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蛋白质工程复习题

蛋白质工程复习题
蛋白质工程复习题

蛋白质工程复习题

名词解释

结构域:生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域,特别指蛋白质中这样的区域

基因突变:基因组DNA分子发生的突然的、可遗传的变异现象

融合蛋白:将两个或多个开放阅读框按一定序列顺序连接,融合阅读框表达出一杂合蛋白。蛋白的表达模式:

蛋白质的分子设计:

构型:是一个分子中原子的特定空间排布。构型改变必须有共价键的断裂和重新形成。最基本的分子构型为L-型和D-型,这种异构体在化学上可以分离。

构象:组成分子的原子或基团绕单键旋转而形成的不同空间排布。构象改变,无共价键的断裂和重新形成,化学上难于区分和分离

α-氨基酸:

原核表达:是指通过基因克隆技术,将外源目的基因,通过构建表达载体并导入表达菌株的方法,使其在特定原核生物或细胞内表达

蛋白质的二级结构:在一段连续的肽单位中具有同一相对取向,可以用相同的构象角来表征,构成一种特征的多肽链线性组合。

结构域:二级结构和结构模体以特定的方式组合连接,在蛋白质分子中形成2个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体,称为结构域。

蛋白质的三级结构:结构域在三维空间中以专一的方式组合排布,或者二级结构、结构模体及其与之相关联的各种环肽链在空间中的进一步协同盘曲、折叠,形成包括主链、侧链在内的专一排布。

蛋白质分子的四级结构:指蛋白质分子的亚基结构(subunit),亚基的数目、类型、空间排布方式和亚基间相互作用的性质,构成四级结构的基本内容。

亚基:许多蛋白质作为完整的活性分子,是由两条以上的多肽链组成,它们各自以独特的一

级、二级、三级结构相互以非共价作用联结,共同构成完整的蛋白质分子,这些肽链单位称为亚基。其聚合整体称为寡聚体

蛋白质的分子设计:从蛋白质分子水平上通过数据库等大量实验数据,结合现代的理论方法通过计算机设计新的分子。

分子伴侣:一类在序列上没有相关性但有共同功能的蛋白质,它们在细胞内帮助其他含多肽的结构完成正确的组装,而且在组装完毕后与之分离,不构成这些蛋白质结构执行功能时的组份

启动子:由核苷酸组成,本身并不控制基因活动而是通过与转录因子的这种蛋白质结合而控制基因活动的

增强子:能强化转录起始的一段DNA序列为增强子或强化子

乳糖操纵子:是参与乳糖分解的一个基因群,由乳糖系统的阻遏物和操纵序列组成,使得一组与乳糖代谢相关的基因受到同步的调控。

双特异性抗体:是指能同时识别2种抗原的抗体。1种为对应肿瘤相关抗原。另1种为对应效应成分

蛋白质工程:以蛋白质分子的结构与功能的关系为基础,通过有控制的修饰和合成,对现有蛋白质加以定向改造,设计、构建并最终生产出性能比自然界存在的蛋白质更加优良、更加符合人类社会需要的新型蛋白质。

抗体酶:一类具有催化能力的免疫球蛋白。

简答题

一.简述蛋白质工程研究的基本途径。

1.1 蛋白质结构分析(研究核心)

1)收集大量的蛋白质分子结构的信息;2)建立结构与功能之间关系的数据;3)蛋白质结构与功能之间关系的理论研究。

主要技术:晶体学技术(x射线晶体结构分析)、多维核磁共振波谱技术

1.2 结构预测

对天然蛋白质结构与功能分析建立起来的数据库里的数据,可以预测一定氨基酸序列肽链空间结构和生物功能;根据特定的生物功能,设计蛋白质的氨基酸序列和空间结构。主要技术:分子动力学、分子热力学等,根据能量最低、同一位置不能同时存在两个原子等基本原则分析计算蛋白质分子的立体结构和生物功能。

1.3 创造和改造蛋白质

1)物理、化学法:对蛋白质进行变性、复性处理,修饰蛋白质侧链官能团,分割肽链,改变表面电荷分布促进蛋白质形成一定的立体构像等等

2)生物化学法:使用蛋白酶选择性地分割蛋白质,利用转糖苷酶、酯酶、酰酶等去除或连接不同化学基团,利用转酰胺酶使蛋白质发生胶连等等

3)基因重组技术或人工合成DNA:可以改造蛋白质而且可以实现从头合成全新的蛋白质。

二.欲使目的蛋白在大肠杆菌中表达,则表达载体的一般特点是什么?

1)复制起始点2)选择性基因3)强的、可诱导的启动子4)强的转录终止序列5)核糖体结合位点6)合适的多克隆位点

三.简述X射线晶体衍射技术测定蛋白质晶体结构的具体步骤。

培养大的、质量好的晶体;进行初步的x射线衍射分析;重原子衍生物的制备;衍射数据的测量和处理;相位的计算;电子密度图的计算和解释;分子模型的修正。

四.列举两种常见蛋白质晶体结构测定方法及讨论其优缺点。

晶体结构:X-射线

优点:能快速、精细、直观地表达出分子内各基团的相互空间关系

缺点:不是所有的生物大分子都能够获得良好的结晶;所得到的晶体往往是分子处于基态,而分子功能的行使多发生在激发态,很难捕捉到分子的功能状态

溶液结构:核磁共振(NMR)

优点:是对X-射线晶体衍射的补充,分辨率仅次于X-射线晶体技术,可以在溶液中操作,接近生理状态

缺点:蛋白质的分子量要比较小,一般在50KD以下,分子量越大所测到的谱线就越多,有时各谱线很难分辨。

五.简述蛋白质在生物体内的形成的过程

蛋白质在体内的形成分为两个阶段:

第一阶段:

在遗传密码指导下,将氨基酸按特定序列在核糖体上连接起来,形成只有一级结构(氨基酸序列)的多肽链,称为多肽链的生物合成。

第二阶段:

合成的多肽链,以现在尚不清楚的机制自动折叠成为特定的三维结构,形成具有完整结构和功能的蛋白质分子,称为新生肽链折叠(或蛋白质折叠)

六.蛋白质分子设计的步骤是什么?

1)建立所研究蛋白质的结构模型

2)找出对所要求的性质有重要影响位置

3)悬着一系列的在2)中所选出的位点上改变残基所得到的突变体,一方面使蛋白质可能具有所要求的性质,另一方面又尽量维持原有结构,使其不做大的变动

4)预测突变体的结构

5)定性或定量计算优化所得到的突变体结构是否具有所要求的性质。

七.简述目的蛋白原核表达的基本步骤。

(1)、制备表达载体:酶切, 去磷酸化;胶回收纯化

(2)、制备目的DNA:质粒纯化/PCR;酶切;胶回收纯化

(3)、将目的DNA 克隆到载体上:目的片断与载体连接、转化非表达型宿主菌、筛选阳性克隆: 菌落PCR, 质粒提取酶,测序确定阅读框

(4)、转化表达宿主菌:转化带有T7RNA 聚合酶基因的菌株

(5)、诱导优化表达目的蛋白:检测质粒稳定性、确定表达时间和温度的最佳条件、分析蛋白溶解性和活性、SDS-PAGE, Western 印迹等确定目的蛋白

(6)、纯化目的蛋白:放大培养、制备粗提物、亲和纯化、切除融合标签并去除蛋白酶八.蛋白质分子设计的步骤是什么?

1. 建立所研究蛋白质的结构模型;

2. 找出对所要求的性质有重要影响的位置;

3. 选择一系列的在(2)中所选出位点上改变残基所得到的突变体;

4. 预测突变体的结构;

5. 定性或定量计算优化所得到的突变体结构是否具有所要求的性质。

九.简述大肠杆菌中表达体系的优缺点?

