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化学信息学及国外软件

化学信息学及国外软件
化学信息学及国外软件

1.什么是化学信息学?

化学信息学是化学领域中近几年发展起来的一个新的分支,是建立在多学科基础上的交叉学科,利用计算机技术和计算机网络技术,对化学信息进行表示,管理,分析,模拟和传播,以实现化学信息的提取,转化与共享,揭示化学信息的实质与内在联系,促进化学学科的知识创新。

化学信息学是一门应用信息学方法来解决化学问题的学科。20世纪中后期,伴随着计算机技术的发展,化学家开始意识到,多年来所积累的大量信息,只有通过计算机技术才能让科学界容易获得和处理,换言之,这些信息必须通过数据库的形式存在,才能为科学界所用。这一新领域出现以后,没有一个恰当的名称。活跃在这个领域的化学家总是说他们在“化学信息”领域工作。然而,因为这一名称难以将处理化学文献的工作和发展计算机方法来处理化学信息的研究分别开来。所以,一些化学家就称之为“计算机化学”,以强调采用计算机技术来处理化学信息工作的重要性。

2.化学信息如何分类?

化学信息学的研究内容的包含范围,不同的学者有不同阐述。缪强认为包括以下六个方面:“化学、化工文献学;化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输;化学图形学;化学信息的解析与处理;化学知识的计算机推演;化学教育与教学的现代技术与远程信息资源”。徐筱杰认为化学信息学内容包括:“化学信息的组织、管理、检索和使用;分子结构的编码、描述、三维结构的构建;化学信息的加工、处理及深化;计算组合化学;化学体系中信息的交换及传递;分子的物理化学性质预测”。邵学广等人认为化学信息学的研究内容主要包括:“利用计算机技术和计算机网络技术对化学信息进行表示和管理;利用计算机网络技术对化学信息进行收集、传播和共享;化学体系的计算机模拟或建模;利用计算机技术对复杂的化学信息进行解析,以快捷方便的方式最大限度地提取和利用有用信息”。

3.通过网络了解国外有哪些分子模拟及化工模拟软件,并指出每个软件的优缺点以及应用领域。

(1)GROMACS

GROMACS是用于研究生物分子体系的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或者路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子,进行分子能量的最小化,分析构象等。它的模拟程序包包含GROMACS力场(蛋白质、核苷酸、糖等),研究的范围可以包括玻璃和液晶、到聚合物、晶体和生物分子溶液。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。

优点:

(1) GROMACS进行了大量的算法的优化,使其计算功能更强大。例如:在计算矩阵的逆时,算法的内循环会根据自身系统的特点自动选择由C语言或Fortran来编译。GROMACS中对Altivec loops的计算,无论是在Linux还是MacOSX.系统上,它都要比其它软件快3-10倍,而且GROMACS提高计算速度的同时也保证了计算精度。

(2) GROMACS具有友好的用户界面,拓扑文件和参数文件都以文档的形式给出。在程序运行过程中,并不用输入脚本注释语言。所有GROMACS的操作都是通过简单的命令行操作进行的。而且运行的过程是分步的,随时可以检查模拟的正确性和可行性,可以减少时间上的浪费。

(3) GRMACS操作简单,功能丰富,而且对于初学者来说易于上手。而且可以通过详细的免费使用手册,用户可以得到更多的信息。

(4) 在模拟运行的过程中,GROMACS会不断报告用户程序的运算速度和进程。

(5) GROMACS具有良好的兼容性。输入文件和输出的轨迹文件的格式都是独立于硬件的。

(6) GROMACS能通过二进制文件来写入坐标,这样就提供了一个压缩性很强的轨迹数据存储方法,压缩方式的精度可以由用户来选择。

(7) GROMACS还为轨迹分析提供了大量的辅助工具,用户不必再为常规分析编写任何程序。GROMACS还提供了轨迹的可视程序,而且许多可视化工具都可以显示。

(8) GROMACS允许并行运算,使用标准的MPI通讯。

(9) GROMACS程序包中包括各种常见的蛋白质和核酸的拓扑结构。包括20种标准的氨基酸以及其变异体,4种核苷和4种脱氧核苷,以及糖类和脂类。

GROMACS的运行过程,主要由一系列的文件和命令组成。GROMACS一般的模拟过程可以分成以下三个阶段:

(1) 前处理过程:生成模拟对象的坐标文件、拓扑结构文件以及平衡参数及其外力作用参数等文件。

(2) 模拟过程:首先要对系统进行能量最小化,避免结构的不合理而在模拟中出现错误;然后是对系统升温过程,先给系统的各个原子以Boltzmen分布初速度,再模拟较短的时间以达到初步的平衡;最后进行真正的分子动力学模拟,即平衡过程。此过程一般时间步长为1fs,运行时间在ns量级,以保证模拟系统尽可能找到势能的最低点。当然,对于其他的操作,如施加外力(模拟AFM加力)需要在平衡之后进行。在MD模拟的过程中,用户可以运用配套的可视化软件,如VMD等随时观测模拟的过程及系统的状态。

(3) 后处理过程:MD模拟结束后,GROMACS会产生一系列文件,如.pdo文件(受力分析文件)、.trr文件(模拟过程结果文件)、.edr文件(能量文件)等。同时,GROMACS 本身还提供了多种分析程序,可以对这些文件进行分析,可以得到分子体系的各种信息。

缺点:

(1)结果可靠性差,重复性难,高档次分析工具欠缺,分析工具中bug多,并行通

信量大

(2)GROMACS力场对生物大分子,蛋白质的应用,较amber和charmm力场准确

度差

对螺旋结构的模拟效果不是很好,螺旋很容易散掉. 所以很难用在应用上.不能确定是因为力场还是因为蛋白本身构象转换

(2)NAMD

NAMD(NAnoscale Molecular Dynamics)是用于在大规模并行计算机上快速模拟大分子体系的并行分子动力学代码。NAMD用经验力场,如Amber,CHARMM和Dreiding,通过数值求解运动方程计算原子轨迹。

1. 软件所能模拟的体系的尺度,如微观,介观或跨尺度等

微观。

是众多md 软件中并行处理最好的,可以支持几千个cpu 运算。在单机上速度也很快。

模拟体系常为为10,000-1,000,000 个原子。

2. 软件所属的类型,如MD,DPD,DFT,MC,量化,或交叉等

全原子md,有文献上也用它做过cgmd。

3. 软件能研究的相关领域,使用者的背景最好是?

使用的力场有charmm,x-plor,amber 等,适合模拟蛋白质,核酸,细胞膜等体系。

也可进行团簇和CNT 系统的模拟

软件原理经典,操作简单。但需要对体系的性质足够了解。

4. 软件中主要涉及的理论方法范畴

经典的md,以及用多种方法计算自由能和SMD模拟。

数据分析时候一般很少涉及复杂的热力学和统计热力学的原理,但知道一些最好。

5.软件主要包含的处理工具

namd 是计算部分,本身不能建模和数据分析(unix 的哲学kiss)。但vmd 同namd 系出同门,已同namd 实现无逢链接。

vmd 的tcl 脚本一定要搞懂,别的就不多介绍了。[2]

6.与此软件密切相关的软件

vmd,及其他数据统计分析软件(excel,OOo-calc 等足够了)

(3)Amber

Amber是著名的分子动力学软件,用于蛋白质、核酸、糖等生物大分子的计算模拟。Amber也指一种经验力场(empirical force fields)。力场和代码是分开的,一些软件中包含amber力场, 而其他的力场也包含在此amber的软件中。

AMBER提供两部分内容:用于模拟生物分子的一组分子力学力场(无版权限制,也用于其它一些模拟程序中);分子模拟程序软件包,包含源代码和演示。

AMBER主要程序

Leap:用于准备分子系统坐标和参数文件,有两个程序:

xleap:X-windows版本的leap,带GUI图形界面

tleap:文本界面的Leap

Antechamber:用于生成少见小分子力学参数文件的。有的时候一些小分子Leap程序不认识,需要加载其力学参数,这些力学参数文件就要antechamber生成Sander:MD数据产生程序,即MD模拟程序,被称做AMBER的大脑程序。

Ptraj:MD模拟轨迹分析程序。

(4)Simsci PRO/II

Simsci PRO/II 流程模拟程序,广泛地应用于化学过程的严格的质量和能量平衡。SIMSCI公司是工业应用软件和相关服务的主要提供商。这些软件被广泛的应用在石油、石化、工业化工以及工程和制造相关专业。SIMSCI设计的软件产品可以降低用户的成本、提高效益、提高产品质量、增强管理决策。PRO/II适用于:油/气加工、炼油、化工、化学、工程和建筑、聚合物、精细化工/制药等行业,主要用来模拟设计新工艺、评估改变的装置配置、改进现有装置、依据环境规则进行评估和证明、消除装置工艺瓶颈、优化和改进装置产量和效益等。

