比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群落研究中的应用

比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群

落研究中的应用

成斌;许伟;胡从从;贺学礼;赵丽莉

【期刊名称】《菌物学报》

【年(卷),期】2018(037)009

【摘要】采集内蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根围土样,采用形态学方法、聚丙酰胺凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术和二代测序(next generation sequencing,NGS)技术分析羊柴根围AM真菌群落组成和多样性.结果表明,应用NGS共鉴定AM 真菌3纲4目10科18属,DGGE鉴定2纲2目2科5属,形态学鉴定1纲2目2科3属.AM真菌分类等级越低,NGS、DGGE和形态学鉴定结果差异越大,尤其在属水平上差异显著.与NGS技术相比,形态学和DGGE方法所反映AM真菌种类主要为优势菌种,显著低估了AM真菌物种组成并高估其丰度,分子测序是对形态学分类的补充和完善.

【总页数】9页(1170-1178)

【关键词】AM真菌;形态学方法;二代测序;群落结构和多样性;荒漠生境

【作者】成斌;许伟;胡从从;贺学礼;赵丽莉

【作者单位】河北大学生命科学学院河北保定071002;兰州大学生命科学学院甘肃兰州730000;河北大学生命科学学院河北保定071002;河北大学生命科学学院河北保定071002;河北大学生命科学学院河北保定071002;河北大学生命科学学院河北保定071002

【正文语种】中文