率的Meta分析及软件实现
率的Meta分析及软件实现
周?波1,2?陈?欣1,2?时景璞1,2* 付凌雨1,2?王海龙1,2?吴晓梅1,2
1. 中国医科大学附属第一医院临床流行病学与循证医学教研室（沈阳 110001）；
2. 辽宁省循证医学中心（沈阳 110001）
摘要?目前对于效应量为率的同类研究进行Meta 分析的研究很多，但相关方法的研究较少。因此，本文概括性介绍了率的Meta 分析的适用条件、分析步骤及常用软件的实现过程，并通过应用实例中的数据比较常用的R 软件、Comprehensive Meta-Analysis 、Stata 和MetaAnalyst 的不同操作过程。率的Meta 分析难点在于判断能否进行率的合并，对如何处理不同研究结果间异质性的问题尚需进一步探讨。
关键词?率；Meta 分析；异质性
Meta-Analysis of Rates and Software Implementation
ZHOU Bo 1,2, CHEN Xin 1,2, SHI Jing-pu 1,2*, FU Ling-yu 1,2, WANG Hai-long 1,2, WU Xiao-mei 1,2
1. Department of Clinical Epidemiology and Evidence-based Medicine, First Affiliated Hospital, China Medical University, Shenyang 110001, China;
2. Evidence-based Medicine Center of Liaoning Province, Shenyang 110001, China
Abstract Many meta-analysis studies evaluate rates as parameter to assess the overall estimate of effects. However, none of these studies address systematic approaches for the meta-analysis of rates. This paper outlines the conditions, analysis and software operation procedures for the meta-analysis of rates. It also compares different operation procedures of three types of commonly-used R software (Comprehensive Meta-Analysis, Stata and MetaAnalyst) through real appli-cation examples. The biggest challenge for the meta-analysis of rates is to determine whether rates can be pooled, and how to evaluate heterogeneity between studies’ outcomes needs further discussion.
Key words Rate; Meta-analysis; Heterogeneity
DOI ：?10.7507/1672-2531.20140166作者简介：周波，女（1978年～），博士，讲师，以心血管流行病学与循证医学为主要研究方向。Email: ripple_zhou@https://www.wendangku.net/doc/f114029286.html, * 通讯作者，Email: sjp56@https://www.wendangku.net/doc/f114029286.html,
目前，应用Meta 分析的方法将以往的研究结果进行定量合并在临床医学研究领域越来越受重视，如2013年PubMed 收录的关于Meta 分析的文章就达5 200余篇。通过Meta 分析，可达到为同类研究增大样本量，提高检验效能的目的?[1]。所以其结果作为高质量证据，也正在被广大临床医生接受并应用于临床实践。随着方法学的不断发展，临床研究中Meta 分析的种类也逐渐多样化，由原来的局限于治疗性研究的随机对照试验的Meta 分析，扩展到诊断性试验的Meta 分析、队列研究的Meta 分析和病例-对照研究的Meta 分析等。近几年，国内外期刊有关率的Meta 分析论文开始出现?[2-5]。率或比值，在临床医学中应用非常广泛，可用于描述疾病的分布频率，干预措施的治疗效果及不良反应的程度，诊断试验的准确性，疾病的预后等。率具有直观、便于比较的优势，但由于不同研究间质量
参差不齐，样本来源、样本量大小不一，使很多同类率的结果差别很大。因此，可考虑通过率的Meta 分析方法，对于多个研究的同类率指标进行定量合并，以期得到更为可靠的结论。本文旨在阐述率的Meta 分析过程及常用率的Meta 分析软件实现过程。
1 适用条件
率的Meta 分析可用于各种率或比的综合分析。例如：在描述疾病分布的研究中，可进行特定人群中高血压、心脑血管事件、恶性肿瘤、急性传染病等的发病率、患病率、死亡率、病死率、知晓率和控制率等的Meta 分析，还可对描述疾病本身不同临床亚型、病理分型、症状和体征等的比例进行Meta 分析，也可对用于反映某项干预措施的效果或不良反应的治愈率、缓解率、复发率和发生率等进行Meta 分析，或对反映诊断试验准确性的灵敏度、特异度、预测值和似然比等进行Meta 分析。
2 分析步骤
2.1提出问题，明确研究目的