(5)Aspen Plus

Aspen Plus是一个生产装置设计、稳态模拟和优化的大型通用流程模拟系统。Aspen Plus是大型通用流程模拟系统,源于美国能源部七十年代后期在麻省理工学院(MIT)组织的会战,开发新型第三代流程模拟软件。该项目称为“过程工程的先进系统”(Advanced System for Process Engineering,简称ASPEN),并于1981年底完成。1982年为了将其商品化,成立了AspenTech公司,并称之为Aspen Plus。该软件经过20多年来不断地改进、扩充和提高,已先后推出了十多个版本,成为举世公认的标准大型流程模拟软件,应用案例数以百万计。

1)产品具有完备的物性数据库

物性模型和数据是得到精确可靠的模拟结果的关键。人们普遍认为AspenPlus 具有最适用于工业、且最完备的物性系统。许多公司为了使其物性计算方法标准化而采用Aspen Plus 的物性系统,并与其自身的工程计算软件相结合。

Aspen Plus 数据库包括将近6000 种纯组分的物性数据

1. 纯组分数据库,包括将近6000 种化合物的参数。

2. 电解质水溶液数据库,包括约900 种离子和分子溶质估算电解质物性所需的参数。

3. 固体数据库,包括约3314 种固体的固体模型参数。

4. Henry 常数库,包括水溶液中61 种化合物的Henry 常数参数。

5. 二元交互作用参数库,包括Ridlich-Kwong Soave、Peng Robinson、Lee Kesler Plocker、BWR Lee Starling,以及Hayden O’Connel l状态方程的二元交互作用参数约40,000 多个,涉及5,000 种双元混合物。

6. PURE10 数据库,包括1727 种纯化物的物性数据,这是基于美国化工学会开发的DIPPR 物性数据库的比较完整的数据库。

7. 无机物数据库,包括2450 种组分(大部分是无机化合物)的热化学参数。

8. 燃烧数据库,包括燃烧产物中常见的59 种组分和自由基的参数。

9. 固体数据库,包括3314 种组分,主要用于固体和电解质的应用。

10. 水溶液数据库,包括900 种离子,主要用于电解质的应用。

Aspen Plus 是唯一获准与DECHEMA 数据库接口的软件。该数据库收集了世界上最完备的气液平衡和液液平衡数据,共计二十五万多套数据。用户也可以把自己的物性数据与Aspen Plus 系统连接。

2)产品线比较长,集成能力很强

Aspen Plus 是Aspen 工程套件(AES)的一个组份。AES 是集成的工程产品套件,有几十种产品。以Aspen Plus 的严格机理模型为基础,形成了针对不同用途、不同层次的AspenTech 家族软件产品,并为这些软件提供一致的物性支持。

如:

Polymers Plus:

在Aspen Plus 基础上专门为模拟高分子聚合过程而开发的层次产品,已成功地用于聚烯烃、聚酯等过程。

Aspen Dynamics:

在使用Aspen Plus 计算稳态过程的基础上,转入此软件可接着计算动态过程。

Petro Frac:

专门用于炼油厂的模拟软件。

Aspen HX-NET:

Aspen Plus 可以为夹点技术软件直接提供其所需要的各流段的热焓、温度和压力等参数。

B-JAC/ HTFS:

换热器详细设计(包括机械计算)的软件包,Aspen Plus 可以在流程模拟工艺计算之后直接无缝集成,转入设备设计计算。

Aspen Zyqad:

这是一个工程设计工作流集成平台,可以供多种用户环境下将概念设计、初步设计、工程设计直到设备采购、工厂操作全过程生命周期的各项工作数据、报表及知识集成共享。Aspen Plus 有接口可与之自动集成。

Aspen Online

在线工具,将Aspen Plus 离线模型与DCS 或装置数据库管理系统联结,用实际装置的数据,自动校核模型,并利用模型的计算结果指导生产。

3)包含两种算法

唯一将序贯(SM)模块和联立方程(EO)两种算法同时包含在一个模拟工具中。

序贯算法提供了流程收敛计算的初值,采用联立方程算法,大大提高了大型流程计算的收敛速度,同时,让以往收敛困难的流程计算成为可能。节省了工程师计算的时间。

4)结构完整

除组分、物性、状态方程之外,还包含以下单元操作模块:

对于气/液系统,

(6)HYSYS

HYSYS 软件是世界著名油气加工模拟软件工程公司开发的大型专家系统软件。该软件分动态和稳态两大部分。其动态和稳态主要用于油田地面工程建设设计和石油石化炼油工程设计计算分析。其动态部分可用于指挥原油生产和储运系统的运行。对于油田地面建设该软件可以解决以下问题:

一、

1)在油田地面工程建设中的应用

各种集输流程的设计、评估及方案优化站内管网、长输管线及泵站管道停输的温降收发清管球及段塞流的预测油气分离油、气、水三相分离油气分离器的设计计算天然气水化物的预测油气的相图绘制及预测油气的反析点原油脱水原油稳

定装置设计、优化天然气脱水(甘醇或分子筛)、脱硫装置设计、优化天然气轻烃回收装置设计、优化泵、压缩机的选型和计算

2)在石油石化炼油方面的应用

常减压系统设计、优化; FCC 主分馏塔设计、优化;气体装置设计与优化;汽油稳定、石脑油分离和气提、反应精馏、变换和甲烷化反应器、酸水分离器、硫和 HF 酸烷基化、脱异丁烷塔等设计与优化;在气体处理方面:可完成:胺脱硫、多级冷

冻、压缩机组、脱乙烷塔和脱甲烷塔、膨胀装置、气体脱氢、水合物生成 / 抑制、多级、平台操作、冷冻回路、透平膨胀机优化。

二、 HYSYS 软件的国内外应用情况

Hyprotech公司创建于1976 年,是世界上最早开拓石油、化工方面的工业模拟、仿真技术的跨国公司。其技术广泛应用于石油开采、储运、天然气加工、石油化工、精细化工、制药、炼制等领域。它在世界范围内石油化工模拟、仿真技术领域占主导地位。Hyprotech 已有 17000 多家用户,遍布 80 多个国家,其注册用户数目超过世界上任何一家过程模拟软件公司。目前世界各大主要石油化工公司都在使用Hyprotech 的产品,包括世界上名列前茅的前 15 家石油和天然气公司,前 15 家石油炼制公司中的 14 家和前 15 家化学制品公司中的 13 家。 2002 年 7 月Hyprotech 公司成为 AspenTech 公司的一部分。

Hyprotech 公司国外用户: BP 、Chevron 、Dow 、DuPont 、Exxon Mobil 、Fluor Daniel 、Monsanto 、 Glaxo SmithKline 、Rohm Hass 、Bayer 、Shell 、PraxAir 、UOP 等

HYSYS 在国内应用非常广泛,国内用户总数已超过 50 。所有的油田设计系统全部采用该软件进行工艺设计。下面是部分国内油田用户名单:

大庆油田设计院、辽河油田设计院、华北油田设计院、大港油田设计院、四川油田设计院、长庆油田设计院、青海油田设计院、中原油田设计院、江汉油田设计院、克拉玛依油田设计院、克拉玛依油田研究院、独山子炼油厂、独山子石化设计院、廊坊管道勘察设计研究院、中国海洋总公司生产研究中心、中国海洋总公司石油工程公司(天津塘沽)。中国海洋总公司南海分公司、壳牌中国分公司( Shell )、辽阳化纤公司、辽阳石化设计院、大庆石化设计院、岳阳石化公司、九江石化公司、南京石化公司、扬子石化公司、扬子石化设计院、抚顺石化设计院、抚顺石化公司、金陵石化公司、茂名石化设计院、镇江炼化工程公司等

三、 HYSYS 软件功能

HYSYS 软件与同类软件相比具有非常好的操作界面,方便易学,软件智能化程度高。最先进的集成式工程环境: 由于使用了面向目标的新一代编程工具,使集成式的工程模拟软件成为现实。在这种集成系统中,流程、单元操作是互相独立的、流程只是各种单元操作这种目标的集合,单元操作之间靠流程中的物流进行联系。在工程设计中稳态和动态使用的是同一个目标,然后共享目标的数据,不需进行数据传递。因此在这种最先进且易于使用的系统中用户能够得到最大的效益。

