土壤微生物多样性与地上植被类型关系的研究进展

土壤微生物多样性与地上植被类型关系的研究进展

杜玮超1袁霞2曲同宝1

（1．吉林农业大学，长春130118；2东北师范大学，长春130024）

摘要：土壤微生物是生态系统中重要的组成成分，土壤微生物多样性代表着微生物群落的稳定性，对植物的生长发育和群落结构的演替具有重要作用。同时地上植被也影响土壤微生物多样性，地上植被和地下微生物间具协同作用和正负反馈效应的互作机制。探讨植被和土壤微生物多样性之间的互作关系，为植物保护和生态系统的可持续发展研究提供参考。

关键词：地上植被；土壤微生物多样性；互作关系

成果来源：吉林省教育厅“十一五”科学技术研究项目（吉教科合字［2008］第315号）

作者简介：杜玮超（1986－），女，汉，植物学在读硕士生，主要研究土壤微生物空间异质性；袁霞（1983－），女，汉，生态学在读博士生，主要研究土壤微生物遗传多样性。

通讯作者：曲同宝（1970－），男，汉，作物遗传育种学博士，副教授，主要研究草地生态学。

生物多样性（biodiversity/biological di-

versity）涉及植物、动物和微生物及其生存环境（钱迎倩，1994），包括生物及其组成系统的总体多样性和变异性，植被在陆地生态系统物质循环和能量流动中起到中枢作用（温仲明等，2005）。由于植物无论在种间还是种内都表现出较高的遗传多样性（大部分变异存在于种群内）（杨芳等，2002），因此，即使是同一生态型的植物如果他们之间的生境不同，也会产生不同的表型分化，也就是说植物会由于其生长环境比如土质、气候、施肥、水分等因素的改变而产生不同的生态型。其中土质、施肥、水分等因素会直接影响到土壤微生物的生存数量、多样性和变异性（李骁等，2006）。1土壤微生物的多样性及其重要性

1．1土壤微生物多样性

微生物的物种资源极其丰富，是地球上仅次于昆虫的第二大类生物，微生物多样性的研究是整个生物多样性研究的重要组成部分（陈文新，1990）。土壤微生物（soil mi-croorganism），指生活在土壤中的微生物，一般包括细菌、放线菌、真菌、藻类、原生动物、病毒及类病毒。土壤微生物多样性包括栖息地中微生物分类群的多样性和分类群内的遗传多样性，以及群落结构的变异性、相互作用的复杂性、营养水平和共位群数量（功能多样性（姚槐应等，2003））在内的生态多样性。

目前，土壤微生物种类多样性研究主要从以下几个层面展开，遗传多样性、分类多

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样性、生态功能多样性以及系统发育多样性。其中遗传多样性认为是遗传信息在微生物聚集地或群落中的量和分布，反映微生物群落总的遗传能力。

1．2土壤微生物的重要性

土壤微生物是土壤生物的重要组成部分，微生物多样性代表着微生物群落的稳定性，也能客观反映土壤生态机制和土壤胁迫作用对群落的影响（杨海君等，2005）。土壤微生物不仅参与有机质的分解、养分的循环、土壤结构的改善、还能为地上植被储备养分、促进植物的吸收、增加植物的抗性，为植物多样性提供有利条件。同时，土壤微生物还能促进腐殖酸的形成，有利于土壤改良和地上植物生长。土壤微生物还能为植物提供物理屏障，有效防御病原菌的侵害。1．3土壤微生物技术的研究

土壤微生物学是从19世纪中叶发展起来的一支生命科学的分支学科，人们对于土壤微生物多样性的研究远远不及动物和植物。鉴于传统培养方法的局限性和科技的发展，人们开始采用多聚酶链式反应（PCR）、核酸测序等分子生物学手段来了解土壤微生物多样性（Zhou＆Lei，2007）。

分子生物学手段已逐渐应用于土壤微生物的研究中，这使得微生物的研究从宏观转向微观。Fischer和Lerman（1983）等首先提出用变性梯度凝胶电泳（DGGE）方法检测DNA突变。Muyzer（1993）等将DGGE 技术首次运用到微生物研究中，现在DGGE 在微生物的研究中已日渐广泛，涉及土壤（Smalla et al．，2001）、活性污泥（Liu et al．，2002）、海洋底泥（刘慧杰等，2010）等。TGGE是在DGGE基础上衍生出的温度梯度凝胶电泳技术（Muyzer et al．，1999）。同时，Sessitsch等（2001）用T－RFLP技术对不同施肥条件下土壤颗粒大小和微生物多样性关系进行了研究。

2植物多样性对土壤微生物多样性的影响

植被多样性与土壤微生物多样性相互联系、密不可分。植物通过对土壤环境如含水量（Ross et al．，1987）、pH值（Doda et al．，2003），碳（Zheng et al．，2006）、氮、磷含量及比例（Liu et al．，2010）等的影响，作用于土壤微生物的生存环境，从而对微生物多样性产生效应。植被多样性高的土壤有利于微生物的生长和繁殖，更有利于微生物的代谢过程以及多样性的产生。夏北成等（1998）应用PCR－RFLP研究了不同土壤及覆盖其上的植被与土壤微生物群落结构和多样性的关系，验证了植物的分泌物可使微生物获得更丰富的资源；植被覆盖使得土壤湿度更适于群落的发展。Zak等（2003）利用磷脂脂肪酸（PLFA）证明，当植物多样性增加时土壤中细菌和放线菌的数量是降低的，但是真菌是增加的。

植物群落在空间上的不均匀性及复杂性或变异性（Wu et al．，2000）被定义为植物群落空间异质性（spatial heterogeneity）。植物群落的空间异质性存在很大差异性，这些差异性不仅会影响植物群落本身，更会影响到植物根际微生物含量及多样性。植物的凋落物以及根系的分泌物是微生物的能源来源；植物群落类型，初步决定了微生物群落的组成。研究证明，植物通过影响微生物周围的土壤环境，进而影响其多样性；土壤微生物的多样性与地上植被多样性多呈正相关关系。但是，目前由于技术方法的局限、取样的不准确性及影响因子的复杂性等因素，

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使得关于植物对微生物影响的研究还不透彻，需进一步深入探讨。

