细菌分类表

1.酸杆菌目(Acidobacteriales)

1.酸杆菌科(Acidobacteriaceae)

1.酸杆菌属(Acidobacterium)

2.(Edaphobacter)

3.(Terriglobus)

1.石鳖杆菌目(Acanthopleuribacterales)

1.石鳖杆菌科(Acanthopleuribacteraceae)

1.石鳖杆菌属(Acanthopleuribacter)

2.全噬菌目(Holophagales)

1.全噬菌科(Holophagaceae)

1.地发菌属(Geothrix)

2.全噬菌属(Holophaga)

1.酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)

1.酸微菌目(Acidimicrobiales)

1.酸微菌亚目(Acidimicrobineae)

1.酸微菌科(Acidimicrobiaceae)

1.酸微菌属(Acidimicrobium)

2.(Iamiaceae)

1.(Iamia)

2.放线菌亚纲(Actinobacteridae)

1.放线菌目(Actinomycetales)

1.放线菌亚目(Actinomycineae)

1.放线菌科(Actinomycetaceae)

1.放线棒菌属(Actinobaculum)

2.放线菌属(Actinomyces)

3.隐秘杆菌属(Arcanobacterium)

4.(Falcivibrio)

5.动弯杆菌属(Mobiluncus)

6.(Varibaculum)

2.(Actinopolysporineae)

1.(Actinopolysporaceae)

1.(Actinopolyspora)

3.(Catenulisporineae)

1.(Actinospicaceae)

1.(Actinospica)

2.(Catenulisporaceae)

1.(Catenulispora)

4.棒杆菌亚目(Corynebacterineae)

1.棒杆菌科(Corynebacteriaceae)

1.(Bacterionema)

2.(Caseobacter)

3.棒杆菌属(Corynebacterium)

4.(Turicella)

2.迪茨氏菌科(Dietziaceae)

1.迪茨氏菌属(Dietzia)

3.分枝杆菌科(Mycobacteriaceae)

1.分枝杆菌属(Mycobacterium) （含结核杆菌）

4.诺卡氏菌科(Nocardiaceae)

1.戈登氏菌属(Gordonia)

2.(Micropolyspora)

3.(Millisia)

4.诺卡氏菌属(Nocardia)

5.红球菌属(Rhodococcus)

6.斯科曼氏菌属(Skermania)

7.(Williamsia)

8.(Smaragdicoccus)

5.(Segniliparaceae)

1.(Segniliparus)

6.束村氏菌科(Tsukamurellaceae)

1.束村氏菌属(Tsukamurella)

5.弗兰克氏菌亚目(Frankineae)

1.酸热菌科(Acidothermaceae)

1.酸热菌属(Acidothermus)

2.弗兰克氏菌科(Frankiaceae)

1.弗兰克氏菌属(Frankia)

3.地嗜皮菌科(Geodermatophilaceae)

1.芽球菌属(Blastococcus)

2.地嗜皮菌属(Geodermatophilus)

3.(Modestobacter)

4.(Kineosporiaceae)

1.(Cryptosporangium)

2.(Kineococcus)

3.(Kineosporia)

5.(Nakamurellaceae)

1.(Humicoccus)

2.(Nakamurella)

3.(Quadrisphaera)

6.孢鱼菌科(Sporichthyaceae)

1.孢鱼菌属(Sporichthya)

6.糖霉菌亚目(Glycomycineae)

1.糖霉菌科(Glycomycetaceae)

1.糖霉菌属(Glycomyces)

2.(Stackerbrandtia)

7.微球菌亚目(Micrococcineae)

1.获山氏菌科(Beutenbergiaceae)

1.获山氏菌属(Beutenbergia)

2.乔治菌属(Georgenia)

3.萨勒河菌属(Salana)

2.博戈里亚湖菌科(Bogoriellaceae)

1.博戈里亚湖菌属(Bogoriella)

3.短杆菌科(Brevibacteriaceae)

1.短杆菌属(Brevibacterium)

4.纤维素单胞菌科(Cellulomonadaceae)

1.纤维素单胞菌属(Cellulomonas)

2.厄氏菌属(Oerskovia)

3.(Tropheryma)

5.(Dermabacteraceae)

1.(Brachybacterium)

2.(Dermabacter)

6.(Dermacoccaceae)

1.(Demetria)

2.(Dermacoccus)

3.(Kytococcus)

7.(Dermatophilaceae)

1.(Dermatophilus)

2.(Kineosphaera)

8.(Intrasporangiaceae)

1.(Arsenicicoccus)

2.(Humihabitans)

3.(Intrasporangium)

4.(Janibacter)

5.(Knoellia)

6.(Kribbia)

7.(Lapillicoccus)

8.(Ornithinicoccus)

9.(Ornithinimicrobium)

10.(Oryzihumus)

11.(Serinicoccus)

12.(Terrabacter)

13.(Terracoccus)

14.(Tetrasphaera)

9.(Jonesiaceae)

1.(Jonesia)

10.(Microbacteriaceae)

1.(Agreia)

2.(Agrococcus)

3.(Agromyces)

4.(Aureobacterium)

5.(Clavibacter)

6.(Cryobacterium)

7.(Curtobacterium)

8.(Frigoribacterium)

9.(Frondicola)

10.(Gulosibacter)

11.(Labedella)

12.(Leifsonia)

13.(Leucobacter)

14.(Microbacterium)

15.(Microcella)

16.(Mycetocola)

17.(Okibacterium)

18.(Plantibacter)

19.(Pseudoclavibacter)

20.(Rathayibacter)

21.(Rhodoglobus)

22.(Salinibacterium)

23.(Subtercola)

24.(Yonghaparkia)

25.(Zimmermannella)

11.微球菌科(Micrococcaceae)

1.(Acaricomes)

2.节杆菌属(Arthrobacter)

3.(Citricoccus)

4.(Kocuria)

5.微球菌属(Micrococcus)

6.(Nesterenkonia)

7.(Renibacterium)

8.罗氏菌属(Rothia)

9.口腔球菌属(Stomatococcus)

10.刘志恒菌属(Zhihengliuella)

12.(Promicromonosporaceae)

1.(Cellulosimicrobium)

2.(Isoptericola)

3.(Myceligenerans)

4.(Promicromonospora)

5.(Xylanibacterium)

6.(Xylanimonas)

13.(Rarobacteraceae)

1.(Rarobacter)

14.(Sanguibacteraceae)

1.血杆菌属(Sanguibacter)

15.(Yaniaceae)

1.(Yania)

16.科未定

1.(Actinotalea)

2.(Demequina)

3.(Phycicoccus)

4.(Ruania)

8.微单孢菌亚目(Micromonosporineae)

1.微单孢菌科(Micromonosporaceae)

1.(Actinocatenispora)

2.(Actinoplanes)

3.(Amorphosporangium)

4.(Ampullariella)

5.(Asanoa)

6.(Catellatospora)

7.(Catenuloplanes)

8.(Couchiolanes)

9.(Dactylosporangium)

10.(Krasilnikovia)

11.(Longispora)

12.(Luedemannella)

13.微单孢菌属(Micromonospora)

14.(Pilimelia)

15.(Planopolyspora)

16.(Polymorphospora)

17.(Salinispora)

18.(Spirilliplanes)

19.(Verrucosispora)

20.(Virgisporangium)

9.丙酸杆菌亚目(Propionibacterineae)

1.(Nocardioidaceae)

1.(Actinopolymorpha)

2.(Aeromicrobium)

3.(Friedmanniella)

4.(Hongia)

5.(Kribbella)

6.(Marmoricola)

7.(Micropruina)

8.(Nocardioides)

9.(Pimelobacter)

10.(Propionicicella)

11.(Propionicimonas)

2.丙酸杆菌科(Propionibacteriaceae)

1.河口微菌属(Aestuariimicrobium)

2.(Arachnia)

3.(Brooklawnia)

4.(Granulicoccus)

5.江氏菌属(Jiangella)

6.(Luteococcus)

7.(Microlunatus)

8.丙酸杆菌属(Propionibacterium)

9.(Propioniferax)

10.(Propionimicrobium)

11.(Tessaracocccus)

10.(Pseudonocardineae)

1.(Actinosynnemataceae)

1.(Actinokineospora)

2.(Actinosynnema)

3.(Lechevalieria)

4.(Lentzea)

5.(Saccharothrix)

6.(Umezawaea)

2.(Pseudonocardiaceae)

1.(Actinoalloteichus)

2.(Actinobispora)

3.(Amycolata)

4.(Amycolatopsis)

5.(Crossiella)

6.(Faenia)

7.(Goodfellowia)

8.(Kibdelosporangium)

9.(Kutzneria)

10.(Prauserella)

11.(Pseudoamycolata)

12.(Pseudonocardia)

13.(Saccharomonospora)

14.(Saccharopolyspora)

15.(Streptoalloteichus)

16.(Thermobispora)

17.(Thermocrispum)

11.链霉菌亚目(Streptomycineae)

1.链霉菌科(Sterptomycetaceae)

1.(Actinopycnidium)

2.(Actinosporangium)

3.(Chainia)