内置人工智能:在系统中设有人工智能系统,它在所有过程中都能发挥非常重要的作用。当输入的数据能满足系统计算要求时,人工智能系统会驱动系统自动计算。当数据输入发生错误时,该系统会告诉你哪里出了问题。数据回归包:数据回归整理包提供了强有力的回归工具。用实验数据或库中的标准数据通过该工具用户可得到焓、气液平衡常数 K 的数学回归方程 ( 方程的形式可自定 ) 。用回归公式可以提高运算速度,在特定的条件下还可使计算精度提高。

严格物性计算包: HYSYS 提供了一组功能强大的物性计算包,它的基础数据也是来源于世界富有盛名的物性数据系统,并经过本公司的严格校验。这些数据包括20,000 个交互作用参数和 4,500 多个纯物质数据。

功能强大的物性预测系统:对于 HYSYS 标准库没有包括的组分,可通过定义假组分,然后选择 HYSYS 的物性计算包来自动计算基础数据。

DCS 接口: HYSYS 通过其动态链接库 DLL 与 DCS 控制系统链接。装置的 DCS 数据可以进入 HYSYS,而 HYSYS的工艺参数也可以传回装置。通过这种技术可以实现:1) 在线优化控制;2) 生产指导;3) 生产培训;4) 仪表设计系统的离线调试。事件驱动:将模拟技术和完全交互的操作方法结合,使 HYSIM 获得成功。而利用面向目标的技术使 HYSYS 这一交互方式提高到一个更高的层次,即事件驱动。

当你在研究方案时,需要将许多工艺参数放在一张表中,当变化一种或几种变量时,另一些也要随之而变,算出的结果也要在表中自动刷新。这种几处显示数据随计算结果同时自动变化的技术就叫事件驱动。通过这种途径能使工程师对所研究的流程有更彻底的了解。工艺参数优化器:软件中增加了功能强大的优化器,它有五种算法供您选择,可解决无约束、有约束、等式约束及不等式约束的问题。其中序列二次型是比较先进的一种方法,可进行多变量的线性、非线性优化,配合使用变量计算表,你可将更加复杂的经济计算模型加入优化器中,以得到最大经济效益的操作条件。

窄点分析工具:利用 HYSYS 的窄点分析技术可对流程中的热网进行分析计算,合理设计热网,使能量的损失最小。

方案分析工具:某些变量按一定趋势变化时,其它变量的变化趋势如何呢?了解这些对方案分析非常重要。比如,当研究塔的回流比和产品质量的变化对热负荷、产量、温度的影响时,在 HYSYS 的方案分析中选回流比和产品质量作为自变量,给出它们的变化范围和步长,HYSYS 就开始计算,最后会给出一个汇总表。

各种塔板的水力学计算: HYSYS 增加了浮阀、填料、筛板等各种塔板的计算,使塔的热力学和水力学同时解决。任意塔的计算:我们以前接触的软件中所有分馏塔都是软件商提供了一个最全的塔,然后让用户自己选择保留部分。试问,若用户有一个塔,其上部分为吸收 - 解析塔,下部分为提馏塔,这种塔该如何计算呢? HYSYS 就可以。由于采用了面向目标的编程工具,塔板、重沸器、泵、回流罐等等都是相互独立的目标。人们可以任意组合这种目标,而完成各种各样的任意塔,十分方便。

(6)ChemCAD

ChemCAD是由Chemstations公司推出的一款极具应用和推广价值的软件[ 1, 2 ] ,它主要用于化工生产方面的工艺开发、优化设计和技术改造[ 3 - 5 ]。由于ChemCAD 内置的专家系统数据库集成了多个方面且非常详尽的数据,使得Chem2

CAD可以应用于化工生产的诸多领域,而且随着Chemsta2tions公司的深入开发,ChemCAD的应用领域还将不断拓展。

ChemCAD的应用范围包含了化学工业细分出来的多个方面,如炼油、石化、气体、气电共生、工业安全、特化、制药、生化、污染防治、清洁生产等。它可以对这些领域中的工艺过程进行计算机模拟并为实际生产提供参考和指导。

ChemCAD内置了功能强大的标准物性数据库, 它以A IChE的D IPPR数据库为基础,加上电解质共约2000多种纯物质,并允许用户添加多达2000个组分到数据库中,可以定义烃类虚拟组分用于炼油计算,也可以通过中立文件嵌入物性数据,从5. 3版开始还提供了200多种原油的评价数据库,是工程技术人员用来对连续操作单元进行物料平衡和能量平衡核算的有力工具。使用它,可以在计算机上建立和现场装置吻合的数据模型,并通过运算模拟装置的稳态和动态运行,为工艺开发、工程设计以及优化

操作提供理论指导。在工程设计中,无论是建立一个新厂或是对老厂进行改造, ChemCAD都可以用来选择方案,研究非设计工况的操作以及工厂处理原料范围的灵活性。工艺设计模拟研究不仅可以避免工厂设备交付前的费用估算错误,还可用模拟模型来优化工艺设计,同时通过一系列的工况研究,来确保工厂能在较大范围的操作条件内良好运行。即使是在工程设计的最初阶段,也可用这个模型来估计工艺条件变化对整个装置性能的影响。对于老厂,由ChemCAD建立的模型可作为工程技术人员用来改进工厂操作以提高产量产率、减少能量消耗、降低生产成本的有力工具。可模拟确定操作条件的变化以适应原料、产品要求和环境条件的变化,也可模拟研究工厂合理化方案以消除“瓶颈”问题,或模拟采用先进技术改善工厂状况的可行性,如采用改进的催化剂、新溶剂或新的工艺过程操作单元。

化学信息学课件

第一章化学信息概论 一、化学信息学的产生和发展 信息:实物的存在方式和运动状态的记录,它精确地描述物体或事件,并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。 化学学科的重要性化学信息量的快速增长 化学信息学:是应用信息学方法解决化学问题的学科。(化学信息学是信息科学与化学的交叉学科。)(利用数学、统计学与计算机科学的理论、方法和网络技术作为手段,研究化学信息的获取、表示、管理、传播、分析、加工和应用,在此基础上进行知识创新,促进化学学科的发展。) 二、化学信息学的研究领域 应用现代信息技术构建信息处理系统,处理长期积累的大量化学信息资源,帮助化学家组织、分析和理解已知的科学数据,正确地预测化学物质的性质,开发新化合物、材料和方法。 应用计算机科学方法或信息学解决化学问题,对化学信息进行有效的存储、操作和处理,使化学信息合理地提升为化学知识。 研究内容:化学、化工文献学;化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输;化学图形学;化学信息的解析与处理;化学知识的计算机推演;化学教育与教学的现代技术与远程信息资源。 三、信息资源检索的意义与作用 ?? 启迪创新:科研工作具有继承和创新两重性,要求科研人员在探索未知进行创新之前,应该尽 可能地继承和利用与之相关的信息。 ?? 拓宽视野:21世纪信息与知识的积累日新月异,出现了大量的边缘科学和交叉科学。面对知识 频繁更新的世界,需要接受终身教育,在不断的教育中更新知识,适应环境的变化。 ?? 培养能力:现代教育不单纯是知识的传授,更重要是要大力进行各种能力的培养,其中包括自 学能力、思维能力、研究能力、表达能力、创新能力、终生教育能力、组织管理能力和收集处理信息的能力。 ?? 提高素质:信息素质是信息社会中实现对知识的探索和发现的综合能力,它是进入信息社会赖 以生存的通行证。

