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核酸提取常见试剂的作用原理

核酸提取常见试剂的作用原理
核酸提取常见试剂的作用原理

异硫氰酸胍

强用力的蛋白质变性剂,能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构的破坏消失而迅速与核酸分离。胍盐是破坏蛋白质三维结构的离液剂,在通常使用的蛋白质变性剂中作用最强的是异硫氰酸胍,它们可以使多数蛋白质转换成一随机的卷曲状态。含有强力的阴离子和阳离子基团,它们可以形成较强的氢键。在还原剂存在的情况下,异硫氰酸胍可以断裂氢键,而去垢剂,如SDS存在的情况下,可以破坏疏水作用。

盐酸胍、尿素

盐酸胍是一个核酸酶的强抑制剂,它并不是一种足够强的变性剂,可以允许完整的RNA 从富含RNase的组织中提取出来。

4-8M可断裂氢键,有两种可能机制:1变性蛋白和盐酸胍、尿素优先结合,形成变性蛋白-变性剂复合物,当复合物被除去,从而引起N-D反应平衡向右移动,随着变性剂浓度增加,天然状态的蛋白不断转变为复合物,最终导致蛋白质完全变性;2盐酸胍、尿素对氨基酸的增溶作用,能形成氢键,当浓度高时,能破坏水的氢键结构,结果盐酸胍、尿素就称为非极性残基的较好溶剂,使蛋白质内部的疏水残基伸展和溶解性加强,盐酸胍、尿素引起的变性往往是不可逆的。

高浓度尿素使蛋白质变性并抑制Rnase活性

十二烷基肌氨酸钠

使蛋白质解体变性

巯基试剂

1防止蛋白质或酶等(如辅酶A)分子中SH基团氧化成二硫键,2在某些酶反应过程中维持体系的还原环境。DTT,DDTE、巯基乙醇应用最广,谷胱甘肽也常应用,由于他是生物体内的还原剂,同时氧化后能被谷胱甘肽还原酶原位释放。DNA提取中,常使用巯基乙醇,维持缓冲液的还原环境,防止多酚类氧化,由于具有一定的毒性,浓度不应高于2%。

巯基乙醇

β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键(肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键)。

1 还原蛋白质二硫键,使Rna酶变性

2 抑制酚类氧化,若氧化,核酸会变成灰黑色,苯酚的氧化产物苯醌等氧化物引起磷酸二酯键的断裂及导致RNA和DNA的交联

3 保护蛋白质的巯基蛋白质提取中需要

巯基乙醇还原二硫键,使RNA酶失活

化学变性剂SDS、尿素、盐酸胍能破坏疏水键、盐键、氢键、范德华力使蛋白质变性但不影响肽键和二硫键,不能使蛋白质彻底变性

加上还原剂巯基乙醇或DTT,能还原二硫键,使RNA彻底变性

DTT二硫苏糖醇

刺激性气味要小很多,毒性也比巯基乙醇低很多。而且DTT比巯基乙醇的浓度低7倍时,两者效果相近,但DTT价格略高一些。由于容易被空气氧化,因此DTT的稳定性较差;但冷冻保存或在惰性气体中处理能够延长它的使用寿命。由于质子化的硫的亲核性较低,随着pH值的降低,DTT的有效还原性也随之降低;DTT或含有DTT的溶液不能进行高压处理。抑制Rnase活性

TCEP 三(2-甲酰乙基)膦盐酸盐

半胱氨酸

Trizol

苯酚、异硫氰酸胍、8-羟基喹啉、β-巯基乙醇等。TRIzol的主要成分是苯酚。苯酚的主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放。苯酚虽可有效地变性蛋白质,但不能完全抑制RNA酶活性,因此TRIzol中还加入了8-羟基喹啉、异硫氰酸胍、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase(RNA酶)。

0.1%的8-羟基喹啉可以抑制RNase,与氯仿联合使用可增强抑制作用。

异硫氰酸胍属于解偶剂,是一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质并使蛋白质二级结构消失,导致细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离。

β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键。

液氮

组织破碎,裂解细胞

SDS

十二烷基硫酸钠

阴离子去垢剂,高温(55-65℃)裂解细胞,使染色体离析,蛋白变性,形成SDS/蛋白质/多糖复合物,释放核酸,提高盐(KAc或NaAc)浓度并降低温度(冰浴),使SDS/蛋白质/复合物转变为溶解度更小的钾盐酸形式,使蛋白质及多糖杂质沉淀更加完全、离心后除去沉淀,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,乙醇沉淀水相中的DNA

操作简单,温和,可提取到高分子量的DNA,但产物多糖类杂质较多

阳离子强表面活性剂,通常与蛋白酶K和抗氧化剂、螯合剂一起使用

可破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离

溶解膜类蛋白

SDS 能裂解细胞。使细胞中的蛋白质和核酸之间常借着静电引力或配位键结合,阴离子去污剂能够破坏这种价键,使染色体离析,蛋白变性,释放核酸。

(1)SDS是一种阴离子表面活性剂,能使蛋白质的氢键和疏水键打开,并结合到蛋白质的疏水部位;

(2)SDS可引起蛋白质构象改变

(3)SDS是一种良好的解离剂,可使蛋白质溶解,变性

(4)形成SDS-蛋白质复合物,并使复合物带负电

质粒方面:在1%的SDS溶液中慢慢加入5 N的NaCl,你会发现SDS在高盐浓度下是会产生沉淀的。因此高浓度的盐导致了SDS的沉淀。但如果你加入的不是NaCl而是KCl,你会发现沉淀的量要多的多。这其实是十二烷基硫酸钠(sodium dodecylsulfate)遇到钾离子后变成了十二烷基硫酸钾(potassium dodecylsulfate, PDS),而PDS是水不溶的,因此发生了沉淀。如此看来,溶液III加入后的沉淀实际上是钾离子置换了SDS中的纳离子形成了不溶性的PDS,而高浓度的盐,使得沉淀更完全。大家知道SDS专门喜欢和蛋白质结合,平均两个氨基酸上结合一个SDS分子,钾钠离子置换所产生的大量沉淀自然就将绝大部分蛋白质沉淀了,让人高兴的是大肠杆菌的基因组DNA也一起被共沉淀了。基因组DNA一旦发生断裂,只要是50-100 kb大小的片断,就没有办法再被PDS共沉淀了

CTAB

CTAB:十六烷基三甲基溴乙胺,低温时易沉淀

阳离子去污剂

一种在高盐下能和核酸结合形成可溶、稳定的复合物,低盐浓度下可沉淀的表面活性剂

是一种阳离子去污剂, 低离子强度(0.1-0.5M NaCl),沉淀核酸与酸性多聚糖,而蛋白质和中性多聚糖仍留在溶液中。在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。

CTAB可从大量产生黏多糖的植物及某些革兰氏阴性菌制备纯化的DNA,这种去污剂加入调节至高离子强度的细菌和细胞裂解液中(>0.7M NaCl),经过连续的酚/氯仿抽提,去除CTAB/黏多糖/ 蛋白质复合体,异丙醇/无水乙醇沉淀上清即可将DNA分离出来

CTAB还有提高DNA互补链复性速率及稳定已形成的DNA双螺旋的作用

CTAB法的主要特点是用用较广

CTAB溶液在低于15度会形成沉淀析出,因此在将其加入冰冷的植物材料时,必须预热,且离心温度不低于15度

EDTA

酶抑制剂,螯合二价金属,抑制金属依赖性的酶

螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制细胞中DNase的活性,该酶可降解DNA

EDTA是去垢剂,结合离子用,而它结合的部分离子是能够诱发或者促进RNA酶活性的,比如Ca2+。EDTA是一种二价离子熬合剂,能熬合Mg2+和Ca2+等二价阳离子,而多种RNA酶的活性是需要依赖二价阳离子的,所以EDTA能通过熬合二价阳离子来抑制RNA酶的活性