提出问题是Meta分析的首要环节，需临床专业等相关知识基础。在进行率的Meta分析时，构建问题同样需要遵循PICOS原则?[6]。
P：指代患者及参与者，还指代疾病；
I：指代干预，还指代暴露；
C：指代对照或者比较；
O：指代结局或者结果；
S：一般指代研究设计类型。
值得注意的是，在进行率的Meta分析时，这5个要素中，常常有1个或2个要素是缺如的。如：在反映干预措施效果时，对于设立对照的研究，仅能选择其中1组的率进行汇总；在进行疾病分布等描述时，相关原始研究多数为观察性研究，无干预措施，且横断面研究、病例系列等研究类型，也未设立对照组。问题提出后，应全面了解其背景知识，掌握国内外研究现状，同时为避免重复，应检索是否有类似系统评价或Meta分析发表。
2.2 制定检索策略，收集相关研究
确定研究问题后，需系统、全面地收集相关文献。为提高文献的查全率、查准率，保证Meta分析质量，则需制定合理的检索策略，通过多种途径、多种语言收集文献。目前，很多数据库和网站均有自己特定的检索策略，以帮助研究者最大程度上检索到所需文献。如BMJ集团的《Clinical Evidence》，其采用的检索策略由BMJ证据中心的信息专家制定，经评价验证可用于检索到那些符合方法学要求的研究。此外，EMbase数据库还根据不同研究内容制订了相应的检索策略，也是优秀的检索策略代表。
2.2.1电子检索①首先选择和确定数据库。可获得率的原始研究的英文数据库主要包括MED-LINE、EMbase、Web of Science和Ovid等；中文数据库主要包括WanFang Data、CBM、CNKI和VIP 等。②其次制定检索式和检索词。检索式可由关注疾病、目标人群、暴露因素、某个（些）率的指标和研究类型（病例系列、横断面研究、队列研究、随机对照试验和诊断性试验等）组成。检索词应采用MeSH词与自由词相结合的方式，且需注意，不同部分检索词间用逻辑符“AND”连接，各部分多个同义词间，应以逻辑符“OR”连接。此外，还有一些其他运算符，如“WITH”、“NEAR”和“NOT”等，可帮助提高查准率。
2.2.2 手工检索手工检索是电子检索的补充。尤其是中文期刊中有很多杂志尚未被电子数据库收
录，则需通过手工检索进行补充。还有一些在研研究、会议论文等尚未公开发表，也需进行手工检索获得。
2.2.3追溯参考文献在进行文献检索时要特别重视参考文献的追溯。某些情况下，由于检索词或检索策略设置不完善，可通过参考文献进行补充，以获得更全的文献信息。
2.3 文献筛选
根据事先拟定的纳入和排除标准，在收集的文献中，检出能够回答研究问题的文献资料。由2位研究者通过阅读文题、摘要和全文独立进行文献筛选，如遇分歧则与第三人协商解决，并记录排除的研究及其排除原因。常用的选择标准如：①原始研究设计类型（横断面研究、队列研究等）；②同一人群相关频率指标时效性的规定；③研究人群范围局部与整体的关系；④重复报道的数据的定义；⑤可根据研究目的确定是否排除特定群体的研究（如老年人、青少年等）。
此外，关于研究疾病的诊断标准、暴露因素的暴露水平等均应有严格统一的标准，并在文中标明。
2.4 纳入研究的质量评价
Meta分析质量受纳入的原始研究质量、评价的方法、评价者的知识水平及观点的影响。若Meta 分析纳入的原始研究质量低，且未对原始研究的质量进行正确评价，就会直接影响系统评价或Meta 分析的结论准确性和临床应用?[7]。因此，可以说，对Meta分析纳入的原始研究质量进行严格评价是系统评价或Meta分析最重要的组成部分。质量评价包括评价纳入研究的方法学质量及报告质量。原始研究质量评价工具主要根据研究设计、实施、结果分析整个过程中可能出现偏倚的各个因素确定。目前已有多个评价工具，包括单个评价条目、清单和量表三种类型。对于随机对照试验的方法学质量评价，可采用的评价工具包括Jadad量表?[8]、PEDro （物理治疗证据数据库）量表?[9]、Dephi清单?[10]、英国牛津循证医学中心文献严格评价项目CASP清单（critical appraisal skill program，CASP，2004）?[11]及Cochrane手册推荐的“偏倚风险评估”工具?[7]等，而随机对照试验的报告质量可采用CONSORT声明来评价和解释?[12]。非试验性研究（如队列研究和病例-对照研究）的方法学质量评价主要采用纽卡斯尔-渥太华量表（Newcastle-Ottawa Scale，NOS）?[13]、CASP清单。横断面研究质量评价目前尚无统一标准，其中有代表性的是美国卫生保健质量和研
究机构（Agency for Healthcare Research and Qual-ity，AHRQ）推荐的11条评价标准?[14]。STROBE （strengthening the reporting of observational studies in epidemiology）?[15]则用于规范流行病学观察性研究的报告格式，包括队列研究、病例-对照研究及横断面研究；诊断性试验中的相关率的指标较为特殊，可采用QUADAS（quality assessment for diag-nostic accuracy studies）质量评价标准?[16]。具体这些评价工具内容可参考曾宪涛等?[17,18]的文章。
2.5 Meta分析
可用于率的Meta分析的常见软件包括R软件、Comprehensive Meta-Analysis、Stata、Meta-Analyst 等。以下对其分别进行介绍。
2.5.1 R软件
（1）首先建立Excel表，录入原始研究名称（study）、事件发生数（event）及样本量（n），然后另存为CSV（逗号分隔）文件，放在R软件的起始文件夹中。在R Console输入命令，利用read函数读入之前建立好的Excel数据集：
