专利申请中核苷酸和氨基酸序列表的表述标准

氨基酸缩写简写及密码子及其氨基酸应用

氨基酸 体内20 种氨基酸按理化性质可分为4 组： ①非极性、疏水性氨基酸：甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、苯丙 氨酸和脯氨酸。 ②极性、中性氨基酸：色氨酸、丝氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、蛋氨酸、天冬酰胺、 谷氨酰胺和苏氨酸。 ③酸性的氨基酸：天冬氨酸和谷氨酸。 ④碱性氨基酸：赖氨酸、精氨酸和组氨酸。 中文名称英文名称缩写符号分子量类型 丙氨酸Alanine Ala A 89.079 脂肪族类 精氨酸Arginine Arg R 174.188 碱性氨基酸类天冬酰胺Asparagine Asn N 132.104 酰胺类 天冬氨酸Aspartic acid Asp D 133.089 酸性氨基酸类半胱氨酸Cysteine Cys C 121.145 含硫类 谷氨酰胺Glutamine Gln Q 146.131 酰胺类 谷氨酸Glutamic acid Glu E 147.116 酸性氨基酸类甘氨酸Glycine Gly] G 75.052 脂肪族类 组氨酸Histidine His H 155.141 碱性氨基酸类异亮氨酸Isoleucine Ile I 131.16 脂肪族类 亮氨酸Leucine Leu L 131.16 脂肪族类 赖氨酸Lysine Lys K 146.17 碱性氨基酸类蛋氨酸Methionine Met M 149.199 含硫类 苯丙氨酸Phenylalanine Phe F 165.177 芳香族类 脯氨酸Proline Pro P 115.117 亚氨基酸 丝氨酸Serine Ser S 105.078 羟基类 苏氨酸Threonine Thr T 119.105 羟基类 色氨酸Tryptophan Trp W 204.213 芳香族类 酪氨酸Tyrosine Tyr Y 181.176 芳香族类 缬氨酸Valine Val V 117.133 脂肪族类

氨基酸与核酸代谢

氨基酸与核酸代谢 1. 概述三大类营养物质代谢的联系。 答：在生物体内，糖类、脂质和蛋白质这三类物质的代谢是同时进行的，它们之间既相互联系，又相互制约，形成一个协调统一的过程。 1.糖类、脂质和蛋白质之间可以转化关系 （1）糖类代谢与蛋白质代谢的关系 ①糖类代谢的中间产物可以转变成非必需氨基酸； ②蛋白质可以转化成糖类。 几乎所有组成蛋白质的天然氨基酸均可转变成糖类。 （2）糖类代谢与脂质代谢的关系 ①糖类转变成脂肪 ②脂肪转变成糖类 脂质分解产生的甘油和脂肪酸能够转变成糖类。 （3）蛋白质代谢与脂质代谢的关系 ①一般来说，动物体内不容易利用脂肪酸合成氨基酸。植物和微生物可由脂肪酸和氮源生成氨基酸。某些氨基酸通过不同途径可转变成甘油或脂肪酸 ②某些氨基酸通过不同途径可转变成甘油或脂肪酸。 2.糖类、脂质和蛋白质之间转化的条件 糖类、脂质和蛋白质之间的转化是有条件的。例如，只有在糖类供应充足的情况下，糖类才有可能大量转化成脂质。不仅如此，各种代谢物之间的转化程度也是有明显差异的。例如，糖类可以大量转化成脂肪，而脂肪却不能大量转化成糖类。只有当糖类代谢发生障碍时才由脂肪和蛋白质来供能,当糖类和脂肪摄入量都不足时,蛋白质的分解才会增加 3.糖类、脂质和蛋白质之间除了能转化外，还相互制约 三大营养物质在代谢上的共同点; （1）物质的来源：从根本上说均是食物。 （2）这些物质在细胞内虽然均进行着许多种的生物化学反应，但是可以归纳为进行合成和分解这两方面的反应，并且这两方面的反应在细胞内是同时进行，相互联系的。 （3）三大营养物质的代谢均必须在酶的催化作用下才能够完成。 （4）这些物质彻底氧化分解时，代谢终产物里均有CO2和水，均能放释能量。 三大营养物质在代谢上的不同点 （1）糖类是主要的供能物质，脂肪是主要的储能物质，蛋白质的主要功能是构成生物体和调节生命活动。 （2）蛋白质质代谢的最终产物里还有尿素。 人体内的物质代谢是一个完整的统一过程 我们从糖类、氨基酸能够转变成脂肪，脂肪、氨基酸能够转变成糖类，可以看出各种物质代谢之间是相互联系的。这种联系说明，人体内的物质代谢是一个完整的统一过程，它使细胞内的成分不断地进行新旧更替。 2. 如何看懂肝功化验单？ 临床上肝功能检查的主要项目包括：蛋白代谢检查、糖代谢检查、脂类检查、胆红素代谢检查、血清酶学检查等。 如何看血清酶学化验单 常见以下几种酶：谷丙转氨酶（英文简写为ALT或GPT)、谷草转氨酶(AST或GOT)、碱性

各种标签Tag的核苷酸与氨基酸序列

V5-tag 5ˊGGT AAG CCT ATC CCT AAC CCT CTC CTC GGT CTC GAT TCT ACG 3ˊ G K P I P N P L L G L D S T 6 X His tag CAT CAT CAC CAT CAC CAT H H H H H H S-tag AAA GAA ACC GCT GCT GCT AAA TTC GAA CGC CAG CAC A TG GAC A GC KETAAAKFERQHMDS Flag-Tag GAT TAC AAG GAT GAC GAC GAT AAG D Y K D D D D K