3土壤微生物多样性对植物多样性的影响

新鲜土壤中含有大量的细菌、真菌菌丝，特别是与植物形成共生体的微生物，它们对碳、氮、磷的循环、植物养分的获得及植物多样性有非常重要的影响（陈声明等，2007）。

Connor等（2002）的研究表明丛枝菌根真菌对植物多样性有抑制作用，并指出优势种对菌根真菌的依赖性比较明显。然而另有研究表明丛枝菌根通过提高幼苗的成活率以及增强与优势种相关的竞争，增加了植物多样性（Van der Heijden et al．，1998）。Clay等（2000）研究表明，当夜黑草莓的幼苗出现在成熟林中时，成熟林下累积的腐霉菌会阻止它的生长，而远离成熟植株的幼苗成活率较高，说明土壤微生物能够影响植物群落的空间变异。因此，微生物多样性对地上植被多样性有正、负效应，但整体上都有利于物种的发展，对物种的稳定性起到了关键性的作用，是生物种群的稳定性和多样性的积极影响因子。

微生物的多样性为植物提供了丰富的碳源和氮源（王长庭等，2010），微生物的生产力水平和代谢能力也严重影响着地上植被的组成及多样性。同时土壤中的微生物参与土壤中有机质的分解，如放线菌能参与化合物和难分解的有机质的分解（李博，1995）；真菌能分解纤维素及类似化合物，释放的氨使植物木质素有效沉积能力加强（赵吉等，1995）。高婷等（2006）关于土壤微生物对植被影响的研究表明，不同土壤类型与地上植被有相互制约和依存的关系。土壤微生物和地上植被是不可分割的整体，它们互相影响、互相制约，为生态系统的多样性和稳定性提供了有利条件。

4结束语

土壤微生物多样性与植物多样性密切相关。微生物通过多种途径对地上植被产生作用；地上植被多样性也可以影响微生物多样性，特别是对根际微生物具有反馈作用，它们之间构成的互利共生关系，有利于生物多样性和生态系统多样性。

土壤中孕育着丰富的微生物群落，它们参与土壤中的循环过程，为生物多样性提供了平台和空间。植物群落对微生物多样性影响的不确定因素较多，而微生物也影响植物群落稳定性。因此有必要充分利用现代分子生物学手段，从整体上研究土壤微生物群落多样性及环境因子的相互作用关系。目前，对草地系统生物多样性的研究多集中在物种多样性方面，随着生物技术的不断发展，未来的研究热点会集中在互作关系上，特别是在动物、植物、微生物以及无机环境多因子之间的相互作用。

参考文献

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Research Progress of the Relationship Between Soil Microbial Diversity and Above－ground Vegetation Types

Du Weichao1，Yuan Xia2，Qu Tongbao1

（1Jilin Agricultural University，Changchun，130118）

（2Northeast Normal University，Changchun，130024）

Abstract：Soil microbes is the important component in ecosystem，soil microbial diversity represents the stability of the microbial communities，which plays an important role in plant growing develop-ment and community structure succession．Meanwhile vegetation influences the richness of soil mi-crobial diversity，higher diversity of plant species represent population is more stable in a certain ex-tent．Research shows there are cooperative mechanisms and positive and negative feedback effects between aboveground vegetation and underground soil microbial communities．Exploring the coopera-tive relationship between plants and soil microbial diversity can provide indication to plant protection and the sustainable development of ecosystem．

Keywords：Aboveground vegetation；Soil microbial diversity；Cooperative mechanism

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污染土壤微生物修复技术研究进展

污染土壤微生物修复技术研究进展课程论文 摘要针对2014年4月环境环保部公布的首次全国土壤污染状况调查结果，撰写我国最严重的耕地污染中主要污染物镉、砷、滴滴涕和多环芳烃的微生物修复研究进展。 关键词土壤污染；微生物修复；重金属污染；有机物污染 2005年4月至2013年12月我国开展的首次全国土壤污染状况调查结果显示全国土壤环境状况总体不容乐观，部分地区土壤污染较重，耕地土壤环境质量堪忧，工矿业废弃地土壤环境问题突出。全国土壤总的超标率为16.1%，其中轻微、轻度、中度和重度污染点位比例分别为11.2%、2.3%、1.5%和1.1%。人类赖以生存的耕地中土壤点位超标率高达19.4%，迫在眉睫的主要污染物为镉、砷、滴滴涕和多环芳烃[1]。 微生物修复是指利用天然存在的或所培养的功能微生物群，在适宜环境条件下，促进或强化微生物代谢功能，从而达到降低有毒污染物活性或降解成无毒物质的生物修复技术，它已成为污染土壤生物修复技术的重要组成部分和生力军[2]。由于我国土壤调查结果显示在农田耕地中重金属污染物镉、镍、砷、有机污染物滴滴涕和多环芳烃超标最严重，对这些污染物的治理已经迫在眉睫。所以，本文重点阐述针对这5种污染物的微生物修复技术研究进展。 1、重金属污染土壤微生物修复研究进展 土壤微生物种类繁多、数量庞大，是土壤的活性有机胶体，比表面大、带电荷和代谢活动旺盛，在重金属污染物的土壤生物地球化学循环过程中起到了积极作用。微生物可以对土壤中重金属进行固定、移动或转化，改变它们在土壤中的环境化学行为，可促进有毒、有害物质解毒或降低毒性，从而达到生物修复的目的[3]。因此，重金属污染土壤的微生物修复原理主要包括生物富集 (如生物积累、吸附作用)、生物转化(如生物氧化还原、甲基化与去甲基化以及重金属的溶解和有机络合配位降解)、生物固定（如与S2-的共沉淀）、生物滤除（如细菌的淋滤作用）等作用方式。 1.1镉污染 将具有重金属吸附能力的天然蛋白或人工合成肽展示在微生物细胞表面,可以提高微生物对重金属的吸附能力。Kuro da等[4]改造了微生物表面蛋白使得当酵母金属硫蛋白( YMT )串联体在酵母表面展示表达后,4 聚体对重金属吸附能力提高5.9 倍, 8 聚

微生物多样性对植物群落影响的研究进展(1)(1)

安庆师范学院本科毕业（学位）论文 姓名：王婷婷 年级： 2 0 0 7级 专业：环境科学 论文题目：微生物多样性对植物 群落影响的研究进展 完成日期：2011年4月27日 指导老师：潘少兵 安庆师范学院资源环境学院 二O一一年四月二十七日

