纯化前准备
1.推荐在中性至弱碱性条件下(pH 7-8)结合重组蛋白。磷酸盐buffer是常用的缓冲液,Tric-Cl在
一般情况下可用,但要注意它会降低结合强度。
2.避免在buffer中包含EDTA或柠檬酸盐等螯合剂。
3.若重组蛋白以包涵体形式表达,在所有的buffer中添加6 M盐酸胍或8 M尿素
4.避免缓冲液中有高浓度的电子供体基团,比如:NH4,甘氨酸,精氨酸,Tris,等等
5.各种缓冲液里不能有高浓度的强还原剂,,比如DTT,防止二价Ni被还原;
6.不能含离子型的去垢剂,比如SDS,防止Ni流失;
7.缓冲液里可以加入甘油,防止蛋白之间由于疏水相互作用而发生聚集沉淀,甘油浓度最高可达
50%(v/v)
8.缓冲液里NaCl的浓度应在300mM到2M之间;
9.可加入非离子型去垢剂,如Triton,Tween,NP40等,最高2%,可以减少背景蛋白污染和去除
核酸污染
注:
1.包含尿素的样品可直接进行SDS-PAGE分析,若样品中包含盐酸胍,在SDS-PAGE前则需先用含
有尿素的buffer进行透析
2.除利用咪唑洗脱蛋白,其它方法,如低pH值法等可被应用,详见说明书
Binding buffer 中咪唑的浓度
在洗涤时所用的Binding buffer 中咪唑浓度越大,重组蛋白纯度越高。但过高的咪唑浓度将导致蛋白的洗脱。合适的咪唑浓度需要优化。
Buffer 的准备
所用的水及化学物质须是高纯度的。Buffer 在使用前需经0.45μm滤膜过滤。所用高纯度的咪唑需在280nm 处无吸光度或吸光度极低。
推荐buffer (使用前用0.45 μm filter过滤)
Binding buffer:20 mM 磷酸盐
0.5 M NaCl
20- 40 mM 咪唑pH 7.4 (咪唑浓度是蛋白依赖的,可变!)Elution buffer :20 mM 磷酸盐
0.5 M NaCl
500 mM 咪唑pH 7.4 (咪唑浓度是蛋白依赖的,可变!)
1. 样品准备
样品需被充分溶解。过柱前经0.45 μm滤膜过滤。样品以pH 7.4 binding buffer 溶解。勿用强酸强碱调节pH 值,否则将可能导致沉淀。
2. 重力纯化法Ni-NTA Column 准备
1. 温和地颠倒瓶中的Ni-NTA Agarose 数次。
2. 吸取2ml的树脂加入15ml离心管中,使树脂在重力(5–10 minutes)或低速离心(5 minute at 500 ×
g),轻柔的吸出上清。
3. 加入5ml的无菌蒸馏水,温和的颠倒柱子3min,离心5 minute at 500 × g,轻柔的吸出上清。
4. 用bingding buffer 重复第3步。
5. 在Ni 柱中加入等体积的bingding buffer,制成50%的slurry
Ni柱子的beads浸泡在20% ethanol中,倾除20% ethanol溶液,用蒸馏水将beats调成75%(v/v)的浓浆状的凝胶。.沿玻璃棒一次倒入柱子中,静置。
3. 样品与Ni 柱结合
1.每1ml 50%的slurry中加入4ml 的样品。1ml 50%的slurry 可结合20mg His-蛋白
2.将混合物室温,低速振荡孵育1h
4. Buffer 洗涤及洗脱
1.离心5 minute at 500 × g,轻柔的吸出上清。上清保存放在4℃for SDS-PAGE analysis。
2.用1 ml Binding Buffer洗涤柱子,在摇床上温和的振荡2min,然后低速离心5 minute at 500 ×
g,小心吸出上清,重复该步一次。上清保存放在4°C for SDS-PAGE analysis。
3.用0.5 ml Elution buffer洗脱柱子,方法同4。重复该步三次。分管收集4次洗脱液,存放在4°C
for SDS-PAGE analysis。
纯化柱的再生:
如果纯化同一种蛋白,Ni-NTA resin不需要再生,可以重复使用5-7次。
1.用5倍柱体积的含50 mM EDTA,20 mM 磷酸盐,0.5 M NaCl pH 7.4的buffer
洗涤柱子,洗去螯合的镍离子。
2.用5倍柱体积的binding buffer洗涤柱子
3.用5倍柱体积的无菌去离子水洗涤柱子
4.用0.5倍柱体积的含0.1 M 的NiSO4的无菌水溶液装填
5.用5倍柱体积的无菌去离子水洗涤柱子
6.用5倍柱体积的bingding buffer洗涤柱子
7.加入20%的乙醇4-30℃长期保存。
lysis buffer中加咪唑的目的是与杂蛋白竞争,使那些与填料亲和力弱的杂蛋白不能挂柱;
wash buffer中加咪唑是为了洗去大部分已挂柱的杂蛋白(也会洗去少量目的蛋白);
elution buffer中加梯度咪唑,而且咪唑浓度渐高,是咪唑和目的蛋白竞争性结合填料,从而把目的蛋白从柱上洗脱。
层析柱再生
1. 除镍
①10倍柱床体积的stripping buffer洗柱,1ml/min ②10倍柱床体积的binding buffer洗柱,1ml/min (可省)
③10倍柱床体积的ddH2O洗柱,1ml/min
2. 除去柱上残余蛋白
①1M NaOH充满柱并保持2h ②10倍柱床体积的binding buffer洗柱,1ml/min (可省)
③10倍柱床体积的ddH2O洗柱,1ml/min
3. 挂镍
①0.5倍柱床体积的0.1NiSO4洗柱,1ml/min ②5倍柱床体积的ddH2O洗柱,1ml/min
③5倍柱床体积的binding buffer洗柱,1ml/min
4. 20%乙醇过柱,4℃保存
注:stripping buffer:2 mM Na3PO4
0.5 M NaCl
50 mM Na2EDTA pH 7.4
蛋白纯化
Elution buffer 洗柱
①10倍柱床体积的binding buffer平衡②样品过滤,上样(关阀门,15min)
③10倍柱床体积的binding buffer洗柱④Elution buffer 洗脱蛋白(一般蛋白位于前5ml)⑤超滤管10000rpm,浓缩离心10min
注:500ml
Binding buffer:20 mM Na3PO4 20×10-3×0.5×380.16=3.8g
0.5 M NaCl 0.5×0.5×58.5=14.625g
5mM 咪唑5×10-3×0.5×68.09=0.17g
pH 7.4 (咪唑浓度是蛋白依赖的,可变!)
500ml
Elution buffer :20 mM Na3PO4 20×10-3×0.5×380.16=3.8g
0.5 M NaCl 0.5×0.5×58.5=14.625g
500 mM 咪唑0.5×0.5×68.09=17g
pH 7.4 (咪唑浓度是蛋白依赖的,可变!)