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生物化学及分子生物学常用缩略语

生物化学及分子生物学常用缩略语
生物化学及分子生物学常用缩略语

生物化学及分子生物学实验常用缩略语

(教学团队的范浩讲师编制)

英文缩写英文名中文名

A(1) absorbance

(2) absorbency 吸收率吸收

Acr acrylamide 丙烯酰胺

ADP adenosine diphosphate二磷酸腺苷,腺苷二磷酸AMP adenosine monophosphate腺苷一磷酸,腺苷酸Amp ampicillin氨苄青霉素

AMV avian myeloblastosis virus禽类成髓细胞瘤病毒APS ammonium persulfate 过硫酸铵

AR analytical reagent 分析纯试剂

ATP adenosine triphosphate三磷酸腺苷,腺苷三磷酸ALT alanine transaminase丙氨酸转氨酶

BAC bacterial artificial chromosome细菌人工染色体

Bis N,N’-methylene-bis-acrylamide N,N’-亚甲双丙烯酰胺BSA bovine serum albumin 牛血清白蛋白

bp base pair碱基对

ccc-DNA covalently closed circular DNA共价闭环DNA

cDNA complementary DNA互补DNA

CE capillary electrophoresis 毛细管电泳

Ch cholesterol 胆固醇

CP creatine phosphate 磷酸肌酸

DEPC diethylpyrocarbonate焦碳酸二乙酯

DNA deoxyribonucleic acid脱氧核糖核酸

dsDNA double stranded DNA双链DNA

dsRNA double stranded RNA双链RNA

DTT dithiothreitol二硫苏糖醇

EB ethidium bromide溴乙锭

E.coli Escherichia coli 大肠杆菌

EDTA ethylene diaminetetraacetic acid乙二胺四乙酸

EGTA ethylene glycol bis (2-aminoethyl) tetraacetic acid 乙二醇二乙醚二胺四乙酸ELISA enzyme-linked immunosorbent assay酶联免疫吸附测定(法)FAM Carboxyfluorescein 羧基荧光素

FCM flow cytometry 流式细胞仪

FITC fluorescein isothiocyanate 异硫氰酸荧光素

FPLC fast protein liquid chromatograpgy 快速(蛋白)液相层析G6PD glucose-6-phosphate dehydrogenase 葡糖-6-磷酸脱氢酶

GFP green fluorescence protein 绿色荧光蛋白

GST glutathione-S-transferase 谷胱甘肽S转移酶

Hb hemoglobin 血红蛋白

HEPES 4-(2-Hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid 4-羟乙基哌嗪乙磺酸

His,H histidine 组氨酸

HPLC high performance liquid chromatography 高效液相层析

Hsp heat shock protein 热休克蛋白

IEF isoelectric focusing 等电聚焦

IPTG isopropyl-β-D-thiogalactoside 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷

kb kilobase pair 千碱基对

kDa kilo-Dalton 千道尔顿

Km Michaelis constant 米氏常数

LDH lactic dehydrogenase; lactate dehydrogenase 乳酸脱氢酶

mRNA messenger RNA 信使RNA

MW molecular weight 分子量

NBT nitrotetrazolium blue氯化硝基四氮唑蓝

NC nitrocellulose membrane 硝酸纤维素膜

oc-DNA open circular DNA 开环DNA

OD optical density 光密度

PAGE polyacrylamide gel electrophoresis 聚丙烯酰胺凝胶电泳

PCR polymerase chain reaction 聚合酶链反应

PKC protein kinase C 蛋白激酶C

pI isoelectric point 等电点

PMSF phenylmethanesulfonyl fluoride 苯甲基磺酰氟

RNase ribonuclease RNA酶

PBS phosphate buffered saline PBS缓冲液

RNAi RNA interference RNA干扰

RPM round per minute 每分钟转数

RQ-PCR Real-time quantitative PCR 实时定量PCR

RT-PCR reverse transcription PCR 反转录PCR,逆转录PCR

SDS sodium dodecyl sulfate 十二烷基硫酸钠

siRNA small interfering RNA 小干扰RNA

SNP single nucleotide polymorphism 单核苷酸多态性

SSCP single strand conformation polymorphism 单链构象多态性

SWR standard working reagent 标准工作液

TBS Tris-buffered sodium chloride TBS缓冲液

TE Tris-EDTA buffer 含Tris和EDTA的缓冲液TEMED N,N,N’,N’-tetramethyl ethylene diamine N,N,N’,N’-四甲基乙二胺

TLC thin-layer chromatography 薄层层析

Tris N-Tris (hydroxymethyl) aminomethane 2-氨基-2-羟甲基-1,3-丙二醇UV ultraviolet 紫外线

X-gal 5-bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactoside 5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷YAC yeast artificial chromosome vector 酵母人工染色体载体

生物化学与分子生物学实验常用词中英文对照(教学团队的范浩讲师编制)

A

abluent 洗洁剂

absolute (ethyl) alcohol 无水乙醇

absorbance (A) 吸光率,吸收率

absorbency (A) 吸收性,吸光度

absorption 吸收(作用)

absorption coefficient 吸收系数

absorption spectrum 吸收光谱

abstract 提取

acetate 乙酸盐,醋酸盐

acetic acid 乙酸,醋酸

acidity 酸度,酸性

acrylamide 丙烯酰胺

adjustable micropipetter 可调式微量移液器/加样器affinity 亲和,亲和力,亲和性

affinity labeling 亲和标记

agar 琼脂

agarose 琼脂糖

agarose gel electrophoresis 琼脂糖凝胶电泳agitate 搅动

A:G ratio A/G比率,清球比率

alanine (Ala, A) 丙氨酸

albumin 清蛋白,白蛋白

alcohol 酒精,乙醇

alcohol burner 酒精灯

alkalinity 碱度,碱性

alkaline phosphatase 碱性磷酸酶

alpha complementation α-互补

amino 氨基

amino terminal 氨基(末)端,N-(末)端ammonium persulfate 过硫酸铵

ampholyte 两性电解质

amplicon PCR扩增产物

amplification 扩增

analytical balance 分析天平

analytical reagent 分析纯试剂

anhydrous 脱水的,无水的annealing 退火

antibiotics 抗生素

antibody 抗体

antigen 抗原

antiseptic 消毒剂,防腐剂

apolipoprotein 载脂蛋白

apoptosis 凋亡

appearent molecular weight 表观分子量

aseptic 无菌的,防腐剂

autoclave 高压灭菌器

automatic biochemical analyzer 全自动生化分析仪automatic gel image analysis system 全自动凝胶成像分析系统

autoradiography 放射自显影

azotometer 定氮仪

B

balance 天平

base 碱基

base sequence 碱基序列

beaker 烧杯

beaker brush 烧杯刷

Beer’s law 比尔定律

benchtop ultracentrifuge 台式超速离心机biochemistry 生物化学

biochip 生物芯片

biomacromolecule 生物大分子

biotin 生物素

biuret reaction 双缩脲反应

blender 搅拌器,搅碎器

blood 血液

blood sugar 血糖

blotting 印迹分析

blotting membranes 印迹膜

blotting paper 印迹用滤纸

blue-white selection 蓝白斑筛选

blunt end 平端

bottle brush 瓶刷

bromophenol blue 溴酚蓝

buffer 缓冲液

C

capacity 容量

capillary electrophoresis 毛细管电泳

capillary electrophoresis system 毛细管电泳仪carboxy(l) 羧基

catalyst 催化剂

catecholamine 儿茶酚胺

cation 阳离子

cDNA 互补DNA

cDNA chip cDNA芯片

cDNA library cDNA文库

cDNA probe cDNA探针

cell 细胞

cell culture 细胞培养

cellophane 玻璃纸

cellulose acetate membrane 醋酸纤维薄膜centrifugal force 离心力

centrifuge 离心机

centrifuge tube 离心管

chromatogram 层析图,色谱

chromatography 层析,色谱法chromatography column 层析柱

clamp 夹子

clone 克隆

cloning vector 克隆载体

CO2 incubator 二氧化碳培养箱

coomassie (brilliant) blue 考马斯亮蓝coomassie (brilliant) blue staining 考马斯亮蓝染色coefficient 系数

colloid 胶体

colony 菌落

colony counter 菌落计数器

color reaction 呈色反应

colorimetry 比色法

competence 感受态

competent cell 感受态细胞

competitive inhibition 竞争性抑制作用complementary DNA (cDNA) 互补DNA component 成分,组分

concentration 浓度condenser 冷凝器

conformation 空间构象

conical beaker 锥形瓶

conical bottom culture tube 锥底试管

constant temperature incubator 恒温培养箱constant temperature oven 恒温箱

content 含量

control experiment 对照实验

cosmid vector 黏粒载体,科斯质粒载体

counter 计数器

creatine 肌酸

culture dish 培养皿

culture flask 培养瓶

culture media 培养基

culture shaker 培养摇床

culture vessel 培养瓶

culture tube 培养管

cuvette 比色皿

D

2-D electrophoresis apparatus 双向电泳仪denaturant 变性剂

denaturation 变性(作用)

density 密度

density gradient centrifugation 密度梯度离心desiccator 干燥器

desiccant 干燥剂

detector 检测器

detergent 去垢剂,去污剂

dialysis 透析

differential display PCR 差异显示PCR

digital gel image analysis system 数码凝胶成像分析仪

diluent 稀释剂

dilute 稀释

distilled water 蒸馏水

DNA blotting DNA印迹(法)

