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生物化学名词解释

生物化学名词解释

1.蛋白质(protein)的一级结构(primary structure):多肽(polypeptide)链中,氨基酸(amino acid)

的排列顺序,其主要化学键为肽键(peptide bond)。

2.蛋白质的二级结构:指蛋白质中某一段肽链主链C原子的空间排布

3.蛋白质的三级结构(tertiary structure):指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条

肽链所有原子在三维空间的排布顺序。

4.结构域(domain):蛋白质的三级结构常可以分割成一个或数个球状区域,折叠较为紧密,各行其功

能,成为结构域。

5.蛋白质的四级结构:蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用称为蛋白质的

四级结构。

6.蛋白质的等电点:在某一溶液中,蛋白质分子解离成正负离子的趋势相等。成为兼性离子,其净电荷

为零,此时溶液的PH值即为该蛋白质的等电点。

7.蛋白质变性(denatutation):在某些理化因素作用下,致使蛋白质的空间构象(conformation)破坏,

从而改变蛋白质的理化性质和生物活性,称为蛋白质变性。

8.肽单元(peptide uni):参与组成蛋白质的6个原子位于同一平面,叫肽单元。它是蛋白质构想的基本

结构单位。

9.模体(Motif):在蛋白质分子中,在空间上相互接近的两个或三个具有二级结构的肽段,形成一个特

殊的空间构象,并具有相应的功能,叫做模体或模序。

10.亚基(subunit):具有四级结构的蛋白质中每条具有独立三级结构的多肽链,称为亚基。

11.蛋白质组:一种细胞或一种生物所表达的全部蛋白质。

12.变构效应(allosteric effect):蛋白质空间构象及其功能改变,称为变构效应。

13.协同效应:

甘氨酸(Glycine)丙氨酸(Alanine)酪氨酸(Tyrosine)苏氨酸(threonine)

球蛋白(globulin)β-折叠(β-pleated sheet)阮病毒(prion)

14.全酶(holoenzyme):酶(enzyme)蛋白与辅助因子(prosthetic)结合形成的复合物。

15.化学修饰:蛋白质肽链上的某些残基可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而引起酶活性的改变。

16.米氏常数Km(Michaelis constant):等于酶促反应速率为最大速率一半时的底物(substrate)浓度。

Km值是酶的特征性常数。

17.变构调节:小分子化合物与酶蛋白分子活性中心以外的某一部分特异结合,引起酶蛋白分子构象变化,

从而改变酶的活性。

18.酶的活性中心(active center):酶蛋白分子中能与底物特异结合并发挥催化作用,将底物转变为产物

的部位称为酶的活性中心或活性部位。

19.酶原(zymogen)激活:有些酶在细胞内合成或初分泌,或在其发挥催化功能前只是酶的无活性前体,

必需在一定条件下,这些前体水解开一个或几个特定的肽键,致使构象发生改变,表现出酶的活性。

这种无活性酶的前体称为酶原,酶原向酶的转化过程称为酶原的激活。

20.多酶体系:由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。

21.同工酶(isoenzyme):是指催化相同的化学反应,但酶分子结构、理化性质及免疫学性质等不同的一

组酶。

乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase)辅酶(coenzyme)可逆抑制剂(reversible inhibitor)

竞争抑制剂(competitive inhibition)变构作用(allosteric effect)

必需基团(essential group)共价修饰(covalent modification)

变构酶(allosteric enzyme)不可逆抑制(irreversible inhibition)最适PH(optimum PH)金属酶(metalloenzyme)

结合酶(conjuncted enzyme)酶的特异性(specificity of enzyme)活化能(activation energy)

激活剂(activator)酶促反应动力学(kinetics of enzyme-catalyzed reaction)