4.(Elytrosporangium)

5.北里菌属(Kitasatoa)

6.北里孢菌属(Kitasatospora)

7.(Microellobosporia)

8.(Streptacidiphilus)

9.链霉菌属(Streptomyces)

10.(Streptoverticillium)

12.(Streptosporangineae)

1.(Nocardiopsaceae)

1.(Nocardiopsis)

2.(Streptomonospora)

3.(Thermobifida)

2.(Streptosporangiaceae)

1.(Acrocarpospora)

2.(Herbidospora)

3.(Microbispora)

4.(Microtetraspora)

5.(Nonomuraea)

6.(Planobispora)

7.(Planomonospora)

8.(Planotetraspora)

9.(Sphaerisporangium)

10.(Streptosporangium)

11.(Thermopolyspora)

3.(Thermomonosporaceae)

1.珊瑚状放线菌属(Actinocorallia)

2.(Actinomadura)

3.(Excellospora)

4.(Spirillospora)

5.(Thermomonospora)

2.双歧杆菌目(Bifidobacteriales)

1.双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)

1.(Aeriscardovia)

2.(Alloscardovia)

3.双歧杆菌属(Bifidobacterium)

4.(Gardnerella)

5.(Metascardovia)

6.(Parascardovia)

7.(Scardovia)

2.科未定

3.(Coriobacteridae)

1.(Coriobacteriales)

1.(Coriobacterineae)

1.(Coriobacteriaceae)

1.奇异菌属(Atopobium)

2.(Collinsella)

3.(Coriobacterium)

4.(Cryptobacterium)

5.(Denitrobacterium)

6.(Eggerthella)

7.(Olsenella)

8.(Slackia)

4.红色杆菌亚纲(Rubrobacteridae)

1.红色杆菌目(Rubrobacterales)

1.红色杆菌亚目(Rubrobacterineae)

1.(Conexibacteraceae)

1.(Conexibacter)

2.(Patulibacteraceae)

1.(Patulibacter)

3.红色杆菌科(Rubrobacteraceae)

1.红色杆菌属(Rubrobacter)

4.(Solirubrobacteraceae)

1.(Solirubrobacter)

5.(Thermoleophilaceae)

1.(Thermoleophilum)

5.球形杆菌亚纲(Sphaerobacteridae)

1.球形杆菌目(Sphaerobacterales)

1.球形杆菌亚目(Sphaerobacterineae)

1.球形杆菌科(Sphaerobacteraceae)

1.球形杆菌属(Sphaerobacter)

1.产水菌目(Aquificales)

1.产水菌科(Aquificaceae)

1.产水菌属(Aquifex)

2.(Calderobacterium)

3.(Hydrogenivirga)

4.(Hydrogenobacter)

5.(Hydrogenobaculum)

6.(Thermocrinis)

2.除硫杆菌科(Desulfurobacteriaceae)

1.(Balnearium)

2.除硫杆菌属(Desulfurobacterium)

3.热弧菌属(Thermovibrio)

3.(Hydrogenothermaceae)

1.(Hydrogenothermus)

2.(Persephonella)

3.(Sulfurihydrogenibium)

1.拟杆菌目(Bacteroidales)

1.拟杆菌科(Bacteroidaceae)

1.(Acetomicrobium)

2.(Anaerophaga)

3.(Anaerorhabdus)

4.拟杆菌属(Bacteroides)

5.(Pontibacter)

2.紫单胞菌科(Porphyromonadaceae)

1.(Barnesiella)

2.(Capsularis)

3.(Dysgonomonas)

4.(Hallella)

5.(Odoribacter)

6.(Oribaculum)

7.(Paludibacter)

8.(Parabacteroides)

9.紫单胞菌属(Porphyromonas) （多译作“卟啉单胞菌”，但

porphyro-应来源于希腊语“紫色”）

10.(Proteiniphilum)

11.(Tannerella)

12.(Xylanibacter)

3.普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)

1.普雷沃氏菌属(Prevotella) （或译作“普氏菌”）

4.理研菌科(Rikenellaceae)

1.(Alistipes)

2.(Alkaliflexus)

3.(Marinilabilia)

4.(Petrimonas)

5.理研菌属(Rikenella) （注：Riken是日语“理化学研究所”简

称）

5.科未定

1.(Acetofilamentum)

2.(Acetothermus)

1.黄杆菌目(Flavobacteriales)

1.蟑螂杆状体科(Blattabacteriaceae)

1.蟑螂杆状体属(Blattabacterium)

2.(Cryomorphaceae)

1.(Algoriphagus)

2.(Brumimicrobium)

3.(Crocinitomix)

4.(Cryomorpha)

5.(Fluviicola)

6.李时珍菌属(Lishizhenia)

7.(Owenweeksia)

3.黄杆菌科(Flavobacteriaceae)

1.(Actibacter)

2.(Aequorivita)

3.(Algibacter)

4.(Aquimarina)

5.(Arenibacter)

6.伯杰菌属(Bergeyella)

7.(Bizionia)

8.碳酸噬胞菌属(Capnocytophaga) （注：多译作“二氧化碳噬纤

维菌属”）

9.噬纤维素菌属(Cellulophaga)

10.金黄杆菌属(Chryseobacterium)

11.(Cloacibacterium)

12.(Coenonia)

13.(Costertonia)

14.(Croceibacter)

15.独岛菌属(Dokdonia)

16.东海菌属(Donghaeana)

17.(Elizabethkingia)

18.(Empedobacter)

19.(Epilithonimonas)

20.(Flaviramulus)

21.黄杆菌属(Flavobacterium)

22.(Formosa)

23.泥滩杆菌属(Gaetbulibacter)

24.泥滩微菌属(Gaetbulimicrobium)

25.(Galbibacter)

26.(Gelidibacter)

27.(Gillisia)

28.(Gilvibacter)

29.革兰菌属(Gramella)

30.(Kaistella)

31.(Kordia)

32.(Krokinobacter)

33.(Lacinutrix)

34.列文虎克菌属(Leeuwenhoekiella)

35.(Lutibacter)

36.(Maribacter)

37.(Mariniflexile)

38.(Marixanthomonas)

39.(Mesonia)

40.(Muricauda)

41.(Myroides)

42.(Nonlabens)

43.(Olleya)

44.(Ornithobacterium)

45.(Persicivirga)

46.(Pibocella)

47.极地杆菌属(Polaribacter)

48.冷弯菌属(Psychroflexus)

49.(Psychroserpens)

50.(Riemerella)

51.(Robiginitalea)

52.(Salegentibacter)

53.(Sandarakinotalea)

54.(Sediminibacter)

55.(Sediminicola)

56.世宗菌属(Sejongia)

57.(Stanierella)

58.(Stenothermobacter)

59.(Subsaxibacter)

60.(Subsaximicrobium)

61.(Tamlana)

62.(Tenacibaculum)

64.(Vitellibacter)

65.(Wautersiella)

66.(Weeksella)

67.(Winogradskyella)

68.丽水菌属(Yeosuana)

69.(Zeaxanthinibacter)

70.周氏菌属(Zhouia)

71.(Zobellia)

72.王祖农菌属(Zunongwangia)

1.鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)

1.泉发菌科(Crenotrichaceae)

1.(Balneola)

2.(Chitinophaga)

3.泉发菌属(Crenothrix)

4.(Rhodothermus)

5.(Salinibacter)

6.(Terrimonas)

7.(Toxothrix)

2.(Flammeovirgaceae)

1.(Flammeovirga)

2.(Flexithrix)

3.(Perexilibacter)

4.(Persicobacter)

5.(Rapidithrix)

6.(Sediminitomix)

7.(Thermonema)

3.屈挠杆菌科(Flexibacteraceae)

1.(Adhaeribacter)

2.(Aquiflexum)

3.(Arcicella)

4.(Belliella)

5.(Chimaereicella)

6.(Cyclobacterium)

7.噬胞菌属(Cytophaga) （注：目前多称此属为“噬纤维菌属”，

此处依拉丁文）

8.(Dyadobacter)

9.(Echinicola)

10.(Effluviibacter)

11.(Emticicia)

13.(Flectobacillus)

14.屈挠杆菌属(Flexibacter)

15.(Hongiella)

16.(Hymenobacter)

17.(Larkinella)

18.(Leadbetterella)

19.(Marinicola)

20.(Meniscus)

21.(Microscilla)

22.(Niastella)

23.(Persicitalea)

24.(Reichenbachiella)

25.(Rhodonellum)

26.(Roseivirga)

27.(Runella)

28.(Spirosoma)

29.生孢噬胞菌属(Sporocytophaga)

4.腐螺旋菌科(Saprospiraceae)

1.(Aureispira)

2.(Haliscomenobacter)

3.(Lewinella)

4.腐螺旋菌属(Saprospira)

5.鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)

1.(Mucilaginibacter)

2.(Olivibacter)

3.(Parapedobacter)

4.(Pedobacter)

5.(Pseudosphingobacterium)

6.鞘脂杆菌属(Sphingobacterium)

6.科未定

1.(Niabella)

1.(Flavisolibacter)

2.(Fulvivirga)

3.(Prolixibacter)

