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pubmed检索方法

1. 进入PubMed
Pubmed的网址:http://www.wendangku.net/doc/ae46d6bcf121dd36a32d8260.html/PubMed/
2. 普通检索
在检索式提问框中输入一个或更多的词(例如:vitamin c common cold),PubMed就会利用"自动词语匹配"功能将重要的词或词组用"AND"组合在一起进行检索。输入的词可以是自由词、主题词、或其他指定字段。由于主题词检索的文献更全面、更准确,应尽量使用主题词/副主题词检索。对于某些新的技术词汇、新药、新方法、新疾病等,还没有相应的主题词时,应该用自由词检索。

3. 高级检索
3.1 PubMed检索规则和语法
① 布尔运算符AND,OR,NOT必须大写,例如,vitamin c OR zinc;
② 如想查找词组须用英文双引号,如”t cell receptor”
③ PubMed从左至右进行布尔运算,圆括符可以改变运算顺序;运算顺序是:NOT>AND>OR,利用括号可以不过多考虑运算顺序。如common cold AND (vitamin c OR zinc)。括弧内的字段是作为一个整体来处理的。
④ 如果输入的字段含有主题词组,PubMed优先按词组检索。如果不希望这样,应该加布尔运算符。例如输入:air bladder fistula,PubMed会将"air bladder"作为词组。此时应输入:air AND bladder AND fistula。
⑤ 字段标记符(tag)使用规则:只能在词后加字段标记符,如:romatherapy [mh],mh为主题词缩写,必须用封闭的方括弧[ ],大小写和空格会被忽略,如crabs [mh] = Crabs[MH]。
⑥ 日期格式:采用YYYY/MM/DD[DP]格式,如1998/03/06[dp],1999/10 [EDAT]。月和日可以不写。输入日期范围则用冒号连接,如1996:1998[dp],1998/01:1998/04[dp]。日期字段标记符有3个:Date of Publication [DP] :出版日期;Entrez Date [EDAT] :进入PubMed的日期; MeSH Date [MHDA]:该引文被 MeSH 主题词编入索引的日期。
⑦ 检索须有摘要的文献,使用 "hasabstract"。 如: neoplasms AND hasabstract

3.2. PubMed的检索语法
检索语法格式是:检索词[tag] 布尔运算符 检索词[tag]
例如:要检索作者Dr. Crick在1993年撰写的关于DNA的文献,格式是:
dna [mh] AND crick [au] AND 1993 [dp]
要检索关于热或潮湿与多发性硬化的关系,格式是:
(heat OR humidity) AND multiple sclerosis
检索学龄前儿童哮喘治疗的英文综述文献,格式是:
asthma/therapy [mh] AND review [pt] AND child, preschool [mh] AND english [la]

3.3 作者姓名检索
输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写,不用标点符号)的格式,例如SmithJA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓,PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索,但如果作者的姓是一个MeSH词的时候除外,例如输入Yang,则PubMed将只检索:Yin-Yang[MeSH](阴阳、中医词汇)或Yang[Text Word]。此外,如果

使用双引号""将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来,并用作者检索字段标识符[au]限制,如"smith j"[au],PubMed将关闭自动截词,且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。

3.4 期刊名检索
包括期刊名全称(如molecular biology of the cell)、期刊名MEDLINE缩写(如mol biol cell)、国际标准连续出版物号(ISSN,如1059-1524)。例如,如果输入"New England Journal of Medicine",PubMed将按"N Engl J Med[ta]"查询。应注意:
① 如果杂志名也是一个MeSH词,例如Gene Therapy, Science, 或 Cell,PubMed只会按MeSH词来检索,要想检索杂志名,必须加字段标记[ta],如 gene therapy [ta]。
② 对一个单词的杂志名,也必须加字段标记[ta]。
③ 尽量使用期刊名全称和期刊名MEDLINE缩写检索,在早期的文献中,ISSN号是不能保证检索完全的。
④ 如果杂志名带有参数或引号,应该去掉这些参数或引号,如:J Hand Surg [Am]应该以 J Hand Surg Am 键入。

3.5 截词检索
可以在词尾加*号,来检索有一样词头的所有词, 如输入 bacter*,则会检索 bacter, bacteria, bacterium, bacteriophage 等词,但不会检索带有空格的词组,如 bacteria control。PubMed只能检索前150个相符合的词。此外,截词检索将关闭自动词语匹配功能,也不能进行扩展检索。如:heart attack*不会匹配MeSH词,也不会扩展检索myocardial infarction、myocardial stunning、shock、cardiogenic这些方面的文献。

3.6 检索细节
点击Details按钮,可以查看和编辑检索情况,即可以增加或删除检索词。
还可以从检索细节窗口保存检索项目:点击URL按钮后,用浏览器的书签(或收藏夹)菜单将目前的检索项目作为URL地址以书签形式保存,以便下次再检索。