碱性条件下才能够溶解,要和NaOH粉末混合后,再加水,然后用NaOH水溶液调节pH。0.01M,DNase酶基本失活。

BSA

酶抑制剂,使一些降解酶的活性的表面变性

精胺或其他多胺

酶抑制剂,降低核酸酶的影响

氰化物

酶抑制剂,降低重金属氧化酶的影响

PVP

减少酚类、醌类、单宁类物质的影响,抗氧化作用,络合多酚和萜类物质,防止多酚类褐变而氧化,去除多糖和色素,色素是PCR强抑制剂,必须去除

样品液氮研磨及提取缓冲液中加入PVP或PVPP等能络合多酚和萜类物质,离心或氯仿抽提出去,有效防止多酚氧化成醌类,避免溶液变褐色而具有抗氧化能力

提取液中加入适量的PVP或PVPP能提高DNA的纯度,用量根据杂质而定(1-6%),PVP同时能去除多糖,因此将PVP和巯基乙醇配合使用并调整用量,能有效防止多酚污染

PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。

Triton-x100

Triton X100之类的去垢剂有苯环结构,所以在280nm有很强的吸收。

蛋白酶K

蛋白酶K:切割活性较广的丝氨酸蛋白酶,切割脂族和芳香族氨基酸的羧基端肽键,将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来。

蛋白酶K 在较广的pH范围内均有活性(pH 4-12.5)温度范围37-60度盐浓度3M GuHCl 或4M尿素中均有活性在一些去污剂:Tween20(5%)、Triton X-100 (1%)和SDS(1%)条件下也有活性。

蛋白酶K消化裂解法适用于所有标本的消化处理,尤以DNA样品为佳.如组织细胞(包括石蜡包埋组织)绒毛、毛发、精斑、血液(血清、血浆、全血)局部分泌物、尿,粪便等.蛋白酶K的一般工作浓度是50—100μg/ml

蛋白酶(蛋白酶K 或链酶蛋白酶) 可以降解蛋白质,灭活核酸酶(DNase 和

RNase) ,DNase 和RNase 也用于去除不需要的核酸,有人使用蛋白酶替代DEPC处理水的,但有些人说效果不好。

蛋白酶 K,威力巨大的广谱蛋白酶,95C 加热10 分钟,则完全失活。数年前首次使用它替代 DEPC 处理 RNA 抽提用的离心管和枪头,效果不错;后来又用于处理 RNase-Free 的水,效果也是一级棒。从此就再也不用 DEPC 了。配制 RNA 裂解试剂时,直接用灭菌的双蒸水配制,最后,加入蛋白酶 K 至终浓度 1ug/ml。轻轻混匀,室温放置 15 分钟后即可。枪头及离心管去除 RNase:先将枪头及离心管清洗干净后,移入预先混好的含 1ug/ml 蛋白酶 K 的双蒸水,彻底浸入。室温放置 30 分钟后,连水一起高压灭菌。弃水后,烘干即可。RNase-Free 水的获得:直接在灭菌的双蒸馏水中加入蛋白酶 K 至终浓度 1ug/ml。轻轻混匀,室温放置 15 分钟后,灭菌处理即可。该蛋白质的残留对后续实验没有可见的影响。无蛋白质残留的RNase-Free 水的获得:这比较麻烦。直接在灭菌的双蒸馏水中加入蛋白酶K 至终浓度 1ug/ml。轻轻混匀后,倒入专用的蒸馏器中。放置 15 分钟后,加热蒸馏,流出的就是无蛋白质残留的RNase-Free 水。要提醒的是,该专用蒸馏器头几次流出来的水,只能当普通蒸馏水用,因为通道中难确保 RNase-Free 的环境;另外,一定要主要密闭性,否则,流出的水又被污染了。

DNA裂解液的作用是破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离,抑制细胞中Dnase的活性,而蛋白酶k的作用是将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子完整地分离出来!

溶菌酶

溶壁酶

Dnase

Rnase

多糖水解酶:水解多糖

饱和酚

酚是一种有机溶剂,预先要用STE 缓冲液饱和,因未饱和的酚会吸收水相而带走一部分核酸。酚也易氧化发黄,而氧化的酚可引起核酸链中磷酸二酯键断裂或使核酸链交联:故在制备酚饱和液时要加入82羟基喹咛,以防止酚氧化。

苯酚

非极性分子水为极性分子

使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。使用酚的优点:1. 有效变性蛋白质;2. 抑制了DNase的降解作用。能有效使蛋白质变性而出去,酚形成的有机相破坏蛋白质的胶体稳定性,从而蛋白质不会分布在水相中,避免核酸污染

缺点:1. 能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。2. 不能完全抑制RNase的活性。

酚变性大,但与水相有一定程度的互溶,大约10-15%的水溶在酚相中,使核酸损失

酚(Phenol)对蛋白质的变性作用远大于氯仿,按道理应该用酚来最大程度将蛋白质抽提掉,但是水饱和酚的比重略比水重,碰到高浓度的盐溶液(比如4M的异硫氰酸胍),离心后酚相会跑到上层,不利于含质粒的水相的回收;但加入氯仿后可以增加比重,使得酚/氯仿始终在下层,方便水相的回收;还有一点,酚与水有很大的互溶性,如果单独用酚抽提后会有大量的酚溶解到水相中,而酚会抑制很多酶反应(比如限制性酶切反应),应此如果单独用酚抽提后一定要用氯仿抽提一次将水相中的酚去除,而用酚/氯仿的混合液进行抽提,跑到水相中的酚则少得多,微量的酚在乙醇沉淀时就会被除干净而不必担心酶切等反应不能正常进行。至于异戊醇的添加,其作用主要是为了让离心后上下层的界面更加清晰,也方便了水相的回收。

氯仿

非极性分子水为极性分子

去除脂肪,使更多蛋白质变性,从而提高提取效率

克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。(酚易溶于氯仿中)

氯仿变性不如酚好,但与水不混溶,不会带走DNA

因此混合使用最佳,经酚第一次抽提的水相有残留的酚,由于酚和氯仿互溶,可用氯仿第二次带走酚,也可在第二次抽提中混合使用,比例为1:1

苯酚/氯仿

苯酚、氯仿抽提去除蛋白质

非极性分子水为极性分子,当蛋白水溶液与他们混合时,蛋白质分子见的水分子被挤去,使蛋白失去水合状态而变性,经离心,变性蛋白密度比对大,而与水相分离,苯酚/氯仿比重大,保留在最下层

苯酚氯仿使蛋白质变性量要足够,因为苯酚去除蛋白是有一定的饱和度的,超过饱和度,裂解体系中蛋白质不能被一次性去除,必须多次抽提。离心后分三层,下层有机层中有一些脂溶性的杂质,中间层白色絮状沉淀是蛋白,上清液中即含有核酸;变性后的蛋白质从水相中析出,位于苯酚中或苯酚与水相之间。

异戊醇

抽提DNA,为混合均匀,容易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用,加入异戊醇降低分子表面张力,一般采用氯仿:异戊醇=24:1或酚:氯仿:异戊醇=25:24:1(不必先配置,临用前加入即可)

减少操作过程中产生的气泡。

减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。

NaCl

提供一个高盐环境,使DNA充分溶解于液相

沉淀DNA时总会加入高浓度的盐,加盐的目的是破坏能使蛋白质保持稳定的两个因素,使蛋白和DNA分离并沉淀下来.而此时盐的阳离子会与DNA结合形成DNA-阳离子盐溶于溶液中,再用无水乙醇可以将DNA-阳离子盐沉淀下来

提取DNA时先加0.14mol/L氯化钠,因为在这种浓度的氯化钠溶液中,DNA的溶解度最低,而蛋白质的溶解度增加,这样通过过滤能将DNA分离开,以除去蛋白质。再加入95%的酒精能使DNA沉淀,因为在这个浓度下DNA溶解度最低。如果直接加酒精不先加氯化钠,DNA和蛋白质都能被酒精所沉淀,就无法将DNA和蛋白质分离开。所以必须先加氯化钠后加酒精,顺序不能颠倒。

DNA溶液是DNA以水合状态稳定存在,当加入乙醇时,乙醇会夺去DNA周围的水分子,使DNA失水而易于聚合。这样可以是DNA沉淀出来在pH为8左右的溶液中,DNA分子是带负电荷的,加一定浓度的NaAc或NaCl,使Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,易于互相聚合而形成DNA钠盐沉淀,当加入的盐溶液浓度太低时,只有部分DNA形成DNA钠盐而聚合,这样就造成DNA沉淀不完全,当加入的盐溶液浓度太高时,其效果也不好。在沉淀的DNA中,由于过多的盐杂质存在,影响DNA的酶切等反应,必须要进行洗涤或重沉淀。