Myc-Tag GAG CAG AAA CTC ATC TCT GAA GAG GAT CTG HA-Tag TAC CCA TAC GAC GTC CCA GAC TAC GCT VSV-G: TATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAG Thrombin recognises the consensus sequence Leu-Val-Pro-Arg-Gly-Ser Sequence：CTG GTT CCG CGT GGA TCC 重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域。特别是体内功能研究和蛋白质的大规模生产都需要应用重组蛋白表达载体。 美国GeneCopoeia的蛋白表达载体按照表达宿主的不同新推出3类，分别为表达宿主为 大肠杆菌，哺乳动物细胞的，以及慢病毒载体，宿主可以为哺乳动物细胞和原代细胞。 除了必要的复制和筛选的元件，协助表达和翻译的元件外，本文将各类载体分别按照功能标签的不同确定种类并将个标签的功能初步介绍如下： His6： His6是指六个组氨酸残基组成的融合标签，可插入在目的蛋白的C末端或N末端。当某 一个标签的使用，一是能构成表位利于纯化和检测；二是构成独特的结构特征（结合配体）利于纯化。组氨酸残基侧链与固态的镍有强烈的吸引力，可用于固定化金属螯合层析(IMAC)，对重组蛋白进行分离纯化。 使用His-tag有下面优点： 1.标签的分子量小，只有~0.84KD，而GST和蛋白A分别为~26KD和~30KD，一般不影响目标蛋白的功能； 2.His标签融合蛋白可以在非离子型表面活性剂存在的条件下或变性条件下纯化，前者在纯

氨基酸代谢和核苷酸代谢_0

---------------------------------------------------------------最新资料推荐------------------------------------------------------ 氨基酸代谢和核苷酸代谢 组卷测试一： 填空题 1.哺乳动物产生 1 分子尿素需要消耗________________分子的 ATP。 2.褪黑激素来源于________________氨基酸，而硫磺酸来源于________________氨基酸。 3. -谷氨酰循环的生理功能是________________。 4.核苷酸的合成包括________________和________________两条途径。 5.转氨酶的辅基是________________。 6.________________酶的缺乏可导致人患严重的复合性免疫缺陷症(SCID)，使用________________治疗可治愈此疾患。 7.痛风是因为体内________________产生过多造成的，使用________________作为黄嘌呤氧化酶的自杀性底物可以治疗痛风。 8.不能使用 5-溴尿嘧啶核苷酸代替 5-溴尿嘧啶治疗癌症是因为________________。 9.脑细胞中氨的主要代谢去向是________________。 10.从 IMP 合成 GMP 需要消耗________________，而从IMP 合成 AMP 需要消耗________________作为能源物质。 11.Arg 可以通过________________循环形成。 1 / 6

氨基酸核苷酸

生物化学:氨基酸、核苷酸代谢考卷说明：生物化学，执业医师考试在线测试试题。满分64分! 单项选择题(每题1分,共64题) 1. 下列氨基酸中不属于必需氨基酸的是答案解析 A 缬氨酸 B 苏氨酸 C 赖氨酸 D 蛋氨酸 E 谷氨酸 2. 蛋白质的消化酶主要来源于答案解析 A 胃 B 小肠 C 胆囊 D 胰腺 E 肝脏 3. 体内NH3的主要来源是答案解析 A 肠道吸收 B 肾脏产氨 C 氨基酸脱氨基 D 胺分解 E 碱基分解 4. 体内氨的主要去路答案解析

A 合成谷氨酰胺 B 合成尿素 C 生成铵盐 D 生成非必需氨基酸 E 参与嘌呤、嘧啶合成 5. 蛋白质生理价值大小主要取决于答案解析 A 氨基酸种类 B 氨基酸数量 C 必需氨基酸数量 D 必需氨基酸种类 E 必需氨基酸数量、种类及比例 6. 蛋白质腐败作用的主要产物答案解析 A 氨、胺类 B 胺类、硫化氢 C 吲哚、氨 D 苯酚、胺类 E 硫化氢 7. 下述哪种酶缺乏可致白化病答案解析 A 酪氨酸转氨酶 B 苯丙氨酸转氨酶 C 苯丙酮酸羟化酶 D 酪氨酸羟化酶

E 酪氨酸酶 8. 下述有关糖、脂肪、蛋白质互变的叙述中，哪一项是错误的答案解析 A 蛋白质可转变为糖 B 脂肪可转变为蛋白质 C 糖可转变为脂肪 D 葡萄糖可转变为非必需氨基酸的碳架部分 E 脂肪中甘油可转变为糖 9. 下列哪种氨基酸是生酮氨基酸答案解析 A 谷氨酸 B 赖氨酸 C 亮氨酸 D 甘氨酸 E 蛋氨酸 10. 血液中NPN的主要成分是答案解析 A 尿素 B 尿酸 C 肌酸 D 胺 E 氨基酸 11. 肌酸的合成原料是答案解析 A 精氨酸和瓜氨酸 B 精氨酸和甘氨酸

氨基酸与核苷酸代谢

氨基酸与核苷酸代谢 （一）名词解释 1．蛋白酶（Proteinase） 2．肽酶（Peptidase） 3．氮平衡（Nitrogen balance） 4．转氨作用（Transamination） 联合脱氨基作用 8．尿素循环（Urea cycle） 9．生糖氨基酸（Glucogenic amino acid） 10．生酮氨基酸（Ketogenic amino acid） 11．核酸酶（Nuclease） 12．限制性核酸内切酶（Restriction endonuclease） 13．一碳单位（One carbon unit） （二）英文缩写符号 1．GOT 2．GPT 3．APS 4．PAL 5．PRPP 6．SAM 7．GDH 8．IMP （三）填空 1．生物体内的蛋白质可被和共同作用降解成氨基酸。 2．多肽链经胰蛋白酶降解后，产生新肽段羧基端主要是和氨基酸残基。3．胰凝乳蛋白酶专一性水解多肽链由族氨基酸端形成的肽键。 4．氨基酸的降解反应包括、和作用。 5．转氨酶和脱羧酶的辅酶通常是。 6．谷氨酸经脱氨后产生和氨，前者进入进一步代谢。 7．尿素循环中产生的和两种氨基酸不是蛋白质氨基酸。 8．尿素分子中两个N原子，分别来自和。 9．芳香族氨基酸碳架主要来自糖酵解中间代谢物和磷酸戊糖途径的中间代谢物。 13．组氨酸合成的碳架来自糖代谢的中间物。 14．氨基酸脱下氨的主要去路有、和。 15．胞嘧啶和尿嘧啶经脱氨、还原和水解产生的终产物为。 16．参与嘌呤核苷酸合成的氨基酸有、和。 17．尿苷酸转变为胞苷酸是在水平上进行的。 18．脱氧核糖核苷酸的合成是由酶催化的，被还原的底物是。19．在嘌呤核苷酸的合成中,腺苷酸的C-6氨基来自；鸟苷酸的C-2氨基来自。 20．对某些碱基顺序有专一性的核酸内切酶称为。 21．多巴是经作用生成的。 22．生物体中活性蛋氨酸是，它是活泼的供应者。 23．转氨基作用是沟通和桥梁； 24．尿素循环中涉及的天然蛋白质氨基酸是； 25．氨的去路有、和降解；脱氨产生的生理作用是和。 26．氨基酸通过、和降解，脱羧后产生和，此过程需——作辅酶。 27．Tyr脱NH3,然后脱羧后生成。 28．Tyr羟化后生成，后者经脱羧生成。

