已发表基因组动植物分类-20120725

初中科学复习生物部分第一讲-动植物分类

A B C D 一棵大树 一片树叶 一层表皮 一个细胞 一．生物与非生物的区别： 细胞结构 新陈代谢 生长 应激性 生殖发育 遗传变异 适应环境 生物 非生物 二．动物与植物的区别： 细胞壁 细胞膜 细胞质 细胞核 叶绿体 液泡 营养方式 动物 植物 三、几种生物的区别： 细胞壁 细胞膜 细胞质 细胞核 叶绿体 液泡 营养方式 动物 植物 真菌 细菌 四、植物的宏观区别： 根 茎 叶 花 果 种子 被子植物 裸子植物 蕨类植物 苔藓植物 藻类植物 1．春雪过后，有些植物会被冻死。植物被冻死的主要原因是（ ） A ．雪天光照不足，植物光合作用停止 B ．地面结冰，植物无法吸水 C ．细胞液结冰，体积增大，导致细胞破裂，引起细胞死亡 D ．低温下细胞中的酶催化功能减弱，呼吸作用停止 2． “根深叶茂，树干粗壮”，这是对一棵大树的整体性描述。下图所示的结构层次中，属于器官的是（ ） 3.每种生物都有独特的生存本领，草履虫、酵母菌、衣藻等小小的单细胞生物也能进行独立生活。单细胞生物（ ） A ．必须生活在水中 B ．都是分解者 C ．都能进行呼吸作用 D ．都吸收现成有机物作为营养 4.某同学探究“不同营养液对草履虫培养效果的影响”，实验设计如下表。下列对该实验改进建议不合理的是（ ） A ．统一用稻草浸出液 B ．营养液温度统一为25℃ C ．草履虫数量改为20只 D ．可设置用清水作培养液的对照组

5.下列关于生物类群的判断，完全正确的是（） A.疟原虫、血吸虫和瓢虫都是昆虫 B.鱿鱼、章鱼和草鱼都是鱼类 C.兰花、菊花和荷花都是被子植物 D.乳酸菌、根瘤菌和酵母菌都是细菌 6.以下对绿色植物的描述正确的是 ①玉米种子储存营养物质的结构是子叶②植物落叶能带走一部分废物 ③水绵属于苔藓植物④针叶林植被类型以松、杉等植物为主 ⑤西瓜是果实，小麦的子粒是种子⑥生物圈中的水不影响绿色植物的分布 A．①③ B．②④ C．③⑤ D.②⑥ 7.建立自然保护区是保护生物多样性最为有效的措施，因为自然保护区是 A.天然基因库 B．天然实验室 C．活的自然博物馆 D.以上三者均对 8.关于细菌和真菌的说法正确的是 A.细菌和真菌对人类一般都是有害的 B.细菌可以通过形成芽孢来繁殖后代 C.细菌和真菌都要生长在有氧的环境中 D.酵母菌与乳酸菌结构的主要区别是有无成形的细胞核 9.中新网2008年3月11日电，著名呼吸疾病专家，中国工程院院士钟南山称SARS已经过去五 年，仍不清楚其最终源头。SARS病毒与动物细胞相比最主要的不同是 A.没有生命特征 B.没有蛋白质 C.没有遗传物质 D.没有细胞结构 10.目前，我国以煤炭发电为主。形成这些煤的植物类群主要是古代的 A.藻类植物 B.蕨类植物 C.被子植物 D.裸子植物 11.我国科学家袁隆平院士利用野生水稻与普通栽培水稻多次杂交，培育出高产杂交稻新品种， 这是利用了 A.生物种类的多样性 B．基因的多样性 C.生态环境的多样性 D．生态系统的多样性 12.在观察蚯蚓运动的实验中，要经常用浸水的湿棉球轻擦蚯蚓体表，使体表保持湿润，这样做 的目的是 A．有利于蚯蚓的运动 B．有利于蚯蚓正常呼吸 C．便于蚯蚓留下运动痕迹 D．保持蚯蚓身体的柔软性 13.右图所示是银杏树上结的“白果”，对白果的描述正确的是 A白果是银杏的种子，成熟时果皮脱落 B白果是银杏的种子，没有果皮包被 C白果是银杏的种子，没有果皮和种皮包被 D白果是银杏的种子，没有种皮包被 14.把动、植物细胞放在清水中，只有植物细胞不会胀破，是因为植物细胞有起支持和保护 作用的（） A．细胞壁 B.细胞膜 C.液泡 D.叶绿体 15.爬行动物、鸟类、哺乳动物的共同特征是（） A.生活在陆地上，以卵繁殖后代 B.恒温，终生用肺呼吸 C.既能生活在水中，又能生活在陆地上，对环境的适应能力强 D.体内受精，幼体发育摆脱了水环境

