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UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息

UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息

实用生物信息技术课程第3次作业

1

序列比对

姓名________ 学号______________ 编号_________ 日期__________

1. 从UniProt 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列,进行全局比

对,选择默认计分矩阵BLOSUM62和空位罚分,将比对结果填入表1。分析比对结果,说明得到上述结果的原因和进一步分析思路。

表1 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列比对结果 物种 Species 登录号 Accession

得分 Score 相同氨基酸 Identity

相同和相似氨基酸

Similarity

空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠

/

2. 从RefSeq 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基编码区序列,进行全局比

对,将结果填入表2。选择不同计分矩阵和空位罚分,分析比对结果。 表2 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基mRNA 编码区序列比对结果 物种 Species 登录号 Accession

得分 Score 相同核苷酸 Identity

相同和相似核苷酸

Similarity

空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠

/

3. 从UniProt 数据库中检索并提取人血红蛋白alpha 亚基和胞红蛋白(Cytoglobin )序列,

分别进行全局比对和局部比对,将比对结果填入表3。分析比对结果,说明全局比对和局部比对的差别。

表3 人血红蛋白alpha 亚基和beta 亚基蛋白质序列比对结果

比对方法 长度 得分 相同氨基酸 相同和相似氨基酸 空位 Needle Water 4. 将上述数据库检索、序列比对、结果分析的方法、思路、策略用于和你研究课题相关或

你熟悉的蛋白质及其编码序列,分析比对结果,说明原因。

2.4《网络大数据库的信息检索》教学设计课题

信息技术说课稿 说课题目:《网络数据库的信息检索》 年级:高一年级教科书:《信息技术基础》 说课老师:王琳蝉 工作单位:屯昌县红旗中学 一、说教材: 1、教材地位和作用 本节容是教育科学《信息技术基础》教材第二章第四节“网络数据库的信息检索”的容。本节教材分三部分构成,一是概述,教材通过一个简单的实例来体验从网络数据库获取信息的一般过程,目的是为学习网络数据库的基本知识做准备性的铺垫。二是多样化的网络数据库,教材对这部分容介绍比较多,意在让学生充分体验网络数据库的多样性和学会对各数据库信息的获取方法。三是网络数据库评价,在本章的最后重点安排了网络数据库的评价,目的是进一步提醒教师,在信息获取活动中,要培养学生及时、科学地评价信息的习惯,这是提高获取信息资源质量的关键,也是积累信息获取经验的关键一环。在本课教材访问丰富多彩的数据库这个模块中,应适当引导学生对资源进行点评,引导学生探索数据库这一现代信息管理手段的特点,为第七章中数据库知识的学习打下基础。 2、学生状况分析 ⑴虽然学生在初中有信息课,但是作为副科没有参加升学考试,所以学生在课堂上多数的时间是玩游戏、聊天,没有纠正学习这门课程的学习态度。初中学生上了高中后,其信息技术意识层次不齐,这就要教师有计划培养学生的信息技术意识。 ⑵经过半个学期的学习,高一学生自觉性有所提高一般具备了一定的网络操作技能,这样对于本节课的学习已经有了相关知识上的准备。 3、教学目标 (1)知识与技能目标: ①学生了解网络数据库 ②学会简单的信息检索 ③体会到网络数据库的重要作用 ④运用网络数据库检索获取需要的信息容

(2)能力目标: ①培养学生利用网络数据库提高信息获取的能力 ②引导学生着重从资源获取的角度来审视数据库的价值 (3) 情感与价值观目标: ①在同学的互助下交流合作中,培养合作意识和合作精神 ②培养学生遵守网络道德,规、合法地获取网络资源 4、教学重点与难点: 学习重点:网络数据库的理解、网络数据库的多样性、网络数据库信息的检索 学习难点:对网络数据库信息的检索、学生要用科学的评价方式判断所得信息的准确性 二、说教学 教学过程实质上是学生主动学习的过程,强调激发学生的兴趣,力求形成学生强烈的学习动机和乐学、善学的学习态度。本节是采用任务驱动法导入新课,采取合作探究法解决提出的任务,对于同学们的作答采取了赏识教育法树立大家的自信心。再利用提问启发法去发现新的问题,从而导入本节的容。在新课网络数据库简介中,我采用了列举法和图表法加深对网络数据库概念的理解。网络数据库信息检索的一般过程和数字城市的介绍上都分别用了演示学习法,演示具体的各个操作步骤。网络数据库信息检索的一般过程和教育资源库的使用,都采取小组分工制合作探究法解决提出的任务。 三、说学法 教学指导在于提高学生的个性发展和全面发展。通过本节教学,主要使学生掌握以下几种学习方法: ①培养学生利用教材、网络自主学习的能力 ②培养学生动手操作能力 四、教学过程 1、导入新课 首先复习旧知识,使用任务驱动法导入新课

