光合作用。在地球早期的历史中，大气中氧气的含量要低很多。据科学家估计，假如断绝了植物的光合作用，那么大气层中的氧气，将会由于氧化反应在数千年内消耗殆尽。 4、生物多样性的维持，将有益于一些珍稀濒危物种的保存。任何一个物种一旦灭绝，便永远不可能再生。今天仍生存在我们地球上的物种，尤其是那些处于灭绝边缘的濒危物种，一旦消失了，那么人类将永远丧失这些宝贵的生物资源。而保护生物多样性，特别是保护濒危物种，对于人类后代，对科学事业都具有重大的战略意义。 二、生物多样性的现状 生物多样性是指一定范围内多种多样活的有机体(动物、植物、微生物) 有规律地结合所构成稳定的生态综合体。这种多样包括动物、植物、微生物的物种多样性，物种的遗传与变异的多样性及生态系统的多样性。 20世纪以来，随着世界人口的持续增长和人类活动范围与强度的森林生态系统不断增加，人类社会遭遇到一系列前所未有的环境问题，生物多样性逐渐降低。 我国是生物多样性特别丰富的国家之一。据统计，我国的生物多样性居世界第八位，北半球第一位。同时，我国又是生物多样性受到最严重威胁的国家之一。我国的原始森林长期受到乱砍滥伐、毁林开荒等人为活动的影响，其面积以每年0.5×104km2的速度减少；草原由于超载过牧、毁草开荒的影响，退化面积达 87×104km2。生态系统的大面积破坏和退化，不仅表现在总面积的减少，更为严重的是其结构和功能的降低或丧失使生存其中的许多物种已变成濒危种或受威胁种。高等植物中有4000种~5000种受到威胁，占总种数的15％~20％。在《濒危野生动植物种国际贸易公约》列出的640个世界性濒危物种中，中国就占156种，形势是十分严峻的。

保护生物多样性对人类的重要意义

生物多样性保护与利用论文题目：保护生物多样性对人类的重要意义 院（系）： 专业： 班级： 姓名： 学号： 成绩： 完成日期：年月日

保护生物多样性对人类的重要意义摘要：生物多样性是维持生态平衡、促进人与自然和谐发展的重要成分，保护生物多样性，对于人类经济和未来的发展都是极其有利的。本文通过自身对保护生物多样性对人类的重要意义的理解，结合社会发展过程中存在的一些问题，对保护生物多样性提出自己的见解和呼吁。 关键词：生物多样性；人类发展；重要意义 1992年在巴西里约热内卢世界环境与发展大会上签署的《生物多样性保护公约》把生物多样性提到了与世界和平与发展同等重要的地位，已成为国际社会共同关注的热点问题。生物多样性是人类赖以生存和发展的物质源泉，目前生物多样性的丧失已严重威胁到人类的生存和发展，专家估计:地球上已知的生物种的25%已消失，并有20%一30%还有消失的危险。而任何多样性的丧失是不可逆的、不可再生的，对人类的损失是不可估量的。因此保护生物多样性已成为全球共同的呼声，将有利于环境保护和生物资源的持续利用，对人类具有极为重要的意义，需要全人类共同采取迫切行为。 1.生物多样性的概念 生物多样性是生物及其环境形成的生态复合体以及与此相关的各种生态的总和。生物多样性一词80年代初出现在自然保护刊物上，是指生物的变异性。它包括数以万计的动物、植物、微生物和它们所拥有的基因以及它们与生存环境形成的复杂的生态系统。是一个描述自然界多样性程度内容的广泛概念，其中研究较多、意义重大的主要包括遗传多样性、物种多样性、生态系统多样性和景观多样性四个层次。 不同水平的生物多样性是紧密联系、不可分割的。生态系统的功能是由物种表现的，物种具有不同的特征是因为其具有不同的基因型。换言之，某一水平的多样性是由其下一级生命实体的不同组合方式形成的，尽管不同水平的多样性都很重要，但从目前生物多样性的现状、研究方法或手段的成熟与难易程度，人力及财力资源的承受能力等方面考虑，都有其各自的研究重点。可以认为，物种多样性是生物多样性研究的基础，生态系统多样性是生物多样性的研究重点。 2．生物多样性的表现 科学家们曾在一棵树上发现多达650种的昆虫，它们是如何结成一个生态系统的？ 即使是一只昆虫本身也能自成一大千世界。将一只蜣螂置于显微镜下，可以惊讶地发现蜣螂的背上和翅膀上各住着两种不同的虫子，两种虫子因种类不同，栖息地也不一样，它们之间是如何达成协议的？

《生物多样性的意义》教学设计

生物多样性的意义 教学背景分析： 生物多样性是人类生存的重要资源，也是维护地球环境的重要资源。现今，全世界都在关注生物多样性的问题，并为保护生物的多样性做着种种努力。学生在认识了生物种类的多种多样；同种生物不同个体之间的差异；生物个体不同的形态结构与他们生活环境关系的基础上，认识多种多样的生物存在的意义。这是一节总结提升课。 认识生物的多样性，就是为了更好地理解生物多样性的意义；我们寻找造成生物多样性的原因，就是为了更好地保护生物的多样性。 教学设计思路： 依据本课的特点，学生的认知规律，发现学生对生物的多样性认识是零散的。我们需要做的是帮助学生整理和提升他们已有的认识，并进一步丰富他们的认识。因此采取如下教学策略： （1）引领学生通过收集资料丰富生物多样性对人类意义的认识； （2）通过组织学生分主题整理资料，概括并展示生物多样性与人类的关系，使学生的认识更加清晰。 （3）讨论保护家乡生物多样性的策略，在参与决策过程中体会学习的乐趣。 教学目标： 科学概念 生物多样性对于人类生存具有意义。 生物多样性对于其他生物的生存具有意义。 生物多样性对于维护地球环境具有意义。 保护生物多样性就要保护它们生活的环境。 过程与方法 用图表、文字或小论文等方式阐释生物多样性与人类的关系。 情感、态度、价值观 树立保护生物多样性的意识。 教学重点： 知道生物多样性对于人类生存的意义。体会生物多样性对于维护地球环境具

有重要意义。 教学难点 能用图表、文字或小论文等方式阐释生物多样性与人类的关系。 教学准备 教师准备：图片：昆虫在花上吸食花蜜水稻田中的蝗虫水稻下面有只青蛙 为全班准备：几张大白纸、几支记号笔。 为每组准备：不同主题内容的生物多样性的意义及保护的打印资料、几张A4纸。 板书设计 教学过程 一、激情导入新课： 地球是我们美丽的家园，各种各样的生物，在这个家园中都扮演着不同的角色，它们相互依存，相互作用，相互影响。 二、探究活动： （一）、生物多样性与我们生活的关系是怎样的 想一想：一天中，我们会做哪些事情？其中有多少是与生物有关的？ （与我们的衣、食、住、行相关的生物：面包、书、铅笔、鸡蛋、苹果、牛奶等，橡胶树、奶牛、鸡、棉花、水稻、梨树、苹果树、树木和小麦等。）目的：体会生物多样性与我们生活的密切关系。 （二）、组织学生分主题收集资料阐明生物的多样性与人类生存的关系 1、讨论生物的多样性与我们人类有怎样的关系？想一想可以怎样做？（《生物多样性的意义》的学习评价单） （预设：根据学生兴趣分成：植物与人类关系调查组；动物与人类关系调查组；生物多样性的药用价值，欣赏价值调查组，什么是生物多样性？生物多样性的意义调查组？中国生物多样性的特点？我国生物多样性面临的主要威胁？人