植物基因功能研究方法的新进展

植物基因功能诠释研究方法的新进展 (东北农业大学，150030) 摘要：本文通过阅读大量的文献，总结了植物基因功能注释研究方法的最新进展。对每种方法的原理及优缺点做了综述，拟供初学者和作相关研究者参考。 关键词：基因功能；研究方法；新进展 基因组研究应该包括两方面的内容：以全基因组测序为目标的结构基因组学(struc tural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组(functional genomics)。结构基因组学代表基因组分析的早期阶段，以建立生物体高分辨率遗传、物理和转录图谱为主。功能基因组学代表基因分析的新阶段，是利用结构基因组学提供的信息系统地研究基因功能，它以高通量、大规模实验方法以及统计与计算机分析为特征。功能基因组学(functional genomics)又往往被称为后基因组学(postgenomics)，它利用结构基因组所提供的信息和产物，发展和应用新的实验手段，通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能，使得生物学研究从对单一基因或蛋白质的研究转向多个基因或蛋白质同时进行系统的研究。[1,2]这是在基因组静态的碱基序列弄清楚之后转入基因组动态的生物学功能学研究。研究内容包括基因功能发现、基因表达分析及突变检测。基因的功能包括：生物学功能，如作为蛋白质激酶对特异蛋白质进行磷酸化修饰；细胞学功能，如参与细胞间和细胞内信号传递途径；发育上功能，如参与形态建成等采用的手段包括经典的减法杂交，差示筛选，cDNA代表差异分析以及mRNA差异显示等，但这些技术不能对基因进行全面系统的分析。新的技术应运而生，包括基因表达的系统分析，cDNA微阵列，DNA芯片等。鉴定基因功能最有效的方法是观察基因表达被阻断或增加后在细胞和整体水平所产生的表型变异，因此需要建立模式生物体。 自华大基因启动“千种动植物基因组参考序列谱构建计划”和“千种植物转录组研究”以来，已完成水稻、黄瓜、马铃薯、白菜等植物的基因组序列图谱绘制，并通过对大豆的重测序研究建立了高密度分子标记图谱。这将是21世纪生命科学研究的重要领域。[3]本文将对研究基因功能的新技术及其新进展作一综述。 1 利用生物信息学方法分析基因的功能 生物信息学是利用生物信息学和电子技术(互联网技术)寻找并克隆新的未知功能的基因,着重于技术和操作层面,利用生物信息学对新基因进行电子克隆,及克隆该新基因的序列后对其进行简单的功能分析,如基因的编码区、启动子区、内含子/外显子、翻译启始位点和翻译终止信号预测,基因的同源比对,编码的氨基酸辨识蛋白质,蛋白质的物理性质,蛋白质的二级/三级结构、特殊局部结构以及功能预测等[4]。 1.1 通过序列比对预测基因功能

基因组学研究的应用前景

基因组学研究的应用前景摘要：基因组学是一门研究基因组的结构，功能及表达产物的学科，基因组的结构不仅是蛋白质，还有许多复杂功能的RNA,包括三个不同的亚领域，及结构基因组学，功能基因组学和比较基因组学。近几年，基因组学在微生物药物，细菌，病毒基因，营养基因方面都有进展，其前景是光明的。 关键词：基因研究未来结构 一、微生物药物产生菌功能基因组学研究进展 微生物药物是一类化学结构和生物活性多样的次级代谢产物，近年来多个产生菌基因组序列已经被测定完成，在此基础上开展的功能基因组研究方兴未艾，并在抗生素生物合成，形态分化，调控，发育与进化及此生代谢产物挖掘等方面有着新的发现，展现出广阔的研究前景，青霉素及其衍生的《》内酰胺类抗生素极大地改善了人类的卫生保健和生活质量，并促进研究人员不断对其工业生产菌株类黄青霉进行遗传改良和提高其产量，从而降低生产成本。经过60年的随机诱变筛选，当前青霉素产量至少提高了三个数量级，同时，青霉素的生物合成机理也得到了较为清晰的阐述，其pcbAB编码的非核糖体肽合酶ACVS~DPcbc编码的异青霉素N合成酶IPNS位于细胞质中，而苯乙酸COA连接酶PenDE编码的IPN酰基转移酶位于特殊细胞器一微体中。 研究发现，青霉素合成基因区域串联扩增，产黄青细霉胞中微体含量增加都可显著提高青霉素产量。然而随机诱变筛选得到的黄青霉工业菌株高产的分子机制尚不明确。为此，2008年荷兰研究人员联合国美国venter基因组研究所对黄青霉wisconsin54—1225进行了基因组测试和分析，并进一步利用DNA芯片技术研究了wisconsin54—1255及其高产菌株DS17690在培养基中是否添加侧链前体苯乙酸情况下的转录组变化，四组数据的比较分析发现，有2470个基因至少在其中一个条件下是差异表达的，根据更为严格的筛选标准，在PPA存在的条件下，高产菌相比测序菌株有307个基因转录是上调的，和生长代谢，青霉素前体合成及其初级代谢和转运等功能相关，另有271个基因显著下调，主要是与生长代谢及发育分化相关的功能基因。 二、乳酸菌基因组学的研究进展

(生物)泰山的动植物种类

高二1班3组 泰山是我国的“五岳”之首，有“天下第一山”之美誉，又称东岳，中国最美的、令人震撼的十大名山之一。泰山位于山东省中部，自然景观雄伟高大，泰山具有生物多样性，有29 个特有珍稀的物种 泰山景区森林覆盖率81.5%，植被覆盖率达90%以上，有古树名木近20000株，植物、鸟类、昆虫种类繁多。其中，泰山特有植物28种，泰山赤鳞鱼为特有的动物物种，这29种动植物具有重要的生态环境价值和科研价值

泰山有山东特有植物32种，约占山东特有植物总数的40%，其中有28种特产于泰山，分别为：山东山楂、泰山柳、泰山谷精草、山东白鳞莎草、泰山花楸、泰山盐肤木、泰山堇菜、山东耳蕨、响毛杨、山东百部、大果麻栎、垂枝朴、山东石竹、三脉石竹、山东瓦松、大花瓦松、长毛华北绣线菊、直果绣线菊、歪把海棠、泰山野樱花、白花长柔毛野豌豆、多脉鼠李、泰山椴、大花附地菜、泰山母草、泰山韭、矮齿韭、白花米口袋。 1．1．1、野生植物 泰山低等植物（包括藻类、菌类和地衣）未见文献记载，这里不再阐述。但这类植物是泰山植物生态系统中的重要成员，对于岩石风化、土壤形成和腐殖质分解等作用过程，具有重要的意义。 目前已知泰山共有野生的高等植物157科、521属、954种、4亚种、85变种、6变型。 （1）苔藓植物根据赵尊田研究，泰山有苔藓植物30科、67属、134种、3变种，其中苔类植物8科、10属、13种、1变种；藓类植物22科、57属、121种、2变种。泰山苔藓植物的垂直分布不明显，包括土生、石生和树生三种类型的植物群落,其中以土生和石生为主。区系成分除少量为旧热带成分和世界广布种外，绝大多数为泛北极成分，其中东亚成分又为多数，欧洲、北美成分较少。