高分子材料与工程专业考研学校选择

高分子材料与工程专业考研学校选择作者:admin 更新时间:2009-3-9 20:25:14 在全国高校中在高分子领域领先: 工科: 偏合成的:浙江大学(国内高分子鼻祖,尤其在合成方面)、华东理工、北京化工大学、清华大学; 偏加工和应用的:四川大学、华南理工大学、东华大学(原中国纺织大学)、上海交通大学理科:偏合成的:北京大学(好像北大遥遥领先,其他象南开、南京大学明显差一些);偏性能形态研究的:中科院北化所(明显领先)、南京大学、复旦大学、北京大学(上述为网上摘录,不一定全面)简单评述下 浙江大学是出高分子院士最多的学校。 北京大学合成做的好,特别是高分子液晶。 复旦大学的研究偏向理论研究,有杨玉良和江明两位院士,实力不凡。上海交通大学也有新评上一个高分子方面的院士:颜德岳, 华南理工和北京化工大学研究领域较广,在橡胶、塑料、纤维方面做的都不错。华南理工大学有3位中科院院士程镕时、姜中宏生、曹镛、长江学者特聘教授2人、珠江学者特聘教授2人、博士生导师43人),副教授、副研究员和高级工程师67人;高分子加工实力很强的。在全国排前3名。 四川大学有高分子材料工程国家重点实验室,主要是做塑料的加工改性,实力虽有下滑,但仍然很强,毕竟其根基很厚。 东华大学的研究重点在纤维方面,建有纤维素改性国家重点实验室。 中科院长春应化所和中科院北京化学研究所共同建有高分子化学与物理国家重点实验室。长春应化所在一直是在做合成方面比较强。化学所在前两年还有个工程塑料国家重点实验室,不过现在降格为中科院的重点实验室了。所以化学所的合成和加工做的都还不错。 青岛科技大学在高分子方面主要的特色是其橡胶,2003年建成了教育部橡塑工程重点实验室,也是多年来对青岛科技大学研究工作的肯定。 研究生的方向很多,大的方面大概一下几个:树脂合成(环氧,丙烯酸,聚苯,聚酯等每个方向都很多);塑料/纤维加工(加工工艺川大最强的,模具和机械华南理工及北化都不错);生物医用高分子(华东理工等);高分子理论及表征(中科院化学所及南京大学最强);液晶高分子(吉大,北大,北科大等);导电高分子(化学所等);纳米高分子(化学所);碳纤维/碳纳米(北化,清华);有机硅(化学所)等等 而在珠三角这一带,华南理工中山大学都是不错选择,有志在高分子领域深入了解的同学可以报读。 下面附有2009年华南理工大学科学与工程学院硕士招生目录及初复试科目材料高分子材料与工程专业考研学校选择 作者:admin 更新时间:2009-3-9 20:25:14 高分子化学与物理专业设置如下研究方向 01 高分子物理、02高分子合成与高分子化学、03 功能高分子、04高分子结构与性能、05天然高分子与生物医用高分子、06环境友好高分子 09年初试科目:①101政治② 201英语③629物理化学(一) ④865有机化学复试:复试笔试科目:979高分子化学与物理 材料物理与化学专业设置如下研究方向: 01 、高分子光电材料与器件物理、02 金属材料表面物理化学、03 生态环境材料、04功能材料制备、结构与性能、05纳米材料与纳米技术、06纳米材料与新型能源材料、07非线性

化学信息学总结

总结 化学信息学是化学领域中近几年发展起来的一个新的分支,是建立在多学科基础上的交叉学科,利用计算机技术和计算机网络技术,对化学信息进行表示,管理,分析,模拟和传播,以实现化学信息的提取,转化与共享,揭示化学信息的实质与内在联系,促进化学学科的知识创新。 当今时代信息具有四大特点:信息量大、延伸范围广、传播速度快、交叉性能强。这些信息的记载、组织与交流对化学学科的发展起到越来越重要的推动作用,同时也成为化学学科的一个重要组成部分。化学信息可分为两大部分,即化学物质的化学信息和媒体形式的化学信息。前者是利用科学的原理和方法通过测量得到的化学成分的相关信息,如物质的物理、化学性质,物质中各成分的定性、定量以及结构信息等。后者是化学信息的记录形式,如图书、期刊、专利等。化学信息的传播使化学工作者们共享测量的原理、方法及测量结果。学生们要想充分利用有益的测量数据和结果,必须首先学会整合信息内容,提高自己整合信息的综合能力。既不能丢掉有用信息,又不能使用虚假信息。其次,还要学会表示、管理、变换和使用化学信息。当前最先进的手段是利用计算机表示和管理化学信息,因为计算机能方便地将数据信息的数字符号保存、读入、计算和输出。同时,计算机也可以把化学信息中的结构信息用线性编码等方式表示出来。并能保证结构信息的“惟一性”和“无二义性”。化学信息学从计算机与Internet基础开始,到联机文献检索、到数据库的资源与使用、再到信息的表示方式以及小波分析等方面作了详细地介绍和阐述,已经不再是原来的狭义的信息检索等方面的内容。这门交叉性较强的学科势必能使学生具备完善的分析、处理、变换和使用信息的能力。即综合整合信息的能力。 化学信息学是培养学生信息素质的重要学科。信息素质是一种涉及信息内容、传播、分析、信息检索以及评价各方面的综合能力。化学信息学可以提高其自觉筛选吸收信息的能力,养成创新思维习惯,自觉具有课题查新的意识,具备渴求知识的欲望,掌握必备的信息处理能力,提高在今后工作岗位上的竞争力,适应日后深造和社会终身学习的客观要求。化学信息学能培养高职学生的创新人格。化学信息学首先能培养学生的良好信息素质,良好的信息素质会使学生在走入社会之后具备较好的独立性、坚持性、合作性以及自信心和责任心等,而这五个要素是学生创新人格的具体体现。有了良好的独立性,学生在智力活动和实际活动中能够独立自主地发现问题和解决问题。有了良好的坚持性,学生会在创新活动中冷静面对和睿智的思考他所面临的一切困难。会在诸多困难中寻找到一丝曙光,为自己找到达到创新目标的途径和方法。化学信息学在利用计算机和网络技术的基础上,本身就特别强调广域的合作性,有了良好信息素质的学生一定不会为了独立的个性素质而舍弃合作。相反,会更乐于接触更多的人,也会把自己的想法和做法与合作者共享。良好的信息素质当然也加强了学生们的责任心和自信心。 一学期化学信息课让我感悟良多。老师课上讲的随时会让学生重复,以巩固新知识。也会让学生自己课下搜集信息,在课堂上与同学分享,增加与老师的互动,同时老师也会给我们很多意见。再此感谢老师。还有希望老师可以向学校建议化学信息学最好在机房上,这样可以增强每个学生的动手能力。

化学信息学考题

15、广义的信息检索包含两个过程( B ) A、检索与利用 B、存储与检索 C、存储与利用 D、检索与报道 17、狭义的专利文献是指( C ) A、专利公报 B、专利目录 C、专利说明书 D、专利索引 18、中国国家标准的代码是( A ) A、GB B、CB C、ZG D、CG 19、政府出版物主要包括两大类型的文献( B ) A、专利与标准 B、行政文件与科技文献 C、图书与期刊 D、档案与标准 20、ISBN是( B )的缩写 A、国际标准刊号 B、国际标准书号 C、连续出版物代码 D、国内统一刊号 1. 文献是记录有知识的( A ) A 载体 B 纸张 C 光盘 D 磁盘 2. 下列哪种文献属于一次文献( A ) A 期刊论文 B 百科全书 C 综述 D 文摘 3. 下列哪种文献属于二次文献( D ) A 专利文献 B 学位论文 C 会议文献 D 目录 4. 下列哪种文献属于三次文献( C ) A 标准文献 B 学位论文 C 综述 D 文摘 5. 下列选项中属于连续出版物类型的选项有( C ) A 图书 B 学位论文 C 科技期刊 D 会议文献 6. 下列选项中属于特种文献类型的有( D ) A 报纸 B 图书 C 科技期刊 D 标准文献 7. 纸质信息源的载体是( D ) A 光盘 B 缩微平片 C 感光材料 D 纸张

8. 以刊载新闻和评论为主的文献是( B ) A 图书 B 报纸 C 期刊 D 会议文献 9. 使用分类语言对信息进行描述和标引,主要是可以把( B )的信息集中在一起。 A 同一作者 B 同一学科 C 同一主题 D A+B+C 1、根据国家相关标准,文献的定义是指“记录有(A )的一切载体”。 A.情报 B.信息 C.知识 D.数据 2、以作者本人取得的成果为依据而创作的论文、报告等,并经公开发表或出版的各种文献,称为( B ) A.零次文献 B.一次文献 C.二次文献 D.三次文献 3、文摘、题录、目录等属于( B ) A.一次文献 B.二次文献 C.零次文献 D.三次文献 4、手稿、私人笔记等属于( C)文献,辞典、手册等属于()文献 A.一次,三 次 B.零次,二次 C.零次,三次 D.一次,二次 5、按照出版时间的先后,应将各个级别的文献排列成( A ) A.三次文献、二次文献、一次文献 B.一次文献、三次文献、二次文献 C.一次文献、二次文献、三次文献 D.二次文献、三次文献、一次文献 6、( B )的主要功能是检索、通报、控制一次文献,帮助人们在较短时间内获取较多的文献信息。 A.零次文献 B.二次文献 C.一次文献 D.三次文献 7、一次文献、二次文献、三次文献是按照( A )进行区分的。 A.内容的公开次数 B.原创的层次 C.印刷的次数 D.评论的次数 8、从文献的( C )角度区分,可将文献分为印刷型、缩微型等。 A.内容的公开次数 B.载体类型 C.出版类型 D.公开程度 9、具有固定名称、统一出版形式和一定出版规律的定期或不定期的连续出版物,称为( D ) A.图书 B.会议文献 C.学位论文 D.期刊 10、利用文献后面所附的参考文献进行检索的方法称为( A ) A.追溯法 B.直接 法 C.抽查法 D.综合法 11、中国图书馆图书分类法的分类号采用了( A ) A.拼音字母+数字 B.英语字母+数字 C.全部拼音字母 D.全部数字