22.呼吸链(respiratory chain):代谢物脱下的成对氢原子(2H)通过多种酶和辅酶所催化的连锁反应逐

步传递,最终与氧结合生成水。

23.氧化磷酸化(oxidative phosphorylation):在呼吸链电子传递过程中偶联ADP磷酸化,生成ATP。

24.P/O比值:物质氧化时,每消耗一摩尔氧原子所消耗无机磷的摩尔数(或ADP摩尔数),即生成ATP

的摩尔数。

25.底物水平磷酸化(substrate-level phosphorylation):细胞内的一种直接将代谢物分子中的能量转移至

ADP(或GDP),生成ATP(或GTP)的过程。

26.电子传递链(electron transfer chain)细胞色素(cytochrome)寡霉素敏感相关蛋白(OSCP)

27.生物氧化(biological oxidation)

28.糖酵解(glycolysis):在机体缺氧的情况下,葡萄糖或糖原生成乳酸的过程。

29.糖异生(gluconeogenesis):从非糖化合物(乳酸、甘油、生糖氨基酸等)转变为葡萄糖或糖元的过

程。

30.TCA循环:由乙酰CoA与草酰乙酸缩合成柠檬酸开始,经4次脱氢、2次脱羧再生成草酰乙酸的循环

反应过程。

31.Cori循环:肌收缩(尤其是供氧不足时)通过糖酵解生成乳酸,乳酸通过细胞膜弥散入血后再入肝,

在肝内异生成葡萄糖,葡萄糖入血后又可被肌肉摄取,这种循环成为乳酸循环(Cori cycle)。

32.糖的有氧氧化(aerobic oxidation):葡萄糖在有氧条件下,彻底氧化成H2O和CO2的反应过程。

磷酸戊糖途径(pentose phosphate pathway)糖原合酶()糖原磷酸化酶(plycogen phosphorylase)血糖(Blood sugar)三羧酸循环(tricarboxylic acid cycle)胰高血糖素(Glucagon)胰岛素(Insulin)丙酮酸脱氢酶复合体(pyravate dehydrogenase complex)6-磷酸葡萄糖(Glucose-6-phophate)柠檬酸合酶(citrate synthase)

33.必需脂酸(Essential fatty acid):体内营养必需,但又不能合成或合成量不足,必须从食物中摄取的脂

肪酸,均为多价不饱和脂肪酸,如亚麻酸、亚油酸和花生四烯酸(Arachidonic acid)等。

34.脂肪动员(Fat mobilization):脂肪组织中的甘油三酯(Triglyceride),被脂肪酶逐步水解为游离脂肪

酸和甘油,释放入血供其他组织氧化利用。

35.激素敏感性酯酶(Hormone sensitive lipase):脂肪细胞中的甘油三酯酶是脂肪分解的限速酶,能受多

种激素的调控,称为~。

36.酮体(Ketone bodies):是脂酸在肝分解氧化时特有的中间代谢产物,包括乙酰乙酸、β-羟丁酸和丙

酮。酮体作为能源物质,在肝外氧化利用。

37.β-氧化:脂酸的氧化分解时从脂酸的羧基端β位碳原子开始的,所以称为~,它是脂酸氧化分解的主

要方式。

胆碱(Choline)酰基载体蛋白(ACP)乳糜微粒(CM)极低密度脂蛋白(VLDL)

高密度脂蛋白(HDL)卵磷脂胆固醇脂酰转移酶(LCAT)脂类(Lipids)类脂(Lipoid)

磷脂(Phospholipid)磷脂酶(phospholipase)胆固醇(Cholesterol)脂蛋白(LIpoprotein)

载脂蛋白(Apolipoprotein)脂蛋白酯酶(Lipoprotein lipase)