rate <-read.csv("rate.csv")
（2）然后加载“meta”程序包：点击“Packages”选项，下拉菜单点击“load package”，选择“meta”。
（3）利用metaprop函数计算各个独立研究的率及95%CI，并按照率的分布选择合适的估计方法，得到合并的率及其95%CI。命令如下：
metarate <- metaprop(event,n, study,data=rate,sm="PRA W",incr=0.5,allincr=FALSE, addincr=FALSE,title="")
sm=“PRAW”，表示没有转换的原始率；
sm=“PLN”
，表示对数转换；sm=“PLOGIT”，表
示logit转换；sm=“PAS”，表示反正弦转换；sm=“PFT”，表示Freeman-Tukey双重反正弦转换。incr=0.5表示当事件发生数为0时用0.5来替代。allincr=TRUE表示至少有1个研究的事件发生数为0时，所有事件发生数都加上incr数值；为FALSE 时，只对事件发生数为0的研究加上incr数值。addincr=TRUE表示无论是否有事件发生数为0的研究，所有研究都加上incr数值；为FALSE时，表示无论是否有事件发生数为0的研究，所有研究都不加上incr数值。title=“”表示这次Meta分析的标题。
（4）绘制森林图，命令如下：
forest(metarate)
（5）查看数据合并后的率等相关数据，命令如下：
summary(metarate)
（6）查看漏斗图，命令如下：
funnel(metarate)
以《胆管癌肝移植有效性与安全性的Meta分析》一文?[19]的数据为例，应用R软件进行胆管癌原位肝移植1年有效生存率的Meta分析，数据录入见图1，命令输入见图2，结果分析森林图见图3。结果与原文中结果一致。
2.5.2 Comprehensive Meta-Analysis Comprehen-sive Meta-Analysis软件可直接录入数据或者从其他软件中导入数据。此外，该软件还可实现多种数据格式的录入，用于多种指标的Meta分析：①两个组、时间点或暴露（含相关），可以是二分类变量dichotomous（number of events）、连续性变量continuous（means）、相关系数correlation、以人年计算的率rates（events by person years）和生存时间survival（time to event）；②一个时间点、一组数的均数、比例或者率的估计，可以是一组的二分类变量dichotomous（number of events）、连续性变量continuous（means）和以人年计算的率rates（events by person years）；③普通的点估计，以原始尺度分析的数据；④对数尺度的普通点估计，以对数尺度分析的数据。利用该软件进行率的合并选择第②种
图 1 数据录入Excel
就可以。录入数据后，直接点击Run analyses进行分析即可。
仍以《胆管癌肝移植有效性与安全性的Meta 分析》一文?[19]的数据为例，应用Comprehensive Meta-Analysis软件进行胆管癌原位肝移植1年有效生存率的Meta分析。数据录入见图4，结果分析森林图见图5。结果与原文中结果一致。
2.5.3 Stata
图 2 R软件率的Meta分析命令
图 3 R软件率的Meta分析森林图
图 4 Comprehensive Meta-Analysis软件数据录入
（1）首先，在数据编辑窗口输入数据，设置变量名称，分别为研究的名称（study ）、事件发生率（r ）及样本量（n ）。
（2）计算各样本率的标准误，在command 窗口输入命令：
generate ser=sqrt(r *(1-r)/n)
（3）进行Meta 分析，得到结果森林图，命令如下：
metan r ser, random label(namevar=study) 随机效应模型metan r ser, fixed label(namevar=study) 固定效应模型
（4）得到漏斗图，命令如下：
metafunnel r ser
仍以《胆管癌肝移植有效性与安全性的Meta 分析》一文?[19]的数据为例，应用Stata 软件进行胆管癌原位肝移植1年有效生存率的Meta 分析，数据录入见图6，结果分析森林图及漏斗图见图7、8。结果与原文中结果一致。
2.5.4 MetaAnalyst 该软件与Comprehensive Meta-Analysis 软件类似，无须输入命令，操作简单。以《胆管癌肝移植有效性与安全性的Meta 分析》一
文?[19]的数据为例，应用MetaAnalyst 软件进行胆管癌原位肝移植1年有效生存率的Meta 分析。数据录入见图9，仅需录入研究的名称、年份、发生数和总数，其构成比及其下限和上限（图中黄色显示）会自动算出。接下来即可进行率的Meta 分析，点击“Analysis ”-“New Analysis ”，出现的菜单见图10，先选择随机效应模型进行分析，结果森林图和漏斗图见图11、12。结果与原文中结果一致。2.6 异质性来源
率的指标来自众多不同的研究。这些研究由于受研究者、研究对象、设计方案和研究实施等各种因素影响，其结果间通常存在很大异质性，尤其是非试验性研究，这种异质性就更为明显。按异质性来源，一般可将异质性分为临床异质性和统计学异质性。在率的Meta 分析中，临床异质性显得尤为突出，其中研究对象的来源，包括样本量的问题等均是导致异质性产生的主要原因。关于率的Meta
分
图 5 Comprehensive Meta-Analysis
软件结果森林图