金日光+华幼卿+第三版+高分子物理课后习题答桉+全集

第1章高分子的链结构 1.写出聚氯丁二烯的各种可能构型。 等。 2.构象与构型有何区别?聚丙烯分子链中碳—碳单键是可以旋转的,通过单键的内旋转是否可以使全同立构聚丙烯变为间同立构聚丙烯?为什么? 答:(1)区别:构象是由于单键的内旋转而产生的分子中原子在空间位置上的变化,而构型则是分子中由化学键所固定的原子在空间的排列;构象的改变不需打破化学键,而构型的改变必须断裂化学键。 (2)不能,碳-碳单键的旋转只能改变构象,却没有断裂化学键,所以不能改变构型,而全同立构聚丙烯与间同立构聚丙烯是不同的构型。 3.为什么等规立构聚丙乙烯分子链在晶体中呈31螺旋构象,而间规立构聚氯乙烯分子链在晶体中呈平面锯齿构象? 答(1)由于等归立构聚苯乙烯的两个苯环距离比其范德华半径总和小,产生排斥作用,使平面锯齿形(…ttt…)构象极不稳定,必须通过C-C键的旋转,形成31螺旋构象,才能满足晶体分子链构象能最低原则。 (2)由于间规聚氯乙烯的氯取代基分得较开,相互间距离比范德华半径大,所以平面锯齿形构象是能量最低的构象。 4.哪些参数可以表征高分子链的柔顺性?如何表征? 答:(1)空间位阻参数(或称刚性因子),值愈大,柔顺性愈差; (2)特征比Cn,Cn值越小,链的柔顺性越好; (3)连段长度b,b值愈小,链愈柔顺。

5.聚乙烯分子链上没有侧基,内旋转位能不大,柔顺性好。该聚合物为什么室温下为塑料而不是橡胶? 答:这是由于聚乙烯分子对称性好,容易结晶,从而失去弹性,因而在室温下为塑料而不是橡胶。 6.从结构出发,简述下列各组聚合物的性能差异: (1)聚丙烯睛与碳纤维; (2)无规立构聚丙烯与等规立构聚丙烯; (3)顺式聚1,4-异戊二烯(天然橡胶)与反式聚1,4-异戊二烯(杜仲橡胶)。(4)高密度聚乙烯、低密度聚乙烯与交联聚乙烯。 7.比较下列四组高分子链的柔顺性并简要加以解释。 解:

化学信息学化学信息学试题

【化学信息学期末考试】 第一部分、选择题(选项框的是单选题,选项框的是多选题,共50题,100分): 1、不是国际著名的四大检索工具是___。 B A. SCI B. CA C. ISTP D. EI 2、检索字段最多的数据库是_____。 B A. Web of Science B. CrossFire Beilstein/Gmelin C. 中国期刊全文数据库 D. CA on CD 3、CC 集检索时,检索字段必须是_____。 B A. BASIC B. Set combination C. Full Source D. Title Word 4、不带有化学结构和化学反应检索的数据库是___。 C A. Web of Science Scholar on CD D CrossFire Beilstein/Gmelin 5、某一期刊的影响因子高,它不可___。 A A. 说明期刊中特定论文的质量高 B. 说明期刊中论文平均被引用率高 C. 作为作者投稿的选择对象 D. 反映期刊的整体学术水平高 6、提高查准率的方法有___。 b A. 增加“逻辑或”组合 B. 正确使用“逻辑与”和“逻辑非” C. 使用截词检索 D. 减少限制条件 7、检索前对检索结果进行限定,不能达到____的作用。 d A. 减少检索结果的输出量 B. 提高检索速度 C. 提高检索结果的相关性 D. 提高查全率 8、利用 Web of Science 检索黄本立院士 2005 年在 Chinese Journal of Analytical Chemistry 期刊上发表的文献被其它文献引用的情况,正确的方法是使用___。 D A. 普通检索 B. 高级检索 C. 作者索引检索 D. 引文检索 9、CrossFire Beilstein/Gmelin的明显特异点是______。 b A. 可进行化合物检索 B. 可进行化学反应检索 C. 可进行事实数据检索 D. 可进行文献检索 10、中国期刊网全文数据库不具有的功能是。 b A. 标记文献记录直接存盘输出 B. 跨库统一检索 C. 扩展检索 D. 相似文献链接 11、Web of Knowledge 最有特色的检索方法是______。 A A. 相关法 B. 普查法 C. 追溯法 D. 跟踪法 12、不能进行检索表达式的存储并将其作为以后再检索的数据库为_ A A. SciFinder Scholar B. CA on CD C. Web of Knowledge D. CrossFire Beilstein/Gmelin 13、不带有文献被引用信息的系统是______。 d A. 中国期刊全文数据库 B. SciFinder Scholar C. Web of Knowledge D. CA on CD 14、需要输入 CA 检索的正确主题词,可以通过以下___ 查询确定。 C A. 普通主题索引 B. 化学物质索引 C. 索引指南 D. 关键词索引 15、以下哪项不是 CA on CD 的特点___。 D A. 提供了化学物质与分子式的层次检索 B. 收集化学化工类文献最多的数据库 C. 检索词检索通过检索表达式实现 D. 可一次性检索多年的文献资料 16、Scirus科学搜索引擎的明显特点是___。 A A. 链接到可获得全文网站 B. 带有类似结果 C. 对检索结果进行二次检索 D. 可标记并输出搜索引擎的检索结果 17、Web of Knowledge 已注册用户登录到数据库后,无法进行以下操作____。 b A. 运行已存储的检索历史 B. 使用数据库的 Alert 功能 C. 将检索结果存储在服务器上 D. 修改用户的个人信息 18、电子期刊的最主要功能是____。 c A. 获取原始文献 B. 检索文献 C. 文献浏览 D. 检索出版物 19、CA on CD 检索分子式 H4SiO4 时,正确输入格式是___。 D A. O4SiH4 B. SiO4H4 C. H4SiO4 D. H4O4Si 20、在检索结果中不带有相关(相似)记录的是______。 b A. Web of Knowledge B. SciFinder Scholar C. 中国期刊全文数据库 D. Scirus 21、EndNote 的明显优点不是______。 D A. 可方便地进行多种数据库文献数据的导入 B. 可方便地进行数据库内文献信息检索 C. 可方便地生成特定格式论文参考文献目录 D. 可方便地进行论文的边写边引 22、下列电子期刊中收录期刊数量最多的是_____。 D A. ACS B. SpringerLink(439) C. Wiley InterScience(586) D. Science Direct(1800) 23、不是专利权主要特征的是___。 C A. 独占性 B. 时间性 C. 公开性 D. 地域性 24、收录化学化工期刊种类最多的文献数据库是______。 c A. Science Direct B. CrossFire Beilstein/Gmelin C. SciFinder Scholar D. Web of Science 25、Web of Knowledge的注册用户通过 E-mail 无法实现____。d

《高分子化学教程》习题答案(第三版)

《高分子化学教程》习题答案(王槐三第三版) 第1章 1、解释下列概念 (1) 高分子化合物:由众多原子或原子团主要以共价键结合而成的相对分子质量在1万以上的化合物。 (2) 重复结构单元:将大分子链上化学组成和结构可重复的最小单位称为重复结构单元(在高分子物理里也称为链节)。 (3) 结构单元:由1个单体分子通过聚合反应而进入聚合物重复单元的那一部分叫结构单元。 (4) 平均相对分子质量:高分子化合物中同系物相对分子质量的统计平均值。 (5) 平均聚合度:所有大分子链上所含重复结构单元数量的统计平均值。 (6) 多分散性和分散指数: 多分散性是指聚合物材料中所含大分子同系物的相对分子质量不相等的这一特性。 分散指数是指重均相对分子质量与数均相对分子质量的比值。 2、写出合成下列聚合物的聚合反应方程式并标出结构单元 (1) 涤纶 n HOOC COOH n HO(CH 2)2OH (2n -1)H 2O HO[OC COO(CH 2)2O]n H += +结构 结构单元 单元