DNA chip DNA芯片

DNA ligase DNA连接酶

DNA marker 标准分子量DNA

DNA polymerase DNA聚合酶

DNA recombination DNA重组

DNA recombination technique 重组DNA技术DNA recombination technology 重组DNA技术

DNA sequencer DNA测序仪

dot blotting 斑点印迹

dropper 滴管

drying oven 干燥箱,干燥炉

E

electric stove 电炉

electrical receptacle 电源插座

electrode 电极

electrolyte 电解质

electromagnetic oven 电磁炉electrophoresis 电泳

electronic analytical balance 电子分析天平electronic balance 电子天平electrophoresis cell 电泳槽electrophoresis system 电泳仪electrophoretogram 电泳图(谱) electrophorogram 电泳图(谱) electroporation 电穿孔

electroporation instrument 电穿孔转化仪electrothermal incubator 电热恒温培养箱eluant 洗脱液,洗脱剂

eluate 洗出液

eluent 洗脱液,洗脱剂

elution 洗脱

enzyme 酶

Escherichia coli大肠杆菌

ethanol 乙醇

exon 外显子

exponential growth phase 指数生长期expression vector 表达载体

extinction coefficient 消光系数

extract ①提取,抽取②提取液

F

fetal calf serum 胎牛血清

filter 过滤

filtration 过滤

flask 培养瓶,长颈瓶

flow cytometer (FCM) 流式细胞仪fluorescence 荧光

fluorescence intensity 荧光强度fluorescence probe 荧光探针fluorescence quantified PCR 荧光定量PCR fluorescence spectrophotometer 荧光分光光度计fluorochrome 荧光染料

fluorophore 荧光基团

forceps 镊子

formamide 甲酰胺

freezer 冷冻冰箱

frost-free refrigerator 无霜冰箱

full size ultracentrifuge 大型超速离心机

fume hood 通风橱

G

gas chromatography 气相层析

gel 凝胶

gel chromatography 凝胶层析

gel comb 凝胶梳

gel dryer 凝胶干燥仪

gel imaging system 凝胶成像系统

gene 基因

gene chip 基因芯片

gene cloning 基因克隆

gene expression 基因表达

gene inactivation 基因失活

gene knock-out 基因敲除

gene library 基因文库

genetic analyzer 全自动遗传分析仪

genetic engineering 基因工程

genome 基因组

genomic DNA 基因组DNA

genomic library 基因组文库

glassware 玻璃仪器

glass graduates with scale 刻度量杯

glass stopper 玻璃瓶塞

globulin 球蛋白

glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) 6-磷酸葡萄糖脱氢酶

glutamic oxaloacetic transaminase (GOT) 谷草转氨酶

glutamic pyruvic transaminase (GPT) 谷丙转氨酶glycogen 糖原

gradient centrifugation 梯度离心

gradient thermal cycler 梯度PCR仪

graduated cylinder 量筒

growth media 培养基

H

hemoglobin 血红蛋白

heat shock protein (HSP) 热休克蛋白

heating bath 加热水浴箱

heat-stable 耐热的,热稳定的

heparin 肝素

high density lipoprotein (HDL) 高密度脂蛋白

高效液相层析,高效液相色谱法

high pressure steam sterilizer 高压蒸汽灭菌器high speed centrifuge 高速离心机

high speed refrigerated centrifuge 高速冷冻离心机high speed centrifugation 高速离心

histidine (His, H) 组氨酸

homogenate 组织匀浆

homogenize 匀浆

homogenizer 匀浆器

homoiothermic 恒温的

horizontal gel electrophoresis system 水平凝胶电泳仪

horseradish peroxidase 辣根过氧化物酶

host 宿主

hybrid molecule 杂交分子

hybridization 杂交

hybridization in situ原位杂交

I

ice machine 制冰机

ice scoop 冰勺

immunoblotting 免疫印迹法immunoradioautography 免疫放射自显影inactivation 灭活

incubation 保温,温浴

incubator 培养箱

induce 诱导

induced mutagenesis 诱变

inducer 诱导物

induction 诱导作用

infection 感染

inhibitor 抑制剂

insertion inactivation 插入灭活

insertion sequence (IS) 插入序列

in situ hybridization 原位杂交

in situ PCR 原位PCR

insulin 胰岛素in vitro 体外,试管内

in vivo体内

iodacetamide 碘乙酰胺

ion-exchange resin 离子交换树脂

ion exchange chromatography 离子交换层析

ionic strength 离子强度

isoelectric focusing 等电聚焦

isoelectric focusing system 等电聚焦仪isoelectric point (pI) 等电点

isoelectric separation 等电分离

J

jar 广口瓶

K

kalium 钾

kinase 激酶

kinetic coefficient 动力学系数

kinetic constant 动力学常数

Klenow fragment Klenow片段,DNA聚合酶I大片段

L

lab cart 实验室样品推车

lab sink 实验室水槽

lab stool 实验凳

laboratory notebook 实验记录本

laboratory coat 工作服

label 标签

lactose 乳糖

laser scanning confocal microscope 激光扫描共焦显微镜

Lambert-Beer law 朗伯-比尔定律

latex glove 乳胶手套

ligand 配体

ligase 连接酶

liquid nitrogen 液氮

liquid nitrogen storage tank 液氮储存罐

loop 细菌接种环

low speed centrifuge 低速离心机

lysis 溶菌作用

lysozyme 溶菌酶

M

magnetic stirrer 磁力搅拌器

malonic acid 丙二酸

marker 记号笔

medicine dropper 滴管

medium 培养液

methylase 甲基化酶

methylation 甲基化

methylene blue 亚甲蓝,甲烯蓝microbalance 微量天平

microcentrifuge 微型离心机microcentrifuge tube 微型离心管

microliter syringe 微量注射器

microinjection 显微注射

microinjector 微量注射器

microplate reader 酶标仪

micropipetter 微量移液器

micropipetter tip 微量移液头

microwave oven 微波炉

milligram 毫克

mince 切碎

mini gel system 迷你凝胶电泳仪mitochondrial DNA (mtDNA) 线粒体DNA mixer 混合器,搅拌器

mobility 迁移率

molecular cloning 分子克隆,无性繁殖molecular hybridization 分子杂交

molecular weight 分子量

monoclonal antibody 单克隆抗体

mortar 研钵

multichannel pipetter 多道移液器multifunctional PCR 多功能PCR仪

multiplex PCR 多重PCR

mutation 突变

N

negative 负的,阴性的

nick 缺口

nick translation 缺口平移法

non-protein nitrogen 非蛋白氮

Northern blotting RNA印迹

nucleic acid 核酸

nucleic acid hybridization 核酸分子杂交nucleic acid sequencing system 核酸序列分析仪O

oligonucleotide 寡核苷酸

orbital rocker 旋转混匀器

optimum pH 最适pH

optimum temperature 最适温度

outlet strip 电源插座板

oven 烤箱

P

paper chromatography 纸层析,纸色谱法paper label 标签

paraffin film 密封用石蜡薄膜

PCR thermocycler 基因扩增仪

PCR plate PCR板

penicillin 青霉素

pestle 研杵

pH buffer pH缓冲液

pH meter pH酸度计

pH paper pH试纸

pH testing strips pH试纸

plasma 血浆

plasmid 质粒

pipette 移液管,吸量管

pipette tip 移液器吸头,枪头

pipettor 移液器

polyclonal antibody 多克隆抗体

polymerase 聚合酶,多聚酶

polymerase chain reaction (PCR) 聚合酶链反应polymorphism 多态性,多态现象

point mutation 点突变

positive 正的,阳的

power supply 电源

precipitation reaction 沉淀反应

pre-cast gel 预制凝胶板

pretreat 预处理

primer 引物

probe 探针

protease 蛋白酶

protein 蛋白质

protein chip 蛋白质芯片

protein expression 蛋白质表达

protein kinase 蛋白激酶

purification 纯化

purity 纯度

R

radioactivity 放射性

radioautography 放射自显影

random primer 随机引物

random priming 随机引物法

reagent 试剂

reagent bottle 试剂瓶

Real-time fluorescence quantified PCR 实时荧光定量PCR

receptor 受体

reference weight set 标准砝码系列

refrigerator 冰箱

relaxed circular DNA 开环DNA

repeating pipetter 连续移液器

reporter gene 报告基因

restriction endonuclease 限制性核酸内切酶restriction fragment length polymorphism (RFLP) 限制性片段长度多态