核酸、氨基酸序列和蛋白质二级结构之间关系的探究

核酸、氨基酸序列和蛋白质二级结构之间关系的探究 马鹏，王联结 陕西科技大学生命科学与工程学院，陕西咸阳（712081） E-mail：04mapeng@https://www.wendangku.net/doc/d91819054.html, 摘要：核酸序列中是否存在蛋白质空间结构信息？根据通常情况下遗传密码表中密码子中间位的碱基配对时产生的氢键数目，尝试将20种氨基酸划分为两类，并用自编的计算机软件对蛋白质二级结构数据库中两类氨基酸的类聚现象进行了统计分析。结果表明，使用这种方法对氨基酸进行划分后，氨基酸残基具有较大概率与划入同一类的氨基酸残基相邻出现，并且这种聚集体对二级结构具有一定的偏好性。 关键词：核酸，氨基酸序列，二级结构，预测 1. 引言 过去的几十年中，出现了多种多样的蛋白质二级结构预测方法。其中一部分，也是最早出现的，后来出现低谷的研究方法是统计序列中氨基酸残基对结构的倾向性[1~3]。但近年来，通过氨基酸序列预测蛋白质二级结构的研究又有复苏。长期以来，人们也试图通过分析核酸序列找到蛋白质空间结构的信息，例如从氨基酸的密码子出发来研究序列和结构之间的关系[4~6]。对氨基酸残基聚集体的研究也有报道[3,7~9]。本文根据氨基酸密码子和反密码子配对时中间位碱基之间正常情况下形成的氢键数目（以下简称为氢键数法）的不同对氨基酸残基进行了重新分类，并对分类后可能在蛋白质序列中存在的类聚现象（同一类氨基酸残基的连续分布）做了初步研究。 2. 方法 2.1 氢键数方法 根据20种氨基酸三联密码子中间位的碱基在正常情况下能够形成的氢键数目为2或3的不同，将20种氨基酸分为两大类，其中：第一类氨基酸残基包括A、G、C、T、P、R、S和W；而第二类包括D、E、F、I、K、L、N、Q、V、H、Y和M。 2.2 数据库 选用DSSP数据库，并使用相似性小于25％的蛋白质选择列表，最后取得了923个非同源蛋白质数据。在DSSP二级结构8态分类到3态分类转换中借鉴前人工作采用如下划分：α螺旋h（H，G，I），β折叠e（E）和卷曲c（B，T，S，C）。将B结构划入卷曲中是因为它作为一个独立的连接键，很难被认为是一种规则结构[3]。再将3种二级结构按照其是否属于规则结构划为两大类：第一类为非规则结构（c）；第二类为规则结构（h，e）。 2.3 统计方法 根据氢键数方法将氨基酸分类后，为了研究这种分类方法在蛋白质二级结构预测中的应用意义，我们进行了一些统计计算。早期观察表明，分类后某些氨基酸残基在一些蛋白质中具有类聚倾向。那么这种类聚是否在蛋白质中具有普遍性？在不考虑二级结构的情况下，对蛋白质中类聚出现概率的统计给这个问题做出了衡量。类聚的出现如果有相当大的可能性，对类聚和蛋白质二级结构之间对应关系的研究则是必要的。这种对应关系的研究包括两个方面：类聚中的残基是否具有特定的二级结构；具有特定二级结构的氨基酸残基是否处于特定的类聚中。 在不考虑二级结构情况下，统计出处于类聚的残基数量N，该数值与残基总数N t的比值P作为衡量类聚现象是否具有普遍性的统计量，表示一个氨基酸残基处于类聚的概率，有：P＝N/N t

