武汉大学分子模拟实验作业分子轨道能级图

CO分子轨道能级图：

非线性拟合：

武大数字测图作业答案

1、解释下列名词：总地球椭球、参考地球椭球、垂线偏差、大地水准面差距。 答：总地球椭圆：与全球范围内的大地水准面最佳拟合。 参考椭圆：于某个区域的大地水准面最佳拟合。 垂线偏差：地面一点对大地水准面的垂线和对地球椭球面的法线夹角。 大地水准面差距：地球椭圆与大地水准面的距离。 2、地面测量要素有哪些？测量工作应遵循的原则是什么？ 答：三要素：角度、距离、高差。 三原则：从整体到局部；先控制后碎部；复测复算，步步检核。 3、什么叫测量坐标系？坐标方位角是如何定义的？它与数学坐标系中的方位角有何不同？答：为了确定地面点的空间位置而建立的参考系叫做测量坐标系。 由直线一段的坐标方位角起，顺时针方向至该直线的水平角度成为该直线的坐标方位角。 它与数学上所说的方位角的不同点在于，后者是以水平面上横轴起，逆时针转过的角度。 4、试写出坐标正反算公式。 答：由于在同一高斯平面直角坐标系内各点处坐标北方向均是平行的，所以一条直线的正反坐标方位角相差180°，即α12=α21±180° 5、何谓大地水准面？它在测量工作中有何作用？ 答：与平静的平均海水面相重合，并延伸通过陆地而形成的封闭曲面称为大地水准面。 它是测量外业所依据的基准面。 6、测量工作中常用哪几种坐标系？它们是如何定义的？ 答：①大地坐标系：地面上的一点的空间位置可用大地坐标(B,L,H)表示。大地坐标系是以参考椭球面作为基准面，以起始子午面和赤道面作为在椭球面上确定某一点投影位置的两个参考面。L表示大地经度，B表示纬度，H表示大地高。 ②空间直角坐标系：以椭球体中心O为原点，起始子午面与赤道面交线为X轴，赤道面上与X轴正交的方向为Y轴，椭球体的旋转轴为Z轴，构成右手直角坐标系0-XYZ，在该坐标系中，P点的点位置用OP在这三个坐标轴上的投影X、Y、Z表示。 ③平面直角坐标系：以纵轴为X轴，表示南北方向，向北为正；横轴为Y轴，表示东西方向，向东为正；象限顺序依顺时针方向排列。 7、测量工作中采用的平面直角坐标系与数学中的平面直角坐标系有何不同之处？画图说明。答：测绘工作中以极坐标表示点位置时其角度值是以北方向为准按顺时针方向计算，而数学中则从横轴起按逆时针方向计算。如图所示。

武汉大学分子生物学真题2001-2014

一.解释概念(20分,每个4分) 卫星DNA 复制体逆转座子反式激活因子衰减子与衰减作用 三、问答题(50分) 1. 说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。(15分) 2. 简述增强子的特点和性质及作用机制。(10分) 3. 简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始(15分) 4. DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶,它是在大肠杆菌 (E.coli)R株中发现的,它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一,它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DN**段克隆到pUC质粒中,并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增,已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶,你设计如何做才能确保成功?为什么?(10分) 武汉大学2002分子生物学 三.问答: 1.简述(或绘图说明)真核细胞RNA聚合酶II转录的起始需要哪些基本转录因子及其装配过程(15分) 2.简述(或绘图说明)色氨酸操纵子弱化的机制(15分) 3.在讨论基因家庭时经常提到胚胎、胎儿和成体形成的蛋白质,这些述语是指什么现象?可用什么术语来描述这一类基因家族(5分) 4. 你正在进行Southern blot分析,并刚刚完成凝胶电泳部分,下一步是将胶浸泡在NaOH溶液中使DNA变性为单链,为了节约时间,你跳过这一步,直接把DNA 从胶上转到硝酸纤维素膜上,你将标记好的探针与膜杂交,却发现放射自显影结果是一片空白,哪里错了呢?(5分)

一、下列名词翻译成中文，并简要解释 1、Domains and motifs 2、Alternative splicing 3、Reporter genes 4、The PCR cycle 5、Restriction mapping 6、Multiple cloning sites 7、DNA libraries 8、Proteomics 9、Replicon 10、Semi-conservative replication 二、简答题(共5题,每题8分,共40分) 1、请列举三种以上蛋白质纯化技术,并说明不同纯化技术的简单原理。 2、简述DNA损伤与DNA突变之间的区别与相互关系。 3、简述密码的简并性(degeneracy)和同义密码子(synonymous codon)及其在生物学上的重要性。 4、简述原核生物转录起始与转录终止过程中所涉及的主要蛋白质和核酸结构及其具体作用。 5、简述cDNA文库的构建过程。 三、论述题(共5题,1-4题每题15分,第5题10分,共70分) 1、人类基因组计划完成的社会意义和科学意义是什么？ 2、什么是操纵子(operon)？试说明色氨酸操纵子(Trp operon)在原核基因表达调控中的调控机制和重要作用。 3、请简要解释顺式作用元件与反式作用因子,并举二例加以说明它们的相互作用方式。 4、试说明真核细胞与原核细胞在基因转录、翻译及DNA的空间结构方面存在的主要差异,表现在哪些方面？ 5、限制性核酸内切酶有哪几种类型？哪一种类型的限制酶最适合于基因工程,为什么？请简要说明其理由。