4.(Segetibacter)

1.衣原体目(Chlamydiales)

1.衣原体科(Chlamydiaceae)

1.衣原体属(Chlamydia)

2.嗜衣体属(Chlamydophila)

2.副衣原体属(Parachlamydiaceae)

1.新衣原体属(Neochlamydia)

2.副衣原体属(Parachlamydia)

3.芯卡体科(Simkaniaceae)

1.芯卡体属(Simkania) （注：人名缩写简称，此处用音译）

2.棍衣原体属(Rhabdochlamydia)*

4.华诊体科(Waddliaceae)

1.华诊体属(Waddlia) （注：WADDL为“华盛顿动物病诊断实验室”

缩写）

1.绿菌目(Chlorobiales)

1.绿菌科(Chlorobiaceae)

1.臂绿菌属(Ancalochloris)

2.绿棒菌属(Chlorobaculum)

3.绿菌属(Chlorobium)

4.绿爬菌属(Chloroherpeton)

5.暗网菌属(Pelodictyon)

6.突柄绿菌属(Prosthecochloris)

1.厌氧绳菌目(Anaerolineales)

1.厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)

1.厌氧绳菌属(Anaerolinea)

2.(Bellilinea)

3.纤绳菌属(Leptolinea)

4.(Levilinea)

5.长绳菌属(Longilinea)

1.暖绳菌目(Caldilineales)

1.暖绳菌科(Caldilineaceae)

1.暖绳菌属(Caldilinea)

1.绿弯菌目(Chloroflexales)

1.绿弯菌科(Chloroflexaceae)

1.绿弯菌属(Chloroflexus)

2.绿线菌属(Chloronema)

3.太阳发菌属(Heliothrix)

4.玫瑰弯菌属(Roseiflexus)

2.颤绿菌科(Oscillochloridaceae)

1.颤绿菌属(Oscillochloris)

2.爬管菌目(Herpetosiphonales)

1.爬管菌科(Herpetosiphonaceae)

1.爬管菌属(Herpetosiphon)

1.产金菌目(Chrysiogenales)

1.产金菌科(Chrysiogenaceae)

1.产金菌属(Chrysiogenes)

而非“属”(Genus)。表中在形态分类后面加注"@"。预料不久的将来整个蓝藻分类系统将会大调，与其它细菌统一为系统发育分类系统。

此外，因汉语“藻”字可指多种水生光合产氧生物，包括多支互不相关的原生生物甚至高等水生植物，此处仍用按照“藻”翻译蓝藻门(Cyanobacteria)细菌。但也可依据个人理念将名称定为“某菌”或“某蓝菌”，但应注意避免与其余细菌重名。

1.第一目（色球藻目(Chroococcales)）@

1.第一科@

1.管孢藻属(Chamaesiphon)@

2.色球藻属(Chroococcus)@

3.(Cyanobacterium)@

4.(Cyanobium)@

5.(Cyanothece)@

6.蓝纤维藻属(Dactylococcopsis)@

7.(Gloeobacter)@

8.黏球藻属(Gloeocapsa)@

9.黏杆藻属(Gloeothece)@

10.微囊藻属(Microcystis)@

11.原绿球藻属(Prochlorococcus)@

12.原绿藻属(Prochloron)@

13.聚球藻属(Synechococcus)@

14.集胞藻属(Synechocystis)@

2.第二目（宽球藻目(Pleurocapsales)）@

1.第一科@

1.(Cyanocystis)@

2.(Dermocarpella)@

3.(Stanieria)@

4.异球藻属(Xenococcus)@

2.第二科@

1.拟色球藻属(Chroococcidiopsis)@

2.黏囊藻属(Myxosarcina)@

3.宽球藻属(Pleurocapsa)@

3.第三目（颤藻目(Oscillatoriales)）@

1.第一科@

1.节螺藻属(Arthrospira)@ （包含商业化螺旋藻）

2.(Borzia)@

3.(Crinalium)@

4.(Geitlerinema)@

5.盐螺旋藻属(Halospirulina)

6.(Leptolyngbya)@

7.(Limnothrix)@

8.鞘丝藻属(Lyngbya)@

9.微鞘藻属(Microcoleus)@

10.颤藻属(Oscillatoria)@

11.(Planktothrix)@

12.原绿发藻属(Prochlorothrix)@

13.(Pseudanabaena)@

14.螺旋藻属(Spirulina)@

15.(Starria)@

16.束藻属(Symploca)@

17.束毛藻属(Trichodesmium)

18.(Tychonema)@

4.第四目（念珠藻目(Nostocales)）@

1.第一科@

1.鱼腥藻属(Anabaena)@

2.项圈藻属(Anabaenopsis)@

3.束丝藻属(Aphanizomenon)@

4.(Cyanospira)@

5.(Cylindrospermopsis)@

6.筒孢藻属(Cylindrospermum)@

7.节球藻属(Nodularia)@

8.念珠藻属(Nostoc)@

9.伪枝藻属(Scytonema)@

2.第二科@

1.眉藻属(Calothrix)@

2.胶须藻属(Rivularia)@

3.单歧藻属(Tolypothrix)@

5.第五目（真枝藻目(Stigonematales)）@

1.第一科@

1.(Chlorogloeopsis)@

2.费氏藻属(Fischerella)@

3.(Geitleria)@

4.(Iyengariella)@

5.拟念珠藻属(Nostochopsis)@

6.真枝藻属(Stigonema)@

1.脱铁杆菌目(Deferribacterales)

1.脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)

1.脱铁杆菌属(Deferribacter)

2.(Denitrovibrio)

3.(Flexistipes)

4.地弧菌属(Geovibrio)

5.(Mucispirillum)

2.科未定

1.暖发菌属(Caldithrix)

2.(Synergistes)

1.异常球菌目(Deinococcales)

1.异常球菌科(Deinococcaceae)

1.异常杆菌属(Deinobacter)

2.异常球菌属(Deinococcus)

2.特吕珀菌科(Trueperaceae)

1.特吕珀菌属(Truepera)

2.栖热菌目(Thermales)

1.栖热菌科(Thermaceae)

1.海栖热菌属(Marinithermus)

2.亚栖热菌属(Meiothermus)

3.海洋栖热菌属(Oceanithermus)

4.栖热菌属(Thermus)

5.火山栖热菌属(Vulcanithermus)

1.网团菌目(Dictyoglomales)

1.网团菌科(Dictyoglomaceae)

1.网团菌属(Dictyoglomus)

1.纤维杆菌目(Fibrobacterales)

1.纤维杆菌科(Fibrobacteraceae)

1.纤维杆菌属(Fibrobacter)

1.芽孢杆菌目(Bacillales)

1.(Alicyclobacillaceae)

1.(Alicyclobacillus)

2.(Pasteuria)

3.(Sulfobacillus)

2.芽孢杆菌科(Bacillaceae)

1.(Alkalibacillus)

2.(Amphibacillus)

3.(Anoxybacillus)

4.芽孢杆菌属(Bacillus)

5.(Caldalkalibacillus)

6.(Cerasibacillus)

7.(Exiguobacterium)

8.(Filobacillus)

9.(Geobacillus)

10.(Gracilibacillus)

11.(Halalkalibacillus)

12.(Halobacillus)

13.(Haloactibacillus)

14.(Jeotgalibacillus)

15.(Lentibacillus)

16.(Lysinibacillus)

17.(Marinibacillus)

18.(Oceanobacillus)

19.(Ornithinibacillus)

20.(Paraliobacillus)

21.(Paucisalibacillus)

22.(Pelagibacillus)

23.(Piscibacillus)

24.(Pontibacillus)

25.糖球菌属(Saccharococcus)

26.(Salibacillus)

27.(Salimicrobium)

28.(Salinibacillus)

29.(Salirhabdus)

30.(Sasuginibacillus)

31.(Tenuibacillus)

32.(Terribacillus)

33.(Thalassobacillus)

34.(Ureibacillus)

35.(Virgibacillus)

36.(Vulcanibacillus)

3.(Caryophanaceae)

1.(Caryophanon)

4.李斯特氏菌科(Listeriaceae)

1.环丝菌属(Brochothrix)

2.李斯特氏菌属(Listeria)

5.(Paenibacillaceae)

1.(Ammoniphilus)

2.(Aneurinibacillus)

3.(Brevibacillus)

4.(Cohnella)

5.(Oxalophagus)

6.(Paenibacillus)

7.(Thermicanus)

8.(Thermobacillus)

6.(Planococcaceae)

1.(Filibacter)

2.(Kurthia)

3.(Planococcus)

4.(Planomicrobium)

5.(Sporosarcina)

7.芽孢乳杆菌科(Sporolactobacillaceae)

1.(Marinococcus)

2.(Sinococcus)

3.芽孢乳杆菌属(Sporolactobacillus)

4.(Tuberibacillus)

8.葡萄球菌科(Staphylococcaceae)

1.孪生菌属(Gemella)

2.(Joetgalicoccus)

3.(Macrococcus)

4.(Salinicoccus)

5.葡萄球菌属(Staphylococcus)

9.(Thermoactinomycetaceae)