氨基酸代谢核苷酸代谢

组卷测试 一：填空题 1.哺乳动物产生1分子尿素需要消耗________________分子的A TP。 2.褪黑激素来源于________________氨基酸，而硫磺酸来源于________________氨基酸。 3.γ-谷氨酰循环的生理功能是________________。 4.核苷酸的合成包括________________和________________两条途径。 5.转氨酶的辅基是________________。 6.________________酶的缺乏可导致人患严重的复合性免疫缺陷症(SCID)，使用________________治疗可治愈此疾患。 7.痛风是因为体内________________产生过多造成的，使用________________作为黄嘌呤氧化酶的自杀性底物可以治疗痛风。 8.不能使用5-溴尿嘧啶核苷酸代替5-溴尿嘧啶治疗癌症是因为________________。 9.脑细胞中氨的主要代谢去向是________________。 10.从IMP合成GMP需要消耗________________，而从IMP合成AMP需要消耗________________作为能源物质。 11.Arg可以通过________________循环形成。 12.氨基酸共有的代谢途径有________________和________________。 13.人类对嘌呤代谢的终产物是________________。 14.羟基脲作为________________酶的抑制剂，可抑制脱氧核苷酸的生物合成。 15.脱氧核苷酸是由________________还原而来。 16.HGPRT是指________________，该酶的完全缺失可导致人患________________。 17.人类对氨基代谢的终产物是________________，鸟类对氨基代谢的终产物是________________，植物解除氨的毒害的方法是________________。 18.重亮氨酸作为________________类似物可抑制嘌呤核苷酸的从头合成。 19.通过________________的脱羧可产生β-丙氨酸。 20.细菌嘧啶核苷酸从头合成途径中的第一个酶是________________。该酶可被终产物 ________________抑制。 21.PAPS是指________________，它的生理功能是________________。 二：是非题 1.[ ]真核细胞内参与嘧啶核苷酸从头合成的酶都位于细胞质。 2.[ ]参与尿素循环的酶都位于线粒体内。 3.[ ]既然谷氨酸上的N原子可经过转氨基作用重新分布，那么谷氨酸应该可作为很好的营养品而弥补蛋白质缺乏。 4.[ ]嘧啶合成所需要的氨甲酰磷酸合成酶与尿素循环所需要的氨甲酰磷酸合成酶是同一个酶。 5.[ ]氨基酸脱羧酶通常也需要吡哆醛磷酸作为其辅基。 6.[ ]一般来说，在哺乳动物体内由蛋白质氧化分解产生的能量效率低于糖或脂肪的氧化分解。 7.[ ]嘌呤核苷酸的从头合成是先闭环，再在形成N糖苷键。 8.[ ]氨基酸经脱氨基作用以后留下的碳骨架进行氧化分解需要先形成能够进入TCA循环的中间物。 9.[ ]Arg是哺乳动物的一种非必需氨基酸，因为在它们的肝细胞之中，含有足够的合成Arg的酶。 10.[ ]动物产生尿素的主要器官是肾脏。 11.[ ]黄嘌呤氧化酶既可以使用黄嘌呤又可以使用次黄嘌呤作为底物。 12.[ ]L-氨基酸氧化酶是参与氨基酸脱氨基作用的主要酶。

生化核苷酸代谢和生物转化

本科-核苷酸代谢-非营养物质代谢1 一、单5选1(题下选项可能多个正确，只能选择其中最佳的一项) 1、参加肠道次级结合胆汁酸生成的氨基酸是 A:鸟氨酸 B:精氨酸 C:甘氨酸 D:蛋氨酸 E:瓜氨酸 考生答案：C 标准答案：C 满分：4 得分：4 2、体内脱氧核苷酸是由下列哪种物质直接还原而成的 A:核糖 B:核糖核苷 C:一磷酸核苷 D:二磷酸核苷 E:三磷酸核苷 考生答案：D 标准答案：D 满分：4 得分：4 3、关于生物转化作用，下列哪项是不正确的 A:具有多样性和连续性的特点 B:常受年龄、性别、诱导物等因素影响 C:有解毒与致毒的双重性 D:使非营养性物质极性降低，利于排泄 E:使非营养性物质极性增加，利于排泄 考生答案：D 标准答案：D 满分：4 得分：4 4、甲氨蝶呤（MTX）在临床上用于治疗白血病的依据是 A:嘌呤类似物 B:嘧啶类似物 C:叶酸类似物 D:二氢叶酸类似物

E:氨基酸类似物 考生答案：C 标准答案：C 满分：4 得分：4 5、嘧啶分解代谢的终产物正确的是 A:尿酸 B:尿苷 C:尿素 D:α-丙氨酸 E:氨和二氧化碳 考生答案：E 标准答案：E 满分：4 得分：4 6、胸腺嘧啶在体内合成时甲基来自 A:N10-甲酰四氢叶酸 B:胆碱 C:N5，N10-甲烯四氢叶酸 D:S-腺苷甲硫氨酸 E:肉碱 考生答案：C 标准答案：C 满分：4 得分：4 7、下列哪种物质是结合胆红素 A:胆红素—清蛋白 B:胆红素—Y蛋白 C:胆红素—Z蛋白 D:双葡糖醛酸胆红素 E:胆红素-结合珠蛋白 考生答案：D 标准答案：D 满分：4 得分：4 8、嘧啶环中两个氮原子是来自 A:谷氨酰胺和氮 B:谷氨酰胺和天冬酰胺 C:谷氨酰胺和氨甲基鳞酸 D:天冬酰胺和氨甲基磷酸

39. 保护氨基酸检验指导书

保护氨基酸检验指导书发放号： 编写: 审核:批准: 1. 检验流程 1.1 成品置于待测区 1.2 检验员取样 1.3 成品检测(外观、纯度、质谱、旋光、熔点、澄清度等) 1.4 备注： A. 产品粉碎并包装置于待测区后，取样检测出的数据写入检验报告。 B. 研发部提供的生产过程中的图谱 (MS、HPLC) ，可做参考，有权进行复查。 2 检验项目 2.1 外观：目测法（须为白色或类白色粉末或结晶性类白色粉末） 2.2 光学纯度的测定 2.2.1 仪器和试剂 液相色谱仪、输液泵、检测器、色谱柱、记录装置、进样阀、微量注射器、超声波发生器、蒸馏水、乙晴、三氟乙酸 2.2.2 分析步骤 A. 称取一定量的样品溶于10ml容量瓶中，直至完全溶解，然后将其过滤。 B. 用微量注射器吸取一定量试样溶液进入色谱系统，利用梯度洗脱使样品达到分离。 C. 各组分经过紫外检测器，通过色谱工作站记录各组分的紫外吸收、并转换为电信号。 D. 在线色谱工作站记录各组分的各项参数，如保留时间、峰高、峰面积，通过面积归一法计算出各组分的百分含量。 2.2.3 注意事项 A. 氨基酸样品分析必须打空白，谱图中不允许出现未积分的小杂峰，若是空白中有的，必须以基线相减的方式处理掉；如果处理不掉，必须进行复测。 B. 基线尽量保持一条直线。 C. 谱图中不允许出现负峰。 2.2.4 要求及规定 A. 氨基酸样品分析必须打空白，谱图中不允许出现未积分的小杂峰，若是空白中有的，必须以基线相减的方式处理掉；如果处理不掉，必须进行复测。 B. 基线尽量保持一条直线。 C. 谱图中不允许出现负峰。 D. 尽量安排同一产品的测试使用同一分析条件，这样可加强可比性。 E. 比较数据的重复性时，安排统一产品测试的时间不要间隔很久。 F . 若单项杂质在1%±0.05%，复测确定数据的重复性。 G. 若同一批次产品分包装送样检测，混合样数据应在各分包装测试数据的范围内。例如：分包装测试的数据分别为：98.5%、98.6%、98.7%，若混合样数据不在98.5%-98.7%范围内，则复测确定数据的重复性。 2.3 旋光的测定 2.3.1 仪器和试剂 旋光仪、25ml容量瓶、电子天平、DMF、NaOH、AcOH、EtOAc、MeOH、EtOH、HCl、CHCl3等。