植物功能基因组学及其研究技术_崔兴国

第9卷　第1期2007年3月 衡水学院学报 J o u r n a l o f H e n g s h u i U n i v e r s i t y V o l.9,N o.1 Ma r.2007植物功能基因组学及其研究技术 崔兴国 (衡水学院　生命科学系,河北　衡水053000) 摘　要:植物基因组的研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究.植物功能基因组学研究是利用结构基因组学积累的数据,从中得到有价值的信息,阐述D N A序列的功能,从而对所有基因如何行使其职能并控制各种生命现象的问题作出回答.近年来植物功能基因组学的研究技术主要包括表达序列标签、基因表达的系列分析、D N A微阵列和反向遗传学等.对植物功能基因组学的研究将有利于我们对基因功能的理解和对植物形状的定性改造和利用. 关键词:植物;功能基因组学;研究技术 中图分类号:Q3-3 文献标识码:A 文章编号:1673-2065(2007)01-0023-04 基因是细胞的遗传物质,决定细胞的生物学形状,细胞的生物学功能最终是由大量的基因表达完成的.随着人类基因组“工作框架图”的完成,生命科学研究的重点已经从结构基因组学转移到了功能基因组学的研究,特别是模式植物拟南芥(A r a b i d o p-s i s t h a l i a n a)和水稻(O r y z a s a t i v a)基因组测序的完成,公共数据库中已经积累了大量基因序列信息,获得了许多与植物发育相关的功能基因,在此基础上应用实验分析方法并结合统计和计算机分析来研究基因的表达、调控与功能,并相应诞生和发展了一批新的研究技术,为功能基因组学的研究提供了必要而有效的技术支撑.功能基因组学研究的最终目标是解析所有基因的功能,即从基因水平上大规模批量鉴定基因的功能,进而全面研究控制植物生长发育及响应环境变化的遗传机制,在基因组序列与细胞学行为之间起到桥梁作用,共同承担起从整体水平上解析生命现象的重任. 1　植物功能基因组学研究 植物的生长和发育是一个有机体或有机体的一部分形态建成和功能按一定次序而进行的一系列生化代谢反应的总合,反应在分子水平上,它要求相应的遗传代谢途径必须按照特定的时空次序严格进行以保证正常发育.植物功能基因组研究就是要利用植物全基因组序列的信息,通过发展和应用系统基因组水平的实验方法来研究和鉴别基因组序列的作用;研究基因组的结构、组织与植物功能在细胞、有机体和进化上的关系以及基因与基因间的调控关系;从表达时间、表达部位和表达水平3个方面对目的基因在植物中的精细调控进行系统研究.当前植物功能基因组学研究主要集中于一年生的拟南芥与水稻两个物种上,这主要是由于它们的遗传背景清楚,基因组较小,基因结构简单而且易于进行分子生物学操作.拟南芥研究组“2010计划”的宏伟目标是充分利用拟南芥基因组计划获得的序列信息并结合功能基因组研究技术来获知其25000个基因的全部功能,例如开花的诱导过程是植物生活周期中最奇妙的过程,目前从拟南芥中鉴定了提早开花和延迟开花的多种突变体,显示植物开花受多个遗传基因的控制,如延迟开花的两个突变体是由等位基因 C O(C O N S T A N S)和L D(C O L D L U M I N I D E P E N- D E N S)突变引起,这两个基因均已被克隆,并使其在转基因植物的叶片中进行表达,将C O基因转移到拟南芥中,高效表达C O蛋白的转基因植株即使处于短日照条件下也会开花,这说明C O基因具有激活开花基因的作用.对模式植物功能基因组的研究将有助于整个植物基因组学的研究. 目前的功能基因组研究主要包括以下几个方面:(1)c D N A全长克隆与测序;(2)获得D N A芯片 ①收稿日期:2006-10-12 作者简介:崔兴国(1963-),女,河北冀州市人,衡水学院生命科学系副教授.

基因组学的研究内容

基因组学的研究内容 结构基因组学： 基因定位；基因组作图；测定核苷酸序列 功能基因组学：又称后基因组学（postgenomics基因的识别、鉴定、克隆；基因结构、功能及其相互关系；基因表达调控的研究 蛋白质组学： 鉴定蛋白质的产生过程、结构、功能和相互作用方式 遗传图谱 （genetic map）采用遗传分析的方法将基因或其它dNA序列标定在染色体上构建连锁图。 遗传标记： 有可以识别的标记，才能确定目标的方位及彼此之间的相对位置。 构建遗传图谱 就是寻找基因组不同位置上的特征标记。包括： 形态标记； 细胞学标记； 生化标记；DNA 分子标记 所有的标记都必须具有多态性！所有多态性都是基因突变的结果！ 形态标记： 形态性状：株高、颜色、白化症等，又称表型标记。 数量少，很多突变是致死的，受环境、生育期等因素的影响 控制性状的其实是基因，所以形态标记实质上就是基因标记。

细胞学标记 明确显示遗传多态性的染色体结构特征和数量特征 ：染色体的核型、染色体的带型、染色 体的结构变异、染色体的数目变异。优点：不受环境影响。缺点：数量少、费力、费时、对生物体的生长发育不利 生化标记 又称蛋白质标记 就是利用蛋白质的多态性作为遗传标记。 如：同工酶、贮藏蛋白 优点： 数量较多，受环境影响小 ?