38.氮平衡(Nitrogen balance):测定尿与粪中的含氮量(排出氮)及摄入食物的含氮量(摄入氮)可以

反映人体蛋白质的代谢情况。

39.腐败作用(Putrefaction):消化过程中,有一小部分蛋白质不被消化,也有一小部分消化产物不被吸

收,肠道细菌对这部分蛋白质及其消化产物所起的作用,称为~。

40.生糖兼生酮氨基酸:在体内可以转变成糖及酮体的氨基酸。

41.必需氨基酸:指体内需要而又不能自身合成,必需由食物提供的一类氨基酸。

42.一碳单位(One carbon unit):指某些氨基酸分解代谢过程中产生含有一个碳原子的基团,包括甲基、

亚甲基、甲烯基、甲炔基、甲酰基及亚氨甲基等。

43.氨基酸代谢库:食物蛋白质经消化而被吸收的氨基酸(外源性氨基酸)与体内组织蛋白降解产生的氨

基酸(内源性氨基酸)混在一起,分布于体内各处,参与代谢,称为氨基酸代谢库,

44.联合脱氨基作用:氨基酸首先与α-酮戊二酸在转氨酶的作用下,生成相应的α-酮酸和谷氨酸,然后

谷氨酸再经L-谷氨酸脱氢酶的作用脱去氨基而生成α-同戊二酸,后者再继续参加转氨基作用

(Transanmination)。

3`-磷酸腺苷-5`-磷酸硫酸(PAPS)谷丙转氨酶(ALT)谷草转氨酶(AST)S-腺苷甲硫氨酸(SAM)丙氨酸-葡萄糖循环(Alanine-glucose cycle)鸟氨酸循环(Ornithine cycle)

45.Tm值(melting temperature):DNA变性解链过程中,紫外吸光度的变化ΔA260达到最大变化值一半

时所对应的温度称为DNA的解链温度(Tm)。在Tm时,核酸分子内50%的双链结构被打开,Tm值与DNA的分子大小和碱基中的GC含量成正比。

46.DNA变性:某些理化因素(温度、Ph、离子强度等)会导致DNA双链的互补碱基对之间的氢键断裂,

使DNA双螺旋结构解离为单链的现象即为DNA变性,DNA变性只改变其二级结构,不改变它的核苷酸排列。

47.核酸分子杂交(hybridization):热变性的DNA分子在复性过程中,具有碱基序列部分互补的不同的

DNA(RNA)单链之间或DNA与RNA之间形成杂化双链的现象。

48.核酶(ribozyme):具有催化作用的小RNA分子。

49.基因组:某一生物个体拥有的全部遗传物质,从分子意义上说,是指全部的DNA序列。

50.核小体(nucleosome):是染色质的基本组成单位,由DNA和H1、H2A、H2B、H3、H4五种组蛋白共

同构成。

51.退火(annealing):热变性的DNA经缓慢冷却后即可恢复天然的双螺旋构象的过程。

a)核糖体:ribosome 嘌呤:purine 嘧啶:pyrimidine 小沟:minor groove

b)大沟:major groove RNA干涉:RNA interference

c)不均一核RNA:heterogeneous nuclear RNA 中心法则:the central dogma

52.从头合成途径(de novo synthesis):以磷酸核糖、CO2、氨基酸、一碳单位等小分子物质为原料,经

过一系列酶促反应,合成核苷酸的途径。

53.补救合成途径(salvage pathway):利用体内现成碱基或核苷,经过简单的反应,合成核苷酸的途径。

a)次黄嘌呤核苷酸:IMP 磷酸核糖焦磷酸:PRPP 6-巯基嘌呤:6MP

b)5-氟尿嘧啶:5-FU 尿酸:uric acid 别嘌呤醇:allopurinol

54.基因(gene):是指DNA中的特定区段,其中的核苷酸排列顺序决定了基因的功能。

55.半保留复制(semi-conservative replication):DNA生物合成时,母链DNA解开为两股单链,各自作为

模板按碱基配对规律,合成与模板互补的子链。子代细胞的DNA一股单链从亲代完整的接受过来,另一股链则完全重新合成,两个子细胞的DNA都和亲代DNA碱基序列一致的复制方式。