1.(Laceyella)

2.(Mechercharimyces)

3.(Planifilum)

4.(Seinonella)

5.(Shimazuella)

6.(Thermoactinomyces)

人体正常菌群及常见细菌的分类

人体正常菌群及常见细菌的分类

革兰氏阴性杆菌（G－杆菌）肠杆菌科弧菌科非发酵菌群罕见发酵型其它 一、肠杆菌科： 1、埃希菌属（埃希氏－志贺氏菌属）： 大肠埃希菌弗格森氏埃希菌赫尔曼埃希菌伤口埃希菌蟑螂埃希菌 2、志贺菌属： 痢疾志贺菌福氏志贺菌鲍氏志贺菌宋内氏志贺菌 3、爱德华氏菌属： 迟钝爱德华氏菌保科爱德华氏菌鲶鱼爱德华氏菌 4、沙门氏菌属： 伤寒沙门氏菌猪霍乱沙门氏菌肠炎沙门氏菌 5、枸橼酸杆菌属： 弗劳地枸橼酸杆菌异型枸橼酸杆菌无丙二酸盐枸橼酸杆菌丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌生物Ⅰ群6、肠杆菌属： 阴沟肠杆菌产气肠杆菌中间肠杆菌坂崎肠杆菌聚团肠杆菌日勾肠杆菌 河生肠杆菌溶解肠杆菌超压肠杆菌泰洛肠杆菌阿氏肠杆菌何氏肠杆菌致癌肠杆菌 7、克雷伯菌属： 肺炎克雷伯菌臭鼻克雷伯菌鼻硬结克雷伯菌产酸克雷伯菌解乌氨酸克雷伯菌植生克雷伯菌土生克雷伯菌 8、变形杆菌属： 普通变形杆菌奇异变形杆菌产粘变形杆菌潘氏变形杆菌 9、普罗威登斯菌属： 产碱普罗威登斯菌斯氏普罗威登斯菌雷氏普罗威登斯菌海氏普罗威登斯菌 拉氏普罗威登斯菌 10、摩根菌属：

摩氏摩根菌摩氏摩根菌生物Ⅰ群 11、沙雷菌属： 粘质沙雷菌液化沙雷菌深红沙雷菌普城沙雷菌芳香沙雷菌无花果沙雷菌 居泉沙雷菌嗜昆虫沙雷菌 12、耶尔森菌属： 小肠结肠炎耶氏菌弗氏耶氏菌中间型耶氏菌克氏耶氏菌假结膜耶氏菌 鼠疫耶氏菌拉氏耶氏菌毛氏耶氏菌白氏耶氏菌罗氏耶氏菌奥氏耶氏菌 13、其它： 哈夫尼亚菌属西地西菌属爱文氏菌属勒克氏菌属勒米诺氏菌属兰恩氏菌属塔特姆氏菌属致病杆菌属克卢瓦氏菌属克泽氏菌属 二、弧菌科： 1、弧菌属： 霍乱弧菌麦氏弧菌拟态弧菌霍氏弧菌海鱼弧菌河弧菌弗氏弧菌创伤弧菌溶藻性弧菌副溶血性弧菌 2、气单胞菌属： 嗜水气单胞菌温和气单胞菌豚鼠气单胞菌脆弱气单胞菌杀鲑气单胞菌 3、邻单胞菌： 类志贺单胞菌 4、发光杆菌属：对人无致病性 三、非发酵菌群：指不发酵糖类、专性需氧、不产生芽胞的革兰氏阴性杆菌 1、假单胞菌属： Ⅰ群：铜绿假单胞菌荧光假单胞菌恶臭假单胞菌产碱假单胞菌假产碱假单胞菌斯氏假单胞菌曼多辛假假单胞菌

部分细菌分类表

1 产水菌门(Aquificae) 1.1 产水菌纲(Aquificae) 2 热袍菌门(Thermotogae) 2.1 热袍菌纲(Thermotogae) 3 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria) 3.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria) 4 恐球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) 4.1 恐球菌纲(Deinococci) 5 产金菌门(Chrysiogenetes) 5.1 产金菌纲(Chrysiogenetes) 6 绿弯菌门(Chloroflexi) 6.1 绿弯菌纲(Chloroflexi) 6.2 厌氧绳菌纲(Anaerolineae) 7 热微菌门(Thermomicrobia) 7.1 热微菌纲(Thermomicrobia) 8 硝化螺旋菌门(Nitrospira) 8.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira) 9 脱铁杆菌门(Deferribacteres) 9.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres) 10 蓝藻门(Cyanobacteria) 10.1 蓝藻纲(Cyanobacteria) 11 绿菌门(Chlorobi) 11.1 绿菌纲(Chlorobia) 12 变形菌门(Proteobacteria) 12.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria) 12.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria) 12.3 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria) 12.4 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria) 12.5 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria) 13 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）13.1 梭菌纲(Clostridia) 13.2 柔膜菌纲(Mollicutes) 13.3 芽孢杆菌纲(Bacilli) 14 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌） 14.1 放线菌纲(Actinobacteria) 15 浮霉菌门(Planctomycetes) 15.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia) 16 衣原体门(Chlamydiae) 16.1 衣原体纲(Chlamydiae) 17 螺旋体门(Spirochaetes) 17.1 螺旋体纲(Spirochaetes) 18 纤维杆菌门(Fibrobacteres) 18.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres) 19 酸杆菌门(Acidobacteria)

细菌的分类与命名微生物命名规则

细菌的分类与命名 细菌分类学 细菌分类学（taxonomy）是指对细菌进行分类、命名与鉴定的一门学科。它的任务是在全面了解细菌的生物学特征的基础上，研究它们的种类，探索其起源、演化以及与其他类群之间的亲缘关系，进而提出能反映自然发展的分类系统，并将细菌加以分门别类。它包括三个方面：分类（classification）、命名（nomenclature）和鉴定（identification）。 一、基本概念 1.细菌分类是根据每种细菌各自的特征，并按照它们的亲缘关系分门别 类，以不同等级编排成系统。分类有两种：①以细菌的形态和生理生化特性为依据的表型特征分类法，包括有传统分类法（classical classification）和数值分类法(numerical classification)；②用化学分析和核酸分析，以细菌大分子物质（核酸、蛋白质）结构的同源程度进行分类称种系分类（phylogenetic classification）或自然分类（natural classfication）。 2.细菌命名在分类基础上，给予每种细菌一个科学名称，使之在生产实践、临床实践和科学研究工作中相互交流成为可能。按照细菌命名的法规，能保证所有的科研工作者以同样方式给予细菌命名。 3.细菌鉴定将未知细菌按分类原则放入系统中某一适当位置和已知细菌比较其相似性，用对比分析方法确定细菌的分类地位。若与已知细菌相同即采用已知菌的名称，不同者则按命名原则确定一个新名称。 二、分类等级

细菌的分类等级和其他生物相同，依次为界（kingdom）、门（division）、纲（class）、目（order）、科（family）、属（genus）、种（species）。细菌属于原核生物界（procaryotae），包括有细菌、放线菌、支原体、衣原体、立克次体和螺旋体。 分类等级拉丁字尾比较固定，表示方法如下：目-ales、亚目-ineae、科-aceae、亚科-oideaae、族-eae、亚族-inae。 种是细菌分类的基本单位，将生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种；性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属；相近的属归为一科；依次类推。在两个等级之间，可添加次要的分类单位，如亚门、亚纲、亚属和亚种等。群和组不是正式分类等级，是泛指具有某种共同特性的某个集体，任何等级都可借用。 同一菌种的各个细菌，在某些方面仍有一定的差异，可再分成亚种（subspecies），亚种以下的分类等级为型（type），以区别某些特殊的特征。例如抗原结构不同而分的血清型（serotype）；对噬菌体敏感性不同的噬菌体型（phagetype）；对细菌素敏感性不同的细菌素型（bacteriocin-type），生化反应和某些生物学性状不同的生物型（biotype）。 由不同来源分离的同一种、同一亚种或同一型的细菌，称为株（strain）。株的建立是从一次单独分离物的单个原始菌落传代的纯培养物，例如从10个肺结核患者的痰液中分离出的10株结核分枝杆菌。具有某种细菌典型特征的菌株称为模式菌（typical strain）或标准菌株（standard strain），它是该种菌株的参比菌株。在细菌的分类、鉴定和命名时以模式菌为依据，也可作为质量控制的标准。