缺点： 受发育时间的影响、有组织特异性、只反映基因编码区的信息 DNA 分子标记： 简称分子标记以 DNA 序列的多态性作为遗传标记 优点： ? 不受时间和环境的限制 ? 遍布整个基因组，数量无限 ?

不影响性状表达 ? 自然存在的变异丰富，多态性好 ? 共显性，能鉴别纯合体和杂合体 限制性片段长度多态性（restriction fragment length polymorphism ， RFLP ） DNA 序列能或不能被某一酶酶切，

常见的动物及植物

动物： 一、动物的分类 陆生动物 根据是水生还是陆生： 水生动物 有羽毛动物 根据有没有羽毛： 无羽毛动物 脊椎动物 根据体内有无脊椎 无脊椎动物 二、脊椎动物 身体背部都有一条脊柱，脊柱由许多块脊椎骨组成，称脊椎动物 身体上没有脊椎骨的动物称为无脊椎动物 鱼类特征：生活在水中，体表有鳞片，用鳃呼吸，用鳍游泳。 体温不恒定.卵生. 种类：淡水鱼、海水鱼。<黄鳝,泥鳅> 两栖类特征：幼体水生，用鳃呼吸；成体用肺呼吸；皮肤裸露,体 温不恒定.卵生.种类：青蛙、蟾蜍、蝾螈、大鲵等等。<娃 娃鱼> 脊椎动物爬行类特征：陆生,体表被角质鳞片或甲，用肺呼吸，贴地爬行。 体温不恒定.卵生.种类：蛇、蜥蜴、龟、鳄鱼、鳖等。(最高等的动物) 鸟类特征：身体呈纺锤型，前肢特化成翼，体表被羽毛，胸肌发 达，骨骼愈合、薄、中空，脑较发达适于飞翔。体温恒定. 卵生种类：鸡、鸭、鹰、鸵鸟、猫头鹰等等。 哺乳类特征：分布最广、功能最完善的动物。体表被毛，胎生， 哺乳，体温恒定种类：白鳍豚、蝙蝠、鲸.老虎等等。 脊椎动物的进化过程 鱼类两栖类哺乳类 从水生到陆生；从低等到高等；从简单到复杂；

三、无脊椎动物 地球上大约有4.7万种脊椎动物，无脊椎动物有120万种 原生动物特点：体形微小、一般由单细胞构成、适应性极强如变形虫、 草履虫、疟原虫、绿眼虫等。 腔肠动物特点：多细胞动物、身体呈辐射对称，身体和排泄同一开口。 如水螅、海蜇、水母、海葵、珊瑚 扁形动物特点：身体两侧对称、背腹扁平如：涡虫、吸虫、绦虫 无脊椎动物线形动物特点：身体线形，不分节，消化系统有口和肛门。如：蛔虫、 蠕虫、蛲虫 环节动物特征：身体分节、真体腔如：蚯蚓、沙蚕、水蛭 软体动物特点：身体柔软，大多数有贝壳如：蚌，蜗牛 棘皮动物特点：体具棘皮，身体辐射对称。如：海参、海胆、海星等 节肢动物特点：身体和足分节，体表具有外骨骼。其中昆虫纲是成员最多 的家族，已知道有的100多万种。 讨论：昆虫中哪些是益虫哪些是害虫？人类如何进行利用的防治？ 植物： 分类等级： 界、门、纲、目、科、属、种 分类的最小单位：种 分类等级越高，生物间的共同点越少 分类等级越低，生物间的共同点越多

植物功能组研究进展

程论文（作业）封面（2011 至2012 学年度第 2 学期）课程名称：_ ___ 课程编号：___________ 学生姓名：__ ________ 学号：_______ 年级：__ ___________ 任课教师: _ ____________ 提交日期：年月日成绩：__________________ 教师签字：__________________ 开课---结课：第周---第周评阅日期：年月日