restriction map 限制酶切图谱

reverse transcription 逆转录

ribonuclease (RNase) RNA酶

RNase H RNA酶H

rocker 混摇器

rocking platform 摇床

rotor 离心机转头

rubber pipette bulb 洗耳球

rubber stopper 橡皮瓶塞

S

safety glasses 安全眼镜

salt precipitation 盐析

sample 样品

sampling 采样,抽样

scalpel 解剖刀

scanner 扫描器

scintillation counter 闪烁计数仪

scissors 剪刀

screening 筛选

seal sample bag 密封样品袋

semi-dry transfer unit 半干转膜仪

separation 分离

sequence 序列

sequencing 测序sequenator 序列分析仪

serum 血清

shaker 摇床,混合器

shoe covers 鞋套

sodium tetraphenylboron 四苯硼钠

solid medium 固体培养基

solubility 溶解度

solute 溶质

solution 溶液

solvent 溶剂

sonic oscillation 超声振荡

sonication probe 超声(探)头/端子

sonicator 超声破碎仪

Southern blot DNA印迹

spatula 药匙

specimen 样品,标本

spectrofluorimeter 荧光分光光度计spectrophotography 分光光度法spectrophotometer 分光光度计

squirt bottles 洗瓶

standard curve 标准曲线

steam sterilizer 蒸汽灭菌器

stir 搅动

stir bar磁力搅拌转子

stopcock 活塞,玻璃活塞

stopper 塞子

substrate 底物

superhelix 超螺旋结构

supernatant 上清液

syringe needle 注射器针头

T

Taq DNA polymerase Taq DNA聚合酶

test tube 试管

test tube holder 试管夹

test tube rack 试管架

test tube shelf 试管架

template 模板

terminal transferase 末端转移酶

tetracycline 四环素

thermoduric 耐热的

thermometer 温度计

thermostat 恒温器

thermostatic oscillation incubator 恒温振荡培养器

thermostatic oven 恒温烤箱

thermostatic water bath 恒温水浴箱

timer 定时器

thin membrane electrophoresis 薄膜电泳

tissue 组织

tissue grinder 组织研磨器

tissue culture 组织培养

tissue homogenate 组织匀浆

tracer isotope 示踪同位素

transaminase 转氨酶

transfer apparatus 电转仪

transduction 转导,转导作用

transfection 转染

transformation 转化

transmittance 透光度

transmittancy 透射比

tube brush 试管刷

tumbling mixer 翻转混匀器

U

ultra freezer 超低温冰箱

ultra purified water system 超纯水系统ultrabalance 微量天平

ultracentrifuge 超速离心机ultracentrifugation 超速离心

ultrafiltration membrane 超滤膜ultrasonication 超声破碎

ultrasonator 超声振荡器

ultrasonic cell disruptor 超声细胞破碎仪ultraviolet absorption 紫外吸收

ultraviolet lamp 紫外观察灯

ultra-low temperature freezer 超低温冰箱universal microplate reader 通用酶标仪

urea 尿素

UV spectrophotometer 紫外分光光度计

UV/VIS spectrophotometer 紫外可见分光光度计

V

vacuum drying apparatus 真空干燥器

vacuum drying oven 真空干燥炉/箱

vaseline 凡士林

vector 载体

vertical electrophoresis apparatus 垂直电泳仪vertical electrophoresis system 垂直电泳仪virus 病毒

VIS spectrophotometer 可见分光光度计volumetric flask 容量瓶

vortex mixer 漩涡混匀器

W

water bath shaker 水浴摇床

water bath 水浴,水浴槽

water bath pot 水浴锅

water still 蒸馏水器

wavelength 波长

96-well plate 96孔板

weighing paper 称量纸

Western blot 蛋白印迹

wild type 野生型

wiper for lens 擦镜纸

X

xerogel 干凝胶

Y

yeast 酵母

yeast two-hybrid system 酵母双杂交系统

参考文献

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生化及分子生物学复习资料

生化及分子生物学复习资料(15天15题) 一、变性蛋白质的性质改变 ①结晶及生物活性丧失是蛋白质变性的主要特征。 ②硫水侧链基团外露。 ③理化性质改变,溶解度降低、沉淀,粘度增加,分子伸展。 ④生理化学性质改变。分子结构伸展松散,易被蛋白酶水解。 蛋白质一、二、三、四级结构;β-折叠、α-螺旋 二、B型双螺旋DNA的结构特点 1. 两条反向平行的多核苷酸链围绕一个“中心轴”形成右手双螺旋结构,螺旋表面有一条大沟和小沟; 2.磷酸和脱氧核糖在外侧,通过3’,5 ’-磷酸二酯键相连形成DNA的骨架,与中心轴平行。碱基位于内侧,与中心轴垂直; 3. 两条链间存在碱基互补:A与T或G与C配对形成氢键,称为碱基互补原则(A与T为两个氢键,G与C为三个氢键); 4. 螺旋的稳定因素为碱基堆集力和氢键; 5. 螺旋的直径为2nm,螺距为,相邻碱基对的距离为,相邻两个核苷酸的夹角为36度。 DNA变性(复性)、增色(减色)效应 三、酶催化作用特点 一般特点(同普通的催化剂):1、只催化热力学上允许的化学反应(G<0);2、降低活化能,但不改变化学反应的平衡点;3、加快化学反应速度,但催化剂本身反应前后不发生改变。 特殊之处:1.催化具有高效性;2.高度的专一性(只能催化一种底物或一定结构的底物); 3.易失活; 4.催化活性受到调节和控制; 5.催化活性与辅助因子有关 (全酶=酶蛋白+辅助因子) 维生素;酶促反应速度;抑制剂;酶原 四、生物氧化的特点 1.反应条件温和。

2.生物氧化并非代谢物与氧直接结合,而是以脱氢为主的逐步反应。 3.生物氧化是逐步进行的,能量释放也是逐步的,一部分生成ATP。 4.终产物CO2为有机物氧化成有机酸进而脱羧生成。 呼吸链;氧化磷酸化;底物水平磷酸化;解偶联剂 五、磷酸戊糖途径的生理意义 1. 是体内生成NADPH的主要代谢途径 2. 该途径的中间产物为许多化合物的生物合成提供原料。 3. 与光合作用联系起来,实现某些单糖间的互变。 糖酵解;三羧酸循环;糖异生(掌握反应历程) 六、软脂酸β-氧化和从头合成的比较 β-氧化;α-氧化作用;ω-氧化作用 七、如何判断蛋白质的营养价值

常用分子生物学工具汇总【最新版】

常用分子生物学工具汇总 书目资料库管理系统 1、ReferenceManager v11.0 【说明】ReferenceManager是一个专门设计来管理书目参考文献的资料库程序。任何需要收集参考文献做研究之用或需要制作书目的人都可以使用Reference Manager更轻易地管理资料。Reference Manager受到全球学术机构以及商业、研究机构的研究人员、图书馆员和学生广泛地使用。 【功能】 a、快速地从草稿中准备格式化的内文引用文献和参考书目 b、建立并维护部门的研究资料库 c、追踪再版馆藏 d、为研究人员或图书馆赞助者管理新知通报服务 e、从不同的参考文献来源(如:联机、光碟、网际网络资料服务)收集参考文献 f、为学生建立指定阅读清单 g、建立教职员出版品清单 h、编目特殊馆藏 2、Endnote7.0

【说明】Endnote由ThomsonCorporation下属的Thomson ResearchSoft开发,是SCI的官方软件,具备直接连接上千个数据库、边书写论文边插入参考文献、管理数十万条参考文献等的功能。其所占系统资源容量小,基本不会发生因Endnote数据库过大而电脑死机的现象。 【功能】 a、在线搜索文献:直接从网络搜索相关文献并导入到Endnote的文献库内 b、建立文献库和图片库:收藏,管理和搜索个人文献和图片、表格 c、定制文稿:直接在Word中格式化引文和图形,利用文稿模板直接书写合乎杂志社要求的文章。 d、引文编排:可以自动帮助我们编辑参考文献的格式 序列获得和同源性比对