细菌分类

细菌分类表（按“界门纲目科属种”分类） 生物分类总表 生物病毒分类表 古菌分类表 细菌分类表 原生生物分类表 藻类分类表 (NCBI) 真菌分类表 植物分类表 植物分类表 (NCBI) APG I、II、III 克朗奎斯特分类 动物分类表 软体动物分类表 环节动物分类表 昆虫分类表 鱼类分类表 两栖动物分类表 爬行动物分类表 鸟类传统分类系统 鸟类DNA分类系统 鹦形目分类表 哺乳动物分类表 翼手目分类表 ? 1 酸杆菌门(Acidobacteria) o 1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria) o 1.2 全噬菌纲(Holophagae) ? 2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌） o 2.1 放线菌纲(Actinobacteria) ? 3 产水菌门(Aquificae) o 3.1 产水菌纲(Aquificae) ? 4 拟杆菌门(Bacteroidetes) o 4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes) o 4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria) o 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria) o 4.4 纲未定 ? 5 衣原体门(Chlamydiae)

o 5.1 衣原体纲(Chlamydiae) ? 6 绿菌门(Chlorobi) o 6.1 绿菌纲(Chlorobia) ?7 绿弯菌门(Chloroflexi) o7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae) o7.2 暖绳菌纲(Caldilineae) o7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi) ?8 产金菌门(Chrysiogenetes) o8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes) ?9 蓝藻门(Cyanobacteria) o9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria) ?10 脱铁杆菌门(Deferribacteres) o10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres) ?11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) o11.1 异常球菌纲(Deinococci) ?12 网团菌门(Dictyoglomi) o12.1 网团菌纲(Dictyoglomi) ?13 纤维杆菌门(Fibrobacteres) o13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres) ?14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌）o14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli) o14.2 梭菌纲(Clostridia) o14.3 热石杆菌纲(Thermolithobacteria) ?15 梭杆菌门(Fusobacteria) o15.1 梭杆菌纲(Fusobacteria) ?16 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes) o16.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes) ?17 黏胶球形菌门(Lentisphaerae) o17.1 黏胶球形菌纲(Lentisphaerae) ?18 硝化螺旋菌门(Nitrospirae) o18.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira) ?19 浮霉菌门(Planctomycetes) o19.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia) ?20 海绵杆菌门(Poribacteria)* ?21 变形菌门(Proteobacteria) o21.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria) o21.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria) o21.3 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria) o21.4 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria) o21.5 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)?22 螺旋体门(Spirochaetes) o22.1 螺旋体纲(Spirochaetes) ?23 柔膜菌门(Tenericutes) o23.1 柔膜菌纲(Mollicutes)

人体正常菌群及常见细菌的分类

人体正常菌群及常见细菌的分类人体各部位的正常菌群

一、肠杆菌科: 阴沟肠杆菌产气肠杆菌中间肠杆菌坂崎肠杆菌聚团肠杆菌日勾肠杆菌河生肠杆菌溶解肠杆菌超压肠杆菌泰洛肠杆菌阿氏肠杆菌何氏肠杆菌致癌肠杆菌克雷伯菌属： 肺炎克雷伯菌臭鼻克雷伯菌鼻硬结克雷伯菌产酸克雷伯菌解乌氨酸克雷伯菌植生克雷伯菌土生克雷伯菌 变形杆菌属： 普通变形杆菌奇异变形杆菌产粘变形杆菌潘氏变形杆菌 普罗威登斯菌属： 产碱普罗威登斯菌斯氏普罗威登斯菌雷氏普罗威登斯菌海氏普罗威登斯菌拉氏普罗威登斯菌10、摩根菌属： 摩氏摩根菌 11、沙雷菌属： 粘质沙雷菌 居泉沙雷菌 12、耶尔森菌属： 小肠结肠炎耶氏菌 鼠疫耶氏菌 13、其它： 哈夫尼亚菌属 塔特姆氏菌属弗氏耶氏菌中间型耶氏菌克氏耶氏菌拉氏耶 氏菌 西地西菌属 致病杆菌属假结膜耶氏菌毛氏耶氏菌白氏耶氏菌罗氏耶氏菌奥氏耶氏 菌 爱文氏菌属勒克氏菌属勒米诺氏菌属兰恩氏菌属克卢瓦氏菌属克泽氏菌属 肠杆菌科革兰氏阴性杆菌（G-L 杆—A. 弧菌科非发酵菌群罕见发酵型其它 1埃希菌属（埃希氏一志贺氏菌属）： 大肠埃希菌弗格森氏埃希菌赫尔曼埃希菌伤口埃希菌蟑螂埃希菌2、志贺菌属： 痢疾志贺菌福氏志贺菌鲍氏志贺菌 3、爱德华氏菌属： 迟钝爱德华氏菌4、沙门氏菌属： 伤寒沙门氏菌5、枸橼酸杆菌属： 弗劳地枸橼酸杆菌 肠杆菌属：保科爱德华氏菌猪霍乱沙门氏菌 6、 宋内氏志贺菌 鲶鱼爱德华氏菌 肠炎沙门氏菌 异型枸橼酸杆菌无丙二酸盐枸橼酸杆菌丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌生物I群 7、 9、 摩氏摩根菌生物I群 液化沙雷菌深红沙雷菌普城沙雷菌芳香沙雷菌无花果沙雷菌嗜昆虫沙雷菌

细菌分类学

细菌分类学课件 第一章绪论 细菌分类学是研究细菌分类理论和方法的科学，它包括（分类、命名、和鉴定)3个独立和相关的分类学领域。细菌分类的目的？课本第一页 第一节细菌分类学的发展和趋势 细菌分类学的发展： 一、形态学时期：分类依据：细菌的形态特征 1872年，德国植物学家Cohn提出第一个细菌分类系统。将细菌分为球菌、短杆菌、长杆菌和螺旋菌 二、生理学时期(第二纪元) 分类依据：生理特征为主起始于：Orla-Jesen(1909年)的分类系统 主要贡献：1916-1918年，美国微生物学家Buchanan对细菌的命名和分类进行了研究，把细菌分成科、族和属。 1957年，英国细菌学家Sneath把电子计算机技术应用于细菌分类，建立数值分类法。 三、分子生物学时期(第三纪元) 分类依据：化学结构和核酸起始于：20世纪60年代应用：1、分子生物学技术在细菌分类中的应用： 一、DNA分子中G＋C百分含量测定：亲缘关系越近的细菌，G+Cmol%越相近 二、DNA-DNA杂交 三、16S rRNA相关度分析 2、分子生物学技术在细菌鉴定中的应用： 一、核酸探针：原理：用带有酶、化学荧光物、放射性核素或生物素标记的已知序列特定DNA片段(探针)，在一定条件下，按碱基互补原则探针与待测标本中的核酸杂交，通过对杂交信号的检测，从而鉴定标本中有无相应的病原微生物基因及其分子大小 二、核酸扩增技术 3、分子生物学技术在细菌药敏试验中的应用：检测耐药基因 第二节细菌的分类单元和命名规则 一、分类单元及其等级：分类单元：是指具体的分类群。和其他生物分类一样，细菌的分类单元也分为七个基本的分类等级或分类阶元，由上而下依次是界、门、纲、目、科、属、种。 1、种的概念：具有高度特征相似性的菌株群，这个菌株群与其它类群的菌株有很明显的区别。 2、亚种：当某一个种内的不同菌株存在少数明显而稳定的变异特征或遗传性而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元—亚种。亚种是细菌分类中具有正式分类地位的最低等级。 3、亚种以下的等级：生物型、培养型、致病型、血清型、噬菌型、化学型、形态型等。 在细菌分类中，还常常使用非正式的类群术语。如培养物、菌株、居群和型 培养物（culture),是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物菌株（strain)，从自然界分离得到的任何一种微生物的纯培养物都可以称为微生物的一个菌株 居群（population)是指一定空间中同种个体的组合 型（form或type)：常指亚种以下的细分，当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为心的亚种时，可以细分为不同的型。 生物型biovar biotype 特殊的生理生化性状的菌株群 血清型serovar serotype 不同的抗原特征的菌株群 致病型pathovar pathotype 对宿主致病性的差异的菌株群 噬菌型phagovar phagotype lysotype 对噬菌体有特异性反应的菌株群 形态型morphovar morphotype 特殊的形态学特征的菌株群 4、属：是介于种（或亚种）与科之间分类等级，也是生物分类中的基本分类单元。通常把具有某些共同特征或密切相关的种归为一个高一级的分类单元，称之为属。 5、科：把具有某些共同特征或相关的属归为更高一级的分类单元称为科。 二、细菌分类单元的命名规则 (一)国际细菌命名法规 1、分类单元的命名法 (1)属名用一个单数主格名词或当作名词用的形容词来表示，可以是阳性、阴性或中性，首字母要大写。 如：Bacillus(芽胞杆菌属)(阳性) Lostridium(梭菌属)(中性) Salmonella(沙门氏菌)(阴性) (2)种名双名法命名 由属名和种名两部分组合而成。第一个词为属名，首字母要大写；第二个词为种名词，常用形容词，也可以用人名、地名、病名或其他名词(名词用主格或所属格形式)，种名加词首字母不大写。例： Pseudomonas aeruginosa(铜绿色假单胞菌) Mycobacterium tuberculosis(结核分枝杆菌) Bacillus thuringiensis(苏云金芽胞杆菌) (3)亚种名由属名、种名加词和亚种名加词构成 如：Alcaligenes denitrificans subsp.xylosoxydans (反硝化产碱杆菌氧化木糖亚种) (4)属以上分类单元的名称，是用拉丁或其他词源拉丁化的复数名词(或当作名词用的形容词)命名，首字母要大写2、新名称的合格发表3、合法性4、发表的优先权5、有效发表 (二)细菌名称的批准名录 第三节细菌的分类系统 一、克拉西里尼科夫分类系统 二、普雷沃分类系统 三、伯杰氏分类系统(当前国际上普遍采用) (一)第七版系统(1957年) (二)第八版系统(1974年) (三)伯杰氏系统细菌学手册(1984-1989年) (四)<<伯杰细菌鉴定手册>>第九版(1994年) 1、具有细胞壁的革兰氏阴性细菌