2001到2011年武汉大学分子生物学和细胞生物学真题大全

武汉大学 2001年攻读硕士学位研究生入学考试试题 科目名称:分子生物学 科目代码: 477 一、解释概念(20分,每个4分) 卫星DNA 复制体逆转座子反式激活因子衰减子与衰减作用 二、填空(30分,每空1分,请将答案写在答卷上) 1. 从病毒到高等生物的研究表明,遗传物质是。 2. 冈崎片段的发现证实了双链DNA的复制,在复制过程中,一条新生链的合成 是的,称为链;而另一条链的合成是的,称为链。 3. 大肠菌中有三种DNA聚合酶,其中的pol I的作用是,而pol III的作用是。pol I和pol III都有的三种活性是、、。 4. 由于真核细胞染色体DNA的复制要有一段RNA为引物,因此线状的DNA复制后必须存在着5’端缩短的问题。已发现有一种端粒蛋白称为,它由构成,可以使单链DNA的5’延长。 5. 对DNA损伤有几种修复系统,其中只有修复系统可以造成DNA变异,与这一系统有关的一套基因平时受到一称为的抑制蛋白所抑制,它发挥抑制作用是结合在一段约20bp 长的称为的DNA序列上,当DNA损伤时,另一种蛋白质称为把这种抑制蛋白水解后,修复系统的基因才会被激活。 6. 真核细胞中有三种依赖于DNA的RNA聚合酶分别合成不同的RNA,RNA pol I负责合成,RNA pol II负责合成,RNA pol III负责合成。 7. 大分子互相作用是分子生物学的重要内容,包括蛋白质之间、蛋白质与DNA或RNA之间的互相作用,蛋白质有四种重要的结构花式与大分子互相作用有关,这些结构花式是, , 。 8. NO是气体小分子信号,它可由脱氨产生,它的作用方式是直接与酶作用使产生cGMP(环式GMP)。 9. 真核mRNA的5’端通常有帽子结构,3’端有polyA。在polyA上游有一保守序列称为polyA信号,其序列为。polyA能提高mRNA的翻译水平是由于: (1) (2) 。 10. G-蛋白关联受体是一类重要的细胞表面受体,它的结构特色是,它发挥信号传递作用的两条途径是途径和途径。 三、问答题(50分) 1. 说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。(15分) 2. 简述增强子的特点和性质及作用机制。(10分) 3. 简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始(15分) 4. DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶,它是在大肠杆菌(E.coli)R株中发现的,它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一,它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DN**段克隆到pUC质粒中,并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增,已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶,你设计如何做才能确保成功?为什么?(10分) 武汉大学

分子光谱模拟

0.012 0.010 0.008 0.006 0.004 0.002 0.000 k (L o r e n t z ) 分子光谱模拟 姓名： 学号： 专业： 日期：151207&151214 一.实验内容 1.红外光谱模拟 1.1 用PM3理论方法计算H2O 分子红外光谱 图1-1 GAMESS 程序中PM3方法预测的H2O 分子的红外光谱 用0.974来标定计算的频率，然后做出红外光谱图

得到的振动频率分别为1698 cm-1、3770 cm-1、3880 cm-1 与标准值1594cm-1，3657cm-1，3756cm-1比较三个频率都偏大。说明半经验方法计算的红外光谱可靠性不高，若采用高水平计算方法，理论计算一实验值会符合很好，但同时会提高对计算机资源的要求。 2.拉曼光谱光谱模拟 2.1用HF/6-31G(d)计算的CH4分子的拉曼谱图 图2-1 HF/6-31G(d)计算的CH4分子的拉曼谱图 3.紫外可见光谱的模拟 3.1计算甲酸分子5个垂直激发的单重态和三重态，2个绝热激发的单重态和三重态，并确定垂直激发和绝热激发波长。 3.1.1 甲酸分子5个单重态垂直激发能(HF/6-31G(d)) ①利用GAMESS程序HF/6-31G（d）理论水平优化基态 Total Energy =-118450.0392 Kcal/Mol ②手动修改输入方式，其中NSTATE=5 甲酸分子（HCOOH）分子的5个单重态的垂直激发能

λ=1/△E(cm)=10^7/△E(nm) 经过换算，5个单重态的垂直激发波长分别为179nm、120nm、111nm、109nm、100nm均位于紫外区内。 3.1.2 甲酸分子5个三重态垂直激发能(HF/6-31G(d)) ①利用GAMESS程序HF/6-31G（d）理论水平优化基态 Total Energy =-118450.039 Kcal/Mol ②手动修改输入方式，其中NSTATE=5 MULT=3 甲酸分子（HCOOH）分子的5个单重态的垂直激发能 经过换算，5个三重态的垂直激发波长分别为198nm、195nm、122nm、116nm、109nm均位于紫外区内。 HF/6-31G(d)实验下HCOOH分子垂直激发波长表（单位：nm） 3.1.3甲酸分子2个单/三重态绝热激发能(HF/6-31G(d))