1、NCBI-Genbank 【说明】GenBank是美国国家生物技术信息中心(NCBI)建立的DNA序列数据库,从公共资源中获取序列数据,主要是科研人员直接提供或来源于大规模基因组测序计划( Benson等,1998)。为保证数据尽可能的完全,GenBank 与EMBL(欧洲分子生物学实验室)、DDBJ建立了相互交换数据的合作关系。 【功能】 a、Entrez检索:将核酸、蛋白质序列和基因图谱、蛋白质结构数据库整合在一起。 b、Blast检索:通过已知序列检索其同源序列(序列类型为核酸或核苷酸)。 c、序列分类检索:高通量基因组序列(HTG)、表达序列标记(EST)、序列标记位点(STS)和基因组概览序列(GSS)。序列文件的基本单位是序列条目,包括核甘酸碱基排列顺序和注释两部分。

生物化学基本概念

生物化学基本概念

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生物化学基本概念(280) 一、绪论 1生物化学 2 分子生物学(狭义、广义) 3 结构生物学 4 基因组学 5蛋白质组学 6 糖生物学 7生物工程 8 基因工程 9酶工程 10 蛋白质工程 11 细胞工程 12 发酵工程 13生化工程 14 模式生物 二、核酸化学 1 核酸 2 拟核区 3质粒 4 沉降系数 5N-C糖苷键 6第二信使 7 转化现象 8 类病毒 9沅病毒(蛋白质侵染因子) 10 核酸的一级结构 11 DNA的一级结构 12 RNA的一级结构 13 寡核苷酸 14 多核苷酸 15 DNA的二级结构 16DNA的三级结构 17 正超螺旋

18负超螺旋 19 RNA的二级结构 20RNA的三级结构 21发夹结构 22 多顺反子 23 单顺反子 24减色效应 25 增色效应 26核酸的变性 27 核酸的复性 28DNA的熔点(Tm、熔解温度) 29 退火 30 分子杂交 31 Southern 印迹法 32Nouthern 印迹法 三、蛋白质化学 1激素 2抗体 3 补体 4 干扰素 5 糖蛋白 6蛋白质氨基酸 7非蛋白质氨基酸 8等电点(PI) 9肽 10生物活性肽 11 双缩脲反应 12构型 13 构象 14蛋白质的一级结构 15蛋白质的二级结构 16蛋白质的三级结构 17蛋白质的四级结构 18二面角

19β-折叠 20 β-转角 21 无规则卷曲 22超二级结构 23 结构域 24分子病 25 可变残基 26 不变残基 27电泳 28 透析 29 相对迁移率 30盐析 31 盐溶 32 蛋白质的变性作用 33 变性蛋白 34 蛋白质的复性 35 简单蛋白 36 结合蛋白 37糖蛋白 38脂蛋白 39色蛋白 40 核蛋白 41 磷蛋白 42 金属蛋白 43可逆沉淀 44 不可逆沉淀 四、酶学 1 酶 2 单纯酶 3 结合酶 4 酶蛋白 5 辅因子 6全酶 7 辅酶

612生物化学与分子生物学

中科院研究生院硕士研究生入学考试 《生物化学与分子生物学》考试大纲 一、考试内容 1.蛋白质化学 考试内容 ●蛋白质的化学组成,20种氨基酸的简写符号 ●氨基酸的理化性质及化学反应 ●蛋白质分子的结构(一级、二级、高级结构的概念及形式) ●蛋白质一级结构测定的一般步骤 ●蛋白质的理化性质及分离纯化和纯度鉴定的方法 ●蛋白质的变性作用 ●蛋白质结构与功能的关系 考试要求 ●了解氨基酸、肽的分类 ●掌握氨基酸与蛋白质的物理性质和化学性质 ●了解蛋白质一级结构的测定方法(目前关于蛋白质一级结构测定的新方法和新思路很多,而教科书和教学中 涉及的可能不够广泛,建议只让学生了解即可) ●理解氨基酸的通式与结构 ●理解蛋白质二级和三级结构的类型及特点,四级结构的概念及亚基 ●掌握肽键的特点 ●掌握蛋白质的变性作用 ●掌握蛋白质结构与功能的关系 2.核酸化学 考试内容 ●核酸的基本化学组成及分类 ●核苷酸的结构 ●DNA和RNA一级结构的概念和二级结构要特点;DNA的三级结构 ●RNA的分类及各类RNA的生物学功能 ●核酸的主要理化特性 ●核酸的研究方法 考试要求 ●全面了解核酸的组成、结构、结构单位以及掌握核酸的性质 ●全面了解核苷酸组成、结构、结构单位以及掌握核苷酸的性质 ●掌握DNA的二级结构模型和核酸杂交技术 ●了解microRNA的序列和结构特点(近年来针对非编码RNA的研究越来越深入,建议增加相关考核) 3. 糖类结构与功能 考试内容 ●糖的主要分类及其各自的代表 ●糖聚合物及其代表和它们的生物学功能 ●糖链和糖蛋白的生物活性 考试要求 ●掌握糖的概念及其分类 ●掌握糖类的元素组成、化学本质及生物学功用 ●理解旋光异构 ●掌握单糖、二糖、寡糖和多糖的结构和性质 ●掌握糖的鉴定原理 4. 脂质与生物膜 考试内容

生物化学、化学生物学、分子生物学,三者联系与区别

一、生物化学、化学生物学、分子生物学,三者联系与区别 欧洲化学生物学的一个专门刊名为ChemBioChem刊物,这部刊物在我所阅读的文献中被反复提及,我查到该文献的两位主编分别是Jean-Marie Lehn教授和Alan R. Fersht教授,他们在诠释刊物的宗旨[1]时指出:ChemBioChem意指化学生物学和生物化学,其使命是涵盖从复杂的碳水化合物、多肽蛋白质到DNA/RNA,从组合化学、组合生物学到信号传导,从催化抗体到蛋白质折叠,从生物信息学和结构生物学到药物设计,这一范围宽广而欣欣向荣的学科领域。既然化学生物学涵盖面这么广泛,它到底和其它学科之间怎么区分呢? 想到拿这个题目出来介绍是因为这是我在第一节课课堂讨论中的内容,我们小组所参考的文献主要是关于对化学生物学这门学科的认识,化学生物学的分析手段以及一些新的研究进展,比如药物开发和寻找药物靶点。当时课堂上对于题目中三者展开过热烈讨论,作为新兴学科的化学生物学,研究的是小分子作为工具解决生物学问题的学科,它如何从生物化学和分子生物学中分别出来,这也是我自己最开始产生过矛盾的问题,这里我结合所查阅的文献谈一下自己的理解。 1.1 生物化学(Biological Chemistry) 生物化学是研究生命物质的化学组成、结构、化学现象及生命过程中各种化学变化的生物学分支学科[1]。根据一些生物化学的书我归纳了一下,其研究的基本内容包括对生物体的化学组成的鉴定,对

新陈代谢与代谢调节控制,生物大分子的结构与功能测定,以及研究酶催化,生物膜和生物力学,激素与维生素,生命的起源与进化。 生物化学对其他各门生物学科的深刻影响首先反映在与其关系比较密切的细胞学、微生物学、遗传学、生理学等领域。通过对生物高分子结构与功能进行的深入研究,揭示了生物体物质代谢、能量转换、遗传信息传递、光合作用、神经传导、肌肉收缩、激素作用、免疫和细胞间通讯等许多奥秘,使人们对生命本质的认识跃进到一个崭新的阶段。(摘自https://www.wendangku.net/doc/802883326.html,/view/253496.htm) 1.2 化学生物学(Chemical Biology) 化学生物学是使用小分子作为工具解决生物学的问题或通过干扰/调节正常过程了解蛋白质的功能[1]。曾看到过一篇关于介绍化学生物学的奠基人Schreiber的文章,他曾经指出:“化学生物学是对分子生物学的有力补充,分子生物学采用定点突变的方法来改变生物分子如蛋白质和核酸的功能;而化学生物学是采用化学的手段,如运用小分子或人工设计合成的分子作为配体来直接改变生物分子的功能[2]。” 化学生物学是近年来出现的新兴研究领域,它融合了化学、生物学、物理学、信息科学等多个相关学科的理论、技术和研究方法,是一个有活力、有应用前景的新学科。它主要研究的内容包括[3]:1化学遗传学—采用小分子活性化合物作为探针,探索和调控细胞过程 (1)基因表达的小分子调控

