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信息生物学硕博连读研究生培养方案

生物信息学硕博连读研究生培养方案

一、培养目标

本专业培养德、智、体全面发展的信息生物学科领域的高级专门人才。要求学生加强思想道德的学习和修养,热爱祖国,遵纪守法,品德良好。英语水平优秀,在本学科及相关学科上掌握坚实宽广的基础理论与系统深入的专门知识,具备在在信息生物学这一交叉学科领域独立开展科学研究的能力与创新意识,并具有从事高校教学、企业科技开发与管理等方面的工作能力,成为祖国现代化建设的高级专门人才。

二、研究方向

1.生物序列识别与调控

2.生物分子进化

3.基因药物设计

4.生物信息与生物纳米技术

5.细胞分子生物工程学

三、招生对象

按中山大学《学位与研究生教育工作手册》的规定要求。

四、学习年限

按中山大学《学位与研究生教育工作手册》及中山大学文件中大研院(2003)3号

“中山大学硕博连读研究生培养工作试行办法”的规定执行。硕士学制三年。

五、课程设置

类别编号课程名称开课

学期

任课教师

(职称)

考核方式

必公

000002101

第一外国语

(First Foreign Language)

1 120 5 外语学院考试

000002103

马克思主义理论

(Theory of Marxism)

1,2 72 4 教育学院考试基

0710222101 生物信息学(Bioinformatics) 1 80 4 何淼副教授考试0710222102 生物统计学(Biostatistics) 1 80 4

方颖讲师

何淼副教授

考试

* 专

课0710222103

细胞与分子生物力学(Molecular

and Celluar Biomechanics)

1 80 4

吴建华教授

方颖讲师

考试0710222104

细胞生物工程学

(Celluar Bioengineering)

2 80 4

方颖讲师

吴建华教授

考试0710222105

信息生物学进展

(Advanced in Bioinformatics)

2 80 4 导师组考试0710222106

分子生物学研究技术

(Research Technology of

Molecular Biology)

1 80 4 屈良鹄教授考试3300002101

生命科学进展

(Advance in Life Science)

1-2 80 4 徐安龙考试

选修课专

0710222201

蛋白3D结构的理论预测

(Protein 3D structure prediction)

2 40 2 吴建华教授考试

0710222202

高等生物信息学导论

(An Introduction of

Advanced Bioinformatics)

2 60

3 吴建华教授考试

0710222203

高级数据库技术

(Advanced DBMS Technology)

2 40 2 倪德明副教授考试

0710222204

分子药物设计

(Molecular Drugs Design

2 40 2 彭文烈副教授考试

0710222205

生物图像识别技术

(Bio-image Recognition )

3 40 2 赖剑煌教授考试

0710222206

Perl语言

(Perl Language)

2 40 2 张文军副教授考试

0710112101

生物电子显微学(Biological

Electronic Microscopy)

1 80 4

张勤奋副教授

李鲲鹏博士

考试0710102206

分子免疫学

(Molecular Immunology)

3 60 3 徐安龙教授考试

0710222207 生物物理学专题(Biophysics) 2 40 3 吴建华教授考试0710021242

蛋白质电子晶体学(Protein

Electronic Crystallography)

3 80 4

张勤奋副教授

李鲲鹏博士

考试0904022209

计算机应用与软件设计

(Computer Application Software

Designing)

3 60 3

张文军副教授

考试0710092101

细胞分子生物学(二)

(Molecular Biology of the Cells)

1 60 3 欧阳学智教授考试

0710222208

(新增)

微生物基因组学与生物信息学

Microbial Genomics and

Bioinformatics

2 60

3 艾云灿教授考试

0710101204

教学实践

(Teaching Experiment)

2 40 2 导师组考核

讲座0710111209

生物大分子结构与功能

(Macromolecular Structure and

Function)