柠檬酸钠

它可以控制反应体系的离子强度,同时还有一定的缓冲作用,保证体系PH的相对稳定状态,总之柠檬酸钠在这里的作用类似于食物中的防腐剂。

DEPC

焦碳酸二乙酯,它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。与肝素何用效果增强。在Tris中不稳定,很快会分解为二氧化碳和乙醇。

强烈但不彻底的RNA酶抑制剂0.1%浓度

Tris-HCl

缓冲体系,使pH变化不会太大

异丙醇

加入异丙醇之后立即出现絮状沉淀,我一直以为这是正确的,看了帖子才知道是蛋白质污染,异丙醇的沉淀效果要比无水乙醇的沉淀效果要好,但是异丙醇沉淀有一个弊端就是会沉淀下来好多的盐和蛋白质这样会影响下一步的操作,一般我加异丙醇是等体积的效果还可以。

70%乙醇

70%乙醇洗涤DNA沉淀(因为在70%乙醇里DNA是不溶的,而盐离子却可溶),用无水乙醇则达不到这个目的!乙醇对于蛋白质、核酸的沉淀效应随分子量加大而增大,小分子的核酸和蛋白质碎片是可以溶于75%乙醇的。漂洗DNA,是为了去除残余的盐类,去除过量SDS和酚等杂物,因为SDS在70%的乙醇中保持溶解状态,不与DNA共沉淀,从而通过弃上清液去除这种去污剂,避免对以后PCR反应的影响。

DEPC

(焦碳酸二乙酯):常用RNA酶抑制剂,与RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,强烈但不彻底的RNA酶抑制剂

甲酰胺

用高浓度甲酰胺替代苯酚从细胞裂解物的蛋白酶K消化物中分离抽提DNA,甲酰胺是一种离子化溶剂,能分离蛋白质-DNA复合物并使蛋白变性和释放,因其不影响蛋白酶K的活性,特别适于分离高分子质量的DNA,其分离物籍火棉胶袋的透析,去除变性蛋白进而纯化DNA。

聚乙二醇PEG

有机聚合物,无毒,亲水性强,相对分子量6-20k,沉淀效果主要与其本身的浓度和分子量有关,同时受离子强度、溶液pH值和温度等因素的影响,采用该方法可将病毒浓缩10倍以上。为一种非离子多聚物,多离子多聚物是六十年代发展起来的一类重要沉淀剂。基于多聚物的沉淀作用主要依赖于多聚物的浓度和被沉淀物的分子量大小,Laurent等(1967)提出PEG的沉淀机理主要是通过空间位置排斥,使液体中的微粒(包括生物大分子、病毒和细菌等)被迫集聚在—起而引起沉淀的发生。PEG最早应用于提纯免疫球蛋白(IgG)和沉淀一些细菌病毒,今年来逐渐应用于核酸和酶的分离纯化,特别是用PEG分离质粒DNA,已相当普遍。用PEG8000代替乙醇沉淀DNA,可以在500ul DNA液中加入200ul 20%PEG8000(含1.2 mol /LNaCl),冰浴20min(Li et a1.,1994)。该操作的优点在于:操作条件温和,不易引起生物大分子的变性。同时具有极高的沉淀效能,少量的PEG可以沉淀相当多的生物大分子。

乙基黄原酸钾

乙基黄原酸钾能够与多糖结合,形成可溶性复合物,使细胞壁破裂,释放出核酸。此复合物

在铵离子存在的情况下可转变为水不溶性,并可通过简单的离心除去,不需要苯酚或氯仿抽提。另外,乙基黄原酸钾能够结合金属离子,抑制DNase的活性。Tillett等(2000)利用该方法从蓝细菌、微生物、环境样品中提取到高质量的核酸,DNA可以用于酶切、克隆、PCR,RNA可以用于RT-PCR,Southern杂交等反应,并且样品中不含核酸酶,温育16 h没有发生降解。

高纯度质粒小量快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书

杭州昊鑫生物科技股份有限公司 htpp://https://www.wendangku.net/doc/ca8317763.html, HighPure Plasmid Mini Kit 高纯质粒小量快速提取试剂盒 目录号:PL03 试剂盒组成、储存、稳定性: 试剂盒组成保存 50次 (PL0301) 100次 (PL0302) 200次 (PL0303) 平衡液室温5ml 10ml 20ml RNaseA(10mg/ml)-20℃150μl 250μl 500μl 溶液P1 4℃15 ml 25 ml 50 ml 溶液P2 室温15 ml 25 ml 50 ml 溶液P3 室温20 ml 35 ml 70 ml 去蛋白液PE 室温16ml 31.5 ml 63 ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇 漂洗液WB 室温15 ml 25ml 50ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇 洗脱缓冲液EB 室温10ml 15ml 20ml 吸附柱AC 室温50个100个200个 收集管(2ml)室温50个100个200个 本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果。 储存事项: 1.第一次使用时,将试剂盒所带的全部RNase A加入溶液P1后(终浓度100ug/ml) 置于2-8℃保存。如果溶液P1中RNase A失活,提取的质粒可能会有微量RNA 残留,在溶液P1中补加RNase A即可。 2.环境温度低时溶液P2中SDS可能会析出浑浊或者沉淀,可在37℃水浴加热几分 钟,即可恢复澄清,不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。 3.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时 盖紧盖子。 产品介绍:

本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞,离心吸附柱内的硅基质膜在高盐、低pH值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,最后低盐、高pH值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。 产品特点: 1.离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口世界著名公司特制吸附膜,柱与柱之间吸附 量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。 2.独有的去蛋白液配方,可以高效去除残留的核酸酶,即使是核酸酶含量丰富的菌 株如JM系列、HB101也可以轻松去除。有效防止了质粒被核酸酶降解。 3.快速、方便,不需要使用有毒的苯酚、氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀。获得的 质粒产量高、纯度好,可以直接用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序等各种分子生物学实验。 注意事项 1. 所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到13,000rpm的传统台式离心机, 如Eppendorf 5415C 或者类似离心机。 2. 提取质粒的量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。一般高拷贝质粒,建议 接种单菌落于1.5-4.5 ml加合适抗生素的LB培养基,过夜培养14-16个小时,可提取出多达20μg的纯净质粒。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb的大质粒,应适当加大菌体使用量,使用5-10 ml过夜培养物,同时按比例增加P1、P2、P3的用量,其它步骤相同。 3. 得到的质粒DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260 值为1相当于大约50μg/ml DNA。电泳可能为单一条带,也可能为2条或者多条DNA条带,这主要是不同程度的超螺旋构象质粒泳动位置不一造成,与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过90%。 4. 质粒DNA确切分子大小,必须酶切线性化后,对比DNA分子量Marker才可以知 道。处于环状或者超螺旋状态的的质粒,泳动位置不确定,无法通过电泳知道其确切大小。 5. 洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗 脱,但应该确保pH大于7.5,pH过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-