细菌分类表

细菌分类表 本表以LPSN网站的分类为基础（当前版本2008年1月7日），本分类代表原核生物分类的权威杂志IJSEM的分类系统，同时参考NCBI Taxonomy，但目前其它中文维基分类表可能依照其它标准，请注意其区别。 中文名称采用惯例（包括网上搜索途径）以及拉丁名直接意译，部分参考《细菌名称》第二版，拉丁文意译参考原核生物名称(英文)网站。翻译问题欢迎在原文中添加或者在讨论页中提出。 本表列到属级。后面带*者为尚未被IJSEM杂志确认的分类。 ? 1 酸杆菌门(Acidobacteria) 1.1 酸杆菌纲(Acidobacteria) 1.2 全噬菌纲(Holophagae) ? 2 放线菌门(Actinobacteria)（高G+C革兰氏阳性菌） 2.1 放线菌纲(Actinobacteria) ? 3 产水菌门(Aquificae) 3.1 产水菌纲(Aquificae) ? 4 拟杆菌门(Bacteroidetes) 4.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes) 4.2 黄杆菌纲(Flavobacteria) 4.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria) 4.4 纲未定 ? 5 衣原体门(Chlamydiae) 5.1 衣原体纲(Chlamydiae) ? 6 绿菌门(Chlorobi) 6.1 绿菌纲(Chlorobia) ?7 绿弯菌门(Chloroflexi) 7.1 厌氧绳菌纲(Anaerolineae) 7.2 暖绳菌纲(Caldilineae) 7.3 绿弯菌纲(Chloroflexi) ?8 产金菌门(Chrysiogenetes) 8.1 产金菌纲(Chrysiogenetes) ?9 蓝藻门(Cyanobacteria) 9.1 蓝藻纲(Cyanobacteria) ?10 脱铁杆菌门(Deferribacteres) 10.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres) ?11 异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus) 11.1 异常球菌纲(Deinococci) ?12 网团菌门(Dictyoglomi) 12.1 网团菌纲(Dictyoglomi) ?13 纤维杆菌门(Fibrobacteres) 13.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres) ?14 厚壁菌门(Firmicutes)（低G+C革兰氏阳性菌） 14.1 芽孢杆菌纲(Bacilli) 14.2 梭菌纲(Clostridia)

人体正常菌群及常见细菌的分类

人体正常菌群及常见细 菌的分类 Document serial number【UU89WT-UU98YT-UU8CB-UUUT-UUT108】

人体正常菌群及常见细菌的分类 革兰氏阴性杆菌（G－杆菌）

肠杆菌科弧菌科非发酵菌群罕见发酵型其它 一、肠杆菌科： 1、埃希菌属（埃希氏－志贺氏菌属）： 大肠埃希菌弗格森氏埃希菌赫尔曼埃希菌伤口埃希菌蟑螂埃希菌2、志贺菌属： 痢疾志贺菌福氏志贺菌鲍氏志贺菌宋内氏志贺菌 3、爱德华氏菌属： 迟钝爱德华氏菌保科爱德华氏菌鲶鱼爱德华氏菌 4、沙门氏菌属： 伤寒沙门氏菌猪霍乱沙门氏菌肠炎沙门氏菌 5、枸橼酸杆菌属： 弗劳地枸橼酸杆菌异型枸橼酸杆菌无丙二酸盐枸橼酸杆菌丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌生物Ⅰ群 6、肠杆菌属： 阴沟肠杆菌产气肠杆菌中间肠杆菌坂崎肠杆菌聚团肠杆菌日勾肠杆菌 河生肠杆菌溶解肠杆菌超压肠杆菌泰洛肠杆菌阿氏肠杆菌何氏肠杆菌致癌肠杆菌 7、克雷伯菌属： 肺炎克雷伯菌臭鼻克雷伯菌鼻硬结克雷伯菌产酸克雷伯菌解乌氨酸克雷伯菌 植生克雷伯菌土生克雷伯菌

8、变形杆菌属： 普通变形杆菌奇异变形杆菌产粘变形杆菌潘氏变形杆菌 9、普罗威登斯菌属： 产碱普罗威登斯菌斯氏普罗威登斯菌雷氏普罗威登斯菌海氏普罗威登斯菌 拉氏普罗威登斯菌 10、摩根菌属： 摩氏摩根菌摩氏摩根菌生物Ⅰ群 11、沙雷菌属： 粘质沙雷菌液化沙雷菌深红沙雷菌普城沙雷菌芳香沙雷菌无花果沙雷菌 居泉沙雷菌嗜昆虫沙雷菌 12、耶尔森菌属： 小肠结肠炎耶氏菌弗氏耶氏菌中间型耶氏菌克氏耶氏菌假结膜耶氏菌 鼠疫耶氏菌拉氏耶氏菌毛氏耶氏菌白氏耶氏菌罗氏耶氏菌奥氏耶氏菌 13、其它： 哈夫尼亚菌属西地西菌属爱文氏菌属勒克氏菌属勒米诺氏菌属兰恩氏菌属 塔特姆氏菌属致病杆菌属克卢瓦氏菌属克泽氏菌属 二、弧菌科：

细菌分类大全

细菌分类大全 Prepared on 22 November 2020

革兰氏阳性菌 革兰氏阳性菌 革兰氏染色法的意义就在于鉴别细菌，把众多的细菌分为两大类，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。 常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等；常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、及脑膜炎双球菌等。 在治疗上，大多数革兰氏阳性菌都对敏感（结核杆菌对青霉素不敏感）；而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感（但奈瑟氏菌中的双球菌和淋病双球菌对青霉素敏感），而对链霉素、等敏感。所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择方面意义重大。 革兰氏阴性菌,大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病.常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感,可以选择氟喹诺酮类药物如诺氟沙星，左氧氟沙星等，也可以选择大环内酯类比如克拉霉素、罗红霉素等。 革兰氏阳性菌，大多数化脓性球菌都属于革兰氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。可以选择青霉素族，头孢曲松钠等。 革兰氏阴性菌，以[]为代表。大肠为兼气性菌种，一般生存于肠道中及厌氧的还境中。革兰氏阴性菌细胞壁的特征为有一层outer membrane 与阳性菌种不同。目前对大肠杆菌的研究很

常见细菌分类

肠杆菌 1.肠杆菌属 产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物1群、河生肠杆菌生物2群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌 2.埃希菌属 大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌 3.沙雷菌属 粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌1群、芳香沙雷菌2群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌 4.克雷伯菌属 肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌 5.变形杆菌属 奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌 6.普罗威登斯菌属 产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌 7.沙门菌属 猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌 8.枸橼酸杆菌 弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌

美洲爱文菌 10.布特维西菌属 水生布特维西菌 11.爱德华菌属 迟缓爱德华菌、保科爱德华菌 12.巴提奥杆菌属 乡间巴提奥杆菌 13.哈夫尼亚菌属 蜂房哈夫菌属 14.西地西菌属 戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌 15.摩根菌属 摩根摩根菌 16志贺菌属 志贺菌A，B，C 群、宋内志贺菌 17.克吕沃菌属 抗坏血酸克吕沃菌、栖冷克吕沃菌

不脱羧莱克勒菌 19 .默勒菌属 威斯康星默勒菌 20 拉恩菌属 水生拉恩菌 21.塔特姆菌属、 痰塔特姆菌 22．耶尔森菌属 假结核耶尔森菌、小结肠炎耶尔森菌、中间耶尔森菌、克氏耶尔森菌、费氏耶尔森菌 23．不动杆菌属 洛菲不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌、醋酸钙不动杆菌 24. 寡养单胞菌属 嗜麦芽窄单胞菌 非发酵菌 1.假单胞菌属 铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌、恶臭假单胞菌、施氏假单胞菌、门多萨假单胞菌、产碱假单胞菌、假产碱假单胞菌