微生物多样性对植物群落影响的研究进展 作者：王婷婷指导老师：潘少兵 （安庆师范学院资源环境学院安徽安庆246011） 摘要：土壤是微生物的主要存在场所，它承载了大部分生命的基因多样性。微生物群落在各种生态进程中具有重要作用，但是对于微生物多样性与执行生态功能能力的联系却研究的很有限。这篇文章以微生物多样性在植物群落方面的作用为基础，探讨微生物群落在执行生态功能中的冗余现象。 关键词：微生物多样性；功能冗余；植物多样性 Advancement of Effect of Microbial Diversity on Plant Diversity Autor：Wang Tingting Instructor: Pan Shaobing （School of Resources and environmental science,Anqing Teachers’College,Anqing 246011,Anhui） Abstract: Microbes are abundant in soil and comprise a large portion of Life's genetic diversity. Soil microbes play key roles in a large number of important ecosystem process- es. But the relativity between soil microbial diversity and their ecological functions is still poorly understood. Here we approach the functional redundances during soil microb- es influencing the ecological functions based on the various roles that they play in plant diversity. Key words：microbial diversity, functional redundances, plant diversity 引言： 土壤是微生物的主要存在场所，微生物在土壤养分转化与腐殖质形成过程中有着非常重要的作用。土壤生态系统是保证动植物生存、农业健康、持续发展的基础[1],对全球的生态环境变化有着深远的影响。土壤微生物群落是土壤中的活性组分, 包括细菌、真菌、放线菌和原生动物、病毒和小型藻类[2],每克土壤中栖息着大约100 亿个微生物[3]。土壤微生物群落对全球生态系统功能如养分转化、有机物的分解、土壤基本结构的维持、

八年级下植物与土壤知识点总结

八年级下第四章植物与土壤知识点总结 一、土壤的成分 1、土壤生物：动物、植物、细菌、真菌等 2、土壤中的非生命物质：空气、水、无机盐和有机物 （1）土壤中的水分：加热土壤，出现水珠 ；此块土壤 （2）测定土壤中空气的体积分数：取用的土壤体积为V 放入烧杯后缓慢加水，直至液面恰好浸没土壤，用去的水的体积；取与土壤相同体积的铁块放入同样大小的烧杯中加水，直为V 1 。 至液面恰好浸没铁块，用去的水的体积为V 2 这块土壤中空气的体积分数的算式为：（V1-V2）/ V0。 （3）土壤中的有机物：先称取一定量的干燥土壤，然后用酒精灯加热（放石棉网上），现象：土壤颜色发生明显变化，燃烧过后，再称量土壤， 发现质量变少。 土壤中的有机物主要来源于生物的排泄物和死亡的生物体 土壤中的无机盐：过滤土壤浸出液，再在蒸发皿中加热蒸发，可见 很细的结晶物 注：①（1）图实验试管口略向下倾斜，防止水倒流使试管炸裂 ②有机物能燃烧，但不能溶于水；无机盐能溶于水，但不能燃烧 3、土壤生物：动物、植物、细菌、真菌 土壤的组成固体 土壤非生物液体 空气 矿物质颗粒（无机盐）：占固体体积的95%

腐殖质（有机物） 4、土壤的形成：主要包括地表岩石的风化和有机物积累两个部分。 岩石的风化:指岩石在风、流水、温度等物理因素和化学物质的 溶蚀作用和各种生物的作用下，不断碎裂的过程。 总结：岩石在长期的风吹雨打、冷热交替和生物的作用下，逐渐风化变成石砾和砂粒等矿物质颗粒，最后经各种生物和气候的长期作用才形成了土壤。 二、各种各样的土壤 1、 三、植物的根与物质吸收 1、根系：一株植物所有的根合在一起。 直根系：有明显发达的主根和侧根之分的根系（如：大豆、青菜、棉花、菠

高通量测序：环境微生物群落多样性分析

(5)高通量测序：环境微生物群落多样性分析 微生物群落多样性的基本概念 环境中微生物的群落结构及多样性和微生物的功能及代谢机理是微生物生态学的研究 热点。长期以来，由于受到技术限制，对微生物群落结构和多样性的认识还不全面， 对微生物功能及代谢机理方面了解的也很少。但随着高通量测序、基因芯片等新技术 的不断更新，微生物分子生态学的研究方法和研究途径也在不断变化。第二代高通量 测序技术（尤其 是Roche 454高通量测序技术）的成熟和普及，使我们能够对环境微生物进行深度测序，灵 敏地探测出环境微生物群落结构随外界环境的改变而发生的极其微弱的变化，对于我 们研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用以及人类医疗健康有着重 要的理论和现实意义。 在国内，微生物多样性的研究涉及农业、土壤、林业、海洋、矿井、人体医学等诸多领域。以在医疗领域的应用为例，通 过比较正常和疾病状态下或疾病不同进程中人体微生物群落的结构和功能变化，可以 对正常人群与某些疾病患者体内的微生物群体多样性进行比较分析，研究获得人体微 生物群

落变化同疾病之间的关系；通过深度测序还可以快速地发现和检测常见病原及新发传 染病病原微生物。研究方法进展 环境微生物多样性的研究方法很多，从国内外目前采用的方法来看大致上包括以下四 类：传统的微生物平板纯培养方法、微平板分析方法、磷脂脂肪酸法以及分子生物学 方法等等。 近几年，随着分子生物学的发展，尤其是高通量测序技术的研发及应用，为微生物分 子生态学的研究策略注入了新的力量。 目前用于研究微生物多样性的分子生物学技术主要包 括:DGGE/TGGE/TTGE 、 T-RFLP 、SSCP、FISH 、印记杂交、定量 PCR、基因芯片等。 DGGE 等分子指纹图谱技术，在其实验结果中往往只含有数十条条带，只能反映出样品中少数 优势菌的信息；另一方面，由于分辨率的误差，部分电泳条带中可能包含不只一种 16S rDNA 序列，因此要获悉电泳图谱中具体的菌种信息，还需 对每一条带构建克隆文库，并筛选克隆进行测序，此实验操 作相对繁琐；此外，采用这种方法无法对样品中的微生物做 到绝对定量。生物芯片是通过固定在芯片上的探针来获得微

中国微生物物种多样性研究进展_郭良栋.

