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动物肝脏DNA提取

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实验教学教案首页

综合性、设计性实验基本信息表

动物肝脏DNA的提取及检测(综合性)

相关知识

1.蛋白质变性作用,变性剂和酶的抑制剂

2.EDTA、SDS、蛋白酶K的作用、DNA的理化性质:溶解特性

3.影响电泳迁移率的因素

4.核酸分子大小与琼脂糖浓度的关系

琼脂糖浓度与DNA分离范围

琼脂糖浓度0.3 0.6 0.7 0.9 1.2 1.5 2.0

线状DNA大小/kb 5-60 1-20 0.8-10 0.5-7 0.4-6 0.2-4 0.1-3

5.核酸构型与琼脂糖凝胶电泳分离的关系

不同构型DNA的移动速度次序为:共价闭环DNA>直线DNA>开环的双链环状DNA。6.琼脂糖凝胶电泳的特点

天然琼脂(agar)是一种多聚糖,主要由琼脂糖

(agarose,约占80%)及琼脂胶(agaropectin)组

成。琼脂糖是由半乳糖及其衍生物构成的中性物质,

不带电荷,而琼脂胶是一种含硫酸根和羧基的强酸

性多糖,由于这些基团带有电荷,在电场作用下能

产生较强的电渗现象,加之硫酸根可与某些蛋白质

作用而影响电泳速度及分离效果。因此,目前多用

琼脂糖为电泳支持物进行平板电泳,其优点如下。

①琼脂糖凝胶电泳操作简单,电泳速度快,样品不需事先处理就可以进行电泳。

②琼脂糖凝胶结构均匀,含水量大(约占98%~99%),近似自由电泳,样品扩散较自由电

流,对样品吸附极微,因此电泳图谱清晰,分辨率高,重复性好。

③琼脂糖透明无紫外吸收,电泳过程和结果可直接用紫外光灯检测及定量测定。

④电泳后区带易染色,样品极易洗脱,便于定量测定。制成干膜可长期保存。

7.常用染料EB(溴化乙锭Ethidium Bromide,EB):

溴乙锭染料全名是3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶溴盐,是诱变剂,可与核酸结合,在紫外光下呈黄色荧光。使用时一定要戴手套。EB废液要经过处理才能丢弃。

①在300nm波长的紫外光照射下发出荧光。在适当的下,荧光强度与DNA片段的大小(或

数量)成正比。

可插入碱基与碱基之间造成移码突变。

DNA(RNA)定量分析:可用紫外光谱

分析,原理是DNA(RNA)分子在260 nm处

有特异的紫外吸收峰,且吸收强度与

DNA(RNA)的浓度成正比。此外,还可通过琼

脂糖凝胶电泳上显示的DNA(RNA)带的亮

度来分析,因为EB 作为一种荧光染料,能插

入DNA(RNA)的碱基对平面之间而结合于其

上,在紫外光的激发下产生荧光,DNA(RNA)分子上EB的量与DNA分子的长度和数量成正比。在电泳时加入已知浓度的DNA(RNA)Marker作为DNA(RNA)分子量及浓度的参考,样品DNA(RNA)的荧光强度就可以大致表示DNA(RNA)量的多少。

8.提纯的思路

①基因组DNA的特性:分子量较大、所提取的DNA片段的大小:100 — 150kb,易断(如何

保证DNA分子的完整性?)

②组织和细胞的破碎

③要去除的物质:蛋白、多糖、脂类、RNA和小分子物质

第一部分动物肝脏DNA的提取

一、实验目的

通过本实验了解并掌握提取基因组DNA的原理和技术。

二、实验原理

在EDTA和SDS等去污剂存在下,用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提,可以得到哺乳动物基因组DNA,用此方法得到的DNA长度为100-150Kb,适用于Southern杂交、基因组DNA 文库的构建,酸性条件下DNA溶于有机相。碱性条件下(7~8以上)溶于水相。

三、实验仪器、材料和试剂

材料:鸡肝

试剂:

1.5mol/L Nacl

2.0.5 mol/L Tris.HCl pH8.0

3.0.5 mol/L EDTA pH8.0

4.3mol/L NaAc pH5.2

以上均高压灭菌

5.蛋白酶K:10mg/ml配好后用一次性过滤器过滤,-20度保存

6.组织匀浆液100mmol/L NaCl, 10mmol/L Tris.HCl(pH8.0),25mmol/L EDTA (pH8.0)7.酶解液:200mmol/L NaCl,20mmol/L Tris.HCl(pH8.0),50mmol/L EDTA (pH8.0),200ug/ml蛋白酶K,1%SDS。

8.无DNA酶的RNA酶:将胰RNA酶溶于100 mmol/L Tris.HCl(pH7.5)、15 mmol/L NaCl 溶液中,浓度10mg/ml,于100度水浴处理15分钟以降解DNA酶,缓慢冷却到室温,-20度保存。

9.TE缓冲液10mmol/L Tris.HCl(pH8.0),1 mmol/L EDTA(pH8.0)

10.平衡酚(pH8.0):氯仿:异戊醇=25:24:1(体积比)

10. 氯仿:异戊醇=24:1(体积比)

11. 5×TBE 5.4gTris, 2.75g硼酸,2ml 0.5 mol/L EDTA (pH8.0),加水到100ml

12. 6×上样缓冲液0.25%溴酚蓝,40%(W/V)蔗糖水溶液

13. DNA相对分子质量标准片段(bp)。

四、实验操作步骤

0.3g(0.2g)鸡肝,(冰冷生理盐水洗3次),剪碎(速度要快)

碎鸡肝转入预冷的玻璃匀浆器中,加入2mL匀浆液(含EDTA),匀浆

(低温操作,至少5-6次,直到无大块的组织存在)

匀浆液转入2mL小离心管(转管前先静置一会,防止未碎的大块的组织进入2ml管)

40C , 5000rpm离心1~2min(离心要平衡,对称)

弃上清,沉淀(细胞)加0.4mL无菌水,用枪吹散,再加0.4mL酶解液(含SDS、蛋白酶K)

慢慢颠倒混匀,

55℃水浴酶解2-3小时,直到酶解液彻底清澈

(加RNase ,终浓度200ug/mL,370C保温60min,可省略)

加等体积酚/氯仿,(取下层液)慢慢颠倒混匀,冰上平倒静置10min

40C,10000rpm离心10min

试管中液体分三层:水相、蛋白层、有机相

用钝化枪头小心取出上清水相(水相中含有DNA丝状粘稠)入另一新1.5小试管中

注意不要取到蛋白

上清加1/10体积的3mol/L NaAc(pH5.2 ?)和2倍体积的无水乙醇

慢慢混匀,冰上(-20℃)静置30min以上(析出DNA,观察丝状物)

40C,8000rpm离心10min

沉淀用1mL 70%冷乙醇洗1-2次,每次8000rpm离心10min,弃上清

离心管中开盖,超净台中干燥沉淀

加 20-100uL TE, 40C溶解(可根据沉淀量确定加TE的量)

问题:各步操作所用试剂的作用及结果现象?操作方法注意事项?