(2) 尼龙-610 n HOOC COOH n H 2N(CH 2)6NH 2(2n -1)H 2O HO [ OC(CH 2)8COHN(CH 2)6NH ]+= +(CH 2)8n H 结构单元 结构单元 (3) 有机玻璃 n CH 2CH 3 COOCH 3 C CH 2 CH 3C 3 =[]n CH 2 CH 3C 3结构单元: (4) 聚乙烯醇 n CH 2 = CHOCOCH 3 CH 2 CH []OCOCH 3 n 水解 聚合 []CH 2 CH OH n (5) 环氧树脂 (见P8) (6) 聚碳酸酯 HO CH 3 CH 3 C Cl C O Cl H O C 3 CH 3 O C Cl + (2n - 1)HCl = +n n []OH n O (7) 聚己二氨基甲酸丁二酯 n OCN(CH 2)6NCO + n HO(CH 2)2OH = []OCNH(CH 2)6NHCOO(CH 2)4O n (8) 维尼纶 []CH 2 CH OH n + CH 2O CH 2CH CH 2CH CH 2CH O CH 2 O OH (9) 丁腈橡胶

化学信息学论文内容要求

1、写清姓名、年级、专业、班级以及学号、日期。 2、自己写一个与你所查内容相关的题目。比如:***的文献检索总结。 3、内容必须有以下几部分:对该课程的介绍及其重要性、文献检索的思路与方法技巧、学到或用到的中英文数据库以及常见的中英文化学类期刊、对你所查内容(方向或课题)的综述(不要照抄)、最后有一个总结或小结、附中英文参考文献。不少于5000字。 4、做成电子版word格式,文件名为学号-姓名(注:姓名用中文),在最后一次上机时,发到我的邮箱singlebase68@https://www.wendangku.net/doc/d22731139.html,。 一、明确查找文献资料的工具 查找文献资料的工具有哪些? (1)了解、熟知国内外的重要信息源与信息检索工具。 (2)学习使用上述重要信息源检索使用方法。 (3)检索工具书,如各种手册、检索刊物、字典、数据手册等。 (4)光盘数据库。 (5)联机数据库。 (6)主页(WWW)信息。 二、掌握查找文献资料的方法 查找文献资料的方法有哪些 1.了解文献类型 按科技文献的来源可划分为: (1)一次文献(Primary Document)。是著作者根据自己在实际的科技工作中取得的成果所撰写或创作的文献,包括期刊文献、会议文献、专利说明书、科技报告、学位论文等,常称为原始文献,又叫做参考工具书。 (2)二次文献(Secondary Document)。二次文献是对一次文献进行加工、整理后的产物。主要用于管理和利用一次文献,如各种书目、索引、题录、文摘等,为读者查找文献资料提供路径,又叫做检索工具书。 (3)三次文献(Tertiary Document)。三次文献是指利用二次文献,选用一次文献的内容而编纂出的成果。例如,各种词典、手册、年鉴、百科全书。各种图书、综述、评论、专题报告等。从三次文献中可以大致了解某一文献资料的总体情况。 2.了解英文科技文献 (1)图书。具有著者、书名、出版地、出版社、出版年代等信息。 (2)期刊。具有期刊名、期刊年、卷、期,甚至文献所在的页码等信息。 (3)会议文献。有会议记录或第几届会议、会议的举办者、举办地等信息。 (4)科技报告。一般标有报告号,例如,美国政府工作报告、AD报告。NASA报告等。 (5)学位论文。一般标明有Thesis或Dissertation等字样,并标有学位论文名称、颁发学位的单位及学位授予时间等信息。 (6)专利文献。具有专利号,包括专利国别代码、专利文献出版时间等信息。 3.掌握基本检索方法 (1)关键词检索:全篇文献中所有有实义的词均可作为检索词。 (2)主题词检索:通过严格规定的主题词或叙词进行检索。 (3)题名检索:只在文献的标题中进行主题词或关键词的检索。

《化学信息学》教学大纲

《化学信息学》教学大纲 一、课程基本信息 课程编号:84110123 课程中文名称:化学信息学 课程英文名称:Chemical Informatics 课程类型:专业必选课 总学时:42学时 学分:3 适用专业:化学 先修课程:无机化学、有机化学、物理化学 开课院系:化学学院 二、课程性质和任务 本课程是化学—生物学实验班的专业必选课,辅助专业课应用的一门技术基础课。本课程将全面介绍化学信息学的发展和现状,检索方法和文献情报的搜集整理。使学生掌握一般化学化工参考工具书,化学情报,化学化工核心期刊的检索方法,了解互联网的知识。并使学生利用专业课、完善学生的知识体系的能力得以提升,为今后实际工作打下坚实的基础。

三、课程教学目标 在学完本课程之后,学生能够: 1.了解化学信息学的发展和现状 2.了解化学信息的出版形式和存储方法 3.掌握各种信息资料的检索方法 4.掌握化学信息的搜集整理 5.掌握一般化学化工参考工具书,ISI数据库,美国化学文摘,化学化工核心期刊的检索方法。 6.了解互联网的一般知识。 四、理论教学环节和实践教学环节 第一章绪论 【教学目标】介绍化学文献的发展历史、化学情报检索系统的建立以及化学文献查阅的意义。 【教学重点】了解化学文献的发展历史。 【教学难点】情报检索系统。 【学时数】 2学时。 【考核知识点与考核要求】化学文献的发展历史、化学情报检索系统的建立以及 化学文献查阅的意义。 第一节化学文献的发展 本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论 1、了解化学文献的发展历史。 2、理解当今化学文献总的特点。 第二节化学文献源概述 本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论 1、掌握化学文献源的构成:图书、期刊、科技报告、学位论文、会议资料、专 利文献、技术标准、技术档案和产品样本。 2、掌握化学文献源的特点及作用。 第三节化学情报检索系统的建立和发展 本节应了解、理解、掌握的基本概念、基本理论 1、掌握一次文献、二次文献和三次文献的概念。 2、化学情报检索系统的建立。 3、了解化学情报检索系统的发展过程。

化学信息学期末考试2005(1)

化学信息学期末考试2005(1)

化学信息学期末考试 第一部分、选择题(选项框的是单选题,选项框的是多选题,共50题,100分): 1、不是国际著名的四大检索工具是___。B A. SCI B. CA C. ISTP D. EI 2、检索字段最多的数据库是_____。B A. Web of Science B. CrossFire Beilstein/Gmelin C. 中国期刊全文数据库 D. CA on CD 3、CC 集检索时,检索字段必须是_____。B A. BASIC B. Set combination C. Full Source D. Title Word

4、不带有化学结构和化学反应检索的数据库是___。C A. Web of Science B. SciFinder Scholar C. CA on CD D. CrossFire Beilstein/Gmelin 5、某一期刊的影响因子高,它不可___。A A. 说明期刊中特定论文的质量高 B. 说明期刊中论文平均被引用率高 C. 作为作者投稿的选择对象 D. 反映期刊的整体学术水平高 6、提高查准率的方法有___。b A. 增加“逻辑或”组合 B. 正确使用“逻辑与”和“逻辑非” C. 使用截词检索 D. 减少限制条件

7、检索前对检索结果进行限定,不能达到____的作用。d A. 减少检索结果的输出量 B. 提高检索速度 C. 提高检索结果的相关性 D. 提高查全率 8、利用Web of Science 检索黄本立院士2005 年在Chinese Journal of Analytical Chemistry 期刊上发表的文献被其它文献引用的情况,正确的方法是使用___。D A. 普通检索 B. 高级检索 C. 作者索引检索 D. 引文检索 9、CrossFire Beilstein/Gmelin的明显特异点是______。b