生物多样性 2012, 20 (5): 572–580 Doi: 10.3724/SP.J.1003.2012.10129 Biodiversity Science http: //https://www.wendangku.net/doc/95920718.html, —————————————————— 收稿日期: 2012-06-13; 接受日期: 2012-08-10 基金项目: 国家自然科学基金重点项目(30930005) ? 通讯作者 Author for correspondence. E-mail: guold@https://www.wendangku.net/doc/95920718.html, 中国微生物物种多样性研究进展 郭良栋* (中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室, 北京 100101) 摘要: 微生物是分布最为广泛的生命形式, 几乎分布到地球上的所有生境, 具有丰富的物种多样性。我国地域辽阔, 跨越热带至寒温带, 气候条件多样, 地理环境与生态系统类型复杂, 是世界上生物多样性最丰富的国家之一。我国已开展了大量微生物多样性研究, 并证实我国多样的生境蕴藏着丰富的微生物物种多样性。目前我国已报道真核微生物(菌物)约14,700种, 其中包括真菌约14,060种、卵菌约300种、黏菌约340种, 而真菌中有药用菌473种、食用菌966个分类单元。特别是近年来通过免培养的分子生物学技术发现我国存在丰富的原核微生物多样性。本文概述了传统方法和现代分子生物学技术在我国原核微生物(古菌、细菌)和真核微生物(真菌、卵菌、黏菌)物种多样性研究的最新进展。 关键词: 真核微生物, 原核微生物, 物种多样性, 培养方法, 分子技术 Progress of microbial species diversity research in China Liangdong Guo * State Key Laboratory of Mycology, Institute of Microbiology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101 Abstract: Microbes with rich species and genetic diversity are widely distributed throughout various habitats in the world. China possesses a variety of climate zones, geographic environments, and complex ecosystems, which play a large role shaping the complex biodiversity of this country. Microbial diversity has been widely studied and well documented by Chinese scientists. For example, a total of ca. 14,700 eukaryotic microbe species have been recorded, including ca. 14,060 fungi, ca. 300 oomycetes, and ca. 340 slime molds. Within the Fungi, there have been 473 medicinal fungal species and 966 edible fungal taxa recorded. However, re-cent studies have documented much high species diversity of prokaryotic microbes using molecular tech-niques, which have greatly promoted the study level of microbial diversity in China. This review paper sum-marizes recent research progress of microbial (i.e., archaea, bacteria, fungi, oomycetes, and slime molds) di-versity in China based on traditional and molecular techniques. Key words: eukaryotic microbe, prokaryotic microbe, species diversity, cultivation method, molecular technique 微生物是分布最为广泛的生命形式, 几乎分布到地球上的所有生境, 可利用各种有机化合物、无机盐等作为能源, 在有氧或无氧条件下, 在寒冷的极地、高达100℃的热泉或高盐碱度等极端环境中生活。微生物具有丰富的物种和遗传多样性, 并以高度的变异性适应不同的生境。作为生态系统中的重要组分, 微生物在自然界的物质与能量循环、生态系统的演替以及生物多样性的维持中发挥重要的生态功能。微生物与人类的生活休戚相关, 在直 接或间接地为人类提供了极其丰富的物质资源的同时, 也为人类带来了巨大危害。 Woese 和Fox(1977)以核糖体RNA(rRNA)的小亚基(原核生物的16S 、真核生物的18S 基因)序列为依据, 提出了独立于真细菌(Eubacteria)和真核生物(Urkaryotes)之外的第三种生命形式——古菌(Archaea), 认为它和真核生物以及真细菌是从一个具有原始遗传机制的共同祖先分别进化而来。随后Woese 等(1990)提出了三域(Domain)分类系统, 将

土壤微生物的分类、多样性及作用 王悦 1521011188

土壤微生物的分类及作用 摘要：土壤是生态系统中岩石圈、大气圈、水圈和生物圈的交界面，而土壤微生物分布广、数量大、种类多，是土壤的重要组成部分，也是土壤生物中最活跃的部分。其在地球生境中数量最多、生物多样性最复杂、生物量最大。土壤微生物能够参与土壤有机质的分解、腐殖质的合成、养分的转化和推动土壤的发育和形成，同时它也是土壤肥力水平的活性指标。因此研究土壤微生物的分类、多样性以及其在土壤中的作用有重要意义。 关键词：土壤微生物分类；土壤微生物多样性；土壤微生物作用 Abstract:The soil is the interface of lithosphere, atmosphere, hydrosphere, and biosphere in the ecosystem.There are many kinds of soil microbial,their havel wide distribution and large quantity and, they are an important component of the soil, as well as the most active part of soil organisms. In the earth's habitats, their biodiversity is the most complex and the biomass is the largest. Soil microorganisms can participate in soil organic matter decomposition, synthesis of humus, nutrient transformation and promote the development and form of the soil, it is also the activity indicators of soil fertility level .So research the classification, the diversity of soil microorganisms and its role in the soil have important significance. Key words: the classification of soil microorganisms, the diversity of soil microorganisms, the role of soil microorganisms. 1 引言 土壤微生物是从19世纪中叶发展起来的一支生命科学的分支学科[1]，这时学术界己经将土壤内部的三大过程(土壤有机质的分解、硝化和固氮作用)清晰界定为生物过程，对这些土壤内部过程的机理探索直接催生了土壤微生物学，并导致20世纪初土壤微生物学的空前繁荣。土壤微生物是土壤生物的重要组成部分，参与了土壤发生、发展和发育的全过程。其群落结构组成和生物量等可以反映土壤的肥力状况。土壤微生物可以分解土壤有机质和促进腐殖质形成，吸收、固定并释放养分, 对植物营养状况的改善和调节有重要作用。有些微生物可以和植物形成共生系统，促进植物的生长发育。同时土壤微生物在降解土壤污染物方面也有重要作用。 2 土壤微生物的组成及分类[2] 土壤微生物的生物量通常以生物量碳表示。它是指土壤中体积小于5x103um3的生物总量，包括细菌、放线菌、真菌和小型动物，不包括植物根系。测量土壤微生物生物量的方法包括传统镜检法、成分分析法、底物诱导呼吸法和熏蒸法。 土壤微生物按形态可以分为真核微生物，原核微生物和分子微生物。其中真核微生物包括真菌和藻类。原核微生物有细菌、放线菌和蓝细菌。分子生物则无