Uniprot数据库介绍及信息检索下载指南

UniProt数据库 一、UniProt数据库简介 蛋白质组常用数据库——UniProt数据库,是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库。它由Swiss-Prot、TrEMBL 和PIR-PSD三大数据库的数据整合而成,数据主要来自于基因组测序项目完成后,后续获得的蛋白质序列,并包含了大量来自文献的蛋白质生物功能的信息。一般蛋白质组搜库首选数据库也是UniProt,所以对于通过UniProt库搜库的组学数据,可以在此网站中进行蛋白功能查询。UniProt数据库可以提供的信息包括蛋白功能描述、GO条目、细胞定位、组织特异性表达情况、生理病理情况描述、互作蛋白、Domain、翻译后修饰位点等信息。蛋白的信息描述段落均会标出引用文章,并且可以跳转到PubMed界面进行浏览。 UniProt 数据库由UniProt 知识库(UniProtKB )、UniProt 档案(UniParc )、UniProt 参考资料库(UniRef)以及UniProt元基因组学与环境微生物序列数据库(UniMES)构成。 UniProtKB全称 UniProt Knowledgebase(UniProt知识库)它是经过专家校验的数据集,主要由两部分组成:UniProtKB/Swiss-Prot (包含检查过的、手工注释的条目) 和 UniProtKB/TrEMBL (包含未校验的、自动注释的条目)。Swiss-Prot 数据库特点高质量的、手工注释的、非冗余的数据集;主要来自文献中的研究成果和E-value校验过计算分析结果。有质量保证的数据才被加入该数据库!TrEMBL数据集包含高质量的计算分析结果,一般都在自动注释中富集,主要应对基因组项目获得的大量数据流以人工校验在时间上和人力上的不足。它能注释所有可用的蛋白序列。在三大核酸数据库(EMBL-Bank/GenBank/DDBJ)中注释的编码序列都被自动翻译并加入该数据库中。它也有来自PDB数据库的序列,以及Ensembl、Refeq和CCDS基因预测的序列。 UniParc全称是UniProt Archive(UniProt 档案),他是一个综合性的非冗余数据库,它包含了所有主要的、公开的数据库的蛋白质序列。由于蛋白质可能在不同的数据库中存在,并且可能在同一个数据库中有多个版本,为了去冗余,UniaraParc对每条唯一的序列只存一次!无论是否为同一物种的序列,只要序列相同就被合并为一条,每条序列提供稳定的、唯一的编号UPI。该数据库只含有蛋白质的序列信息,而没有注释数据。 UniRef(UniProt 参考资料库)可以通过序列同一性对最相近的序列进行归并,加快搜索速度。UniRef对来自UniProtKB的各种数据包括各种剪接变异体进行了分类汇总,还从UniParc中选取了一些数据以求能完整的、没有遗漏的

实用生物信息技术课程第3次作业UniProt数据库高级检索及数据条目

实用生物信息技术课程第3次作业 1 序列比对 姓名________ 学号______________ 编号_________ 日期__________ 1. 从UniProt 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列,进行全局比 对,选择默认计分矩阵BLOSUM62和空位罚分,将比对结果填入表1。分析比对结果,说明得到上述结果的原因和进一步分析思路。 表1 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基蛋白质序列比对结果 物种 Species 登录号 Accession 得分 Score 相同氨基酸 Identity 相同和相似氨基酸 Similarity 空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠 / 2. 从RefSeq 数据库中提取人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基编码区序列,进行全局比 对,将结果填入表2。选择不同计分矩阵和空位罚分,分析比对结果。 表2 人、小鼠、大鼠血红蛋白alpha 亚基mRNA 编码区序列比对结果 物种 Species 登录号 Accession 得分 Score 相同核苷酸 Identity 相同和相似核苷酸 Similarity 空位 Gaps 人/小鼠 / 人/大鼠 / 小鼠/大鼠 / 3. 从UniProt 数据库中检索并提取人血红蛋白alpha 亚基和胞红蛋白(Cytoglobin )序列, 分别进行全局比对和局部比对,将比对结果填入表3。分析比对结果,说明全局比对和局部比对的差别。 表3 人血红蛋白alpha 亚基和beta 亚基蛋白质序列比对结果 比对方法 长度 得分 相同氨基酸 相同和相似氨基酸 空位 Needle Water 4. 将上述数据库检索、序列比对、结果分析的方法、思路、策略用于和你研究课题相关或 你熟悉的蛋白质及其编码序列,分析比对结果,说明原因。

高级数据库工程师的基本职责

高级数据库工程师的基本职责 高级数据库工程师需要负责数据库进行容量规划、架构设计,提高业务高可用性和容灾能力。以下是小编整理的高级数据库工程师的基本职责。 高级数据库工程师的基本职责1 职责: 1、负责公司oracle、DB2数据库及相关系统维护管理、性能调优工作; 2、参与公司数据分析产品的大数据基础架构设计与优化,设计数据整体架构及其细节; 3、负责公司各个项目的数据库系统部署方案的计划、设计和实施指导,参与项目的数据库设计; 4、指导各个实施项目成员,对数据库语句进行优化,解决性能问题; 5、负责研发及使用新技术和新架构满足日益增长的数据需求;

6、负责数据库的日常维护,包括:日常维护,性能监控,性能优化,安全管理等。 任职要求: 1. 计算机相关专业大学本科及以上学历,具备三年以上大型Oracle、DB2数据库DBA或数据仓库架构设计经验,精通数据库管理与优化; 2. 精通ORACLE、DB2等主流数据库的管理,要求具备有较强的故障定位和问题分析、解决能力;具备一年以上Hadoop、GreenPlum、NoSQL等大数据技术平台实施、部署、优化经验; 3. 丰富的数据库维护经验,擅于分析运行瓶颈,并提供改进方案;精通数据库的性能优化、SQL调优技术,对高并发数据库的锁和事务隔离问题有深入理解;精通数据库容量规划和分表设计方法,有海量数据库设计和支持经验; 4. 熟悉UNIX/LINUX等主流OS平台,理解操作系统原理,具备脚本编写能力(SHELL/PERL/PYTHON),并善于利用脚本解决问题; 5. 熟悉RAC/PureScale/GoldenGate/CDC等高可用技术; 6. 善于数据库架构的规划,能设计主机、存储、数据库的整体方案;