图 6 Stata 软件数据编辑
析异质性来源的探索和处理方法，尚无最新、一致的专家意见提出，目前均采用与其他类型的Meta 分析一致的方法。
3讨论
Meta分析作为一种统计学方法，从其产生至今一直备受关注，尤其在临床医学领域，更起到了关键作用。很多原始研究由于样本量的问题、方法学的限制等原因，使针对同一个研究问题得到不同甚至相反的结果，而Meta分析要求最广泛、全面地收集原始研究并进行严格的质量评价，使纳入的原始研究在方法学质量和结果报告上均达到一定要求后进行定量合并，一定程度上弥补了原始研究的不足，增加了把握度，汇总后的总体效应估计值更具可信性。
采用Meta分析方法进行率的合并，在国内外发展时间很短，目前可实现率的合并的软件很多，如本文介绍的Stata、R、CMA、MetaAnalyst等。不同软件的操作难易程度有所差异，其结果呈现形式亦不尽相同?[20-22]，各有特色：R软件和Stata软件功能较全面，除可实现率的Meta分析外，还可行Meta 回归、累积Meta分析、敏感性分析、发表偏倚的统计检验、可信区间的合并等，但需进行编程；CMA 软件优势是无需编程，通过模块的运用即可完成相关功能，更灵活且易操作。从本文实例分析结果可见，采用不同软件得出的合并后率的总体效应估计值及可信区间与原文均一致，因此，我们认为进行不同研究率的Meta分析合并，操作上可行。
需要特别注意的是，由于率的产生来源不同，不同研究结果间是否可进行率的合并是关键问题。这需结合专业知识且充分探讨异质性来源后才能
图 7 Stata软件结果森林图图 8 Stata软件漏斗图
图 9 MetaAnalyst软件数据录入
图 10 MetaAnalyst软件Meta分析菜单
图 11 MetaAnalyst软件结果森林图
图 12 MetaAnalyst软件漏斗图
决定是否能够进行合并?[23]。不同研究率的异质性往往很大，尤其是一些常见慢性病的患病率。由于只考虑单组数据，大样本数据所得可信区间小，而小样本数据所得可信区间相对较大，这种差异直接导致I2和P值差异显著。一定时期内符合纳入标准的文献越多，合并估计得到率的结果越准确。时间范围越窄，研究地区范围越小，结果所代表的意义越大。而对于有显著异质性的研究，可采用亚组分析、敏感性分析或Meta回归的方法对其异质性进行探讨，分析后如仍存在显著异质性，则不应继续进行合并，仅能进行定性分析。
参 考 文 献
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收稿日期：2014–04–12 修回日期：2014–05–14
本文编辑：蒋茜、杜亮
R软件实现meta分析
Package‘meta’ January12,2010 Title Meta-Analysis with R Version1.1-8 Depends R(>=2.9.1),grid Author Guido Schwarzer
2addvar metaprop (37) Olkin95 (39) plot.meta (40) print.meta (43) read.mtv (46) read.rm5 (48) trim?ll (51) trim?ll.meta (53) Index56 addvar Additional functions for objects of class meta Description The as.data.frame method returns a data frame containing information on individual studies, e.g.,estimated treatment effect and its standard error.The function addvar can be used to add a single variable to an object of class meta which for example is useful to conduct sub-group analysis or meta-regression. Usage ##S3method for class'meta': as.data.frame(x,https://www.wendangku.net/doc/f114029286.html,s=NULL,optional=FALSE,...) addvar(x,y,varname,by.x="studlab",by.y=by.x) Arguments x An object of class meta. https://www.wendangku.net/doc/f114029286.html,s NULL or a character vector giving the row names for the data frame. optional logical.If TRUE,setting row names and converting column names(to syntactic names)is optional. y A data frame with an additional covariate varname A character specifying name of additional variable by.x,by.y Speci?cations of the common columns(see merge) ...other arguments Value A data frame is returned by the function as.data.frame. A single covariate is returned by the function addvar which can be added to an object of class meta.Internally,the merge function is utilised.