武汉大学《分子生物学》复习题库及答案

考试复习重点资料（最新版） 资料见第二页 封 面 第1页

分子生物复习题及答案 一、填空题 1．病毒ΦX174及M13的遗传物质都是单链DNA。 2．AIDS病毒的遗传物质是单链RNA。 3．X射线分析证明一个完整的DNA螺旋延伸长度为3.4nm。 4．氢键负责维持A-T间（或G-C间）的亲和力 5．天然存在的DNA分子形式为右手B型螺旋。 二、选择题（单选或多选） 1．证明DNA是遗传物质的两个关键性实验是：肺炎球菌在老鼠体内的毒性和T2噬菌体感染大肠杆菌。这两个实验中主要的论点证据是（C）。 A．从被感染的生物体内重新分离得到DNA作为疾病的致病剂 B．DNA突变导致毒性丧失 C．生物体吸收的外源DNA（而并非蛋白质）改变了其遗传潜能 D．DNA是不能在生物体间转移的，因此它一定是一种非常保守的分子E．真核心生物、原核生物、病毒的DNA能相互混合并彼此替代 2．1953年Watson和Crick提出（A）。

A．多核苷酸DNA链通过氢键连接成一个双螺旋 B．DNA的复制是半保留的，常常形成亲本-子代双螺旋杂合链 C．三个连续的核苷酸代表一个遗传密码 D．遗传物质通常是DNA而非RNA E．分离到回复突变体证明这一突变并非是一个缺失突变 3．DNA双螺旋的解链或变性打断了互补碱基间的氢键，并因此改变了它们的光吸收特性。以下哪些是对DNA的解链温度的正确描述？（C、D）A．哺乳动物DNA约为45℃，因此发烧时体温高于42℃是十分危险的B．依赖于A-T含量，因为A-T含量越高则双链分开所需要的能量越少 C．是双链DNA中两条单链分开过程中温度变化范围的中间值 D．可通过碱基在260nm的特征吸收峰的改变来确定 E．就是单链发生断裂（磷酸二酯键断裂）时的温度 4．DNA的变性（A、C、E）。 A．包括双螺旋的解链B．可以由低温产生 C．是可逆的D．是磷酸二酯键的断裂 E．包括氢键的断裂

武汉大学测绘学院数字测图实习报告

课程编号：20151024117 课程性质：必修 数字测图实习 数字测图实习报告 学院：测绘学院 专业：测绘工程 地点：咸安实习基地 班级： 2014级03班 组号： 03组 姓名：张岩 学号： 2014301610386 教师：贾剑钢 徐进军 2015年11月08日至 2015年11月27日

目录 一、实习目的及意义 (3) 二、实习内容及技术要求 (3) 三、数字地形图测绘基本原理 (6) 四、数字地图测绘过程 (6) 五、参考资料 (12) 六、附录 (13) （1）全站仪的检验报告 （2）实习技术设计报告 （3）实习原始数据 （4）实习心得（手写版）

2015-11-8至2015-11-27我们测绘工程专业学生在湖北科技学院进行了为期两个星期的数字化测图实习。 一、实习目的及意义 通过这次实习，使我们熟练地掌握了由控制到碎步再到内业成图的全部流程，逐渐领悟到了日后测绘学习以及实践中的基本理论与窍门，可以说是一次 贴近实战的大练兵，在风风雨雨的半个月里，逐步具备了测绘工作者的技能， 展现了武测学子的昂扬向上精神风貌。 实习让我们对《数字测图》这门课程有一个系统的了解和掌握，进一步加 深我们对数字化测图的基本理论和基本知识的理解，提高我们实际操作的能力。本次实习培养了我们理论联系实际，分析问题以及实地解决问题的能力，更要 求我们在工作中要实事求是，严谨认真，吃苦耐劳，同时还要团结协作，相互 配合，共同完成好小组的实习任务。从各方面锻炼自己，为以后的测量工作打 下良好的基础。 二、实习内容及技术要求 1.实习的具体内容如下： 1、数字地图测绘 （1）练习和掌握全站仪的使用方法； （2）每组测绘一幅1：500的数字地图； （3）熟悉和掌握南方CASS地形测图软件编辑地形图的基本方法； （4）完成各自小组的控制网布设； 2、实习的具体要求如下 (1)掌握数字化测图的基本过程和基本方法。 (2)掌握并熟练全站仪的使用。 (3)掌握使用数字成图软件（南方CASS）进行数字地图编绘的方法。 2.根据实习指导书及老师的要求，有以下相关技术要求数据：

武汉大学分子生物学试卷

2002年 三、问答： 1、简述（或绘图说明）真核细胞RNA聚合酶II转录的起始需要哪些基本转录因子及其装配过程（15分） 2、简述（或绘图说明）色氨酸操纵子弱化的机制（15分） 3、在讨论基因家庭时经常提到胚胎、胎儿和成体形成的蛋白质，这些述语是指什么现象？可用什么术语来描述这一类基因家族（5分） 4、你正在进行Southern blot分析，并刚刚完成凝胶电泳部分，下一步是将胶浸泡在NaOH溶液中使DNA变性为单链，为了节约时间，你跳过这一步，直接把DNA从胶上转到硝酸纤维素膜上，你将标记好的探针与膜杂交，却发现放射自显影结果是一片空白，哪里错了呢？（5分） 2001年 三、问答题（50分） 1．说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。（15分） 2．简述增强子的特点和性质及作用机制。（10分） 3．简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始（15分） 4． DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶，它是在大肠杆菌（E.coli）R株中发现的，它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一，它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DNA片段克隆到pUC质粒中，并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增，已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶，你设计如何做才能确保成功？为什么？（10分）

