一、CTAB法提取DNA主要试剂及配方:
CTAB缓冲液(2%):
试剂用量(g/L)
CTAB 20
NaCl 81.816
Tris-base 7.444
EDTA-Na212.114
β巯基乙醇2~3mL
pH 8.0
称量好后65℃水浴,搅拌,直至完全溶解,然后定容,调pH
24:1溶液:
24:1为体积比,如果是一瓶新的三氯甲烷(500mL),可直接加入21mL异戊醇即可。70%乙醇:
二、CTAB法提取DNA的简要步骤
步骤备注
1将新鲜叶片叶脉去掉,剪碎置于研钵中,加入液氮快速研磨成粉末状,转入2mL离心管,加入65℃预热的CTAB提取液900 uL充分混匀,65℃保温40 -60min,在此期间轻轻颠倒离心管几次。加入CTAB后,需及时充分混匀,然后水浴。开始混匀可以使劲,后面的混匀要轻,保证DNA的完整性。此步骤是裂解细胞,释放细胞
产物
2水浴完后,冷却至室温,加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1)混合液轻轻摇动10 min。12000 r/min离心10 min;第一次抽提24:1尽量加满2mL的离心管,摇和离心的时候尽量轻拿轻放。此步骤是用氯仿抽提有机相,异戊醇的作用是去除气泡。
3取上清液,再用等体积的氯仿/异戊醇抽提一次,12000 r/min离心10 min;离心后,DNA溶于上层水相,变性蛋白溶于下层氯仿,第二次24:1抽
提加1mL即可。
4小心吸出上清液于另一2mL离心管中,加入0.6倍上清液体积的异丙醇,缓慢混匀,于-20℃冰箱中沉淀DNA;
第二次吸上清尽量不要吸到中间层,按需要浓度大小,可选择性吸取。异丙醇用前需预冷。
5挑出成团的DNA,用70%乙醇洗2~3次;挑出的DNA还是含有一定的杂质,因此,第一次70%乙醇洗时间建议
长些,一般不低于10分钟,期间上
下摇晃几次,但不可太长,否则DNA
要断裂6无水乙醇洗1次;
7倒干残余乙醇,自然干燥也可以进行真空干燥
8加无菌水溶解DNA
9 RNA去除,按100微升DNA溶液加1微升RNA
RNA酶可以加到水中,溶解DNA 酶
10溶解后放置几小时后(尽量过夜)便可电泳检测,
浓度测定
三、提取过程中可能出现的一些情况(主要是提玉米DNA)
四、10×TBE配方
Tris-base 108g/L
硼酸55 g/L
EDTA-Na27.444 g/L
pH 8.0