(完整版)国内外主要有限元分析软件比较
有限元分析是对于结构力学分析迅速发展起来的一种现代计算方法。它是50年代首先在连续体力学领域--飞机结构静、动态特性分析中应用的一种有效的数值分析方法，随后很快广泛的应用于求解热传导、电磁场、流体力学等连续性问题。有限元分析软件目前最流行的有：ANSYS、ADINA、ABAQUS、MSC四个比较知名比较大的公司。 常见软件 有限元分析软件目前最流行的有：ANSYS、ADINA、ABAQUS、MSC四个比较知名比较大的公司，其中ADINA、ABAQUS在非线性分析方面有较强的能力目前是业内最认可的两款有限元分析软件，ANSYS、MSC进入中国比较早所以在国内知名度高应用广泛。目前在多物理场耦合方面几大公司都可以做到结构、流体、热的耦合分析，但是除ADINA以外其它三个必须与别的软件搭配进行迭代分析，唯一能做到真正流固耦合的软件只有ADINA。 软件对比 ANSYS是商业化比较早的一个软件，目前公司收购了很多其他软件在旗下。ABAQUS专注结构分析目前没有流体模块。MSC是比较老的一款软件目前更新速度比较慢。ADINA是在同一体系下开发有结构、流体、热分析的一款软件，功能强大但进入中国时间比较晚市场还没有完全铺开。 结构分析能力排名：1、ABAQUS、ADINA、MSC、ANSYS 流体分析能力排名：1、ANSYS、ADINA、MSC、ABAQUS 耦合分析能力排名：1、ADINA、ANSYS、MSC、ABAQUS 性价比排名：最好的是ADINA，其次ABAQUS、再次ANSYS、最后MSC ABAQUS软件与ANSYS软件的对比分析 1．在世界范围内的知名度 两种软件同为国际知名的有限元分析软件，在世界范围内具有各自广泛的用户群。ANSYS 软件在致力于线性分析的用户中具有很好的声誉，它在计算机资源的利用，用户界面开发等方面也做出了较大的贡献。ABAQUS软件则致力于更复杂和深入的工程问题，其强大的非线性分析功能在设计和研究的高端用户群中得到了广泛的认可。 由于ANSYS产品进入中国市场早于ABAQUS，并且在五年前ANSYS的界面是当时最好的界面之一，所以在中国，ANSYS软件在用户数量和市场推广度方面要高于ABAQUS。但随着ABAQUS北京办事处的成立，ABAQUS软件的用户数目和市场占有率正在大幅度和稳步提高，并可望在今后的几年内赶上和超过ANSYS。 2．应用领域
meta分析及其软件实现
Meta分析及其软件实现 Meta分析概念： Meta分析有广义和狭义两种概念：前者指的是一个科学的临床研究活动，指全面收集所有相关研究(包括已发表和未发表的)并逐个进行严格评价和分析，再用定量合成的方法对资料进行统计学处理得出综合结论的整个过程；后者仅仅是一种单纯的定量合成的统计学方法。 Meta分析的用途： 作为一种整合资料的统计方法，Meta分析具有以下几个方面的用途: (l)提供个体独立研究所达不到的样本量，使得一些较为微弱的效果能够被发现。 (2)对干预的全局性效果提供较为精确的估计。具有相同研究目的的单个独立研究，其研究发现不尽相同，很难直接得出某种干预的效果到底怎么样的总体性结论，meta分析正提供了回答总体性结论的方法。 (3)meta分析可以用来评价不同研究展现出来的相互矛盾的结果，这是对第二个用途的扩展。 (4)如果一项干预是有效的，meta分析可用来评价其在事先定义好的亚组人群中是否同样有效。 (5)改善对剂量反应关系的估计。 Meta分析的基本步骤如下： (1)明确简洁地提出需要解决的问题。 (2)制定检索策略，全面广泛地收集随机对照试验。 (3)确定纳入和排除标准，剔除不符合要求的文献。 (4)资料选择和提取。 (5)各试验的质量评估和特征描述。 （6）统计学处理。 a．异质性检验（齐性检验）。 b．统计合并效应量（加权合并，计算效应尺度及95％的置信区间）并进行统计推断。 c．图示单个试验的结果和合并后的结果。 d．敏感性分析。 e．通过“失安全数”的计算或采用“倒漏斗图”了解潜在的发表偏倚。
(7)结果解释、作出结论及评价。 (8)维护和更新资料。 Meta分析所使用的软件及其使用方法： 可用于Meta Analysis的软件有： 商业软件：COMPREHENSIVE META ANALYSIS，MetaWin，EasyEA 2001 自由软件：RevMan (Review Manager)，Meta Stat，Epi Meta 通用统计软件中有Meta analysis的程序： STATA，SAS，WinBUGS，NCSS MetaWin软件特点 MetaWin是一个主要为生态学工作者设计的定量Meta分析软件，操作简单且功能较全，以Windows作支持，用户通过界面与机器直接对话，分析过程简单易学，结果输出明了。其主要特点如下所述。 1. 提供了两种假设模型：这两种假设模型为固定效应模型和混合效应模型，区别主要在于前者假设所综合的研究共享一个真实效应大小，实际测量的效应大小不同是由于随机取样所导致，而后者却假设研究间具有不同的真实效应大小，即所测效应大小的不同是由两部分组成，真实效应的不同，随机取样造成误差。后者更切合实际，区间估计较保守，更受Meta分析家们欢迎。 2. 提供多种可选择的结合统计量：j(其中，Xe、Xc分别为实验组和对照组的测量平均值，S为两组共同标准差，J为小样本较正值），MetaWin还提供了反应比（response ratio）：ln（Xe /Xc）（Xe、Xc的意义同上）这是从医学Meta 中新引进的一种结合统计量；此外，MetaWin还为对Meta分析较为熟悉的分析者提供了更多的选择机会，如相关系数（correlation coefficient）等。 