第二部分DNA琼脂糖凝胶电泳

一、实验目的

通过本实验学习琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术。

二、实验原理

DNA在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。核酸为两性分子,在P H3.5时,整个分子带正电;P H8左右时,碱基几乎不解离,整个分子带负电。在碱性环境下,不同的核酸分子由于具有相同的磷酸戊糖结构,几乎具有相同的电荷密度,相同碱基数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速度向正极方向移动。在一定的电场强度下,DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应即DNA分本身的大小和构型。具有不同的相对分子质量的DNA 片段泳动速度不一样,可进行分离。

三、仪器、材料与试剂

(一)仪器

电泳仪、平板电泳槽、样品槽模板(梳子)、橡皮膏、锥形瓶(100ml或50ml)、紫外分析仪、照相机或凝胶自动成像仪、一次性塑料手套、Eppendorf管(1.5ul)、微量移液器、量筒、微波炉。

(二)材料自已提取的DNA,相对分子质量标准品

(三)试剂

1.5× TBE储液(P H8.0)每升含Tris54g,硼酸27.5g,0.5mol/L EDTA20ml,使用时稀释10倍成0.5×TBE(1×TBE也可)。

2.6×凝胶加样缓冲液0.2%溴酚蓝,50%蔗糖,10mol/L NaOH1~2滴,调至蓝色。3.10mg/ml溴化乙锭溶液(EB),4℃保存。用时稀释成0.5ug/ml的EB。

四、实验操作步骤

1.琼脂糖凝胶的制备(配制浓度依照所提DNA的大小来确定,0.8%)配0.8%的胶,称到一定

量的琼脂糖,放入锥形瓶中,加入25ml 0.5×TBE缓冲液,置微波炉或水浴加热至完全溶化取出摇匀,得一定浓度。等琼脂糖凝胶溶液冷却至50℃。加入EB液(3ul,原液10mg/ml)。

2.凝胶板的制备

3.加样(样品总体积在10~30ul)

待测DNA中和DNA标准样品中分别加入1/5体积的溴酚蓝指示剂,混匀用移液器加入加样孔。

4.电泳

电压选择为80~120/cm,溴酚蓝移动到距胶板正极端约 1cm时停止电泳。

5.结果观察在254nm紫外光灯下(300nm紫外灯下)

五、实验结果与讨论

1.根据观察结果,按比例绘出凝胶图谱,并注明观察到的DNA亮带。

2.判断所提DNA是否完整,如果断裂或者弥散,分析是在哪些步骤出现的问题。

3. 提DNA及电泳过程都遇到哪些问题,有哪些是在操作中应该注意的。

六、注意事项

思考题

1.各步骤及所加试剂的作用及结果现象

2.核酸的变性?核酸的理化性质

动物肝脏中DNA的提取及检测实验报告(肝相关类)

动物肝脏中DNA的提取及检测 一、前言 脱氧核糖核酸 脱氧核糖核酸(DNA,为英文Deoxyribonucleic acid的缩写),又称去氧核糖核酸,是脱氧核糖核酸染色体的主要化学成分,同时也是组成基因的材料。有时也被称为“遗传微粒”,原因是在繁殖过程中,父代会把它们自己DNA的一部分复制传递到子代中,从而完成性状的传播。 DNA是高分子聚合物,DNA溶液为高分子溶液,具有很高的粘度,可被甲基绿染成绿色。DNA对紫外线(260nm)有吸收作用,利用这一特性,可以对DNA进行含量测定。当核酸变性时,吸光度升高,称为增色效应;当变性核酸重新复性时,吸光度又会恢复到原来的水平。较高温度、有机溶剂、酸碱试剂、尿素、酰胺等都可以引起DNA分子变性,即DNA双链碱基间的氢键断裂,双螺旋结构解开—也称为DNA 的解螺旋。 在细胞内,DNA能与蛋白质结合形成染色体,整组染色体则统称为染色体组。对于人类而言,正常的体细中含有46条染色体。染色体在细胞分裂之前会先在分裂间期完成复制,细胞分裂间期又可划分为:G1期-DNA合成前期、S期-DNA合成期、G2-DNA合成后期。对于真核生物,如动物、植物及真菌而言,染色体主要存在于细胞核内;

而对于原核生物,如细菌而言,则主要存在于细胞质中的拟核内。染色体上的染色质蛋白,如组织蛋白,能够将DNA进行组织并压缩,以帮助DNA与其他蛋白质进行交互作用,进而调节基因的转录。 脱氧核糖核酸的结构 DNA的结构: DNA的结构一般可划分为一级结构、二级结构、三级结构和四级结构四个水平。 DNA是一种长链聚合物,组成单位为四种脱氧核苷酸,即腺嘌呤脱氧核苷酸(dAMP 脱氧腺苷)、胸腺嘧啶脱氧核苷酸(dTMP 脱氧胸苷)、胞嘧啶脱氧核苷酸(dCMP 脱氧胞苷)、鸟嘌呤脱氧核苷酸(dGMP 脱氧鸟苷)。而脱氧核糖(五碳糖)与磷酸分子借由酯键相连,组成其长链骨架,排列在外侧,四种碱基排列在内侧。每个糖分子都与四种碱基里的其中一种相连,这些碱基沿着DNA长链所排列而成的序列,可组成遗传密码,指导蛋白质的合成。读取密码的过程称为转录,是以DNA双链中的一条单链为模板转录出一段称为mRNA(信使RNA)的核酸分子。 DNA是由许多脱氧核苷酸按一定碱基顺序彼此用3’,5’-磷酸二酯键相连构成的长链。大多数DNA含有两条这样的长链,也有的DNA为单链,如大肠杆菌噬菌体φX174、G4、M13等。DNA有环形DNA 和链状DNA之分。在某些类型的DNA中,5-甲基胞嘧啶可在一定限度内取代胞嘧啶,其中小麦胚DNA的5-甲基胞嘧啶特别丰富。在某些

实验九-动物组织中核酸的提取和鉴定

实验七动物组织中核酸的提取和鉴定 【原理】 动物组织细胞中的核糖核酸(RNA)与脱氧核糖孩酸(DNA)大部分与蛋白质结合形成核蛋白。核蛋白可被三氯醋酸沉淀,再用95%乙醇加热可以除去附着在沉淀上的脂类杂质,然后用10%NaCl溶液提取出核酸的钠盐,加入醇可使核酸钠沉淀析出。 先用水由动物肝中提出核蛋白,再籍酚将核酸与蛋白质之间的结合键断裂,并用乙醚抽提去蛋白质及其它杂质,最后用乙醇将核酸沉淀。 核酸(RNA、DNA)可被硫酸水解产生磷酸。有机碱(嘌岭、嘧啶)和戊糖(核糖、脱氧核糖)。 此三类化合物可用下列方法鉴定之。 1、磷酸:能与钼酸试剂作用生成磷钼酸,后者在还原剂的作用下。还原成兰色的钼兰。常用的还原剂有氨基苯磺酸、氯化亚锡,维生素C等。 H3PO4+12H2MoO4→H3PO4·12MoO3 + 12H2O H3PO4·12MoO3H3PO4·6MoO3·3Mo2O5 2、嘌呤碱:能与苦 味酸作用形成针状结晶 3、戊糖: (1)核糖:经与强酸 (盐酸与硫酸)共热生成 糠醛,后者可与3;5二羟 甲基苯缩合成绿色化合 物。 (2)脱氧核糖:在强 酸中加热,可生成ω—羟 基γ—酮基戊醛,后者再 与二苯胺作用生成一蓝 色化合物。 上述二反应如下 【操作】