庐山植被与土壤

浅析庐山的植被与土壤 08地理科学一班张丹 0810030118 实习地点：庐山，位于中国江西省北部，东经115度52分——116度零8 分，北纬29度26分——29度41分，面积302平方公里，外围保护地带面积500平方公里。北濒一泻千里的长江，南襟烟波浩渺的鄱阳湖，大江、大湖、大山浑然一体，险峻与秀丽刚柔相济，素以“雄、奇、险、秀”闻名于世。 主要内容：庐山的植被与土壤。庐山植物概况、主要植被类型及组成、结构 动态和分布规律。庐山土壤地带性分布；庐山非地带性土壤；庐山土壤的分布规律。 一、植物概况： 庐山植物区系特征。庐山植物分布种类及丰富，据初步统计有2231种，1019属，其中蕨类植物41科83属217种，裸子植物9科34属94种，被子植物154科902属1017种，庐山野生植物中有不少的稀有和珍贵的植物，野生种的比例相当高，达91.8% 。由表 1 可以看出庐山植物区系的特征。 1）热带、亚热带植物种类丰富，特别是亚热带种类是庐山植被的主要成分。 2）温带、热带区系成分的渗入，反映了庐山植物区系过渡性的特点。 二、庐山群落类型： 庐山在自然植被上，由于它地处中亚热带，海拔1400多米，属于我国亚热带东部季风区域，离海700公里左右，在植被分布上，其水平地带是常绿阔叶林，随着海拔高度的增加，地表水热状况的垂直分异，深刻地制约着植被的垂直分布，导致植物群落类型多种多样。从大的方面来分，主要分为两部分：阔叶林和针叶林。 （一）、阔叶林 在庐山，常绿叶林、落叶阔叶林、常绿、落叶阔叶混交林也有着广泛的分布。常绿阔叶林又叫照叶林，叶光亮、革质、墨绿色、而落叶阔叶林（夏绿阔叶林）

土壤微生物群落多样性研究方法及进展_1

第27卷增刊V ol 127,Sup 1广西农业生物科学Journal o f Guangx i A g ric 1and Biol 1Science 2008年6月June,2008 收稿日期:20080122。 基金项目:广西大学博士启动基金项目(X05119)。 作者简介:姚晓华(广西大学副教授,博士;E -mail:x hy ao@g xu 1edu 1cn 。文章编号:10083464(2008)增008405 土壤微生物群落多样性研究方法及进展 姚晓华 (广西大学农学院,广西南宁530005) 摘要:微生物多样性是指群落中的微生物种群类型和数量、种的丰度和均度以及种的分布情况。研究 土壤微生物群落多样性的方法包括传统的以生化技术为基础的方法(直接平板计数、单碳源利用模式等) 和以现代分子生物技术为基础的方法(从土壤中提取DN A ,进行G+C%含量的分析,或杂交分析,或进 行PCR,产物再进行D GGE/T GG E 等分析)。现代生物技术与传统微生物研究方法的结合使用,为更全面 地理解土壤微生物群落的多样性和生态功能提供了良好的前景。 关键词:微生物多样性;生化技术;分子生物学技术;DN A 中图分类号:.Q 938115 文献标识码:A Advancement of methods in studying soil microbial diversity YAO Xiao -hua (Co llege of Ag ricultur e,G uangx i U niv ersit y,N anning 530005,China) Abstract:Species div ersity consist o f species richness,the total number of species,species ev enness,and the distribution of species 1Methods to measure microbial diversity in so il can be categ orized into tw o g roups:biochemica-l based techniques and m olecular -based techniques 1The fo rmer techniques include plate counts,sole carbon so urce utilizatio n patterns,fatty acid methy l ester analysis,and et al 1The latter techniques include G +C%,DNA reassociation,DNA -DNA hy br idization,DGGE/TGGC,and et al 1Ov er all,the best w ay to study soil microbial diversity w o uld be to use a variety of tests w ith differ ent endpoints and degr ees o f r esolutio n to o btain the bro adest picture possible and the most inform ation r eg ar ding the microbial co mmunity 1 Key words:microbial diversity;biochem ica-l based techniques,mo lecular -based techniques,DNA 微生物多样性研究是微生物生态学最重要的研究内容之一。微生物在土壤中普遍存在,对环境条件的变化反应敏捷,它能较早地预测土壤养分及环境质量的变化过程,被认为是最有潜力的敏感性生物指标之一[1] 。但土壤微生物的种类庞大,使得有关微生物区系的分析工作十分耗时费力。因此,微生物群落结构的研究主要通过微生物生态学的方法来完成,即通过描述微生物群落的稳定性、微生物群落生态学机理以及自然或人为干扰对群落产生的影响,揭示土壤质量与微生物数量和活性之间的关系。利用分子生物学技术和研究策略,揭示自然界各种环境中(尤其是极端环境)微生物多样性的真实水平及其物种组成,是微生物生态学各项研究的基础和核心,是重新认识复杂的微生物世界的开端。

微生物多样性研究—β多样性分析概述

微生物多样研究中的—β多样性分析概述

一、β-多样性分析介绍 1. β（Beta）Diversity： 是对不同样品/不同组间样品的微生物群落构成进行比较分析。 ?β多样性分析前的数据“来源”： 1）OTUs的丰度信息表； 2）OTUs之间的系统发生关系， 计算Unweighted Unifrac及Weighted Unifrac距离。 ?通过多变量统计学方法主成分分析(PCA，Principal Component Analysis)，主坐标分析(PCoA，Principal Co-ordinates Analysis)，非加权组平均聚类分析(UPGMA，Unweighted Pair-group Method with Arithmetic Means)等分析方法，从中发现不同样品（组）间的差异。

2. PCA & PCoA分析 ?主成分分析（PCA）是多变量统计学中最为人熟知的分析方法，它通过线性变换，将原始的高维数据投影至少量新合成的变量（即主成分），从而简化数据结构，展现样品的自然分布。 ?主成分分析不考虑原始变量之间可能存在的相互关系，并且是基于欧式距离评价样品之间的相似度。 ?多维尺度分析与主成分分析类似，但是它可以采用任何距离评价样品之间的相似度。主坐标分析（Principal coordinates analysis，PCoA）是经典的多维尺度分析方法。

3.UniFrac距离 ?由于微生物极其多样，不同微生物彼此之间的系统发育关系往往千差万别，仅仅将群落中不同微生物成员视为相互独立的变量显然并不合理。 ?因此，在比较不同群落样品之间的差异时，需要考虑两个群落成员之间的系统发育关系是否相似。 ?基于这个思想，计算微生物群落样品间距离的UniFrac距离应运而生，通过比较两个群落各自独有的微生物成员之间系统发育关系的远近，更为客观地反映两个群落样品之间的相似程度。

