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DNAstar使用说明

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DNAstar使用说明书

Editseq序列编辑Seqman序列拼接MegAlign序列比对PrimerSeletSeqBulderGeneQuest

1.Editseq

(1)找到ORF(open reading frame,开放阅读框)——理论氨基酸编码区或者找到目标序列

Search find 加目标序列

(2)反向互补:“Goodies”“ReverseComplement”

2.Seqman

(1)“Add sequence”添加拼接序列,选中目标序列,“Add”、“的Done”导入目标序列

(2)如果导入为峰图文件,可双击文件名弹出峰图,用黑分隔线去除测序质量不好的区域(为黄色区域)

(3)修正后点击Assemble(拼接),若能拼接上,则在“conting”一栏显示(4)双击“conting”可看到完整序列,以及两个峰图的重叠区域,若两个峰图完全匹配,则拼接可靠

(5)点击菜单栏的“conting”“saveconsensus”“singleFile”保存拼接好的序列

Seqman去除载体

当插入到载体上的片段,在分析前需要先去除载体序列。

Trim sequence ends

Scam for vector “SetVector”,选前后载体(两栏都要选)“optionptimire sequence assembly order

Don,t add single sequence Congtigs

3.MegAlign

(1)“Flie”“New”再点击“File”“Entersequence”添加需对比的序列,“add”

“Done”

The Jotun Hein method

(2)点击“Align”有三种比对方式Clustal V

Clustal W

Onepair先选中将要比对的两序列,选中“Alimentcolor”“vartioalsare”选颜色

IE安全漏洞及防范措施

IE安全漏洞及防范措施 摘要 谈到联网的计算机,就能想到它百纳海川的资讯,可以在网络的世界里找到自己想了解到的,自己想探索到的新知识,但是要想了解到这些资讯我们需要借助到一个工具,这就是我们每一个人都熟悉的----IE浏览器。技术的进步,离不开知识的传播。时代的需求就是我们的责任,我们要抓住信息时代的脉搏,在Internet飞速发展的今天,互联网成为人们快速获取、发布和传递信息的重要渠道,从而倍受人们的重视。互联网上信息的查找又要通过浏览器的浏览来实现,所以希望通过对IE浏览器的安全漏洞和防范措施的探讨让大家对网络及网络资源搜索的认识以及浏览器的各个功能。 关键词:IE浏览器/漏洞/措施

IE Security vulnerabilities and preventive measures ABSTRACT The PC is popular and the brilliant Computer-Culture is developing rapidly by drived of the Financial globalization,Assimilation of information and the Industrial knowledge-ization.Studying computer knowledge is becoming a consciousness action for many back-hoping people in the Boundary of the century.There are many progresses in the information industry,the time of the network and so on.We can see that more person's work and life are never left by a computer.It isn't left the spread of knowledge by technological progress.The demanding of the time is our responsibility.In the days of the internet developing fastly,we should catch the pulse of it,make the internet become a basilic channel that make people getting,issuancing and passing the news at a rapid rate.And then made the internet receives people's emphasis increasingly.One looking for the information by the browser's browsing,so I hope everyone should increasing Browser vulnerabilities and preventive measures and all kinds of functions of the browser by my paper. Keyword: Internet Explorer /vulnerabilities/measure