大肠杆菌中表达体系的优点:

大肠杆菌表达体系是目前应用最广的一个外源基因表达体系,是外源基因表达的首选体系。利用大肠杆菌作为表达体系的优点:遗传学和生理学背景清楚;容易培养,特别是高密度发酵;外源基因经常可以达到高效表达。

大肠杆菌表达体系的缺点:

大肠杆菌系统最大的不足之处是不能进行典型真核细胞所具有的复杂的翻译后修饰,如糖基化、烷基化、磷酸化、特异性的蛋白水解加工等;而广泛二硫键的形成以及外源蛋白质组装成多亚基复合体的能力也受到限制。大肠杆菌体系的另一个不足之处是外源基因产物在大肠杆菌细胞内易形成不溶性的包涵体;而当真核基因在大肠杆菌中表达时,作为起始氨基酸,甲硫氨酸常依然保留在蛋白质的N末端。最后,由于真核mRNA的结构特性以及密码子使用频率与大肠杆菌本身的差异,当用真核mRNA的序列直接在大肠杆菌细胞中表达时,有时不能得到足够的产物。

酶工程复习资料

酶的定向进化:模拟自然进化过程(随机突变+自然选择),在体外对酶基因进行人工随机突变,建立突变基因库,在人工控制条件的特殊环境下,定向选择得到具有预先期望的具有某些特性的酶的突变体的技术过程。

酶反应器:用于完成酶促反应的核心装置。它为酶催化反应提供合适的场所和最佳的反应条件,以便在酶的催化下,使底物(原料)最大限度地转化成产物。它处于酶催化应过程的中心地位,是连接原料和产物的桥梁。

超临界流体:指温度和压力超过某物质超临界点的流体

盐析:在盐浓度达到一定界限时,酶的溶解度随盐的浓度升高而降低。

必需水:维持酶分子完整的空间构象所必需的最低水量称为必需水。

离子液体:由有机阳离子与有机阴离子构成的在室温条件下呈液态的低熔点盐类,挥发性低,稳定性好

酶的定义:酶是生物体内进行新陈代谢不可缺少的受多种因素调节控制的具有催化能力的生物催化剂。

离心分离:借助于离心机旋转所产生的离心力,使不同大小、不同密度的物质分离的技术过程。

酶的分类:氧化还原酶、转移酶、水解酶、裂合酶、异构酶、合成酶

提高酶产量的措施:添加诱导物(酶的作用底物、酶的催化反应产物、作用底物的类似物)、控制阻遏物的浓度(产物阻遏作用、分解代谢物阻遏作用)、添加表面活性剂、添加产酶促进剂

酶的生产方法:提取分离法、生物合成、化学合成

培养基的五大要素:碳源、氮源、无机盐、生长因子、水

酶生物合成的模式分为4种类型:同步合成型,延续合成型,中期合成型和滞后合成型酶生物合成模式:同步合成型,中期合成型,延续合成型,滞后合成型

离心机的分类及选择

低速离心机:主要用于细胞、细胞碎片和培养基残渣等固形物的分离。也用于酶的结晶等较大颗粒的分离。

高速离心机:用于沉淀、细胞碎片和细胞器等的分离。

超速离心机:用于DNA、RNA、蛋白质等生物大分子以及细胞器、病毒等的分离纯化;样品纯度的检测;沉降系数和相对分子质量的测定等。

易错PCR技术

原理:从酶的单一基因出发,在改变反应条件的情况下进行聚合酶链反应,使扩增得到的基因出现碱基配对错误,从而引起基因突变的技术过程。

优点:简便,随机突变丰富;缺点:正突变率低,突变基因文库大,筛选工作量大;适用于较小基因的定向进化

酶固定化

概念:采用各种方法,将酶固定在水不溶性的载体上,制备成固定化酶的过程称为酶的固定化。固定在载体上并在一定的空间范围内进行催化反应的酶称为固定化酶。

方法:吸附法、包埋法、交联法、热处理法

应用:运用于工业化生产、酶传感器、酶电极

问答题

一.如何提高酶的产量?

答:a、添加诱导物:对于诱导酶的发酵生产,在发酵过程中的某个适宜的时机,添加适宜的诱导物,可以显著提高酶的产量。

b、控制阻遏物的浓度:阻遏作用根据机理不同,可分为:产物阻遏和分解代谢物阻遏两种。

产物阻遏作用是由酶催化作用的产物或者代谢途径的末端产物引起的阻遏作用。分解代谢物阻遏作用是由分解代谢物(葡萄糖等和其它容易利用的碳源等物质经过分解代谢而产生的物质)引起的阻遏作用。

c、添加表面活性剂:表面活性剂可以与细胞膜相互作用,增加细胞的透过性,有利于胞外酶的分泌,从而提高酶的产量。

d、添加产酶促进剂:产酶促进剂是指可以促进产酶、但是作用机理未阐明清楚的物质。二.细胞破碎的方法及原理。

a、机械破碎法:捣碎法,研磨法,匀浆法。原理:通过机械运动产生的剪切力,使组织、细胞破碎;

b、物理破碎法:温度差破碎法,压力差破碎法,超声波破碎法。原理:通过各种物理因素的作用,使组织、细胞的外层结构破坏,而使细胞破碎;

c、化学破碎法:添加有机溶剂(甲苯、丙酮、丁醇、氯仿),添加表面活性剂。原理:通过各种化学试剂对细胞膜的作用,从而使细胞破碎;

d、酶促破碎法:自溶法,外加酶制剂法。原理:通过细胞本身的酶系或外加酶制剂的催化作用,使细胞外层结构受到破坏,而达到细胞破碎

三.酶分子修饰的意义、方法。

概念:通过各种方法使酶分子的结构发生某些改变,从而改变酶的某些特性和功能的技术过程称为酶分子修饰。

意义:①提高酶的活力;②增强酶的稳定性;③降低或消除酶的抗原性;④研究和了解酶

分子中主链、侧链、组成单位、金属离子和各种物理因素对酶分子空间构象的影响。

方法:①金属离子置换修饰:把酶分子中的金属离子换成另一种金属离子,使酶的特性和功能发生改变的修饰方法称为金属离子置换修饰。

②大分子结合修饰(共价/非共价):非共价修饰:使用一些能与酶非共价地相互作用而又能有效地保护酶的一些添加物,如聚乙二醇、右旋糖苷等,它们既能通过氢键固定在酶分子表面,也能通过氢键有效地与外部水相连,从而保护酶的活力。共价修饰:用可溶性大分子,如聚乙二醇、右旋糖苷、肝素等,通过共价键连接于酶分子的表面,形成一层覆盖层。

③侧链基团修饰:采用一定的方法(一般为化学法)使酶蛋白的侧链基团发生改变,从而改变酶分子的特性和功能的修饰方法。

④肽链有限水解修饰:酶蛋白主链修饰(肽链有限水解修饰),利用酶分子主链的切断和连接,使酶分子的化学结构及其空间结构发生某些改变,从而改变酶的特性和功能的方法。酶蛋白主链修饰主要是靠酶切/酶原激活法。

⑤氨基酸置换修饰:现在常用的氨基酸置换修饰的方法是定点突变技术。

⑥酶分子的物理修饰:通过物理修饰,可以了解不同物理条件下,特别是在极端条件下(高温、高压、高盐、极端pH值等)由于酶分子空间构象的改变而引起酶的特性和功能的变化情况。

四.酶的分离纯化有:离心分离,过滤分离,沉淀分离,层析分离,电泳分离,萃取分离,结晶分离等

五.酶的纯化过程:

(1) 粗蛋白质 (crude protein): 采样→均质打破细胞→抽出全蛋白,多使用盐析沉淀法;可以粗略去除蛋白质以外的物质。

(2) 部分纯化 (partially purified): 初步的纯化,使用各钟柱层析法。

(3) 均质酶 (homogeneous): 目标酶的进一步精制纯化,可用制备式电泳或 HPLC。

分离纯化路线:细胞破碎,提取,离心分离,过滤与膜分离,沉淀分离,层析分离,电泳分离,浓缩,干燥结晶。

六.离心分离,离心机的分类和选择。

离心分离是借助于离心机旋转所产生的离心力,使不同大小、不同密度的物质分离的技术过程。

离心机的分类:

a、常速离心机:又称为低速离心机, 其最大转速在8000 r/min以内,相对离心力(RCF)在1×104 g以下,在酶的分离纯化过程中,主要用于细胞、细胞碎片和培养基残渣等固形物的分离。也用于酶的结晶等较大颗粒的分离。

b、高速离心机:最大转速为(1~2.5)×104r/min ,相对离心力达到 1×104~1×105g ,在酶的分离中主要用于沉淀、细胞碎片和细胞器等的分离。为了防止高速离心过程中,温度升高而造成酶的变性失活,有些高速离心机装设有冷冻装置,谓之高速冷冻离心机。

c、超速离心机:最大转速达 (2.5~12)×104 r/min,相对离心力可以高达 5×105g甚至更高。超速离心主要用于DNA、RNA、蛋白质等生物大分子以及细胞器、病毒等的分离纯化;样品纯度的检测;沉降系数和相对分子质量的测定等。

