Tm-shift 基因分型方法在遗传学中的应用

Tm-shift 基因分型方法在遗传学中的应用

作者：袁芳;徐进;季林丹;费丽娟;刘盼盼;张莉娜

作者机构：宁波大学医学院,宁波,315211;宁波大学医学院,宁波,315211;中国科学院昆明动物研究所-香港中文大学生物资源与疾病分子机理联合实验室,昆明,650223;宁波大学医学院,宁波,315211;中国科学院昆明动物研究所-香港中文大学生物资源与疾病分子机理联合实验室,昆明,650223;宁波大学医学院,宁波,315211;宁波大学医学院,宁波,315211;宁波大学医学院,宁波,315211

来源：遗传

ISSN：0253-9772

年：2012

卷：034

期：011

页码：1484-1490

页数：7

正文语种：chi

关键词：Tm-shift;基因分型;遗传学

摘要：Melting Temperature shift(Tm-shift)是一种新的基因分型方法,主要通过在两条特异性引物5′端加入不同长度的GC 序列,PCR 扩增后根据熔解曲线中产物Tm 值的差异来完成分型.文章建立了Tm-shift 法对2 048 份样品的29 个SNP 进行分型,通过分型成功率、重复检测一致率、测序验证准确度综合评价分型效果.结果显示,29 个SNP 中有27 个可以采用本方法分型,分型成功率为93.1%.测序验证准确性达到100%.3 种基因型阳性标准对照重复检测一致率为100%; 100 个随机样品重复检测,重复性为97%.因此,Tm-shift 基因分型法是一种成本低廉、准确灵敏、稳定可靠、通量灵活、操作简便的基因分型方法,可在遗传学研究中推广应用.