北邮数据库原理与应用阶段作业

一、单项选择题(共10道小题,共100.0分) 1. 数据库事务的隔离性通过_______实现。 2. 1.DBMS的事务管理子系统 2.应用程序员 3.DBMS的并发控制机制 4.DBMS的恢复子系统 知识点:事务的概念 学生答案:[C;] 标准答 案: C; 得分:[10]试题分 值: 10.0 提示: 3. 数据库的一致性状态由_______来负责。 4. 1.DBMS的事务管理子系统 2.应用程序员 3.DBMS的并发控制机制 4.DBMS的恢复子系统 知识点:事务的概念 学生答案:[B;] 标准答 案: B; 得分:[10]试题分 值: 10.0 提示: 1. 事务开始前,数据库处于一致性的状态;事务结束后,数据库必须仍处

于一致性状态。这指的是事务的_____。 2. 1.一致性 2.隔离性 3.持久性 4.原子性 知识点:事务的概念 学生答案:[A;] 标准答 案: A; 得分:[10]试题分 值: 10.0 提示: 1. 一个事务一旦提交之后,它对数据库的影响必须是永久的,无论发生何种系统故障。这指的是事务的____。 2. 1.一致性 2.隔离性 3.持久性 4.原子性 知识点:事务的概念 学生答案:[C;] 标准答 案: C; 得分:[10]试题分 值: 10.0 提示: 1. 系统必须保证事务不受其它并发执行事务的影响,这指的是事务的________。 2.

2.隔离性 3.持久性 4.原子性知识点:事务的概念 学生答案:[B;] 标准答 案: B; 得分:[10]试题分 值: 10.0 提示: 1. 一个事务中所有对数据库的操作是一个不可分割的操作序列。每个事务的操作序列要么都被成功地执行,要么一个也不被执行,这指的是事务的______。 2. 1.一致性 2.隔离性 3.持久性 4.原子性 知识点:事务的概念 学生答案:[D;] 标准答 案: D; 得分:[10]试题分 值: 10.0 提示: 1. DBS运行的最小逻辑单位是__________。 2. 1.事务 2.表 3.属性

网络数据库的信息检索教案

《网络数据库的信息检索》教学设计 一、教材内容分析 本节内容是教育科学出版社《信息技术基础》教材第二章第四节“网络数据库的信息检索”的内容。本节教材分三部分构成,一是概述,教材通过一个简单的实例来体验从网络数据库获取信息的一般过程,目的是为学习网络数据库的基本知识做准备性的铺垫。二是多样化的网络数据库,教材对这部分内容介绍比较多,意在让学生充分体验网络数据库的多样性和学会对各数据库信息的获取方法。三是网络数据库评价,在本章的最后重点安排了网络数据库的评价,目的是进一步提醒教师,在信息获取活动中,要培养学生及时、科学地评价信息的习惯,这是提高获取信息资源质量的关键,也是积累信息获取经验的关键一环。在本课教材访问丰富多彩的数据库这个模块中,应适当引导学生对资源进行点评,引导学生探索数据库这一现代信息管理手段的特点,为数据库知识的学习打下基础。 二、学生情况分析 学生已具备了一定的网络操作技能,对本节课的学习已经有了相关知识上的准备。在前面的课中,学生在不经意中已经使用到了网络数据库,比如小说网、音乐网等等,只是自己不知道而已。本节课选用有较强的代表性而学生一般都没有使用过的网络数据库。 三、教学目标分析 (1)知识与技能目标:

了解网络数据库;学会简单的信息检索;运用网络数据库检索获取需要的信息内容 (2)能力目标: ①培养学生利用网络数据库提高信息获取的能力 ②引导学生着重从资源获取的角度来审视数据库的价值 (3) 情感与价值观目标: ①在同学的互助下交流合作中,培养合作意识和合作精神 ②培养学生遵守网络道德,规范、合法地获取网络资源 四、重难点分析 重点:理解网络数据库、网络数据库的多样性、网络数据库信息的检索难点:对网络数据库信息的检索、评价 五、教学策略设计 教学过程实质上是学生主动学习的过程,强调激发学生的兴趣,力求形成学生强烈的学习动机和乐学、善学的学习态度。本节是采用情景设置法,从“神奇的化学实验——大象牙膏”入手,吸引学生的学习兴趣,引导学生进入欢快的化学学习之旅。然后设置疑问:你能帮化学教师搜索到不同版本的教学资料吗?进而导入本节的内容——利用网络数据库来解决问题。在进行网络数据库新课内容时,通过设计自主学习、合作探究、任务驱动及成果展现四个大环节,让学生去认识、感受、体验、评价网络数据库。使学生对网络数据库信息检索这一重难点从感性认识提升到理性理解,从而实现本节课的学习目标。 六、教学资源与媒体准备

