万方数据
万方数据
价函数相同时,本文行列双动态规划的方法相比于传统的动态规划方法,在一定程度f:降低错误匹配率,提高匹配效果。
圈3实验结果
裹1镑误匹配率的比较f%)算法
本文算法I.503.5067o452054.69
口咖+咖1.923.926800.842.435.67
SAD+doubledp3.5l5.4514.202.684.3l22.60朋D+咖38358614203995Il24(1()
●■_●■■=====一I-■●■■■■E4===目=______-■=======___-_●-_-E==口■};=_■_-___●t==-======■;j_____一
锋法——一—坚!尘————一一.竺塑竺一——.
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nonocfalfdisttlonoccalfdisc奉史算法96588019804.8l15209.97
adp+dp9.7Il8.8019905.3615.701I.50SAD+double咖96718.9022708.93189018.30SAD+dⅣII10202f)239010902【)61)2I40
4结束语
本义提出一种双动态规划的全局优化立体匹配算法,算法中代价函数采用具有良好视差不连续保持特性的自适应加权代价函数,同时引入一种全局能鼍函数数据项奖励策略,从而实现在行列2个方向上均迸行动态规划来求解市体匹配问题。实验结果表明,该算法能够取得较为理想的效果,与传统动态规划方法相比降低了错误匹配率。
参考文献
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编辑陈文
(上接第226页)
国回国囤预测蛋白质序转换蛋H质序列
列皿细胞定位、为伪缸基酸J≯列、
Grey?PseAAC向昔
预测J≯列亚细胞位置
J≯列亚细胞化置
7
序列哑细胞f{置
o—————-—-———-——?
圈I曩舅亚纲囊定位的黑序圈
另外,需要指出的是,在实验过程中,发现tomcat的Windowsservice版町能会找不剑ctf文件,从而不能装载类,所以建议使用Tomcat的其他版本。
5结束语
研究厄细胞定位目前已取得较大的进展,出现了如神经网络、支持向疑机等新算法。但如何表示蛋白质序列始终是一个重要的课题,目前大多采用离散型向晕来表示一个氨基酸序列。在这之中,本文提出的grey?PseAAC具有低维且较好地表达了序列内在信息等优点,基于此开发的亚细胞定位预测服务器极大地提高了预测精度。另外,本文的研究也为灰色理论应用于生物信息学进行了有益的探索。尽管灰色理论已应用于诸多领域,但鲜见应用在生物信息学。相信灰色理论对G蛋自藕联受体fGPCRs)类型预测、蛋白质四级结构预测、二级结构类型预测等课题也有较好应用前景,这些也将成为笔者的未来研究工作。
参考文献
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编辑顾逸斐 万方数据
基于GM(2,1)的亚细胞定位预测
作者:林卫中, 肖绚, LIN Wei-zhong, XIAO Xuan
作者单位:林卫中,LIN Wei-zhong(景德镇陶瓷学院信息工程学院,景德镇,333403), 肖绚,XIAO
Xuan(景德镇陶瓷学院机电系,景德镇,333403)
刊名:
计算机工程
英文刊名:COMPUTER ENGINEERING
年,卷(期):2009,35(8)
被引用次数:3次
参考文献(5条)
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2.Pan Yuxi;Zhang Zhizhou;Guo Zongming Application of Pseudo Amino Acid Composition for Predicting Protein Subcellular Location:Stochastic Signal Processing Approach[外文期刊] 2003(04)
3.Xiao Xuan;Shao Shihuang;Ding Yongsheng Using Cellular Automata Images and Pseudo Amino Acid Composition to Predict Protein Subcellular Location[外文期刊] 2006(01)
4.刘思峰;党耀国;方志耕色系统理论及其应用 2004
5.Wang Guoli;Roland L;Dunbrack J PISCES:A Protein Sequence Culling Server 2003(12)
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引证文献(3条)
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3.刘陶.简志宏.林卫中.肖绚灰色理论在古陶瓷断代中的应用[期刊论文]-计算机工程 2010(11)本文链接:https://www.wendangku.net/doc/f48739857.html,/Periodical_jsjgc200908076.aspx