生物化学与分子生物学问答题

机体是如何维持血糖平衡的(说明血糖的来源、去路及调节过程)? 血液中的葡萄糖称为血糖,机体血糖平衡是糖、脂肪、氨基酸代谢协调的结果,也是肝、肌、脂肪组织等器官代谢协调的结果(由于血糖的来源与去路保持动态平衡,血糖是组织、中枢神经、脑能量来源的主要保证)。 A.血糖来源(3分) 糖类消化吸收:食物中的糖类经消化吸收入血,这是血糖最主要的来源;肝糖原分解:短期饥饿后,肝中储存的糖原分解成葡萄糖进入血液;糖异生作用:在较长时间饥饿后,氨基酸、甘油等非糖物质在肝内异生合成葡萄糖;其他单糖转化成葡萄糖。 B.血糖去路(4分) 氧化供能:葡萄糖在组织细胞中通过有氧氧化和无氧酵解产生ATP,为细胞供给能量,此为血糖的主要去路。合成糖原:进食后,肝和肌肉等组织将葡萄糖合成糖原以储存。转化成非糖物质:可转化为甘油、脂肪酸以合成脂肪;可转化为氨基酸、合成蛋白质。转变成其他糖或糖衍生物(戊糖磷酸途径),如核糖、脱氧核糖、氨基多糖等。血糖浓度高于肾阈时可随尿排出一部分。 C.血糖的调节(2分) 胰岛素是体内唯一降低血糖的激素,但胰岛素分泌受机体血糖的控制(机体血糖升高胰岛素分泌减少)。胰岛素分泌增加,糖原合酶活性提高、糖原磷酸化酶活性降低,糖原分解降低、糖原合成提高,血糖降低。否则相反(胰岛素分泌减少,糖原合酶活性降低、糖原磷酸化酶活性提高,糖原分解提高、糖原合成降低,血糖提高)。胰高血糖素、肾上腺素作用是升高机体血糖。胰高血糖素、肾上腺素分泌增加,糖原合酶活性降低、糖原磷酸化酶活性提高,糖原分解提高、糖原合成降低,血糖提高。否则相反。 老师,丙酮酸被还原为乳酸后,乳酸的去路是什么 这个问题很重要。 肌组织产生的乳酸的去向包括:大量乳酸透过肌细胞膜进入血液,在肝脏进行糖异生转变为葡萄糖。大量乳酸进入血液,在心肌中经LDH1催化生成丙酮酸氧化供能;部分乳酸在肌肉内脱氢生成丙酮酸而进入到有氧氧化供能。大量乳酸透过肌细胞膜进入血液,在肾脏异生为糖或经尿排出体外。 下面问题你能回答出来不 1说明脂肪氧化供能的过程 (1)脂肪动员:脂肪组织中的甘油三酯在HSL的作用下水解释放脂酸和甘油。 (2)脂酸氧化:经脂肪酸活化、脂酰CoA进入线粒体、β-氧化、乙酰CoA进入三羧酸循环彻底氧化成H2O 和CO2并释放能量。 (3)甘油氧化:经磷酸化、脱氢、异构转变成3-磷酸甘油醛,3-磷酸甘油醛循糖氧化分解途径彻底分解生成H2O 和CO2并释放能量。 1.丙氨酸异生形成葡萄糖的过程 答:(1)丙氨酸经GPT催化生成丙酮酸。(2)丙酮酸在线粒体内经丙酮酸羧化酶催化生成草酰乙酸,后者经苹果酸脱氢酶催化生成苹果酸出线粒体,在胞液中经苹果酸脱氢酶催化生成草酰乙酸,后者在磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶作用下生成磷酸烯醇式丙酮酸。(3)磷酸烯醇式丙酮酸循糖酵解途径至1,6-双磷酸果糖。1,6-双磷酸果糖经果糖双磷酸酶催化生成6-磷酸果糖,再异构成6-磷酸葡萄糖。6-磷酸葡萄糖在葡萄糖-6-磷酸酶作用下生成葡萄糖。

生物化学与分子生物学试题库完整

“生物化学与分子生物学” 题库 第二军医大学基础医学部 生物化学与分子生物学教研室编制 2004年7月

第一篇生物大分子的结构与功能 第一章蛋白质的结构与功能 一、单项选择题(A型题) 1.蛋白质的一级结构是指下面的哪一种情况?( ) A、氨基酸种类的数量 B、分子中的各种化学键 C、氨基酸残基的排列顺序 D、多肽链的形态和大小 E、氨基酸的连接方式 2.关于蛋白质分子三级结构的描述,其中错误的是:( ) A、天然蛋白质分子均有这种结构 B、具有三级结构的多肽链都有生物学活性 C、三级结构的稳定性主要是次级键维系 D、亲水基团多聚集在三级结构的表面 E、骨架链原子的空间排布 3、学习“蛋白质结构与功能”的理论后,我们认识到错误概念是()。 A、蛋白质变性是肽键断裂所致 B、蛋白质的一级结构决定其空间结构 C、肽键的键长较单键短,但较双键长 D、四级结构蛋白质必定由二条或二条以上多肽链组成 E、蛋白质活性不仅取决于其一级结构,还依赖于高级结构的正确 4、通过“蛋白质、核酸的结构与功能”的学习,认为错误的概念是()。 A、氢键是维系多肽链β-折叠的主要化学键 B、DNA分子的二级结构是双螺旋,维系其稳定的重要因素是碱基堆积力 C、蛋白质变性后可以恢复,但DNA变性后则不能恢复 D、谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸三者组成GSH E、蛋白质亚基具有三级结构,而tRNA三级结构呈倒L形 5、“蛋白质分子结构与功能”一章学习,告之我们以下概念不对的是()。 A、氢键不仅是维系β-折叠的作用力,也是稳定β-转角结构的化学键 B、活性蛋白质均具有四级结构 C、α-螺旋的每一圈包含3.6个氨基酸残基 D、亚基独立存在时,不呈现生物学活性的 E、肽键是不可以自由旋转的 6、关于蛋白质分子中α-螺旋的下列描述,哪一项是错误的?() A、蛋白质的一种二级结构 B、呈右手螺旋

常用分子生物学软件简介

常用分子生物学软件简 介 公司内部编号:(GOOD-TMMT-MMUT-UUPTY-UUYY-DTTI-

常用分子生物学软件 一、基因芯片: 1、基因芯片综合分析软件。 ArrayVision 一种功能强大的商业版基因芯片分析软件,不仅可以进行图像分析,还可以进行数据处理,方便protocol的管理功能强大,商业版正式版:6900美元。Arraypro Media Cybernetics公司的产品,该公司的gelpro, imagepro一直以精确成为同类产品中的佼佼者,相信arraypro也不会差。 phoretix? Array Nonlinear Dynamics公司的基因片综合分析软件。 J-express 挪威Bergen大学编写,是一个用JAVA语言写的应用程序,界面清晰漂亮,用来分析微矩阵(microarray)实验获得的基因表达数据,需要下载安装JAVA运行环境后后,才能运行。 2、基因芯片阅读图像分析软件 ScanAlyze ,斯坦福的基因芯片基因芯片阅读软件,进行微矩阵荧光图像分析,包括半自动定义格栅与像素点分析。输出为分隔的文本格式,可很容易地转化为任何数据库。 3、基因芯片数据分析软件 Cluster

斯坦福的对大量微矩阵数据组进行各种簇(Cluster)分析与其它各种处理的软件。 SAM Significance Analysis of Microarrays 的缩写,微矩阵显着性分析软件,EXCEL软件的插件,由Stanford大学编制。 4.基因芯片聚类图形显示 TreeView 斯坦福开发的用来显示Cluster软件分析的图形化结果。现已和Cluster成为了基因芯片处理的标准软件。 FreeView 是基于JAVA语言的系统树生成软件,接收Cluster生成的数据,比Treeview增强了某些功能。 5.基因芯片引物设计 Array Designer DNA微矩阵(microarray)软件,批量设计DNA和寡核苷酸引物工具 二、RNA二级结构。 RNA Structure RNA Sturcture 根据最小自由能原理,将Zuker的根据RNA一级序列预测RNA二级结构的算法在软件上实现。预测所用的热力学数据是最近由Turner实验室获得。提供了一些模块以扩展Zuker算法的能力,使之为一个界面友好的RNA折叠程序。允许你同时打开多个数据处理窗口。主窗口的工具条提供一些基本功能:打开文件、导入文件、关闭文件、设置程序参数、重排窗口、以及即时帮助和退