植物的功能基因组学研究进展 摘要:基因组研究计划包括以全基因组测序为目标的结构基因组学和以基因功能鉴定为 目标的功能基因组学两方面的内容。目前基因功能鉴定的方法主要有:基因表达的系统分析(SAGE) 、cDNA 微阵列、DNA(基因) 芯片、蛋白组技术以及基于转座子标签和T-DNA 标签的反求遗传学技术等。本文对上述各种技术的优缺点以及它们在植物基因功能鉴定中的应用进行了综述。 关键词:功能基因组学; 基因表达的系统分析;cDNA 微阵列;DNA 芯片;蛋白组 以拟南芥和水稻为代表的植物基因组研究已取得了迅速的进展,到目前为止,占拟南芥基因组(100Mb) 近三分之一的DNA 序列已被测定并在GenBank 数据库中登记注册,预期到2001 年通过全球合作将完成拟南芥全基因组的序列测定工作。随着植物基因组计划的实施和进展,GenBank 中累积了大量的未知功能的DNA 序列,如何鉴定出这些基因的功能将成为基因组研究的重点课题, 因此, 基因组研究应该包括两方面的内容: 以全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics) 和以基因功能鉴定为目标的功能基因组研究, 后者往往又被称为后基因组研究。功能基因组研究的内容是利用结构基因组所提供的信息, 发展和应用新的实验手段系统地分析基因的功能〔1 〕。目前人类和酵母的功能基因组研究已经全面展开, 尤其是对已完成全基因组测序的酵母来说, 其功能基因组研究任务更加紧迫。植物的基因组研究虽然起步较晚, 但由于吸取了人类基因组研究中积累的一些经验, 所以进展也相当迅速, 对植物功能基因组学的研究目前也已经受到重视, 在1998 年12月出版的最新一期Plant Cell (10 :1771) 和Plant Physiol . (118 :713) 上均编发了关于植物功能基因组学研究的编者按, 并由Bouchez 和Hofte (1998) 〔2 〕综述了植物尤其是拟南芥功能基因组学研究的现状, 本文在此基础上综述了目前植物功能基因组学研究中使用的主要技术手段以及最新的研究进展。 1 基因功能的含义 基因的功能主要包括: 生物化学功能, 如作为蛋白质激酶对特异的蛋白质进行磷酸化修饰; 细胞学功能, 如参与细胞间和细胞内的信号传递途径; 发育上的功能, 如参与形态建成等。目前,获得一段DNA 序列的功能信息的最简单的方法是将该DNA 序列与GenBank 中公布的基因序列进行同源性比较,如利用BLASTn 和BLASTx 两种软件分别进行核苷酸和氨基酸序列同源性比较等。同源性比较的结果大体可以分为如下类型: 与生化和生理功能均已知的基因具同源性; 与生化功能已知的基因具同源性, 但该基因的生理功能未知;与其它物种中生化和生理功能均未知的基因具同源性; 虽与生化和生理功能均已知的基因具同源性, 但对该基因功能的了解尚不深入, 仍停留在表观现象上。上述同源性检索分析方法仅仅为该DNA 片段的功能提供了间接的证据,对基因功能的直接证据还需要实验上的数据。Bouchez 和Hofte (1998)〔2 〕将所需要的实验证据归纳如下: (1) 通过研究基因的时空表达模式确定其在细胞学或发育上的功能, 如在不同细胞类型、不同发育阶段、不同环境条件下以及病原菌侵染过程中mRNA 和/ 或蛋白质的表达的差异等。(2) 研究基因在亚细胞内的定位和蛋白质的翻译后调控等。(3) 利用基因敲除(knock - out) 技术进行功能丧分析或通过基因的过量表达(转基因) 进行功能获(gain2of2function) 分析,进而研究目的基因与表型性状间的关系。(4) 通过比较研究自发或诱发突变体与其野生型植株在特定环境条件下基因表达的差异来获取基因功能的可能信息。 2 植物的表达序列标记(EST) 与基因组大规模测序 通过从cDNA 文库中随机挑取的克隆进行测序所获得的部分cDNA 的5′或3′端序列称为表达序列标记( EST) ,一般长300～500bp 左右, 利用EST作为标记所构建的分子遗传图

植物基因组测序

千年基因将应邀参加第十六届全国植物基因组学大会 第十六届全国植物基因组学大会将于2015年8月19日-22日在陕西杨凌召开，千年基因应邀参加此次会议，并将在会场学术交流区设立展台。届时千年基因的技术团队会向大家展示我们最全面的测序平台、一站式的基因组学解决方案以及近年来在植物基因组学领域取得的科研成果，欢迎广大科研人员莅临指导交流！ 在测序平台方面，千年基因目前拥有国内最全面的测序平台，能够为科研人员提供一站式解决方案。以PacBio RS II三代平台为例，千年基因自去年提供PacBio RS II测序以来，通过项目经验的积累及严格的质量控制，目前各项数据指标已达国内最高水平。数据产出已稳步升级至1.4Gb/ SMRT cell，读长最长可达42 Kb，reads N50高达18Kb，远超PacBio官方提供的数据标准！在植物基因组de novo测序的研究中，千年基因提供的超长读长测序可更好地跨越基因组高重复序列、转座子区域以及大的拷贝数变异区域和结构变异区，从而实现对高杂合及高重复基因组的完美组装。在植物转录组测序的研究中，千年基因提供的超长读长测序无需拼接即可获得全长转录组序列信息，同时可获得全面的可变剪切、融合基因以及Isoform信息。另外，千年基因提供的HiSeq 4000及HiSeq 2000/2500测序可解决研究人员在植物基因组重测序、转录组测序、小RNA测序等方面的科研需求。 在项目经验方面，千年基因与来自全球的科研人员合作开展了大量植物基因组项目，相关成果已发表于Nature、Nature Genetics、Science等杂志。例如，油棕榈基因组项目在Nature 杂志同时发表两篇文章，辣椒基因组项目的成果发表于Nature Genetics，玉米基因组项目的成果发表于Science。在国外合作方面，千年基因与美国爱荷华州立大学Patrick Schnable教授领导的国际玉米基因组团队合作开展的上万份玉米样本重测序项目也正在进行中；千年基因与国际半干旱热带作物研究所建立长期战略合作关系，正在开展上千份木豆、鹰嘴豆及高粱样本的群体遗传学研究；同时千年基因与华盛顿大学的Evan Eugene Eichler院士及佐治亚大学的Jeffrey Lynn Bennetzen院士也有大量基因组项目合作。在国内合作方面，千年基因与广东省农科院、山东省农科院共同启动的花生基因组项目已全部完成de novo测序及数据挖掘，同时与中国科学院、北京大学、中国农业大学、中国科学技术大学、上海交通大学、