56.复制叉(replication fork):DNA双链解开分成两股,各自作为模板,子链沿模板延长所形成的Y字形

结构。

57.领头链(the leading strand):顺解链方向生长的子链,复制是连续进行的,这股链称为领头链。

58.随从链(the lagging strand):复制方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,只能不连续复

制的链。

59.逆转录:以RNA为模板在逆转录酶的作用下合成DNA的过程。

60.冈崎片段(Okazaki fragment):在DNA复制过程中,随从链的合成是不连续的短核苷酸。

61.端粒(telomere):是真核生物染色体线性DNA分子末端的结构,膨大呈粒状,由DNA和其结合蛋白

组成。端粒在维持染色体稳定性和DNA复制的完整性具有重要作用。

62.端粒酶(telomerase):由RNA、协同蛋白和逆转录酶组成的,提供RNA模板和催化逆转录(reverse

transcription)的功能,对维持染色体的完整有作用。

63.点突变(point mutation):DNA分子的碱基错配又称为点突变。指DNA分子上的某一碱基的置换。

64.框移突变:基于遗传密码的连续性,mRNA分子中如有一个(或非3n个)核苷酸插入或缺失,就会

使此后的读码产生错译,造成下游翻译产物氨基酸序列的改变,合成一条不是原来意义上的多肽链,由此而引起的突变。

65.互补DNA(cDNA):是指经逆转录合成的,与RNA互补的单链DNA。以单链cDNA为模板经聚合反应

可合成双链cDNA。

a)DNA损伤:DNA damage 滚环复制:rolling circle replication 引发体:primosome

66.转录(transcription):生物体以DNA为模板合成RNA的过程。

67.结构基因(structural gene):在基因组中,能转录出RNA的DNA区段。

68.内含子(intron):断裂基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。

69.外显子(exon):在断裂基因和初级转录产物上出现,并表达为成熟RNA的核酸序列。

70.断裂基因(splite gene):真核生物结构基因,由若干个编码区和非编码区互相间隔开而又连续镶嵌而

成,去除非编码区在连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质的基因。

71.转录因子(transcriptional factor,TF):反式作用因子中,直接或间接结合RNA聚合酶的,则称为转录

因子。

72.Rho因子(β因子):是原核生物转录终止因子,由相同亚基组成的六聚体蛋白质,有ATP酶和解螺

旋酶活性。

73.模板链(template strand):DNA双链中按碱基互补配对规律能指引转录生成RNA的一股单链。

74.编码链(coding strand):DNA双链中,一股链作为模板链,另一股链是编码链。

75.剪接:是指剪切后又将相邻的外显子片段连接起来,然后进行多聚腺苷酸化。

76.不对称转录(asymmetric transcription):一是在DNA双链上,一股链作为模板指引转录,另一股链不

转录;二是模板链并非总是在同一单链上。

a)转录起始前复合物:pre-initiation complex(PIC)初级RNA转录物:primary RNA factor

b)转录空泡:transcription bubble

77.单顺反子(monocistron):真核生物的一个mRNA只编码一种蛋白质。

78.多顺反子:原核细胞中数个结构基因常串联为一个转录单位,转录生成的mRNA可编码几种功能相关

的蛋白质。

79.遗传密码(genetic coden):mRNA分子上从5’到3’方向每三个相邻的核苷酸为一组,在蛋白质合成中

代表某种氨基酸或其他信息,称为密码子或三联体密码,统称为遗传密码。

80.S-D序列:在原核生物各种mRNA起始AUG密码上游,存在4-9个核苷酸的一致序列,富含嘌呤,序

列为-AGGAGG-,称S-D序列。此序列与翻译起始时mRNA与小亚基的结合有关。

81.分子伴侣(molecular chaperon):是细胞中保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象,促进各功能区和