3 . 提供了两种数据输入方式: 对有经验的分析者可直接输入效应值、样本方差等所需数据，其格式称效应数据格式。这种数据输入法的好处在于分析者可根据所收集的文献的实际情况来自己构造结合统计量，也即MetaWin为分析者提供了较大的自由。在文献数据满足前两种结合统计量计算情况下，分析者可以输入原文献中的统计数据，如平均值、样本方差、样本大小来进行计算，比较方便，称原始数据格式。 4.提供了一项非参数检验——重取样检验 重取样检验是一种计算机加强（computer intensive）非参数检验方法。MetaWin 中提供了随机化检验法（randomization test）和自助法或靴襻法（bootstrap）。前者常被用来决定一个统计量的显著性水平，后者则用于给出统计量的置信区
Meta分析系列之二_Meta分析的软件
·循证理论与实践· Meta分析系列之二:Meta分析的软件 曾宪涛，Joey S．W．Kwong，田国祥，董圣杰［中图分类号］R4［文献标识码］A［文章编号］1674-4055(2012)02-0089-03 随着循证医学的发展，Meta分析(Meta-analysis)已被公认为客观评价和合成针对某一特定问题研究证据的最佳手段，被视为最高级别的证据，成为循证决策的良好依据［1］。上一篇文章我们对Meta分析的类型进行了介绍［2］，为了适应不同类型的需要，多种Meta分析软件被开发出来了。这些软件中有的软件可以进行各种Meta分析，有的仅仅是针对某一种类型的Meta分析开发的;基于的操作系统有Win-dows、DOS、Linux和Mac;按照是否需要编程又分为编程软件和非编程软件(表1)。这些软件为行Meta分析提供了很好的支持，但也为评价者的选择带来了疑惑。鉴于此，本文拟对当前常用的Meta分析的软件进行简介，以期为使用者提供参考。 1编程软件 1．1Stata Stata是基于C语言的一个功能强大而又小巧玲珑的统计分析软件，最初由美国计算机资源中心(Computer Resource Center)研制，现为Stata公司的产品。1985年Stata 1．0版问世，从4．0版起进入Windows时代，当前最新版本为12．0，操作系统还有Linux和Mac［3］。Stata的许多高级统计模块均是程序文件(ado文件)，并允许用户自行修改、添加和发布ado文件，用户可随时到Stata网站或者其他个人网站上寻找并免费下载所需的程序包安装后使用。Meta分析通过Stata的meta．ado模块完成，包括metan、metareg、metabias等常用命令，可完成二分类变量、连续性变量、诊断试验、单纯P 值、单组率、剂量反应关系、生存资料的Meta分析，也可以完成Meta回归分析、累积Meta分析、网状Meta分析等几乎所有的Meta分析方法，还可以行Begg＇s检验和Egger＇s检验，可绘制Meta分析的相关图形，如森林图(forest plot)、漏斗图(funnel plot)和拉贝图(L＇A bbe plot)，亦可排除单个研究行敏感性分析。据悉，Stata是目前Meta分析最受推崇的软件，国外高质量杂志更倾向于接收Stata Meta分析图形界面。 1．2R R软件是基于S语言的一种免费开放式的统计编程环境，由Auckland大学Ross Ihaka和Robert Gentlemen及其他志愿者开发，目前由R核心开发小组维护。R软件具备完整的数据处理、计算和作图功能，不依赖于操作系统可以运行于Unix、Linux、Windows及Mac系统［4］。R部分统计功能整合在R语言底层，大多数功能以程序包的形式提供，用户可以从R软件的官方网站(http://www．r-project．org)获取最新的软件及相应的统计包(package)。R软件通过相应的程序包完成Meta分析，具有功能完整、作图精美等优点。目前 基金项目:湖北医药学院2010年教学研究项目(2010017);湖北医药学院2011年度优秀中青年科技创新团队项目(2011CZX01)。 作者单位:442000十堰，湖北医药学院附属太和医院口腔医学中心(曾宪涛);香港中文大学医学院内科及药物治疗学系心脏科(Joey S．W．Kwong);北京军区总医院第二门诊部(田国祥);苏州大学附属第一医院骨科(董圣杰) 通讯作者:田国祥，E-mail:tian-gx@126．com doi:10．3969/j．issn．1674-4055．2012．02．002常用的Meta分析程序包有metafor、meta、rmeta等，可以完成二分类及连续性变量的Meta分析外，还可以行Meta回归分析、累积Meta分析、非参数剪补法识别和校正有发表偏倚导致的漏斗图的不对称及对发表偏倚的Begg＇s检验和Egger＇s 检验。同时可以绘制森林图、漏斗图、星状图(radial plot)、拉贝图以及Q-Q正态分位图(Q-Q normal plot)。其中，Metafor 程序包是R软件Meta分析程序包中唯一可以进行混合效应模型(包括单个、多个分类或连续性调节变量)拟合运算的。据悉，R有取代SPSS而与Stata、SAS并列为新的三大统计学软件的趋势。 2非编程软件 2．1Review Manager Review Manager(RevMan)是国际Co-chrane协作网制作和保存Cochrane系统评价的专用软件，其独特的功能是可以与Archie服务器连接［5］。RevMan由北欧Cochrane中心制作和更新，基于的操作系统有操作系统还有Windows、Linux和Mac。