细菌的分类G和G

细菌的分类（G+和G－） 广义的细菌即为原核生物。是指一大类细胞核无包裹，只存在称作区(nuclear region)(或拟核)的裸露DNA的原始，包括真细菌(eubacteria)和古生菌(archaea)两大类群。人们通常所说的即为狭义的细菌，狭义的细菌为的一类，是一类形状细短，结构简单，多以二分裂方式进行繁殖的原核生物，是在自然界分布最广、个体数量最多的，是大自然的主要参与者。 把众多的细菌分为两大类，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。 常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、李式杆菌属、丹毒丝菌属、肾杆菌属、芽孢杆菌属、梭菌属、分歧杆菌属、放线菌属、奴卡菌属、棒状杆菌属、红球菌属、丹毒杆菌、气肿疽杆菌、结核杆菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等； 常见的革兰氏阴性菌有:伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布式杆菌、流感副流感杆菌、卡他杆菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、绿脓杆菌、（副）百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、弧菌、副溶血性杆菌及双球菌等。 G+ 球菌：金黄色葡萄球菌（葡萄球菌属）、乙型溶血性链球（链球菌属）、肺炎链球菌（链球菌属） G—球菌：淋球菌、脑膜炎双球菌（奈瑟菌属） G+ 杆菌：白喉杆菌（棒状杆菌属）、结核杆菌（分歧杆菌属）抗酸菌 麻风杆菌（分歧杆菌属）抗酸菌 G—杆菌：大肠杆菌（埃希菌属）、伤寒杆菌、副伤寒杆菌、志贺痢疾杆菌、福式痢疾杆菌、宋内痢疾杆菌（志贺菌属）、百日咳杆菌（包特菌属）、 肠炎杆菌（沙门菌属）、绿脓杆菌（假单胞菌属）、 在治疗上，大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感；而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感，而对链霉素、氯霉素等敏感。所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择抗生素方面意义重大。 附：(（Actinomycete）是另一大类革兰氏阳性菌，根据DNA中(G)和(C)的含量，放线菌被称为高G+C革兰氏阳性菌，而厚壁菌被称为低G+C革兰氏阳性菌。如果细胞的第二层膜是衍生特征，这两类革兰氏阳性菌可能是细菌基部的分支，否则它们可能组成关系相对较近的。它们被认为可能是和的祖先，因为它们都缺乏第二层膜，并且具有一些生化上的相似性，比如含有固醇类。此外，尽管恐球菌-栖热菌(Deinococcus-Thermus)类细菌结构上类似，但也可被染成)

(推荐)细菌分类大全

革兰氏阳性菌 革兰氏阳性菌 革兰氏染色法的意义就在于鉴别细菌，把众多的细菌分为两大类，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。 常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等；常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。 在治疗上，大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感（结核杆菌对青霉素不敏感）；而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感（但奈瑟氏菌中的流行性脑膜炎双球菌和淋病双球菌对青霉素敏感），而对链霉素、氯霉素等敏感。所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择抗生素方面意义重大。 革兰氏阴性菌,大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病.常见的革兰氏阴性菌有痢疾杆菌、伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、绿脓杆菌、百日咳杆菌、霍乱弧菌及脑膜炎双球菌等。革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感,可以选择氟喹诺酮类药物如诺氟沙星，左氧氟沙星等，也可以选择大环内酯类比如克拉霉素、罗红霉素等。 革兰氏阳性菌，大多数化脓性球菌都属于革兰氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。可以选择青霉素族，头孢曲松钠等。 革兰氏阴性菌，以[大肠杆菌]为代表。大肠杆菌为兼气性菌种，一般生存于肠道中及厌氧的还境中。革兰氏阴性菌细胞壁的特征为有一层outer membrane 与阳性菌种不同。目前对大肠杆菌的研究很多，除了它是一般食物中是否有被污染的指标外，很多分子生物学方面的研究皆需要使用到大肠杆菌当作实验宿主。 除了大肠杆菌外，变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布氏杆菌、产气夹膜杆菌、流感(嗜血)杆菌、副流感(嗜血)杆菌、卡他(摩拉)菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、百日咳杆菌、副百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌、类志贺吡邻单胞菌等也是革兰氏阴性菌 革兰氏阳性菌与阴性菌

(完整版)常见细菌分类

肠杆菌 1. 肠杆菌属产气肠杆菌、阴沟肠杆菌、聚团肠杆菌、阿斯布肠杆菌、河生肠杆菌生物 1 群、河生肠杆菌生物 2 群、中间肠杆菌、格高非肠杆菌、阪崎肠杆菌、泰洛肠杆菌 2. 埃希菌属大肠埃希菌、福格森氏埃希菌、不活跃大肠埃希菌、伤口大肠埃希菌、赫尔曼氏埃希菌 3. 沙雷菌属粘质沙雷菌、深红沙雷菌、无花果沙雷菌、泉居沙雷菌、芳香沙雷菌 1 群、芳香沙雷菌 2 群、晋城沙雷菌、液化沙雷菌 4. 克雷伯菌属肺炎克雷伯菌、臭鼻克雷伯菌、鼻硬节克雷伯菌、产酸克雷伯菌、解鸟氨酸克雷伯菌 5. 变形杆菌属奇异变形杆菌属、普通变形杆菌、潘尼变形杆菌 6. 普罗威登斯菌属产碱普罗威登菌、斯图普罗威登菌、雷极普罗威登菌、拉氏普罗威登菌 7. 沙门菌属猪霍乱沙门菌、甲型副伤寒沙门菌、伤寒沙门菌、雏白利沙门菌 8. 枸橼酸杆菌弗旁地枸橼酸杆菌、异型枸橼酸杆菌、丙二酸盐阴性枸橼酸杆菌 9. 爱文菌属 美洲爱文菌 10. 布特维西菌属水生布特维西菌 11. 爱德华菌属迟缓爱德华菌、保科爱德华菌 12. 巴提奥杆菌属乡间巴提奥杆菌 13. 哈夫尼亚菌属蜂房哈夫菌属 14. 西地西菌属戴氏西地西菌、拉氏西地西菌、奈氏西地西菌 15. 摩根菌属摩根摩根菌 16 志贺菌属 志贺菌A，B，C 群、宋内志贺菌 17.克吕沃菌属 抗坏血酸克吕沃菌、栖冷克吕沃菌 18．莱克勒菌属 不脱羧莱克勒菌 19 .默勒菌属 威斯康星默勒菌 20 拉恩菌属 水生拉恩菌 21. 塔特姆菌属、

痰塔特姆菌 22．耶尔森菌属假结核耶尔森菌、小结肠炎耶尔森菌、中间耶尔森菌、克氏耶尔森菌、费氏耶尔森菌 23．不动杆菌属 洛菲不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌、醋酸钙不动杆菌 24. 寡养单胞菌属嗜麦芽窄单胞菌 发酵菌 1. 假单胞菌属铜绿假单胞菌、荧光假单胞菌、恶臭假单胞菌、施氏假单胞菌、门多萨假单胞菌、产碱假单胞菌、假产碱假单胞菌 2. 伯克霍尔德氏菌属鼻疽伯克霍尔德氏菌、假鼻疽伯克霍尔德氏菌、洋葱伯克霍尔德氏菌、唐菖蒲伯克霍尔德氏菌 3. 丛毛单胞菌属 食酸丛毛单胞菌、睾丸酮丛毛单胞菌 4. 短波单胞菌属缺陷短波单胞菌、波囊短波单胞菌 5. 窄食单胞菌属 嗜麦芽窄单胞菌 6. 产碱杆菌属 木糖氧化产碱杆菌反硝化亚种、木糖氧化产碱杆菌木糖氧化亚种、粪产碱杆菌 7. 不动杆菌属 洛菲不动杆菌、醋酸钙不动杆菌、溶血不动杆菌、鲍曼不动杆菌 8. 黄杆菌属 脑膜败血性黄杆菌、芳香黄杆菌、u b群黄杆菌、产吲哆黄杆菌 9. 威克斯菌属 有毒威克斯菌、动物溃疡威克斯菌 10. 金色单胞菌属浅黄假单胞菌 11. 黄色单胞菌属栖稻假单胞菌 12. 弧菌属 霍乱弧菌、副溶血弧菌、溶藻弧菌、河流弧菌、创伤弧菌 13 气单胞菌属嗜水气单胞菌、温和气单胞菌、杀鲑气单胞菌、舒伯特气单胞菌、豚鼠气单胞菌 14 邻单胞菌属类志贺邻单胞菌 15 巴斯德菌属

生物分类总表

生物分类总表 1 古菌域(Archaea) 2 细菌域(Bacteria) 3 真核生物域(Eukarya) 3.1 植物界(Plantae) 3.2 真菌/后生动物组 3.2.1 动物界(Metazoa) 3.2.2 真菌界(Fungi) 3.3 其余真核生物（原生生物和真核藻类） 4 病毒和类病毒 古菌域(Archaea) 包含嗜盐菌、一些超嗜热菌、嗜酸菌等。 参见古菌分类表。 细菌域(Bacteria) 包含蓝藻、放线菌、衣原体、支原体、立克次体等。 参见细菌分类表。 真核生物域(Eukarya) 植物界(Plantae) 包含绿藻、轮藻、苔藓植物、蕨类植物、种子植物等。 参见植物分类表。 真菌/后生动物组 真菌/后生动物组除动物界和真菌外，还包含领鞭毛虫、鱼醉菌等。