(一)核酸提取 l、用酚提取法: (1)取小白鼠一只,断头处死,剖腹取肝,置于研钵中,加入玻璃少许,研磨至糊状后,加入蒸馏水3ml,继续研磨约三分钟。 (2)于该研钵中再加酚液5ml,研磨约十分钟后,倒入—-圆底离心管中,离心5分钟(约2000转/分钟)。 (3)用毛细管将上液吸出,置于一圆底离心管中,加乙醚2ml,用拇指将管口按住,用力振摇1—2分钟(提出酚),离心5分钟后,用毛细滴管吸取全部下层液于一圆底离心管中。 (4)于该管中加入95%乙醇2ml,用玻棒搅拌约2分钟,离心3分钟,取出.去上清液,沉淀部分即为核酸。 2、用三氯醋酸提取法 (1)杀兔;取肝,称重,按每克肝脏4ml比例加入1%三氯醋酸,制成肝匀浆。每组量取肝匀浆5ml于带塞离心管中,3000转/分离心5分钟。 (2)将离心后的上清液倾去,于沉淀中加95%乙醇5ml充分混匀,在水浴中加热至沸2分钟,注意酒精沸腾后将火关小,避免酒精蒸汽燃烧。冷却后离心。 (3)倾去上层乙醇液。于沉淀中再加入10%NaCI溶液4ml,置沸水浴中8分钟,并用玻棒不断搅拌,取出;冷却后再离心, (4)将上清液倾入另一离心管中,再离心一次,除去可能存在的微量残渣,将上清液倒入一试管。 取等量95%的乙醇,逐滴加入到上清液中,即可见白色沉淀逐渐出现,静置10分钟后。将其内容物摇匀后倒入一圆底离心管中,离心5分钟,将上液倾去,所得白色沉淀即为核酸钠。 (二)核酸的水解: 在有核酸沉淀的离心管中加入蒸馏水2ml。振摇至沉淀溶解后,加入10%H2SO42mL摇匀,于沸水浴中加热10分钟,即得核酸水解液,用流水冷却后进行下列定性试验。 (三)鉴定: l、嘌呤碱的鉴定: 取中试管一支,加入饱和苦味酸约2ml,再加入核酸水解液4—6滴,摇匀。静置于室温中,观察有无黄色针状结晶出现,。 2、脱氧核糖的鉴定:

动物肝脏中提取DNA

动物肝脏中提取DNA 【实验目的】 1.掌握肝脏DNA分离的原理及操作过程 2.掌握主要试剂的作用 3.熟悉DNA纯度及含量鉴定方法 【实验原理】 动物肝脏。小牛胸腺和鱼类精子含有较多的DNA,是提取DNA的良好材料。动植物的DNA室以核蛋白的形式存在于生物体中(主要在核内),DNA核蛋白(DNP)在0.14mol/L NaCl溶液中溶解度很低,近视它在纯水中的1%。,而在1mol/L NaCl溶液中,其溶解度至少是纯水中的二倍。相反,核糖核蛋白(RNP)能在0.15mol/L NaCl溶液中溶解。利用这一性质,可使脱氧核糖核蛋白与核糖核蛋白分开。 制备过程中,当细胞破碎时,脱氧核糖核酸酶的活性增加,DNA将遭受降解,为此在提取液中加入柠檬酸盐、EDTA做抑制剂,并要求整个提取操作在4℃以下进行,以减少酶对DNA的破坏。 分离得到的DNP,进一步用十二烷基硫酸钠(SDS)使蛋白质变性,用含有异丙醇的氯仿除去变性蛋白,最后用95%的冷乙醇从溶液中把DNA沉淀出来。 DNA纯度可以通过A260/A280进行鉴定,而浓度可以用紫外吸收法、定磷法、二苯胺显色法测定。 【实验操作】 1.取新鲜猪肝脏,除去血水和结缔组织,在冰浴上切成小块,称取10g,加入2倍体积(20ml)0.15mol/L NaCl-0.015mol/L枸橼酸钠缓冲溶液,于组织捣碎机中迅速捣成匀浆,再以玻璃匀浆器2~3次使细胞破碎,最后加缓冲液至50ml。 2.组织匀浆移入离心管内,浸入冰盐溶液中冷却,而后在4℃下6000r/min离心5~10min。弃上清(可用于制备RNA)。将沉淀用2倍体积的冷的上述缓冲液洗涤2次,洗涤时用匀浆器研磨洗涤,离心条件同上。 3.将离心后所得沉淀物悬于5倍体积的0.15mol/L NaCl-0.1mol/L EDTA-Na2(pH8.0)溶液中,而后边搅拌边慢慢滴加5%SDS溶液,直至SDS的最终浓度达到1%为止。然后加入固体NaCl,使其最终浓度达1mol/L。继续不断搅拌30~45min,以确保NaCl

动物肝脏中DNA的提取及检测实验报告

动物肝脏中D N A的提取及检测实验报告 内部编号:(YUUT-TBBY-MMUT-URRUY-UOOY-DBUYI-0128)

动物肝脏中DNA的提取及检测 一、前言 脱氧核糖核酸 脱氧核糖核酸(DNA,为英文Deoxyribonucleic?acid的缩写),又称去氧核糖核酸,是脱氧核糖核酸染色体的主要化学成分,同时也是组成基因的材料。有时也被称为“遗传微粒”,原因是在繁殖过程中,父代会把它们自己DNA的一部分复制传递到子代中,从而完成性状的传播。 DNA是高分子聚合物,DNA溶液为高分子溶液,具有很高的粘度,可被甲基绿染成绿色。DNA对紫外线(260nm)有吸收作用,利用这一特性,可以对DNA进行含量测定。当核酸变性时,吸光度升高,称为增色效应;当变性核酸重新复性时,吸光度又会恢复到原来的水平。较高温度、有机溶剂、酸碱试剂、尿素、酰胺等都可以引起DNA分子变性,即DNA双链碱基间的氢键断裂,双螺旋结构解开—也称为DNA的解螺旋。 在细胞内,DNA能与蛋白质结合形成染色体,整组染色体则统称为染色体组。对于人类而言,正常的体细中含有46条染色体。染色体在细胞分裂之前会先在分裂间期完成复制,细胞分裂间期又可划分为:G1期-DNA合成前期、S期-DNA合成期、G2-DNA合成后期。对于真核生物,如动物、植物及真菌而言,染色体主要存在于细胞核内;而对于原核生物,如细菌而言,则主要存在于细胞质中的拟核内。染色体上的染色质蛋白,如组织蛋白,能够将DNA进行组织并压缩,以帮助DNA与其他蛋白质进行交互作用,进而调节基因的转录。 脱氧核糖核酸的结构