生化和分子生物学

华中科技大学生物学硕士研究生入学考试《生化与分子生物学》 考试大纲 第一部分考试说明 一、考试性质 全国硕士研究生入学考试是为高等学校招收硕士研究生而设置的。其中,生物学(专业部分)由我校自行出题。它的评价标准是高等学校优秀本科毕业生能达到的及格或及格以上水平,以保证被录取者具有基本的生物学知识而有利于我校在录取时择优选拔。 二、评价目标 生物学(专业部分)考试在重点考查生物化学和分子生物学的基础知识、基本理论的基础上,注重考查理论联系实际的能力,说明、提出、分析和解决这些学科中出现的现象和问题。 ?正确地理解和掌握有关的基本概念、理论、假说、规律和论断 ?运用掌握的基础理论知识和原理,可以就某一问题设计出实验方案 ?准确、恰当地使用专业术语,文字通顺、层次清楚、有论有据、合乎逻辑地表述 三、考试形式和试卷结构 o答卷方式:闭卷,笔试,所列题目全部为必答题 o答题时间:180分钟 o题型比例:名词解释约15%;填空题约25%;简答和计算约30%;分析论述约30% 第二部分考查要点 一、分子生物学 (一)DNA 1、DNA的结构 DNA的构成,DNA的一级结构、二级结构、高级结构 2、DNA的复制 DNA的半保留复制,复制起点、方向和速度,复制的几种主要方式 3、原核生物和真核生物DNA复制特点 原核生物DNA复制特点,真核生物DNA复制特点,DNA的复制调控 4、DNA的修复 四种修复方式

5、DNA的转座 转座子的分类和结构特征,转座机制,转座作用的遗传学效应,真核生物的转座子 (二)生物信息的传递(上)——从DNA到RNA 1、RNA的转录 转录的基本过程,转录机器的主要成分 2、启动子与转录起始 启动子的基本结构,启动子的识别,酶与启动子的结合,-10区和-35区的最佳间距,增强子及其功能,真核生物启动子对转录的影响 3、原核生物与真核生物mRNA的特征比较 原核生物mRNA的特征,真核生物mRNA的特征 4、终止和抗终止 不依赖于ρ因子的终止,依赖于ρ因子的终止,抗终止 5、内含子的剪接、编辑及化学修饰 RNA中的内含子,RNA的剪接,RNA的编辑和化学修饰 (三)生物信息的传递(下)——从DNA到蛋白质 1.遗传密码 三联子密码及其破译,遗传密码的性质 2.tRNA tRNA的结构、功能及种类,氨酰-tRNA合成酶 3.核糖体 核糖体的结构,rRNA,核糖体的功能 4.蛋白质合成的生物学机制 氨基酸的活化,肽链的起始、延伸和终止,蛋白质前体的加工,蛋白质合成抑制剂,RNA分子在生物进化中的地位 5.蛋白质运转机制 翻译-运转同步机制,翻译后的运转机制,核定位蛋白的运转机制,蛋白质的降解 (四)分子生物学研究法 1、重组DNA技术发展史上的重大事件 略 2、DNA操作技术 核酸的分离、提纯和定量测定的方法,核酸的凝胶电泳,分子杂交,细菌转化,核苷酸序列分析,基因扩增,DNA与蛋白质相互作用研究 2、基因克隆的主要载体系统 质粒DNA及其分离纯化,重要的大肠杆菌质粒载体,λ噬菌体载体,柯斯质粒载体,pBluescript噬菌体载体

生物化学与分子生物学学习指导与习题集

生物化学与分子生物学学习指导与习题集11

第一篇生物大分子的结构与功能 第一章蛋白质的结构与功能 氨基酸的结构与性质 1.氨基酸的概念:氨基酸(amino acid)是蛋白质分子的基本结构单位。构成蛋白质分子的氨基酸共有20种,这些氨基酸都是L-构型的α-氨基酸。 2.氨基酸分子的结构通式: 5、氨基酸的等电点 氨基酸不带电荷时,溶液的pH值称为该氨基酸的等电点,以pI表示。氨基酸不同,其等电点也不同。也就是说,等电点是氨基酸的一个特征值。 6、氨基酸的茚三酮反应 如果把氨基酸和茚三酮一起煮沸,除脯氨酸和羟脯氨酸显黄色外,其它氨基酸都显深浅不同的紫色。氨基酸与茚三酮的反应,在生化中是特别重要的,因为它能用来定量测定氨基酸。。 肽键: 1、肽键: 一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基以共价键偶联形成肽,其间的化学键称为肽键(peptide bond),也叫酰胺键(-CO-NH-)。 4、肽(peptide)是氨基酸通过肽键相连的化合物。肽按其组成的氨基酸数目为2个、3个和4个等不同而分别称为二肽、三肽和四肽等,多肽和蛋白质的区别是多肽中氨基酸残基数较蛋白质少,一般少于50个,而蛋白质大多由100个以上氨基酸残基组成,但它们之间在数量上也没有严格的分界线。 蛋白质的分离和纯化 2、盐析:在蛋白质溶液中加入大量中性盐,以破坏蛋白质的胶体性质,使蛋白质从溶液中沉淀析出,称为盐析。常用的中性盐有:硫酸铵、氯化钠、硫酸钠等。 √蛋白质的等电点概念:蛋白质分子所带正、负电荷相等时溶液的pH值称为蛋白质的等电点。 pH 值在等电点以上,蛋白质带负电,在等电点以下,则带正电。溶液的pH在蛋白质的等电点处蛋白质的溶解度最小。

分子生物学常见名词解释完全版

分子生物学常见名词解释完全版(中英文对照) A Abundance (mRNA 丰度):指每个细胞中mRNA 分子的数目。 Abundant mRNA(高丰度mRNA):由少量不同种类mRNA组成,每一种在细胞中出现大量 拷贝。 Acceptor splicing site (受体剪切位点):内含子右末端和相邻外显子左末端的边界。Acentric fragment(无着丝粒片段):(由打断产生的)染色体无着丝粒片段缺少中心粒,从而 在细胞分化中被丢失。 Active site(活性位点):蛋白质上一个底物结合的有限区域。 Allele(等位基因):在染色体上占据给定位点基因的不同形式。 Allelic exclusion(等位基因排斥):形容在特殊淋巴细胞中只有一个等位基因来表达编码的 免疫球蛋白质。 Allosteric control(别构调控):指蛋白质一个位点上的反应能够影响另一个位点活性的能力。Alu-equivalent family(Alu 相当序列基因):哺乳动物基因组上一组序列,它们与人类Alu 家族相关。 Alu family (Alu家族):人类基因组中一系列分散的相关序列,每个约300bp长。每个成员 其两端有Alu 切割位点(名字的由来)。 α-Amanitin(鹅膏覃碱):是来自毒蘑菇Amanita phalloides 二环八肽,能抑制真核RNA聚 合酶,特别是聚合酶II 转录。 Amber codon (琥珀密码子):核苷酸三联体UAG,引起蛋白质合成终止的三个密码子之一。Amber mutation (琥珀突变):指代表蛋白质中氨基酸密码子占据的位点上突变成琥珀密码 子的任何DNA 改变。 Amber suppressors (琥珀抑制子):编码tRNA的基因突变使其反密码子被改变,从而能识 别UAG 密码子和之前的密码子。 Aminoacyl-tRNA (氨酰-tRNA):是携带氨基酸的转运RNA,共价连接位在氨基酸的NH2 基团和tRNA 终止碱基的3¢或者2¢-OH 基团上。 Aminoacyl-tRNA synthetases (氨酰-tRNA 合成酶):催化氨基酸与tRNA 3¢或者2¢-OH基团共价连接的酶。 Amphipathic structure(两亲结构):具有两个表面,一个亲水,一个疏水。脂类是两亲结构,一个蛋白质结构域能够形成两亲螺旋,拥有一个带电的表面和中性表面。 Amplification (扩增):指产生一个染色体序列额外拷贝,以染色体内或者染色体外DNA形 式簇存在。 Anchorage dependence (贴壁依赖):指正常的真核细胞需要吸附表面才能在培养基上生长。Aneuploid (非整倍体):组成与通常的多倍体结构不同,染色体或者染色体片段或成倍丢失。Annealing (退火):两条互补单链配对形成双螺旋结构。 Anterograde (顺式转运):蛋白质质从内质网沿着高尔基体向质膜转运。 Antibody (抗体):由B 淋巴细胞产生的蛋白质(免疫球蛋白质),它能识别特殊的外源“抗 2 原”,从而引起免疫应答。 Anticoding strand (反编码链):DNA 双链中作为膜板指导与之互补的RNA 合成的链。Antigen (抗原):进入基体后能引起抗体(免疫球蛋白质)合成的分子。 Antiparallel (反式平行):DNA双螺旋以相反的方向组织,因此一条链的5¢端与另一条链的3¢端相连。