4. 限定检索(Limits)
可以对多个选项限定检索,以缩小检索范围,提高检索准确率。
限定字段检索的项目有:
4.1 字段选择
可选择:所有字段(All Fields)、作者地址、作者姓名、期刊名、ISSN号码、语种、MeSH词、副主题词、页码、出版日期、自由词、标题词、期刊卷号、数据库更新代码、物资名称等22个选项,默认选项为All Fields。
4.2必须有摘要的文献(Only Items with Abstracts )

为复选框,选中后检索出的文献均有摘要。注意1975年前的文献是没有摘要的。
4.3 出版形式(Publication Types)
包括: Clinical Trial 临床试验;Editorial 编辑按语;Letter 读者来信;Meta-Analysis 荟萃分析 ;Practice Guideline 实践指南 ;Randomized Controlled Trial 随即对照试验 ;Review 综述
4.4 出版语种(Languages )
PubMed 引用了近40种语言的期刊。但下拉式菜单中只有最常检索的几种语言供选择:英语、法语、德语、意大利语、日语、俄语和西班牙语

。如您没有限制语言,PubMed会检索所有语种出版的文献。语种的字段标记符一般取英文的前3个字母表示,如汉语为[chi],德语为[ger],但日语例外,为[jpn] 。
4.5 年龄(Ages )
可在下拉式菜单中选择其中一项。
All Infant: birth-23 month 出生到23月龄的婴儿All Child: 0-18 years 0~18岁的儿童
All Adult:19+ years 所有成年人(19岁以上)
Newborn: birth-1month 新生儿(出生到1个月)
Infant: 1-23 months 婴儿
Preschool Child: 2-5 years 2~5岁的学龄前儿童
Child: 6-12 years 6~12岁儿童
Adolescent: 13-18 years 青春期13~18岁
Adult:19-44 years 19~44岁成年人
Middle Aged:45-64 years 45~64岁
Aged:65+ years 65岁以上
80 and over: 80+ years 80岁以上
4.6 性别(Gender)

4.7 人或动物(Human or Animal)
4.8 子项(Subsets )
包括:目前有9个数据库或过滤检索系统可选:AIDS、AIM、Dental、MEDLINE、Nursing、PreMEDLINE 、Publisher、PubRef、Toxicology。其中MEDLINE, PreMEDLINE和出版商直接提供的电子出版物文献( Publishers)较常用。
4.9 文献进入MEDLINE的时间
有30天、60天、90天、180天、1年、2年、5年和10年选择。
4.10 出版或进入MEDLINE的时间段
应输入时间范围。按照年/月/日的格式。


5. 利用预览/索引(Preview/Index)检索

使用预览/索引可以:预览检索出的文献数量,加快显示速度、一次性地增加检索词来精确检索、增加检索词来检索某些特殊领域、从索引中查看和选择检索词。例如:要检索以"chickenpox"为头的MeSH词,先选择在下拉式菜单的MeSH Terms,在检索框内输入chickenpox,再点击Index按钮。滚动索引Index窗,高亮显示"chickenpox vaccine",点击AND按钮,"Chickenpox vaccine" 就会出现在检索提问框内。 注意: Preview/Index 只能显示最近三次检索的预览结果。而历史(History)窗口能显示多达过去100次的检索请求。
回到目录

6. 利用历史记录(History)检索
PubMed 能保存您所有的检索请求和结果。历史窗口显示检索序号、检索请求、检索时间、检出的文献数。点击检索结果数字,可以阅读检索出的文献。
也可以将历史检索合并,重新检索。方法是在检索序号前加#号,如 #2 AND #6, 或 #3 AND (drug therapy OR diet therapy)。再按Go按钮开始重新检索。
注意: ①历史记录最多保存100条。②若PubMed 停止使用1小时,历史记录就会被删除。③PubMed是利用 cookies 来保存检索历史的,要使用此功能,您的浏览器必须设置为accept cookies。
7. 利用剪贴板(Clipboard)检索

方法与利用历史记录检索相同。注意:①剪贴板最多可加入500条检索。②若PubMed 停止使用1小时,剪贴板记录就会被删除。③PubMed 是利用 cookies 来保存剪贴板记录的,要使用此功能,您的浏览器

必须设置为accept cookies。 ④可对剪贴板内的检索项目再检索,如要限制为检索英文文献,可以这样: #0 AND english [la]。这不会影响或替代剪贴板内容。
可以从剪贴板内保存检索结果,按照作者名、期刊名、出版日期将检索结果重新排序(Sort)。


8. 检索结果的处理
8.1 显示(Displaying)

在检索窗输入检索词后进行检索,PubMed 最初返回是检索结果是文献题录格式,不含摘要,如图7、8。如需查看摘要,点击Display按钮即可。PubMed默认以概要(summary)形式显示检索出的文献。也可以选择其他几种显示形式:大纲(Brief),文摘(Abstract),引文(Citation), MEDLINE and ASN.1。方法:
①显示某篇引文:单击蓝色的有下划线的作者名,显示该篇的摘要等。
②显示所有引文:先在下拉式菜单里选择显示形式,再点击 Display 按钮。
③显示所选的引文:先选中作者名前是选择框,在下拉式菜单里选择显示形式,再点击 Display 按钮。
8.2 显示形式
主要有以下几种形式:
①概要(Summary):显示作者名,题目,期刊名,记录状态(Record Status), 非英语