DNA的结构: DNA的结构一般可划分为一级结构、二级结构、三级结构和四级结构四个水平。 DNA是一种长链聚合物,组成单位为四种脱氧核苷酸,即腺嘌呤脱氧核苷酸(dAMP 脱氧腺苷)、胸腺嘧啶脱氧核苷酸(dTMP 脱氧胸苷)、胞嘧啶脱氧核苷酸(dCMP 脱氧胞苷)、鸟嘌呤脱氧核苷酸(dGMP 脱氧鸟苷)。而脱氧核糖(五碳糖)与磷酸分子借由酯键相连,组成其长链骨架,排列在外侧,四种碱基排列在内侧。每个糖分子都与四种碱基里的其中一种相连,这些碱基沿着DNA长链所排列而成的序列,可组成遗传密码,指导蛋白质的合成。读取密码的过程称为转录,是以DNA双链中的一条单链为模板转录出一段称为mRNA(信使RNA)的核酸分子。 DNA是由许多脱氧核苷酸按一定碱基顺序彼此用3’,5’-磷酸二酯键相连构成的长链。大多数DNA含有两条这样的长链,也有的DNA为单链,如大肠杆菌噬菌体φX174、G4、M13等。DNA有环形DNA和链状DNA之分。在某些类型的DNA中,5-甲基胞嘧啶可在一定限度内取代胞嘧啶,其中小麦胚DNA的5-甲基胞嘧啶特别丰富。在某些噬菌体中,5-羟甲基胞嘧啶取代了胞嘧啶。40年代后期,查加夫(E.Chargaff)发现不同物种DNA的碱基组成不同,但其中的腺嘌呤数等于其胸腺嘧啶数(A=T),鸟嘌呤数等于胞嘧啶数(G=C),因而嘌呤数之和等于嘧啶数之和,一般用几个层次描绘DNA的结构。 浓盐法从动物组织中提取DNA 核酸和蛋白质在生物体中常以核蛋白(DNP/RNP)的形式存在,其中DNP能溶于水及高浓度盐溶液,但在0.14 M的盐溶液中溶解度很低,而RNP则可溶于

QIAGEN试剂盒——动物组织样品DNA提取方法

QIAGEN试剂盒提取组织DNA 试验前的注意事项 1、仔细阅读试剂盒使用说明。 2、所有的离心操作应在15-25℃下完成。 3、涡旋一般进行5-10s。 4、对于福尔马林或石蜡浸泡过样品,另见说明。 5、总RNA提取另见说明。 试验准备 1、Buffer ATL 和 Buffer AL保存时可能会出现沉淀,如果必要的话,可置于56°C 水浴至完全溶解。 2、提供的Buffer AW1 和 Buffer AW2是高浓度液,使用前需用96-100%的乙醇稀释至瓶子上注明的使用浓度。 3、预备一个热的振荡器或摇床或摇动的平板至56°C备步骤2使用。 4、如果为冻存的组织,需要将其溶至室温。但是要避免此类的反复溶解。 应额外准备的物品: 200μL枪及枪头;20μL枪及枪头;2mL的微量离心管;96-100%乙醇;56℃水浴锅;离心机(20,000×g(14,000rpm));小镊子;振荡器

操作步骤: 1、取25mg的动物组织(脾脏最多10mg)粉碎成碎片放入1.5ml的微量离心管中。对于啮齿类的尾巴,择取两只小鼠或一只大鼠尾巴0.4-0.6cm。加入180μL buffer ATL,并将对应的动物作以标记。 (保证足够量的组织样本,对于脾脏由于其细胞含量丰富,我们建议不超过10mg。我们强烈建议将组织粉碎以便于溶解提取DNA。最好的方法是在添加bufferATL和蛋白酶K之前置于液氮中冻融。同时,也可以采用QIAGEN公司产的几种组织匀浆机进行组织粉碎) 2、加入20μL蛋白酶K,涡旋混合均匀,56℃孵育直至溶解。在组织溶解的过程中不断(偶尔)涡旋使组织充分散开,或将该微量离心管置于摇晃的平台上,如摇床等。(不同组织溶解时间不同,通常组织为1-3h,小鼠尾巴为6-8h。如果试验条件许可,可以溶解过夜,其不会影响DNA提取) 3、涡旋15s。加入200μL buffer AL 并涡旋使充分混匀,70℃孵育10min,然后加入200μL乙醇(96%-100%),再次涡旋混合。 (如果在做多个样品时,可以将buffer AL和乙醇先混合均匀,一起加入到组织中涡旋均匀。在添加bufferAL与乙醇后可能会出现白色沉淀,该沉淀不会影响试剂盒的操作。一些组织(如脾脏)添加了bufferAL与乙醇后出现凝胶状产物,这种情况下,我们建议剧烈摇晃或涡旋样本使之消失。70℃孵育10min该步骤在我在河南农大用的盒子操作中没有) 4、移出步骤3中的混合物(包括沉淀物)至DNeasy Mini spin column,该柱子放在一2mL收集管中(本试剂盒提供的)。6000 × g(8000 rpm)离心1min,收取管子,弃去滤液。 13000 rpm 5、将DNeasy Mini spin column放入另一2mL的收集管中(本试剂盒提供),加入500μLbuffer AW1,6000×g (8000 rpm)离心1min,收取管子,弃去滤液。 6、将DNeasy Mini spin column 放入另一2mL的收集管中(本试剂盒提供),加入500μLbuffer AW2,20,000 ×g (14,000 rpm)离心3min,使Dneasy膜干燥,收取管子,弃去滤液。 (使DNeasy Mini spin column膜干燥是非常重要的,因为残留的乙醇会影响下面的反应。这个离心步骤就是为了确保没有残留的乙醇影响下步的洗脱。离心后,小心地取出DNeasy Mini spin column防止其与下边的滤液接触。如果与下边的滤液接触沾了少量乙醇则需要再次20,000×g(14,000rpm)离心1mim) 7、向DNeasy Mini spin column膜移入1mL或2mL的微量离心管中(本试剂盒不提供)直接加入200μL buffer AE,清洗DNeasy Mini spin column膜,室温孵育1min,然后6000 × g(8000 rpm)离心1min。 (为了DNA浓度可将200μL buffer AE改为100μL,但是这样会减少DNA的总产量) 8、推荐:如果需要获取最大量的DNA,可将步骤7重复1次。 (使用一个新的1mL或2mL的微量离心管,这样可防止降低前者DNA浓度。当然也可以使用前者离心管) 注意:洗脱液不要多于200μL,以防止滤液过多与DNeasy Mini spin column发生接触。