BIOG核酸提取试剂盒操作步骤说明

BIOG 游离DNA 提取试剂盒操作步骤 说明 运输条件:常温运输 货 号:51019:50次反应 51020:100次反应 储存条件:室温(15-25℃),消化液、DNA Carrier 请于-20℃存放 产品特点 试剂盒组成 组分 50次 100次 吸附柱和收集管 各50个 各100个 裂解液 18mL 36 mL 洗涤液A 21mL 42 mL 洗涤液B 9 mL 18 mL 洗脱液 3mL 6 mL 消化液 1.2 mL 2.4 mL DNA Carrier 0.24 mL 0.48 mL 说明书 1份 1份 产品介绍 BIOG cfDNA Easy Kit 是常州百代生物科技股份有限公司研制的专门用于提取血清、血浆等游离DNA 的试剂盒。BIOG cfDNA Easy Kit 采用了最新的优质进口离子膜,裂解液和洗脱液经过多次优化,能高效地分离DNA 。提取得到的DNA 较其它品牌的同类试剂盒产量更大,纯度更高,最大限度地去除了蛋白、色素、脂类等杂质污染,可以直接应用于PCR 、荧光定量PCR 和各种酶切试验等。 操作步骤 1. 请自行准备:无水乙醇、1.5mL 离心管。 2. 取出洗涤液,按以下操作: a) 洗涤液A :21mL 加入9mL 无水乙醇;42mL 加入18mL 无水乙醇。 b) 洗涤液B :9mL 加入21mL 无水乙醇;18mL 加入42mL 无水乙醇。 c) 配制好的洗涤液如出现沉淀,可在37℃溶解,摇匀后使用。 3. 取1.5mL 离心管,加入200μL 样本,4μL DNA Carrier 混合均匀,加入300μL 裂解液及20μL 消化液,振荡混匀,56℃水浴10 分钟。 4. 加入1000μL 无水乙醇,轻轻颠倒混匀,如有半透明悬浮物,不影响DNA 的提取与后续实验。 5. 将吸附柱放入收集管内,将760μL 上述溶液转入吸附柱内,静置2 分钟,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液; 6. 将吸附柱放回收集管内,将剩余760μL 溶液转移至吸附柱内,重复步骤5。 7. 将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液A 至吸附柱内,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。 8. 将吸附柱放回收集管内,加500μL 洗涤液B 至吸附柱内,12,000 rpm 4℃离心1 分钟,弃收集管内废液。 9. 将吸附柱放回收集管内,12,000 rpm 4℃离心2 分钟,离去残留的洗涤液。 10. 取出吸附柱,放入新的1.5 mL 离心管内,加入30-50 μL 洗脱液,静置3 分钟,12,000 rpm 4℃ 离心2 分钟,收集DNA 溶液。提取的 DNA 即可用于下一步实验或-20℃保存。 注意事项: 裂解液、洗涤液含有刺激性化学物质,操作过程请做好防护措施,避免直接接触皮肤,防止吸入口鼻。如不慎沾染皮肤或眼睛, 请立即用清水或生理盐水冲洗,必要时请就医。 储存、运输和有效期 本试剂盒可常温运输,室温(15-25℃)保存,有效期为12个月,消化液、DNA Carrier 请于-20℃存放,避免反复冻融。 质量控制 本产品经严格的质量检验证明,无生物污染 注意 :本产品仅用于科研 BIOG 游离RNA 提取试剂盒操作步骤说明 运输条件:常温运输 ◎操作简便快速,可在半小时内获得理想的DNA ; ◎提取DNA 纯度高,无抑制剂,A260/A280为1.7-1.9; ◎产量更高,较国内同类产品高出20%; ◎可用于血清、血浆等游离样本中DNA 的提取; ◎不含苯酚和氯仿等有毒溶剂,安全无毒。

0922粪便核酸提取试剂盒说明书

磁珠法粪便核酸提取试剂盒(常规版) Faeces DNA Extraction Kit (Regular Version) 【目录号】FDE-5005、FDE-5030 【运输条件】2~25℃; 【保存条件】磁珠分散液、裂解液②2~8℃,其它组分室温; 【试剂盒组成】 【注意事项】 1. 在使用本试剂盒钱,请用户自备80%乙醇; 2. 使用前请检查裂解液①、②是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将裂解液置 于378℃水浴重新溶解; 3. 本操作指南经本公司反复验证,使用前请仔细阅读,并且按照操作指南的建议操作。

磁珠法·自动化:为生命科学提供自动化磁纳米捕获方案 【产品简介】 本试剂盒采用具有独特分离作用的磁珠和独特的缓冲液系统,从各种固态或液态粪便样品中分离纯化高质量基因组DNA。特殊技术包埋的磁珠在特定条件下对核酸具有极强的 亲和力,而当条件改变时,磁珠会释放吸附的核酸,从而达到快速分离纯化核酸的目的。 提取的基因组DNA片段打,纯度高,质量稳定可靠,尤其适合高通量工作站的自动化提取,特别是本公司各型号的自动化核酸提取仪。 本试剂盒纯化的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、荧光定量PCR、文库构建、Sputhem杂交、芯片检测和高通量测序等实验。 【试剂盒说明】 1. 磁珠分散液严禁反复冻融和离心,磁珠使用前务必充分混匀,可涡旋振荡10秒左右; 2. 实验中使用我先混合仪的目的是为使磁珠能够充分吸附核酸、将磁珠表面的杂质充分去 除或核酸从磁珠表面充分洗脱; 3. 使用前检查裂解液①、②是否出现结晶或者沉淀,如有结晶或者沉淀,请将裂解①、② 于37℃水浴重新溶解。 【自备仪器、耗材和试剂】 仪器自动版 涡旋混合仪、高速离心机、水浴锅或金属浴、96孔方孔圆底板、无水乙醇、异丙醇、英芮诚ETP-300核酸提取仪。 手动版 涡旋混合仪、高速离心机、金属浴或水浴锅;EP管、EP管用磁力架、无水乙醇、异丙醇。 【仪器自动版操作步骤】 以英芮诚ETP-300型全自动核酸提取仪为例,可同步完成32个样本的提取工作。 1.上样准备 参照下表用量向96孔板中分别加入相应试剂。

核酸提取常见试剂的作用原理

异硫氰酸胍 强用力的蛋白质变性剂,能迅速溶解蛋白质,导致细胞结构破碎,核蛋白由于其二级结构的破坏消失而迅速与核酸分离。胍盐是破坏蛋白质三维结构的离液剂,在通常使用的蛋白质变性剂中作用最强的是异硫氰酸胍,它们可以使多数蛋白质转换成一随机的卷曲状态。含有强力的阴离子和阳离子基团,它们可以形成较强的氢键。在还原剂存在的情况下,异硫氰酸胍可以断裂氢键,而去垢剂,如SDS存在的情况下,可以破坏疏水作用。 盐酸胍、尿素 盐酸胍是一个核酸酶的强抑制剂,它并不是一种足够强的变性剂,可以允许完整的RNA 从富含RNase的组织中提取出来。 4-8M可断裂氢键,有两种可能机制:1变性蛋白和盐酸胍、尿素优先结合,形成变性蛋白-变性剂复合物,当复合物被除去,从而引起N-D反应平衡向右移动,随着变性剂浓度增加,天然状态的蛋白不断转变为复合物,最终导致蛋白质完全变性;2盐酸胍、尿素对氨基酸的增溶作用,能形成氢键,当浓度高时,能破坏水的氢键结构,结果盐酸胍、尿素就称为非极性残基的较好溶剂,使蛋白质内部的疏水残基伸展和溶解性加强,盐酸胍、尿素引起的变性往往是不可逆的。 高浓度尿素使蛋白质变性并抑制Rnase活性 十二烷基肌氨酸钠 使蛋白质解体变性 巯基试剂

1防止蛋白质或酶等(如辅酶A)分子中SH基团氧化成二硫键,2在某些酶反应过程中维持体系的还原环境。DTT,DDTE、巯基乙醇应用最广,谷胱甘肽也常应用,由于他是生物体内的还原剂,同时氧化后能被谷胱甘肽还原酶原位释放。DNA提取中,常使用巯基乙醇,维持缓冲液的还原环境,防止多酚类氧化,由于具有一定的毒性,浓度不应高于2%。 巯基乙醇 β-巯基乙醇的主要作用是破坏RNase蛋白质中的二硫键(肽和蛋白质分子中的半胱氨酸残基中的键)。 1 还原蛋白质二硫键,使Rna酶变性 2 抑制酚类氧化,若氧化,核酸会变成灰黑色,苯酚的氧化产物苯醌等氧化物引起磷酸二酯键的断裂及导致RNA和DNA的交联 3 保护蛋白质的巯基蛋白质提取中需要 巯基乙醇还原二硫键,使RNA酶失活 化学变性剂SDS、尿素、盐酸胍能破坏疏水键、盐键、氢键、范德华力使蛋白质变性但不影响肽键和二硫键,不能使蛋白质彻底变性 加上还原剂巯基乙醇或DTT,能还原二硫键,使RNA彻底变性 DTT二硫苏糖醇 刺激性气味要小很多,毒性也比巯基乙醇低很多。而且DTT比巯基乙醇的浓度低7倍时,两者效果相近,但DTT价格略高一些。由于容易被空气氧化,因此DTT的稳定性较差;但