第20章氨酸代谢与核苷酸代谢

第十一章氨基酸代谢与核苷酸代谢 一：填空题 1.氨基酸共有的代谢途径有________________和________________。 2.转氨酶的辅基是________________。 3.人类对氨基代谢的终产物是________________，鸟类对氨基代谢的终产物是________________，植物解除氨的毒害的方法是________________。 4.哺乳动物产生1分子尿素需要消耗________________分子的A TP。 5.脑细胞中氨的主要代谢去向是________________。 6.通过________________的脱羧可产生β-丙氨酸。 7.人类对嘌呤代谢的终产物是________________。 8.痛风是因为体内________________产生过多造成的，使用________________作为黄嘌呤氧化酶的自杀性底物可以治疗痛风。 9.________________酶的缺乏可导致人患严重的复合性免疫缺陷症(SCID)，使用________________治疗可治愈此疾患。 10.核苷酸的合成包括________________和________________两条途径。 11.脱氧核苷酸是由________________还原而来。 12.Arg可以通过________________循环形成。 13.重亮氨酸作为________________类似物可抑制嘌呤核苷酸的从头合成。 14.HGPRT是指________________，该酶的完全缺失可导致人患________________。 15.从IMP合成GMP需要消耗________________，而从IMP合成AMP需要消耗________________作为能源物质。 16.羟基脲作为________________酶的抑制剂，可抑制脱氧核苷酸的生物合成。 17.不能使用5-溴尿嘧啶核苷酸代替5-溴尿嘧啶治疗癌症是因为________________。 18.细菌嘧啶核苷酸从头合成途径中的第一个酶是________________。该酶可被终产物 ________________抑制。 19.褪黑激素来源于________________氨基酸，而硫磺酸来源于________________氨基酸。 20.PAPS是指________________，它的生理功能是________________。 21.γ-谷氨酰循环的生理功能是________________。 二：是非题 1.[ ]对于苯丙酮尿患者来说酪氨酸也是必需氨基酸。 2.[ ]氨基酸脱羧酶通常也需要吡哆醛磷酸作为其辅基。 3.[ ]动物产生尿素的主要器官是肾脏。 4.[ ]参与尿素循环的酶都位于线粒体内。 5.[ ]L-氨基酸氧化酶是参与氨基酸脱氨基作用的主要酶。 6.[ ]黄嘌呤氧化酶既可以使用黄嘌呤又可以使用次黄嘌呤作为底物。 7.[ ]嘌呤核苷酸的从头合成是先闭环，再在形成N糖苷键。 8.[ ]IMP是嘌呤核苷酸从头合成途径中的中间产物。 9.[ ]严格的生酮氨基酸都是必需氨基酸。 10.[ ]Lys的缺乏可以通过在食物中添加相应的α-酮酸加以纠正。 11.[ ]能刺激固氮酶的活性。 12.[ ]氨基酸经脱氨基作用以后留下的碳骨架进行氧化分解需要先形成能够进入TCA循环的中间物。 13.[ ]真核细胞内参与嘧啶核苷酸从头合成的酶都位于细胞质。

蛋白质结构与功能的生物信息学研究

实验名称：蛋白质结构与功能的生物信息学研究 实验目的：1.掌握运用BLAST工具对指定蛋白质的氨基酸序列同源性搜索的方法。 2.掌握用不同的工具分析蛋白质的氨基酸序列的基本性质 3掌握蛋白质的氨基酸序列进行三维结构的分析 4.熟悉对蛋白质的氨基酸序列所代表蛋白的修饰情况、所参与的 代谢途径、相互作用的蛋白，以及与疾病的相关性的分析。实验方法和流程： 一、同源性搜索 同源性从分子水平讲则是指两个核酸分子的核苷酸序列或两个蛋白质分子的氨基酸序列间的相似程度。BLAST工具能对生物不同蛋白质的氨基酸序列或不同的基因的DNA序列极性比对，并从相应数据库中找到相同或相似序列。对指定的蛋白质的氨基酸序列进行同源性搜索步骤如下： ↓ 登录网址https://www.wendangku.net/doc/d91819054.html,/blast/ ↓ 输入序列后,运行blast工具 ↓ 序列比对的图形结果显示

序列比对的图形结果：用相似性区段（Hit）覆盖输入序列的范围判断两个序列 的相似性。如果图形中包含低得分的颜色（主要是红色） 区段，表明两序列的并非完全匹配。 ↓ 匹配序列列表及得分

各序列得分 可选择不同的比对工具 备注: Clustal是一款用来对()的软件。可以用来发现特征序列，进行蛋白分类，证明序列间的同源性，帮助预测新序列二级结构与三级结构，确定PCR引物，以及 在分子进化分析方面均有很大帮助。Clustal包括Clustalx和Clustalw(前者是 图形化界面版本后者是命令界面)，是生物信息学常用的多序列比对工具。 该序列的比对结果有100条，按得分降序排列，其中最大得分2373，最小得分 分为1195. ↓ 详细的比对序列的排列情况 第一个匹配 序列 第一个序列的匹配率为100% Score表示打分矩阵计算出来的值，由搜索算法决定的，值越大说明匹配程度