实验6 动物肝脏中DNA的提取

实验六:动物肝脏中DNA的提取及定量测定 一、实验目的 1、学习和掌握用浓盐法从动物组织中提取DNA的原理与技术。 2、了解常见生化组分提取技术。 3、学习和掌握二苯胺法测定DNA含量的原理和方法。 二、实验原理 核酸和蛋白质在生物体中以核蛋白的形成存在,其中DNA主要存在于细胞核中,RNA 主要存在于核仁及胞质中,在制备核酸时应防止过酸、过碱及其他能引起核酸降解的因素的作用。全部操作过程应在低温下(4℃)进行,必要时还要加入酶抑制剂。如柠檬酸、氰化物、砷酸盐、乙二胺四乙酸(EDTA)等可以抑制DNA酶活性,皂土可抑制RNA酶活性,同时SDS 或苯酚等蛋白变性剂也可使核酸降解酶破坏。 动植物的DNA核蛋白能溶于水及高浓度的盐溶液(如1mol/L NaCl),但在0.14mol/L的盐溶液中溶解度很低,而RNA核蛋白则溶于0.14mol/L盐溶液,可利用不同浓度的氯化钠溶液,将脱氧核糖核蛋白和核糖核蛋白从样品中分别抽提出来。 将抽提得到的脱氧核糖核蛋白用SDS(十二烷基硫酸钠)处理,DNA即与蛋白质分开,可用氯仿-异戊醇将蛋白质沉淀除去,而DNA则溶解于溶液中。向含有DNA的水相中加入冷乙醇,DNA即呈纤维状沉淀出来。 DNA分子中的脱氧核糖基,在酸性溶液中变成w-羟基-r-酮基戊醛,与二苯胺试剂作用生成蓝色化合物(λmax=595nm)。 DNA(脱氧戊糖基) [H+]HO-CH2-C(=O)-CH2-CH2-CHO 二苯胺蓝色化合物 在DNA浓度为20~200μg/ml范围内,吸光度与DNA浓度成正比,可用比色法测定。 三、实验器材 猪肝,分光光度计(595nm),比色杯,匀浆器,量筒(50ml、10ml),离心机(5000r/min),离心管,试管及试管架,移液管(1.0ml、2.0ml、5.0ml),恒温水浴锅 四、实验试剂 氯化钠,柠檬酸钠,95%乙醇,SDS,氯仿,异戊醇,二苯胺试剂,DNA标准溶液(200μg/m1),二苯胺试剂等。 五、实验操作 1、配制溶液: 0.1mol/L NaCl-0.05mol/L柠檬酸钠溶液(2.925g氯化钠,20.85g柠檬酸钠,溶解于500mL 蒸馏水)。 氯仿-异戊醇混合液:按照体积比20:1配制500mL。 5%SDS溶液:10g SDS溶于200ml水中。 二苯胺试剂:称取纯二苯胺(如不纯,需在70%乙醇中重结晶2次)5克溶于500ml 分析纯的冰醋酸中,再加入50ml过氯酸(A.R,60%以上),混匀待用。当所用药品纯净时,配得试剂应为无色。临用前加入5ml 1.6%乙醛溶液(乙醛溶液应保存于冰箱中,一周内可使用),贮于棕色瓶。 2、称取猪肝2g,用匀浆器磨碎(冰浴),加入4ml的0.1mol/L NaCl-0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液,研磨三次,然后倒出匀浆物,匀浆物在4000r/min下离心10min,弃上清;沉淀中再加入6ml缓冲液,于4000r/min离心10min;取沉淀。

动物组织基因组DNA提取试剂盒说明书

磁珠法动物组织基因组DNA提取试剂盒 MagBeads Tissues Gen DNA Extraction Kit 【目录号】TGDE-5005、TGDE-5030 【运输条件】2~25℃; 【保存条件】磁珠悬浮液2~8℃,其它组分室温保存; 【试剂盒组成】 【注意事项】 1. 磁珠悬浮液严禁反复冻融和离心,使用前请充分混匀; 2. 使用前请检查裂解液1和裂解液2是否出现结晶,如有结晶请置于65℃水浴重新溶解; 3. 在使用本试剂盒前,请用户自配80%乙醇; 4. 如需去除RNA请自备RNase A溶液(100mg/mL, 分散液10mM Tris-HCl, 1mM EDTA, pH值8.0); 5. 本操作指南经本公司反复验证,使用前请仔细阅读,并且按照操作指南的建议操作。

磁珠法·自动化:为生命科学提供自动化磁纳米捕获方案 【产品简介】 本产品适用于从各种动物组织以或者细胞样本中提取基因组DNA。试剂盒采用具有独特分离作用的纳米磁珠和独特的缓冲液系统。特殊技术包埋的纳米磁珠在特定条件下对核酸具有极强的亲和力,而当条件改变时可以释放所吸附的核酸,从而达到快速分离纯化核酸的目的。 本试剂盒提取所得基因组DNA产物得量高、纯度好,适用于各种下游分子生物学实验,如:酶切、PCR、QPCR、文库构建、Southern 杂交、芯片检测和高通量测序等。本试剂盒可配合核自动化酸提取仪或工作站使用,实现高通量操作。 【试剂盒说明】 【自备仪器、耗材及试剂】 仪器自动版 研钵(或组织研磨机、匀浆机)、英芮诚ETP-300型全自动核酸提取仪、核酸提取仪配套用磁棒套、水浴锅或金属浴、涡旋振荡仪、96孔方孔圆底板、80%乙醇、异丙醇、液氮。 手动版 研钵(或组织研磨机、匀浆机)、水浴锅或金属浴、涡旋振荡仪、真空干燥箱、80%乙醇、异丙醇、2.0mL离心管、离心管配套用磁力架、液氮。 【仪器自动版操作步骤】 本操作以英芮诚ETP-300型全自动核酸提取仪为例,同步可完成32个样本的提取。 1.准备96孔板 参照下表向96孔板各孔位中分别加入相应试剂:

动物组织细胞基因组DNA提取

动物组织细胞基因组DNA提取 一、实验原理 真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组DNA。真核生物的DNA 是以染色体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、脂类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。 蛋白酶K的重要特性是能在SDS和EDTA(乙二胺四乙酸二钠)存在下保持很高的活性。在匀浆后提取DNA的反应体系中,SDS可破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离,EDTA则抑制细胞中Dnase的活性;而蛋白酶K可将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA 分子完整地分离出来。 二、仪器及试剂 1. 仪器: 恒温水浴锅、台式离心机、紫外分光光度计(GeneQuant)、移液器、玻璃匀浆器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌) 2. 试剂: (1)细胞裂解缓冲液: Tris (pH8.0) 100 mmol/L EDTA (pH 8.0) 500 mmol/L NaCL 20 mmol/L SDS 10%

胰RNA酶20ug/ml (2)蛋白酶K:称取20mg蛋白酶k溶于1ml灭菌的双蒸水中,?C20℃备用。 (3)TE缓冲液(pH 8.0):高压灭菌,室温贮存。 (4)酚?氯仿?异戊醇(25:24:1)、 (5)异丙醇、冷无水乙醇、70%乙醇、灭菌水。 三、操作步骤 1. 取新鲜或冰冻动物组织块0.1g(0.5cm3),尽量剪碎。置于玻璃匀浆器中,加入1ml 的细胞裂解缓冲液匀浆至不见组织块,转入1.5ml 离心管中,加入蛋白酶K (500ug/ml)20μl,混匀。在65℃恒温水浴锅中水浴30min,也可转入37℃水浴12~24h,间歇振荡离心管数次。于台式离心机以12000 rpm离心5min,取上清液入另一离心管中。 2.加2倍体积异丙醇,倒转混匀后,可以看见丝状物,用100ul 吸头挑出,凉干,用200ul TE 重新溶解。(可进行PCR反应等,需要进一步纯化的按下列步骤进行) 3.加等量的酚?氯仿?异戊醇振荡混匀,离心12000 rpm,5min。 4.取上层溶液至另一管,加入等体积的氯仿?异戊醇,振荡混匀,离心12000 rpm,5min。 5. 取上层溶液至另一管,加入1/2体积的7.5mol/L乙酸氨加入2倍体积的无水乙醇,混匀后室温沉淀2min ,离心12000 rpm ,10min。 6.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,将附于管壁的残余液滴除掉。 7.用1ml 70%乙醇洗涤沉淀物1次,离心12000 rpm ,5min。 8.小心倒掉上清液,将离心管倒置于吸水纸上,将附于管壁的残余液滴除掉,室温干燥。 9.加200ul TE重新溶解沉淀物,然后置于4℃或?C20℃保存备用。 10.吸取适量样品于GeneQuant上检测浓度和纯度。