质粒提取试剂盒-说明书-翻译

精品文档 。 1欢迎下载 E.Z.N.A.? 质粒小提试剂盒操作规程(英文版译文) (适用于No. D6942, D6943 & D6944) 1. 自新鲜划痕选择培养板中分离单菌落,接种含适当选择性抗生素的1-5ml 的LB 培 养基进行培养。37℃强力摇动(~300rpm )孵育12-16h 。使用10-20ml 培养管或容量至少4倍于培养容积的培养瓶。强烈推荐使用endA 阴性大肠杆菌菌株进行常规质粒分离。此类菌株包括DH5α和JM109。 2. 将1.5-5.0ml 细菌室温10,000 x g 离心1min 。轻轻倒出或吸走培养基并丢弃。 3. 加入250μl 的溶液I/Rnase A 重悬沉淀,涡旋或用移液器反复吹打。充分重悬沉 淀对于获得高质量的DNA 非常重要。 4. 加入250μl 溶液II ,倒置、转动试管数次使之轻轻混匀,得到透明的裂解产物。 可能需要孵育2min 。不要用力混合,以免使染色体DNA 断裂,减低质粒的纯度。该步反应不要超过5min 。溶液II 不用时要拧紧瓶盖,以免试剂被空气中的CO2酸化。 5. 加入350μl 溶液III ,立即倒置试管数次混匀,直至白色絮状沉淀物形成。为避免 形成局部沉淀,加入溶液III 后应立即、充分混匀溶液。 6. 室温≥10,000 x g 离心10分钟。白色沉淀物形成,立即进行下一步操作。 7. 小心翼翼.... 的吸取上清液,加入装配在2ml 收集管中的小量纯化柱I 中。确保离心沉淀未受扰动,确保没有细胞碎片加入到柱子中。室温下10,000 x g 离心1分钟,使裂解液完全通过柱子。 8. 丢弃滤过液,重新使用2ml 收集管;加入500μl HB 缓冲液清洗柱子,室温10,000 x g 离心1分钟,使溶液完成通过柱子。该步操作需确保残余的蛋白质污染被去除,以保证获得高品质的DNA 以适合于下游的应用。 9. 丢弃滤过液,重新使用2ml 收集管;加入700μl 用无水乙醇稀释的DNA 清洗液清 洗柱子,室温10,000 x g 离心1分钟,使溶液完全通过柱子,丢弃滤过液。 注意:DNA 清洗液的浓缩液使用前必须用无水乙醇稀释(5倍稀释),如果DNA 清洗液稀 释液经过冷藏,则使用之前必须置于室温。 10. 可选步骤:重复清洗,加入另外的700μl 用无水乙醇稀释的DNA 清洗液。 11. 将空柱子≥13,000 x g 离心2min ,使柱子的基质干燥。此步骤为关键操作,不可 遗漏。 12. 将柱子放入干净的1.5ml 微量离心管中。将30-50μl (取决于终产物的期望浓度) 洗脱液或无菌去离子水直接加入柱子基质上,使之于室温下静置1-2min 。≥13,000 x g 离心1min 洗脱DNA 。可以进行二次洗脱,以收集残存的DNA 。 13. DNA 的产量和质量:分别在波长260nm 和280nm 处测定样品适当稀释液的吸光度。DNA 的浓度计算如下: DNA 浓度=A 260×50×(稀释倍数)μg/ml A 260/A 280的比率可以反映核酸的纯度。比值大于1.8表明核算的纯度在90%以上。或者,DNA 的产量(及质量)有时可以通过琼脂糖胶/溴乙锭电泳与已知浓度的DNA 样品相比较更好的予以确定。通常情况下洗脱的大部分DNA 是超螺旋单体形式,但也可能存在串联体形式。 张小强 翻译

大量全血基因组DNA提取试剂盒操作方法及步骤说明书

大量全血基因组DNA提取试剂盒 目录号:DN04 DN0401 16次×10ml DN0402 32次×10ml DN0403 96次×10ml 适用范围: 适用于快速提取各种动物全血基因组DNA 试剂盒组成、储存、稳定性: 试剂盒组成保存16次×10ml 32次×10ml 96次×10ml 10x红细胞裂解液室温50 ml 100 ml 300 ml 细胞核裂解液室温180 ml 180×2 ml 250 m l×4 蛋白沉淀液室温55 ml 110 ml 330 ml DNA溶解液室温15 ml 30 ml 90 ml 本试剂盒在室温储存18个月不影响使用效果。 储存事项: 1.环境温度低时细胞核裂解液中某些去污剂成份会析出出现浑浊或者沉淀,可在 37℃水浴加热几分钟,即可恢复澄清,不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。 2.蛋白沉淀液可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分钟帮助重新溶解,如果不 能完全溶解,也不影响使用效果,直接取用上层溶液即可。

3.避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时 盖紧盖子。 产品介绍: 本试剂盒根据全血特点采用几个快速步骤提取基因组DNA。首先红细胞裂解液裂解去除不含DNA的红细胞,细胞核裂解液裂解白细胞释放出基因组DNA,然后蛋白沉淀液选择性沉淀去除蛋白,最后纯净的基因组DNA通过异丙醇沉淀并重溶解于DNA 溶解液。 产品特点: 1.从十几个配方中优选出的红细胞裂解液配方,裂解快速完全。 2.不需要使用有毒的苯酚等试剂。 3.快速,简捷,单个样品操作一般可在1小时内完成。 4.结果稳定,产量高(典型的产量10ml全血可提取出150-500μg),OD260/OD280 典型的比值达 1.7~1.9,长度可达50kb-150kb,可直接用于构建文库、PCR、Southern-blot和各种酶切反应。 注意事项 1.所有的离心步骤均在室温完成,使用转速可以达到2,500 x g,并配备容纳50ml心 管转头的传统台式离心机。 2.用户需自备异丙醇和70%乙醇。 3.典型的产量10ml全血可提取出150-500μg基因组DNA(不同样品尤其疾病样品中 中白细胞数量差异可能非常大,因此产量的个体差异也可能非常大)。 4.本试剂盒为溶液型,可以很容易的按照比例扩大或者缩小每次处理的全血量 (20μl-10ml),请联系我们索取其它处理量的操作手册。

核酸的提取经验及原理总结

一、核酸 核苷酸单体聚合而成的生物大分子,是生物细胞最基本和最重要的成分。一般认为,生物进化即始于核酸,因为在所有生命物质中只有核酸能够自我复制。今天已知核酸是生物遗传信息的贮藏所和传递者。一种生物的蓝图就编码在其核酸分子中。核酸是1869年米歇尔(F.Miescher)在脓液的白细胞中发现的。他当时称之为核素。阿尔特曼(R.Altmann)于1889年认识其酸性后,定名为核酸。 二、核酸的分类和功能 核酸分为核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)两大类。这两类核酸有某些共同的结构特点,但生物功能不同。 DNA贮存遗传信息,在细胞分裂过程中复制,使每个子细胞接受与母细胞结构和信息含量相同的DNA;RNA主要在蛋白质合成中起作用,负责将DNA的遗传信息转变成特定蛋白质的氨基酸序列。 核酸的基本结构单元是核苷酸,核苷酸含有含氮碱基、戊糖和磷酸3种组分。碱基与戊糖构成核苷,核苷的磷酸酯为核苷酸。DNA和RNA中的戊糖不同,RNA中的戊糖是D-核糖;DNA不含核糖而含D-2-脱氧核糖(核糖中2位碳原子上的羟基为氢所取代)。核酸就是根据其中戊糖种类来分类的,DNA和RNA的碱基也有所不同。 三、核酸的理化性质 RNA和核苷酸的纯品都呈白色粉末或结晶,DNA则为白色类似石棉样的纤维状物。除肌苷酸、鸟苷酸具有鲜味外,核酸和核苷酸大都呈酸味。DNA、RNA和核苷酸都是极性化合物,一般都溶于水,不溶于乙醇、氯仿等有机溶剂,它们的钠盐比游离核酸易溶于水,RNA钠盐在水中溶解度可达40g/L,DNA钠盐在水中为10g/L,呈黏性胶体溶液。在酸性溶液中,DNA、RNA易水解,在中性或弱碱性溶液中较稳定。天然状态的DNA 是以脱氧核糖核蛋白(DNP)形式存在于细胞核中。要从细胞中提取DNA 时,先把DNP抽提出来,再把P除去,再除去细胞中的糖,RNA 及无机离子等,从中分离DNA 。 四、细胞裂解: (一)裂解原理在核酸提取过程中,细胞裂解是非常重要的。经典的裂解液几乎都含有去污剂(如SDS、Triton X-100、NP-40、Tween 20 等) 和盐(如Tris、EDTA、NaCl 等)。 盐的作用,除了提供一个合适的裂解环境(如Tris),还包括抑制样品中的核酸酶在裂解过程中对核酸的破坏(如EDTA)、维持核酸结构的稳定(如NaCl) 等。去污剂则是通过使蛋白质变性,破坏膜结构及解开与核酸相连接的蛋白质,从而实现核酸游离在裂解体系中。裂解体系中还可能加入蛋白酶,利用蛋白酶将蛋白质消化成小的片段,促进核酸与蛋白质的分开,同时,也便于后面的纯化操作以及获得更纯的核酸。也有直接使用高浓度的蛋白质变性剂(如GIT、GuHCl 等) 裂解的,该方法已经成为了RNA 抽提的主流,却不是基因组DNA 抽提的主流。 (二)细胞的裂解方法