数据库技术与应用(第二版)课后答案

第1章习题参考答案 1.思考题 (1)什么是数据库、数据库管理系统、数据库系统?它们之间有什么联系? 答:数据库是存贮在计算机内的有结构的数据集合;数据库管理系统是一个软件,用以维护数据库、接受并完成用户对数据库的一切操作;数据库系统指由硬件设备、软件系统、专业领域的数据体和管理人员构成的一个运行系统。 (2)当前,主要有哪几种新型数据库系统?它们各有什么特点?用于什么领域,试举例说明?答:主要有:分布式数据库、面向对象数据库、多媒体数据库、数据仓库技术、空间数据库。 (3)什么是数据模型?目前数据库主要有哪几种数据模型?它们各有什么特点? 答:数据模型是一组描述数据库的概念。这些概念精确地描述数据、数据之间的关系、数据的语义和完整性约束。很多数据模型还包括一个操作集合。这些操作用来说明对数据库的存取和更新。数据模型应满足3方面要求:一是能真实地模拟现实世界;二是容易为人们理解;三是便于在计算机上实现。目前在数据库领域,常用的数据模型有:层次模型、网络模型、关系模型以及最近兴起的面向对象的模型。 (4)关系数据库中选择、投影、连接运算的含义是什么? 答: 1)选择运算:从关系中筛选出满足给定条件的元组(记录)。选择是从行的角度进行运算,选择出的记录是原关系的子集。 2)投影运算:从关系中指定若干个属性(字段)组成新的关系。投影是从列的角度进行运算,得到的新关系中的字段个数往往比原关系少。 3)连接运算:将两个关系按照给定的条件横向拼接成新的关系。连接过程是通过两个关系中公有的字段名进行的。 (5)关键字段的含义是什么?它的作用是什么? 答:一个关系中可以确定一个字段为关键字段,该字段的值在各条记录中不能有相同的值。(如:门牌号码);关键字段的作用主要是为建立多个表的关联和进行快速查询。 (6)什么是E-R图?E-R 图是由哪几种基本要素组成?这些要素如何表示? 答:E-R图也称实体-联系图(Entity Relationship Diagram),提供了表示实体类型、属性和联系的方法,用来描述现实世界的概念模型。构成E-R图的基本要素有3种,即实体、属性和联系。其表示方法为:用矩形框表示现实世界中的实体,用菱形框表示实体间的联系,用椭圆形框表示实体和联系的属性,实体名、属性名和联系名分别写在相应框内。ABAAC ABCAA 第2章习题解答 1. 思考题 (1)在SQL Server 2008中的数据库中包含哪些对象?其中什么对象是必不可少的?其作用又是什么? 答:SQL Server 2008中的数据库对象主要包括数据库关系图、表、视图、同义词、可编程性、Service Broker、存储和安全性等。其中表对象是必不可少的。表是由行和列构成的集合,用来存储数据。 (2)SQL Server提供的系统数据库master它的作用是什么?用户可以删除和修改吗?为什么?答:master 数据库记录SQL Server 系统的所有系统级信息。主要包括实例范围的元数据、端点、链接服务器和系统配置设置以及记录了所有其他数据库的存在、数据库

uniprot

全球蛋白资源数据库UniProt 收藏 UniProt 是一个集中收录蛋白质资源并能与其它资源相互联系的数据库,也是目前为止收录蛋白质序列目录最广泛、功能注释最全面的一个数据库。UniProt 是由欧洲生物信息学研究所(European Bioinformatics Institute)、美国蛋白质信息资源(Prontein Information Resource)以及瑞士生物信息研究所(Swiss Institute of Bioinformatics)等机构共同组成的UniProt协会(UniProt Consortium)编辑、制作的一个信息资源,旨在为从事现代生物研究的科研人员提供一个有关蛋白质序列及其相关功能方面的广泛的、高质量的并可免费使用的共享数据库。 UniProt 是一个向所有使用者免费开放的数据库,全球科研人员都可以登陆网站https://www.wendangku.net/doc/cf4897827.html, 浏览并下载这些资料。借助它,科研人员可以对目的蛋白进行交互式分析或特定的分析。 1 UniProt数据库的构成 UniProt 数据库由UniProt 知识库(UniProtKB )、UniProt 档案(UniParc )、UniProt 参考资料库 (UniRef)以及UniProt元基因组学与环境微生物序列数据库(UniMES)构成。 1.1 UniProt知识库(UniProtKB) UniProt 知识库是一个专家级的数据库,它可以通过与其它资源进行交互查找的方式为用户提供一个有 关目的蛋白质的全面的综合信息。 UniProtKB包括两个组成部分:UniProtKB/Swiss-Prot与UniProtKB/TrEMBL。 1.1.1 UniProtKB/Swiss-Prot UniProtKB/Swiss-Prot 主要收录人工注释的序列及其相关文献信息和经过计算机辅助分析的序列。这 些注释都是由专业的生物学家给出的,准确性无需置疑。在UniProtKB中,注释包括对蛋白质功能、酶学特 性、具有生物学意义的相关结构域及位点、翻译后修饰情况、亚细胞定位、组织特异性、发育阶段特异性、 结构、相互作用、剪接异构体、相关疾病信息的注释等等。注释的另一个重要工作就是对同一蛋白的所有相 关报道进行归纳、总结。对蛋白质序列进行仔细检查之后,注释人员还会将相关参考序列、剪接变异体、基 因变异体和疾病相关信息全都整合起来,而且不同序列间有任何的差异也会标示出来。注释人员还会将蛋白 质数据与其它核酸数据库、物种特异性数据库、结构域数据库、家族遗传史或疾病资料数据库进行交叉参 考。 1.1.2 UniProtKB/TrEMBL UniProtKB/TrEMBL 收录的则是高质量的经计算机分析后进行自动注释和分类的序列。计算机辅助 注释使用的是Spearmint 规则,而人工注释依据的则是蛋白质家族规则,包括HAMAP 家族规则(HAMAP family rules )、RuleBase 规则、PIRSF 分类命名规则以及位点规则。UniProtKB/TrEMBL