2003年分子生物学 一。下列名词翻译成中文，并简要解释4*10 1.Domains and motifs 2. Alternative splicing 3.Reporter genes 4. The PCR cycle 5.Restriction mapping 6.Multiple cloning sites 7.DNA libraries 8.Proteomics 9.Replicon 10. semi-conservative replication 二。简答题8*5 总计40分 1. 请列举三种以上的蛋白质纯化技术，并说明不同技术的简单原理。 2. 说说DNA损伤与DNA突变之间的区别和相互关系。 3. 简述密码的简并性（degeneracy）和同义密码子（synonymous codon）及其在生物上的重要性。 4. 简述原核生物转录起始与转录终止过程中涉及到的主要蛋白质和核酸结构及其具体作用。 5. 简述cDNA文库的构建过程。 三。问答题（1-4每题15，5题10，总计70） 1. 人类基因组计划完成的社会意义和科学意义是什么？ 2. 什么是操纵子（operon）?试说明色氨酸操纵子（Trp operon）在原核基因表达调控中的调控机制和重要作用。 3. 简要解释顺式作用元件与反式作用因子，并举二例说明他们的相互作用方式。 4. 试说明真核细胞与原核细胞在基因转录，翻译及DNA的空间结构方面存在的主要差异，表现在哪些方面？ 5. 限制性核酸内切酶有哪几种类型？哪一种类型的限制酶最适合于基因工程，为什么？请简要说明理由。 2004年武汉大学硕士研究生入学考试分子生物学试卷 一名词翻译与解释 1synonymous codons 2RNA editing 3Spliceosome 4Microarray 5Plaque hybridization 6Open reading frame 7Ribozyme 8RFLP

武汉大学考研分子生物学名词

分子生物学名词解释 1、gel electrophoresis(凝胶电泳) 2、restriction endonuclease(限制性内切酶) 3、hybridization(杂交) 4、probe（探针） 5、Autoradiogram（放射自显影） 6、DNA cloning 7、DNA ligase（DNA连接酶） 10、transformants（转化子） 11、copy DNA（cDNA） 12、DNA library 13、colony hybridization（菌落杂交） 14、oligonucleotide（寡聚核苷酸） 15、site-directed mutagenesis（定位突变） 16、shotgun sequencing（鸟枪法测序） 17、contig（叠连群） 18、annotation（注释） 19、transcriptome（转录组） 20、BLAST（基本局部比对搜索工具） （11.7.2015） 21、tandem mass spectrometry（MS-串联质谱） 22、interactome（互作组） 23、DNA foot printing（DNA足迹） 24、insulator（绝缘子） 25、homeodomain（同源结构域） 26、mediator（中介蛋白） 27、bromodomain（同源调节域） 28、chromodomain（染色质结构域） 29、locus control region-LCR（位点控制区域） 30、heterochromatin（异染色质） （11.10.2015） 31、euchromatin（常染色质） 32、epigenetic regulation（表观遗传调控） 33、constitutive expression（组成型表达） 34、operator（操作子） 35、operon（操纵子） 36、CTD（c端结构域） 37、lysogenically（溶源生长） 38、lytically（裂解） 39、prophage（原噬菌体） 40、antitermination（抗终止作用） 41、retroregulation（逆向调控）

分子模拟实验实验报告设计实验二氯卡宾

分子模拟实验作业——设计实验 -----------二氯卡宾与甲醛环加成反应的理论研究 一、实验背景 在大二的有机实验中，我接触到了连续合成实验，其中有一类反应为相转移催化合成·卡宾及其反应。卡宾（Carbene）亦称为碳烯，是一类具有六个加点字的两价碳原子活性中间体，构造式为：CH2。其中的氢原子可以被其他原子或基团所取代，这类取代物称为卡宾体或取代卡宾。卡宾是缺电子的，具有很强的亲电性，可发生多种反应。在有机合成中常使之与烯烃反应以制取环丙烷衍生物，上网查阅资料后，我想到了可以结合本学期所学的分子模拟理论计算方法来模拟二氯卡宾与甲醛环加成反应。（题目来源于有机化学实验和查阅到的文献）二氯卡宾是一种取代卡宾，通常由氯仿与强碱作用产生： CHCl3 + Base ：CH2 + HB + Cl- 为了进一步探讨卤代卡宾与含有不对称π键物质环加成反应的机理,本文对单重态二氯卡宾与甲醛加成生成二氯环氧丙烷反应： 进行了量子化学从头算的研究,得到了该反应的反应机理,并对其反应机理作了理论分析说明.同时计算了该反应在不同温度下的热力学函数和动力学性质,并作了讨论。 二、实验内容 ①用分子轨道理论分析二氯卡宾与甲醛环加成的机理 用Chem3D软件做出二氯卡宾与甲醛的分子轨道能级图，计算分子轨道，并图示二氯卡宾和甲醛的HOMO和LUMO轨道的形状和能量。将所有分子轨道按能级排列次序，并以此分析两反应物的轨道匹配情况。（优化条件：Gamess Interface，HF/6-31G(d)）