高纯度质粒小提试剂盒使用说明书

高纯度质粒小提试剂盒 Pure Mini Plasmid Kit (目录号:HS0103) 产品包装 试剂盒成分 50 preps Buffer P1 15 ml Buffer P2 15 ml Buffer P3 20 ml Buffer PD 30 ml RNase A(10 mg/ml) 150 ul Buffer PW 60 ml Buffer EB 10 ml Spin Columns PA 50个 Collection Tubes (2 ml) 50个 (注意:使用前将全部RNase A 溶液加到Buffer P1中混合均匀,2 ~ 8℃保存) 保存条件 本试剂盒在室温(15 ~ 25℃)干燥条件下,可保存12个月;更长时间的保存可置于2 ~ 8℃。若溶液产生沉淀,应在使用前置于37℃下溶解沉淀。单独包装的RNase A 在室温可稳定保存12个月。加入RNase A 后的Buffer P1应置于2 ~ 8℃保存,可稳定保存6个月。 产品简介 本试剂盒用于高纯度质粒DNA 的小量制备与纯化。菌体经碱裂解、高盐、低pH 处理,质粒可从菌体中释放出来,并特异、高效地被离心柱硅胶膜(Spin Columns PA )吸附。通过去蛋白液(Buffer PD )和漂洗液(Buffer PW )的清洗可去除蛋白及其他杂质,在低盐、高pH 条件下洗脱,最后得到高纯度的质粒DNA 。 北京厚生博泰科技有限公司 Beijing Hooseen Biotech Co., Ltd.

使用本试剂盒可从1 ~ 5 ml过夜培养的菌液中纯化得到高达20 ug的高纯度质粒DNA,可在30 min之内完成提取任务。所得质粒可直接用于酶切、转化、PCR、测序、低敏感细胞株的转染等各种常规分子生物学操作。 产品特点 1. 快速:步骤少,操作简便,节约时间。 2. 简便:离心吸附柱不需要预平衡,漂洗液Buffer PW 和去蛋白液Buffer PD不需要另加乙醇,即开即用。 3. 纯度高:所得质粒可直接用于酶切、转化、PCR、测序、低敏感细胞株的转染等各种常规分子生物学操作。 操作步骤 1. 取1 ~ 5 ml过夜培养的菌液,室温12,000 rpm离心1 min,尽量将上清去除干净。 (注意:根据菌液的浓度决定取液量,浓度高时取1 ml菌液离心即可,浓度低时可多收集一次) 2. 加入250 ul Buffer P1,用枪头充分吹打使菌体重悬均匀。 (注意:是否将RNase A溶液加到Buffer P1中并混合均匀;菌体沉淀是否悬浮充分,如有未彻底悬浮的菌块会影响裂解,导致提取的质粒浓度及纯度降低) 3. 加入250 ul Buffer P2,温和颠倒混匀6 ~ 8次,直到溶液变得清亮粘稠。 (注意:不可剧烈震荡,以免造成基因组DNA片段的污染,所用时间不要超过5 min,以免质粒受到破坏,如未完全变得清亮,可能是菌体太多,可增加Buffer P2的用量,在后续的操作中Buffer P3的用量也要相应增加) 4. 加入350 ul Buffer P3,立即温和颠倒混匀6 ~ 8次,可见白色沉淀物产生,室温静置2 min,然后12,000 rpm离心3 ~ 5 min。 (注意:Buffer P3加入后应立即混合,避免产生局部沉淀,如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清) 5. 小心将上清液转移到离心吸附柱Spin Columns PA中,静置2 min,让质粒DNA与吸附柱中的硅胶膜充分结合。12,000 rpm离心0.5 ~ 1 min,弃收集管中的废液。 6. 向吸附柱中加入500 ul去蛋白液,12,000 rpm离心1 min,弃收集管中废液。 (注意:如果宿主菌是endA-,如DH5α若TOP10,此步骤可省略。如果宿主菌是endA+,如TG1、BL21、HB101、JM101等,此步骤不可省略,因这些宿主菌含有大量的核酸酶,易降解质粒。如果提取低拷贝质粒

20170915XXXX游离核酸提取试剂盒(货号:LS-R-N-004-05-3-0)测试报告

******外周血游离核酸提取试剂盒 货号:LS-R-N-004-05-3-0 测试报告 测试人员: 测试时间: 一、主要内容: 测试广东南芯医疗外周血游离核酸提取试剂盒游离核酸提取得率和质量。 实验过程中使用的是两个样本。 对实验过程中的cfDNA纯化产物进行质控(浓度及4200目的条带)。 二、实验结论 1、Qubit测定1号样本、2号样本浓度均低于0.5ng/mL。溶解体系为50μL,1号样本、2号样本均无法计算cfDNA的提取量。 2、4200检测:HSD1000, 1号样本在185bp处有主峰,2号样本在182bp处有主峰。 3、实验过程遇到的问题及解决方法 (1)问题:试剂盒说明书上适用于3mL的血浆,本次实验使用1mL血浆进行,并且蛋白酶K、BufferBEO用量根据倍数减少。 疑问: 1mL血浆的蛋白酶K用量为20uL,对裂解效果是否有影响? 建议联系该试剂盒技术支持进行咨询,关于提取条带中500bp以上条带的来源。 除上述问题外,其余实验步骤完全依照试剂盒要求进行。 三、实验结果 1、测试样本2个,实验步骤完全依照试剂盒要求进行,具体信息见下表:

样本名称样本编号cDNA浓度 李万才1<0.5ng/mL 陈秀英2<0.5ng/mL 4200检测图谱如下 1号样本的图谱: 2号样本的图谱: 结果分析:

Qubit测定1号样本、2号样本浓度均低于0.5ng/mL。溶解体系为50μL,1号样本、2号样本均无法计算cfDNA的提取量。 1号样本在185bp处有主峰,2号样本在182bp处有主峰。 四、实验方案 cfDNA的提取: 1、实验前准备:往BufferBEE中加入异丙醇;往BufferBEZ1和Buffer BEZ2中加入无水乙醇;加入体积参照试剂瓶上的标签。 2、准备血浆样品:从-80℃冰箱中取出样品1号李万才和样品2号陈秀英,置于室温水槽中溶解。 3、选择10ml的离心管,依次加入20μLProteinase K、1mL血浆。 4、再加入0.8mL Buffer BEO,涡旋震荡混匀30s。 5、在60℃孵育30min。 6、向裂解物中加入1.8mL Buffer BEE,涡旋震荡混匀15-30s。 7、冰上孵育5min。 8、取出吸附柱,做好标志。分多次将步骤7得到的裂解物加到吸附柱上,10000rpm,1min离心,去除废液。直至裂解物完全过柱。 9、向吸附柱中加入600μL Buffer BEZ1,12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱放回收集管上。 10、向吸附柱中加入750μL Buffer BEZ2,12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱放回收集管上。 11、向吸附柱中加入750μL无水乙醇,12000rpm离心1min,倒掉废液,将吸附柱放回收集管上。 12、12000rpm离心2miin,以去除吸附柱中残余液体。