高级数据库技术试卷

《高级数据库技术与应用》期末试题(2013) 1.数据库技术发展阶段如何划分,简述当前数据库技术热点和发展趋势。 (1)数据库技术发展阶段 数据库技术的发展,已经成为先进信息技术的重要组成部分,是现代计算机信息系统和计算机应用系统的基础和核心。数据库技术最初产生于20世纪60年代中期数根据数据模型的发展,可以划分为三个阶段:第一代的网状、层次数据库系统;第二代的关系数据库系统;第三代的以面向对象模型为主要特征的数据库系统。 第一代数据库的代表是1969年IBM公司研制的层次模型的数据库管理系统IMS和70年代美国数据库系统语言协商CODASYL下属数据库任务组DBTG提议的网状模型。层次数据库的数据模型是有根的定向有序树,网状模型对应的是有向图。这两种数据库奠定了现代数据库发展的基础。这两种数据库具有如下共同点:1.支持三级模式(外模式、模式、内模式)。保证数据库系统具有数据与程序的物理独立性和一定的逻辑独立性;2.用存取路径来表示数据之间的联系;3.有独立的数据定义语言;4.导航式的数据操纵语言。 第二代数据库的主要特征是支持关系数据模型(数据结构、关系操作、数据完整性)。关系模型具有以下特点:1.关系模型的概念单一,实体和实体之间的连系用关系来表示;2.以关系数学为基础;3.数据的物理存储和存取路径对用户不透明;4.关系数据库语言是非过程化的。 第三代数据库产生于80年代,随着科学技术的不断进步,各个行业领域对数据库技术提出了更多的需求,关系型数据库已经不能完全满足需求,于是产生了第三代数据库。主要有以下特征:1.支持数据管理、对象管理和知识管理;2.保持和继承了第二代数据库系统的技术;3.对其它系统开放,支持数据库语言标准,支持标准网络协议,有良好的可移植性、可连接性、可扩展性和互操作性等。第三代数据库支持多种数据模型(比如关系模型和面向对象的模型),并和诸多新技术相结合(比如分布处理技术、并行计算技术、人工智能技术、

UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息

UniProt数据库高级检索及数据条目注释信息 姓名________ 学号______________ 编号_____ 日期________ 1.人珠蛋白家族检索 1)写出从UniProt数据库中检索已审阅的人珠蛋白(globin)家族12个亚基的步骤。 2)列表说明这12个珠蛋白的登录号、蛋白质名称、和序列长度。 3)与血红蛋白alpha亚基差异最大的序列是哪个?相同位点百分比? 4)与血红蛋白beta亚基差异最小的序列是哪个?差异位点共多少个? 3.列表说明从UniProt数据库中检索以下序列条目的步骤和结果: 1)所有拟南芥序列 2)已审阅拟南芥序列 3)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据的序列 4)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、且具有跨膜螺旋的序列 5)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋和信号肽的序列 6)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋和信号肽、并具有二硫键的序 列 7)已审阅拟南芥序列中具有蛋白质证据、具有跨膜螺旋、信号肽、二硫键,且已经测 定三维结构的序列 3.课题相关蛋白检索 1)UniProt数据库中与你研究课题相关的物种共有多少序列条目 2)其中已审阅的序列条目有多少 3)上述已审阅的序列条目中具有蛋白质证据的有多少 4)上述具有蛋白质证据的条目中与你们实验室研究方向相关的有多少 5)上述具有与你们实验室研究方向相关的序列中与你课题相关的有多少 4.血红蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝) 1)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括几类相关文献。 2)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括几类注释信息。 3)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括哪些特征位点信息。 4)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目包括哪几类数据库交叉链接,其中 你最感兴趣的有哪些数据库。 5.豌豆内膜蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝) 1)以豌豆内膜蛋白PPF1_PEA为例,说明该序列条目包括哪些注释信息。 2)通过注释信息或高级检索,查找拟南芥中与PPF1_PEA属于同一家族的内膜蛋白。 3)通过查看注释信息和多序列比对,找出拟南芥中PPF1_PEA的直系同源蛋白 ALB3_ARA TH。 4)查看ALB3_ARATH的注释信息,特别是拟南芥专门数据库AraPort和TAIR,并与 PPF1_PEA的注释信息进行比较,说明如何将模式生物研究结果用于非模式生物。 6.课题相关蛋白注释信息(请在认真查看注释信息基础上用中文总结,不要用屏幕拷贝) 1)以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括几类相关文献。 2)以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括几类注释信息。 3)以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括哪些特征位点信 息。 4)以研究课题相关或你感兴趣的蛋白质为例,说明该序列条目包括哪几类数据库交叉 链接,其中你最感兴趣的有哪些数据库。

大数据库应用技术模拟精彩试题

数据库应用技术模拟试题1 一、单项选择题(每个题只有一个答案是正确的,请将正确的答案填写到括号内。) 1.下列功能中,不属于数据库管理系统功能的是(B)。 A、数据库对象定义 B、数据库文件读写 C、数据查询 D、数据更新 2.下列类型中,属于定点小数类型的是(A)。 A、numeric B、int C、datetime D、real 3.对char(10)类型的列,若存储“电视”,其占用的字节数是(C)。 A、4 B、5 C、10 D、20 4.下列条件子句中,能够筛选出成绩在60~80(包括边界值)的是(B)。 A、Where 成绩 >= 60 OR成绩 <= 80 B、Where成绩 >= 60 AND成绩 <= 80 C、Where 60 <= 成绩 <= 80 D、Where成绩 IN(60..80)