1-4 80 4 来访专家考核

*:由导师指定几门课程

六、考核方式

按中山大学《学位与研究生教育工作手册》及中山大学文件中大研院(2003)3号“中山大学硕博连读研究生培养工作试行办法”的规定执行。。

七、学位论文工作及发表论文要求

按中山大学《学位与研究生教育工作手册》及中山大学文件中大研院(2003)3号“中山大学硕博连读研究生培养工作试行办法”的规定执行。本专业特别要求必须在SCI源杂志上发表(含接受)一篇研究论文或在中文一级学报发表(含接受)二篇以上研究论文方可授予博士学位。

八、参考书目

1. D.A. Lauffenburger and J.J. Linderman. “Receptors”, Oxford Univ. Press. 1993.

2.Warren J. Ewens, Gregory R. Grant,Statistical Methods in Bioinformatics. Springer Press,

2003

3.Andreas D. Baxevanis, B. F. Ouellette, Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of

Genes and Proteins. John Wiley & Sons Press, New York, 2002

4.Pavel A. Pevzner, Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach

(Computational Molecular Biology). MIT Press, 1st edition, 2000

5.Michael S. Waterman, Introduction to Computational Biology: Maps, Sequences and

Genomes. CRC Press, 1995

6.Isaac S. Kohane, Alvin Kho, Atul J. Butte, Microarrays for an Integrative Genomics

(Computational Molecular Biology), MIT Press, 2002

7.David W. Mount, Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. Cold Spring Harbor

Laboratory Press, 1st edition , 2001

8.R.Mannhold/H.Kubinyi/H.Timmerman, Bioinformatics. WILEY-VCH 2002

9.Osamu Hatase,Jerry H.Wang, Bioinformatics:information transduction and processing

systems from cell to whole body. 1989

10.T K Attwood , D J Parry-Smith(罗静初等译),生物信息学概论“Introduction to

bioinformatics”。北京大学出版社,2002

11.郝柏林、张淑誉,生物信息学手册。上海科学技术出版社,2000

12.赵国屏,生物信息学。科学出版社,2002

13.Andreas D.Baxevanis B.F.Francis Ouellette,(李衍达、孙之荣等译),生物信息学--基因

和蛋白质分析的实用指南“Bioinf ormatics--A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins ”。清华大学出版社,2000

14.山东大学生物系,基因组研究与生物信息学。山东大学出版社,2001

15.T.S.Bakeretal. Microbiology and Molecular Biology Review. Pre.1999 P862-922

16.J. Dubochet. Cryo-electron Microscopy of Vitrified Specimens. Quarterly Review

of Biophysics 21.2 (1988) pp.129—228.

17.T.A.布朗,基因组,科学出版社,2002

18.Watson JD,et al.. Molecular biology of the gene,1993

19.Robert F,Weaver. Molecular biology. McGraw-Hill,2002

20.David M. Hillis et al. Molecular Systematics,1996

21.Alfred Goodman Gilman,et al. The Pharmacological Basis of Therapeutics,eighth edition,

Mcgraw-Hill Inc. 1995

22.冯元桢著、邢善熙译,《生物力学:运动、流动、应力和生长》,四川教育出版社,1993

23.陈兰荪,陈健.非线性生物动力系统,北京:科学出版社,1993.

24.Brown D. and Rothery P. Models in Biology: Mathematics, Statistics, & Computing.

Wiley, Chichester. 1994

25.张景强等,生物电子显微技术广州中山大学出版社,1993。

26.阎隆乙等,蛋白质分子结构1999。

27.裘法祖等,现代免役学实验技术湖北科技出版社,1998。

28.卢圣栋,现代分子生物学实验技术科学出版社,1993。

主要期刊:

中国科学,科学通报,生物数学学报,生物化学与生物物理学报,生物物理学报,生物化学与生物物理进展,电子显微学报,Nature, Science, Cell, Biophysical J., J. Cell Biology, Advances in Applied Mathematics,Applied Mathematical Modeling,European Communications in Mathematical and Theoretical Biology,Journal of Mathematical Biology

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