文献语种提示,文献类型(综述),"无文摘"提示("No abstract available"),PubMed 和 MEDLINE 统一标识码。
②大纲(Brief):作者名,文献题目的前30个单词,统一标识码。
③摘要(Abstract):显示期刊名,记录状态(Record Status), 非英语文献语种提示,文献类型(综述),作者名,作者所属单位,题目,文摘(如果有的话),错误(Erratum),收回(Retraction),注释( Comments), PubMed 和 MEDLINE 统一标识码。
④引文(Citation):在摘要(Abstract)形式上增加显示MeSH词、作为文献标题的人名(Personal Name as Subject),化学物质、研究项目批号、SI数据库进入号码。
⑤MEDLINE :完全 MEDLINE 记录形式,可以下载检索出的文献到某些检索软件再处理。
⑥ASN.1 :ASN.1 (1号文摘语法符号)是一个通用于各种计算机平台检索的国际标准。
⑦XML/SGML :即扩展标记语言,是由国际互联网联盟(W3C)维护的一种标准,它定义用于信息结构的标记语言的语法规则。其显示形式与HTML相似。

8.3 纯文本形式(Text)
点击Text 按钮,可以显示纯文本形式。要回到PubMed显示形式,按浏览器的Backup按钮就可。
8.4 每页显示文献数(Show)
PubMed 默认每页显示20篇文献,点击Show按钮,可以改变每页显示数。
8.5 保存(Saving)
可以保存检索出的全部文献或所选的部分文献。注意:
①在当前页点击保存按钮,可以保存检索的所有的文献,尽管其他页的文献还没有显示。
②最大保存量是10,000篇。
③默认的保存文件名是 query.fcgi。如果需再在文本编辑

器或其他软件编辑和打印,可以改变文件名或保存为存文本格式.txt格式。
④要以超文本标记语言格式 HTML 保存,应使用浏览器的另存为(Save as...)命令。
8.6 链接(Links)
相关的 PubMed 文章链接,点击" Related Articles"按钮。
外部链接(LinkOut) - 可以链接相关的出版商、赞助者、图书馆、生物系数据库、 sequence centers, 和其他的网络资源。这能帮助你得到全文、有关资料。

9. PubMed的其他服务

9.2 MeSH词浏览器
可以输入主题词或关键词进行查找。若输入的检索词不是主题词,PubMed会自动指引到正确的主题词,比如输入"stroke"(中风),PubMed会告知stroke不是一个主题词,而是与主题词 "Cerebrovascular Accident"相关联的词,并对该主题词作简单解释,建议以该主题词检索。
今年MeSH已有19000多个主题词、82个副主题词,加上词组搭配,已经有30多万个词和词组。下面列出康复医学有关康复治疗的主题词,疾病名称和症状的主题词太多,这里从略。值得注意的是,我们习惯称短波、超短波、微波疗法为高频电疗,但其主题词并不是"Electric Stimulation Therapy",而是"Diathermy"(透热疗法)。

附录tag说明
Tag Name 中文说明
AA Abstract Author 表明有作者自己写的文摘
AB Abstract 文摘
AD Affiliation 第一作者所属的机构、地址、资助号等
AU Author Name 作者名
CM Comments 相关的注释
CU Class Update 修改记录日期
CY Country 期刊出版所在国家
DA Date of Entry 引文收入国立医学图书馆机器检索系统的日期
DOI Digital Object Identifier 由出版商给予的永久文章标识号码
DP Publication Date 出版日期
EA English Abstract Indicator 表明有英文文摘的非英语语种出版的文献
EDAT Entrez Date 进入PubMed 数据库的日期
GS Gene Symbol 基因名称缩写
ID Identification Number 研究项目编号、合同号码、资助号码等
IP Issue 期刊期号(第几期)
IS ISSN 国际标准连续期刊号码
JC Journal Title Code 期刊代码
LA Language 语种
LR Last Revision Date 最后修改日期
MH MeSH Terms MeSH词
NI No-Author Indicator 表示匿名作者
PG Page Number 页码
PID Publisher Identifier 出版商使用的标识码
PS Personal Name as Subject 文献标题里的人名
PMID PubMed Unique Identifier Pubmed数据库给予每篇文献的唯一标识码
PT Publication Type 文献出版类型
RF Number of References 综述的参考文献数量
SO Source 文献出处
TA Journal Title Abbreviation 期刊名称 包括期刊名全称、简称、ISSN
TI Title Words 文献标题
TT Transliterated / Vernacular Title 非罗马字母语言文献的翻译后标题
UI MEDLINE Unique Identifier 文献的MEDLINE标识码
URLF URL Full-Text 在早期的PubMed中,全文提供者的网址
URLS URL Summary 在早期的PubMed中,摘要提

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