5.下列关于聚集索引与非聚集索引的说法,正确的是(C)。 A、在一个表上可以建立多个聚集索引和多个非聚集索引 B、在一个表上可以建立多个聚集索引和最多一个非聚集索引 C、在一个表上可以同时存在聚集索引和非聚集索引 D、必须先建立聚集索引,然后再建立非聚集索引 6.下列关于触发器的说法,正确的是(B)。 A、后触发型触发器是在触发器执行完成后再执行引发触发器执行的语句 B、触发器是由数据更改操作引发的自动执行的代码 C、引发触发器执行的操作可以是SELECT D、CREATE TRIGGER tri ON table1 FOR INSERT定义的是前触发型触发器 7.可以利用Connection对象的Execute方法实现对数据库的更改操作。下列将SC表中学号为S105的学生的成绩减少10分的语句,正确的是(C)。 A、ADOcn.Execute “ALTER SC SET Grade = Grade - 10 WHERE 学号 = 'S105' ” B、ADOcn.Execute “ALTER FROM SC SET Grade = Grade - 10 WHERE 学号 = 'S105' ” C、ADOcn.Execute “UPDATE SC SET Grade = Grade - 10 WHERE 学号 ='S105' ” D、ADOcn.Execute “UPDATE FROM SC SET Grade = Grade - 10 WHERE 学号 = 'S105' ” 8.下列声明并创建Connection对象的语句,正确的是(B)。 A、Dim ADOcn As Connection B、Dim ADOcn As New Connection C、Declare ADOcn As New Connection D、Declare ADOcn As Connection 9.若有学生表Student,结构为:学生(学号,姓名,所在系),选课表SC结构为:选课(学号,课程号,成绩)。现要查询信息工程系学生的姓名和所选的课程号。下列关系代数表达式正确的是(C)。 A、σ姓名,课程号( ∏所在系=‘信息工程’ (SCStudent)) B、σ姓名,课程号( ∏所在系=‘信息工程’ SCStudent)

数据库应用技术考试必过

一、选择题 1.三级模式间存在两种映射,它们是(模式与子模式间,模式与内模式间)。 2.SQL Server系统中的所有系统级信息存储于哪个数据库 ( master )。 3.下面关于tempdb数据库描述不正确的是(是用户建立新数据库的模板)。 4.在数据库技术中,面向对象数据模型是一种(结构模型)。 5.数据库管理系统常见的数据模型有(层次、关系和网状)。 6.用户看到的数据表,属于数据库系统三级模式中的(模式) 7.对数据的插入属于数据库管理系统(数据操纵)的功能。 8.保持数据的完整性属于数据库管理系统( C )的功能。C.数据库的运行管理 9.在SQL Server数据库中,默认情况下Sys通常是( C )。C.系统表表名的前缀 10.设一个关系为R,如果它的每个属性都是不可再分的,则称这个关系是符合( A )。A.第一范式 11.在第一个关系中出现,在第二个关系中不出现的记录组成的关系称为两个关系的( C )。C.差 12.关系数据库规范化是为了解决关系数据库中的( A )问题。A.插入、删除和数据冗余B.提高查询的速度 13.关系模式中,满足2NF的模式,( B )。B.必定是1NF 14.下述关于索引的描述,正确的是(B).建立索引后,会影响基本表的插入速度 15.下述关于视图的描述,正确的是C.在SQL Server中,可以像基本表一样对视图进行查询操作 16.如果希望从学生表中查询出所有姓“张”的同学,那么条件语句应该是( Where 姓名 LIKE ‘张%’)。 17.下列SQL语句中,能够完成求某列最大值的是( B )。B.SELECT MAX(Age) FROM Student 18.假定学生关系S (SNO,SNAME,SEX,AGE),课程关系C (CNO,CNAME,TEACHER),学生选课关系SC(SNO,CNO,GRADE)。要查询选修了“计算机技术”课程的“女”学生姓名,将涉及到关系( D )。D.S,C,SC 19.如果希望从学生表中查询出所有 姓“李”的同学,那么条件语句应该 是(B)。B、Where 姓名 LIKE ‘李%’ 20.在一个教师关系中,能够成为主 关键字(或称主码)的属性是(B)。 B、教师编号 21.从最终用户应用程序的视角看, 数据库系统的三级模式结构是(C)。 C、外模式、模式和内模式 22.在一个学生关系中,能够成为主 关键字(或称主码)的属性是(C)。 C、学号 23.有严格的数学基础的数据模型是 (A)。A、关系模型 24.下列关于索引的说明不正确的是 (A)。A、索引必须创建在主关键字 之上 25.设关系R是满足第一范式的,若R 中不存在非主属性对主键的部分函数 依赖,则R符合(A)。A、第二范式 26.下列符合第三范式的关系是 (D)。D、学生(学号,姓名,性 别) 27.在第一个关系中出现,而在第二 个关系中不出现的记录组成的新关系 称为(D)。D、两个关系的差 28.数据库应用程序开发中,需求分 析阶段的主要目的是(A)。A、回答 “干什么”的问题 29.用户使用SQL Server时,通常需 要依次经过两个安全性阶段(C)。 C、身份验证、权限认证 30.SQL Server数据库中的一个完整 的备份通常要包括(A)。A、系统数 据库、用户数据库和事务日志 31.下列哪些不属于索引的类型 (D)。D、事务日志索引 32.下列SQL语句中,能够完成并运 算的是(A)。A、SELECT * FROM 篮 球爱好者UNION SELECT * FROM 足球 爱好者 33.设学生表和课程表的结构分别为 (学号,姓名)和(学号,课程号, 成绩),如果希望查询出“成绩大于 90分的学生姓名”,则对应的SQL语 句是(D)。D、SELECT 姓名 FROM 学 生表,课程表 WHERE 学生表.学号=课 程表.学号 AND 课程表.成绩>90 34.如果希望从学生表中查询出所有 姓“王”的同学,那么条件语句应该 是( B )。B、Where 姓名 LIKE ‘王%’ 35.通常情况下,“数据库管理系 统”的英文缩写是(DBMS )。 36.从最终用户应用程序的视角看,数 据库系统的三级模式结构是( C )。 C、外模式、模式和内模式 37.在一个学生关系中,能够成为主关 键字(或称主码)的属性是(学号)。 38.有严格的数学基础的数据模型是 ( A )。A、关系模型 39.下列关于索引的说明不正确的是 ( A )。A、索引必须创建在主关键字 之上 40.设关系R是满足第一范式的,若R 中不存在非主属性对主键的部分函数依 赖,则R符合( A )。A、第二范式 41.下列符合第三范式的关系是 (D)。D、学生(学号,姓名,性 别) 42.在第一个关系中出现,而在第二个 关系中不出现的记录组成的新关系称为 (D)。D、两个关系的差 43.数据库应用程序开发中,需求分析 阶段的主要目的是( A )。A、回答 “干什么”的问题 44.用户使用SQL Server时,通常需 要依次经过两个安全性阶段 ( C )。C、身份验证、权限认证 45.SQL Server数据库中的一个完整的 备份通常要包括( A )。A、系统数 据库、用户数据库和事务日志 46.SQL Server中进行数据库恢复的 SQL语句是( C )。C、RESTORE DATABASE 47.下列SQL语句中,能够完成并运算 的是( A )。A、SELECT * FROM 篮 球爱好者 UNION SELECT * FROM 足 球爱好者 48.设学生表和课程表的结构分别为 (学号,姓名)和(学号,课程号,成 绩),如果希望查询出“成绩大于90 分的学生姓名”,则对应的SQL语句是 ( D )。D、SELECT 姓名 FROM 学 生表,课程表 WHERE 学生表.学号=课 程表.学号 AND 课程表.成绩>90 49.关系数据库系统采用关系模型作为 数据的组织方式。关系模型通常由三部 分组成()。A.数据结构、关系操作 集合和关系的完整性