七.酶非水相催化的类型。

酶在非水介质中进行的催化作用称为酶的非水相催化。

a、有机介质中的酶催化

有机介质中的酶催化是指酶在含有一定量水的有机溶剂中进行的催化反应。适用于底物、产物两者或其中之一为疏水性物质的酶催化作用。酶在有机介质中由于能够基本保持其完整的结构和活性中心的空间构象,所以能够发挥其催化功能。

b 、气相介质中的酶催化

酶在气相介质中进行的催化反应。适用于底物是气体或者能够转化为气体的物质的酶催化反应。由于气体介质的密度低,扩散容易,因此酶在气相中的催化作用与在水溶液中的催化作用有明显的不同特点。

c、超临界介质中的酶催化

酶在超临界流体中进行的催化反应。超临界流体是指温度和压力超过某物质超临界点的流体。

d、离子液介质中的酶催化

酶在离子液中进行的催化作用。离子液(ionic liquids)是由有机阳离子与有机(无机)阴离子构成的在室温条件下呈液态的低熔点盐类,挥发性低、稳定性好。酶在离子液中的催化作用具有良好的稳定性和区域选择性、立体选择性、键选择性等显著特点。

八.简述细胞破碎的方法及其原理。

分类细胞破碎方法细胞破碎原理

机械破碎法捣碎法、研磨法、匀浆法通过机械运动产生的剪切力,使组织、

细胞破碎。

物理破碎法温度差破碎法、压力差破碎法、

超声波破碎法通过各种物理因素的作用,使组织、细胞的外层结构破坏,而使细胞破碎。

化学破碎法添加有机溶剂、添加表面活性剂通过各种化学试剂对细胞膜的作用,而

使细胞破碎。

酶促破碎法自溶法、外加酶制剂法通过细胞本身的酶系或外加酶制剂的

催化作用,使细胞外层结构受到破坏,

而达到细胞破碎。

九.固定化酶与游离酶相比,有哪些优缺点?

优点:(1)易将固定化酶和底物,产物分开产物溶液中没有酶的残留简化了提纯工艺(2)可以在较长的时间内连续使用(3)反应过程可以严格控制,有利于工艺自动化(4)提高了酶的稳定性(5)较能适于多酶反应(6)酶的使用效率高、产率高、成本低

缺点:(1)固定化时酶的活力有损失(2)比较适应于水溶性底物(3)与完整的细胞相比,不适于多酶反应。

十.阐述酶工程的应用并分别举例说明。

酶工程主要应用在以下几个领域:

1、发酵工艺:生产葡萄糖、生产氨基酸、生产核苷酸、生产生物柴油、生产抗生素、生产有机酸、甾体激素等;

2、医药领域:①疾病诊断方面应用:根据体液内酶活力的变化诊断疾病、用酶测定体液中某种物质的量诊断疾病等;②疾病治疗方面的应用:生产蛋白酶、溶解酶、超氧化物歧化酶等;③药物制造方面的应用:生产青霉素酰化酶、β酪氨酸酶、核苷磷酸化酶等;

3、分析检测:酶试纸、酶柱和酶管、酶传感器等的应用都有重大贡献;

4、基础理论研究:阐明酶反应机制、生物工程中去除细胞壁等方面的应用;

5、环境保护领域:环境监测、三废处理、生物脱墨等;

6、其他方面:洗涤剂工业、酿酒工业、乳制品工业、饼干、纺织工业、化妆品等工业中都有应用。

十一.写出四种分离纯化酶蛋白的方法,并简述其原理。

1凝胶过滤:

凝胶过滤层析也称分子筛层析、排阻层析。是利用具有网状结构的凝胶的分子筛作用,根据被分离物质的分子大小不同来进行分离。层析柱中的填料是某些惰性的多孔网状结构物质,多是交联的聚糖(如葡聚糖或琼脂糖)类物质,小分子物质能进入其内部,流下时路程较长,而大分子物质却被排除在外部,下来的路程短,当一混合溶液通过凝胶过滤层析柱时,溶液中的物质就按不同分子量筛分开了。

2等电点沉淀:在等电点时,蛋白质分子以两性离子形式存在,其分子净电荷为零(即正负电荷相等),此时蛋白质分子颗粒在溶液中因没有相同电荷的相互排斥,分子相互之间的作用力减弱,其颗粒极易碰撞、凝聚而产生沉淀,所以蛋白质在等电点时,其溶解度最小,最易形成沉淀物。等电点时的许多物理性质如黏度、膨胀性、渗透压等都变小,从而有利于悬浮液的过滤。

3吸附层析:利用固定相吸附中对物质分子吸附能力的差异实现对混合物的分离,吸附色谱的色谱过程是流动相分子与物质分子竞争固定相吸附中心的过程。

4盐析沉淀法:利用不同蛋白质在不同的盐浓度条件下溶解度不同的特性,通过在酶液中添加一定浓度的中性盐,使酶或杂质从溶液中析出沉淀,从而使酶与杂质分离。

5离心分离:是借助于离心机旋转所产生的离心力,使不同大小、不同密度的物质分离的技术过程。

6过滤:是借助于过滤介质将不同大小、不同形状的物质分离的技术过程。

生物化学第一章蛋白质习题含答案

蛋白质习题 一、是非题 1.所有蛋白质分子中N元素的含量都是16%。 2.蛋白质是由20种L-型氨基酸组成,因此所有蛋白质的分子量都一样。 3.蛋白质构象的改变是由于分子内共价键的断裂所致。 4.氨基酸是生物体内唯一含有氮元素的物质。 5.组成蛋白质的20种氨基酸分子中都含有不对称的α-碳原子。 6.用凝胶电泳技术分离蛋白质是根据各种蛋白质的分子大小和电荷不同。 7.蛋白质分子的亚基就是蛋白质的结构域。 8.在酸性条件下茚三酮与20种氨基酸部能生成紫色物质。 9.蛋白质变性是其构象发生变化的结果。 10.脯氨酸不能维持α-螺旋,凡有脯氨酸的部位肽链都发生弯转。 11.蛋日质的空间结构在很大程度上是由该蛋白质的一级结构决定的。 12.胶原蛋白在水中煮沸转变为明胶,是各种氨基酸的水溶液。 13.蛋白质和酶原的激活过程说明蛋白顺的一级结构变化与蛋白质的功能无关。 14.利用盐浓度的不同可以提高或降低蛋白质的溶解度。 15.血红蛋白比肌红蛋白携氧能力高.这是因为它有多个亚基。

二、填空题 1.20种氨基酸中是亚氨基酸.它可改变α-螺旋方向。 2.20种氨基酸中除外都有旋光性。 3.20种氨基酸中和分子量比较小而且不含硫,在折叠的多肽链中能形成氢键。 4.20种氨基酸中的一个环氮上的孤对电子,像甲硫氨酸一样,使之在血红蛋白分子中与铁离子结合成为配位体。 5.球蛋白分子外部主要是基团.分子内部主要是基团。 6.1953年英国科学家桑耳等人首次完成牛胰岛素的测定,证明牛胰岛素由条肽链共个氨基酸组成。 7.测定蛋白质浓度的方法有、、 8.氨基酸混合物纸层析图谱最常用的显色方法是 9.用紫外光吸收法测定蛋白质含量的依据是所有的蛋白质分子中都含有、、和三种氨 基酸。 10.1965年中国科学家完成了由53个氨基酸残基组成的的人工合成。 11.目前已知的蛋白质二级结构有、、、和几种基本形式。

