ImageJ荧光共定位分析 教程

ImageJ 共定位分析的网址，插件需在官网下载保存至安装文件夹。

http://wwwfacilities.uhnresearch.ca/wcif/imagej/colour_analysis.htm#coloc_ica 一：共定位scatter plot图(需用Colocalisation Threshold插件)

1．使用PS将需要做共定位分析的单个细胞从共染图片中分离出来

2.使用Image J打开该图片：File--Open

3. 分离荧光通道：Image—Color—Spilt Channels

结果会分离出三个荧光通道(blue & green & red),示例图中只有两个荧光通道（red & green），所以blue通道直接删去。

4.作共定位分析：Plugins—Colocalisation Threshold

会出现下图的窗口，channel1和channel2选择好red和green通道，勾选show scatter plot,点击ok.

结果出现Results和scatter plot窗口，其中Rcolor为Pearson’s for image above thresholds.

二共定位的Plot Profile图

1.打开需分析的图片，分离荧光通道Split channels ，再合并荧光通道Merge

channels,点击ok.

出现Composite窗口，左上角有红色的c1/2字样即为红色通道,滚动滚轮有绿色的c2/2字样此时即为绿色通道。

2.使用直线工具画一条直线，Analyze—Plot Profile,出现下图

3.滚动滚轮，在Plot of Composite窗口中选中Live,即可切换到绿色通道的Plot

profile .

4.选中List可得到数据，Edit—copy可以将原始数据复制到origin中作图。

5.最后origin做出下图。