微生物基因组研究

微生物基因组研究 微生物是包括细菌、病毒、真菌以及一些小型的原生动物等在内的一大类生物群体，它个体微小，却与人类生活密切相关。微生物在自然界中可谓“无处不在，无处不有”，涵盖了有益有害的众多种类，广泛涉及健康、医药、工农业、 环保等诸多领域。 微生物对人类最重要的影响之一是导致传染病的流行。在人类疾病中有50％是由病毒引起。世界卫生组织公布资料显示：传染病的发病率和病死率在所有疾病中占据第一位。微生物导致人类疾病的历史，也就是人类与之不断斗争的历史。在疾病的预防和治疗方面，人类取得了长足的进展，但是新现和再现的微生物感染还是不断发生，像大量的病毒性疾病一直缺乏有效的治疗药物。一些疾病的致病机制并不清楚。大量的广谱抗生素的滥用造成了强大的选择压力，使许多菌株发生变异，导致耐药性的产生，人类健康受到新的威胁。一些分节段的病毒之间可以通过重组或重配发生变异，最典型的例子就是流行性感冒病毒。每次流感大流行流感病毒都与前次导致感染的株型发生了变异，这种快速的变异给疫苗的设计和治疗造成了很大的障碍。而耐药性结核杆菌的出现使原本已近控制住的结核感染又在世界范围内猖獗起来。 微生物能够致病，能够造成食品、布匹、皮革等发霉腐烂，但微生物也有有益的一面。最早是弗莱明从青霉菌抑制其它细菌的生长中发现了青霉素，这对医药界来讲是一个划时代的发现。后来大量的抗生素从放线菌等的代谢产物中筛选出来。抗生素的使用在第二次世界大战中挽救了无数人的生命。一些微生物被广泛应用于工业发酵，生产乙醇、食品及各种酶制剂等；一部分微生物能够降解塑料、处理废水废气等等，并且可再生资源的潜力极大，称为环保微生物；还有一些能在极端环境中生存的微生物，例如：高温、低温、高盐、高碱以及高辐射等普通生命体不能生存的环境，依然存在着一部分微生物等等。看上去，我们发现的微生物已经很多，但实际上由于培养方式等技术手段的限制，人类现今发现的微生物还只占自然界中存在的微生物的很少一部分。 微生物间的相互作用机制也相当奥秘。例如健康人肠道中即有大量细菌存在，称正常菌群，其中包含的细菌种类高达上百种。在肠道环境中这些细菌相互依存，互惠共生。食物、有毒物质甚至药物的分解与吸收，菌群在这些过程中发挥的作用，以及细菌之间的相互作用机制还不明了。一旦菌群失调，就会引起腹泻。 随着医学研究进入分子水平，人们对基因、遗传物质等专业术语也日渐熟悉。人们认识到，是遗传信息决定了生物体具有的生命特征，包括外部形态以及从事的生命活动等等，而生物体的基因组正是这些遗传信息的携带者。因此阐明生物体基因组携带的遗传信息，将大大有助于揭示生命的起源和奥秘。在分子水平上研究微生物病原体的变异规律、毒力和致病性，对于传统微生物学来说是一场革命。 以人类基因组计划为代表的生物体基因组研究成为整个生命科学研究的前沿，

小专题(一) 动植物的特征及分类含解析

小专题(一) 动植物的特征及分类 01 专题概述 生物的分类等级：牢记分类单位的排序，明确不同分类之间的关系。分类单位越大，包含的生物种类越多，生物之间的共同特征越少。 动、植物的分类：动物的分类往往依据动物的形态结构特征和生理功能区分，如脊椎骨的有无、体表特征、生殖方式、呼吸器官、体温是否恒定等；植物的分类往往依据根、茎、叶、花、果实、种子的形态结构特征。 所属类群判断：记住各类群动植物的主要特征是解决这类题目的关键。 02 专题训练 类型1 生物的分类等级 1．(聊城中考)生物的分类单位：界、门、纲、目、科、属、种7个分类等级中，哪个等级中的生物共同特征最少( ) A ．界 B ．纲 C ．科 D ．种 2．(锦州中考)同一纲的生物，它们一定属于( ) A ．同一属 B ．同一门 C ．同一种 D ．同一科 3．(龙岩中考)下列关于生物分类的说法，正确的是( ) A ．生物分类的依据是生物个体大小 B ．同一分类单位中的生物，其特征完全相同 C ．分类单位越小，所包含的生物种类越多 D ．生物分类的基本单位是种 4．如图是分类等级示意图，以下理解正确的是( ) A ．图中最大的分类单位是属 B ．狼和犬的相似程度最小 C ．猫和虎同属于猫科 D ．虎和犬没有任何亲缘关系 5．下面是小麦、满江红和月季的分类等级图，请分析回答。 (1)亲缘关系较近的两种植物________________。 (2)进化中比较低等的植物是________。 (3)包含生物最多的分类单位是________。 (4)如果在分类单位中增加一个单位“亚门”，其分类单位应处于________之间。 类型2 动植物类群特征 6．(成都中考)具有“终生生活在水中，用鳍游泳，用鳃呼吸”特征的动物是( ) A ．金丝猴 B ．鲤鱼 C ．褐马鸡 D ．蚯蚓 7．(太原中考)蝙蝠之所以不属于鸟类，是因为蝙蝠( ) A ．大脑发达 B ．体温恒定 C ．胎生、哺乳 D ．心脏有四腔 8．(潍坊中考)下列叙述符合苔藓植物特点的是( ) A ．孢子生殖 B ．有了根、茎、叶的分化 C ．能适应干旱环境 D ．植株高大 界 植物界 植物界 植物界 门 种子植物门 蕨类植物门 种子植物门 纲 单子叶植物纲 真蕨纲 双子叶植物纲 目 禾本目 槐叶萍目 蔷薇目 科 禾本科 满江红科 蔷薇科 属 稻属 满江红属 蔷薇属 种 小麦 满江红 月季