蛋白质工程试题

1.蛋白质分子的构型与构象 构型:是分子中原子的特定空间排布。当构型相互转变时,必须有共价键的断裂和重新形成。基本构型有L-型和D型两种。这种构型无法通过单键的旋转相互转换。 构象:是组成分子的原子或基团围绕单键旋转而成的不同空间排布,构象的转换不要求有共价键的断裂和重新形成,在化学上难以区分和分离。 2.内核假设原理所谓内核是指蛋白质在大自然的进化中形成的保守内部区域。这样的区域一般由氢键连接而成的二级结构单元组成。内核假设原理就是所有蛋白质的折叠形式主要决定于其内核中残基的相互作用和组织形式。遵循这样的内核原理意味着蛋白质工程无法创造出超越天然蛋白质所具有二级结构的新蛋白质二级结构。 3. van't Hoff焓平衡常数与焓/熵的关系式为:-RT lnK = △H - T△S。取对数可以变为: lnK = -△H/RT + △S/R。进一步推导可以变为:d(lnK)/d(1/T)= -△H/R。基于此,以lnK对1/T可以得到一条曲线。在这条曲线上任何一点的斜率就是△H/R,其中的△H称为van't Hoff焓。通过解析van't Hoff焓随温度变化的曲线特点,可以用于测定蛋白质体系构象平衡的转变,主要是两态转变模型的分析。也就是通过这样的曲线分析,可以预测蛋白质天然构象退在折叠时的容易程度。 4. 盒式突变法也称为片断取代法(DNA fragment replacement)。这一方法的要点是利用目标基因中具有的适当的限制性酶切位点,用具有任何长度、任何序列的DNA片断来置换或者取代目标基因上的一段DNA序列。 5、熔球态在折叠途径中第一个可以观测到的中间体是柔性无序的为折叠多肽链卷折成局部有组织的球状体,称为熔球体melton globule。熔球体具有天然态的大多数二级结构,但不如天然结构致密,蛋白质内部的密堆积相互作用尚未形成,环肽区和表面结构多数处于未折叠状态,侧链可以活动。非折叠态卷折成熔球体包含了蛋白质折叠的主要奥秘—疏水侧链的包埋。 6. 反向折叠设计在蛋白质工程中,全新蛋白质设计是以弥补天然蛋白质结构和功能在应用方面的不足为目的,根据人类所希望的结构和功能,采取工程手段,来人工设计新的氨基酸序列,这样的设计研究称为反向折叠研究。在全新蛋白质设计的反向折叠研究中,需要采取的基本策略是通过设计新的氨基酸序列,来加强或者减弱蛋白质的某些相互作用力,使设计的序列能最终具有所希望的结构和功能。 7. 功能基团的特异性修饰 蛋白质中,不仅末端氨基酸具有氨基和羧基,很多链中氨基酸侧链也具有羟基、巯基、氨基和羧基等能进行特征性化学反应的功能基团。利用这些功能基团的化学反应性可以进行蛋白质功能基团的特异性修饰。 8. 基因突变技术 在基因水平上设计并使某特定基因发生变异,对该基因所编码的蛋白质进行改造,在突变基因表达后、用来研究蛋白质结构功能的一种方法。 9. 融合蛋白质 重组DNA技术允许在体外产生不同基因和基因片段之间的融合,并且通过基因融合产生的蛋白质叫做融合蛋白质。

生物信息学试题整理

UTR的含义是(B ) A.编码区 B. 非编码区 C. motif的含义是(D )。 A.基序 B. 跨叠克隆群 C. algorithm 的含义是(B )。 A.登录号 B. 算法 C. RGR^ (D )。 A.在线人类孟德尔遗传数据 D.水稻基因组计划 下列Fasta格式正确的是(B) 低复杂度区域 D. 幵放阅读框 碱基对 D. 结构域 比对 D. 类推 B. 国家核酸数据库 C. 人类基因组计划 A. seql: agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta B. >seq1 agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta C. seq1:agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta D. >seq1agcggatccagacgctgcgtttgctggctttgatgaaaactctaactaaacactccctta 如果我们试图做蛋白质亚细胞定位分析,应使用(D) A. NDB 数据库 B. PDB 数据库 C. GenBank 数据库 D. SWISS-PROT 数

据库 Bioinformatics 的含义是(A )。 A. 生物信息学 B. 基因组学 C. 蛋白质组学 D. 表观遗传学 Gen Bank中分类码PLN表示是(D )。 A.哺乳类序列 B. 细菌序列 C.噬菌体序列 D. 植物、真菌和藻类序列 ortholog 的含义是(A)0 A.直系同源 B.旁系同源 C.直接进化 D.间接进化 从cDNA文库中获得的短序列是(D )o A. STS B. UTR C. CDS D. EST con tig的含义是(B )o A.基序 B. 跨叠克隆群 C. 碱基对 D. 结构域 TAIR (AtDB)数据库是(C)o A.线虫基因组 B. 果蝇基因组 C. 拟南芥数据库 D. 大肠杆菌基因组ORF的含义是(D )o A.调控区 B. 非编码区 C.低复杂度区域 D. 幵放阅读框

蛋白质习题及答案

一、名词解释(每词5分) 1、必须氨基酸 2、等电点 3、蛋白质的变性 4、胶凝 5、持水力 二、填空题(每空5分) 1.蛋白质分子中氨基酸之间是通过连接的。 2.在pH大于氨基酸的等电点时,该氨基酸净带电荷。 3.在pH小于氨基酸的等电点时,该氨基酸净带电荷。 4.在pH等于氨基酸的等电点时,该氨基酸。 5.蛋白质的功能性质主要有、、 和。 6.蛋白质溶解度主要取决于、和。 7.蛋白质的变性只涉及到结构的改变,而不变。 三、选择题(每题2分) 1.下列氨基酸中不属于必需氨基酸是( )。 A.蛋氨酸 B.半胱氨酸 C.缬氨酸 D.苯丙氨酸 E.苏氨酸 2.维持蛋白质二级结构的化学键为( )。 A.肽键 B.二硫键 C.氢键 D.疏水键 E.碱基堆积力 3. 蛋白质变性后( )。 A.溶解度下降 B.粘度下降 C.失去结晶能力 D.消化率提高 E.分子量减小 4、蛋白质与风味物结合的相互作用可以是()。 A、范徳华力 B、氢键 C、静电相互作用 D、疏水相互作用 5、作为有效的起泡剂,PRO必须满足的基本条件为() A、能快速地吸附在汽-水界面B、易于在界面上展开和重排 C、通过分子间相互作用力形成粘合性膜 D、能与低分子量的表面活性剂共同作用 四、判断题(每题2分) 1.蛋白质的水合性好,则其溶解性也好。() 2.通常蛋白质的起泡能力好,则稳定泡沫的能力也好。() 3.溶解度越大,蛋白质的乳化性能也越好,溶解度非常低的蛋白质,乳化性能差。 () 4.盐溶降低风味结合,而盐析类型的盐提高风味结合。() 5.氨基酸侧链的疏水值越大,该氨基酸的疏水性越大。() 五、简答题(每题5分) 1.影响蛋白质发泡及泡沫稳定性的因素 2.对食品进行热加工的目的是什么热加工会对蛋白质有何不利影响 六、论述题(10分) 影响蛋白质变性的因素有哪些

蛋白质组学试题整理 - 副本

蛋白质组学相关试题及答案 1…Proteome(蛋白质组):由一个细胞或者组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质,称为蛋白质组。 Proteomics(蛋白质组学):指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴学科,即研究细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同,对相关蛋白质进行分类和鉴定。更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能. 2…. Mass Spectrometer(质谱仪):质谱仪是一个用来测量单个分子质量的仪器,但实际上质谱仪提供的是分子的质量与电荷比(m/z or m/e)。分离和检测不同同位素的仪器。即根据带电粒子在电磁场中能够偏转的原理,按物质原子、分子或分子碎片的质量差异进行分离和检测物质组成的一类仪器。质谱仪最重要的应用是分离同位素并测定它们的原子质量及相对丰度。 3. Proteome sample holographic preparation(蛋白组样品的全息制备):(1)keep protein information(2)adapted to separation and identification methods(3)different samples,different extraction.蛋白质样品制备是蛋白质组研究的第一步,也是最关键的一步。因为这一步会影响蛋白质产量、生物学活性、结构完整性。因此要用最小的力量使细胞达到最大破坏程度同时保持蛋白质的完整性。 原则是,保持蛋白质的所有信息;选择合适的分离和鉴定方法;对于不同的样品要用不同的提取方法。 4.Post translational modification(蛋白质翻译后修饰) 肽链合成的结束,并不一定意味着具有正常生理功能的蛋白质分子已经生成。已知很多蛋白质在肽链合成后还需经过一定的加工(processing)或修饰,由几条肽链构成的蛋白质和带有辅基的蛋白质,其各个亚单位必须互相聚合才能成为完整的蛋白质分子。 5.De novo sequencing(从头测序) unknow peptide从头测序为蛋白质组研究提供了一种不用借助于任何蛋白质序列数据库信息,直接解读串联质谱数据的方法。其基本算法主要由4个部分组成:质谱图的构建、离子类型的确定、测序算法以及打分算法。