核苷酸和／或氨基酸序列表和序列表电子文件标准

核苷酸和／或氨基酸序列表和序列表电子文件标准 （2001年11月1日国家知识产权局令第15号公布） 1 总则 根据专利法实施细则第18条第4款的规定，包含一个或多个核苷酸或者氨基酸序列的发明专利申请，说明书中应当包括符合国家知识产权局专利局规定的序列表，并按照国家知识产权局专利局的规定提交含有该序列表的计算机可读形式的副本。 为了使提交的纸件形式的核苷酸和／或氨基酸序列表及计算机可读形式的含有该序列表的电子文件规范化，以利于申请人提交；也为了使序列表电子文件可以快捷地输入国家知识产权局专利局的计算机数据库，并与其它的序列检索数据库交换数据，以利于公众检索；同时也利于专利局审查员加快审查，更好地为申请人服务；特制定本标准。 2 适用范围 本标准适用于所有向国家知识产权局专利局提交的包含核苷酸和／或氨基酸序列的发明专利申请，具体地说，适用于该申请提交的纸件形式的核苷酸和／或氨基酸序列表，以及含有核苷酸和／或氨基酸序列表的计算机可读形式的序列表电子文件。 3 术语和定义 在本标准中，采用下面术语和定义： （1）序列表：是指以纸件形式提交的专利申请说明书的一部分，它公开了核苷酸和／或氨基酸序列的详细内容和其它有用信息。序列表中的序列是不少于10个核苷酸的非支链核苷酸序列，或者是不少于4个氨基酸的非支链氨基酸序列。所述的序列不包括支链序列；不包括具有少于4个特别定义的核苷酸或氨基酸的序列；也不包括含有列于附录1之表1—4以外的核苷酸或氨基酸的序列。 （2）序列表电子文件：是指包含核苷酸和／或氨基酸序列表的计算机可读形式的纯文本文件。 （3）核苷酸：只包括附录1之表1中列出的符号所表示的核苷酸。附录1之表2中列

核苷酸生理功能

核苷酸生理功能：①作为体内合成DNA和RNA的基本原料②作为体内能量的利用形式③构成辅酶④在体内残余各种生化代谢活动和生理调节⑤充当载体，活化中间代谢物 从头合成途径：在胞液中进行，关键酶：磷酸核糖焦磷酸合成酶和PRPP酰胺转移酶。 重要特点：①在磷酸核糖分子上逐步合成嘌呤环结构②先形成IMP然后再单个磷酸水平上转变为AMP、GMP ③肝细胞为主要场所，小肠粘膜及胸腺为次要场所，脑和脊髓不可合成。 补救合成途径：参与的酶：腺嘌呤磷酸核糖转移酶、次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶。生理意义：①减少能量和一些氨基酸前体的消耗②脑、脊髓等组织细胞只可进行嘌呤核苷酸补救合成③若HGPRT不足，可导致自毁容貌症。基因突变生理意义：①是进化和分化的分子基础②突变导致基因型改变③是某些疾病的发病基础④导致死亡。 DNA复制的保真性三种机制：①严格遵守碱基互补配对原则；②聚合酶在复制延长过程中相对碱基的选择功能（非常重要）；③复制出错时，DNA-pol的及时校读功能。 单链DNA结合蛋白（SSB）功能：①防止单链重新形成双螺旋②防止单链模板被核酸酶水解总而言之：SSB能稳定并保护DNA单链。 引发突变因素：物理因素：主要为紫外线及各种辐射。（可导致相邻嘧啶碱基形成二聚体，最常见为胸腺嘧啶二聚体）化学因素：包括药物、化学试剂、食品添加剂、工业废物、汽车废气等。生物因素：某些病毒或噬菌体的感染。 基因突变类型：①点突变：（同型碱基之间改变为转换，不同型碱基之间改变为颠换）②框移：包括多个碱基或者核苷酸序列的缺失、插入；③重排：DNA分子片段的位移，或不同DNA分子间的片段的转移及重新组合。DNA修复：针对已经发生了的缺陷而实施补救机制，使其恢复原有的天然状态。 切除修复：是胞内最重要有效的修复（复制前的修复）。重组修复：损伤部位较大，（复制后的修复）在这种修复机制中，受损部位仍然保留，但随细胞分裂，DNA复制错误的比率会逐渐降低。SOS修复：在生物体内DNA损伤面较大的紧急状态下诱导产生的一种修复机制，保持了DNA双链的完整性。 断裂基因：（必定为真核生物）真核生物机构基因，由若干个编码区和非编码区互间隔开但又连续镶嵌而成，取出非编码区再连接后，可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质的基因。 外显子：在断裂基因及其初级转录产物上出现，并表达为成熟RNA的核酸序列。（即经过转录又经过翻译。为编码区） 内含子：是阻隔基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。（只转录不翻译，为非编码区） mRNA编辑生物学意义：①增加了基因产物的多样性②与生物发育与分化有关，是基因调控的一种重要方式。 核酶研究的意义：①核酶的发现，对中心法则做了重要补充②核酶的发现又是对传统酶学的挑战③利用核酶的结构设计合成人工核酶。 遗传密码特点：①方向性：合成蛋白质的翻译过程是从mRNA的5’端到3’端方将阅读密码。②连续性：③简并性：一个氨基酸有两种以上密码子的现象。（色、蛋氨酸只有一个）（意义：对于减少基因突变对蛋白质功能的影响具有一定的生物学意义）④摆动性：密码子与反密码子配对时出现的不遵守碱基配对规律的现象，（通常发生在反密码子的以第一位碱基与密码子的第三位碱基上配对时）⑤通用性：无论高等或低等动物都使用一套遗传密码。 原核生物蛋白质合成的起始复合物的合成：大小亚基分离②小亚基定位于mRNA起始信号部位③起始氨基酰-tRNA与mRNA结合④起始复合物的形成 真核生物蛋白质合成的起始复合物的合成：①核蛋白体大小亚基分离②起始氨基酰-tRNA的结合③mRNA在核蛋白体小亚基就位④核蛋白体大亚基的结合 真核生物翻译起始特点：核蛋白体为80S（40S和60S结合）②起始tRNA携带的甲硫氨酸不需要甲酰化③mRNA 5’端帽子结构与其在核蛋白体上就位有关。 多肽链合成的延长：①进位②成肽③转位（真核生物与原核生物延长过程基本相似，只有反应体系和延长因子不同） 链霉素：与原核生物小亚基结合，引起读码错误，抑制起始于延长。四环素：主要与原核生物核蛋白体小亚基A位结合，阻止氨基酰-tRNA进位。 氯霉素：可与原核生物核蛋白体大亚基结合，阻断翻译延长过程，抑制转肽酶活性。（高浓度氯霉素对真核生物线粒体蛋白质合成有抑制作用） 红霉素：与细菌大亚基结合，阻止核蛋白体在mRNA链的滑动，抑制转为酶活性。基因表达：指基因转录及翻译，产生具有生物学活性的蛋白质分子或RNA分子的过程。 管家基因：一个生物个体几乎所有细胞中持续表达的一种基因。细胞基本的或组成型基因表达：只在组织细胞中呈持续表达，维持细胞基本生存需要，其表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响，几乎很少受到外界环境影响的一类基因。 协调表达：在一定机制控制下，功能上相关的一组基因，无论哪种表达方式，均需协调一致，共同表达的这一现象。 可诱导基因：在特定环境信号刺激下，相应基因被激活，基因表达产物增加的基因。可阻遏基因：随环境条件变化而基因表达水平降低，基因表达产物减少的基因。 基因表达调控生物学意义：①维持个体的发育与分化②适应环境，维持生长和繁殖 影响基因表达调控的因素：基因的结构、性质、生物个体活细胞所处的内、外环境，以及细胞内所存在的转录调节蛋白都有关。又： ㈠特异DNA序列：决定基因转录活性，原核生物大多数基因的表达是通过操纵子机制实现的。操纵子由数个编码序列、启动序列、操纵序列以及其他调节序列在染色体上串联组成。 启动序列：至少包括转录起始点（正1区），-10区序列（结合部位），-35区序列（辨认部位）㈡转录调节蛋白：可增强或抑制转录活性，㈢DNA-蛋白质或蛋白质-蛋白质相互作用。㈣RNA聚合酶活性。真核生物基因组结构特点：①真核生物基因组十分庞大，重复基因约占5%~10%。②真核基因转录产物为单顺反子③真核基因组普遍存在大量重复出现的核苷酸顺序，按重复频率可分：高度、中度重复序列和单拷贝序列④真核生物基因为断裂基因。 印迹技术分类：①DNA印迹技术：Southern blotting, DNA印迹技术主要应用于基因组中特异基因的定位与检测等。还可用于分析重组质粒和噬菌体。②RNA印迹技术：Northern blotting ，主要应用于检测某一组织或细胞中已知的特异mRNA的表达水平，是目前最可靠的mRNA水平分析方法。③蛋白质的印迹分析：Western blotting, 目的蛋白最常用的是用抗体来检测，又称免疫印迹。