八年级下第四章植物与土壤知识点总结

八年级下第四章植物与土壤知识点总结 一、土壤的成分 1、土壤生物：动物、植物、细菌、真菌等 2、土壤中的非生命物质： 空气、水、无机盐和有机物 （1）土壤中的水分：加热土壤，出现水珠 （2）测定土壤中空气的体积分数：取用的土壤体积为V 0；此块土壤 放入烧杯后缓慢加水，直至液面恰好浸没土壤，用去的水的体积 为V 1；取与土壤相同体积的铁块放入同样大小的烧杯中加水，直 至液面恰好浸没铁块，用去的水的体积为V 2。 这块土壤中空气的体积分数的算式为： （V 1-V 2）/ V 0 。 （3）土壤中的有机物：先称取一定量的干燥土壤，然后用酒精灯加热（放石 棉网上），现象：土壤颜色发生明显变化，燃烧过后，再称量土壤， 发现质量变少。 土壤中的有机物主要来源于生物的排泄物和死亡的生物体 土壤中的无机盐：过滤土壤浸出液，再在蒸发皿中加热蒸发，可见 很细的结晶物 注：①（1）图实验试管口略向下倾斜，防止水倒流使试管炸裂 ②有机物能燃烧，但不能溶于水；无机盐能溶于水，但不能燃烧 3、 土壤生物：动物、植物、细菌、真菌 土壤的组成 固体 土壤非生物 液体 空气 矿物质颗粒（无机盐）：占固体体积的95% 腐殖质（有机物） 4、土壤的形成：主要包括地表岩石的风化和有机物积累两个部分。 岩石的风化:指岩石在风、流水、温度等物理因素和化学物质的 溶蚀作用和各种生物的作用下，不断碎裂的过程。 总结：岩石在长期的风吹雨打、冷热交替和生物的作用下，逐渐风化变成 石砾和砂粒等矿物质颗粒，最后经各种生物和气候的长期作用才形成了土壤。 二、各种各样的土壤 1、 三、植物的根与物质吸收 1、根系：一株植物所有的根合在一起。 直根系：有明显发达的主根和侧根之分的根系（如：大豆、青菜、棉花、菠菜等双子叶植物的根系) 须根系：没有明显主侧根之分的根系（如：水稻、小麦、蒜、葱等单子叶植物的根系） 土壤分类 土壤质地 土壤性状 砂土类土壤 砂粒多、黏粒少，土壤颗粒较细 输送，不易粘结；通气、透水性最好；保水保肥性差；易干旱，有机物分解快，易流失 黏土类土壤 黏粒、粉砂多，土壤颗粒较细 质地黏重，湿而黏，干而硬；保水、保肥性最好；通气透水性差； 壤土类土壤 砂粒、黏粒、粉砂大致等量，土壤质地较均匀 黏性适中，既通气透水，又保水保肥，最适于耕种

微生物之微生物多样性分析-DGGE

变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE） 普通的聚丙烯酰胺凝胶电泳只能通过片段大小不同在同一浓度的胶上电泳迁移率不同而分离不同的DNA片段，对于片段大小接近或相同的DNA片段无法做到有效地分离；DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis) 即变性梯度凝胶电泳，是利用DNA在不同浓度的变性剂中解链行为的不同而导致电泳迁移率发生变化，从而将片段大小相同而碱基组成不同的DNA片段分开。 DGGE作为一种成熟的分子生物学技术被广泛应用于环境科学（土壤、海洋、河流、冰川、淤泥等）、医学（各种疾病治疗前后，病变部位微生物的差异）、人体（鼻咽、口腔、黏膜、肠道）等领域进行微生物多样性分析。 实验流程图： 实验结果 实验结果包括以下内容 1 引物设计 以下是DGGE中常用的引物，我们将根据客户的不同需求，进行针对性的引物设计。 引物序列（5’-3’）

细菌 16S V3 区扩 增引物 357-F-GC CGCCCGCCGCGCGCGGCGGGCGGGGCGGGG GCACGGGGGGCCTACGGGAGGCAGCAG 518r ATTACCGCGGCTGCTGG 引物 序列（5’-3’） 真核 18S V1-3区扩增引物 Euk1A CTGGTTGATCCTGCCAG EukA516r-GC CGCCCGGGGCGCGCCCCGGGCGGGGCGGGGGCA CGGGGGGACCAGACTTGCCCTCC 2 基因组DNA 抽提电泳检测图 针对客户的样本来源不同，我们针对性优化不同的基因组抽提方法，已达到提取效果最佳。 说明：1-8为样本所抽提基因组DNA，上样量3uL；M 为1kb Marker 上数第一条带为8 kb，中间的亮带为3kb，浓度为30ng/uL，其余为10 ng/uL。 3 目的片段PCR 检测 说明：1-8为样本，负为负对照（说明我们的实验没有污染，这对分子实验是至关重要的），上样量为5uL；M 为DL2000 Marker，上样量3uL。其中亮带为20ng/uL，其余为10 ng/uL。 Reconditioning PCR： 第一轮PCR 产物将会作为新的模板再进行少数循环的第二轮PCR 扩增，这叫做“Reconditioning PCR”。由于在“ Reconditioning PCR”的过程中引物和模板之