当前最新版本为5．1．6，任何非商业目的的使用者均可免费下载及使用(http://ims．cochrane．org/revman/download)。RevMan5．1与之前版本相比，界面更加方便友好，能够输入中文，增加了风险偏倚评估工具表(rsik of bias tables)、证据结果总结表(summary of findings ta-bles)、计算器(calculator，可输入效应量、可信区间、标准误、Z 值、P值进行效应值的转化)、PRISMA文献检索流程图、森林图小数位数(2位与4位间)的调整等。 RevMan软件中设置了干预措施系统评价、诊断试验精确性系统评价、方法学系统评价和系统评价汇总评价4类格式，支持Windows、Linux和Mac OSX操作平台，可绘制森林图及漏斗图，但不能行Meta回归分析、累积Meta分析、Begg＇S 检验、Egger＇S检验及绘制拉贝图等。 RevMan是所有Meta分析软件中唯一可与GRADEprofil-er软件相互导入进行证据等级评级的软件［1，6］。RevMan是当前医学领域应用最为广泛的Meta分析软件。 2．2Comprehensive Meta-Analysis Comprehensive Meta-Analy-sis(CMA)软件是由美国国家卫生研究院(NIH)资助、由英国和美国Meta分析领域公认的一群专家制作并进行维护、更新的一款专程设计进行Meta分析软件，当前最新版本为2．1［7］。CMA为是一款商业软件，学术目的购买完整版为99美元/年、终身版795美元，用户可从http://www．meta-analy-sis．com/pages/demo．html免费下载体验版试用30d。CMA 基于的系统为Windows，界面友好，能够输入中文，主要包括数据输入(data entry)、数据分析(data analysis)和高分辨率图形(high resolution plots)三个版块。CMA包除可以完成二分类及连续性变量的Meta分析外，还可以行Meta回归分析、累计Meta分析、单组率Meta分析、剔除单个研究行敏感性分析，但不能行诊断试验的Meta分析;可调整小数位数、绘制森林图、漏斗图等;可行Begg＇s检验和Egger＇s检验。CMA是目前非编程软件中唯一可同时行随机与固定效应模型、自动剔除单个研究行敏感性分析、及将多种类型数据(如二分类/连续性变量与OR值)合并分析的软件。
meta分析的完整步骤()
Meta分析的完整步骤，根据个人的体会，结合战友的经验总结而成，meta的精髓就是对文献的二次加工和定量合成，所以这个总结也算是对战友经验的meta分析吧。 一、选题和立题 （一）形成需要解决的临床问题： 系统评价可以解决下列临床问题: 1.病因学和危险因素研究; 2.治疗手段的有效性研究; 3.诊断方法评价; 4.预后估计; 5.病人费用和效益分析等。 进行系统评价的最初阶段就应对要解决的问题进行精确描述,包括人群类型(疾病确切分型、分期) 、治疗手段或暴露因素的种类、预期结果等,合理选择进行评价的指标。 （二）指标的选择直接影响文献检索的准确性和敏感性，关系到制定检索策略。（三）制定纳入排除标准。 二、文献检索 （一）检索策略的制定 这是关键，要求查全和查准。推荐Mesh联合free word检索。 （二）文献检索，获取摘要和全文
国内的有维普全文VIP，CNKI，万方数据库，外文的有medline ,SD，OVID等。（三）文献管理 强烈推荐使用endnote，procite，noteexpress等文献管理软件进行检索和管理文献。 查找文献全文的途径： 在这里，讲一下找文献的过程，以请后来的战友们参考（不包括网上有电子全文的）： 1.查找免费全文： （1）在pubmed center中看有无免费全文。有的时候虽然没有显示free full text，但是点击进去看全文链接也有提供免费全文的。我就碰到几次。 （2）在google中搜一下。 少数情况下，NCBI没有提供全文的，google有可能会找到，使用“学术搜索”。本人虽然没能在google中找到一篇所需的文献，但发现了一篇非常重要的综述，里面包含了所有我需要的文献（当然不是数据），但起码提供了一个信息，所需要的文献也就这么多了，因为老外的综述也只包含了这么多的内容。这样，到底找多少文献，找什么文献，心里就更有底了。 2.图书馆查馆藏目录： 包括到本校的，当然方便，使用pubmed的linkout看文献收录的数据库，就知道
LinkLab原创：META分析软件的选择
实用到没朋友——META分析软件的选择 所谓“工欲善其事，必先利其器”，随着循证医学的发展，META分析已被公认为客观评价和合并针对某一特定问题研究证据的最佳手段,想要做好META分析，离不开合适的META分析工具。在琳琅满目的各种META分析软件中，该选择哪一款？究竟是免费的好还是收费的好？这是一个大问题！ 目前常用的Meta分析软件大抵可分为两种，编程软件和非编程软件。其中好评如潮的Stata 和R软件均属于编程软件，这类软件的优点在于其开放式的编程环境，这就意味着会有不少统计学家为它们量身打造各种优秀的可用于Meta分析的扩展包，作为终端用户只需要在网络上搜寻到这些扩展包，就可以直接坐享其福；当然，使用者也必须对软件的基本模块和命令有一定的了解。另一类非编程软件，如RevMan和Meta-Analyst都属于Meta分析专用软件，这类软件多来源于官方，易于操作、界面简洁友好，操作性更高，但其分析模式和功能相对更为固定。 