生物化学与分子生物学名词解释

生物化学与分子生物学名词解释

生化名解 1、肽单元(peptide unit):参与肽键的6个原子Ca1、C、O、N、H、Ca2位于同一平面,Ca1和Ca2在平面上所处的位置为反式构型,此同一平面上的6个原子构成了肽单元,它是蛋白质分子构象的结构单元。Ca是两个肽平面的连接点,两个肽平面可经Ca的单键进行旋转,N—Ca、Ca—C是单键,可自由旋转。 2、结构域(domain):分子量大的蛋白质三级结构常可分割成1个和数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,具有独立的生物学功能,大多数结构域含有序列上连续的100—200个氨基酸残基,若用限制性蛋白酶水解,含多个结构域的蛋白质常分成数个结构域,但各结构域的构象基本不变。 3、模体(motif):在许多蛋白质分子中,二个或三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象。一个模序总有其特征性的氨基酸序列,并发挥特殊功能,如锌指结构。 4、蛋白质变性(denaturation):在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质的改变和生物活性的丧失。主要发生二硫键与非共价键的破坏,不涉及一级结构中氨基酸序列的改变,变性的蛋白质易沉淀,沉淀的蛋白质不一定变性。 5、蛋白质的等电点( isoelectric point, pI):当蛋白质溶液处于某一pH时,

而改变酶的活性,此过程称为共价修饰。主要包括:磷酸化—去磷酸化;乙酰化—脱乙酰化;甲基化—去甲基化;腺苷化—脱腺苷化;—SH与—S—S—互变等;磷酸化与脱磷酸是最常见的方式。 10、酶原和酶原激活(zymogen and zymogen activation):有些酶在细胞内合成或初分泌时只是酶的无活性前体,必须在一定的条件下水解开一个或几个特定的肽键,使构象发生改变,表现出酶的活性,此前体物质称为酶 原。由无活性的酶原向有活性酶转化的过程称为酶原激活。酶原的激活,实际是酶的活性中心形成或暴露的过程。 11、同工酶(isoenzyme isozyme):催化同一化学反应而酶蛋白的分子结构,理化性质,以及免疫学性质都不同的一组酶。它们彼此在氨基酸序列,底物的亲和性等方面都存在着差异。由同一基因或不同基因编码,同工酶存在于同一种属或同一个体的不同组织或同一细胞的不同亚细胞结构中,它使不同的组织、器官和不同的亚细胞结构具有不同的代谢特征。 12、糖酵解(glycolysis):在机体缺氧条件下,葡萄糖经一系列酶促反应生成丙酮酸进而还原生成乳酸的过程称为糖酵解(糖的无氧氧化)。糖酵解的反应部位在胞浆。主要包括由葡萄糖分解成丙酮酸的糖酵解途径和由丙酮酸转变成乳酸两个阶段,1分子葡萄糖经历4次底物水平磷酸化,净生成2分子ATP。关键酶主要有己糖激酶,6-磷酸果糖激酶-1和丙酮酸激酶。它的意义是机体在缺氧情况下获取能量的有效方式;某些细胞在氧供应正常情况下的重要供能途径。

生物化学笔记(整理版)1

《生物化学》绪论 生物化学可以认为是生命的化学,是研究微生物、植物、动物及人体等的化学组成和生命过程中的化学变化的一门科学。 生命是发展的,生命起源,生物进化,人类起源等,说明生命是在发展,因而人类对生命化学的认识也在发展之中。 20世纪中叶直到80年代,生物化学领域中主要的事件: (一)生物化学研究方法的改进 a. 分配色谱法的创立——快捷、经济的分析技术由Martin.Synge创立。 b. Tisellius用电泳方法分离血清中化学构造相似的蛋白质成分。吸附层析法分离蛋白质及其他物质。 c. Svedberg第一台超离心机,测定了高度复杂的蛋白质。 d. 荧光分析法,同位素示踪,电子显微镜的应用,生物化学的分离、纯化、鉴定的方法向微量、快速、精确、简便、自动化的方向发展。 (二)物理学家、化学家、遗传学家参加到生命化学领域中来 1. Kendrew——物理学家,测定了肌红蛋白的结构。 2. Perutz——对血红蛋白结构进行了X-射线衍射分析。 3. Pauling——化学家,氢键在蛋白质结构中以及大分子间相互作用的重要性,认为某些protein具有类似的螺旋结构,镰刀形红细胞贫血症。 (1.2.3.都是诺贝尔获奖者) 4.Sanger―― 生物化学家 1955年确定了牛胰岛素的结构,获1958年Nobel prize化学奖。1980年设计出一种测定DNA内核苷酸排列顺序的方法,获1980年诺贝尔化学奖。 5.Berg―― 研究DNA重组技术,育成含有哺乳动物激素基因的菌株。 6.Mc clintock―― 遗传学家发现可移动的遗传成分,获1958年诺贝尔生理奖。 7.Krebs―― 生物化学家 1937年发现三羧酸循环,对细胞代谢及分生物的研究作出重要贡献,获1953年诺贝尔生理学或医学奖。 8.Lipmann―― 发现了辅酶A。 9. Ochoa——发现了细菌内的多核苷酸磷酸化酶 10.Korberg——生物化学家,发现DNA分子在细菌内及试管内的复制方式。(9.10.获1959年的诺贝尔生理医学奖) 11.Avery―― 加拿大细菌学家与美国生物学家Macleod,Carty1944年美国纽约洛克菲勒研究所著名实验。肺炎球菌会产生荚膜,其成分为多糖,若将具荚膜的肺炎球菌(光滑型)制成无细胞的物质,与活的无荚膜的肺炎球菌(粗糙型)细胞混合 ->粗糙型细胞也具有与之混合的光滑型的荚膜->表明,引起这种遗传的物质是DNA 12.Wilkins―― 完成DNA的X-射线衍射研究,对Watson和Crick确定DNA分子的双螺旋结构是至关重要的。三人共获1962年诺贝尔生理医学奖。 13.Nirenberg―― 生物化学家在破译遗传密码方面作出重要贡献。

(完整版)生物化学与分子生物学知识总结

生物化学与分子生物学知识总结 第一章蛋白质的结构与功能 1.组成蛋白质的元素主要有C、H、O、N和 S。 2.蛋白质元素组成的特点各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。 100克样品中蛋白质的含量 (g %)= 每克样品含氮克数× 6.25×100 3.组成人体蛋白质的20种氨基酸均属于L- -氨基酸氨基酸 4.可根据侧链结构和理化性质进行分类 非极性脂肪族氨基酸极性中性氨基酸芳香族氨基酸酸性氨基酸碱性氨基酸 5.脯氨酸属于亚氨基酸 6.等电点(isoelectric point, pI) 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。 色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在 280 nm 附近。 氨基酸与茚三酮反应生成蓝紫色化合物 7.蛋白质的分子结构包括: 一级结构(primary structure) 二级结构(secondary structure) 三级结构(tertiary structure) 四级结构(quaternary structure) 1)一级结构定义:蛋白质的一级结构指在蛋白质分子从N-端至C-端的氨基酸排列顺序。主要的化学键:肽键,有些蛋白质还包括二硫键。 2)二级结构定义:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及

氨基酸残基侧链的构象主要的化学键:氢键 ?蛋白质二级结构 包括α-螺旋 (α -helix) β-折叠 (β-pleated sheet) β-转角 (β-turn) 无规卷曲 (random coil) 3)三级结构定义:整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。主要的化学键: 8. 模体(motif)是具有特殊功能的超二级结构,是由二个或 三个具有二级结构的肽段,在空间上相互接近,形成一个特殊的空间构象。 9.分子伴侣(chaperon)通过提供一个保护环境从而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。 ?蛋白质胶体稳定的因素: 颗粒表面电荷、水化膜 10.蛋白质的变性: 在某些物理和化学因素作用下,其特定的空间构象被破坏,也即有序的空间结构变成无序的空间结构,从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。 变性的本质:破坏非共价键和二硫键,不改变蛋白质的一级结构。 ?造成变性的因素: 如加热、乙醇等有机溶剂、强酸、强碱、重金属离子及生物碱试剂等。 由于空间结构改变,分子内部疏水基团暴露,亲水基团被掩盖,故水溶性降低。由于变性蛋白质分子不对称性增加,故粘度增加。由于变性蛋白质肽键暴露,易被蛋白酶水解。