微生物多样性研究进展

姓名：崔靖璞学号：2010212802 专业：生物科学 微生物多样性研究进展 摘要：微生物资源丰富,开发潜力巨大,是生命科学发展的主要动力之一.本文介绍了几种常用的研究微生物多样性的分子生物学技术,主要包括:16SrDNA测序、DGGE/TGGE/TTGE、T-RFLP、SSCP、FISH、印记杂交、定量PCR、基因芯片等,并对微生物多样性研究技术的未来发展进行了展望，同时本文也介绍几种微生物多样性的研究实验方法。 关键词:微生物多样性聚合酶链式反应基因芯片平板纯培养 微生物是地球上生物多样性最为丰富的资源,微生物资源的开发,是21世纪生命科学发展的主要动力之一.由于微生物的微观性,微生物多样性与其他高等生物相比有许多独特之处,包括:生存环境多样;生长、繁殖速度多样;营养、代谢类型多样;生活方式多样.微生物多样性的揭示与研究技术的发展和创新是密不可分的,研究技术的进步是微生物多样性研究向前发展的重要推动力量.近年来,随着微电子、计算机、分子生物学、物理、化学等技术的发展,微生物多样性研究技术也在吸收其他学科先进技术的基础上不断向前发展.各种研究方法的发展使得这种状况有了很大改观.现代分子生物学技术在微生物多样性研究上的应用克服了微生物培养技术的限制,能对样品进行较客观的分析,较精确地揭示了微生物种类和遗传的多样性.目前用于研究微生物多样性的分子生物学技术主要包括:16SrDNA 测序、DGGE/TGGE/TTGE、T-RFLP、SSCP、FISH、印记杂交、定量PCR、基因芯片等。 1核酸探针杂交技术 核酸分子杂交技术是20世纪70年代发展起来的一种分子生物学技术.该技术快速、灵敏、具有高度特异性,近年来被广泛应用于微生物多样性的研究中.用于微生物多样性研究的探针主要有三类:双链DNA、单链DNA和RNA以及寡核苷酸探针,杂交方式主要有荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)、全细胞杂交(whole-cell hybridization)、数量印迹杂交(quantitative dot blot)及生物芯片(biochip).对于环境微生物样品解析而言,最有意义的核酸杂交技术是原位杂交技术,在原位杂交技术中,应用最广泛的是荧光原位杂交技术。

植物与土壤的关系简介

植物与土壤的关系简介 1. 土壤的生态意义 土壤是岩石圈表面的疏松表层，是陆生植物生活的基质。它提供了植物生活必需的营养和水分，是生态系统中物质与能量交换的重要场所。由于植物根系与土壤之间具有极大的接触面，在土壤和植物之间进行频繁的物质交换，彼此强烈影响，因而土壤是植物的一个重要生态因子，通过控制土壤因素就可影响植物的生长和产量。土壤及时满足植物对水、肥、气、热要求的能力，称为土壤肥力。肥沃的土壤同时能满足植物对水、肥、气、热的要求，是植物正常生长发育的基础。 2. 土壤的物理性质及其对植物的影响 （1）土壤质地和结构土壤是由固体、液体和气体组成的三相系统，其中固体颗粒是组成土壤的物质基础，约占土壤总重量的85%以上。根据固体颗粒的大小，可以把土粒分为以下几级：粗砂（直径~）、细砂（~）、粉砂（~）和粘粒（以下）。这些大小不同的固体颗粒的组合百分比称为土壤质地。土壤质地可分为砂土、壤土和粘土三大类。砂土类土壤以粗砂和细砂为主、粉砂和粘粒比重小，土壤粘性小、孔隙多，通气透水性强，蓄水和保肥性能差，易干旱。粘土类土壤以粉砂和粘粒为主，质地粘重，结构致密，保水保肥能力强，但孔隙小，通气透水性能差，湿时粘、干时硬。壤土类土壤质地比较均匀，其中砂粒、粉砂和粘粒所占比重大致相等，既不松又不粘，通气透水性能好，并具一定的保水保肥能力，是比较理想的农作土壤。 土壤结构是指固体颗粒的排列方式、孔隙和团聚体的数量、大小及其稳定度。它可分为微团粒结构（直径小于）、团粒结构（~10mm）和比团粒结构更大的各种结构。团粒结构是土壤中的腐殖质把矿质土粒粘结成~10mm直径的小团块，具有泡水不散的水稳性特点。具有团粒结构的土壤是结构良好的土壤，它能协调土壤中水分、空气和营养物质之间的关系，统一保肥和供肥的矛盾，有利于根系活动及吸取水分和养分，为植物的生长发育提供良好的条件。无结构或结构不良的土壤，土体坚实，通气透水性差，土壤中微生物和动物的活动受抑制，土壤肥

中国土壤微生物生态学研究进展汇总

第1章绪论 由来土壤微生物因其数量庞大、种类繁多而被称为丰富的生物资源库。土壤微生物包括蓝细菌、细菌、放线菌等原核微生物，还有真菌、蓝藻除外的藻类真核生物，地衣以及原生动物等，是一种形体微小，结构较简单的生物。广泛活跃于土壤中，土壤微生物对生物地球化学循环贡献着不可估量的力量，在土壤形成、有机质代谢、污染物降解、植物养分循环转化等过程中具有不可替代的作用，同时也是评价该地土壤肥力的重要指标之一，因此，对土壤微生物的生态学研究，有着非常深远的意义［1 －3］。

第2章草地土壤微生物生态研究概况 草地土壤微生物是土壤有机复合体以及草地生态系统的重要组成部分［4］。通过对土壤中微生物的活动和分布进行详细研究，可以了解对微生物特性、分布、功能等的影响的因素有哪些，同时可以知晓微生物对植物生长发育、土壤肥力以及土壤中能量流动与物质循环的影响和作用。 气候变化与季节更替对草地土壤微生物的数量与分布具有一定影响。微生物总生物量在春夏季节较高，秋季较低，冬季最少。不同类群的微生物量有各自不同的特点，但是随季节变化的总体趋势与上述相似。杨成德等［5］对东祁连山高寒草本草地土壤微生物量及酶的季节动态研究中发现，土壤微生物量碳随季节变化呈先升高后降低再升高的趋势，其中7月达到最大值，9月下降到最小值，但土壤微生物量氮、磷的季节变化与土壤微生物量碳有所不同，土壤酶活性也呈现季节性变化。金风霞等［6］在对不同种植年限苜蓿地土壤环境效应的研究中指出，各种植年限苜蓿草地土壤微生物群落以细菌占优势，而真菌的变化规律不明显，随着种植年限的变化，细菌和放线菌的数量呈现逐年递增的趋势。高雪峰等［7］研究了草原土壤微生物受放牧影响后的季节变化规律，研究结果表明，土壤中的细菌数量最低，从3月份开始逐渐增加，8月份达到最高值，8月到10月降低; 真菌数量3月份最高，5月份最低，而5月8月呈增加趋势，8月到10呈降低趋势; 放线菌数量5月份最少，5月到10月逐渐增加，10月份最高，之后又逐渐降低; 三大微生物类群的季节变化趋势不一致。任佐华等［8］研究了青藏高原腹地中，三江源自然保护区中的高寒草原土壤，分析了土壤微生物受气候变化的影响，结果表明，该区域微生物数量细菌最多，放线菌的数量次之，真菌的数量较少; 并且发现主要功能微生物菌群数量从多到少依次为氨化细菌、好气性固氮菌、硝化细菌、亚硝化细菌; 所研究区域的微生物生物量碳、氮含量差异显著; 对三江源地区高寒草原的土壤微生物活性影响明显的因素是温度的升高。