氨基酸分析仪使用调试技术

氨基酸分析仪使用调试技术 一、仪器安装调试 仪器安装最好外接稳压器，安装安全闸防止突然停电造成难以排除的故障。还要安装铜板地线，这样可使峰谱线稳定。仪器各项技术指标的调试采用18种氨基酸混合标样（日本和光试剂公司H型氨基酸混合标准液）。 1. 基酸分辨率的检测该仪器要求苏一丝氨基酸分辨率为70%以上，甘-丙氨基酸分辨率为80%以上，采用5个标样经检测苏-丝氨基酸分辨率为85%以上，甘一丙氨基酸分辨率为以95%上（试验数据表略）。 2. 氨基酸峰位重现性检测：5个标样连续多次检测，丙氨酸最高和最低出峰保留时间不超过1分钟，精氨酸出峰时间最高和最低偏差在1%以内（试验数据表略）。 3. 氨基酸蜂面积重现性检测：5个标样、经多次检测甘氨酸和丙氨酸峰面积重现性编差平均值均达仪器指标2.5%以下（数据表略）。 4. 仪器重复性检测：仪器分离柱重新装树脂后，对10个标样进行检测,，17种氨基酸（不包括氨峰）的出峰保留时间（t）和峰面积（A）的变异系数（CV）值列表1。 表1看出种17氨基酸值均在以1%内，说明各种氨基酸峰面积再现性较好，仪器重复性好。

二、不同样品氨基酸含里测定 1. 仪器检测原理和方法：该分析仪不锈钢分离柱内装有专利2619混合离子交换树酯（Hitachi Cuiuomion-Exchange Resin），根据离子吸附交换的原理,，样品用6摩尔盐酸水介法处理后，经自动进样器定量，然后进入分离柱，用流量稳定的泵1输送规定的缓冲液，按事先编好的程序卡规定的程序自动淋洗，样品水介后的酸性、中性和碱性氨基酸分别从分离柱上被洗脱下来，各种氨基酸分次与泵2输送的茚三酮显色液在混合器中充分混合，在温度为100℃左右的反应浴中进行显色，生成紫色色素Dikepohydrindlidene Dikerohydrinaomine（DrDA），此紫色发色液经单色分离器的分光光度计，用570 纳米和440 纳米两个注长连续检测，得到的吸光度进行信号放大，记录仪自动绘出各神氨基酸峰谱，以标准氨基酸峰谱为基准，采用峰面极H·W 法进行结果计算，或通过数据处理系统进行计算打印，得出各种氨基酸含量。 2. 分析结果：为了检测仪器的稳定性，选用了各种不同样品20个，进行氨基酸含量的测试，测定数据列表2。