分子生物学常用技术 习题

第五章常用分子生物学技术的原理及其应用习题(引自网络精品课程) 一、选择题 (一)A型题 1 .分子杂交实验不能用于 A .单链DNA 与RNA 分子之间的杂交 B .双链DNA 与RNA 分子之间的杂交 C .单链RNA 分子之间的杂交 D .单链DNA 分子之间的杂交 E .抗原与抗体分子之间的杂交 2 .关于探针叙述错误的是 A .带有特殊标记 B .具有特定序列 C .必须是双链的核酸片段 D .可以是基因组DNA 片段 E .可以是抗体 3 .下列哪种物质不能用作探针 A .DNA 片段 B .cDNA C .蛋白质 D .氨基酸 E .RNA 片段 4 .印迹技术可以分为 A .DNA 印迹 B .RNA 印迹 C .蛋白质印迹 D .斑点印迹 E .以上都对 5 .PCR 实验延伸温度一般是 A .90 ℃ B .72 ℃ C .80 ℃ D .95 ℃ E .60 ℃ 6 .Western blot 中的探针是 A .RNA B .单链DNA C .cDNA D .抗体 E .双链DNA 7 .Northern blotting 与Southern blotting 不同的是 A .基本原理不同 B .无需进行限制性内切酶消化 C .探针必须是RNA D .探针必须是DNA E .靠毛细作用进行转移 8 .可以不经电泳分离而直接点样在NC 膜上进行杂交分析的是 A .斑点印迹 B .原位杂交 C .RNA 印迹 D .DNA 芯片技术 E .DNA 印迹 9 .下列哪种物质在PCR 反应中不能作为模板 A .RNA B .单链DNA C .cDNA D .蛋白质 E .双链DNA 10 .RT-PCR 中不涉及的是 A .探针 B .cDNA C .逆转录酶 D .RNA E .dNTP 11 .关于PCR 的基本成分叙述错误的是 A .特异性引物 B .耐热性DNA 聚合酶 C .dNTP D .含有Zn 2+ 的缓冲液 E .模板 12 .DNA 链末端合成终止法不需要 A .ddNTP B .dNTP C .引物标记 D .DNA 聚合酶 E .模板 13 .cDNA 文库构建不需要 A .提取mRNA B .限制性内切酶裂解mRNA C .逆转录合成cDNA D .将cDNA 克隆入质粒或噬菌体 E .重组载体转化宿主细胞 14 .标签蛋白沉淀是 A .研究蛋白质相互作用的技术 B .基于亲和色谱原理 C .常用标签是GST D .也可以是6 组氨酸标签 E .以上都对 15 .研究蛋白质与DNA 在染色质环境下相互作用的技术是 A .标签蛋白沉淀 B .酵母双杂交 C .凝胶迁移变动实验 D .染色质免疫沉淀法 E .噬菌体显示筛选系统 16 .动物整体克隆技术又称为

生物化学与分子生物学

生物化学与分子生物学 生物化学与分子生物学既是生命科学的基础,又是生命科学的前沿。生物化学是研究生物体内化学分子与化学反应的基础生命科学,从分子水平探讨生命现象的本质。分子生物学研究核酸、蛋白质等生物大分子的结构、功能及基因结构、表达与调控的内容,其发展揭示了生命本质的高度有序性和一致性,是人类在认识论上的重大飞跃。近年来迅猛发展的生物化学与分子生物学学科促进了相关和交叉学科,尤其是医学的发展。因此该门课程是我们学习发展中必不可少的学科之一。故在学习之初就给予了高度重视。 最初学习了蛋白质的结构和功能、酶,以及核酸的结构和功能因高中内容有所涉及以及内容较少所以困难度不大。之后学习了糖代谢、脂质代谢、生物氧化、氨基酸代谢、核苷酸代谢、非营养物质代谢的内容,就对生物化学与分子生物学这门学科有了更多的了解以及认识。 其中我感触最深的就是糖的代谢,糖是人类食物的主要成分,约占食物总量的百分之五十以上。糖是机体的一种重要能量来源,人体所需能量的百分之五十至百分之七十来自于糖。其中葡萄糖占比很大。细胞内葡萄糖代谢主要包括糖的无氧氧化、糖的有氧氧化和磷酸戊糖途径,取决于不同类型细胞的代谢特点和供氧状况。 接下来我想着重谈论下我对糖的有氧氧化的理解及感想。由于在供氧充足的情况下机体绝大多数组织中的葡萄糖进行有氧氧化生成二氧化碳和水以及释放大量能量供机体利用。所以有氧氧化在糖代谢

中占有不可或缺的作用。第一阶段葡萄糖在胞液中进行糖酵产生丙酮酸;第二阶段丙酮酸进入线粒体氧化脱羧生成乙酰辅酶A;第三阶段在线粒体中乙酰辅酶A进入柠檬酸循环以及氧化磷酸化生成ATP。其中有很多内容都需要我们牢固掌握,例如每一步反应发生的部位、产生能量的多少、关键酶的名称以及它的激活剂和抑制剂、每一步反应的产物以及那些反应是底物水平磷酸化。糖酵解过程以及柠檬酸循环过程十分重要,需深刻理解记忆。在此我将氧化反应中的关键酶详细提及,关键酶是代谢途径中决定反应方向和反应速度的酶。它催化的反应速度最慢,所以又称限速酶。在糖酵解中关键酶有己糖激酶、磷酸果糖激酶-1和丙酮酸激酶;第二阶段关键酶有丙酮酸脱氢酶复合体;第三阶段柠檬酸循环中关键酶有柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶、α-酮戊二酸脱氢酶复合体。它们调节的反应均为不可逆反应,其活性决定代谢的总速度,它们的活性除受底物控制外还受多种代谢物或效应剂的调节。ATP/ADP(AMP)全程调节,该比值升高时,所有关键酶均被抑制,其中AMP影响大。 一分子葡萄糖有氧氧化可产生30或32分子ATP是无氧氧化的15或16倍,因此糖有氧氧化是糖分解生成ATP的主要方式。对机体的生长、发育和繁殖都有着重大意义。 学习生物化学与分子生物学对我们将来在临床学习以及工作中对疾病的发生和发展有了透彻的了解,对疾病的诊断和治疗提供了帮助。

分子生物学常见名词解释

专业《分子生物学》复习题 (仅供参考) 一名词解释: 1、基因gene:基因是产生一条多肽链或功能RNA所必须的全部核苷酸序列,是决定遗传性状的功能单位。 2、基因组genome:细胞或生物体的一套完整单倍体的遗传物质的总和。 4、顺式作用元件:是指基因序列中可在原位发挥作用并影响其在物理上相连的基因表达的保守结构。如启动子、上游启动子元件、增强子、终止子等。 5、反式作用因子:是指真核细胞内含有的大量可以通过直接或间接结合顺式作用元件而调节基因转录活性的蛋白质因子。如RNA聚合酶。 6、启动子promoter:是与RNA聚合酶特异性结合并起始转录的DNA区域。 7、增强子enhancer:位于真核基因中远离转录起始点,能明显增强启动子转录效率的特殊DNA序列。它可位于被增强的转录基因的上游或下游,也可相距靶基因较远。 8、基因表达gene expression:是指生物基因组中结构基因所携带的遗传信息经过转录、翻译等一系列过程,合成特定的蛋白质,进而发挥其特定的生物学功能和生物学效应的全过程。 9、分子克隆molecular expression:在体外对DNA分子按照既定目的和方案进行人工重组,将重组分子导入合适宿主,使其在宿主中扩增和繁殖,以获得该DNA分子的大量拷贝。 10、基因工程genetic engineering:有目的的通过分子克隆技术,人为的操作改造基因,改变生物遗传性状的系列过程。 11、 DNA变性Denaturation:在物理或化学因素的作用下,导致两条DNA链之间的氢键断裂,而核酸分子中的所有共价键则不受影响。 12、 DNA复性renaturation:当促使变性的因素解除后,两条DNA链又可以通过碱基互补配对结合形成DNA双螺旋结构。 13、退火annealing:指将温度降至引物的TM值左右或以下,引物与DNA 摸板互补区域结合形成杂交链。 14、反义RNA antisense RNA:碱基序列正好与有意义的mRNA互补的RNA 称为反义RNA。可以作为一种调控特定基因表达的手段。 15、核酶ribozyme:具有催化活性的RNA,在RNA的剪接加工过程中起到自我催化的作用。 16、管家基因(House-keeping gene):在生物体生命的全过程都是必须的,且在一个生物个体的几乎所有细胞中持续表达的基因。 17、奢侈基因(luxury gene):又称可调节基因(regulated gene)、可诱导基因,是在特殊类型的细胞中为特化功能蛋白质编码的基因,其表达和调控都受环境条件的影响。 18、重叠基因(overlapping gene):它是指两个或两个以上的结构基因共用一段DNA顺序的现象。 19、C值矛盾C value paradox:一个单倍体基因组的全部DNA含量总是恒定的。这是物种的一个特征,通常称为该物种的C值。一般而言,随着生物的进化,生物体的结构和功能越来越复杂,其C值就越大。但由于人们无法用已知功能

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