动物界(Metazoa) 即“后生动物”。 参见动物分类表。 真菌界(Fungi) 参见真菌分类表，包括子囊菌、担子菌、接合菌、壶菌、Glomeromycota 和微孢子虫。 金藻纲(Chrysophyceae) 硅鞭藻纲(Dictyochophyceae) 针胞藻纲(Raphidophyceae) 前毛壶菌纲(Hyphochytriomycetes) 卵菌纲(Oomycetes) 褐藻门(Phaeophyceae)，如海带、巨藻、马尾藻、墨角藻。 硅藻门(Bacillariophyta) 黄藻门(Xanthophyceae) 囊泡虫类(Alveolata) 顶复门(Apicomplexa)，如疟原虫。 纤毛虫类(Ciliophora)，如喇叭虫、中缢虫、榴弹虫、草履虫、四膜虫。 甲藻门(Dinophyceae) 单孢子虫门(Haplosporidia) 丝足虫类(Cercozoa) 根肿菌类(Plasmodiophorida) 粒网足虫类(Granuloreticulosea)，如有孔虫。 叶足纲(Lobosea)，如变形虫（阿米巴）。 黏菌门(Mycetozoa) 灰胞藻纲(Glaucocystophyceae) 红藻门(Rhodophyta)，如石花菜、紫菜。 注：以上真核生物列表不完全，尚包括有其它一些未归类原生生物。古菌分类表 目錄

细菌的分类

广义的细菌即为原核生物。是指一大类细胞核无核膜包裹，只存在称作拟核区(nuclear region)(或拟核)的裸露DNA的原始单细胞生物，包括真细菌(eubacteria)和古生菌(archaea)两大类群。人们通常所说的即为狭义的细菌，狭义的细菌为原核微生物的一类，是一类形状细短，结构简单，多以二分裂方式进行繁殖的原核生物，是在自然界分布最广、个体数量最多的有机体，是大自然物质循环的主要参与者。 把众多的细菌分为两大类，革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。大多数化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而大多数肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。 常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、李式杆菌属、丹毒丝菌属、肾杆菌属、芽孢杆菌属、梭菌属、分歧杆菌属、放线菌属、奴卡菌属、棒状杆菌属、红球菌属、丹毒杆菌、气肿疽杆菌、结核杆菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等； 常见的革兰氏阴性菌有:伤寒杆菌、大肠杆菌、变形杆菌、痢疾杆菌、肺炎杆菌、布式杆菌、流感副流感杆菌、卡他杆菌、不动杆菌属、耶尔森菌属、嗜肺军团菌、绿脓杆菌、（副）百日咳杆菌、志贺菌属、巴斯德菌属、霍乱弧菌、副溶血性杆菌及脑膜炎双球菌等。 G+ 球菌：金黄色葡萄球菌（葡萄球菌属）、乙型溶血性链球（链球菌属）、肺炎链球菌（链球菌属） G—球菌：淋球菌、脑膜炎双球菌（奈瑟菌属） G+ 杆菌：白喉杆菌（棒状杆菌属）、结核杆菌（分歧杆菌属）抗酸菌 麻风杆菌（分歧杆菌属）抗酸菌 G—杆菌：大肠杆菌（埃希菌属）、伤寒杆菌、副伤寒杆菌、志贺痢疾杆菌、福式痢疾杆菌、宋内痢疾杆菌（志贺菌属）、百日咳杆菌（包特菌属）、 肠炎杆菌（沙门菌属）、绿脓杆菌（假单胞菌属）、 在治疗上，大多数革兰氏阳性菌都对青霉素敏感；而革兰氏阴性菌则对青霉素不敏感，而对链霉素、氯霉素等敏感。所以首先区分病原菌是革兰氏阳性菌还是阴性菌，在选择抗生素方面意义重大。 附：(放线菌（Actinomycete）是另一大类革兰氏阳性菌，根据DNA中鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)的含量，放线菌被称为高G+C革兰氏阳性菌，而厚壁菌被称为低G+C革兰氏阳性菌。如果细胞的第二层膜是衍生特征，这两类革兰氏阳性菌可能是细菌基部的分支，否则它们可能组成关系相对较近的单系群。它们被认为可能是古细菌和真核生物的祖先，因为它们都缺乏第二层膜，并且具有一些生化上的相似性，比如含有固醇类。此外，尽管恐球菌-栖热菌(Deinococcus-Thermus)类细菌结构上类似革兰氏阴性菌，但也可被染成革兰氏阳性)

第二节细菌分类分类学

第二节细菌分类分类学 内容涉及三个相互依存又有区别的组成部分: 分类(classification)是根据一定的原则(表型特征相似性或系统发育相关性)对微生物进行分群归类，根据相似性或相关性水平排列成系统，并对各个分类群的特征进行描述，以便查考和对未被分类的微生物进行鉴定； 命名(nomenclature)是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称； 鉴定(identification或determination)则是指借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 一、分类单元及其等级 分类单元(taxon,复数taxa)是指具体的分类群，如原核生物界(Procaryotae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)、枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)等都分别代表一个分类单元。 细菌的分类单元分为七个基本的分类等级(rank或category)或分类阶元，由上而下依次是：界、门、纲、目、科、属、种 在分类中，若这些分类单元的等级不足以反映某些分类单元之间的差异时也可以增加"亚等级"即：亚界、亚门……亚种，在细菌分类中，还可以在科(或亚科)和属之间增加族和亚族等级。 值得强调的是，分类单元的等级(阶元)只是分类单元水平的概括，它并不代表具体的分类单元。在细菌分类中，还使用一些非正式的类群术语。

(1)培养物(culture)，是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。 如果某一培养物是由单一微生物细胞繁殖产生的，就称之为该细菌的纯培养物(pure culture)。 （2）菌株(strain)，从自然界中分离得到的任何一种微生物的纯培养物或用实验方法(如通过诱变)所获得的某一菌株的变异型，（但为另一新菌种） 菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体。 菌株名称常用数字编号、字母、人名、地名等表示。如枯草杆ASI.398(Bacillus subtilis ASI.398)和枯草杆菌BF7658( Bacillus subtil is BF7 658)，分别代表枯草杆菌的两个菌株(ASI.398和BF7658分别为菌株的编号) （3）居群，每一个物种在自然界中的存在，都有一定的空间结构，在其分散的、不连续的居住场所或分布区域内，形成不同的群体单元 （4）型(form或type)，常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。 例如抗原特征的差异分为不同的血清型；对噬菌体裂解反应的不同分为不同的噬菌型等等。 （5）种(species)，是生物分类中基本的分类单元和分类等级。作为分类单元的等级，种的地位低于属而高于亚种这是十分明确的。微生物的

真菌分类表

真菌分类表 以前的分类学家将真菌和细菌都列为植物，称为菌类植物，但他们和植物相当不同，都是异养生物，现在的分类法倾向将它们独立在动物和植物之外，各自单独分为一个界。 ? 1 子囊菌门 Phylum （Ascomycota） 1.1 外囊菌亚门 subphylum（Taphrinomycotina） ? 1.1.1 粒毛盘菌纲（Neolectomycetes） ? 1.1.2 肺孢子菌纲 (Pneumocystidomycetes) ? 1.1.3 裂殖酵母纲 (Schizosaccharomycetes) ? 1.1.4 外囊菌纲 (Taphrinomycetes) 1.2 盘菌亚门 (Pezizomycotina) ? 1.2.1 星裂菌纲 (Arthoniomycetes) ? 1.2.2 刺盾炱纲 (Chaetothyriomycetes) ? 1.2.3 座囊菌纲 (Dothideomycetes) ? 1.2.4 散囊菌纲 (Eurotiomycetes) ? 1.2.5 虫囊菌纲 (Laboulbeniomycetes) ? 1.2.6 茶渍纲 (Lecanoromycetes) ? 1.2.6.1 微孢衣亚纲 (Acarosporomycetidae) ? 1.2.6.2 茶渍亚纲 (Lecanoromycetidae) ? 1.2.6.3 厚顶盘菌亚纲 (Ostropomycetidae) ? 1.2.7 锤舌菌纲 (Leotiomycetes) ? 1.2.8 李基那地衣纲 (Lichinomycetes) ? 1.2.9 圆盘菌纲 (Orbiliomycetes) ? 1.2.10 盘菌纲 (Pezizomycetes) ? 1.2.11 粪壳菌纲 (Sordariomycetes) ? 1.2.11.1 肉座菌亚纲 (Hypocreomycetidae) ? 1.2.11.2 粪壳菌亚纲 (Sordariomycetidae) ? 1.2.11.3 炭角菌亚纲 (Xylariomycetidae) 1.3 酵母菌亚门 (Saccharomycotina) ? 1.3.1 酵母纲 (Saccharomycetes) ? 2 担子菌门 (Basidiomycota) 2.1 异担子菌纲 (Heterobasidiomycetes) ? 2.1.1 异担子菌亚纲 (Heterobasidiomycetidae) ? 2.1.2 银耳亚纲 (Tremellomycetidae) 2.2 同担子菌纲 (Homobasidiomycetes) 2.3 锈菌纲 (Urediniomycetes) ? 2.3.1 亚纲 (Agaricostilbomycetidae) ? 2.3.2 微球黑粉菌亚纲 (Microbotryomycetidae) ? 2.3.3 锈菌亚纲 (Urediniomycetidae) 2.4 黑粉菌纲 (Ustilaginomycetes) ? 2.4.1 亚纲 (Entorrhizomycetidae) ? 2.4.2 外担子菌亚纲 (Exobasidiomycetidae) ? 2.4.3 黑粉菌亚纲 (Ustilaginomycetidae)