对于该环加成反应的机理可借助于分子轨道图进行分析。根据轨道对称匹配条件，在反应过程中，应首先是C1的2p 空轨道插入甲醛的成键π轨道，但因甲醛中的羰基是一极性基团，π键电子云密集于氧端，故C1的2p 空轨道将从氧端插入其π轨道.因π电子向C1的2p 空轨道中的迁移，从而使二者首先生成了一半环状的中间配合物。由于二氯卡宾的?孤对电子与甲醛C 端的反键π轨道之间有着较强的成键作用，故随着反应的进行，二氯卡宾将在C1C20平面内按逆时针方向发生旋转.同时H1-C2和H2-C2键也由在中间配合物中与C1C20的共

2015年武汉大学885分子生物学考研真题(B卷)及详解【圣才出品】

2015年武汉大学885分子生物学考研真题（B卷）及详解 一、专业术语翻译与解释（共10小题，每小题4分，共40分） 1．Exon 答：Exon中文名称是外显子，是指断裂基因的一部分，包含在一个基因的转录物中，并在核内RNA剪接过程中保存下来成为细胞质中信使RNA的一部分。外显子在编码蛋白基因中处于三个明显的区域：第一部位，不翻译成蛋白质部分，是RNA转录物起始部分的信号并含有引导mRNA到核糖体进行蛋白质合成的顺序；第二部位是含有翻译成蛋白质氨基酸顺序的信息部分；第三部位是转录为mRNA的一部分含有翻译终止和加多腺苷酸尾的信号。 2．Promoter 答：Promoter中文名称是启动子，是指基因中控制基因表达（转录）的起始时间和表达的程度的一个组成部分。启动子本身并不控制基因活动，而是通过与转录因子结合而控制基因活动的。启动子就像"开关"，决定基因的活动。 3．Proteomics 答：Proteomics中文名称是蛋白质组学，是指一种基因组所表达的全套蛋白质，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

4．Frame-shift mutation 答：Frame-shift mutation中文名称是移码突变，是指由于插入或缺失非3的倍数个的核苷酸导致阅读框发生移动，随着转译成不正常的氨基酸的一种突变。这种突变通常会导致多肽链上一系列的氨基酸发生变化，严重影响后续蛋白质或酶的结构和功能。 5．Wobble hypothesis 答：Wobble hypothesis中文名称是摆动假说，是解释遗传密码简并性的假说，克里克于1966年提出。具体内容是：对氨基酸专一的密码子的头两个碱基与相应转移RNA上反密码子的第2个和第3个碱基互补配对，而密码子的第3个碱基（3＇端）与反密码子5'端碱基的配对专一性相对较差。在反密码子的5＇位置上常发现次黄嘌呤（Ⅰ）或与之相似，仅能形成2个氢键的嘧啶。 6．Single-strand binding protein 答：Single-strand binding protein中文名称是单链结合蛋白，又称DNA结合蛋白，是指结合于螺旋酶沿复制叉方向向前推进产生的单链区，防止新形成的单链DNA重新配对形成双链DNA或被核酸酶降解的蛋白质，是DNA复制所必须酶。DNA解旋后，DNA分子只要碱基配对，就有结合成双链的趋向。 7．Tandem affinity purification 答：Tandem affinity purification中文名称是串联亲和纯化，是指一种可以经过两步特异性亲和纯化可快速得到生理条件下与靶蛋白质存在真实相互作用的蛋白质来研究体内蛋白质相互作用的新技术。

武汉大学生命科学学院分子生物学考研试卷

2001年攻读硕士学位研究生入学考试试题 一、解释概念（20分，每个4分） 卫星DNA 复制体 逆转座子 反式激活因子 衰减子与衰减作用 二、填空（30分，每空1分，请将答案写在答卷上） 1. 从病毒到高等生物的研究表明，遗传物质是。 2. 冈崎片段的发现证实了双链DNA的复制，在复制过程中，一条新生链的合成是的，称为链；而另一条链的合成是的，称为链。 3. 大肠菌中有三种DNA聚合酶，其中的pol I的作用是，而pol III的作用是。pol I和pol III都有的三种活性是。 4. 由于真核细胞染色体DNA的复制要有一段RNA为引物，因此线状的DNA复制后必须存在着5’端缩短的问题。已发现有一种端粒蛋白称为，它由构成，可以使单链DNA的5’延长。 5. 对DNA损伤有几种修复系统，其中只有修复系统可以造成DNA变异，与这一系统有关的一套基因平时受到一称为的抑制蛋白所抑制，它发挥抑制作用是结合在一段约20bp长的称为的DNA序列上，当DNA损伤时，另一种蛋白质称为把这种抑制蛋白水解后，修复系统的基因才会被激活。 6. 真核细胞中有三种依赖于DNA的RNA聚合酶分别合成不同的RNA，RNA pol I负责合成，RNA pol II负责合成,RNA pol III负责合成。 7. 大分子互相作用是分子生物学的重要内容，包括蛋白质之间、蛋白质与DNA或RNA之间的互相作用，蛋白质有四种重要的结构花式与大分子互相作用有关，这些结构花式是，，，。 8. NO是气体小分子信号，它可由脱氨产生，它的作用方式是直接与酶作用使产生cGMP（环式GMP）。 9. 真核mRNA的5’端通常有帽子结构，3’端有polyA。在polyA上游有一保守序列称为polyA信号，其序列为。polyA能提高mRNA的翻译水平是由于： （1）（2）。 10. G-蛋白关联受体是一类重要的细胞表面受体，它的结构特色是，它发挥信号传递作用的两条途径是途径和途径。 三、问答题（50分） 1．说出双链DNA复制起始有关的五种重要的酶或蛋白并简述它们的功能。（15分） 2．简述增强子的特点和性质及作用机制。（10分） 3．简述真核RNA聚合酶II的转录起始复合物装配过程和转录起始（15分） 4．DNA限制性内切酶EcoRI是人们熟悉的常用内切酶，它是在大肠杆菌（E.coli）R株中发现的，它被广泛用于分子克隆操作和DNA分析。pUC质粒是常用克隆载体之一，它的多克隆位点上有EcoRI、BamHI、KpnI、HindIII等酶切点。假如要你把一段由EcoRI切割产生的外源DNA片段克隆到pUC质粒中，并把重组质粒转化大肠杆菌R株来扩增，已知条件是所用的R菌株中只有EcoRI一种限制性内切酶，你设计如何做才能确保成功？为什么？（10分）