Mrbayes中文使用说明

< >内为需要输入的内容,但不包括括号。所有命令都需要在MrBayes >的提示下才能输入。 文件格式: 文件输入,输入格式为Nexus file(ASCII,a simple text file,如图): 或者还有其他信息: interleave=yes 代表数据矩阵为交叉序列interleaved sequences nexus文件可由MacClade或者Mesquite生成。但Mrbayes并不支持the full Nexus standard。 同时,Mrbayes象其它许多系统软件一样允许模糊特点,如:如果一个特点有两个状态2、3,可以表示为:(23),(2,3),{23}或者{2,3}。但除了DNA{A, C, G, T, R, Y, M, K,S, W, H, B, V, D, N}、RNA{A, C, G, U, R, Y, M, K, S, W, H, B, V, D, N}、Protein {A, R, N, D, C, Q, E, G, H, I, L, K, M, F, P, S, T, W, Y, V, X}、二进制数据{0, 1}、标准数据(形态学数据){0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 5, 7, 8, 9}外,并不支持其他数据或者符号形式。 执行文件: execute 或缩写exe ,注意:文件必须在程序所在的文件夹(或者指明文件具体路径),文件名中不能含有空格,如果执行成功,执行窗口会自动输出文件的简单信息。 选定模型: 通常至少需要两个命令,lset和prset,lset用于定义模型的结构,prset用于定义模型参数的先验概率分布。在进行分析之前可以执行showmodel命令检查当前矩阵模型的设置。或者执行help lset检查默认设置(如图): 略 Nucmodel用于指定DNA模型的一般类型。我们通常选取标准的核苷酸替代模型nucleotide substitution model,即默认选项4by4。另外,Doublet选项用于paired stem regions of ribosomal DNA的分析,Codon选项用于DNA sequence in terms of its codons的分析。 替代模型的一般结构一般由Nst设置决定。默认状态下,所有的置换比率相同,对应于F81模型(JC model)。一般我们选用GTR模型,即nst=6。 Code设置只有在DNA模型设置为codon的情况下才使用。Ploidy设置也与我们无关。 Rates通常设置为invgamma (gamma-shaped rate variation with a proportion of invariable sites),Ngammacat(the number of discrete categories used to approximate the gamma distribution)一般采用默认选项4。通常这个设置已经足够,增加该选项设置的数量可能会增加似然计算的精确性,但所花时间也成比例增加,大多数情况下,由增加该数值对结果的影响可以忽略不计。 余下的选项中,只有Covarion和Parsmodel与单核苷酸模型相关,而我们既不会采用parsimony model,也不会采用the covariotide model,故保留默认状态。 在对矩阵作了以上修改后,重新输入help lset命令,可以查看变化后的设置。 设置先验参数prior: 现在可以为模型设置先验参数了。模型有6种类型的参数:the topology, the branch lengths, the four stationary frequencies of the nucleotides, the six different nucleotide substitution rates, the proportion of invariable sites, and

spyglass中文使用说明

望远镜用户指南

概览............................................... (5) 关于本指南 望远镜 概观 按钮 手势 最多显示头---(HUD)的 工具和手段 入门................................................ (17) 版本和功能 硬件和软件兼容性说明............................................. (17) 启用定位服务 设置最多望远镜 开始标记和跟踪对象............................................. . (22) ViewVinder ................................................. . (23) 设置颜色 设置最多的HUD 快速切换 HUD的操作模式 缩放 指南针................................................. (28) 校准

增强现实和三维罗盘............................................. .. (29) 寻找目标对象 设置最多罗盘 罗盘定位模式............................................... .. (32) 罗经................................................. .. (34) 开始使用罗经............................................... .. (34) 确定启动轴承............................................... .. (35) 漂移和调整 全球定位系统................................................. . (37) 设置最多的GPS 获取GPS数据 设置单位 查找................................................. .. (39) 概观 按钮 快速目标标记 添加目标 管理目标 寻找和跟踪 在地图上观测地点的目标............................................. .. (47) 跟踪................................................. .. (48) 设置跟踪

外研社版高二英语选修六单词表(带音标、词性、中文)

英文音标词性中文 small talk 闲谈,聊天 informal /in'f?:ml/ adj. 非正式的 serious /'s??r??s/ adj. 严肃的 confidently /'k?nfid?ntli/ adv. 自信地 make friends 交朋友,建立友谊 lack /l?k/ v. 缺乏,缺少 be nervous about对……神经紧张/害怕/胆怯/焦虑不安advance /?d'vɑ:ns/adj. 预先的,在前的 think of 想起,回忆起 nod /n?d/ v. 点头 body language 身体语言,肢体语言 yawn /j?:n/ v. 打呵欠 sigh /sa?/ v. 叹气,叹息 look away from 把目光从……移开 social rules 社交规则 in addition 除此之外,另外 find out 了解(到);找出(信息)opportunity /,?p?'tju:n?t?/ n. 机会 obligation /??bl?'ge??n/ n. 责任;义务 prize /pra?z/ n. 奖品,奖金 application /??pl?'ke??n/ n. 申请 form /f?:rm/ n. 表格 immigration /??m?'gre??n/ n. 移民 visa /'v?:z?/ n. 签证 impolite /??mp?'la?t/ adj. 不礼貌的 tidy /'ta?d?/ v. 使……整洁,整理 refund /r?:'f?nd/ n. 退款 favour /'feiv?/ n. 恩惠,照顾 reception /r?'sep?n/ n. 欢迎会;招待会 embassy /'emb?s?/ n. 使馆 certain /'s?:tn/ pron. 某些 reply /r?'pla?/ n. 回答,答复,回信 saleswoman /se?lz?w?m?n/ n. 女推销员,女销售员 firm /f?:m/ n. 公司 fax /f?ks/ n. 传真(机) outspoken /,aut'sp?uk?n/ adj. 直言不讳的,坦率的,不客气的human being 人类 motto /'m?t??/ n. 座右铭,格言 put one’s foot in 犯使人难堪的错误,说错话 one’s mouth shortcoming /??:t,k?mi?/n. 缺点,短处 absence /'?bs?ns/ n. 缺乏,不存在 as a consequence 因此,结果

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