核苷酸代谢与遗传性疾病

核苷酸代谢与遗传性疾病 ●摘要： 核苷酸是遗传物质核酸的基本结构单位，它具有多种生物学功用，如作为核酸合成的原料;.构成能量物质，如A TP、GTP、CTP等;参与代谢和生理调节，如cAMP是体内重要第二信使物质，参与信号转导;.组成辅酶，如腺苷是多种辅酶的组成成分;组成活性中间代谢物，核苷酸是多种活性中间代谢物的载体如UDP葡萄糖，CDP-甘油二酯，SAM等。鉴于核苷酸有如此重要的生理意义，因此它在代谢过程中的异常情况往往造成严重的后果，近年来不断发现由于核苷酸代谢而造成的一系列遗传性疾病。本文将以核苷酸的基本代谢情况为基础，分别从嘌呤和嘧啶代谢异常的典型疾病出发探讨有关核苷酸代谢与遗传性疾病。 ●关键词： 核苷酸代谢嘌呤代谢遗传病嘧啶代谢遗传病 ●核苷酸 核苷酸是核酸的基本结构单位，分为脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸。而核苷酸则由碱基、戊糖和磷酸三种成分连接而成。构成核苷酸的碱基有五种，分别属于嘌呤和嘧啶。戊糖作为核苷酸的另一重要成分，脱氧核糖核苷酸中的戊糖是β-D-2-脱氧核糖，核糖核苷酸中的戊糖是β-D-核糖。核苷酸在体内分布广泛，细胞中主要以5‘-核苷酸形式存在。核苷酸具有多种生物学功用：1.作为核酸合成的原料;2.构成能量物质，如A TP、GTP、CTP等;3.参与代谢和生理调节，如cAMP是体内重要第二信使物质，参与信号转导;4.组成辅酶，如腺苷是多种辅酶的组成成分;5.组成活性中间代谢物，核苷酸是多种活性中间代谢物的载体如UDP 葡萄糖，CDP-甘油二酯，SAM等。 ●核苷酸的代谢 核苷酸的合成代谢 一、嘌呤核糖核苷酸的合成 （一）从头合成途径 1.IMP的合成：其磷酸核糖部分由PRPP提供，由5-磷酸核糖与A TP在磷酸核糖焦磷酸激酶催化下生成。IMP的合成有10步，分两个阶段，先生成咪唑环，再生成次黄嘌呤。首先由谷氨酰胺的氨基取代焦磷酸，再连接甘氨酸、甲川基，甘氨酸的羰基生成氨基后环化，生成5-氨基咪唑核苷酸。然后羧化，得到天冬氨酸的氨基，甲酰化，最后脱水闭环，生成IMP。 2. AMP的合成：IMP与天冬氨酸生成腺苷酸琥珀酸，由腺苷酸琥珀酸合成酶催化，GTP提供能量。腺苷酸琥珀酸裂解酶催化分解生成AMP和延胡索酸。 3.GMP的合成：IMP先由次黄嘌呤核苷酸脱氢酶氧化生成黄嘌呤，再由谷氨酰胺提供氨基，生成GMP。 （二）补救途径： 1. 碱基与核糖-1-磷酸在特异的核苷磷酸化酶催化下生成核苷，再由其核苷磷酸激酶生成核苷酸。 2.嘌呤与PRPP在磷酸核糖转移酶催化下生成核苷酸。 （三）调控 从头合成途径受AMP和GMP的反馈抑制，第一步转酰胺酶受二者抑制，分枝后的第一步只受自身抑制。

教你区分氨基酸洗面奶和皂基洗面奶,爱美人士必看哦

人人都洗脸，每人每天都洗脸，大多数人一天不止洗一次脸。由于自身调理和外界环境，我们不可避免地需要用到辅助清洁工具。 小时候，洗脸用肥皂就行，擦一擦，很干净，还有很多泡沫。随着年龄的增长，越来越多的广告告诉我们，脸，不能用肥皂来洗，不管你是老少，无论你是男女。因为肥皂里含有“皂基”。有人会认为这只是商家的一个噱头，也有人深信不疑。那么，到底肥皂能不能洗脸？如果对“皂化配方”很陌生，就要好好读一下这篇文章哦。 现在市面的洁面产品，在成分上分为两大类，一类是皂化配方，一类是表面活性剂配方。简单来说，皂化配方成本低廉，与之相较，表面活性剂配方的成本高一些。 我们都知道，我们皮肤是呈弱酸性的，PH值大约5.5，洗面产品的皂化配方就是用各种脂肪酸与强碱性一起反应制造出来的，PH值大约为9~10，对皮肤的刺激相当大，长期使用会洗掉过多的皮脂，令皮肤失去保护的屏障，造成极大的伤害，会让你的皮肤变得过于敏感，极易发红和出现黑斑。 怎么来区分是否是皂化配方呢？当然是看成分啦，既然肥皂是脂肪酸和强碱一起堆出来的，那么脂肪酸的代表：月桂酸、肉豆蔻酸；强碱的代表：氢氧化钠、氢氧化钾，三乙醇胺。凡是含有以上成分的，无一例外都是皂化配方。所以，成份栏里若同时出现：“脂肪酸与碱剂”，就是皂化配方。 一、脂肪酸类： 1，C12(Dodecanoic Acid, Lauric Acid) 中文名称：月桂酸, 12酸, 十二酸 Cas No：143‐07‐7 致粉刺 刺激性 來源 4 1 Sage Advice 4 1 DERMAdoctor 月桂酸是制造肥皂及各种界面活性剂、酯类、高级脂肪醇等的原料。虽然对黏膜有轻微刺激性，但本身为无毒物质，最重要的是它能加速油脂溶解于水，因此常用于洗发精及肥皂中。 2，Myristic acid (C14, Tetradecanoic Fatty Acid) 中文名称：十四烷脂肪酸, 肉豆蔻酸, 十四酸 Cas No：544‐63‐8 致粉刺 刺激性 來源 3 0 Sage Advice 3 0 Sage Advice 3 0 DERMAdoctor 肉豆蔻酸为饱和性脂肪酸。由于其刺激性之考虑，不宜经常使用于脸部肌肤接触性产品中，拒绝指数为 3/5(越高越不好)。