中国知网数据库信息检索__含答案

1、吉林农业大学图书馆用户利用登录“中国知网——中国知识资源总库” 分别是:___ 和___ 。利用CNKI“高级检索”主题途径的 精确检索,检索2007- 2008年题名包含“世界读书日”的期刊文章共有相关记录___条。阅读全文时 CAJ文件需要先下载安装___ 全文浏览器。吉林农业大学___ 于2007年撰写的___ ___ 一文,专门讨论高校文化建设。 2、利用中国知识资源总库(https://www.wendangku.net/doc/cf4897827.html,)的“跨库高级检索”,检索出主题为“世界读书 日”和“阅读社会”的论文共有相关记录___ 条。 3、如何利用中国知网数据库了解某一项专利核心技术领域国内及世界来源分布情况? 4、如何利用中国知网数据库对我国有关玉米研究情况进行分析? 5、如何利用中国知网数据库的中国农业博硕士论文库

(https://www.wendangku.net/doc/cf4897827.html,/grid2008/index/ZKCAKD.htm)检索学位授予单位是南京农业大学,由学者沈益新指导的有关绿肥作物的硕士论文? 6、如何通过中国知网数据库检索到有关酶工程领域所涉核心技术研究动态的相关文献以及某一专利的核心技术领域国内来源分布和世界来源分布情况? 7、如何通过中国知网数据库检索出同时满足下列检索条件的文献?发表时间:1983.01.01-2008.12.31;题名:大豆;作者:徐克章;单位:吉林农业大学;文献来源:大豆科学。 8、如何通过中国知网数据库检索出同时满足下列检索条件的文献?项目性质:国家自然科学基金;项目承办单位:吉林农业大学。负责人:钱爱东

9、利用中国知网数据库数据库检索中科双高期刊中影响因子排在第三位的期刊刊名 10、利用中国知网数据库检索我校文献被引用频次最高的畜牧与动物医学专业博士生导师是哪位? 11、如何检索吉林农业大学在2000年至今的农业工程类期刊文章数目? 12、如何查找北京大学出版社出版的包含“巨噬细胞能对抗原呈递进行调节,还通过分泌不同的细胞 因子对免疫细胞产生正、负调节”这段话的图书? 13、如何检索与抗体亲和力相关的图片数目? 14、全国园艺学学科院士中,发文量最多、被引频次和下载频次最大的学者发表的,由中国博士后基

Oracle数据库高级复制技术的应用

Oracle数据库高级复制技术的应用 在简要说明数据库复制技术的基础上,主要探讨了oracle数据库高级复制的几种方法,介绍了多主复制和可更新快照复制两种机制的设计步骤,并将实际应用中可能出现的问题进行列举,最后给出一个可更新快照复制实例。 标签:Oracle数据库;高级复制;应用 一些大的信息系统往往由多地的不同用户同时使用,由相距较远的多个站点构成的广域网,并且各个站点之间需要数据共享,通常将这些共享的数据存储在其中一个站点上,作为数据中心,所有用户都从该站点存取数据。这种方案很容易就能保证数据一致性,但会造成数据中心的负载过大,使远程用户的数据响应很慢,甚至造成系统瘫痪。数据复制技术可以有效地解决这个问题,它通过将这些共享数据复制到多个不同站点的数据库中,实现数据的本地访问,减少网络负荷,并提高数据访问的性能,而且通过数据同步,确保数据实时性和一致性[1]。该技术适用于用户数较多、地理分布较广、而且需要实时地访问相同数据的应用模式。 Oracle数据库的复制是由数据库的后台进程自动实现的,通过设置数据库参数,确定后台负责复制任务的进程数和被激活的时间。数据库的后台进程是由系统按设定的时间间隔执行预定的操作,以实现数据定期地从源数据库到目标数据库的传输,并由系统进行控制。Oracle数据库复制支持基本复制和高级复制两种形式,这里主要讲述Oracle高级复制技术在应用时的设计,以及可能遇到的问题和解决办法。 1 基本概念 Oracle高级复制,即对称复制,既可支持整个表的复制也可支持基于部分表的复制两种复制方案,其主要是通过多主复制和可更新快照复制两种机制实现的。同时还可以将这两种复制机制结合起来以满足不断变化的业务需求。 2 高级复制设计步骤 2.1 多主复制 (1)创建复制环境,明确高级复制的站点和参与复制的数据表;保证各站点具有复制关系的表结构的一致性;(2)使用数据库复制管理器,定义参加复制的站点,在复制的各站点,建立包含复制实体的用户和复制的数据库链路,建立复制的管理用户,配置数据更新的计划;(3)建立主复制组,不同的需参与复制的实体可加入不同的组中;(4)给用户分配适合的权限,防止由于用户权限过大而造成的复制冲突。 2.2 可更新快照复制