蛋白质考题及答案解析

蛋白质结构与功能试题 一、问答题: 1.影响蛋白质二级结构改变的因素有哪些? 参考答案: 温度;pH;邻近氨基酸残基的二级结构倾向;肽链中远程肽段的影响;肽段是处于分子表面还是被包埋在分子内部 2.如下图所示。多聚谷氨酸poly (Glu) 是由多个L-Glu聚合形成的多肽链,在pH为3的溶液中能 形成a-螺旋构象,当pH升高到7时,则由a-螺旋变为无规卷曲,旋光率陡然下降。同样,多聚赖氨酸poly (Lys) 在pH为10的溶液中具有a-螺旋结构,当pH降低至7时,旋光率也发生陡然下降,由a-螺旋结构变为无规卷曲。请解释pH对poly (Glu) 和poly (Lys) 构象变化的影响。 答案要点:pH=3接近Glu g-COOH的p K R (4.07),侧链基团为质子化不带电荷状态,可形成a-螺旋结构。其余情况按此思路分析。Lys e-NH2 p K R 为10.54。 3.胶原蛋白的结构特点(原胶原分子的一级结构和高级结构) 1)在体内,胶原蛋白以胶原纤维的形式存在,胶原纤维的基本结构单位是原胶原分子 2)每个原胶原分子由三条左手螺旋的a链(a-肽链)组成右手超螺旋结构,每条a链约含 1000个氨基酸残基 3)a链间靠H-键和范得华力维系,胶原纤维可以通过分子内和分子间的进一步交联增强稳定 性 4)a链一级结构序列96%遵守(Gly-X-Y)n。x多为脯氨酸Pro;y多为羟基脯氨酸Hyp或羟基 赖氨酸Hly 5)胶原蛋白是糖蛋白,少量糖与5-羟赖氨酸(Hyl)残基的碳羟基共价连接 6)具有较好的弹性和抗张强度 4.形成结构域的意义是什么? 参考答案: 1)各结构域分别折叠,其动力学上更有利 2)结构域自身紧密装配,结构域之间的柔性连接使每个结构域间可以作较大幅度的相对运 动 3)多个结构域形成的间隙部位往往是蛋白质的功能部位,结构域的相互作用有利于蛋白质

蛋白质组学常见问题

HPLC 篇 1 . HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法 样品量不足:解决办法为增加样品量 样品未从柱子中流出:可根据样品的化学性质改变流动相或柱子 样品与检测器不匹配:根据样品化学性质调整波长或改换检测器 检测器衰减太多:调整衰减即可。 检测器时间常数太大:解决办法为降低时间参数 检测器池窗污染:解决办法为清洗池窗。 检测池中有气泡:解决办法为排气。 记录仪测压范围不当:调整电压范围即可。 流动相流量不合适:调整流速即可。 检测器与记录仪超出校正曲线:解决办法为检查记录仪与检测器,重作校正曲线。 2 .做 HPLC 分析时,柱压不稳定,原因何在? 如何解决? 原因可能有: ? 泵内有空气,解决的办法是清除泵内空气,对溶剂进行脱气处理; 比例阀失效,更换比例阀即可。 泵密封垫损坏,更换密封垫即可。 溶剂中的气泡,解决的办法是对溶剂脱气,必要时改变脱气方法; 系统检漏,找出漏点,密封即可。 梯度洗脱,这时压力波动是正常的。 3 .我购买的 HPLC 柱验收测试时柱压过高,请问为什么? 柱压过高是 HPLC 柱用户最常碰到的问题。其原因有多方面,而且常常并不是柱子本身的问题,您可按下面步骤检查问题的起因。

拆去保护柱,看柱压是否还高,否则是保护柱的问题,若柱压仍高,再检查; 把色谱柱从仪器上取下,看压力是否下降,否则是管路堵塞,需清洗,若压力下降,再检查。 将柱子的进出口反过来接在仪器上,用 10 倍柱体积的流动相冲洗柱子, ( 此时不要连接检测器,以防固体颗粒进入流动性 ) 。这时,如果柱压仍不下降,再检查; 更换柱子入口筛板,若柱压下降,说明你的溶剂或样品含有颗粒杂质,正是这些杂质将筛 板堵塞引起压力上升。若柱压还高,请与厂商联系。一般情况下,在进样器与保护柱之间 接一个在线过滤器便可避免柱压过高的问题, SGE 提供的Rheodyne 7315 型过滤器就是解 决这一问题的最佳选择。 4 .液相色谱中峰出现拖尾或出现双峰的原因是什么? 筛板堵塞或柱失效,解决办法是反向冲洗柱子,替换筛板或更换柱子。 存在干扰峰,解决办法为使用较长柱子,改换流动相或更换选择性好的柱子。 双向电泳篇 1. 重泡胀后的胶可以不用转移到另一个电泳槽,直接跑 2D 的一向吗? 一般情况下是可以的。但当上样量特别大时,可能会有一部分蛋白质没有被胶条吸收,这 样跑完 1D 和 2D 胶后,会有很多横向条纹。所以在这种情况下,最好在重泡胀后,将胶条 转移到另外一个电泳漕中进行电泳。 2. 为什么我在等电聚焦前加的矿物油在聚焦后会减少,暴露出了胶条的背面? 这是因为BioRad的电泳槽有个盖子。为了固定电泳槽中的胶条,这个盖子上设计了对应 的突起,以便压住胶条。由于虹吸作用,这个突起会导引矿物油到相邻的空电泳槽,从而 降低有胶条的电泳槽中的矿物油液面。如果由此把胶条暴露在空气中,那对等电聚焦的影 响将是毁灭性的。为了防止这个现象的发生,可以在相邻的空电泳槽里,也加入适量 ( 80 %满)的矿物油。 3. 跑第一向时,为什么要设定一个电流的最大值电压(50 μ A/ 胶)? 电流的平方和功率成正比。电流增大,功率增大,放出的热量也随之增大,就会导致胶条 的温度增加。当温度超过30 摄氏度时,缓冲液里的尿素就容易解离,产生一些极性分子,从而对等电聚焦产生影响。

高中生物:蛋白质练习题

高中生物:蛋白质练习题 一.选择题 1.某氨基酸分子中含有两个氨基(-NH 2 ),其中一个氨基和羧基连在同一个碳原子上,则另一个氨基的部位应是() A.和羧基连在同一个碳原子上 B.一定连在羧基上 C.在R基上 D.与氨基相连 2.同为组成生物体蛋白质的氨基酸,酪氨酸几乎不溶于水,而精氨酸易溶于水,造成这种差异的原因是() A.两者R基的组成不同 B.两者的结构完全不同 C.酪氨酸含氨基多 D.精氨酸含羧基多 3.下面关于氨基酸的说法中,正确的是() A.氨基酸是蛋白质的组成单位,是由氨基和羧基组成的 B.每个氨基酸分子都只含有一个氨基和一个羧基 C.氨基酸的种类大约有20种 D.构成蛋白质的氨基酸分子至少含有一个氨基和一个羧基,并连在同一个碳原子上 4.组成蛋白质的氨基酸之间的肽键结构式是() A .NH—CO B.—NH—CO— C.—NH 2—COOH— D.NH 2 —COOH 5. 两个氨基酸缩合成二肽产生一个水分子,这个水分子中的氢来自() A.氨基 B.R基 C.氨基和羧基 D.羧基 6. 谷氨酸的R基为-C 3H 5 O 2 ,在一个谷氨酸分子中,含有碳和氧的原子数分别是 () A.4,4 B.5,4 C.4,5 D.5,5 7.若含有4条多肽链的某蛋白质分子由n个氨基酸构成,那么,它具有的肽键个数和氨基的最少个数分别是()

A.n和n B.n-4和4 C.n和n-4 D.n-4和n-4 8.一条由10个氨基酸分子经脱水缩合而成的肽链中含有—NH 和—COOH的最小 2 数目是() A.11和11 B.10和10 C.9和9 D.1和1 9.现有氨基酸800个,其中氨基总数为810个,羧基总数为808个,则由这些氨 基酸合成的含有2条肽链的蛋白质共有肽键、氨基和羧基的数目依次为() A.798、2和2 B.798、12和10 C.799、1和1 D.799、11和9 10.现有1000个氨基酸,共有氨基1020个,羧基1050个,由它们合成的4条肽 链中,肽建、氨基和羧基的数目分别是() A、999、1016、1046 B、999、1、1 C、996、24、54 D、996、1016、 1046 11.某二十二肽被水解成1个四肽、2个三肽和2个六肽,则这些短肽的氨基总数的最小值及肽键总数依次是() A、6、18 B、5、18 C、5、17 D、6、17 12.胰岛素是一种蛋白质分子,它含有两条多肽链,其中A链含21个氨基酸,B链含 30个氨基酸,即共有51个氨基酸,那么胰岛素分子中含有的肽键数目是() A.51个B.50个 C.49个D.1个 13. 已知20种氨基酸的平均分子量是128,现有一蛋白质分子由两条多肽链组成,共有肽键98个,此蛋白质的分子量接近() A.12 800 B.12 544 C.11 036 D.12 288 14.某蛋白质分子含a条肽链,共有b个氨基酸残基,如果氨基酸的平均相对分子质量是c,则该蛋白质的相对分子质量以及水解时需要的水的相对分子质量