分子模拟实验实验报告二

分析模拟实验实验报告（二） 武汉大学化学与分子科学学院 一、实验结果

2.问题7-1-2 画“三键链”的结果是什么？ 答: “三键链”画不出来 3.问题7-1-3 画出多个联苯环的共轭结构 答：画不出“多联苯环的共轭结构” 5.问题7-3-1 计算H2O的二聚体的结构

6.问题7-4-1 7.问题7-4-2 简介：IUPAC名称为 benzylidene[1,3-bis(2,4,6-trimethylphenyl)-2-imidazolidinylidene]dichloro(tricy clohexylphosphine)ruthenium——苯亚甲基·[1,3-双(三甲基苯基)-2-咪唑啉亚基]·二氯·(三环己基膦)合钌。它具有比原催化剂更高的活性和选择性以及相似的稳定性，但对空气和水敏感，因此需要在氮气或氩气惰性气氛中使用。其催化活性比第一代催化剂提高了两个数量级，在开环复分解聚合反应中的用量可以降低到百万分之一，在某些关环复分解反应中的用量也仅为万分之五。特别适用于低张力的环状烯烃及位阻较大的多取代烯烃的合成。

原因：1.表现中心金属原子钌（Ru）与各配体之间在空间结构上的关系，包括两个卡宾基团和一个膦配体以及两个氯原子。 2.凸显催化剂中的杂原子 二、实验收获 相较于第一次这两次对于Chem3D使用才真正感觉到Chem3D的实用与方便。 学习到了三种不同的分子结构模型创建方法，经过自己的实践操作深刻体会到各个方法之间的差别，基本可以在应用时做到根据需求与情况选择合适的建模方法。 了解了4种分子结构最优化计算方法Hartree-Fock、MP2、B3LYP和PM3，并分别使用这四种计算方法计算H2O的二聚体的结构。体会不同的理论方法的计算结果的差异。进行计算时应该遵从从简单到复杂的原则，对于不同的分子与反应选择合适的计算方法，既保证计算结果的准确性又要能够提高计算速度。

我的考研心得(武大四大化学)

考研心得 本人是2015年考上武汉大学化学与分子科学学院高分子化学与物理专业研究生的一名学生，之前在考研论坛留下过自己的QQ，所以有很多学弟学妹找到我，有时候我也比较忙，没有时间及时的一一回复。现在我每天抽一点时间来总结一下我的考研复习心得，以帮助大家更好的了解相关的情况吧。在此，也特别申明一下，本文为我个人的真实心得体会，都是慢慢回顾自己的复习过程然后一个字一个字的打出来的，文中的某些观点、建议可能并不一定正确，每个人的学习方法还是有区别的，希望大家仅供参考吧！有说的不好的地方也欢迎大家指正！ 首先，我想说说关于为什么考研：就本人的观点认为，目前国内的教育模式导致大部分年轻人不知道自己的兴趣所向，根本不知道自己喜欢做什么，也没有好好想过以后出来做什么事。身边有很多人都考研，所以自己也跟着考。我觉得如果你是出于这样的想法去考研的话还是建议你三思！研究生不像本科那样，像我们理科生基本上是要天天待在实验室里面，而且工作了的话基本上也与这一行有关，如果不喜欢这一行的话趁早改变主意！想好以后要做什么再决定是不是真的选择考研。 目标院校和专业的选择：很多人在选择学习型和专业是很纠结，又想考好学校，又想好专业，还有就是只想混个研究生文凭而已。我的观点是，好专业比好学校更有用。毕竟以后自己很可能就是搞这一行了，所以好好选一个专业吧。选择院校是我建议大家还是量力而行，很多人想报985或者211之类的，我觉得每个人都应该清楚自己的实力，实力有多少就选择个什么样的学校，如果报个985到时候没考上要调剂的时候就比较麻烦了，调剂很多时候都没什么好学校或者没好专业了。选择的院校和专业最好以前有学长或者学姐考上过，这样会有比较大的帮助，资料和经验都比较容易得到，会省很多事的。 合适的目标+坚持不懈的努力=成功！ 在考研的途中有1~2个靠谱的研友也是很有帮助的，人太多了我觉得反而不好。 公共课的复习我就不说了，我觉得都大同小异吧，网上也有很多。下面我详细讲一下我复习的武大的四大化学。 都知道武大的化学学院基本上都是考四大化学（分析、物化、无机、有机），一听到这个有不少人都会被吓住，觉得会很难。是的，我当时也不敢考，分析我还没学过。所以我当时最开始选择那个考数学和普通化学的那个材料物理与化学专业。从14年3月份开始复习数学，到了5月底6月初了，我问了一下我们专业的老师，他建议我还是考四大化学。他让我报高分子化学与物理这个专业，因为这个专业与我们学的也比较接近，再就是这个专业可以选考高分子化学和物理而避开有机！很多人都说武大的有机很难，确实是这样的！当时我非常的纠结！！！那时候数学的线代都看完了，快要去买全书了，我回去想了两天，然后不知道怎么突然也就决定了，就换了吧，考四大化学！因为我没学过分析化学，所以开始看分析上册，估计看了10天左右吧，看到了第五章左右，那时候6月中旬了，我们还有好几门期末考试，考完还有学年论文。。。所以6月份也没看什么书了。 7月份了，我的复习才真正开始！ 7月份我每天上午搞英语，下午和晚上搞分析化学。前20天只看分析上册，我没学过分析化学，所以我那时候先把上册看了两遍。后10天开始，每天下午看无机化学上册，每天一章，晚上是看分析下册。下册是仪器分析，如果没有终点话会一点头绪都没有而浪费掉很多时间！我那时候基本上都是抓重点看！分析上册的重点就是3/5/6/7/8/9/10，其他章节基本上可以不看！分析下册我没有花很多时间，因为我们上一届有学长去武大上了那个暑期内部培训班（大家暑假左右可以留意一下，14年停办了一年，不知道为什么，所以我没有去），就是划重点的，里面给了一些PPT，下册有一个总结性的PPT，基本上要考的都在上