植物功能基因组学概述

植物功能基因组学概述 XXX* (XXXXX) 摘要：植物功能基因组学是从整体水平研究基因的功能及表达规律的科学。对植物功能基因组学的研究将助于我们对基因功能的理解和对植物性状的定性改造和利用。本文简要介绍了植物功能基因组学的概念、研究内容和研究方法。 关键词：植物；功能基因组学；ESTs；SAGE Summarize of Plant Functional Genomics XXX （XXXXX） Abstract：Plant functional genomics studies provide a novel approach to the identification of genome-wide gene expression. It is currently being widely focused on the gene expression by transcript profiling and takes us rapidly forward in our understanding of plant biological traits. In this review, comprehensive of concepts, research contents and methodologies regarding plant functional genomics and transcript profiling are described. Key words: Plant; functional genomics; ESTs; SAGE 1 植物功能基因组学 基因组学(Genomics)是20世纪最后10年研究最活跃的领域之一。基因组学是指对所有基因的结构和功能进行分析的一门学科, 1986年由美国科学家Thomas Roderick提出, 兴起于20世纪90年代[1]。基因组学研究分为结构基因组学( structural genomics) 和功能基因组学( functional genomics)。结构基因组学代表基因组分析的早期阶段, 以建立生物体高分辨率遗传、物理和转录图谱为主, 以研究基因序列为目标。功能基因组学(Functional genomics)的研究又被称为后基因组学(Post genomics)研究，它是利用结构基因组学提供的信息和产物，通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能，使得生物学研究从对单一基因或蛋白质的研究转向对多个基因或蛋白质同时进行系统研究。 植物功能基因组学是植物后基因时代研究的核心内容,它强调发展和应用整体的(基因 组水平或系统水平)实验方法分析基因组序列信息、阐明基因功能,其特点是采用高通量的实验方法结合大规模的数据统计计算方法进行研究。基本策略是从研究单一基因或蛋白质上升到从系统角度研究所有基因或蛋白质。在植物功能基因组学的研究中，拟南芥和水稻是两种最常用的模式植物。目前, 功能基因组学在水稻、拟南芥等模式植物中取得了较快进展, 主要原因在于这两种植物已完成全基因组测序工作[2], 获得了结构基因组数据, 且遗传背景清楚, 易于开展分子生物学研究, 已率先步入后基因组时代。 2 植物功能基因组学研究内容 2、1基因组多样性研究[1] *联系人Tel：XXXXX；E-mail：XXXXX

家养动植物基因组进化的特征和机制

家养动植物基因组进化的特征和机制提名奖种：自然科学奖二等奖 提名者：云南省 提名意见： 家养动植物是人类社会赖以生存和发展的重要基础，是人工选择的结果，然而人们对家养条件下动植物快速变异的遗传机制仍知之甚少。该项目在国家973项目及云南省科技厅相关科技计划的资助下，以家养的水稻、家蚕、山羊及绵羊等动植物为对象，在家养动植物基因组进化的特征和机制研究中取得重要研究成果： 从基因组变异角度揭示了水稻驯化特征及独立起源事件；首次发现旱稻陆生适应性的遗传机制；提供了当时最为全面的水稻基因组多态性数据及基因资源；创新性的建立了研究人工选择机制的理论技术方法，包括多样性降低（ROD）和优良品种标签位点（ETAS）分析方法；首次从全基因组单碱基水平，刻画了水稻、家蚕的表观遗传组学特征，并发掘出在驯化过程可能受人工选择的基因位点；家蚕甲基化组研究澄清了长期以来对昆虫DNA甲基化的模糊认识，开创了昆虫表观遗传组学研究的先河；通过山羊和绵羊参考基因组破译及比较基因组学分析，揭示了反刍类家养动物瘤胃及羊毛、羊脂产生的分子机制；首次利用了光学图谱组装方法而不依赖于遗传图谱将大型基因组山羊基因组组装到染色体水平；该项目研究成果分别发表在Nat Biotechnol （3篇）、Science （1篇）、Nat Commu （1篇）等学术期刊，平均影响因子25.214，合计引用903次，其中他引次数843次，最高单篇他引次数高达289次。成果发表后产生了广泛国际影响。 同意提名该项目为国家自然科学奖二等奖。 项目简介： 家养动植物是人类社会赖以存在和发展的重要基础，是一万多年来不断人工选择的结果。尽管早在1859年达尔文的旷世巨著《物种起源》及1868年的巨著《动植物在家养条件下的变异》详细论述了物种在强烈人工选择下能快速产生大量的形态和生理变异，然而在这之后的150年至今，人类对家养动植物进化的遗传和基因组变异基础的了解甚至比对自然物种还少。在“973前沿科学项

9 人类基因组研究

9.1人类基因组计划简介 人类基因组计划(human genome project, HGP)是由美国科学家于1985年率先提出，于1990年正式启动的。美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一价值达30亿美元的人类基因组计划。这一计划旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因组精确测序，发现所有人类基因并搞清其在染色体上的位置，破译人类全部遗传信息。与曼哈顿原子弹计划和阿波罗登月计划并称为三大科学计划。 1986年,诺贝尔奖获得者Renato Dulbecco发表短文《肿瘤研究的转折点：人类基因组测序》（Science, 231: 1055－1056）。文中指出：如果我们想更多地了解肿瘤，我们从现在起必须关注细胞的基因组。…… 从哪个物种着手努力？如果我们想理解人类肿瘤，那就应从人类开始。……人类肿瘤研究将因对 DNA 的详细知识而得到巨大推动。” 什么是基因组(Genome)?基因组就是一个物种中所有基因的整体组成。人类基因组有两层意义：遗传信息和遗传物质。要揭开生命的奥秘，就需要从整体水平研究基因的存在、基因的结构与功能、基因之间的相互关系。

为什么选择人类的基因组进行研究？因为人类是在“进化”历程上最高级的生物，对它的研究有助于认识自身、掌握生老病死规律、疾病的诊断和治疗、了解生命的起源。 在人类基因组计划中，还包括对五种生物基因组的研究：大肠杆菌、酵母、线虫、果蝇和小鼠，称之为人类的五种“模式生物”。 HGP的目的是解码生命、了解生命的起源、了解生命体生长发育的规律、认识种属之间和个体之间存在差异的起因、认识疾病产生的机制以及长寿与衰老等生命现象、为疾病的诊治提供科学依据。 HGP的诞生和启动： 对人类基因组的研究在70年代已具有一定的雏形，在80年代在许多国家已形成一定规模。 1984年在Utah州的Alta,White R and Mendelsonhn M受美国能源部(DOE）的委托主持召开了一个小型专业会议讨论测定人类整个基因组的DNA序列的意义和前景（Cook Deegan RM,1989） 1985年5月在加州Santa Cruz由美国DOE的Sinsheimer RL主持的会议上提出了测定人类基因组全序列的动议，形成了美国能源部的“人类基因组计划”草案。 1986年3月，在新墨西哥州的Santa Fe讨论了这一计划的可行性，随后DOE 宣布实施这一计划。 1986年遗传学家McKusick V提出从整个基因组的层次研究遗传的科学称为“基因组学” 1987年初，美国能源部和国立卫生研究院为HGP下拨了启动经费约550万美元（全年1.66亿美元） 1988年，美国成立了“国家人类基因组研究中心”由Watson J出任第一任主任