《化学信息学》读书笔记

《化学信息学》读书笔记 诺伯特·维纳对信息的著名定义:“信息就是信息,不是物质也不是能量。不承认这一点的唯物论,在今天就不能存在下去。”这句话深刻揭示了信息的重要地位,信息与物质、能量是客观世界的三大构成要素。信息:事物的存在方式和运动状态的记录,它精确地描述物体或事件,并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。从产生信息的客体的性质来分,可分为自然信息(声、光、热、电、天气变化、地壳运动、天体演化等)、生物信息(如遗传信息、生物体内信息交流、动物种群内的信息交流)、机器信息(自动控制系统)和(人类)社会信息。以信息所依附的载体为依据,可分为文献信息、口头信息、电子信息、生物信息等。 信息与知识和文献之间的区别信息(Information):通过信号带来的消息。知识(knowledge):人类社会实践经验的总结,是信息的一部分,需要通过信息使用归纳、演绎的方法得到。文献(document):是用文字、图形、符号、声频、视频等技术手段记录人类知识的一种载体,或理解为固化在一定物质载体上的知识和信息。情报(information,intelligence):激活了的知识。性质有知识性、传递性及效用性。经过传递的文献才是情报,资料是文献的通俗说法。 化学信息概论 一.化学信息学的产生和发展: 信息:实物的存在方式和运动状态的记录,它精确地描述物体或事件,并且可借助于一定的物质载体进行存储和传播。 化学信息学:是应用信息学方法解决化学问题的学科。(化学信息学是信息科学与化学的交叉学科。) 二.化学信息学的研究领域: 应用现代信息技术构建信息处理系统,处理长期积累的大量化学信息资源,帮助化学家组织、分析和理解已知的科学数据,正确地预测化学物质的性质,开发新化合物、材料和方法。 应用计算机科学方法或信息学解决化学问题,对化学信息进行有效的存储、操作和处理,使化学信息合理地提升为化学知识。 研究内容:化学、化工文献学;化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输;化学图形学;化学信息的解析与处理;化学知识的计算机推演;化学教育与教学的现代技术与远程信息资源。 三.信息资源检索的意义与作用: 1.启迪创新:科研工作具有继承和创新两重性,要求科研人员在探索未知进行创新之前,应该尽可能地继承和利用与之相关的信息。 2.拓宽视野:21世纪信息与知识的积累日新月异,出现了大量的边缘科学和交叉科学。面对知识频繁更新的世界,需要接受终身教育,在不断的教育中更新知识,适应环境的变化。

武汉工程大学考研《高分子化学》考试大纲

武汉工程大学考研《高分子化学》考试 大纲 一、课程基本信息 课程中文名称:高分子化学 课程英文名称:Polymer Chemistry 二、课程的性质与任务 高分子化学是高分子材料科学与工程专业的专业基础课,是研究高分子化合物的合成原理和化学反应的一门学科。它的任务是使学生较熟练的掌握高分子化合物的合成反应原理和控制方法掌握高分子的基本概念和化学反应特征,培养学生具有初步控制聚合反应及选择聚合反应方法的能力。通过本课程的教学,使学生掌握聚合反应原理,合成方法,聚合物结构、性能与应用的关系。培养学生独立分析和解决高分子化学问题的能力,培养学生严谨的科学态度和创新精神。 三、课程教学基本要求 学生学完本课程后,应达到如下要求: 1.根据所学的高分子化学基本原理,能够合成出所需要的高分子化合物; 2.能够选择较好的聚合实施方法,能够制定出大致的工艺流程,能够较好的确定聚合参数; 3.对于高分子合成过程中出现的问题,能够运用所学的理论知识加以解决。 4. 对于高分子材料在生产、生活领域的应用较为熟悉。 四、理论教学内容和基本要求 1.绪论 (1) 引言 (2) 高分子的基本概念 (3) 聚合物分类和命名 (4) 聚合反应 (5) 分子量 (6) 高分子的链结构 (7) 大分子的微观结构 (8) 大分子的聚集态结构 基本要求: (1) 掌握:高分子化合物的基本概念、分类和命名、分子量及分布概念; (2) 理解:线型、支链和体型大分子以及高分子的微观结构; (3) 了解:聚合物的物理状态和主要性能,高分子材料和机械强度以及高分子化学简史。 2.自由基聚合 (1) 引言 (2) 连锁聚合的单体 (3) 自由机聚合机理 (4) 链引发反应 (5) 聚合速率 (6) 分子量和链转移

化学信息学论文

α-氨基酸不对称合成的新进展 摘要: 氨基酸的不对称合成是不对称合成方法中的重要组成部分.本文着重从不对称反应形成C-C化学键的角度出发,综述了近年来α-氨基酸不对称合成的最新进展。 关键词:.α-氨基酸;不对称合成;化学键 不对称合成技术是有机合成化学的一个重要组成部分,近几十年来,不对称合成领域一直是众多化学家和科研人员研究的热点.光学活性的α-氨基酸具有重要的生物活性和生理作用,是抗生素等药物、农药及食物配合剂的重要前体.光学活性的α-氨基酸还可以作为手性导剂应用于不对称合成中。它也是合成一系列肽的重要前体.α-氨基酸的不对称合成因此成为化学界研究和关注的焦点之一.在过去30年间,化学家对各种化学键的形成反应如C-H,C-C,C—O,C-N 键的形成反应等都进行了深入系统的研究。并合成了各种各样的手性催化剂及手性氨基酸.本文从化学键形成的角度出发,对α-氨基酸的不对称合成的进展进行浅显的评述。 1.手性辅基诱导下的亲电取代反应 最初的研究主要是含有手性辅基甘氨酸席夫碱类似物在手性辅基诱导下进行亲电取代反应,亲电试剂多为碘代烃、溴代烃、氯代烃、酮、反应后脱去手性辅基得到光活性α-氨基酸.手性辅基种类繁多,Abellan等已作了全面的综述.用(3R,4S)-1,5一二甲基一4.苯基咪唑啉.2一酮作手性助剂(Scheme 1),碱性条件下亲电试剂对甘氨酸席夫碱类似物进行亲电取代反应,光活性α-氨基酸成功地用Li0H从含手性辅基的中间体上切割下来。 2.不对称的strecker型反应用于a-氨基酸的合成 strecker型反应是a一氨基酸合成中的一类重要反应。特别适用N-取代α-氨基酸的合成.而对于游离的a一氨基酸,只需去除N-取代基即可。 光学纯的胺与醛或酮生成含手性辅基的席夫碱广泛用作光活性a一氨基酸前体,经过Strecker反应可用于手性a一氨基酸的合成.常用的手性胺有a一苯乙胺a-氨基醇及其衍生物,亚磺酰胺.例如,Davis等发现光活性的对甲苯亚磺酰亚胺以及叔丁基亚磺酰亚胺与Et2AlCN/i—PrOH可以发生strecker反应,反应具有较好的对映选择性。.侯雪龙等进一步发现,在KF作用下三甲基硅腈与对甲苯亚磺酰亚胺发生Strecker反应。也具有较高的对映选择性。 最近,吕龙等报道了含三氟甲基的(R)-N-叔丁基亚磺酰基酮亚胺与TMSCN 的strecker反应.研究发现,通过溶剂效应获得较高的对映选择性,并将该方法成功地应用于a-三氟甲基-a-氨基酸的合成。

化学信息学和国外软件

1.什么是化学信息学? 化学信息学是化学领域中近几年发展起来的一个新的分支,是建立在多学科基础上的交叉学科,利用计算机技术和计算机网络技术,对化学信息进行表示,管理,分析,模拟和传播,以实现化学信息的提取,转化与共享,揭示化学信息的实质与内在联系,促进化学学科的知识创新。 化学信息学是一门应用信息学方法来解决化学问题的学科。20世纪中后期,伴随着计算机技术的发展,化学家开始意识到,多年来所积累的大量信息,只有通过计算机技术才能让科学界容易获得和处理,换言之,这些信息必须通过数据库的形式存在,才能为科学界所用。这一新领域出现以后,没有一个恰当的名称。活跃在这个领域的化学家总是说他们在“化学信息”领域工作。然而,因为这一名称难以将处理化学文献的工作和发展计算机方法来处理化学信息的研究分别开来。所以,一些化学家就称之为“计算机化学”,以强调采用计算机技术来处理化学信息工作的重要性。 2.化学信息如何分类? 化学信息学的研究内容的包含范围,不同的学者有不同阐述。缪强认为包括以下六个方面:“化学、化工文献学;化学知识体系的计算机表示、管理与网络传输;化学图形学;化学信息的解析与处理;化学知识的计算机推演;化学教育与教学的现代技术与远程信息资源”。徐筱杰认为化学信息学内容包括:“化学信息的组织、管理、检索和使用;分子结构的编码、描述、三维结构的构建;化学信息的加工、处理及深化;计算组合化学;化学体系中信息的交换及传递;分子的物理化学性质预测”。邵学广等人认为化学信息学的研究内容主要包括:“利用计算机技术和计算机网络技术对化学信息进行表示和管理;利用计算机网络技术对化学信息进行收集、传播和共享;化学体系的计算机模拟或建模;利用计算机技术对复杂的化学信息进行解析,以快捷方便的方式最大限度地提取和利用有用信息”。 3.通过网络了解国外有哪些分子模拟及化工模拟软件,并指出每个软件的优缺点以及应用领域。 (1)GROMACS GROMACS是用于研究生物分子体系的分子动力学程序包。它可以用分子动力学、随机动力学或者路径积分方法模拟溶液或晶体中的任意分子,进行分子能量的最小化,分析构象等。它的模拟程序包包含GROMACS力场(蛋白质、核苷酸、糖等),研究的范围可以包括玻璃和液晶、到聚合物、晶体和生物分子溶液。GROMACS是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分子系统的牛顿运动方面具有极大的优势。 优点: (1) GROMACS进行了大量的算法的优化,使其计算功能更强大。例如:在计算矩阵的逆时,算法的内循环会根据自身系统的特点自动选择由C语言或Fortran来编译。GROMACS中对Altivec loops的计算,无论是在Linux还是MacOSX.系统上,它都要比其它软件快3-10倍,而且GROMACS提高计算速度的同时也保证了计算精度。 (2) GROMACS具有友好的用户界面,拓扑文件和参数文件都以文档的形式给出。在程序运行过程中,并不用输入脚本注释语言。所有GROMACS的操作都是通过简单的命令行操作进行的。而且运行的过程是分步的,随时可以检查模拟的正确性和可行性,可以减少时间上的浪费。