动物肝脏中DNA得提取及检测实验报告

动物肝脏中DNA得提取及检测 一、前言 脱氧核糖核酸 脱氧核糖核酸(DNA,为英文Deoxyribonucleic acid得缩写),又称去氧核糖核酸,就是脱氧核糖核酸染色体得主要化学成分,同时也就是组成基因得材料。有时也被称为“遗传微粒”,原因就是在繁殖过程中,父代会把它们自己DNA得一部分复制传递到子代中,从而完成性状得传播。 DNA就是高分子聚合物,DNA溶液为高分子溶液,具有很高得粘度,可被甲基绿染成绿色。DNA对紫外线(260nm)有吸收作用,利用这一特性,可以对DNA进行含量测定。当核酸变性时,吸光度升高,称为增色效应;当变性核酸重新复性时,吸光度又会恢复到原来得水平。较高温度、有机溶剂、酸碱试剂、尿素、酰胺等都可以引起DNA分子变性,即DNA双链碱基间得氢键断裂,双螺旋结构解开—也称为DNA 得解螺旋。 在细胞内,DNA能与蛋白质结合形成染色体,整组染色体则统称为染色体组。对于人类而言,正常得体细中含有46条染色体。染色体在细胞分裂之前会先在分裂间期完成复制,细胞分裂间期又可划分为:G1期-DNA合成前期、S期-DNA合成期、G2-DNA合成后期。对于真核生物,如动物、植物及真菌而言,染色体主要存在于细胞核内;而对于原核生物,如细菌而言,则主要存在于细胞质中得拟核内。染色体上得染色质蛋白,如组织蛋白,能够将DNA进行组织并压缩,以帮助

DNA与其她蛋白质进行交互作用,进而调节基因得转录。 脱氧核糖核酸得结构 DNA得结构: DNA得结构一般可划分为一级结构、二级结构、三级结构与四级结构四个水平。 DNA就是一种长链聚合物,组成单位为四种脱氧核苷酸,即腺嘌呤脱氧核苷酸(dAMP 脱氧腺苷)、胸腺嘧啶脱氧核苷酸(dTMP 脱氧胸苷)、胞嘧啶脱氧核苷酸(dCMP 脱氧胞苷)、鸟嘌呤脱氧核苷酸(dGMP 脱氧鸟苷)。而脱氧核糖(五碳糖)与磷酸分子借由酯键相连,组成其长链骨架,排列在外侧,四种碱基排列在内侧。每个糖分子都与四种碱基里得其中一种相连,这些碱基沿着DNA长链所排列而成得序列,可组成遗传密码,指导蛋白质得合成。读取密码得过程称为转录,就是以DNA双链中得一条单链为模板转录出一段称为mRNA(信使RNA)得核酸分子。 DNA就是由许多脱氧核苷酸按一定碱基顺序彼此用3’, 5’-磷酸二酯键相连构成得长链。大多数DNA含有两条这样得长链,也有得DNA为单链,如大肠杆菌噬菌体φX174、G4、M13等。DNA有环形DNA与链状DNA之分。在某些类型得DNA中,5-甲基胞嘧啶可在一定限度内取代胞嘧啶,其中小麦胚DNA得5-甲基胞嘧啶特别丰富。在某些噬菌体中,5-羟甲基胞嘧啶取代了胞嘧啶。40年代后期,查加夫(E、Chargaff)发现不同物种DNA得碱基组成不同,但其中得腺嘌呤数等于其胸腺嘧啶数(A=T),鸟嘌呤数等于胞嘧啶数(G=C),因

动物肝脏中DNA的提取

实验报告 实验课程:动物肝脏中DNA的提取学生姓名:15级学长 学号:560311xxxx 专业班级:食科xxx班 2017年 5 月 2 日

实验背景: DNA提取主要是CTAB方法,其他的方法还有物理方式如玻璃珠法、超声波法、研磨法、冻融法。化学方式如异硫氰酸胍法、碱裂解法。生物方式:酶法。根据核酸分离纯化方式的不同有;硅质材料、阴离子交换树脂等。 真核生物基因组DNA广泛应用在动植物的遗传育种、基因图谱的构建、品种鉴定、物种形成和系统演化等方面的研究中.无论是基因工程,还是蛋白质工程,核酸分子都是这些技术应用所涉及的主要对象,所以DNA的分离与提取是分子生物学研究中重要的基本技术.哺乳动物DNA的分离通常是在存在EDTA及SDS去污剂条件下用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提蛋白质而实现的 一、实验目的 学习和掌握用浓盐法从动物组织中提取DNA的原理与技术。二、实验原理 核酸和蛋白质在生物体中常以核蛋白(DNP/RNP)的形式存在,其中DNP能溶于水及高浓度盐溶液,但在0.14M的盐溶液中溶解度很低,而RNP则可溶于低盐溶液,因此可利用不同浓度的NaCl溶液将其从样品中分别抽提出来。将抽提得到的DNP用SDS处理可将其分离成DNA和蛋白质,用氯仿-异戊醇将蛋白质沉淀除去可得DNA上清,加入冷乙醇即可将其呈纤维状析出。

DNA遇二苯胺(沸水浴)会生成蓝色物质,因此可用二苯胺鉴定DNA。 三、实验仪器和材料 1、实验仪器 ①量筒②离心机③离心管④移液枪⑤恒温水浴锅⑥研钵⑦电子天平 2、实验试剂和材料 ①新鲜猪肝②0.1mol/L NaCl-0.05mol/L 柠檬酸钠溶液③95%乙醇④NaCl固体⑤5%SDS溶液⑥V(氯仿):V(异戊醇)20:1的混合液 四、实验步骤 1、称取 2.2g质量的猪肝,加入2倍肝重的0.1mol/L NaCl-0.05mol/L柠檬酸钠缓冲液并用碾砵磨碎;将匀浆倒入两个10毫升离心管中,在4000r/min下离心10min ,沉淀中再加入8 ml缓冲液于4000r/min离心5 min;弃上清,取沉淀。 2、向沉淀中加入檬酸钠缓冲液至10ml,摇匀后将溶液平均分装到2个10毫升离心管中。每个管分别加入2.5 ml 氯仿-异戊醇

动物肝脏中dna的提取及检测实验报告精编WORD版

动物肝脏中d n a的提取 及检测实验报告精编 W O R D版 IBM system office room 【A0816H-A0912AAAHH-GX8Q8-GNTHHJ8】

动物肝脏中DNA的提取及检测 一、前言 脱氧核糖核酸 脱氧核糖核酸(DNA,为英文Deoxyribonucleic?acid的缩写),又称去氧核糖核酸,是脱氧核糖核酸染色体的主要化学成分,同时也是组成基因的材料。有时也被称为“遗传微粒”,原因是在繁殖过程中,父代会把它们自己DNA的一部分复制传递到子代中,从而完成性状的传播。 DNA是高分子聚合物,DNA溶液为高分子溶液,具有很高的粘度,可被甲基绿染成绿色。DNA对紫外线(260nm)有吸收作用,利用这一特性,可以对DNA进行含量测定。当核酸变性时,吸光度升高,称为增色效应;当变性核酸重新复性时,吸光度又会恢复到原来的水平。较高温度、有机溶剂、酸碱试剂、尿素、酰胺等都可以引起DNA分子变性,即DNA双链碱基间的氢键断裂,双螺旋结构解开—也称为DNA的解螺旋。 在细胞内,DNA能与蛋白质结合形成染色体,整组染色体则统称为染色体组。对于人类而言,正常的体细中含有46条染色体。染色体在细胞分裂之前会先在分裂间期完成复制,细胞分裂间期又可划分为:G1期-DNA合成前期、S期-DNA合成期、G2-DNA合成后期。对于真核生物,如动物、植物及真菌而言,染色体主要存在于细胞核内;而对于原核生物,如细菌而言,则主要存在于细胞质中的拟核内。染色体上的染色质蛋白,如组织蛋白,能够将DNA进行组织并压缩,以帮助DNA与其他蛋白质进行交互作用,进而调节基因的转录。 脱氧核糖核酸的结构