蛋白质工程的崛起学案答案

1.4 蛋白质工程的崛起 班级:____________ 姓名:_____________ 小组:_____________ 评价:____________ 【考纲要求】 1.举例说出蛋白质工程崛起的理由。 2.简述蛋白质工程的原理。(重难点) 3.尝试运用逆向思维分析和解决问题。 第一步:了解感知 阅读教材P26-28相关内容,将你认为重要的部分勾画出来,并完成下面内容: (一)蛋白质工程崛起的缘由 1.基因工程及不足 (1)实质:将一种生物的________转移到另一种生物体内,后者可以产生它本不能产生的_________, 进而表现出____________。 (2)不足:在原则上只能生产自然界已存在的________。 2.天然蛋白质的不足 天然蛋白质的___________符合____________生存的需要,却不一定完全符合人类生产和生活的需要。(二)蛋白质工程的基本原理 1.概念:蛋白质工程是指以___________________________为基础,通过_______________________或__________________,对现有蛋白质__________或_____________________,以满足人类生产和生活的需要。 (1)基础:蛋白质分子的____________及其与____________的关系。 (2)手段:通过____________或____________,对现有蛋白质进行__________或制造一种新的蛋白质。 因为基因决定蛋白质,所以必须从基因入手。 (3)目的:获得满足人类生产和生活需求的_______________。2.原理:________________________。 3.流程: 天然蛋白质合成的过程是按照进行的;基因→表达( 和)→形成→形成→行使生物功能;而蛋白质工程与之相反,它的基本途径是:从预期蛋白质功能出发→设计预期的____________→推测应有的________序列→找到相对应的__________序列(基因)。 4、蛋白质工程的成果 (1)延长干扰素体外保存时间 问题:干扰素在体外保存相当困难 措施:可将干扰素分子上的一个半胱氨酸变成丝氨酸,使其长时间保存。 (2)提高玉米中赖氨酸的含量 问题:玉米中含量较低,原因是当赖氨酸浓度达到一定量时,就会抑制赖氨酸合成过程中两个关键酶----天冬氨酸激酶和二氢吡啶二羧酸合成酶的活性。 措施:将玉米中天冬氨酸激酶的第352位的苏氨酸变成异亮氨酸,将二氢吡啶二羧酸合成酶只中第104位的天冬酰胺变成异亮氨酸,就可提高玉米中游离赖氨酸的含量。 (3)还有许多工业用酶也是在改变天然酶的特性后,才使之适应生产和使用需要的。 (三)蛋白质工程的进展和前景 蛋白质工程是在__________的基础上,延伸出来的第______代基因工程,是包含多学科的综合科技工程领域. 1.前景诱人:如用此技术制成的电子元件,具有______、______和效率高的特点;通过对胰岛素的改造,使其成为速效型药品。 2.难度很大:蛋白质工程是一项难度很大的工程,目前成功的例子不多,主要是因为蛋白质发挥功能必须依赖于,这种十分复杂.

蛋白质习题(有答案和解析)

第二节生命活动的主要承担者——蛋白质 (满分100分,90分钟) 一.单项选择题(每小题2分,共64分) 1.已知苯丙氨酸的分子式是C9H11NO2,那么该氨基酸的R基是( ) A.—C7H7O B.—C7H7 C.—C7H7N D.—C7H5NO 2.同为组成生物体蛋白质的氨基酸,酪氨酸几乎不溶于水,而精氨酸易溶于水,这种差异的产生,取决于( ) A.两者R基团组成的不同 B.两者的结构完全不同C.酪氨酸的氨基多 D.精氨酸的羧基多 3.三鹿奶粉的三聚氰胺事件后,2010年在甘肃、青海、吉林竟然再现三聚氰胺超标奶粉。三聚氰胺的化学式:C3H6N6,其结构如右图,俗称密胺、蛋白精,正是因为它含有氮元素,才让唯利是图的人拿它来冒充蛋白质。下列有关它的说法,不正确的是( ) A.组成细胞的有机物中含量最多的是蛋白质 B.高温使蛋白质变性,肽键断裂,变性后的蛋白质易消化 C.核糖体合成蛋白质的方式都为脱水缩合 D.蛋白质能与双缩脲试剂发生紫色反应,而三聚氰胺不能 4下面是三种组成蛋白质的氨基酸的结构式,据图分析下列叙述不正确的是 ( )

A.以上这三种氨基酸的R基依次是—H、—CH3、—CH2OH B.将这三种氨基酸(足量)置于适宜条件下,经脱水缩合可形成三肽化合物最多有27种 C.甲是最简单的氨基酸 D.从上式可看出,只要含有一个氨基和一个羧基的化合物就是组成蛋白质的氨基酸 5.甘氨酸( C2H5O2N)和X氨基酸反应生成二肽的分子式为C7H12O5N2,则X氨基酸是( ) 6.下图是有关蛋白质分子的简要概念图,对图示分析正确的是( ) A.a肯定含有P元素 B.①过程有水生成 C.多肽中b的数目等于c的数目 D.d表示氨基酸种类的多样性 7.下列依次为丙氨酸、丝氨酸和天门冬氨酸的结构式:

基因工程测试题经典

xxxXXXXX 学校XXXX 年学年度第二学期第二次月考 XXX 年级xx 班级 姓名:_______________班级:_______________考号:_______________ 一、选择题 (每空? 分,共? 分) 1、下列有关基因工程和蛋白质工程的叙述,正确的是 A .蛋白质工程的流程和天然蛋白质合成的过程是相同的 B .基因工程合成的是天然存在的蛋白质,蛋白质工程合成的可以不是天然存在的蛋白质 C .基因工程是分子水平操作,蛋白质工程是细胞水平(或性状水平)操作 D .基因工程完全不同于蛋白质工程 2、PCR 是一种体外迅速扩增DNA 片段的技术,下列有关PCR 过程的叙述,不正确的是 A .变性过程中破坏的是DNA 分子内碱基对之间的氢键 B .复性过程中引物与DNA 模板链的结合是依靠碱基互补配对原则完成 C .延伸过程中需要DNA 聚合酶、ATP 、四种核糖核苷酸 D .PCR 与细胞内 DNA 复制相比所需要酶的最适温度较高 3、35.采用基因工程技术将人凝血因子基因导入山羊受精卵,培育出了转基因羊。但是人凝血因子只存在于该转基因羊的乳汁中。下列有关叙述,正确的是( ) A .人体细胞中凝血因子基因的碱基对数目,小于凝血因子氨基酸数目的3倍 B .可用显微注射技术将含有人凝血因子基因的重组DNA 分子导入羊的受精卵 C .在该转基因羊中,人凝血因子基因只存在于乳腺细胞,而不存在于其他体细胞中 D .人凝血因子基因开始转录后,DNA 连接酶以DNA 分子的一条链为模板合成mRNA

4、ch1L基因是蓝细菌拟核DNA上控制叶绿素合成的基因.为研究该基因对叶绿素合成的控制,需要构建该种生物缺失ch1L基因的变异株细胞.技术路线如图所示,对此描述错误的是() 5、下图表示基因工程中目的基因的获取示意图,不正确的是: A、同种生物的基因组文库大于cDNA文库 B、③表示PCR技术,用来扩增目的基因 C、从基因文库中要得到所需目的基因,可根据目的基因的有关信息来获取 D、只要基因的核苷酸序列已知,就只能通过人工合成的方法获取 6、图1表示含有目的基因D的DNA片段长度(bp即碱基对)和部分碱基序 列,图2表示一种质粒的结构和部分碱基序列。现有MspⅠ、BamHⅠ、MboⅠ、SmaⅠ4种限制性核酸内切酶,它们识别的碱基序列和酶切位点分别为:C↓CGG、G↓GATCC、↓GATC、CCC↓GGG。下列分析中正确的是:

蛋白质工程的崛起学案答案

蛋白质工程的崛起 班级: ____________ 姓名: _____________ 小组:_____________ 评价:____________ 【考纲要求】 1.举例说出蛋白质工程崛起的理由。 2.简述蛋白质工程的原理。(重难点) 3.尝试运用逆向思维分析和解决问题。 第一步:了解感知 阅读教材P26-28相关内容,将你认为重要的部分勾画出来,并完成下面内容:(一)蛋白质工程崛起的缘由 1.基因工程及不足 (1)实质:将一种生物的________转移到另一种生物体内,后者可以产生它 本不能产生的_________,进而表现出____________。 (2)不足:在原则上只能生产自然界已存在的________。2.天然蛋白质的不足 天然蛋白质的___________符合____________生存的需要,却不一定完全符合人类生产和生活的需要。 (二)蛋白质工程的基本原理 1.概念:蛋白质工程是指以___________________________为基础,通过_______________________或__________________,对现有蛋白质__________或_____________________,以满足人类生产和生活的需要。 (1)基础:蛋白质分子的____________及其与____________的关系。 (2)手段:通过____________或____________,对现有蛋白质进行 __________或制造一种新的蛋白质。因为基因决定蛋白质,所以必须从基因入手。 (3)目的:获得满足人类生产和生活需求的_______________。 2.原理: ________________________。 3.流程:

蛋白质组学部分题目

蛋白质组学课程试题 简答题(每题10分) 1、自由流电泳分离蛋白质的机理及其优缺点。 自由流电泳(CFFE)是在无固相支持介质的薄的矩形分离中,以缓冲液为分离介质进行生物大分子或不溶性颗粒及细胞等物质的分离纯化技术。在CFFE中,分离介质在两块平行的矩形板组成的分离腔内形成层流(两板之间的距离通常介于0.5-3.0mm)分离腔的两侧为正负电极室。被分离物质由一口径很小的输入口进入分离介质中,形成一细带,在垂直于液流的方向上加上均匀的电场后,样品中各种组分由于各自电泳迁移率的差异而各自向与所带电荷符号相反的电极以不同的速度迁移,相同电泳迁移率的物质则迁移为一窄带,在到达分离腔出口处由分级手机器收集。 优点:CFFE是一个连续的而不是分批进行的分离过程。同时由于它不使用有机溶剂、高盐溶液,及硅胶或凝胶等支持介质,分离调节相当温和,对有活性的生物材料的分离纯化提供了十分合适的分离环境。 缺点:因自由流电泳是完全无载体的液相电泳,因此除了电泳本身所固有的影响因素外(如:焦耳热,电动力学变形),还有层流(流体力学变形)以及一些综合因素的影响(电流体力学变形等),且这些过程常常互相关联,使整个过程变得极其复杂。重力对自由流电泳会产生影响。颗粒沉降、小滴沉降和热对流是影响自由流电泳的三种重力现象,在微重力条件下这些现象几乎消失,这使CFFE的放大在空间有可能得到实现。 2、质谱仪的组成及其主要技术指标。 质谱仪一般由进样装置、离子化原、质量分析器、离子检测器、数据分析系统组成。其中,离子化原用来待分析的分子转化成气态离子。在质量分析器中,不同荷质比m/z离子在一个随时间变化的电场作用下分离。离子检测器用来接受在质量分析器中分离的带有不同荷质比的离子检测m/z值以及不同m/z的离子密度。 主要技术指标包括:灵敏度,分辨率,准确度,稳定性,质量范围,动态范围 3、蛋白质组学定量分析方法的主要原理。 蛋白质组学定量分析主要包括两种方法: 1、建立在2-DE基础上的电泳方法:其原理是通过比较通过比较蛋白质在不同胶上的染色强度来进行相对定量。提供蛋白质表达水平的信息。 2、利用质谱检测技术:对来自不同样品的肽段标上一个内部标准,使得可以识别不同样品来源的肽段,以质谱峰的信号强度就可以作为定量的依据。 4、请列举预测蛋白质相互作用的方法。 1、酵母双杂交法:主要原理是将可能存在相互作用的蛋白之一与Gal4的DB结构域融合。另外一个与Gal4的AD结构域的酸性区域融合。如果在两个待测蛋白之间存在相互作用, 那么分别位于这两个融合蛋白上的DB 和AD就能重新形成有活性的转录激活因子, 从而激活相应基因的转录与表达。通过对报道基因表达产物的检测, 反过来可判别作为“诱饵”和“猎物”的两个蛋白质之间是否存在相互作用。 2、免疫共沉淀法:免疫共沉淀是一种比较经典的蛋白质相互作用方法,其实验比较简单。裂解细胞后,加入抗体,抗原被沉淀下来后洗涤,去除非特异性亲和再分析结合复合体。目前常使用Pull-down实验结合免疫共沉淀可以对可能的蛋白质相互作用进行验证。 3、高通量质谱蛋白质鉴定:使用一分子标签如FLAG标记把蛋白,使融合蛋白在细胞内过表达。通过免疫亲和(FLAG抗体)捕获到抽提物中把蛋白形成的蛋白质复合物。SDS-PAGE分离复合体各组分,胰酶酶切后,进行质谱分析。此法适合于分析天然状态下细胞内浓度较低的蛋白质,但是如果蛋白质浓度过高则背景较强,产生假阳性。 4、串联亲和纯化(tandem affinity purification, TAP):该技术核心是设计一个双重分子标签,包括A蛋白(IgG binding protein)、TEV蛋白酶切位点、钙调素结合蛋白。将TAP标签构建到靶蛋白上,然后在宿主细胞内表达融合蛋白,表达水平接近把蛋白的天然状态。可以与把蛋白相互作用的其他蛋白质结合到融合蛋白上,形成复合体。细胞裂解物和IgG基质温浴在一起,通过A蛋白复合物结合在IgG上。冲洗后,加入TEV蛋白酶,洗脱复合物。在Ca2+存在的情况下,洗脱液与包被钙调素的温育在一起,复合物就结合在珠子上。进一步洗去杂质后,加入EGTA鳌合,复合物脱落。SDS-PAGE分离复合体各组分,胰酶切割后进行质谱分析。该方法检测到的蛋白质相互作用更加接近自然条件下蛋白质的性质,包括浓度,定位和翻译后修饰。适合于

蛋白质试题

一、单选题 1.某条肽链由88个氨基酸缩合而成,其中共有氨基6个,甲硫氨酸5个且在肽链中的位置为3、25、56、78、88,甲硫氨酸的分子式为C5H11O2NS,下列叙述错误的有( ) ①合成该多肽的氨基酸共有N原子数目94个 ②该多肽脱掉甲硫氨酸后形成的多肽中,肽键数目会减少10个 ③该多肽脱掉甲硫氨酸后形成的多肽中,氨基和羧基均分别增加5个 ④该多肽脱掉甲硫氨酸后形成的多肽中,氧原子数目减少1个 A.1项B.2项C.3项D.4项 2.关于多肽和蛋白质的叙述,正确的是 A.加入食盐会使鸡蛋清溶液中蛋白质空间结构发生变化而析出 B.高温变性的蛋白质更易消化吸收 C.双缩脲试剂可以检测氨基酸含量和鉴定变性的蛋白质 D.1个环状八肽分子彻底水解需要7个H20 3.如图为有关蛋白质分子的概念图,下列有关图示的分析正确的是 A.一个多肽中a的种类肯定有20种 B.①过程发生在核糖体上 C.b的结构简式是—NH—COOH— D.蛋白质结构多样性的原因是a的种类、数量和排列顺序的多种多样 4.已知氨基酸的平均分子质量为126,天冬氨酸的R基为(-C2H4ON),现有分子式为C x H y O z N19S2的一条多肽链,其中有2个天冬氨酸参与组成,则该多肽的分子质量最大约为 A.1638B.1854C.1886D.2142 5.现有1000个氨基酸,共有氨基1020个,羧基1050个,由他们合成的4条肽链中,肽键、氨基、羧基的数目分别是() A.999、1016、1016B.999、1、1C.996、24、54D.996、1016、1016 6.如图为由A、B、C三条链共81个氨基酸构成的胰岛素原,其需切除C链才能成为有

【生物】6年高考题按知识点分类汇编WORD版蛋白质工程

蛋白质工程 (2012天津)8.黄曲霉毒素B1(AFB1)存在于被黄曲霉菌污染的饲料中,它可以通过食物链进入动物体内并蓄积,引起瘤变。某些微生物能表达AFB1解毒酶.将该酶添加在饲料中可以降解AFB1,清除其毒性。 回答下列问题: (1) AFB1属于类致癌因子。 (2) AFB1能结合在DNA 的G 上,使该位点受损伤变为G ' ,在DNA复制中,G '会与A 配对。现有受损伤部位的序列为,经两次复制后,该序列突变为。 (3)下图为采用基因工程技术生产AFB1解毒酶的流程图 据图回答问题: ①在甲、乙条件下培养含AFB1解毒酶基因的菌株,经测定,甲菌液细胞密度小、细胞含解毒酶:乙菌液细胞密度大、细胞不含解毒酶.过程l 应选择菌液的细胞提取总RNA ,理由是 ②过程Ⅱ中,与引物结合的模版是 ③检测酵母菌工程菌是否合成了AFB1解毒酶,应采用方法。 (4)选取不含AFB1的饲料和某种实验动物为材料,探究该AFB1解毒酶在饲料中的解毒效果。实验设计及测定结果见下表: 据表回答问题: ①本实验的两个自变量,分别为。 ②本实验中,反映AFB1解毒酶的解毒效果的对照组是。 ③经测定,某污染饲料中AFB1含量为100μg/kg ,则每千克饲料应添加克AFB1解毒酶.解毒效果最好.同时节的了成本。 (5)采用蛋白质工程进一步改造该酶的基本途径是:从提高每的活性出发,设计预期的蛋白质结构,推测应有的氨基酸序列,找到相对应的序列。