人员信息登记表(基本信息)

部门招聘人员信息表 表1

笔试(1) 表2

笔试(2) 您是怎样理解以下各项鹏驰一站文化理念的? 1、鹏驰一站团队愿景:完美追求 您的理解是: 2、鹏驰一站身份定位:引领汽车消费时尚,追求汽车完美服务您的理解是: 3、鹏驰一站企业目标:精品工程,一流名店 您的理解是: 4、鹏驰一站企业使命:提升顾客价值,服务成就梦想 您的理解是: 5、鹏驰一站企业精神:精诚恒久 您的理解是: 6、鹏驰一站管理观:严细始终、和谐如一、高效至尊 您的理解是: 7、鹏驰一站质量观:疏忽一等于失去百分之百 您的理解是: 8、鹏驰一站顾客观:以心换心,一诺千金 您的理解是: 9、鹏驰一站品牌观:产品源自人品 您的理解是: 10、鹏驰一站服务观:用心服务每一刻,真诚善待每个人 您的理解是: 11、鹏驰一站人才观:诚以做人,精以做事 您的理解是: 12、鹏驰一站竞争观:最大的对手是自己 您的理解是: 13、鹏驰一站团队观:同心携手,全力致胜 您的理解是: 评分及评语:

面试 表3 评分及评语: 性格测试 表4 评分及评语:

互动测试 1、企业按类型来分,可以分为生产型企业和服务型企业,作为服务型企业的员工,您认为应具备哪些特殊的素质?您认为你是否具备这些? 2、您为什么想来鹏驰工作?与您的目标有什么联系? 3、您打算从哪几个方面做好您应聘的这项工作? 4、您最遗憾的一件事是什么?您认为是什么原因造成的? 5、鹏驰公司每个部门、每个课都进行独立核算,这样各部门或课之间容易造成利益冲突,如您在今后的工作中遇到此类问题,您将如何认识与处理? 6、当顾客对我们的服务,或者是我们的硬件设施,或者是我们的员工不满意,有投诉意见,您如何处理顾客的投诉? 7、如果您是一家大公司的老总,您认为您会聘用现在的您吗?请诚实回答。理由何在? 8、您认为在何种状态下,您愿意在鹏驰安心工作一辈子?理由何在? 9、您是如何看待跳槽的?您在哪几种情况下会跳槽?

网络数据库的信息检索

第二章信息获取 2.4网络数据库的信息检索教学分析 本节内容是将“因特网信息查找”延用至专业化的网络数据库,主要包括网络数据库简介、网络数据库信息检索的一般过程和使用多样化的网络数据库。 同学们具备了使用搜索引擎搜索信息的经验,但对如何使用网络数据库进行信息检索的还不太了解。本节课教学主题是“学会使用在网络数据库中进行信息检索”,通过同学间的交流、协作,提高信息检索的技巧,亲身体验网络数据库信息的丰富性和可靠性,学会网络数据库的信息检索的方法,同时会对网络数据库的客观评价,更加激发学生学习信息检索的兴趣。 本节课以上机体验为主,同时作为前两章的阶段练习和总结。 教学目标 1.了解网络数据库; 2.学会简单的信息检索; 3.运用网络数据库,检索需要的信息内容。 教学重点、难点 重点:从数据库中检索到自己想要的信息,体验网络数据库信息的多样性。 难点:如何提高搜索技巧、客观评价网络数据库。 教学设计思路(网络机房) 2.4网络数据库的信息检索 复习引入 复习:怎样利用google、百度搜索引擎和网际快车下载工具来通过网络搜索安装“hp1010打印机”的驱动需要的文件。 学生阅读(1分钟)我们首先看到这样的一个故事:周小波的通过运用了网络数据库,在法律在线上找到了相关的知识,然后在竞赛中获得成功。 讨论:网络给我们带来了什么? (多种答案) 2.4.1 体验网络数据库 学生体验:打开法律在线,输入关键字“教育”,浏览相应结果,把需要的文字复制下来。 网络数据库简介 1、什么是网络数据库 数据库:是存放数据的仓库,是按一定的结构和规则组织起来的相关数据的集合。 网络:用通讯设备和线路,将处在不同地方和空间位置、操作相对独立的多个计算机连接起来,再配置一定的系统和应用软件,在原本独立的计算机之间实现软硬件资源共享和信息传递,那么这个系统就是计算机网络。 数据库技术:目前是计算机处理与存储数据的最有效、最成功的技术,计算机网络的特点则是资源共享。 网络数据库:数据和资源共享这两种技术结合在一起即成为在今天广泛应用的网络数据库(也叫WEB 数据库)。它以后台数据库为基础,加上一定的前台程序,通过浏览器完成数据存储、查询等操作的系统。 2、网络数据库信息检索的一般过程 学生体验:检索“义务教育法”https://www.wendangku.net/doc/cf4897827.html, 明确目标——提炼关键字——输入执行——评价调整

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