实验九动物组织中核酸的提取和鉴定

实验七 动物组织中核酸的提取和鉴定 【原 理】 动物组织细胞中的核糖核酸(RNA)与脱氧核糖孩酸(DNA)大部分与蛋白质结合形成核蛋白。核蛋白可被三氯醋酸沉淀,再用95%乙醇加热可以除去附着在沉淀上的脂类杂质,然后用10%NaCl 溶液提取出核酸的钠盐,加入醇可使核酸钠沉淀析出。 先用水由动物肝中提出核蛋白,再籍酚将核酸与蛋白质之间的结合键断裂,并用乙醚抽提去蛋白质及其它杂质,最后用乙醇将核酸沉淀。 核酸(RNA、DNA)可被硫酸水解产生磷酸。有机碱(嘌岭、嘧啶)和戊糖(核糖、脱氧核糖)。此三类化合物可用下列方法鉴定之。 1、磷酸:能与钼酸试剂作用生成磷钼酸,后者在还原剂的作用下。还原成兰色的钼兰。常用的还原剂有氨基苯磺酸、氯化亚锡,维生素C 等。 H 3PO 4+12H 2MoO 4→H 3PO 4·12MoO 3+12H 2O H 3PO 4·12MoO 3 H 3PO 4·6MoO 3·3Mo 2O 5 2、嘌呤碱:能与苦味酸作用形成针状结晶 3、戊糖: (1)核糖:经与强酸(盐酸与硫酸)共热生成糠醛,后者可与3;5二羟甲基苯缩合成绿色化合物。 (2)脱氧核糖:在强酸中加热,可生成ω—羟基γ—酮基戊醛,后者再与二苯胺作用生成一蓝色化合物。上述二反应如下 【操 作】(一)核酸提取l、用酚提取法:(1)取小白鼠一只,断头处死,剖腹取肝,置于研钵中,加入玻璃少许,研磨至糊状后,加入蒸馏水3ml,继续研磨约三分钟。 (2)于该研钵中再加酚液5ml,研磨约十分钟后,倒入—-圆底离心管中,离心5分钟(约2000转/分钟)。 (3)用毛细管将上液吸出,置于一圆底离心管中,加乙醚2ml,用拇指将管口按住,用力振摇1—2分钟(提出酚),离心5分钟后,用毛细滴管 吸取全部下层液于一圆底离心管中。 (4)于该管中加入95%乙醇2ml,用玻棒搅拌约2分钟,离心3分钟,取出.去上清液,沉淀部分即为核酸。2、用三氯醋酸提取法 (1)杀兔;取肝,称重,按每克肝脏4ml 比例加入1%三氯醋酸,制成肝匀浆。每组量取肝匀浆5ml 于带塞离心管中,3000转/分离心5分钟。 (2)将离心后的上清液倾去,于沉淀中加95%乙醇5ml 充分混匀,在水浴中加热至沸2分钟,注意酒精沸腾

动物肝脏中DNA的提取及检测实验报告

动物肝脏中DNA勺提取及检测 一、前言 脱氧核糖核酸 脱氧核糖核酸(DNA为英文Deoxyribo nucleic acid的缩写),又称去氧核糖核酸,是脱氧核糖核酸染色体的主要化学成分,同时也是组成基因的材料。有时也被称为“遗传微粒”,原因是在繁殖过程中,父代会把它们自己DNA勺一部分复制传递到子代中,从而完成性状的传播。 DNA是高分子聚合物,DNA溶液为高分子溶液,具有很高的粘度, 可被甲基绿染成绿色。DNA寸紫外线(260nm有吸收作用,利用这一特性,可以对DNA进行含量测定。当核酸变性时,吸光度升高,称为增色效应;当变性核酸重新复性时,吸光度又会恢复到原来的水平。较高温度、有机溶剂、酸碱试剂、尿素、酰胺等都可以引起DNA分子变性,即DNA双链碱基间的氢键断裂,双螺旋结构解开一也称为DNA 的解螺旋。 在细胞内,DNA能与蛋白质结合形成染色体,整组染色体则统称为染色体组。对于人类而言,正常的体细中含有46条染色体。染色 体在细胞分裂之前会先在分裂间期完成复制,细胞分裂间期又可划分为:G1期-DNA合成前期、S期-DNA合成期、G2-DNA合成后期。对于真核生物,如动物、植物及真菌而言,染色体主要存在于细胞核内;而对于原核生物,如细菌而言,则主要存在于细胞质中的拟核内。染色体上的染色质蛋白,如组织蛋白,能够将DNA进行组织并压缩,以帮助DNA与其

他蛋白质进行交互作用,进而调节基因的转录。 脱氧核糖核酸的结构 DNA勺结构:DNA的结构一般可划分为一级结构、二级结构、三 级结构和四级结构四个水平。 DNA是一种长链聚合物,组成单位为四种脱氧核苷酸,即腺嘌呤 脱氧核苷酸(dAMP脱氧腺苷)、胸腺嘧啶脱氧核苷酸(dTMP脱氧胸苷)、胞嘧啶脱氧核苷酸(dCMP脱氧胞苷)、鸟嘌呤脱氧核苷酸(dGMP 脱氧鸟苷)。而脱氧核糖(五碳糖)与磷酸分子借由酯键相连,组成其长链骨架,排列在外侧,四种碱基排列在内侧。每个糖分子都与四种碱基里的其中一种相连,这些碱基沿着DNA长链所排列而成的序列,可组成遗传密码,指导蛋白质的合成。读取密码的过程称为转录,是以DNA双链中的一条单链为模板转录出一段称为mRN(信使RNA 的核酸分子。 DNA是由许多脱氧核苷酸按一定碱基顺序彼此用3', 5'-磷酸 二酯键相连构成的长链。大多数DNA含有两条这样的长链,也有的DNA 为单链,如大肠杆菌噬菌体? X174 G4 M13等。DNA有环形DNA 和链状DNA之分。在某些类型的DNA中, 5-甲基胞嘧啶可在一定限度内取代胞嘧啶,其中小麦胚DNA勺5-甲基胞嘧啶特别丰富。在某些噬菌体中,5-羟甲基胞嘧啶取代了胞嘧啶。40年代后期,查加夫 (E.Chargaff )发现不同物种DNA勺碱基组成不同,但其中的腺嘌呤

