文档库 最新最全的文档下载
当前位置:文档库 › 高通量测序技术--第二代测序技术

高通量测序技术--第二代测序技术

高通量测序技术--第二代测序技术
高通量测序技术--第二代测序技术

高通量测序技术--第二代测序技术

高通测序技术—量第二—测序代术技

高量通序技测术是对统传测一序次命性的革变改一,次几对万十到百万几DN条分A

子行进列序定,测此因在些有文献中称其下为代一测技术(nex序 gteenrtiano sequnecing足)见其时代的改变,同划时高通测量使得序一对个种物转的组和基录因进组行细致全貌的析分成为能,可以所又称为被度测深(d序eepseq uneincg)。

从2019年自44 5Lif ecSenies公司c2(07年0该司被公Rcoe正式收购h推)了454出 FXL磷酸焦序测台平4(4 F5L Xyrpsoeuqencng piatlorfm)以来曾,推过3出

70xl D3AN测仪序(330xl D7N AAalynze)的Appliedr BoiySste(AmIB这家一直)占着测序据场最市份大额公司的的先地位领就始动摇开,因为了们他的头产拳毛品细管列电泳测阵序系列(series ca仪ilplayra rayr elcetrohopesirsse uencing qmahcnei)s遇了两到强有力的竞个对手,争个一就是氏公罗司(oRhce的4)4 5测仪(序ocRh GSF X Lequesncre,)另一,就是2个00年美国6lluIinma司公出推的olSxe基a因分组析平台G(neoem nalyzeArp lafotmr,)为,此020年7BA公司推I了自主出发研S的LODi 测仪序A(I SBOLD siqueencre。)这三个测平台序即目为前通量高测平台的代序。表(见一表)

公司名称

技术原技理开术发商者业式模

Ap

lyp BosistemysABI()基于珠磁大的模规并克行连隆DNA接序法测美国 gencAourt私基因组人学公司(AP)上G市司公

售设备和试销获取利剂

Il润umilan合成测法序英国 Sloxae司公席科首家D学avdiB entlye上市司:公

售设和备试获取利润剂

R

che 大规o模并行焦磷合成测序法酸国美44 5iLf Sceiecnse公司的创始人onJtahn Raohbtreg上市公司:

售设和试剂获取利润备

He

ilcos大模规行并单子合成分测序法美斯坦福国学大生物程学家工Stehpen Quake

上公市司2:070年月首5公开次股(募PO) I

oCmplee tGneomicsDNA纳阵米列组合与探锚针连接测序定法国Comp美lteeGe nomci公司首席科s家ra学oje drmdnaa 私人公c司投:资额4650万美为元

一:流主测序平一览

台这些

平台共的同点特是极高的序测通量相对于,统传测序的96毛道管测序,高通细测序

一量次实可以验取4读0到万40万条0列。序读长度根取据台不平同从52pb到450b,p

同的不测平台序一在次实中验可,读以1取到G4G不1的等碱数,这样庞基的测序大能是

力统测序传仪不能比所的拟尽。管此,在如项这的新划代时的序测术刚出技的时候,现学

界科对项这技新术并不却衷热。许多习惯用桑技格术科的家学怀疑技术的准新度确阅读、

力能成、本消费实、性用代理。aSger型n测硬件的经销序害怕商其投失败而首资先提了

这出些疑。

怀

一:图在芯片进行上的序测Ill:muni测序平a台

而多大人却数

忽略一个事了,即桑实技格的普及术最也遇初到同的阻碍。样格技桑术开发出刚来时,阅能力很读难超2过5bp,使即F在rd Sengae双脱氧r终法发明止后也达到80只pb如,今却达了7到5bp0;新而展的发合测序技术成,用焦应酸测序磷方法其阅读,力能最只有初100bp,推向市1场6月个增后加至52b0,p着随术的不断技完善,目前达已了4到

00p,很b就快近接格桑术技前目的平水除了。阅能力外读,能否有限以成本的一台仪器

产生用够足数量的列序标也是记另个需要一善改的要问题。重个这题问已被R经cheo公

司解了决应,他用们的系统,仅费花读35阅pb者或小片更段成的本能产就比生5bp多

103倍的序列记标。

图二:G

S LXF高通测序方量原理法意图示

一、高通量

序的测用应

高通量

序可以帮测研究者助跨过文构建这库实验步一,避骤了免亚隆克过程引入的中偏差依。靠后强期大生的物息信学分析力,对能照一参比个基因(组refeernc genomee)高量通测序技术可非以常松完成轻基组重测因(序e-sequrnce)e20,70年avnO sourw等人合改进的

结FAPL 术技和44 5序测技术对米玉基组因进行了测序重该,测重实序发现验超的7过%

的5NP位S能够用S点PWNvea技术验证提,了一条供复对基因组特别是含有高杂度重序

复列植物基的组因进行态性分多的析技路线。20术08年Hlliir对e虫CB48线8 5系进

行品Solxe重a序测,找寻线虫因基中组S的P位N点单位和的缺点或扩增。但是也失应

看该到,于由通量高序读取长测的限制度,使其在对未基因组进知从头行测(序onov equsecning的)用受应限到制,部这分作工仍然需要传测序(读统取度长达到85 0碱基的

协助。但)这并是不响影高通量测技序在术全因基组RmA表达谱,NmcioRrAN表谱达ChIP-ch,p以i及DA甲N化等方基的面应。用

2

008Mor年atzav等人i对鼠小大脑的肝、和脏骼肌进骨行RNA 深度测序了这,工项

展作了示深测度在转录序组研上究的大进两,展表达数和计序分析。列对测的每得序列条

进计行获数得每个特转定本录的表达量是,一种数码的化表达谱测检能,测检丰到度非常

低转录的本。析分得测序列的有,于9大0%数的显示据在已落知外显的中,而那子些已知在序之外列信息通过数据的分展示析是的未被报从道过的NRA切剪式形3,端非翻’译区,变的动启动子域以及潜区在小R的NA 体前,发至少有现5300个基拥因有止一不种剪形式。切这而些息无信使用论片技芯还术是ASG文库测序都E无是被法现的。

高通量序另一测被广个泛应的用域是小分子RNA领或非码编NAR(nRcA)研究N测。方

法序能易的解轻决片技芯在术检小测分子遇时到的技术难题(序列,高短同源度),而且小

分RN子

A

的短列序正配合好高了通量测序长的度,使得据“数浪费”不同,测序时方法还在实

能中发验现的小分新RNA子在衣藻。、马鱼斑果蝇、、虫线、人黑和猩中猩已经成都地功

到找新的了分子小RAN。在虫线中得了4获0万个列序通过,分发析了1现8新的小R个AN分和一类全子新小分的子NRA

相关文档