武汉大学分子模拟实验第十章化学反应模拟

武汉大学化学与分子科学学院 《分子模拟实验》实验报告 化学反应模拟 指导老师：侯华 姓名：陆文心 专业：化学弘毅班 学号：2012301040179 日期：2014年11月13日、11月20日（周四下午） 一、实验内容 问题10-1-1仿照CH4的例子，计算甲基自由基（·CH3）的生成焓（与实验值35kcal/mol 比较）和生成自由能，可采用B3LYP/6-31G(d)理论方法。 ①优化自由基结构，获得总能量： E(CH3) = -24977.699059 kcal/mol ②在优化结构的基础上，用同一方法计算振动频率，在输出文件中找到：零点能为 18.633681 kcal/mol，焓H为21.212 kcal/mol。对焓进行零点能修正： H298K - H0K = H298K– ZPE = (21.212 - 18.633681) kcal/mol = 2.578319 kcal/mol ③从输出文件中找到熵的数据S = 50.463 cal/(mol·K)。

④用同样的理论方法分别计算C 原子和H 原子的能量： E(C) = -23734.548073 kcal/mol E(H) = -311.785384 kcal/mol ⑤计算绝对零度下甲基自由基的生成焓： ?H f,0K ?(M )=∑x?H f,0K ?(X )atoms ?(∑xE (X )atoms ?E (M )?ZPE) = {(1×169.98 + 3×51.63) - [1×(-23734.548073) + 3×(-311.785384) - (-24977.699059) -18.633681]} kcal/mol = 35.7 kcal/mol ⑥298K 时的生成焓，根据以下公式计算： ?H f,298K ?(M )=?H f,0K ?(M )+(H M 298K ?H M 0K )?∑x(H X 298K ?H X 0K )std atoms = [35.7 + 2.578319 - (1×0.25+3×1.01)] kcal/mol = 35.0 kcal/mol 与实验值（35 kcal/mol ）符合得很好。 ⑦根据下列公式计算298K 时的生成自由能： ?G f,298K ?=?H f,298K ??298.15K ×(S M ??∑xS X ?atoms ) = [35.0 - 298.15×(50.463 - 1×1.36 - 3×15.6)/1000] kcal/mol = 34.3 kcal/mol 问题10-2 优化搜索过渡态。 1. CH 3CF 3解离生成CH 2CF 2和HF 的反应 CH 3CF 3原始结构：

武汉大学《数字测图原理与应用》课程试卷

武汉大学 测绘学院 2004～2005学年度第二学期期末考试 《数字测图原理与应用》课程试卷（A ） 一、填空题（将答案填写在空内） 1. 测量工作的三项基本内容是 、 和 。 2. 地面点A 的子午线收敛角γ是指 方向与 方向之间的夹角。 3. 水准测量中,使前后视距相等,可消除______________和______________对高差的影响。 4. 测量用望远镜瞄准目标时,产生视差的原因是_______________与 ______不重合。 5. 测量外业依据的基准线是 ，测量外业依据的基准面是___________。 6. 竖直角是指在 面内 方向与 方向间的夹角。 7. 由于竖盘读数指标偏离正确位置，使视线水平时的竖盘读数大了或小了一个数值，则称该数值为 。 8. 若A 点的国家统一坐标横坐标值Y A =19678626.68ｍ，则A 点在中央子午线的__________侧，A 点所在高斯投影带的带号为 。 9. 当圆水准器气泡居中时，圆水准器的水准轴处于 状态。 10. 为了解决___________和____________的矛盾，光电测距仪采用一组测尺共同测距。 11. 若一对水准尺黑面存在零点差，则可采用 方法消除其对高差的影响。 12. 经纬仪的对中误差对水平角测量的影响是边长愈长，影响愈_________。 13. 在高斯-克吕格坐标系中，是以_______________为x 轴，以___________为y 轴，以_________________________________为原点。 14. 某测距仪的标称精度为)(D B A m D ×+±=,式中D 为被测距离，以km 为单位；称A 为 ；称B 为 。 二、选择题（将答案填写在空内） 1.任意高度静止状态的水面 水准面。 A. 都不是 B. 都是 C. 有的是 2.在面积为100km 2的范围内进行测量，必须考虑地球曲率影响的测量项目是________。