植物类 动物类英语单词归类

植物类英语单词归类 花草类 azalea begonia cactus仙人掌 camellia canna chrysanthemum菊花 yellow chrysanthemum 黄菊 black chrysanthemum 墨菊 red chrysanthemum 红菊 white chrysanthemum 白菊coreopsis 波斯菊 daisy dahlia datura hawthorn山楂 jasmine茉莉 lilac丁香 lily百合 morning glory cockscomb 鸡冠花 narcissus水仙花 peony牡丹 poppy redbud wisteria 紫藤 early lilac 紫丁香 violet rose玫瑰 rose tulip sunflower葵花 dandelion蒲公英 Brazil Chinese enkianthus Chinese flowering crab-apple epiphyllum fringed iris fuchsia Gladiola 剑兰

orchid兰花 mangnolia mangnolia kaffir lily 君子兰 oleander pansy peony 牡丹 peony phalaenopsis 蝶兰 setose asparagus touch-me-not (balsam) water hyacinth 兰 twin lotus 并蒂莲 lotus荷花 black mulberry黑桑 white mulberry 白桑osmanthus桂花 round cardamom豆蔻 carnation 石竹() red carnation-红康乃馨 yellow carnation黄康乃馨tuberose 晚香玉 winter jasmine 迎春花 white camellia 白茶花 red camellia 红茶花 hyacinth 风信子 gardenia 栀子花 forget me not 勿忘我 belis of Ireland 爱尔兰风铃草arbutus 杨梅 cyclamen仙客来 anemone银莲花 dogwood山茱萸 hydrangea八仙花 peony芍药 Daphne瑞香 plum 洋李 pistil雌蕊 ovary子房 petal花瓣 anther花药 stamen雄蕊 ectargland蜜腺 sepal萼片

863计划现代农业技术领域“主要动植物功能基因组研究”重大项目课题申请指南

附件1： 863计划现代农业技术领域“主要动植物功能基因组研究” 重大项目课题申请指南 一、指南说明 动植物功能基因组研究为人类认识生物、改造生物提供重要基础，已成为农业高技术的重要组成部分，同时也是农业生命科学领域国际竞争的焦点。本项目依据我国经济社会，特别是农业农村经济发展的重大需求和现有研究开发基础，以水稻和家蚕为支持重点，同时支持有较好研究基础的主要动植物，以获得一大批有重要应用价值的基因产权为主要目标，系统开展功能基因组研究，为主要动植物品种改良，实现“高产、优质、抗逆、生态、安全”发展目标提供基因资源和知识基础。 项目利用“十五”建立的水稻功能基因组的技术平台，系统开展水稻产量、品质、抗病抗逆、营养高效性状的功能基因组研究，克隆验证新基因和调控因子，应用芯片技术建立水稻重要农艺性状的全基因组表达谱，并开展比较基因组学研究和第3、4染色体功能基因的系统鉴定；利用水稻、拟南芥等模式植物功能基因组的技术平台，开展小麦、玉米、棉花、油菜、大豆、花生、番茄等作物的功能基因组研究，克隆验证重要农艺性状基因；建立家蚕和家鸡的功能基因组研究技术平台，分离克隆与家蚕丝蛋白质合成、性别决定、发育变态、分子免疫和对微生物抵抗性、鸡的生长、品质、抗性、繁殖等重要经济性状相关的重要功能基因和调控因子。 项目的总体目标为：建立并完善水稻、家蚕大规模地开展功能基因组研究的技术体系；建立水稻产量、品质、抗逆、营养高效等重要

性状的全基因组表达谱，揭示表达调控网络，初步弄清水稻第3、4两条染色体大部分基因的功能；克隆水稻、小麦、玉米、棉花、大豆、油菜、花生、番茄、家蚕、家鸡等物种新基因和调控因子1700个以上，其中50个以上有重要应用前景；申请基因（含调控因子）专利450个以上，发表高水平研究论文400篇以上。通过项目的实施，使我国水稻功能基因组研究领域整体达到国际领先水平；小麦、玉米、大豆、棉花、油菜、花生、番茄等作物的功能基因组研究具备一定的规模，并在国际上形成局部优势；建立较完善的家蚕功能基因组研究的技术平台，家鸡功能基因组研究取得较大进展，形成进入国际先进水平的能力。 此次发布的是现代农业技术领域“主要动植物功能基因组研究”重大项目的课题申请指南，安排国拨经费1.7亿。 二、指南内容 课题1. 水稻产量性状的功能基因组研究 研究目标：分离克隆控制水稻产量和杂种优势的基因并验证功能。 研究内容：通过对课题前阶段产生的突变体库进行系统筛选，获得水稻株型、穗型、粒重、生育期等性状的突变体，分离克隆基因及调控因子；系统建立产量性状和杂种优势的基因表达谱，鉴定特异表达基因的功能，分析其对提高产量和增强杂种优势的价值；图位克隆法分离克隆产量性状基因（QTLs）。 考核指标：分离克隆调控水稻株型、穗型、粒重、生育期等性状