【答案】(1)化学(2) (3)①甲甲菌液细胞的AFB1解毒酶基因已转录生成了mRNA,而在乙菌液细胞中该基因未转录②AFB1解毒酶基因的 cDNA. ③抗原-抗体 杂交 (4)① AFB1的有无和AFB1解毒酶的含量。 ② B组(或B组+A组)③ 5 (5)脱氧核苷酸序列。 【解析】黄曲霉毒素B1 (AFB1)存在于被黄曲霉菌污染的饲料中,它可以通过食物链进入动物体内并蓄积,引起瘤变。某些微生物能表达AFB1解毒酶.将该酶添加在饲料中可以降解AFB1,清除其毒性。 (1)黄曲霉毒素B1(AFB1)是化学物质,AFB1属于化学类致癌因子。 (2)AFB1能结合在DNA 的G 上.使该位点受损伤变为G ' ,在DNA复制中,G '会与A配对。 现有受损伤部位的序列为,经两次复制后,该序列突变为。 (3)①在甲、乙条件下培养含AFB1解毒酶基因的菌株.经测定.甲菌液细胞密度小、细胞含解毒酶:乙菌液细胞密度大、细胞不含解毒酶.过程l 应选择甲菌液的细胞提取总RNA ,理由是因为甲菌液细胞含解毒酶,意味着完成了基因的表达,所以应选择甲菌液的细胞提取总RNA ②过程Ⅱ中,根据图示,可以看出与引物结合的模版是cDNA. ③检测酵母菌工程菌是否合成了AFB1解毒酶,检测对象为蛋白质,应采用抗原-抗体杂交方法。 (4)①本实验的两个自变量,分别为AFB1的有无和AFB1解毒酶的含量。 ②本实验中.反映AFB1解毒酶的解毒效果的对照组是B组。 ③经测定,某污染饲料中AFB1含量为100μg/kg ,则每千克饲料应添加5克AFB1解毒酶.AFB1的残留量最少,解毒效果最好.继续添加AFB1解毒酶解解毒效果不变,因此节约了成本。 (5)采用蛋白质工程进一步改造该酶的基本途径是:从提高酶的活性出发,设计预期的蛋白质结构,推测应有的氨基酸序列,找到相对应的脱氧核苷酸序列。 【试题点评】本题以“黄曲霉毒素B1”为材料背景,考查了致癌因子,DNA复制,基因工程,蛋白质工程和实验设计,是一道很好的综合题,考查学生的知识的理解和运用能力,以及对实验分析能力和分析探究能力。难度适中。 (2012广东)29 .(16分)食品种类多,酸碱度范围广。生物兴趣小组拟探究在食品生 产应用范围较广的蛋白酶,查阅相关文献,得知:

蛋白质组学期末复习题

蛋白质组学相关试题及答案 解释 1. Proteome(蛋白质组):由一个细胞或者组织的基因组所表达的全部相应的蛋白质,称为蛋白质组。 2. Proteomics(蛋白质组学):指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴学科,即研究细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同,对相关蛋白质进行分类和鉴定。更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能. 3. Mass Spectrometer(质谱仪):质谱仪是一个用来测量单个分子质量的仪器,但实际上质谱仪提供的是分子的质量与电荷比(m/z or m/e)。分离和检测不同同位素的仪器。即根据带电粒子在电磁场中能够偏转的原理,按物质原子、分子或分子碎片的质量差异进行分离和检测物质组成的一类仪器。质谱仪最重要的应用是分离同位素并测定它们的原子质量及相对丰度。 4. Proteome sample holographic preparation(蛋白组样品的全息制备):(1)keep protein information (2)adapted to separation and identification methods (3)different samples,different extraction. 蛋白质样品制备是蛋白质组研究的第一步,也是最关键的一步。因为这一步会影响蛋白质产量、生物学活性、结构完整性。因此要用最小的力量使细胞达到最大破坏程度同时保持蛋白质的完整性。原则是,保持蛋白质的所有信息;选择合适的分离和鉴定方法;对于不同的样品要用不同的提取方法。 5. Post translational modification(蛋白质翻译后修饰) 肽链合成的结束,并不一定意味着具有正常生理功能的蛋白质分子已经生成。已知很多蛋白质在肽链合成后还需经过一定的加工(processing)或修饰,由几条肽链构成的蛋白质和带有辅基的蛋白质,其各个亚单位必须互相聚合才能成为完整的蛋白质分子。 6. De novo sequencing(从头测序) 从头测序为蛋白质组研究提供了一种不用借助于任何蛋白质序列数据库信息,直接解读串联质谱数据的方法。其基本算法主要由4个部分组成:质谱图的构建、

蛋白质习题

一、单选题 1. 蛋白质分子中的大多数氨基酸属于下列哪一项? (A) L-β- 氨基酸 (B) D-β- 氨基酸 (C) L-α- 氨基酸 (D) D-α- 氨基酸 (E) L 、 D-α- 氨基酸 2. 属于碱性氨基酸的是 (A) 天冬氨酸 (B) 异亮氨酸 (C) 组氨酸 (D) 苯丙氨酸 (E) 半胱氨酸 3. 280nm 波长处有吸收峰的氨基酸为 (A) 丝氨酸 (B) 谷氨酸 (C) 蛋氨酸 (D) 色氨酸 (E) 精氨酸 4. 维系蛋白质二级结构稳定的化学键是 (A) 盐键 (B) 二硫键 (C) 肽键 (D) 疏水键 (E) 氢键 5. 维系蛋白质一级结构的化学键是 ①盐键②二硫键③疏水键④肽键⑤氢键 6. 关于蛋白质二级结构错误的描述是 (A) 蛋白质局部或某一段肽链有规则的重复构象 (B) 二级结构仅指主链的空间构象 (C) 多肽链主链构象由每个肽键的二个二面角所确定 (D) 整条多肽链中全部氨基酸的空间位置 (E) 无规卷曲也属二级结构范畴 7. 有关肽键的叙述,错误的是 (A) 肽键属于一级结构内容 (B) 肽键中C-N键所连的四个原子处于同一平面 (C) 肽键具有部分双键性质 (D) 肽键旋转而形成了β-折叠 (E) 肽键中的C-N键长度比N-Cα单键短 8. 有关蛋白质三级结构描述,错误的是 (A) 具有三级结构的多肽链都有生物学活性 (B) 亲水基团多位于三级结构的表面 (C) 三级结构的稳定性由次级键维系 (D) 三级结构是单体蛋白质或亚基的空间结构 (E) 三级结构是各个单键旋转自由度受到各种限制的结果 9. 正确的蛋白质四级结构叙述应该为 A 蛋白质四级结构的稳定性由二硫键维系 B蛋白质变性时其四级结构不一定受到破坏 C蛋白质亚基间由非共价键聚合 D四级结构是蛋白质保持生物活性的必要条件E蛋白质都有四级结构 10. 蛋白质α一螺旋的特点有 A多为左手螺旋B螺旋方向与长轴垂直 C氨基酸侧链伸向螺旋外侧 D 肽键平面充分伸展E靠盐键维系稳定性 11. 蛋白质分子中的无规卷曲结构属于 (A) 二级结构(B) 三级结构(C) 四级结构(D) 结构域(E) 以上都不是 12. 有关蛋白质β一折叠的描述,错误的是 (A) 主链骨架呈锯齿状(B) 氨基酸侧链交替位于扇面上下方 (C) β一折叠的肽链之间不存在化学键(D) β一折叠有反平行式结构,也有平行式结构 (E) 肽链充分伸展 13 下列有关氨基酸的叙述,错误的是 (A) 丝氨酸和苏氨酸侧链都含羟基(B) 异亮氨酸和亮氨酸侧链都有分支 (C) 组氨酸和脯氨酸都是亚氨基酸(D) 苯丙氨酸和色氨酸都为芳香族氨基酸 (E) 精氨酸和赖氨酸都属于碱性氨基酸

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