1.RevMan：Cochrane协作网META分析软件 RevMan（Review Manager）是国际Cochrane协作网提供给评价者准备和维护更新Cochrane系统评价而设计的软件，也可以说是专门为临床医生量身定做的Meta分析软件，它不仅可以协助我们完成Meta 分析的计算过程，还可以帮助我们了解Meta分析的架构并学习系统评价的方法，最后把完成的系统评价制作成易于通过电子转换的文件以标准统一的格式发送到CDSR，便于电子出版和日后更新。 RevMan是所有Meta分析软件中唯一可与GRADEprofile软件相互导入进行证据等级评级的软件，也是当前医学领域应用最广泛的Meta分析软件。RevMan软件中设置了干预措施系统评价、诊断试验精确性系统评价、方法学评价和系统评价汇总评价4类格式，可绘制森林图及漏斗图，但不能进行Meta回归分析、累积Meta分析、BeggS检验、EggerS检验及绘制拉贝图等。 RevMan是一款可以免费下载及使用的软件，能够输入中文，除以上功能外，最新版RevMan还具有风险偏倚评估工具表、证据结果总结表、计算器（可输入效应量、可信区间、标准误、Z值、P值进行效应值的转化）、PRISMA文献检索流程图、森林图小数位数的调整
有限元分析软件的比较
有限元分析软件的比较（购买必看）－转贴 随着现代科学技术的发展，人们正在不断建造更为快速的交通工具、更大规模的建筑物、更大跨度的桥梁、更大功率的发电机组和更为精密的机械设备。这一切都要求工程师在设计阶段就能精确地预测出产品和工程的技术性能，需要对结构的静、动力强度以及温度场、流场、电磁场和渗流等技术参数进行分析计算。例如分析计算高层建筑和大跨度桥梁在地震时所受到的影响，看看是否会发生破坏性事故；分析计算核反应堆的温度场，确定传热和冷却系统是否合理；分析涡轮机叶片内的流体动力学参数，以提高其运转效率。这些都可归结为求解物理问题的控制偏微分方程式，这些问题的解析计算往往是不现实的。近年来在计算机技术和数值分析方法支持下发展起来的有限元分析（FEA，Finite Element Ana lysis）方法则为解决这些复杂的工程分析计算问题提供了有效的途径。在工程实践中，有限元分析软件与CAD系统的集成应用使设计水平发生了质的飞跃，主要表现在以下几个方面： 增加设计功能，减少设计成本； 缩短设计和分析的循环周期； 增加产品和工程的可靠性； 采用优化设计，降低材料的消耗或成本； 在产品制造或工程施工前预先发现潜在的问题； 模拟各种试验方案，减少试验时间和经费； 进行机械事故分析，查找事故原因。 在大力推广CAD技术的今天，从自行车到航天飞机，所有的设计制造都离不开有限元分析计算，FEA在工程设计和分析中将得到越来越广泛的重视。国际上早20世纪在50年代末、60年代初就投入大量的人力和物力开发具有强大功能的有限元分析程序。其中最为著名的是由美国国家宇航局（NASA）在1965年委托美国计算科学公司和贝尔航空系统公司开发的NASTRAN有限元分析系统。该系统发展至今已有几十个版本，是目前世界上规模最大、功能最强的有限元分析系统。从那时到现在，世界各地的研究机构和大学也发展了一批规模较小但使用灵活、价格较低的专用或通用有限元分析软件，主要有德国的ASKA、英国的PAFE C、法国的SYSTUS、美国的ABQUS、ADINA、ANSYS、BERSAFE、BOSOR、COSMOS、E LAS、MARC和STARDYNE等公司的产品。 以下对一些常用的软件进行一些比较分析： 1. LSTC公司的LS-DYNA系列软件
有限元分析软件比较分析
?有限元分析软件 有限元分析是对于结构力学分析迅速发展起来的一种现代计算方法。它是5０年代首先在连续体力学领域－-飞机结构静、动态特性分析中应用的一种有效的数值分析方法，随后很快广泛的应用于求解热传导、电磁场、流体力学等连续性问题。 有限元分析软件目前最流行的有:AＮSYS、ＡDＩNA、ＡＢAQUＳ、MSC 四个比较知名比较大的公司,其中AＤＩNA、ABAQＵS在非线性分析方面有较强的能力目前是业内最认可的两款有限元分析软件，ANＳYS、MSC 进入中国比较早所以在国内知名度高应用广泛。目前在多物理场耦合方面几大公司都可以做到结构、流体、热的耦合分析，但是除AＤINＡ以外其它三个必须与别的软件搭配进行迭代分析，唯一能做到真正流固耦合的软件只有ADINA。AＮＳYS 是商业化比较早的一个软件,目前公司收购了很多其他软件在旗下。AB AQＵＳ专注结构分析目前没有流体模块。MSC 是比较老的一款软件目前更新速度比较慢。ADINA 是在同一体系下开发有结构、流体、热分析的一款软件，功能强大但进入中国时间比较晚市场还没有完全铺开。 结构分析能力排名:1、ABＡQUS、ADINA、MSC、ANSYS流体分析能力排名：1、AＮSYS、ＡDINA、MＳC、ABAQUS 耦合分析能力排名:1、ADINA、ANSYS、MSC、AＢAＱＵＳ 性价比排名：最好的是ＡDINA,其次ABAQＵＳ、再次AＮＳYS、最后ＭＳＣ ＡBＡQUＳ软件与ＡＮSYS软件的对比分析： 1．在世界范围内的知名度：两种软件同为国际知名的有限元分析软件，在世界范围内具有各自广泛的用户群。ANSYS 软件在致力于线性分析的用户中具有很好的声誉,它在计算机资源的利用，用户界面开发等方面也做出了较大的贡献。ABAQＵS 软件则致力于更复杂和深入的工程问题,其强大的非线性分析功能在设计和研究的高端用户群中得到了广泛的认可。由于ANＳYS产品进入中国市场早于ＡBＡQUＳ，并且在五年前ANSＹS 的界面是当时最好的界面之一，所以在中国，ＡNSYS 软件在用户数量和市场推广度方面要高于ABAＱＵＳ。但随着ABAQUＳ北京办事处的成立，ABAQUS 软件的用户数目和市场占有率正在大幅度和稳步提高,并可望在今后的几年内赶上和超过ANSYS。
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