武汉大学分子生物学真题10,12,13

2010年攻读硕士研究生学位研究生入学考试题分子生物学 科目代码638 一、名解（4*10=40） 1.epigenttic change 2.peptide mass fingerprinting 3.RNA splicing 4.house keeping gene 5.frame-shift mutation 6.DNA binding domain 7.Shine-Dlagarno sequence 8.Gel retardation 9.chromatin immunoprecipitation 10.Rho-dependent transcription termination 二、简答（5*10=50） 1.什么是CPG岛？一段DNA序列中的CPG岛高度甲基化的含义是什么？ 2.说出5种RNA的名称及其功能。 3.什么是enhancer？它有哪些特点？ 4.真枋生物DNA与原核生物DNA复制有哪些差异？ 5.简述突变类型及其遗传效应。 三、论述题（3*20=60） 1.请描述乳糖操纵子的调控机制。 2某科学家发现一种新的野生植物，准备对该植物开展分子生物学研究，请设计实验制备该植物的cDNA文库。 3.2009年三名美国科学家获诺贝尔生理或医学奖，请分析他们为什么获奖，解释他们对分子生物学的贡献。并用他们的发现解释克隆的多莉羊早衰死亡的一个原因。 武汉大学2012年攻读硕士学位研究生入学考试试题分子生物学 一、专业术语翻译与解释 1. base flipping 2. RNase P 3. histon chaperones 4. Viral-like retrotransposon 5. paracodon 6. trans-splicing 7. sliding clamp 8. initial transcribing complex 二、简答题 1、简述保证tRNA和mRNA正确配对的三种机制。 2、简述DNA复制中RNA引物的去除所需要的酶及其作用。 3、简述核糖开关的结构及其作用机制。 4、简述真核生物抑制子的作用方式。 5、简述细菌RNA聚合酶的校正机制。 三、论述题 1、从分子水平和感染条件解释λ噬菌体溶原生长途径的建立过程。

分子模拟实验 溶剂化效应和红外光谱的模拟

分子模拟实验溶剂化效应和红外光谱的模拟 实验内容介绍： 本次实验主要内容是溶剂化效应和红外光谱模拟。何谓溶剂化效应，通常量子化学的研究都是在真空中、绝对零度下、气相分子的性质，实际上大多数化学物质和过程都存在于介质（如各种溶剂）中，与孤立的气相分子相比，溶剂对溶质分子的性质及其参与的化学反应，都有可能有非常重要的影响。不同的溶剂不仅可以影响溶质分子的结构、反应平衡、反应速率，甚至可以改变反应进程和机理，得到不同的产物或产率。将这些影响称之为“溶剂化效应”。对溶剂化效应的模拟有三种模型:显式溶剂化模型、隐式溶剂化模型、显式隐式结合模型。显式模型主要是在溶质分子中加入真正的溶剂分子再进行优化模拟；隐式模型是连续介质模型，溶剂对溶质分子的作用称为反应场，通过场概念运用迭代方法的计算，直至自洽，称自洽反应场方法（SCRF）,其中又包括：Onsager模型、极化连续介质模型（PCM）。实验中，我们以反应F- +CH3F = FCH3 +F-为例，进行溶剂化模型的建立以及反应优化计算。 红外光谱模拟是分子光谱模拟的重要一项。分子的红外光谱是分子振动的反映，振动频率对应于红外光谱的一个谱峰，振子强度（由于振动而引起的分子偶极矩的变化）相应于光谱峰的高度。谱峰的高度则是由于诸如热效应等引起的展宽，与分子本身的振动性质关系不大，因此模拟分子的红外光谱，首先需要对分子进行振动频率分析。计算红外光谱时有以下几个原则：1、必须采用优化的分子结构；2、结构优化和频率计算必须采用同一理论水平； 3、理论计算的频率为谐振动频率，一般偏高； 4、理论计算的振子强度和实验峰高不具有可比性。实验中，我们以H2O分子为对象，作红外光谱的模拟计算。 实验要求： 1、掌握溶剂化效应的概念和溶剂化模型，能做溶剂化效应对反应进程的模拟； 1、理解红外光谱的概念和模拟，作出不同优化方法下的H2O分子的红外光谱图，并比较分析。 实验一：溶剂化效应 （1）、反应F- +CH3F = FCH3 +F- 是一个典型的有机反应S N2反应，反应在气相进行时，首先形成一个“中间体”，这是一个简单的符合过程，不存在过渡态。然后经过一个S N2过渡态，形成另外一个中间体（反应对称，此中间体和初始形成的中间体是一样的），最后直接分解成两种产物。优化方法和基组设置为GAMESS/ HF/(6-31G(d))，R-Closed Shell, Spin Multiplicity 1,Net Charge -1，优化得到各物种的能量作出表一、并计算反应的能量途径图，如下图一所示：