整体蛋白的正确折叠。

82.信号肽(signal peptide):新生分泌蛋白的N端有保守的含疏水氨基酸较多的序列,该序列与蛋白质

的靶向输送有关。

83.框移突变(frameshift mutation):mRNA阅读框内非3的整数倍数碱基发生插入或缺失,可能导致框

移突变,造成下游翻译产物氨基酸序列的改变。

84.摆动配对:转运氨基酸的tRNA反密码子(anticodon)的第一位核苷酸与mRNA密码子的第三位互补

配对结合时,并不严格遵守碱基配对规律。

85.多聚核蛋白体:不论真核、原核细胞中1条mRNA模板链都可附着10-100个核蛋白体,依次结合起

始密码并沿5’-3’方向读码移动,同时进行肽链合成,这种mRNA和多个核蛋白体聚合物。

86.mRNA编辑(mRNA editing):多种生物基因转录后存在一种对mRNA外显子的加工过程,使同一mRNA

前体翻译出序列、功能不同的蛋白质的基因表达的调节方式。

87.翻译:将mRNA分子中的核苷酸碱基序列具体的转变成为蛋白质分子中的氨基酸排列顺序。

88.遗传密码的简并性:一种氨基酸具有2个或2个以上密码子的现象。

89.靶向输送:蛋白质经生物合成以后,定向的被输送到其发挥功能的部位的过程。

90.干扰素:是真核细胞感染病毒后产生的一类具有抗病毒作用的蛋白质。

91.分泌性蛋白:有些蛋白质合成后不被自身细胞利用而是分泌到血液中再达到靶细胞(target cell)而发

挥功能。

a)起始因子:initiation factor 核蛋白体循环:ribosomal cycle 多糖聚合体:polysome

92.基因表达:基因转录和翻译的过程,rRNA和tRNA编码基因转录合成RNA的过程。

93.顺式作用元件(cis-acting element):是指可影响自身基因表达活性的DNA序列,通常包括启动子、

增强子和沉默子(silencer)。

94.反式作用元件(trans-acting factors):通过与特异的顺式作用元件相互作用,反式激活另一基因的转

录的蛋白因子。

95.管家基因(housekeeping gene):某些基因产物对生命全过程都是必需的或是必不可少的,这类基因

较少受环境因素影响,在一个生物个体的各个生长阶段和几乎所有组织细胞中持续表达。

96.操纵子(operon):原核生物的大多数基因按功能相关性串联密集于染色体上,共同组成一个转录单

位。一个操纵子通常含有两个以上的编码序列与启动序列、操纵序列以及其他调节序列在基因组中串联组成。

97.增强子(enhancer):属于真核基因顺式作用元件,是指远离转录起始点、决定基因的时间、空间特

异性表达、增强启动子转录活性的DNA序列,其发挥作用的方式通常与方向、距离无关。

98.启动子(promoter):是RNA聚合酶特异性识别和结合的DNA序列。启动子有方向性,位于结构基因

转录起始点的上游,本身并不被转录。

99.Pribnow盒:原核生物启动序列的共有序列,在-10区是TATAAT,此区是RNA聚合酶结合位点。100.转录因子:真核生物的转录调节蛋白,绝大多数转录因子以反式作用调节基因转录,又称反式作用因子。

101.RNA干扰(RNA interference,RNAi):当导入一段大于19个碱基对的双链RNA(dsRNA)进入人细胞中不仅可以导致人的目的dsRNA降解,而且可以引起细胞内的与之同源的单链RNA(ssRNA),即mRNA 共同降解。

102.siRNA:small interfering RNA,大约22个核苷酸长的双链RNA能够通过不同途径,以序列特异的方式来高效的沉默含有同源序列的靶RNA分子。