人教版 第五章 地球上的植被与土壤 综合训练

第五章地球上的植被与土壤综合训练 一、单选题 1.亚马孙热带雨林具有巨大的生态效益，却 遭到严重破坏，雨林中土壤贫瘠的原因是 ①有机质分解和养分再循环旺盛，土壤缺 少养分积累和补充 ②气候高温多雨，地表径流和淋溶作用带 走养分 ③雨林植被的吸收作用强烈 ④岩石风化所释放的养分不足 A. ①② B. ③④ C. ①③ D. ②④ 2.土壤凋萎湿度是指土壤水分减少到使植 物叶片开始呈现萎蔫状态时的土壤湿度， 被认为是植物能够吸收的土壤水分的最 低值。如图为我国某地区不同树种（苗木） 凋萎湿度测量结果，对土壤凋萎湿度影响 最小的因素是 A.气温高低 B. 土质颗粒 C. 基岩性质 D. 降水多少 3.古尔班通古特沙漠位于新疆准噶尔盆地中央，是中国面积最大的固定、半固定沙漠。沙 漠中的沙丘顶部多流沙，植被较少，而沙丘底部植被相对丰富。夏季炎热，冬季寒冷，年降水量70-150mm，年蒸发量 2000mm以上，冬季一般有20-30cm 深的稳定积雪覆盖。如图为沙漠中某 沙丘剖面图。沙丘1-2米深的土层土 壤水分含量总体变化规律是 A.坡顶＞坡中＞坡脚 B.坡顶＞坡脚＞坡中 C. 坡中＞坡脚＞坡顶 D. 坡脚＞坡中＞坡顶 下图为广西九万山植被与土壤垂直分布示意图，据图完成4－6题。 4.影响该山地土壤性状发生变化的主要原因是 A.水热状况随高度的变化 B.太阳辐射随高度的变化 C. 矿物成分随高度的变化 D. 有机质含量随高度的变化 5.图中甲处的植被类型为 A.荒漠带 B. 落叶阔叶林 C. 草原带 D. 常绿阔叶林 6.图中山地红壤肥力较低，形成的原因是 ①气温较高，有机质分解快②坡度较陡，地表物质迁移快 ③风化作用弱，成土母质薄④植被覆盖率高，枯枝落叶多 A. ①② B. ③④ C. ①④ D. ②③

污染土壤微生物群落结构多样性及功能多样性测定方法

第26卷第10期 2006年10月生 态 学 报ACT A EC O LOGIC A SI NIC A V ol.26,N o.10Oct.,2006 污染土壤微生物群落结构多样性及 功能多样性测定方法 陈承利,廖　敏3 ,曾路生 (污染环境修复与生态健康教育部重点实验室,浙江大学环境与资源学院,杭州　310029)基金项目:国家重点基础研究发展规划“973”资助项目(2002C B410804);国家自然科学基金资助项目(40201026) 收稿日期:2005206227;修订日期:2006205220 作者简介:陈承利(1982～),男,浙江平阳,硕士,主要从事土壤环境化学与环境生态毒理学研究.E 2mail :clchen1982@1631com 3通讯作者C orresponding author.E -mail :liaom in @https://www.wendangku.net/doc/95920718.html, or liaom inzju1@1631com Found ation item :The project was supported by National K ey Basic Research Support F oundation of China (N o.2002C B410804)and National Natural Science F oundation of China (N o.40201026) R eceived d ate :2005206227;Accepted d ate :2006205220 Biography :CHE N Cheng 2Li ,M aster ,mainly engaged in s oil environmental chem istry and ecotoxicology.E 2mail :clchen1982@1631com 摘要:土壤微生物在促进土壤质量和植物健康方面发挥着重要的作用,土壤微生物群落结构和组成的多样性及其变化在一定程度上反映了土壤质量。为了更好地了解土壤健康状况,非常有必要发展有效的方法来研究污染土壤微生物的多样性、分布以及行为等。回顾了近年来国内外污染土壤微生物群落结构多样性及功能多样性的测定方法,包括生物化学技术和分子生物学技术,现将它们的原理、优缺点、实用性及其发展动态作一阐述,同时指出结合这两种技术可为微生物群落分析提供一个更全面的、精确的方法。 关键词:污染土壤;微生物多样性;分子生物学;BI O LOG;P LFA ;PCR ;DNA 文章编号:100020933(2006)1023404209　中图分类号:Q143,Q938,S154　文献标识码:A Methods to measure the microbial community structure and functional diversity in polluted soils CHE N Cheng 2Li ,LI AO Min 3,ZE NG Lu 2Sheng (MOE K ey Laboratory ,Environmental Remediation and Ecosystem H ealth ,College o f Environmental and Resources Sciences ,Zhejiang Univer sity ,Hangzhou ,310029,China ).Acta Ecologica Sinica ,2006,26(10):3404～3412. Abstract :S oil m icroorganisms ,such as bacteria and fungi ,play im portant roles in prom oting soil quality and im proving plant health and nutrition ,thus in fluencing terrestrial ecosystems.Increasing anthropogenic activities ,such as spraw ling urbanization ,agricultural development ,pesticides utilization ,and pollutions from all sources ,can potentially affect soil m icrobial community com position and diversity ,leading to deterioration of soil quality and fertility.H owever ,it is yet to be determ ined how these changes in m icrobial diversity can in fluence surface and ground ecosystems.T o that end ,there is an acute need for reliable and accurate methods to study the community structure and tax onomy of soil m icroorganisms.W ithout the development of effective methods for studying the m icrobial diversity ,distribution ,and behavior in polluted soil ,a thorough understanding of m icrobial diversity ,as well as its im pact on soil health ,cannot be achieved. The determ ination of species diversity depends on several factors including the intensity of each species ,the total number of species present ,species evenness ,and the spatial distribution of species.M ethods to measure m icrobial community structure and functional diversity in polluted soils can be classified into tw o groups ,i.e.,biochem ical 2based techniques and m olecular biological 2based techniques.T ypically ,diversity studies include the relative com parisons of communities across a gradient of stress and disturbance.W ith current techniques ,it is difficult to study true diversity due to lack of know ledge on com position and the techniques to determ ine the accuracy of the extraction or detection methods.T raditionally ,the analysis of soil m icrobial