质粒提取试剂盒 说明书 翻译

E.Z.N.A.?质粒小提试剂盒操作规程(英文版译文) (适用于No. D6942, D6943 & D6944) 1. 自新鲜划痕选择培养板中分离单菌落,接种含适当选择性抗生素的1-5ml的LB培养基进行培养。37℃强力摇动(~300rpm)孵育12-16h。使用10-20ml培养管或容量至少4倍于培养容积的培养瓶。强烈推荐使用endA阴性大肠杆菌菌株进行常规质粒分离。此类菌株包括DH5α和JM109。 2. 将1.5-5.0ml细菌室温10,000 x g离心1min。轻轻倒出或吸走培养基并丢弃。 3. 加入250μl 的溶液I/Rnase A重悬沉淀,涡旋或用移液器反复吹打。充分重悬沉淀对于获得高质量的DNA非常重要。 4. 加入250μl溶液II,倒置、转动试管数次使之轻轻混匀,得到透明的裂解产物。可能需要孵育2min。不要用力混合,以免使染色体DNA断裂,减低质粒的纯度。该步反应不要超过5min。溶液II不用时要拧紧瓶盖,以免试剂被空气中的CO2酸化。 5. 加入350μl溶液III,立即倒置试管数次混匀,直至白色絮状沉淀物形成。为避免形成局部沉淀,加入溶液III后应立即、充分混匀溶液。 6. 室温≥10,000 x g离心10分钟。白色沉淀物形成,立即进行下一步操作。 7. 小心翼翼 ....的吸取上清液,加入装配在2ml收集管中的小量纯化柱I中。确保离心沉淀未受扰动,确保没有细胞碎片加入到柱子中。室温下10,000 x g离心1分钟,使裂解液完全通过柱子。 8. 丢弃滤过液,重新使用2ml收集管;加入500μl HB缓冲液清洗柱子,室温10,000 x g离心1分钟,使溶液完成通过柱子。该步操作需确保残余的蛋白质污染被去除,以保证获得高品质的DNA以适合于下游的应用。 9. 丢弃滤过液,重新使用2ml收集管;加入700μl用无水乙醇稀释的DNA清洗液清洗柱子,室温10,000 x g离心1分钟,使溶液完全通过柱子,丢弃滤过液。 注意:DNA清洗液的浓缩液使用前必须用无水乙醇稀释(5倍稀释),如果DNA清洗液稀释液经过冷藏,则使用之前必须置于室温。 10. 可选步骤:重复清洗,加入另外的700μl用无水乙醇稀释的DNA清洗液。 11. 将空柱子≥13,000 x g离心2min,使柱子的基质干燥。此步骤为关键操作,不可遗漏。 12. 将柱子放入干净的1.5ml微量离心管中。将30-50μl(取决于终产物的期望浓度)洗脱液或无菌去离子水直接加入柱子基质上,使之于室温下静置1-2min。≥13,000 x g离心1min洗脱DNA。可以进行二次洗脱,以收集残存的DNA。 13. DNA的产量和质量:分别在波长260nm和280nm处测定样品适当稀释液的吸光度。DNA的浓度计算如下: DNA浓度=A260×50×(稀释倍数)μg/ml A260/A280的比率可以反映核酸的纯度。比值大于1.8表明核算的纯度在90%以上。或者,DNA的产量(及质量)有时可以通过琼脂糖胶/溴乙锭电泳与已知浓度的DNA样品相比较更好的予以确定。通常情况下洗脱的大部分DNA是超螺旋单体形式,但也可能存在串联体形式。 张小强翻译

动物组织基因组DNA提取试剂盒说明书

磁珠法动物组织基因组DNA提取试剂盒 MagBeads Tissues Gen DNA Extraction Kit 【目录号】TGDE-5005、TGDE-5030 【运输条件】2~25℃; 【保存条件】磁珠悬浮液2~8℃,其它组分室温保存; 【试剂盒组成】 【注意事项】 1. 磁珠悬浮液严禁反复冻融和离心,使用前请充分混匀; 2. 使用前请检查裂解液1和裂解液2是否出现结晶,如有结晶请置于65℃水浴重新溶解; 3. 在使用本试剂盒前,请用户自配80%乙醇; 4. 如需去除RNA请自备RNase A溶液(100mg/mL, 分散液10mM Tris-HCl, 1mM EDTA, pH值8.0); 5. 本操作指南经本公司反复验证,使用前请仔细阅读,并且按照操作指南的建议操作。

磁珠法·自动化:为生命科学提供自动化磁纳米捕获方案 【产品简介】 本产品适用于从各种动物组织以或者细胞样本中提取基因组DNA。试剂盒采用具有独特分离作用的纳米磁珠和独特的缓冲液系统。特殊技术包埋的纳米磁珠在特定条件下对核酸具有极强的亲和力,而当条件改变时可以释放所吸附的核酸,从而达到快速分离纯化核酸的目的。 本试剂盒提取所得基因组DNA产物得量高、纯度好,适用于各种下游分子生物学实验,如:酶切、PCR、QPCR、文库构建、Southern 杂交、芯片检测和高通量测序等。本试剂盒可配合核自动化酸提取仪或工作站使用,实现高通量操作。 【试剂盒说明】 【自备仪器、耗材及试剂】 仪器自动版 研钵(或组织研磨机、匀浆机)、英芮诚ETP-300型全自动核酸提取仪、核酸提取仪配套用磁棒套、水浴锅或金属浴、涡旋振荡仪、96孔方孔圆底板、80%乙醇、异丙醇、液氮。 手动版 研钵(或组织研磨机、匀浆机)、水浴锅或金属浴、涡旋振荡仪、真空干燥箱、80%乙醇、异丙醇、2.0mL离心管、离心管配套用磁力架、液氮。 【仪器自动版操作步骤】 本操作以英芮诚ETP-300型全自动核酸提取仪为例,同步可完成32个样本的提取。 1.准备96孔板 参照下表向96孔板各孔位中分别加入相应试剂:

微量临床样品基因组DNA快速提取试剂盒操作方法及步骤说明书

微量临床样品基因组DNA快速提取试剂盒 目录号:DN25 目录编号包装单位 DN2501 50次 适用范围: 适合于从微量血液、法医材料、干血点、药签等微量样品中分离纯化基因组DNA。 试剂盒组成、储存、稳定性: 试剂盒组成保存50次 裂解液ML 室温11 ml 结合液CB 室温15 ml 抑制物去除液IR 室温25 ml 漂洗液WB 室温15ml 第一次使用前按说明加指定量乙醇 Poly Carrier -20℃200 μl 洗脱缓冲液EB 室温10 ml 蛋白酶K粉(可选) 20mg/ml -20℃20 mg 吸附柱AC和收集管室温50套本试剂盒在室温储存12个月不影响使用效果储存事项:

1.结合液CB或者抑制物去除液IR低温时可能出现析出和沉淀,可以在37℃水浴几分 钟帮助重新溶解,恢复澄清透明后冷却到室温即可使用。 2.为避免降低活性,方便运输,提供蛋白酶K为冻干粉状,收到后,可短暂离心后, 加入1毫升灭菌水溶解。因为反复冻融可能会降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量(20微升)分装冻存,-20℃保存。 3.避免试剂长时间暴露于空气中发生挥发、氧化、pH值变化,各溶液使用后应及时盖 紧盖子。仔细阅读注意事项4。 4. 产品介绍: 本试剂盒采用特制的进口DNA吸附柱和独特的缓冲液系统,特别适合于从微量血液、法医材料、干血点、药签、口香糖、尿液等微量样品中分离纯化基因组DNA。各种来源样品裂解消化处理后DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜(特别配备了Poly Carrier可以从体系中轻松捕获微量核酸),再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将纯净的基因组DNA 从硅基质膜上洗脱。纯化后的DNA无杂质和PCR抑制剂,可直接适用于PCR分析。 产品特点: 1.不需要使用有毒的苯酚等试剂,也不需要乙醇沉淀等步骤。 2.节省时间,简捷,单个样品操作一般可在20分钟内完成。 3.配备了Poly Carrier用于充分收集特别微量DNA。 4.多次柱漂洗确保高纯度,提取的DNA 纯度高,质量稳定可靠,可适用于各种常规 操作,包括PCR、酶切、测序、Southern 杂交等。

promegaDNA组织提取试剂盒

PromegaDNA提取试剂盒的使用方法 一、使用前的准备工作 Proteinase k solution:用无核酸酶的水把蛋白酶K稀释成20mg/ml,按照自己的每次平均使用量分装,储存在-20℃,融化时要在冰上融化,反复冻融会降低Proteinase K的活性 消化液配制:在tube中混合下面各种反应物,使用前放在冰上。 Wizard SV Wash solution(洗脱液)的配制:按照瓶子标签上要求的量,添加95%的乙醇到Wizard sv solution 中,做上标记,室温保存。 PromegaDNA提取试剂盒的使用方法步骤(离心机法) 0、将Nuclease-Free Water 放在65℃的水浴锅中 1、剪取动物组织20mg,分成相同的2份,放在1.5ml的离心管中, 样品中决不能含有软骨组织,否则会阻塞柱子

2、每份样品中添加275ul先前准备的消化液,确保消化液能够完 全覆盖样品,如果不能覆盖,将样品再剪得小点 3、把样品放到55℃的水浴锅或加热块中孵育16-18小时(过夜), 蛋白酶K消化过夜后2000g离心,取上清液到1.5ml的离心管 中。 4、向样品中添加250ul的Wizard SV Lysis Buffer,漩涡混匀 5、处理后的产物尽快进行下面的操作,如果不能进行下面的操作, 应该把它放在-70℃下保存,使用时应该冻融或者放在55℃温 和解冻 6、将收集管做上标记,将柱子放在收集管上,把整个1.5ml离心 管内的溶解产物转移到柱子中。13000g离心3分钟,目的是让 基因组吸附在柱子中,如果仍有残留液体,可以重新13000g 离心一分钟 7、倒掉收集管中的液体,把柱子重新放回收集管上 8、检查一下乙醇是否已经添加到Wizard SV Wash Solution中 9、每个样品中添加650ul的Wizard SV Wash Solution(真空抽 滤要加800ul),13000离心1分钟 10、去除溶液,将柱子重新放置在集合管中 11、重复9-10步3次,(一共需要洗4次) 12、洗剂结束后,清空收集管中的水13000g离心2分钟 13、去掉收集管,取相同数量的1.5ml的离心管做上标记,将柱子 将在 1.5ml的离心管上,添加250ul65℃的Nuclease-Free

mobioDNA提取试剂盒说明书翻译

1.加2g土壤到15mL Bead Tube中 2.加入0.25mLSR1和0.8mLSR2之后,加入2.5mL Bead Solution到Bead Tube 3.加入3.5mL酚:氯仿:异戊醇25:24:1到试管中,加盖后涡旋混合直到分层消失。 4.最大转速涡旋震荡15min 5.室温,2500g离心10min 6.取出后,小心地转移上层水相到干净的15mL收集管中,弃掉下层酚 7.加1.5mL SR3到水相中,然后涡旋混匀,4℃孵育10min 8.室温,2500g离心10min。转移上清到一个新的15mL收集管中 9.加入5mL SR4溶液到装有上清的收集管中,混匀,室温孵育30min 10.室温,2500g离心30min 11.倒掉上清,将收集管倒置在纸上5min 12.震荡SR5混合。加1mL SR5到15mL收集管中,并反复吹打使完全重悬。 13.为每一个RNA样品准备一个RNA Capture Column A.拿去15mL收集管的盖子,将RNA Capture Column放入15mL收集管中。 B.加2mL SR5到RNA Capture Column中,让其完全流尽。 14.从第12步加入RNA样品至RNA Capture Column中,然后让其在重力作用下流尽。收集 液体。 15.用1mLSR5清洗柱子。重力流尽,收集洗脱液。 16.转移柱子到新的收集管,加入SR6震荡混合,然后加入1mL SR6到RNA Capture Column 洗脱RNA到15mL收集管中,重力流尽。 17.转移洗脱的RNA到2.2mL收集管中,并且加入1mL SR4.颠倒至少一次混合,然后-20℃ 孵育最少10min 18.室温13000g离心15min浓缩RNA 19.倒掉上清并倒转收集管在纸上10min晾干 20.用100μL SR7溶液重悬RNA沉淀,去除其中的基因组

高纯度质粒小提中量试剂盒说明书-天根

1.柱平衡步骤:向吸附柱CP4 中(吸附柱放入收集管中)加入500 μL的平衡液BL, 12000 rpm(~13400g)离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱重新放回收集管中。(请使用当天处理过的柱子) 2.取5-15ml 过夜培养的菌液加入离心管中,12000 rpm (~13400g )离心1 min,尽量吸 除上清。 注意:菌液较多时可以通过几次离心将菌体沉淀收集到一个离心管中,菌体量以能够充分裂解为佳,过多的菌体裂解不充分会降低质粒的提取效率。 3.向留有菌体沉淀的离心管中加入500 μL溶液Pl (请先检查是否已加入RNaseA ) ,使 用移液器或涡旋振荡器彻底悬浮细菌细胞沉淀。 注意:请务必彻底悬浮细菌沉淀,如果有未彻底混匀的菌块会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。质粒 4.向离心管中加入500μL溶液P2 ,温和地上下翻转6-8 次使菌体充分裂解。注意:温和 地混合不要剧烈震荡,以免污染基因组DNA 。此时菌液应变得清亮粘稠,所用时间不应超过5 min,以免质粒受到破坏。如果未变得清亮,可能由于菌体过多,裂解不彻底,应减少菌体量。 5.向离心管中加入700 μL溶液P3 ,立即温和地上下翻转6-8 次,充分混匀,此时会出 现白色絮状沉淀。12000rpm ( ~13400g )离心10 min,此时在离心管底部形成沉淀。 注意:P3 加入后应立即混合,避免产生局部沉淀。如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。 6.将上一步收集的上清液分次加入过滤柱Cs (过滤柱放入收集管中), 12000rpm (~13400g )离心2 min,小心地将离心后收集管中得到的溶液分次加入吸附柱CP4 中(吸附柱放入收集管中), (如果过滤柱中有残余的液体说明步骤5 吸取的上清中杂质过多,可以延长离心的时间;如果离心后收集管底部有少量的沉淀.尽量地吸取上清)。 7.12000rpm (~13400g)离心l min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP4 放入收集管中。 8.向吸附柱CP4 中加入500μL去蛋白液PD,12000rpm(~13400g)离心l min,倒掉收 集管中的废液,将吸附柱CP4 放入收集管中。 9.向吸附柱CP4 中加入600μL漂洗液PW(请先检查是否已加入无水乙醇),12000rpm (~13400g)离心1 min,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CP4 放入收集管中。注意:加入漂洗液PW后,如果室温静置2-5 min,有助于更好地去除杂质。 10.向吸附柱CP4 中加入600μL漂洗液PW , 12000rpm(13400g)离心l min,倒掉收集管 中的废液。 11.将吸附柱CP4 重新放回收集管中置于12000rpm(~13400g )离心2 min,目的是将吸 附柱中残余的漂洗液去除。 注意:漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR 等)实验。为确保下游实验不受残留乙醇的影响,建议将吸附柱CP4 开盖,置于室温放置数min,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。 12.将吸附柱自科置于一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100-300μL洗脱 缓冲液TB ,室温放置2 min,12000rpm(~13400g )离心l min将质粒溶液收集到离心管中。 注意:为了增加质粒的回收效率,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中.重复步骤 12 。洗脱液的pH 值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液,应保证其pH 值在 7.0-8.5 范围内(可以用NaOH 将水的pH 值调到此范围), pH 值低于7.0 会降低洗脱 效率。洗脱缓冲液体积不应少于100μL,体积过小影响回收效率。且DNA产物应保存

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