动物组织基因组DNA的提取

实验一动物组织基因组DNA的提取 一、实验目的 掌握从动物组织中提取总DNA的方法。 二、实验原理 DNA是遗传信息的载体,是最重要的生物信息分子,是分子生物学研究的主要对象,为了进行测序、杂交、基因表达、文库构建等实验,获得高分子量和高纯度的基因组DNA 是非常重要的前提,因此基因组DNA的提取也是分子生物学试验技术中最重要、最基本的操作之一。 染色体存在于细胞核中,外有核膜及胞膜。从组织中提取DNA必须先将组织分散成单个细胞,然后破碎胞膜及核膜,使染色体释放出来,同时去除与DNA结合的组蛋白及非组蛋白。 整个实验可分为细胞裂解、DNA分离与纯化和DNA的洗脱收集。1.细胞裂解:酶法(蛋白酶K)。2. DNA分离与纯化:细胞破碎后,常使用吸附材料结合方法去除杂质和纯化DNA,主要有硅基质材料、阴离子交换树脂和磁珠等。本实验采用TIANGEN血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒中的硅基质材料的离心吸附柱。硅基质材料吸附核酸的原理,主要利用DNA在高盐低pH值环境下与硅基质材料相结合,在低盐高pH值环境下与硅基质材料脱离的特征,高效、专一吸附DNA,可最大限度去除杂质蛋白及细胞中其他有机化合物。 三、材料、试剂和设备 1.材料:动物组织 2.试剂:TIANGEN血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒,无水乙醇等 3.设备:离心机,微量移液器等 四、实验步骤 1.处理材料:取动物组织10mg,尽量切碎,加200μl缓冲液GA,振荡至彻底悬浮。 2.加入20μl蛋白酶K溶液,混匀后56℃水浴,直至组织溶解(不同组织裂解时间不同, 通常需1-3小时即可完成)。简短离心以去除管盖内壁的水珠,再进行下一步骤。(细胞裂解) 3.加入200μl缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10分钟,溶液应变清亮,简短离心以 去除管盖内壁水珠。(溶解DNA) 注意:加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般70℃放置时会消失,不会影响后续实验。如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA量少和提取出的DNA 不纯。 4.加入200μl无水乙醇,充分振荡混匀15s,此时可能出现絮状沉淀,简短离心以去除管 盖内壁的水珠。(沉淀DNA) 5.将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中,吸附柱放入收集管中,

动物基因组DNA的提取 DNA实验技术方法汇总

动物基因组DNA的提取 [实验原理] 在EDTA和SDS等去污剂存在下,用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提,可以得到哺乳动构基因组DNA,用此方法得到的DNA长度为100-150 kb,适用于L嘴菌体构建基因组文库和Southern分析。 通过本实验了解并掌握提取基因组DNA的原理和步骤,以及相对分子质量较大的DNA 的琼脂糖凝胶电泳技术。 [仪器、材料与试剂] (一)仪器 1.台式离心机 2.玻璃匀浆器 3.高压灭菌锅 4.恒温水浴 (二)材料 1.1.5mL微量离心管 2.微量取样器和吸头 3.无菌过滤器(一次性) 4.10 mL注射器 5.鼠肝 6.三羟甲基氨基甲烷(Tris) 7.十二烷基硫酸钠(SDS) 8.乙二胺四乙酸(EDTA)

9.蛋白酶K 10.RNA酶 11.DNA相对分子质量标准物,DNA/EcoRI+HindⅢ相对分子质量标准物 (三)试剂 1、1.5 mol/L NaCl 2、0.5 mol/L Tris·HCI pH8.0 3.0.5 mol/L EDTA pH8.0 4.3 mol/L NaAc pH5.2 以上均高压灭菌。 5.蛋白酶K 10mg/mL配好后用一次性过滤器过滤,-20 保存(教师配制) 6.组织匀浆液100mmol/LNaCI,10mmol/LTris·HCl(pH 8.0),0.25mmol/LEDTA(pH8.0) 7.酶解液200mmol/LNaCI,20mmol/L Tris·HCI(pH 8.O),50mmol/LEDTA(PH 8.0),200~g/mL蛋白酶K,1%SDS 8.无DNA酵的RNA酶:将胰RNA酶溶解于10mmol/L Tris.HCI(pH7.5)、15 mmol /L NaCl溶液中,浓度l0mg/mL,于100℃水浴处理15min,以降解DNA酶,缓慢冷却到室温,-20℃保存 9.TE缓冲液:10mmol/LTris·HCl(pH8.0),25 mmol/LEDTA(pH8.0) 10.平衡酚(pH8.0):氧仿:异戊醇=25:24:1<体积比) 11.氧仿:异戊醇=24:l(体积比) 12.5xTBE 5.4gTris,2.75g硼酸2mL 0.5mol/L EDTA(pH8.0),加水到100mL;13.6x上样缓冲液o.25%溴酚蓝,40%(W/V)蔗糖水溶液

动物肝脏DNA的提取

动物肝脏DNA 的提取 点击: 440 作者: 来源: 时间: 2007-03-07 本站论坛 一、目的: 了解分离提取DNA 的一般原理,掌握从动物肝脏中提取DNA 的方法。 二、原理: 在浓氯化钠(1—2mol·L -1)溶液中,脱氧核糖核蛋白的溶解度很大,核糖核蛋白的溶解度很小。在稀氯化钠(0.14mol·L -1)溶液中,脱氧核糖核蛋白的溶解度很小,核糖核蛋白的溶解度很大。因此,可利用不同浓度的氯化钠溶液,将脱氧核糖核蛋白和核糖核蛋白从样品中分别抽提出来。 将抽提得到的核蛋白用SDS (十二烷基磺酸钠)处理,DNA (或RNA )即与蛋白质分开,可用氯仿一异戊醇将蛋白质沉淀除去,而DNA 则溶解于溶液中。向溶液中加入适量乙醇,DNA 即析出。 为了防止DNA (或RNA )酶解,提取时加EDTA (ethy-lenediamine tetracetic acid ,乙二胺四乙酸)。 三、器材及试剂: 1.器材: ①新鲜猪肝(一次用不完一定要冷冻保存) ②匀浆器 ③离心机5000r·min -1 ④量筒50ml (×1)、10ml (×1) ⑤水浴锅 ⑥纱布 ⑦真空干燥器 2.试剂: ①5mol·L -1 NaCl 溶液:将292.3gNaCl 溶于水,稀释至1000ml 。 ②0.14mol·L -1 NaCl-0.10mol·L -1 EDTA-Na 溶液:溶8.18gNaCl 及37.2gEDTA-Na 于蒸馏水,稀释至1000ml 。 四、操作步骤: 1.取猪肝20~30g ,用适量0.14mol·L-1NaCl-0.10mol·L -1 EDTA 溶液洗去血液,剪碎,加入约30~50ml0.14mol·L -1 NaCl-0.10mol·L -1 EDTA 溶液,置匀浆器或研钵中研磨,研磨一定要充分,待研成糊状后,用单层纱布滤去残渣,将滤液离心10分钟(4000r·min-1)弃去上清液,沉淀用0.14mol·L-1NaCl-0.10mol·L -1 EDTA 溶液洗二、三次。所得沉淀为脱氧核糖核蛋白粗制品。 2.向上述沉淀物加入0.14mol·L -1 NaCl-0.10mol·L-1EDTA 溶液,使总体积为37ml ,然后滴加25%SDS 溶液3ml ,边加边搅拌。加毕,置60℃水浴保温10分钟(不停搅拌)溶液变得粘稠并略透明,取出冷至室温。此步操作系使核酸与蛋白质分离。 3.加入5mol·L -1 NaCl 溶液10ml ,使NaCl 最终浓度达到1mol·L -1,搅拌10分钟,加入约一倍

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