103.miRNA:在动植物基因组(geneome)中广泛存在一类非编码蛋白的RNA基因,产生长度大约为21-24个核苷酸的RNA,他们被命名为microRNA,这是一类调节其他基因表达活性的小RNA,在生物的发育过程中发挥重要作用。

a)基因组学:genomics RNA组学:RNomics 组成性表达:constitutive exression

b)阻遏蛋白:repressors 阻遏作用:repression 锌指:zinc finger

104.cDNA文库:cDNA文库是包含某一组织细胞在一定条件下所表达的全部mRNA经逆转录而合成的cDNA 序列的克隆群体,它以cDNA片段的形式贮存着该组织细胞的基因信息。

105.基因载体:又称克隆载体。为“携带”感兴趣的外源DNA,实现外源DNA的无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。常用的有质粒DNA、噬菌体DNA和病毒DNA。

106.回文结构(palindrome):呈二元螺旋对称的核苷酸序列,是限制性核酸内切酶识别的特殊结构。107.限制性核酸内切酶(restriction endonuclease):能识别DNA的特异序列,并在识别为点或其周围特异切割双链DNA的一类内切酶。

108.基因组文库:存在于转化细胞内,由克隆载体所携带的所有基因组DNA的集合。

109.质粒(plasmid):存在于细胞染色体外的小型环状双链DNA分子,常作为基因载体。

110.转化(transformation)作用:通过自动获取或人为地提供外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型。

111.转导(transduction)作用:当病毒从被感染的细胞释放出来,再次感染另一细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间DNA转移及基因重组。

112.聚合酶链反应(PCR):是一种在体外利用酶促反应快速获得特异序列的基因组DNA或cDNA的专门技术。

113.克隆(clone):指来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合,获取同一拷贝的过程。

114.DNA重组:“克隆”某一基因或DNA片段过程中,将外源DNA插入载体(vector)分子所形成的复制子是杂化分子——嵌合DNA,所以DNA克隆或基因克隆又称重组DNA。

a)重组:recimbination 接合:conjugation 转座:transposition 筛选:screening

b)目的基因:target gene 退火:annealing

115.受体(receptor):是细胞膜上或细胞内能特异识别生物活性分子并与之结合,进而引起生物学效应的特殊蛋白质。

116.G蛋白:是鸟苷酸结合蛋白的简称,居于细胞膜上,是一种传导体,可将外来的信号转化为传向细胞内的信号。由α、β、γ三种亚基组成。

117.第二信使(secondary messenger):细胞外的信息分子,包括激素或配体,与相应的膜受体结合后,诱导另一些小分子物质的产生,他们负责将细胞外的信息转导至细胞内,最终引起相应的生物学效应,这些小分子物质统称为第二信使,包括cAMP、cGMP、IP3、DG、Ca2+等。

118.蛋白激酶(protein kinasee):是催化ATP上的γ磷酸基转移到靶蛋白的特定氨基酸残基上的一类酶。119.自身磷酸化:当配体(ligand)与单跨膜螺旋型受体结合后,催化型受体(catalytic receptor)大多发生二聚化二聚体的酪氨酸蛋白激酶(TPK)被激活,彼此可使对方的某些酪氨酸残基磷酸化的过程。120.小G蛋白:Ras蛋白等性质类似于G蛋白(guanylate binding protein),它的活性与其结合GTP或GDP 直接有关,因其分子量小于G蛋白,故被称为小G蛋白。

a)腺苷酸环化酶:adenylate cyclase 佛波脂:phorbol ester cAMP应答元件:CRE

b)磷酸二酯酶:PDE 磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C:PI-PLC 交联对话:cross talk

121.癌基因(oncogene):指能在体外引起细胞转化、在体内诱发肿瘤的基因,它是细胞内总体遗传物质的组成部分,将这类存在于生物正常细胞基因组中的癌基因称为原癌基因(preto-oncogenes,pro-onc)。122.抑癌基因(cancer suppressive gene,anti-oncogene):是一类抑制细胞过度生长、增殖从而遏制肿瘤形成的基因。这类基因的缺失或失活就可能导致细胞恶性转化。

a)病毒癌基因:virus oncogene,v-onc 细胞癌基因:cellular-oncogene,c-onc