821高分子化学与物理考试大纲

821高分子化学与物理考试大纲 青岛科技大学硕士研究生入学考试高分子化学考试大纲 一、本高分子化学考试大纲适用于青岛科技大学高分子材料与工程类专业的硕士生入学考试。 二、考试内容: (一)自由基聚合 1、连锁聚合的单体 2、自由基聚合机理 3、链引发反应 4、聚合速率 5、分子量和链转移反应 6、阻聚和缓聚 7、分子量分布 8、聚合热力学 9、原子转移自由基聚合 (二)自由基共聚合 1、共聚物的类型和命名 2、二元共聚物的组成方程 3、单体和自由基的活性 4、Q-e概念 (三)聚合方法 1、本体聚合 2、溶液聚合 3、悬浮聚合 4、乳液聚合 (四)离子聚合与配位聚合 1、阳离子聚合单体 2、阳离子聚合引发剂 3、阳离子聚合机理 4、阴离子聚合单体

5、阴离子聚合引发剂 6、阴离子聚合机理 7、阴离子聚合在高分子合成中的应用 8、开环聚合的单体、引发剂和反应机理 9、配位聚合的基本概念 10、聚合物的立体异构现象 11、Ziegler-Natta引发剂 12、丙烯的配位聚合机理 13、极性单体的配位聚合 14、茂金属引发剂 15、二烯烃配位聚合引发剂 16、二烯烃配位定向聚合机理 (五)逐步聚合 1、缩聚反应 2、线形缩聚反应机理 3、线形缩聚动力学 4、线形缩聚物的聚合度 5、重要的线形缩聚物 6、体形缩聚 7、凝胶化作用和凝胶点 (六)聚合物化学反应 1、聚合物基团反应 三、考试要求: (一)自由基聚合 明确可以发生自由基聚合反应的烯类单体。掌握自由基聚合基本概念,如链引发、链增长、链转移、链终止。准确描述自由基聚合特征,如慢引发与快增长、分子量与聚合时间、分子量与动力学链长、自动加速现象与分子量、自由基寿命的关系。掌握自由基聚合普适性方程并能够熟练运用该方程进行计算。掌握无链转移时动力学链长的表达式。掌握有链转移时聚合度的表达式。了解阻聚与自阻聚现象。准确写出自由基聚合各基元反应方程式。掌握引发剂分解动力学方程、写出分解反应方程式。了解聚合上限温度的含义及计算公式。了解原子转移自由基聚合的引发剂类型、催化剂类型。

Pipeline Pilot 在化学信息学中的运用

Pipeline Pilot(PP)是美国Accelrys公司旗下用于信息整合和流程定制的软件,是一款功能强大的信息整合和流程定制的科学平台,其在优化研究创新周期、提高工作效率与减少研究和IT经费方面能发挥巨大作用。通过Pipeline Pilot,用户不仅能够整合和挖掘杂乱无章的海量研究数据,自动化数据的分析流程,而且还可以实现企业级的研究成果快速分析、可视化与共享,提升大范围的协作能力。 Pipeline Pilot Chemistry 模块提供了多种对化合物的筛选和学习方法,实现化合物的性质计算、分析和处理等功能,并能将您的化合物与其他数据库中的化合物进行对比,发现其中性质独特、结构新颖的分子。另外还能快速枚举和分析组合化学的反应产物,识别一系列化合物中的公共子结构,实现第三方处理程序与Pipeline Pilot 的无缝连接,自动执行对化合物的全部分析过程。 授课对象: 药物设计者,化学信息学者,药物化学家。 课程安排: 本课程教学的主要内容包括两个部分: 一、Pipeline Pilot基础内容培训 ? Pipeline Pilot基础架构简介 ? Pipeline Pilot操作界面介绍 ? 构建第一个protocol ? 熟悉Pipeline Pilot的Components ? 基本的数据操作和筛选 ? PilotScript介绍 ? 数据的合并 ? Subprotocol的创建和处理 ? 将构建好的Protocols发布到Web Services ? 课程讨论及答疑 二、Pipeline Pilot 在化学信息学中的运用 ? Pipeline Pilot Chemistry模块概述 ? 计算化合物的理化性质 ? 标准化和处理分子结构 ? 分子指纹的介绍和使用 ? 化合物的相似性搜索 ? 化合物的聚类分析 ? 分子筛选:子结构、类药性、HTS筛选 ? 组合化学库的设计:通过化学反应和R基团方法 ? 生成SAR(构效关系)Table ? 识别化合物的MCSS(最大公共子结构) ? 利用生物等电子体进行先导化合物优化 ? 枚举化合物的互变异构体和立体化合物结构 ? 课程讨论及答疑

化学信息学(计算机化学)学科发展

银川能源学院 化工信息学结课论文题目:化学信息学(计算机化学)学科发展 学生姓名杜波阳 学号1210140167 指导教师徐丽娟 院系石油化工学院 专业班级化工(本)1204 设计时间2015.6.24-2015.7.1

分析教研室 目录 目录 0 化学信息学(计算机化学)学科发展 (1) 一、计算机化学是当前化工发展的新任务 (2) 1.1化学信息学的发展历史 (2) 二、化学信息学为本科学生提供解决问题的新方法 (5) 2.1化学信息学定义的提出 (5) 2.2 化学信息学发展现状 (6) 三、化学信息学能提高学生整合信息内容的能力 (8) 3.1化学信息学能提高学生整合 (8) 3.2化学信息学未来发展趋势 (9) 四结语 (10) 参考文献 (11)

化学信息学(计算机化学)学科发展 摘要:化学信息学是一门伴随着计算机等科技发展而形成的一门新的交叉领域的学科,作为化学学科的一个分支学科,它注重的是与计算机以及网络的联系.从它的名字上可以看出,信息在这这门学科中占据着重要的作用.所以我觉得,文献在化学信息学中发挥了很关键的作用.怎样查阅文献怎样理解文献,将会是我们初学本门学科的学生要掌握的基础技能.化学信息学中中的化学并不是我们广义上的化学含义,主要是指分子,或者结构信息,化学信息学中"信息"的意思是信息科学和信息理论 . 关键词:化学分子结构,计算机化学,信息量

一.计算机化学是当前化工发展的新任务 1.1化学信息学的发展历史 化学信息学是一门以计算机技术、计算机网络技术、信息技术为基础的解决化学问题的学科,那么它的发展必然与计算机技术的发展密不可分。20世纪中后期,伴随着计算机的出现及其技术的高速发展,化学信息学也开始随之发展而起。1973年,NSTO高级研究所夏 季学校举办了一个研讨班,研讨班的名称定为“化学信息学的计算机表征与处理”,将大量采用计算机处理化学过程或用计算机技术分析化学信息的不同领域的科学家聚集在一起。由于他们都是利用计算机辅助化学研究,当聚在一起,他们意识到一个新的研究领域已经形成。从此计算机科学和信息学方法悄然进入化学领域。1987年,法国化 学家列恩(J.M Lehn)在研究复杂分子的反应过程中发现分子具有自组织、自识别的化学智能反应现象,识别的概念包含着信息的展示、传递、鉴别和响应等过程,列恩首次提出“化学信息学”的概念,这也就是化学信息学研究的开始。在列恩教授提出“化学信息学”的概念后,国外一些大学就开设了化学信息学课程并确定为研究生的研究方向。于是大量从事化学信息研究的个人、团体开始出现,化学信息学在这段时间内迅速发展。2000年,Wendy A.Warr博士在第218节 美国化学学会国家会议和博览会上做了一个关于“化学信息学的定义”的报告,将化学信息学的发展又一次推向高潮。进入新世纪后,随着计算机及网络技术的迅猛进步,计算机技术能解决的化学问题越来越

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